3UDSA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with adp.
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
433
structure length
365
Chain Sequence
EMILEWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKAVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENILKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPIALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inositol phosphate-induced stabilization of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase and its role in substrate specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 107
structure length 365
sequence length 433
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3udsA01
4AXFA 2XARA 2XAOA 4LV7A 4AXCA 2XANA 4AXEA 2XALA 4AXDA 2XAMA 4AQKA 3UDSA 3UDTA 3UDZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5E8UA 4E73A 4J1RA 1WBTA 1Y8YA 2RKUA 2VTLA 1IASA 2JKKA 3HUCA 1OB3A 2ZV9A 1WBSA 3EN6A 1OBGA 3Q2MA 3VHEA 5HU9A 4QYEA 2ZVAA 3SAYA 4U45A 3ODZX 3QQLA 4IC7A 2WTWA 4QPSA 3TIYA 3B2WA 3GENA 4R5SA 4YZNA 3QXOA 1W83A 2QO2A 4MXXA 5BMMA 3BGPA 1U5QA 4ZJJA 3D94A 2R64A 4AXDA 4K8AA 4DH7A 2WQNA 4L00A 1JSUA 4EJ7A 3K3IA 3K5VA 1QPDA 2ZYBA 4JR3A 4X2JA 4F7JA 3C4WA 3AOXA 4FICA 1YXVA 3TNWA 3DZOA 2G9XA 4CLJA 4ZSJA 2JAMA 5A14A 2PZIA 4DINA 1TQIA 3NAYA 2P55A 3O8PA 2UZLA 5D11A 3VQUA 2ZM1A 3LFAA 1F0QA 2EU9A 4FTMA 1IA9A 3QGWA 4AGCA 2V22A 2UW8A 4DLJA 5HG9A 2BZKB 3KVXA 5DR9A 3JYAA 5C9CA 5CSWA 4BTFA 3QLFA 5DT4A 2HZ0A 2WOUA 4HVDA 5AUXA 3NUAA 3P9JA 2BRHA 3ZZEA 2I1MA 2OH0E 4ZMEA 3GOKA 3E5AA 3PJ1A 1J1BA 2QU5A 3N51A 4FK3A 4TYGA 2H34A 5C27A 3ZXZA 1PXKA 2CNQA 2XZSA 1FGIA 4AFEA 3WARA 4CV8A 4Z55A 3T8OA 4DEGA 1WVYA 5L6OA 4EC9A 4X0MA 4BCQA 4DFLA 1PJKA 3NLBA 5J1WA 5CZHA 5DYJA 4V0GA 2QURA 4IAZA 5KZIA 2FVDA 4FSYA 5EM8A 4K18A 4ZEGA 5HNIX 3VNTA 2W17A 3IW8A 3KRRA 1M7NA 3FC1X 4NTSA 1V1KA 4FT9A 4USEA 2AUHA 1QL6A 4BCNA 4FUYA 3H9RA 4CMTA 2XARA 2XVDA 2JFMA 4IX5A 4JNWA 4TYJA 4CFUA 2GNFA 1SM2A 5AV0A 3I60A 2VWZA 3ORLA 3R9DA 2JDSA 2PZRA 2ITOA 4I4FA 2QOKA 3EKNA 1LEZA 4EBWA 1H26A 3LFDA 3UMWA 4J7BA 4W4WA 4K1BA 1DAYA 3P86A 1T46A 4KBCA 4AOTA 2YZAA 5D9HA 4AGWA 3DKFA 3NUUA 3HRBA 3PXRA 4LL0A 2OZAA 3KXNA 1DI9A 2ZV7A 5FDXA 2YWVA 3E8CA 4QMOA 3RPYA 4B9DA 4F78A 3BI6A 4DHJA 3FMEA 2IZRA 2OFVA 3I6UA 1UVRA 2W1IA 4L45A 4QO9A 2BILB 1JKSA 1KE5A 3QL8A 2PUNA 3PE1A 3FPQA 4BBMA 5CF6A 5LXMA 1M17A 4E93A 3BE9A 4FMQA 2VD5A 4LFIA 3BCEA 4GJ3A 3FEGA 4ZTHA 4AW2A 4BDCA 4D1XA 5LVNA 2X4ZA 4C3FA 4ZXTA 3S4QA 2XNNA 3ORIA 3KFAA 3OCGA 3Q6WA 3SX9A 2A4LA 2R2PA 3DKOA 1ZXEA 2O5KA 2E9PA 2P33A 2Z2WA 1IAJA 3ELJA 3KRXA 4QQTA 4RX5A 5I5ZA 3R21A 2IW6A 3AC1A 5EW3A 3OY3A 3QD2B 3V6RA 5IZFA 4M69B 4CKJA 5GJDA 4BI1A 4DG3E 4YJNA 5M4UA 3BHYA 1XMLA 2ITPA 3FQHA 2XIYA 5HIDA 4X2NA 4K2RA 1RDQE 2OIQA 2PVLA 4H3PA 3W0MA 2OF2A 4QQJA 2C6IA 2YIRA 3SKCA 3VUGA 4DFXE 4LRKA 1Q61A 4BB4A 4GSBA 3UNJA 1XBBA 4PMMA 4WG4A 3ZUTA 5F9EA 1KE6A 4Y73A 5HD4A 2Q0BA 4O0SA 5TT7A 4BCGA 4JAIA 2PZPA 5ETIA 1U54B 2CMWA 2BKZA 3SHEA 2XBAA 5T6KA 1YDTE 3LVPA 4LI5A 5M56A 4JX7A 4AW5A 3CD8A 4TYHA 3LMGA 5EI8A 3CCNA 4DCAA 3ZCLA 4FVPA 4C62A 3TG1A 5KMMA 3EOCA 2VWIA 4EOPA 3KK8A 4QOXA 3IKAA 4ZTQA 4AGUA 2QOBA 4FV1A 5EM7A 3FDNA 5BVNA 2QHMA 4KRDA 3L9MA 4DE4A 4YC3A 5EYDA 5CLPA 2W1HA 2UZUE 4I1ZA 3SW4A 1Y8GA 4L01A 2PZ5A 2GHMA 3H10A 2VO0A 3RI1A 3NYVA 3OEFX 1O6KA 4F7LA 5IG1A 4IM0A 4TN6A 5DLSA 5CAOA 5L2TA 4G17A 4IM3A 2QKRA 3L8XA 3TDVA 5ANOA 2HW7A 4L53A 5GHVA 5HCYA 2R3MA 1M2RA 4IB1A 4I6BA 5HLNA 4AZSA 5IEYA 3TWJA 3NFGB 4ACHA 2OWBA 2J0IA 5F4NA 2PL0A 2B7AA 1R78A 2JAVA 2XKDA 1MRYA 1H01A 3BLRA 4IB3A 2ZM3A 4JJRA 4JT3A 4JG7A 1H24A 3E3BX 5LMAA 3QQGA 4YJQA 3D5VA 2G2FA 3EZRA 4DGNA 4H1JA 2YM5A 4GEOA 2QC6A 3NNUA 5LJJA 3QALE 1PMUA 3H4JA 4D1ZA 2YM3A 5DN3A 4CFMA 4RC3A 2XEYA 5IH5A 3QYZA 4Q9SA 4J53A 4NTTA 5AP3A 2YCFA 1NA7A 3EN7A 3QCSA 4TYEA 3ZFMA 3AXWA 3GCPA 3IGOA 4S31A 3QCXA 2UZWE 4KS7A 2WB8A 4PY1A 3W8LA 5A9UA 1U4DA 1OM1A 3TYKA 2I0VA 3MPTA 1O6YA 3FC2A 4ERWA 4LGGA 3OBJA 3V3VA 4APCA 2WTDA 3ORTA 3QWKA 4W4XA 2P2IA 2YM6A 2DWBA 3UVQA 4UWBA 3WF7A 2E9OA 3F6XA 4ZIMA 3BV2A 4CTBA 4ZLYA 2J0KA 1ZRZA 3EIDA 5I9XA 4PQNA 5AA9A 5FUTA 4BGQA 4GK3A 3FY0A 1LPUA 2OH4A 3T9TA 3ACJA 2R7BA 3CS9A 5M08A 2FYSA 2QR7A 4ACGA 4GFMA 2BZHB 5ANGA 2YIYA 3RVGA 2VUWA 3AKLA 3IOPA 2GS2A 2R7IA 1H0VA 5KO1A 3EYHA 3GC8A 5AUYA 1UV5A 3I0QA 3LFEA 1YW2A 2ZMDA 4J8MA 2QONA 2C3LA 3QQHA 4G9RA 4O21A 1L8TA 3Q9WA 3FMLA 5IEXA 3AQVA 1DI8A 3PA5A 4I24A 1DM2A 4Z16A 3ORXA 4WNOA 2VTIA 3NUPA 3Q9XA 4H3QA 3AD5A 5BUIA 3V5QA 2PUUA 1HCKA 3F61A 3VS2A 3DFCB 2UW4A 2H96A 4CKRA 4KWPA 4C4GA 5J9YA 2WEIA 2VTSA 4O27B 4JBPA 2EXCX 5IU2A 4FSMA 4U40A 2ESMA 3U6IA 4AF3A 1XH9A 4BBFA 4HNIA 2BAQA 3DQWA 3FLQA 3F3VA 3W8QA 1CKJA 4F9AA 3Q4UA 4TY1A 3LQ5A 1SMHA 2DUVA 3QQUA 4KKHA 2B53A 3MVLA 4O7TA 5FDPA 2C1BA 5FGKA 4EBVA 4FKTA 4MX9A 4DGMA 4F9YA 5IA5A 2C3KA 3FSKA 4ZSLA 3EKKA 3VF9A 4FIIA 4F63A 2WIHA 4L7SA 5JQ5A 5KBQA 3UP2A 4DFNA 3QUEA 3KULB 4C58A 4OW8A 2BCJA 2Z7QA 3MA6A 5EI6A 3AT3A 4XX9A 3D9VA 4PMPA 2GTMA 3DV3A 1DAWA 4FX3A 4XV3A 3FKOA 1XR1A 4RT7A 3VJNA 1RQQA 4MD9E 1S9IA 2VWXA 4Q9ZA 4ZZNA 4F70A 2R3IA 4DEHA 4DG2E 3PP0A 3OXTA 1JBPE 3GBZA 4ZSGA 2ONLC 3A60A 3VS1A 4DA5A 4EH3A 1J3HA 4AS0A 3CIKA 4KD1A 3UIBA 1IEPA 1YOJA 4YZBA 2W1EA 2VRXA 3GCVA 4I23A 3LXPA 2OXXA 2W1FA 4JG6A 4QNYA 3DJ6A 4BRXA 4BDAA 2LGCA 3NIZA 4RIWB 4XG2A 5EOBA 4UALA 1VEBA 4KNBA 2BRMA 3BHHA 2Z02A 1VYWA 3DQXA 3VBVA 5A6NA 5LWMA 3PDTA 3FLNC 3CE3A 2IW9A 2Y4IB 3BYVA 4FTJA 2XNEA 4Y5QA 3Q53A 4M68A 4YTHA 4YLKA 3T3VA 3TIZA 3LXLA 3ATTA 2J50A 4FNXA 3LFSA 1IR3A 1M2QA 3ZZWA 4FEWA 4Q2AA 2J4ZA 3I7CA 4XG6A 5M44A 4HYHA 4AXFA 3UZTA 2Q83A 2C0OA 3SGCA 4EHGA 4FL2A 1J7LA 2A2AA 2V62A 3DBDA 4FTQA 4PWNA 2ZV8A 4ZTMA 1JWHA 3KA0A 2OU7A 3PRFA 4ASDA 4IADA 3E3PA 2JITA 3G6GA 4IAKA 3VRYA 3FI4A 4GMYA 1WFCA 3UODA 1SYKA 5CT7A 3VUDA 1GZNA 3DZQA 5EW9A 1KUTA 5H3QA 4X3FC 3CXWA 3LKMA 3A4OX 3MVHA 3P08A 4A7CA 4LMNA 1FVTA 2GMXA 2WTKB 4FTNA 3LM0A 2VN9A 1BLXA 3HKOA 3UOLA 4CFFA 4I0RA 1H4LA 4DDGA 4EH7A 1XQZA 2XJ1A 4DHIB 3AC4A 3C4EA 5J8IA 2F4JA 2FSTX 5CVGA 2CLXA 2OFUA 3PZEA 4CG8A 1YWVA 2XF0A 3DTWA 3KB7A 4O7NA 2A0CX 1EH4A 3PPZA 4L46A 4XS2A 3SOAA 3UIMA 3ZSIA 2XK7A 4A9UA 2OJFE 1RE8A 1AD5A 4YJUA 3NUYA 4U79A 4XBUA 4BICA 3UOHA 1Z57A 1OI9A 4WBOA 4F1TA 3MW1A 3DOGA 3SXSA 4GK2A 4EQUA 3TJCA 5CU2A 1MUOA 1E1XA 3Q04A 1JQHA 2B1PA 2WMVA 5DT0A 3OROA 3CLYA 5C4KA 4O84A 4U7ZA 3HP5A 5D7AA 4L67A 5BVEA 1Q8ZA 4C7TA 4FSNA 3CBLA 2GHGA 5C8MA 5HVKA 4GL9A 3OFMA 2VTMA 5LMKC 3BLQA 1ZOGA 4GVAA 4K9YA 3BBTB 4FUXA 3ZYAA 4IANA 3QZHA 3LXKA 4E26A 3BBWA 4CRLA 4F7NA 3AC2A 3MIYA 4GFGA 1T45A 4QYFA 5HVJA 4RVTA 2QQ7A 3B8RA 4KIPA 3GC9A 4NYEA 4AQKA 4HYIA 4DHZA 4OT5A 4GT3A 3R1SA 1SNXA 4DGOA 5FLFA 4GH2A 3MVJA 3DGKA 4ANLA 2VWUA 3PRIA 5FQDC 4BC6A 4YTCA 2DQ7X 3V5PA 3AMYA 5HO7A 3VUKA 4F64A 3D4QA 3EFLA 3NFFB 5T68A 2WMUA 3GC7A 1YOMA 2CCIA 3CKXA 2YIQA 4O7ZA 5AP1A 5HD7A 3RPOA 3EQCA 3TDWA 4EOSA 4RA5A 4TWNA 1VLRA 4KKGA 4D9TA 1H0WA 4UZDA 5HEZA 4A4XA 4ZZOA 3IONA 3R0TA 3W0PA 3ZTXA 3MSSA 5HG5A 2OKRA 4JS8A 5BYLA 3C9WA 4D4RA 5FEDA 4UB7A 3W2RA 3R63A 4EORA 2YWPA 4FKRA 4FC0A 3BL9A 4JIAA 3FWQA 1Y6AA 2GNGA 2UZNA 4QQCA 5EG3A 2WELA 3DA6A 1H08A 4R6VA 5FXQA 5BNJA 5BPYA 3SRVB 4NJDA 1A48A 3EH9A 3ZFYA 1Q62A 4DFUA 3CSVA 5B2MA 3IQ7A 2WMQA 5IQCA 2XMYA 3DS6A 4K0YA 4NL0A 3ORKA 4F9WA 3SXRA 4A07A 3DAEA 2JD5A 4I6QA 3HMNA 2BZJA 3O50A 4YO6A 2XJ2A 3FMKA 3RAIA 4Z7HA 2XNMA 2X2KA 5EYMA 1OIYA 4ACMA 5CANA 2IVVA 1I44A 4O91A 4CQEA 3SVVA 4EHEA 4FG8A 1WBOA 2XNPA 3EQBA 3TTJA 4O6EA 2B9HA 2C5VA 3CTJA 3MBLA 3GNIB 4BCIA 2DS1A 1GOLA 3F3UA 4S33A 4TWPA 5IA4A 5FRIA 4H3BA 3G33A 3R1QA 4F0FA 1ST4A 3P7BA 2PE2A 1Q5KA 3LCKA 4O81A 2OLCA 4H36A 4ACCA 3A61A 2QO9A 2BHHA 3QTZA 3E88A 4FZAB 3H0ZA 4H58A 3SOCA 2HXQA 3DFAA 4EQMA 4LL5A 4L3PA 4JVGA 1JSTA 1M7QA 2DYLA 2F9GA 3ZONA 4YNEA 4YZ9A 5H8EA 4D1SA 2H8HA 3R83A 5GIOE 1FQ1B 3EFWA 2CNUA 5I9UA 1KV1A 4IJ9A 1R39A 1G3NA 4WKQA 2X8EA 4O0UA 4EH6A 5IMXA 3IG7A 3RGFA 3GGFA 3R7YA 1GIHA 3MYGA 4DBNA 1K3AA 2ITYA 4XP3A 3UIUA 1OKVA 3VO3A 3DBCA 5JRQA 4UBAA 3C4XA 1URCA 2IVSA 3N4TA 3MH3A 4WRGA 1MRVA 2PULA 1G5SA 5G1XA 2C6EA 2FUMA 2UUEA 3GCQA 3NUXA 4DTBA 3G2FA 3RCDA 4BYJA 2P2HA 5EHLA 1GNGA 3VS0A 2Y4IC 2WMAA 3VJOA 4QMUA 5DOSA 4YTFA 3QZFA 4I5PA 4UXLA 5FEQA 1TQPA 3CKWA 3WF5A 4L42A 4YLLA 4EJNA 4RZWA 5AAGA 3BHVA 5ETFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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