3TYKA

Crystal structure of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
TATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and function of APH(4)-Ia, a hygromycin B resistance enzyme.
pubmed rcsb
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 295
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2011-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tykA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3tykA02
4U94A 5EQEA 4FEUA 2PUNA 1ND4A 4PDYA 5IQAA 3TM0A 3HAMA 4CG9A 2PUIA 4U98A 4DT9A 5IQGA 3W0RA 3N4UA 5FTGA 3ATTA 2PULA 3Q2JA 4DBXA 4CG8A 2BKKA 4FEWA 3N4VA 4DFBA 3TDVA 2PYWA 4EJ7A 3DXPA 3W0NA 3W0MA 3LQ3A 3FI8A 4DTAA 3N4TA 5C4KA 5IQCA 3C5IA 2PPQA 5EQYA 3CSVA 4H05A 4ORKA 3SG9A 3SG8A 5IQDA 5IQIA 3FEGA 3F2RA 5BYLA 3W0SA 5IQEA 4CGAA 2PU8A 1NW1A 4DT8A 4R78A 3ATSA 4FEVA 4DCAA 1J7LA 2B0QA 3W0PA 3MESA 4FEXA 4GKIA 4GKHA 1J7IA 2IG7A 3W0QA 2CKPA 4R7BA 5IQHA 2QG7A 4N57A 4DTBA 3TYKA 4O7OA 2CKQA 5FUTA 4DFUA 4O7PA 3JR1A 5EQPA 3DXQA 4WZYA 4BR3A 3ZM9A 3W0OA 5IQBA 2I7QA 3SGCA 2PUPA 3HAVA 3TDWA 4DA5A 3UZRA 1L8TA 5C4LA 3G15A 2Q83A 4R77A 4DE4A 2CKOA 5IQFA 2OLCA 5AFVA 1J7UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HG5A 4U94A 4UYAA 4YHTA 5DNRA 2YZLA 3I79A 3AT4A 4I3ZA 1CDKA 4IX3A 1U46A 2GFCA 2A19B 4QMMA 3VUIA 2JC6A 4RBLA 4AT4A 4AUAA 4FEQA 4Z7HA 1OVEA 2PZRA 1CMKE 3FZOA 3R2BA 4EHVA 2BHEA 4AWIA 4CG9A 4GG5A 3MPAA 5HO7A 4A9RA 4IHPA 4X0MA 3BEGA 4Z16A 4BCMA 3CTJA 1O6YA 3QTZA 2R3FA 3W0RA 5B7VA 3VUHA 2R5TA 5IA3A 3QTWA 4UX9A 1F3MC 3RM7A 4XOYA 2R0IA 5KO1A 1VR2A 5L8LA 3W18A 4YZBA 4YJPA 5CANA 4QMSA 2YWPA 3R1SA 2BUJA 3MY0A 1RE8A 3UJGA 3VJOA 4KKEA 3UNJA 5EW8A 3ODYX 4FR4A 4HVIA 2IVTA 4XLIA 1SNXA 2C0OA 2ZB0A 4RIOA 5AUVA 3A99A 4BVUA 2C3KA 3BYSA 4FZ7A 4MQ1A 3VW6A 3QX2A 3T9TA 3CBLA 2OH0E 5CZIA 3NDMA 4F63A 1Y8YA 2RKUA 3MB7A 3VS6A 3PE2A 4YZNA 4EUTA 5LWMA 2FGIA 3F5PA 3RZBA 4O7RA 3TUBA 2QOBA 3W8LA 3NR9A 4A9SA 1OECA 2O63A 2XK7A 4I92A 4LQMA 5E4HA 5AP0A 3TZ8A 4H05A 4YJQA 3MA6A 3G90X 4FT3A 4D2SA 1OL6A 1PXIA 3TN8A 1GZKA 3MB6A 3LFDA 5E8SA 3G0FA 1H1SA 1OKYA 5I9ZA 5AEPA 2P2HA 1K2PA 4HYUA 5DR9A 3PYYA 1NW1A 4FV6A 5FDPA 5IH6A 3ZO1A 2GQSA 2KTYA 2ZV9A 4A9TA 3MI9A 3Q9WA 5BVFA 2WMQA 3F3ZA 1CM8A 2HWPA 3C4WA 2NRUA 2ITVA 4YLLA 5T3QA 2WTKB 4CFFA 2GHLA 4UYNA 4BCFA 2HY0A 4BF2A 4XNEA 2VX0A 2XMYA 3BQCA 4G31A 4V01A 1OUYA 1I09A 2VTMA 2PSQA 5D10A 3MGYA 4FSYA 3ZXTA 2OZOA 2YAKA 4O0VA 4XBUA 3NNVA 4W8EA 5EM7A 3W0OA 5EHYA 3NUUA 1YHVA 4FTQA 3OCBA 2WTKC 3DAEA 3E93A 5M53A 2WAJA 4DFLA 5C01A 2BFYA 1W8CA 3W32A 2BIYA 4APCA 3U55A 2WHBA 3BGPA 2PUPA 5HIEA 1H01A 1M2PA 4PMMA 1HOWA 3FL5A 3TDWA 3VAPA 3D5WA 4DHIB 4KA3A 3A7HA 1FINA 2NO3A 4XV9A 5C4LA 3ZEPA 1NY3A 4GL9A 4Y5HA 1WMKA 3CS9A 3OUNB 3U51A 5KMKA 4KRDA 3LCKA 4C3FA 4IZ5A 5JEBA 2OK1A 2X7GA 2WOUA 2BRHA 3OXTA 1J7UA 4TN6A 5CNOA 5J7HA 1FOTA 4M13A 4IJPA 3UBDA 4N0SA 5AV3A 1H07A 4GFGA 4QDVA 1YDRE 2XEYA 3GFWA 4IBMA 2CGWA 4IAZA 4PL4A 4EUUA 3TNQB 3OEFX 3VIDA 5HKMA 1ERKA 3M11A 4IAYA 4RX7A 3MJ1A 4YJRA 5E8TA 4F9AA 4Z7GA 5IDNA 3PSCA 4I0TA 2RGPA 1T46A 5CXZA 2DWBA 4RVKA 4EH7A 2W7XA 4W4XA 1GIJA 2QOOA 3C13A 4MNEB 1WBTA 4U3YA 4IB0A 3ZHPC 2FSMX 3N4UA 3K54A 5DT3A 4UXLA 2CGXA 4EOSA 3UMXA 5IH5A 4XOZA 4I24A 5A6NA 3MH3A 4RG0A 5DT4A 2R3GA 4HYIA 1BL7A 2W5AA 1XR1A 4FI1A 4PTEA 4JOAA 2YACA 4U42A 3WYYA 5HNGA 5CAUA 3G2FA 5IISA 3PXQA 4CLIA 4FOBA 3R2YA 3N4VA 3PP1A 4PUZA 3U8WA 3AC1A 4S34A 3O8PA 4U8ZA 5KUPA 1PJKA 4PTGA 4ANMA 4U41A 3W16A 5L6WL 4JIKA 4LOPA 1YDSE 3F9NA 3S0OA 5M07A 4YSMA 2EVAA 4L7FA 4PTCA 3V5QA 3QXOA 4P5QA 2HCKA 4FVRA 3BQRA 4LG4A 5CAPA 1NT2A 5AAFA 4O22A 3RCDA 4UBAA 5C4KA 3KN6A 3COHA 3RAWA 5F95A 4MUQA 4DEAA 3NW6A 4NM7A 1YVJA 1E9HA 1KE8A 3DZQA 3LW0A 4AG8A 2B9JA 3MPMA 3NX8A 4A4OA 2V0DA 3RNYA 4JDHA 1SVGA 2QKRA 3VONA 5EDPA 5HIBA 3KCKA 4JBVA 2VTJA 2YHVA 3QKKA 3JYAA 2PU8A 4B9DA 3D4QA 3ORNA 5HICA 3OFMA 2OXXA 3F7WA 4TYJA 3NFFB 4TW9A 2VTLA 4FVQA 4USFA 4BC6A 2OO8X 3EJ1A 3H0YA 3PRIA 4R7BA 5CWZA 3FLZA 3CIKA 3O50A 3HDNA 3ACJA 2CGUA 2Q0BA 3DCVA 2GNHA 3A7JA 5JN2A 4L01A 2F57A 4AT3A 3G51A 3VBWA 2CN8A 4WRGA 2PE1A 1ZYLA 3I6UA 3UZPA 3ZBFA 2X0GA 2UW6A 3OS3A 4BB4A 5JH6A 3JY9A 4RJ5A 4FTMA 3RK9A 4ENXA 3MIYA 2PVLA 4I41A 4IM0A 4BR3A 1G8KA 3V5LA 5LVMA 2KULA 3NPCA 4LL5A 4BDEA 1H0VA 3BPRA 3HZTA 3V04A 1Q99A 5HVYA 4U0IA 1MRYA 3ULIA 3ZUUA 4ACDA 5EYCA 1U5QA 3GU8A 3ZS5A 2J9MA 2XAMA 4NW5A 4QYEA 3DLSA 4XEYA 2J0JA 4FIEA 1O9UA 2WMWA 4DA5A 5EI2A 4LDTA 2JGZA 2PVKA 2PZPA 3TCPA 2JITA 4E4LA 2VNYA 4HZRA 1ZYSA 3OWJA 2JDSA 4GMYA 5IH4A 3TNPC 4M3QA 4RVMA 2QO2A 5ANOA 3VUGA 4TYIA 3OTUA 3HV4A 1FGKA 2HXLA 3ZUVA 2O5KA 5EQEA 3OC1A 3Q3BA 4W4VA 4FIIA 4TTHB 2HZIA 3QGYA 4W8DA 4AXCA 4AF3A 1QL6A 5K9IA 2WQNA 3DV3A 5TKDA 1YRPA 5IG1A 3E7OA 5C1QB 2R3IA 5LCKA 4YJSA 4DGMA 2WNTA 3F3UA 4I6LA 2XNMA 3QC4A 3BX5A 4HGSA 4YTHA 3UQFA 5L2IA 3C4CA 4GT3A 1OPLA 5IQGA 5M09A 5FXSA 4AU8A 3SRVB 3LQ5A 5K3YA 4XBRA 2W1EA 1MP8A 3P79A 2OJGA 3RCJA 3ITZA 3QD2B 3D5XA 4G5PA 2OU7A 3DK6A 2WELA 4QYFA 4C4JA 3TZ7A 4UZDA 2QHMA 2VTQA 3R1QA 4AW2A 5JZNA 3KC3A 4G1WA 5JRSA 4DEDA 3QTXA 5HTCA 3PJ8A 4IX5A 3Q5ZA 4MXAA 4YTCA 3BBWA 3EQIA 4Y73A 2F49A 2UZBA 2A1AB 3KN5A 3ZZWA 4CCUA 5FD2A 5HE3A 4YUQA 1H0WA 5EYMA 2JKOA 4YO4A 4JLCA 3VWAA 2HW7A 3NYXA 2VX3A 3HX4A 3CSVA 4IJ9A 4YZMA 3RAHA 4DH3A 2QR7A 3P86A 5DHJA 4IAAA 4EL9A 5IQIA 1R0EA 2GNLA 2PK9A 5JQ5A 1A48A 3OOGA 1M17A 3WZDA 2F9GA 3PY3A 3UDSA 5M57A 4IB5A 3MS9A 2R3NA 3QCXA 2PMIA 4L44A 4F0IA 2ITWA 3QU0A 5CENA 2GCDA 3QTQA 4JX3A 2VTOA 2X7OA 3MTLA 3VQUA 2GNGA 4JBOA 5FGKA 4OGRA 4AA4A 4X21A 3KREA 1OM1A 1M7NA 4CZTA 4EYJA 4I4EA 4ALVA 3DDQA 3G5DA 2ZM4A 5KZ0A 2CKPA 3RPSA 2OZAB 3S2PA 4FICA 3TYKA 4YC8A 4PNKA 5CTPA 2IZUA 5DGZA 3UMWA 3I7BA 4EQUA 4Q9ZA 4QMQA 2C5NA 2J5FA 2UVXA 3BIZA 5EQPA 4C58A 5E8WA 5JGDA 2OF2A 4QP1A 4E6QA 3SHEA 3KB7A 2ETKA 4Z55A 3OWPA 3GI3A 3DGKA 4YURA 5HCYA 2ITYA 5IQBA 1DI8A 2CDZA 4IWQA 4KWPA 5IMXA 5L2WA 3P78A 4IDTA 4EH2A 4HNFA 2BZJA 4WIHA 3EQDA 2BRBA 3D15A 3TZ9A 5CY3A 3F2AA 4HJOA 4HPTE 3UP7A 4OTHA 3U6IA 4A07A 5EDQA 4ZLOA 4PDPA 3UZRA 3UQCA 3ML1A 3V5PA 1BYGA 2VWWA 2CNQA 4I5PA 5E8ZA 5A9UA 3NYOA 1IG1A 3NGAA 4R3RA 2YZAA 4BICA 4O0UA 4C33A 4XUFA 5LOHA 3R6XA 1H1WA 5F94A 2XA4A 4QMOA 2X4ZA 5HCXA 4BIBA 4AN9A 2W05A 2ONLA 2X8DA 4F65A 4H3PA 3UIUA 2O0UA 5TO8A 3UTOA 3DFAA 3KXZA 1XQZA 3WZKA 3ZUTA 5A4QA 2J0KA 4G3FA 3C4EA 2VWYA 3ORKA 3FI2A 1MUOA 4GRBA 1EH4A 4R6VA 2PTKA 5TOZA 2ZB1A 3PXZA 3EQPA 4QP6A 1ZMVA 2V5QA 3CD3A 3PP0A 1ZRZA 2PUIA 3BEAA 3PJ3A 2YFXA 4ZTRA 3ZZEA 5M08A 3UPXA 1VJYA 4GK2A 4L45A 4AP7A 3O5AA 5FTGA 4J53A 5LJJA 1Q8ZA 2BTRA 3HGKA 1KV2A 1ZLTA 4CG8A 4O0TA 4NKAA 3F3WA 4M14A 4DFNA 3DB6A 4M7IA 4BCQA 1PKGA 1VYZA 3D7TA 4E26A 4H1JA 4F70A 3HMIA 5LXMA 4KSPA 3W10A 4MCVA 2WTWA 5KMOA 2VZ6A 4RMZA 3BRBA 3FSKA 2ERZE 3V5WA 2VU3A 3FXXA 3QRUA 5M4CA 1FGIA 1OB3A 5AM7A 4F0GA 3DBFA 5EFQA 3W0NA 3W0MA 2BTSA 2XK8A 1BKXA 2QODA 4F1TA 3O8TA 3R7YA 4TZRA 2ZM1A 3O7LD 4NW6A 4QP2A 4QMZA 5BNJA 3FPMA 3SAYA 4F7SA 3FJQE 3Q6UA 4FTOA 3UIMA 5BYZA 4U6RA 3ORIA 1ZOGA 5BYYA 1XH6A 3RMFA 5JFXA 4QP3A 2HW6A 3ROCA 4ZJJA 4QTAA 2JKKA 5K5NA 4BJJA 4C7TA 2UW3A 1CKIA 1IEPA 4F6SA 3GUBA 5AV2A 3BCEA 4X3FA 1GZOA 2G1TA 4R1VA 4A9UA 2BZIB 4I5MA 3EIDA 3EOCA 3L8PA 3AGLA 1DM2A 3BKBA 3QCSA 3FLYA 2IG7A 3MBLA 3GOKA 3JVRA 3HA8A 4MAOA 1Y57A 4KBAA 3VS5A 2J0IA 5LMKC 4GJ2A 1VZOA 4BCKA 1IAHA 4HZSA 2YM4A 2EXMA 4IVDA 5K5XA 3C0HA 4DFYA 4DTKA 4QMTA 4AXAA 5HG8A 1S9IA 3MVLA 5LVNA 3GENA 4RQVA 4C3PA 5KMLA 3RHXA 3UO4A 4RX8A 4G6NA 1Z9XA 1L3RE 3HEGA 1PMVA 2XKDA 1YWRA 3EKKA 4W4WA 5LVOA 2W4KA 4I21A 3NZ0A 1YI6A 4R5SA 4R7HA 3QYWA 4ZS0A 4NUSA 4AT5A 4F9YA 3AMYA 4QMWA 1A9UA 2JLDA 2IJMA 2RFDA 4FIHA 3IG7A 1JQHA 3KVXA 2Z60A 2WKMA 3FBVA 2W1DA 3QZFA 3BGZA 1AQ1A 4X2KA 3VBXA 3F7ZA 4EOOA 4FSZA 1XKKA 3QUPA 3QKLA 3NIEA 1W84A 3HUBA 4M0YA 4AZEA 2UW7A 3ORMA 1YXTA 4P5ZA 4XG4A 2XZSA 4ZOGA 1TKIA 3ZO3A 3DTCA 3VBQA 1RW8A 5ACBC 3CTQA 2ZVAA 2OLCA 3LJ1A 3MH2A 4EK8A 4N70A 3EN4A 4FKRA 3HV3A 3VNTA 1M2RA 3UG2A 5DPVA 5JRQA 1QPJA 2X8IA 1BLXA 4XS2A 2X1NA 3W2OA 2C3LA 2ITXA 2QOCA 3BHYA 3F5UA 3LCSA 4ZTSA 3R63A 5KX8A 2I6LA 4ANBA 4ACHA 2ZDUA 1JVPP 2FSLX 3CXWA 2XNOA 3NYVA 3ORXA 4L67A 3MH0A 5FDXA 5J9LA 3GU7A 4YC6A 4L53A 2F4JA 4U5JA 1UU3A 3EN9A 4M67A 4JG6A 1G5SA 2X2LA 4RWLA 4LRJA 4O0RA 4CMUA 2ETRA 4RC4A 5C9CA 4MX9A 5E1SA 4ZAUA 2IVUA 5E9EA 5A4EA 1UU7A 3E5AA 2HELA 4FEWA 3HL7A 2R64A 3MY1A 4K18A 5KE0A 5IA0A 4KKHA 2OF4A 3MVJA 4MXZA 4I23A 1FVVA 5HLPA 4WD5A 3PPKA 4IWDA 4YPDA 2BDJA 4L7SA 2B9HA 4Q2AA 3EB0A 3HUCA 3CGOA 2OKRA 5CVFA 5KKRC 4EONA 4IFCA 3BE9A 1JKSA 4OBQA 4NTSA 3WIKA 5LARA 3FI8A 4FSUA 4D58A 1NVSA 3RALA 4AE6A 2B7AA 2X81A 3TG1A 3IOPA 4RLLA 5T68A 3PA5A 5HE2A 4NFNA 4UEUA 2H6DA 1TFFA 2XCHA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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