3TYKA

Crystal structure of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
TATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and function of APH(4)-Ia, a hygromycin B resistance enzyme.
pubmed rcsb
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 295
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2011-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tykA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3tykA02
2I7QA 3N4UA 3Q2JA 4DTBA 5C4LA 2BKKA 5FUTA 4R7BA 3TDVA 3G15A 4U98A 5AFVA 5IQAA 4CG8A 4R77A 4WZYA 3HAVA 2PUPA 1L8TA 4H05A 4FEVA 2Q83A 5EQYA 1J7IA 2IG7A 4DT9A 4DFBA 3FEGA 4O7PA 2CKPA 3C5IA 4FEXA 5IQFA 5IQCA 5IQDA 4GKIA 2CKQA 4EJ7A 5FTGA 3MESA 4ORKA 3SGCA 3W0PA 3W0NA 5IQHA 3W0OA 2QG7A 4BR3A 4DTAA 1J7UA 3HAMA 4U94A 4CG9A 3TYKA 4DBXA 3N4VA 4DA5A 2B0QA 2PPQA 3LQ3A 3W0SA 5EQEA 3TM0A 5BYLA 4O7OA 4CGAA 4GKHA 4DE4A 2PULA 3ATTA 3F2RA 3ZM9A 4R78A 2OLCA 3TDWA 4DCAA 4PDYA 3SG8A 3W0QA 4DT8A 1ND4A 3SG9A 5IQEA 2PUNA 5IQIA 5EQPA 3ATSA 3FI8A 5IQGA 1J7LA 3DXQA 3W0MA 4FEUA 3CSVA 2PYWA 4FEWA 2CKOA 4DFUA 3DXPA 3JR1A 2PUIA 3W0RA 5C4KA 1NW1A 2PU8A 4N57A 5IQBA 3N4TA 3UZRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3QA 1WVWA 5JEBA 4KABA 3KA0A 3OWJA 5LMBA 2J0KA 2PY3A 5ANKA 3ZO2A 4WHZA 1R78A 2V5QA 4FKWA 5HICA 3MA6A 1PMUA 3KXNA 3G6GA 4OTDA 5H8EA 2CLXA 4D9TA 3BHVA 4IX3A 3UNZA 3R8PA 4YU2A 4R77A 5FDPA 2UZWE 2J7TA 4ZY6A 3PY0A 1NY3A 1L8TA 2BZHB 3DBQA 3MPMA 4W4VA 3QKMA 4M68A 5BNJA 4CVAA 4LRMA 3C4EA 4FT0A 4R6VA 4TYHB 3TACA 5FG8A 5CXZA 3LZBA 4JLCA 5HE3A 4YZMA 3HV5A 3Q4CA 3D4QA 1XBCA 3R7UA 2WB8A 4JBPA 3BLRA 4MTAA 3OMVA 3SOCA 1OB3A 5A4TA 3VHEA 4AS0A 4BCOA 4EL9A 4JRNA 1ST4A 4U97A 5DEWA 2FSLX 2BAQA 3V04A 3FMDA 4O7RA 4CT2A 2XZSA 5HE1A 4F63A 2W17A 3A7JA 1GIHA 4CCUA 4O7TA 4NJ3A 3F2AA 3VWAA 4NKAA 3JPVA 4TKSA 4ZSLA 5TF9A 4ORKA 4EZ3A 4F9YA 2YACA 3W0PA 3ZSIA 5EM7A 3R1SA 1OKVA 2ZMCA 3FXXA 3DZQA 4RWIA 4XHKB 4P5ZA 5AIRA 4JDHA 1J7UA 3KU2A 4A9TA 4C36A 2G1TA 2WAJA 3O7LB 2C6EA 1SVHA 4EOQA 1S9IA 2HOGA 2Y6OA 2YDJA 4I22A 4KKHA 4O0RA 3ENMA 2H96A 5DVRA 5FEQA 5HCYA 2UVYA 3PPZA 3TCPA 5JRQA 3O8UA 1CKPA 3W33A 3Q5IA 1ZRZA 4BIBA 1XH8A 4IC7A 4BDHA 4CFUA 4CGAA 4KKGA 5DEYA 2P2HA 2EB3A 4HVHA 4B6LA 3MIAA 2IVSA 4XBRA 1P2AA 4D4YA 4QP1A 1OKYA 4KINA 4IDTA 2WHBA 5HBEA 1BYGA 4QMLA 5CSWA 3VS4A 5AA8A 3OW3A 4UXLA 1JSVA 3COIA 4CV8A 2QKWB 4YJOA 4HCTA 2HY0A 3SRVA 4DG2E 2WTVA 2R3OA 2WTCA 2XK6A 3EL7A 2YERA 3FI3A 1PJKA 2PVMA 1B38A 2R0IA 2BROA 3F5UA 4RC3A 1H1QA 4IX6A 1FBNA 4LG4A 2B1PA 2X6DA 2H34A 4G17A 2PYWA 2VO0A 2QOFA 2IW6A 5AV1A 3QA0A 2UZDA 3ALOA 5LARA 2R3IA 3E92A 4FV3A 4QP2A 5HU3A 4MXYA 1A9UA 1R39A 2WOTA 3QBNA 5CSXA 5EK7A 4GU6A 4AXAA 1ZMUA 2PMNX 5DR2A 1TQMA 3ROCA 4FI1A 2QC6A 2Z8CA 3MJ2A 3PXYA 3KXHA 2PMIA 4IFGA 5AP7A 3R30A 1YKRA 3BHUA 2RG6A 4FC0A 3VQUA 3KQ7A 4B4LA 4AXFA 4I21A 4FSWA 4NL0A 4X2JA 5F95A 2CNVA 4QYHA 4AN9A 3KULA 4X3JA 2SRCA 2OU7A 3SRVB 4AW1A 3HLLA 3FY0A 4FEQA 2GCDA 4U9AA 3KRLA 5J5SA 2JGZA 3R7OA 2ESMA 4ZP5A 3ROYA 2GNGA 4X6RA 3RWPA 4D2RA 5LCJA 4U98A 1Y8GA 3U6HA 4TN6A 3HKOA 4FTOA 4AQKA 2C1AA 3EFJA 4QP4A 4EK8A 3PJCA 2GQSA 3BU6A 3QRKA 1E1XA 3JVSA 4TY1A 5FLFA 4F0FA 4R1VA 1DI9A 1GZKA 4A4LA 5A4QA 3BGPA 5CF6A 1BKXA 3RWQA 4FV1A 3C50A 4LQMA 4FODA 5EM6A 4BYIA 4DFBA 4EK4A 4ZMEA 5TT7A 2J50A 4YPSA 5ETFA 2PTKA 5IZFA 4GCJA 2A0CX 5HCZA 4LV5A 1CM8A 2G2FA 3EN6A 1H26A 3AKKA 3C0GA 3KULB 4C58A 5LVNA 4EQCA 2R0UA 4D4VA 5CEIA 4EKKA 5AWMA 4ZLOA 1S9JA 3QYWA 5I9UA 4RIOA 3OY1A 2CMWA 2UW5A 2VO3A 4GUBA 1VJYA 3FPQA 3VUHA 4ZTMA 5HX6A 2KULA 4LOPA 2HK5A 4ZY5A 3G2FA 3MA3A 4O7WA 3WYXA 2UVXA 2UUEA 2W1IA 5GJDA 3LJ2A 3QCQA 3QD2B 3W0OA 5HZNA 5L8LA 4RA4A 1ZWSA 4NCTC 4JI9A 2WIHA 2F7EE 4FSUA 4FKGA 1OIUA 5C1QB 4I6FA 4CG9A 3H30A 1Y6BA 3D5XA 4I1ZA 2ZV2A 1Q4LA 2WQMA 3KC3A 3N4VA 5D11A 4UWBA 3SOAA 2X4ZA 3HECA 5HD7A 3COMA 5IA1A 5H8GA 3W0SA 4A9SA 2QHNA 5AP2A 4D5KA 3IGOA 3PY1A 5BYLA 5M4CA 1E9HA 5HVJA 2F7XE 4XP2A 4Y85A 5KCVA 4GVJA 4RVTA 4BKJA 3L9PA 3VBQA 4APPA 4MNFA 5EI6A 4GIIA 4UZDA 1PHKA 2ETRA 4OTQA 3EQFA 4NW5A 1WFCA 4RQKA 4PMSA 4J99A 2VD5A 1CSNA 2ITZA 5A9UA 5CF8A 4QP7A 2VTTA 4KBKA 1M2RA 4IB0A 4YNOA 4AXCA 4JG8A 4QMNA 4CMOA 2XJ2A 3BQCA 3CEKA 3AGLA 3IS5A 3GCPA 2UZBA 4IAIA 3FC2A 4GS6A 4JX3A 4O0XA 3UQGA 1RQQA 5M4UA 4RJ5A 3UQFA 3KL8A 2IO6A 2YA9A 3CCNA 4IIRA 4YGAA 3Q53A 4IWDA 4A4OA 4AT4A 2VN9A 3PRFA 2QD9A 3QC9A 4YZNA 3DDQA 4IM2A 3D14A 3RINA 3VUKA 2Y8OA 3FHIA 4L6QA 3CKWA 3FLNC 4M84A 5CQWA 4PWNA 3QUPA 4FBXA 1JKSA 4AP7A 4I6BA 5KKRC 4MWIA 3SLSA 3TV4A 3DXPA 2B54A 3NNXA 4YC8A 3ZZWA 3BV2A 4BTKA 4EH4A 3NIZA 2G01A 4EH6A 1MRYA 4TTHB 2HZ0A 3G9NA 4HVSA 2P3GX 1NVRA 2FVDA 3F3ZA 4J71A 4YMJA 5LOHA 5IQBA 1XMMA 2J90A 1Q41A 2GHMA 2ZFYA 4IJ9A 4ZSEA 5BUJA 1OL1A 3G5DA 4QMXA 3FMJA 2BAKA 2GNLA 1ZLTA 5HE0A 3FZSA 3H4JA 5FBNC 3VONA 2X1NA 4ZLZA 2XH5A 3VNTA 2R9SA 3BL9A 4FVRA 5AAEA 4XBUA 3GU7A 3NDMA 3P78A 4R7BA 3LJ0A 3KMUA 1R3CA 3G15A 2QOCA 4QYGA 3FYKX 1MRUA 2BRNA 5AFVA 4AGDA 5KMNA 2R3JA 5FM3A 3NNUA 2J6MA 4G34A 4C2WA 5AV2A 3FE3A 3A60A 2WMWA 5CENA 5LWMA 3FZOA 4EZ5A 3ORXA 4U8ZA 3P86A 2HENA 3QF9A 4IB3A 2PUPA 4UALA 4A9YA 5KHXA 3HA6A 3EQDA 3AKJA 3FZPA 3HDNA 2QLUA 3LVPA 3PFYA 2E9PA 3WOWA 2YEXA 3G51A 2W4JA 2OJFE 2CNUA 3JUHA 4JR3A 5EQYA 2X39A 3O51A 4ALWA 3LFBA 4FTCA 4G9CA 3IDBA 5E9EA 3BRBA 4QMSA 3LLTA 4DFZE 2XNMA 3VVHA 4HOKA 5CU6A 4X3FA 1U4DA 2IVUA 3QQFA 3RNIA 4DLIA 2VAGA 3RK5A 1R0PA 2X2LA 4IAFA 2W5BA 4EHVA 2VWZA 4FZDB 2O5KA 4F9AA 3IOKA 4TYJA 1QPJA 5M4FA 5FEEA 4RWKA 3A4OX 4ZZMA 4EJ7A 1JNKA 1P5EA 4IX4A 3FZTA 4HVGA 2WMQA 1VLRA 4KSPA 1JLUE 2YHVA 3LCDA 3R28A 4U41A 3BU5A 5AP4A 3VQHA 4IVDA 5M09A 1GY3A 3CQEA 2BFXA 2XIRA 4O81A 4EYJA 4P7EA 2J0LA 2XBJA 3AMYA 3GEQA 1PXNA 4AT5A 2A2AA 2FB8A 1Q62A 4BRXA 3NVKI 4FUXA 1J91A 4DA5A 3SVVA 2WFYA 3QTZA 4W8DA 5B2KA 3II5A 3EOCA 2QNJA 3HEGA 1SNUA 2JBOA 4O6LA 4D55A 1DAYA 2RKUA 4UBAA 2IJMA 4X3FB 4IW0A 4BN1A 4WG3A 3C4FA 3O8PA 3R71A 3WIKA 4ZS4A 4MD8E 1NVQA 2ONLA 3TJDA 3EZVA 3RPVA 3F5PA 2I6LA 3UO6A 5IEVA 4E20A 4L43A 3NLBA 2OZOA 2UW3A 3ETAA 5HO8A 4CRSA 3R8VA 5GIOE 3QWJA 4I92A 4L53A 2RL5A 2ZB1A 4HZSA 2X0GA 4YSMA 4B8MA 5JFVA 4F70A 3PXRA 4ENYA 5KHWA 3ZMMA 4FEUA 2JIUA 4O0WA 2NRYA 3KFAA 2W1FA 4EEVA 4JOAA 4GUEA 4NM3A 1ZAOA 4JAJA 5EW9A 4KA3A 4WOVA 3QALE 4J95A 2C30A 4BZNA 4X2NA 5E8SA 2VTHA 2R3MA 1NW1A 4HCVA 3MV5A 5JT2A 1W7HA 2R5TA 4XOYA 5F9EA 3B2TA 5IH6A 4QMYA 1XBBA 4MXCA 3UZRA 3FQSA 3LFFA 1YHVA 1PKDA 4PV0A 4PRJA 4RVMA 2JLDA 2ITTA 3WF6A 4CTBA 2W96B 2C6LA 4KIQA 3TN8A 4EH3A 3ZBXA 4HGEA 3K54A 2HY81 5BVKA 2XBAA 3TDVA 3LMIA 3LJ1A 3MY1A 4PNIA 5BVFA 5ETIA 1XO2B 5IMXA 3DTWA 3QAME 4GJ2A 4YP8A 4BBMA 2BALA 4LRJA 5FBOA 3QD4A 4AG8A 3R1NA 3F3WA 5AX9A 2ZV7A 3K3JA 4RJ4A 3E3BX 4AXEA 2QOKA 4TZRA 3R1YA 3GBZA 5KBRA 1V0PA 3LMHA 4FSMA 3OXIA 2EB2A 4O0YA 2YIYA 4R7HA 4MNEA 3FEGA 3OUNB 3ZDIA 3GCSA 3DV3A 3EZRA 4AOTA 3DS6A 3QD3A 4YJQA 2ITQA 4WNMA 2RF9A 2DS1A 4EORA 4MQ1A 1KE6A 2HZIA 4V0GA 5T6KA 4O21A 4CZTA 4EJNA 5C8NA 2BTSA 2JKQA 2VTIA 3BV3A 2I1MA 3FWQA 3HV6A 4LOOA 3CGOA 4NSTA 5D1JA 5IQCA 3EKNA 4G2FA 3D83A 5AA9A 3KXMA 3TTIA 4M13A 3G33A 1M17A 1OMWA 5FM2A 3RNYA 4AZSA 1SM2A 3GU5A 2PHKA 4FKLA 2WU7A 5IA5A 4RX5A 3NCZA 4X7QA 3CTHA 3W0NA 4U0IA 4PUZA 1WBPA 2CNQA 3DFAA 2RFEA 3DPKA 3JXWA 2OSCA 5I9YA 3RHXA 3VF9A 2W4KA 3F5GA 2QU6A 5CEKA 3D9VA 3OF0A 1OPLA 2R3PA 3TYKA 4FKQA 3V51A 4YUQA 2WEIA 4RMZA 3V5LA 1HOWA 3R8LA 4AE9A 5EW3A 2YAKA 4MNEB 4D4SA 3LCTA 4IHPA 2O0UA 4HNIA 4TXCA 3ZO4A 2VTOA 1QL6A 4XCUA 4ZJIA 3ZFXA 1U5RA 3MSSA 3BBTB 3LMGA 3FBVA 4V0GB 4EUUA 5D12A 1CTPE 1ERKA 3KCFA 3V6SA 2WTKB 3LQ5A 3LPBA 4MBLA 5JFWA 5C26A 4EHGA 3GNIB 4ANLA 3ZCLA 3W0QA 4GU9A 4DF3A 4RVKA 3NNWA 3UOLA 4E6QA 2YWPA 3GB2A 2PK9A 3AG9A 2YFXA 4CXAA 3JYAA 1Z57A 2PUUA 3AC4A 4S34A 5CLPA 5HG5A 4KKEA 3SXFA 3HMIA 3IPHA 1GIJA 3W0MA 4WUNA 2VGPA 4D9UA 4HCUA 5CAVA 4OTGA 2QONA 3DAEA 4WD5A 2YM7A 4O82A 5AUYA 3JY9A 1FINA 4OLIA 1PMVA 2J0IA 4HGSA 2OFVA 4NUSA 4QRCA 1WCCA 1GZ8A 2R3NA 4FSZA 5DR6A 3V8TA 4FK6A 4BCJA 2VTLA 2GTNA 4DHFA 4K6ZA 3WE8A 2C68A 4EOKA 3GXLA 5EI2A 3IOPA 3R9DA 4MQ2A 2CKEA 3RPOA 3MTLA 1Y57A 3QYZA 4FUYA 1GZOA 2ZM1A 5E8VA 5FTQA 1YDTE 2UW0A 4L01A 4ZOGA 4JS8A 3PA4A 3TV7A 4DGMA 4FSYA 4CFMA 5DWRA 4ERWA 3BYMA 3MFSA 2BKKA 1H07A 4AA5A 3BKBA 4UB7A 3ANQA 1OL6A 2NRUA 4NK9A 1KE7A 1WBWA 2EXCX 3KXXA 3THBA 2VU3A 4BCNA 3SD0A 2JEDA 2C5NA 3K3IA 4KNBA 4BBFA 3O23A 2WXVA 4JMQA 2BR1A 1Y8YA 2C6DA 4TW9A 4U81A 3CY2A 3EH9A 3HAVA 3QQHA 1XWSA 3I6UA 4ZTLA 3DCVA 4A7CA 3HRCA 4FA2A 3R2YA 2QCSA 2RFDA 2O65A 2UW6A 2VTSA 5G6VA 3UTOA 4L7SA 1YXTA 3HNGA 3VAPA 3FXWA 5M51A 2WTDA 1KOAA 5HESA 3KIOC 4QO9A 4OTRA 5L6WL 5B2MA 5CYIA 2WO6A 3REPA 2VX3A 1Q3WA 4LV8A 1ZMVA 4C3PA 2QKRA 4F7JA 1KV2A 5AAFA 4ERKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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