3P5JC

The structure of the human rnase h2 complex defines key interaction interfaces relevant to enzyme function and human disease
Total Genus 15
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
15
sequence length
149
structure length
116
Chain Sequence
IHLRPGSLRGAAPAKLHLLPCDVLVSRPAPVDRFFTPAVRHDADGLQASFRGRGLRGEEVAVPPGFAGFVMVTRLIGATGSFSHFTLWGLETVPGPDAKVHRALGWPSLAAAIHAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Human RNase H2 Complex Defines Key Interaction Interfaces Relevant to Enzyme Function and Human Disease.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H2 subunit A
molecule tags Hydrolase/replication
source organism Mus musculus
total genus 15
structure length 116
sequence length 149
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF08615 RNase_H2_suC Ribonuclease H2 non-catalytic subunit (Ylr154p-like)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.130 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3p5jC01
3PUFC 3KIOC 3P5JC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XR1A 1OECA 5KMNA 2X9EA 4RX8A 4RJ8A 3CGOA 2XEZA 1H1PA 4PMSA 1OI9A 4KIPA 4YMJA 2ETMA 5F95A 4AW2A 4LOPA 2O64A 3HV4A 3B2TA 2VWVA 4J71A 3KULB 2YA9A 2R0UA 2RFEA 4QMXA 5BMMA 4MX9A 4WNKA 3CQEA 1DS5A 5LMKA 3ZMMA 4IZYA 3VBQA 4WT6A 2R2PA 4B6LA 3NNVA 4NW6A 3HP2A 2IVVA 5AFVA 4IX3A 4PDOA 3CGFA 2R3LA 3EFLA 3ENHA 3GBZA 4U80A 4XOYA 5KX8A 5M07A 1DI9A 4OTDA 3U8WA 4DFYA 4QQTA 2OK1A 3MWUA 3QTWA 3NYOA 5M53A 1ZMUA 4KKGA 3FYKX 3RHXA 3LHJA 4FTUA 2C3KA 2OH4A 2PE2A 5DOSA 3FLSA 4DINA 1W84A 2O3PA 1KSWA 4PWNA 3WF6A 4YTHA 4BCOA 3O2MA 4Y5QA 2HIWA 3QF9A 4O7SA 4BZOA 3HRCA 1DAWA 2YCQA 3UIMA 3FXXA 1ZWSA 3ERKA 3UVPA 5GJGA 2JKOA 2HW6A 3NZ0A 4TT7A 4EH5A 4DGNA 2C5XA 3GGFA 4RC4A 3W2QA 2J6MA 3PE2A 4PUZA 3HMMA 4WG3A 4QPSA 5M4IA 3AT3A 3NYXA 4RQKA 5HIEA 4DG3E 3R1YA 3PY3A 2YCRA 4RIYA 1XH4A 3NVMB 2VTLA 2BCJA 3E7OA 4L7SA 2J0LA 1Y57A 2X81A 2V0DA 4FT5A 2JDVA 2YM8A 4JLCA 2W5AA 1YHVA 4XV9A 4FTOA 4D1XA 4KSQA 3DV3A 3KXMA 2OH0E 3N4VA 4ARKA 1PMNA 1Q8UA 5EI6A 5FXQA 1OZ1A 2VO6A 2B0QA 2WOTA 4FKWA 3IS5A 3DXQA 5GJDA 4C35A 1OKZA 4LUDA 4KKEA 1PKGA 3FQSA 4HYHA 4KBKA 5AV4A 2E2BA 4XG8A 3TZ7A 2OJIA 3O50A 4ASEA 2BILB 2WMUA 3TCPA 4HJOA 3FMNA 5GIPE 3BYVA 1QPJA 3QTSA 4AXCA 3MB7A 4HCUA 1YKRA 4LRJA 2XIRA 3V8SA 2ZVAA 2P33A 2UW8A 3LFBA 1WBWA 3W2RA 4G9CA 5E4HA 2NYAA 5ETAA 2VTHA 4GVAA 4IJPA 4L3LA 4G6NA 4NFNA 2IW6A 3HAMA 3QKLA 3E92A 4GG7A 4X21A 3ZXZA 4KS8A 2A4LA 4EORA 4MNEA 3S2PA 5BUIA 4J98A 2C6DA 2QOLA 5EM7A 5CEOA 4FZ7A 4YHTA 5CAOA 5EG3A 3F2RA 1P14A 2ITOA 2R3FA 4TKSA 2AEGA 5D7VA 4R5SA 4FSZA 3MFUA 1TQMA 3FWQA 3DAEA 2ITNA 4C4EA 3TWJA 4PDPA 5AA9A 5CZHA 5I9WA 3KB7A 4R6VA 4ZY4A 3KK8A 3D0EA 3QRTA 4O83A 4AOTA 5IF1A 2XF0A 4UWYA 3TV6A 1ZYLA 2W1HA 2X6EA 5CSHA 3RI1A 2OO8X 3UOKA 3ANRA 3R28A 4EKLA 2BR1A 3UYSA 5K9IA 2WQEA 3TACA 3QWJA 2YM4A 2Z7RA 4FYNA 3WYXA 3RKBA 2RG6A 5KZ0A 3DXNA 2CNVA 3K54A 1OKYA 4IMYA 5BVEA 4EK3A 5AUTA 3PJ2A 3U9CA 5T68A 4WNPA 2WNTA 5IDPA 5AP4A 3R83A 2IZUA 4MD8E 3EFJA 3ROCA 2R3MA 2YITA 2X8EA 3QLGA 5ACKA 5CAVA 5KKRC 4O81A 2NRUA 2GHLA 4EBVA 5AUZA 4EWQA 1W0XC 2H9VA 2JFMA 5TKDA 3MH3A 4EQUA 2VTOA 4ZTMA 3V5PA 5LOHA 1F0QA 3OXTA 4RWLA 5CLPA 3GB2A 4O82A 1W7HA 4NWMA 1G3NA 3AKLA 3JYAA 4FTRA 4D9UA 5E8TA 3H10A 4JBPA 4I0SA 2C68A 3JXWA 3BYOA 3ROYA 4O2PA 5M51A 4NL0A 3DPKA 3U87A 4FT3A 5IH4A 4DEHA 3LJ0A 3ZLWA 4P2KA 5CEIA 2WTWA 1NT2A 3GFEA 2B9IA 2XM8A 4FTQA 4H05A 2OF4A 3DB6A 4TWNA 3H0ZA 4IFCA 4QMLA 3LCKA 4MXCA 4C4GA 1LUFA 3EKNA 1XMMA 4J97A 4QQ5A 3NNXA 3TV4A 4D28A 4EH4A 2XK7A 5CQUA 4F9YA 1XKKA 2VWYA 1H24A 2BDFA 2W4JA 2PMIA 3LVPA 5FUTA 4ZZNA 1JWHA 4XHKB 4EOIA 2XP2A 1ZOHA 1LPUA 2WQOA 3DK6A 3RK9A 4BHZA 5GIOE 3BBTB 4BTFA 4ZLOA 3K2LA 2WPAA 2BKZA 3R7UA 4IEBA 3W2PA 5AV2A 2A2AA 4L67A 2B9JA 4ZK5A 2W99B 4NUSA 3P7CA 2OJJA 4ZAUA 3LCDA 2IN6A 5IA0A 1ST0A 4E4MA 1UU3A 1XJDA 4UEUA 1NA7A 2CGUA 5AV1A 4C4JA 4DEIA 2EB3A 1Q4LA 4EC8A 5KBRA 4JQ8A 1Q99A 2Q83A 3FZ1A 2GTMA 3MVHA 4IE9A 4I6LA 3F5UA 5D12A 3G0EA 3KVXA 1IASA 3KRLA 1V0OA 3FC1X 4MWIA 2C6LA 2DUVA 3TN8A 3QCSA 3PY1A 1U4DA 2C3IB 4FV4A 5EKNA 5I5ZA 1XWSA 4RLKA 4U44A 3OHTA 3DXPA 3HMPA 3KIOC 5KMJA 2VTRA 5BVOA 4GIIA 3QD0A 4CXAA 4BDGA 2FVDA 3FBVA 4GJ3A 5BVWA 3TNIA 3BELA 2QOBA 2YJRA 1R0EA 3GU5A 3U55A 4BCMA 3G15A 3I79A 1MUOA 3SKCA 2UW5A 3BX5A 5E1SA 2J4ZA 3VS6A 4MKCA 1DI8A 4YZNA 4ZIMA 5E8UA 4I6BA 3Q32A 1WVXA 2CLXA 4FKRA 4DT8A 3C4ZA 2XMYA 4YC3A 5FBNC 4IACA 5BYLA 4TPTA 3O7LD 4TYEA 2XIXA 4TW9A 2JD5A 3EHAA 3VAPA 4DEBA 3W10A 4QTBA 5E92A 1XQZA 3D7TB 3ZO1A 4J99A 3DNEA 1CSNA 4EHVA 2R5TA 2VWZA 2QURA 3HA6A 4HZRA 1PW2A 2ITUA 4G3GA 4A9SA 3UPZA 2G01A 3IGGA 4EUUA 3OCGA 2ONLA 2ETKA 3CC6A 4AQKA 1JKKA 2EXCX 3UOHA 2VX1A 4O0WA 4WNMA 3KXHA 3R22A 5ANIA 4AU8A 3WE8A 1PXNA 3PSDA 4CKJA 1FVTA 4FI1A 4JRNA 1UKHA 3I1AA 2AC5A 3Q6UA 3ZBFA 3KRWA 3IKAA 5AIRA 3QFVA 3UIBA 3ZFXA 5CSVA 4FG9A 4I3ZA 4BVUA 5M44A 3DCVA 5HTBA 4RX9A 4BF2A 4EEVA 1Y8GA 4G5PA 4G5JA 4Y85A 3LIJA 4A06A 5AV3A 4DGGA 3FI2A 3U9NA 3OMVA 3C1XA 3VS3A 4O7TA 2PU8A 4I20A 4YTIA 2EU9A 2XS0A 2CCIA 3FMLA 4IWPA 5A4QA 4C58A 2CGWA 5LARA 4RBLA 3IW4A 3IQ7A 3FDNA 3W0RA 3LAUA 2PE1A 3OFMA 3TTJA 5CENA 3UE4A 3OCTA 1UU8A 4E5WA 3FZSA 3QHWA 3I5NA 1VR2A 3B2WA 4IVDA 1JAMA 2OZOA 5JN2A 2UV2A 2XEYA 4QYEA 4E6DA 4MBIA 1O9UA 4YJSA 4EQCA 4HVGA 4U3ZA 1L8TA 2R3OA 4OUCA 3QGWA 4WOVA 2YABA 3CPBA 1ZARA 1ZYSA 2FSOX 2PUNA 3VN9A 4AXDA 5K4JA 5EM5A 2NRYA 4GFOA 4L7FA 3R00A 4FKQA 4FKIA 4NTSA 4RA5A 2C6EA 3TNHA 2HK5A 2ESMA 3UPXA 1E9HA 4O84A 2E9PA 5EYDA 2Y4IC 3ZO2A 4E6QA 2DS1A 3HECA 2Z8CA 4YBJA 2W17A 1H0WA 3LFDA 3PFYA 4F6SA 4JBVA 4OW8A 1ZYJA 5FTQA 3Q6WA 1Q3WA 2GNGA 3LM0A 3HA8A 1ZAOA 4HNFA 4QMQA 3MVLA 5C9CA 1Z5MA 4M3QA 4E7WA 3P86A 4PF4A 4RZWA 2XH5A 5IMEA 5HE3A 4PL4A 4FKPA 4EL9A 1NVRA 4GT5A 4J7BA 2R4BA 4L42A 4NSTA 2C3LA 2V62A 2XNNA 4JI9A 4RIXB 4AZTA 4F7NA 2PVJA 1GY3A 4WG4A 2ERKA 2XUUA 3QHRA 2ZB0A 2ACXA 5IPJA 1PXKA 1V1KA 3REPA 5M56A 3CKWA 4MXAA 3P08A 4RJ4A 4YJRA 3V8TA 3DZQA 1GIJA 3AD6A 1J1CA 3DKOA 5HG9A 3RM6A 2XJ2A 2FH9A 2J5FA 2UZEA 2W9ZB 3MFTA 4X2KA 4KRCA 2I0VA 4NJDA 4DH7A 5LVNA 2GTNA 3MH1A 4XG3A 2FO0A 5D11A 1YDSE 4CT2A 1YHWA 4NTTA 3HZTA 4LRMA 2I0YA 5D1JA 5DHJA 4NZWB 5AAFA 3SRVB 4O7WA 5AX3A 3LXNA 2YISA 4IVCA 4KIOA 5CNOA 2CNQA 2PVYA 3ZDUA 4AA0A 2OLCA 3CR0A 5E9EA 3ORMA 3G5DA 1UU7A 4FEUA 4RQVA 3BU6A 4UALA 5HX6A 4FIEA 3ZTXA 2PHKA 2BHEA 1W82A 3VJNA 4NCTA 4BDAA 2HZ0A 5HZNA 5ANEA 2HENA 4GK3A 1VYWA 4XRJA 4EOLA 3DFCB 4PMTA 5ITAA 1V0BA 4YGAA 2VZ6A 2WKMA 2XYNA 1VJYA 5EDPA 4K8AA 3HLLA 1PJKA 1U5RA 3LCTA 5IDNA 1ZLTA 3RPYA 1OUYA 4IDTA 4PMMA 3RINA 3UDBA 4Q5HA 2PY3A 4YLJA 3TUCA 5D41A 4NYEA 2OFVA 4YZMA 2A1AB 3AMAA 4FKLA 3ZOSA 3KU2A 2V55A 2BTRA 3NDMA 4BKJA 3PIZA 3K5UA 3ALNA 5E7RA 3F5PA 2CGXA 3PXQA 4OTGA 2C0IA 4RFYA 2PSQA 4C62A 3Q52A 3RK7A 4UXQA 4CEGA 1CM8A 2IW8A 3LMGA 4XRLA 5DGZA 3KY2A 3WF5A 1RE8A 5E8ZA 4PDYA 5I4NA 2F49A 3EMGA 3BHYA 4LV8A 2CPKE 2QCSA 5BVFA 3FLQA 3KRJA 4R3RA 4QP2A 5L6WL 3ZUTA 5HLNA 4XV3A 2C6OA 5A4TA 1YDTE 2XYUA 4D1SA 3CTQA 4ASXA 5J8IA 3BU3A 3GQLA 1VLRA 5DN3A 4RVTA 4O21A 2Y4PA 3UJGA 3VC4A 2GSFA 2OJGA 1BI7A 3CLYA 4FT0A 4BIBA 2BTSA 4D4YA 3PXYA 4ACHA 2H96A 5AJQA 1NY3A 5JFWA 2JIUA 1KOBA 3QL8A 3EN7A 1PMVA 2XNPA 2YN8A 3FZOA 2WHBA 2ZDUA 5HLPA 4HPTE 4XV2A 3SC1A 4FOBA 3QX2A 5IG1A 4CFUA 3PJ3A 4I94A 3PXKA 2W1GA 4L44A 3F3TA 1KE5A 3Q2JA 3EQGA 3FL5A 5AP5A 4CKRA 3TIZA 3QAME 4BDKA 4C61A 4P4CA 3OC1A 5C8KA 2G15A 3LJ2A 2WMVA 3TT0A 3ZUVA 4FA2A 1KUTA 3UO6A 3JS2A 4IAKA 2Z7SA 1H0VA 3PY0A 2OIBA 3TZ8A 5KNJA 5CTPA 3R1SA 3A8WA 4FSRA 1FQ1B 4BIEA 2VX0A 2WMRA 3R7EA 4OTRA 3RNYA 2QLUA 2XRWA 5CEQA 2CDZA 1JVPP 3N9XA 2X7FA 5FP6A 4JX3A 1YWRA 3LMHA 4R7IA 3MB6A 4DEEA 5ANGA 4GCJA 5CALA 4GYGA 2W05A 2OI4X 2GHMA 2VO0A 2XK8A 5IH5A 5E90A 2O65A 5DEWA 4D4SA 1J1BA 1S9IA 3K5VA 3O5AA 3THBA 2OXYA 2YHVA 4U97A 4RIWA 1KWPA 1ZZ2A 3NNWA 5E8WA 3UDZA 2HY81 2YIWA 4LI5A 3ULZA 4DH1A 4XUFA 2XJ1A 5JZNA 4EZ7A 4Z7GA 3COKA 4YJNA 1TKIA 3KREA 2QOCA 4DGOA 4MQ2A 4R1VA 2YEXA 5G6VA 4MF1A 2XNMA 3D14A 3F61A 4FGRA 5JEBA 3L9PA 5DVRA 2VUWA 3GU4A 2UZNA 4BJJB 5M08A 5CAUA 5IZFA 2WFYA 1IAJA 2UZLA 3TM0A 5IU2A 2J5EA 2YDIA 2C1BA 3UOLA 1ERKA 1SYKA 2GS2A 3NVKI 4IADA 3IDPA 4AX8A 1AGWA 2QOOA 3FYJX 2XNBA 1OBDA 5ANOA 3W2OA 3L9LA 2PVHA 3TUDA 2ERZE 3OZ6A 5CI6A 1R3CA 3TJDA 2PE0A 3ZRKA 2PZPA 4GH2A 5JGDA 5CY3A 3PDTA 5EFQA 3G2FA 4ZOGA 4GW8A 3CD3A 1BKXA 2WTVA 4QDEA 1P5EA 4O91A 2AUHA 4FSUA 3UG2A 4EOKA 3FXZA 3QUEA 3UC3A 2ZM1A 1ZXEA 4BGHA 3E8CA 4FL1A 1I44A 4I6HA 4RLLA 5I9YA 4I6FA 3BE9A 3DBFA 4QMZA 2E9UA 1YXSA 3SAYA 3O17A 3Q4ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PUF C;  3KIO C;  3P5J C; 
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite