3Q2JA

Crystal structure of 3',5"-aminoglycoside phosphotransferase type iiia protein kinase inhibitor cki-7 complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
MRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of two aminoglycoside kinases bound with a eukaryotic protein kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Enterococcus faecalis
molecule keywords Aminoglycoside 3'-phosphotransferase
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.95: Kanamycin kinase.
pdb deposition date 2010-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q2jA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3q2jA02
2SRCA 3KXZA 4WD5A 5M44A 4G3FA 5KKRC 3TKIA 3VBTA 2QONA 3A7HA 4WSYA 4GMYA 4GJ3A 2PE2A 5CU4A 4EUUA 2NRYA 2E9NA 1YWNA 4NM3A 1H1PA 2YIXA 3MH1A 4D5HA 3BU6A 5M56A 4BCKA 4WG5A 5HO7A 1U54B 4HZSA 4Z9LA 2XKDA 3AC5A 5G6VA 4EK3A 5JN2A 1DI9A 2OIDA 3NUSA 4LOQA 3WYXA 2R2PA 3WARA 3EYGA 2OICA 4AQCA 3BPRA 3N4VA 4GYIA 3ZO2A 3HL7A 5CNOA 4E4NA 2OJFE 3DNEA 4EUTA 4XMOA 4AG8A 4UZHA 4L8MA 3W32A 3QXPA 4CCUA 1WBOA 3UQCA 2VTAA 2XA4A 4H3BA 5EHLA 3RMFA 4ITJA 3QCSA 2OWBA 2Y6MA 3QRIA 3MVMA 3I60A 1IR3A 4A9UA 2JFLA 2W1FA 4I3ZA 4QYEA 3TXOA 5BQ0A 4MNFA 1PMNA 2CGWA 2J0LA 2F7XE 4GU9A 4MK0A 3T9TA 3QQHA 3UQFA 3FLZA 3BELA 3F82A 4J97A 2PVHA 3UOLA 3R9NA 3CCNA 3CD3A 3S4QA 2GTMA 2YWPA 3HA6A 3TDVA 2X7GA 2VTMA 4YJRA 1PXOA 4GH2A 3W1FA 4A7CA 1H25A 3Q9WA 5E91A 3SDJA 2YM3A 3WE4A 4YUQA 4BCFA 2BDWA 5DBXA 5J1WA 2PULA 3DAJA 4KABA 4DE4A 4EONA 3G2FA 4E6QA 1PHKA 2FSTX 3AGMA 5JSMA 2YDJA 2ZB1A 4P5ZA 4LOOA 5KZIA 4FV6A 4QTBA 5F94A 4Q5EA 2LGCA 3EHAA 3FYKX 1Q41A 2X81A 2YM5A 5L6OA 4PL3A 4GIIA 2DYLA 3MSSA 3RPRA 2PE0A 2VWXA 4NYEA 3R9RA 3UYSA 1PXLA 2BHHA 5M4IA 1SNUA 3A8WA 1GNGA 4O0XA 3VUMA 5GIPE 3PE1A 5CXHA 3O8TA 4GFMA 1QPDA 1Q8YA 2UW0A 1RE8A 3FQHA 3R1YA 1Q61A 1JSTA 4O0UA 3UVQA 1ND4A 4QMOA 4BDHA 4TNBA 4JL9A 2PVKA 3EKNA 2FSLX 3MBLA 2HWPA 2X6EA 5DH3A 1H8FA 4BDKA 3DQXA 4FTOA 3MPAA 4OTRA 1SVGA 5EW9A 3EQCA 3BE2A 3IGOA 2OBJA 3Q60A 4G3CA 4MTAA 4BKJA 3V51A 2OFUA 2F7EE 4QMSA 3UBDA 2WOUA 3MYGA 3UO6A 2QG7A 2UV2A 4FT3A 3HP5A 4JX7A 2A0CX 3A7FA 4LYNA 3R8LA 3NUXA 2RG5A 3TUCA 2W1EA 3GCPA 3B2WA 3Q4CA 2A27A 2JD5A 3D5WA 4ZXTA 5A46A 4JIKA 3GEQA 1LPUA 3KK9A 3EL8A 4RZVA 4ASXA 4UWCA 1ZY4A 4K1BA 5ITAA 3E8DA 3DJ7A 4L7SA 5HHWA 3IW5A 1ZYCA 2C6DA 4EYMA 1IG1A 5AAEA 2ACXA 2JLDA 3R01A 4PF4A 1KUTA 4LMUA 1V1KA 5DVRA 5KMJA 4NT4A 3W2QA 4XLIA 5IA1A 4G9RA 3LFNA 4A4LA 3I79A 3FE3A 3NVMB 3ZDIA 4GKIA 5LVOA 4IADA 3GENA 1ZWSA 3BU5A 5L2WA 3SD0A 2Q0NA 2WOTA 2UUEA 3LFCA 3TZ7A 4AZEA 2X6DA 3F7WA 2R7BA 5CAPA 4V0GB 4CFMA 4BCGA 3E63A 5IH4A 4CD0A 3UDBA 1LP4A 4EZ5A 3LFAA 2UZWE 3LJ1A 4I5MA 3AQVA 3QRJA 1B39A 3PSDA 4L3LA 4DT9A 3AMAA 5DEYA 2RFSA 4I6QA 3W0MA 4U41A 4IFCA 3LJ2A 2OXYA 4WNMA 4I21A 4EH3A 5HESA 1U4DA 2G15A 4JRVA 4I5HA 4YZMA 2F2CB 4IAZA 4EQMA 3R1NA 3OCTA 3S1HA 4L43A 4G16A 5ETCA 2QVSE 1O6YA 3G5DA 4X2NA 4A07A 4CCBA 4FUXA 3N51A 3RAWA 3BEAA 5IQIA 1QPCA 2X7FA 5JRSA 4ZZOA 3O23A 4X2KA 2QO9A 1KSWA 4FV2A 3E92A 1IRKA 3R02A 4TT7A 4EH8A 2NNWB 4WRGA 2QR7A 1R78A 2YM7A 4C4IA 4CRSA 4G6LA 4UXLA 4BGGA 4LI5A 3H10A 1ZOGA 4JJRA 4Q2AA 5J87A 5HVKA 3UIUA 2OIQA 5ACBC 4DH3A 5L3AA 4FIJA 5IF1A 4FI1A 3TJCA 4FIEA 2OF2A 2REIA 4EWHA 5D7VA 4GV1A 4TYHB 4EHEA 4ZTMA 3ZRLA 4NJDA 4QNYA 4ZLOA 5AUYA 3G6HA 3NAYA 5JH6A 4FV1A 4RVMA 2WO6A 3VVHA 3FPMA 2YAKA 4NM7A 3F69A 1CDKA 3E8NA 3PJ3A 2J7TA 4QMLA 3MJ2A 4FTQA 4LL5A 3KRJA 5A6OA 5KE0A 4E5AX 3F61A 2VTNA 3NIZA 4BDJA 2LAVA 4FKPA 4DCEA 2NO3A 2Q83A 2WKMA 2YZLA 4B0GA 4DGGA 2J2IB 3A62A 4IZAA 4FT5A 4BRXA 4APCA 4U9AA 3BYSA 3D7TB 4E4LA 3BQRA 3Q52A 3PXQA 4XG9A 3VQUA 4QT1A 2OSCA 3EFWA 4GIHA 2B1PA 5HVJA 1I44A 2WQEA 4FT9A 3SOAA 3NYVA 5BVNA 1YI4A 2BZIB 2W1GA 1NA7A 4PQNA 4MBIA 4FNWA 5L2IA 3P86A 5IG1A 4QPSA 3C0IA 2OH4A 4FKWA 4W4YA 4BCMA 3ORIA 3S3IA 3FXWA 3UPZA 2WXVA 5AIKA 3SX9A 3H3CA 2IZTA 4CQEA 2C5VA 5DGZA 1Y91A 3HRBA 1FMKA 3FL5A 4HYUA 3RGFA 3GT8A 4BYJA 4CV8A 4P90A 1R1WA 4G5JA 3ZSHA 4V0GA 2R3JA 4ZOGA 5HU9A 3WF5A 2HZ4A 4XP3A 4C58A 3NR9A 1A9UA 5ANEA 3C5UA 3O0GA 2W99B 4QP6A 1LR4A 3DKGA 5AIRA 2PVYA 2W17A 5DPVA 4KIPA 4UBAA 1IASA 3R2YA 5FBNC 4QMWA 4BC6A 3OUNB 1Q8TA 3BYOA 4XV1A 4DGNA 1YDSE 4I22A 3K3JA 4Z7HA 4QMXA 4WG4A 4IVAA 2UZEA 1Q4LA 5E8YA 4F1MA 2B7AA 3F7ZA 3PPZA 3QD4A 4PMTA 2H34A 4LV8A 2WPAA 5HG7A 4O84A 5AWMA 3NUPA 3L9PA 5HVYA 5KBRA 4J7BA 4V01A 4RC4A 2I0VA 3F5GA 3ZM4A 3Q4TA 3OTVA 3VS4A 1RDQE 3DFAA 3TYKA 3LFBA 5IUHA 3HV5A 3DA6A 2B53A 3DB6A 2VWZA 3FMLA 4BZNA 4AT3A 4ZMEA 4YJVA 5ANJA 2C1AA 1CKIA 4TYHA 3RPYA 3ZC6A 3UG1A 4EWQA 3VBQA 4FG9A 3U6IA 3OW3A 3EB0A 3BYMA 4MH7A 2ZJWA 4NFNA 4RQVA 1AQ1A 1YXUA 1X8BA 2GNIA 3ZUUA 4ASEA 4ALUA 2XK9A 4ZJIA 4EOPA 2R3FA 3Q6WA 4MHAA 4XV3A 4IVBA 4L68A 3KXXA 3U9CA 2O2UA 1YQJA 2BAJA 3ULIA 4C4FA 5HICA 1JOWB 2OO8X 5CT0A 1JAMA 2XVDA 4I5CA 4ARKA 4HGTA 4QQ5A 3EQPA 3EIDA 3VS0A 4AT4A 4D1ZA 5IA2A 4GT5A 4L7FA 4WBOA 4CT1A 5CSWA 3D7TA 4ZS4A 4FGRA 4U94A 4YC3A 1KE7A 3AC3A 4FTAA 4AE6A 5E8SA 3COIA 3CY3A 3OEFX 4HYSA 4C7TA 2Y4PA 5HIDA 2XK3A 4S31A 4AW1A 4ZIMA 3VBVA 5GHVA 3ZXZA 2UZBA 2BKZA 3OP5A 3QC9A 5KMLA 4OUCA 2DWBA 3BZ3A 4AUAA 3G15A 2XNNA 4TYEA 3WZEA 5EYKA 3D9VA 4FEXA 4BF2A 5IEVA 3F66A 2Q0BA 5BVDA 4UYNA 4WOVA 3DOGA 4QYYA 4NWMA 3ZFXA 3CJGA 3PWDA 1YXTA 3F3TA 2GFCA 3KU2A 4FNXA 4AACA 1GZ8A 4FA2A 3GNIB 4U45A 4AGUA 3GC0A 2F9GA 1ZZLA 4UB7A 2C6OA 5CALA 3EKKA 3UOKA 1F0QA 4XYFA 4ZJVA 4X3JA 1G5SA 3TNQB 3E87A 5C01A 2W1DA 3HNGA 4EOIA 3TZ8A 4G3EA 1KWPA 4ACDA 3BKBA 4R7HA 3BYVA 4ZEGA 5BX0A 2HZ0A 2XIXA 4FT7A 4HCUA 3DAKA 2O5KA 4NFMA 5CSXA 5ETIA 5EYMA 1UNLA 5AV3A 1HCLA 1XH6A 3D15A 4BR3A 4X6QC 2GFSA 2A2AA 2QU6A 5IQHA 2PMOX 2OLCA 3QD3A 3TN8A 4U0IA 2B9HA 4DEIA 4EHVA 3GGFA 4Y46A 2X9EA 4QTCA 4USEA 3DNDA 3NNWA 5CU2A 4F6SA 3GC8A 3LFDA 4CMUA 4O83A 3TZMA 3R22A 2B54A 1FVRA 3HECA 2QHNA 4XEYA 5L8LA 4QTDA 3PP1A 4AZTA 5AA8A 2WMTA 1OIUA 3K3IA 3EH9A 4M68A 5J8IA 2W9ZB 5EM5A 5BYLA 2WMWA 2ZDTA 5HTBA 2V62A 1UU8A 4XOZA 4XH6A 4YPDA 4ANLA 3FAAA 4E26A 4DFZE 4AW5A 2CLXA 3LQ3A 5B2KA 1P5EA 4TXCA 5LVMA 4EOOA 5M55A 4BDEA 4IB1A 2FVDA 2XIKA 4U6RA 1XBAA 5HBEA 4ZY6A 2WTJA 3GU5A 4GSBA 4RFYA 3EN4A 2QOBA 4FEVA 3PZHA 2GDOA 4D1SA 3H4JA 3MFRA 4G17A 1BL6A 1M52A 2ITNA 2UZVA 2UVZA 1P4FA 3D7ZA 1H28A 3G0EA 4O91A 3VBXA 5H3QA 4GK3A 5EQEA 1LEWA 3TKUA 2ITXA 3I1AA 4S33A 5CQUA 3FZRA 4JX3A 1XO2B 4RT7A 4FMQA 4WO5A 3ZLWA 2YJSA 5CANA 4PTGA 3L8XA 4BBEA 2GNFA 1PKGA 2Z7SA 5BUEA 3MS9A 3PJ2A 4UZDA 1Q8UA 3KVXA 4QP1A 2C6EA 4OTFA 5CAUA 2W9FB 2H6DA 4IEBA 4HGLA 3FV8A 3UMWA 3NNUA 4QMPA 2ZV8A 3SVVA 1PMUA 5JKGA 2XNPA 1OECA 3HA8A 2IPXA 2QHMA 4FZFB 3LFSA 3F9NA 1GZKA 2VO7A 3OS3A 3BBTB 5LVLA 3Q2JA 1JPAA 3HV4A 4EI4A 2Y4IB 2XNGA 4LV5A 2PMIA 2VX0A 2OZOA 2UW5A 3AMBA 3ORLA 2WTIA 4L9IA 3HLLA 4IAKA 5KX8A 4CFNA 2Z7LA 4FSZA 3OCBA 4M97A 1ZLTA 5CSHA 1WBVA 1T46A 5J7HA 4F09A 4NK9A 1Z57A 4ZZMA 1NVRA 3SC1A 4DH1A 4F70A 3GOKA 1IAJA 3NIEA 5HLWA 5FM2A 4YHJA 5CVGA 4K0YA 4FOCA 4K9YA 1JKTA 4I6HA 4D5KA 3MH2A 3C50A 4GFGA 4PWNA 2QOFA 5J95A 5E4HA 5DR9A 1HOWA 4AA4A 1XWSA 3KXHA 4KIQA 3UIMA 2BRGA 5HO8A 3S2PA 3DXNA 4RWLA 3RI1A 2BZKB 5LVPA 1PRYA 4EK4A 4UWBA 5JZNA 3FPQA 2VRXA 2B9IA 3DT1A 3GBZA 3QKLA 4AOIA 1ZRZA 4WUAA 1TQIA 4TNDA 1GIJA 3H0YA 3CQUA 3H9RA 3PVBA 2A19B 3KGAA 5F95A 3EFKA 2PZRA 4RG0A 2QOQA 1EH4A 3QFVA 5ETAA 2WAJA 3ZO1A 3MVHA 4FNZA 1CKJA 4LGGA 4AZWA 3ATTA 3M2WA 1VZOA 2YEXA 2C3LA 3R9DA 3UO5A 2QOOA 2X2LA 3OBJA 3VUKA 4AF3A 5IISA 1FGKA 2Z2WA 5I5ZA 3IDPA 3GXLA 3EQIA 4YJTA 3C4ZA 4FNYA 3ZDUA 1PJKA 2XM9A 5EDQA 1H1RA 1OL7A 4JDKA 3B8RA 3GFWA 1KE9A 4JS8A 4F65A 3OBGA 5EW3A 2BALA 5DEWA 3ANQA 5EG3A 3WF8A 5FD2A 4EOMA 2J51A 4EQUA 5DOSA 3ZO3A 1UU9A 4XP2A 1URWA 4H1JA 4HPUE 2RG6A 3BHUA 3MPTA 3IO7A 3OTUA 3TIYA 5IQBA 1O6LA 5IZFA 4PL4A 3CTQA 2UW3A 2VWUA 4O86A 2YACA 4CG8A 4U80A 5CEKA 1VYZA 4OTWA 3FC1X 3V6SA 2ITPA 1SMHA 4NZWB 3BHHA 4WZYA 4U81A 3OXZA 4BGHA 1FBNA 5LMAA 4E1ZA 2GCDA 2IZRA 2YN8A 4IM3A 2W96B 3BX5A 4KD1A 3NRMA 2JDOA 3SXSA 5CXZA 1FPUA 2YCRA 4ZSGA 2W7XA 4ZTLA 5HNIX 2UW9A 2OGVA 3TV6A 3TIZA 5IQAA 1B6CB 2BRMA 3BBWA 3SQQA 4M0ZA 3ZZWA 5M57A 3QHRA 4W4VA 2UVXA 4MXCA 4P5QA 4AE9A 3E3PA 1ZMVA 3EN5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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