3UDSA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with adp.
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
433
structure length
365
Chain Sequence
EMILEWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKAVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENILKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPIALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inositol phosphate-induced stabilization of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase and its role in substrate specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 107
structure length 365
sequence length 433
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3udsA01
2XAOA 3UDSA 4AQKA 4AXFA 4AXDA 2XAMA 2XARA 2XANA 3UDTA 3UDZA 4AXCA 4AXEA 2XALA 4LV7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F69A 3F2AA 4QYFA 3DS6A 3FXWA 4IC8A 2QNJA 4RFYA 1ZZ2A 4TYIA 5I0BA 4L6QA 1Q8TA 2BALA 3W2SA 5FEDA 2VX3A 3I7CA 2VRXA 4G17A 3Q4TA 1BMKA 3R7IA 2UVYA 4E4XA 3KY2A 4A9TA 3BBWA 4RWIA 3BEGA 3NR9A 1ZYSA 3C4XA 3ZTXA 3QRJA 4GW8A 3PYYA 3E87A 1VJYA 5DI1A 2J2IB 3ZLXA 4QYGA 4JDJA 5CI6A 2VWZA 4IAKA 3CJGA 3IO7A 3AKJA 3O0GA 4JQEA 1FINA 4NJDA 2CSNA 4FTMA 4I6LA 1YDRE 4QMLA 4FSTA 4H3QA 4UWCA 4LL0A 3RK9A 4QQ5A 4FZDB 4AOJA 4DA5A 5ANEA 3QD3A 1W7HA 3ZBXA 4RX8A 4X2KA 2PTKA 4FSRA 4L3PA 3PY1A 2GFSA 2XRUA 4R7HA 5E8ZA 3GEQA 4FKVA 1XBBA 5LCKA 3BEAA 4E5BA 4FEXA 4FG8A 5AUWA 4TL0A 4LRMA 4RC4A 3W0PA 3F5UA 4IZ7A 2UW3A 4YLLA 4BI1A 4DGGA 4EZ3A 4RLKA 3QALE 3SOCA 4CFMA 1YWRA 4FUXA 3MI9A 3MFRA 2GFCA 1H24A 2ITWA 1JSVA 3MFTA 2W17A 2ZM4A 3M11A 2VWVA 1S9JA 3DBDA 5FDPA 2ZOQA 3KQ7A 5CZIA 2CLQA 4NFMA 1T46A 3BV3A 1YI3A 3OUNB 4X3FB 1J7IA 4O38A 3UMWA 3UZPA 2XF0A 5CASA 5EOBA 3C7QA 3EN4A 4RZVA 4EI4A 3O8PA 4KKHA 5HX8A 3CSVA 2OKRA 4IAAA 4TYEA 4OR5A 5AUZA 5IA0A 3D5UA 4GK2A 3D7TA 5JKGA 1PXLA 2R0IA 4QP6A 2E9UA 5HQ0A 1BKXA 3KMWA 5TF9A 4U45A 4ACGA 5DN3A 5IQFA 3G33A 3AMBA 3VS2A 4QMUA 2OXDA 3IQ7A 4L8MA 3ZRMA 3RAHA 3SV0A 1OIUA 4MHAA 2QLUA 3OUKA 4RX7A 2PVMA 2B0QA 4EOLA 4DGNA 3FZRA 3KRRA 4BDHA 2IPXA 4J96A 4X2GA 4DTBA 3HV5A 2RG6A 4Y83A 4Y5QA 2W1IA 3FYJX 4R3RA 3MYGA 4C4JA 1W84A 4I4FA 1ST4A 3FY2A 2YDJA 5JEBA 4GK3A 3PLAE 1JSTA 3OOMA 2CGUA 3WE4A 4BCFA 1WBTA 1MQ4A 2RL5A 3GU5A 5H8GA 2ZV9A 4GUEA 4RT7A 3RPYA 4EHEA 2J4ZA 1IRKA 1U4DA 5GJGA 4CRLA 4RMZA 4CG8A 3DK7A 3MA3A 4YZNA 3R28A 2XIKA 3NUPA 3GXLA 1BX6A 2AC5A 1O6KA 3O50A 4JG7A 1RDQE 3VW6A 2OIDA 3COHA 3S0OA 4OTDA 2B55A 3G15A 3LFDA 5HE3A 2F7ZE 4C4GA 4F1OA 3OMVA 5KHWA 2CLXA 3EH9A 3FQEA 2ERKA 3PPKA 4RWKA 3W8QA 3D94A 1PXKA 1YKRA 1OPKA 1ZY4A 2BRBA 3QXOA 4KIOA 1Q3DA 3HMMA 4C3RA 2IN6A 3P08A 5K5XA 2J9MA 2VTMA 2YM3A 3CQUA 3HRCA 4BCJA 5IU2A 5CEOA 2W1GA 2WTKB 3C0HA 3LQ5A 3Q9XA 2XIXA 4D55A 2B52A 2BFYA 4FTCA 3PP1A 3HP2A 2XM8A 4G34A 4FTTA 2FUMA 4QYYA 2F4JA 3I0OA 2XJ0A 4F08A 3IS5A 2YISA 1XMMA 3P78A 4IADA 5HVYA 1Q8WA 3CE3A 3MY5A 3FXZA 1Y57A 4FYNA 3ZFMA 3VQHA 2OJGA 2OJJA 3MJ2A 2E9NA 5LOHA 2XNBA 2YJSA 1WFCA 4AE6A 2GNJA 4AZSA 3L1SA 3OWKA 4W4YA 3H0ZA 2P55A 2UV2A 1ZMWA 2RFEA 3HRBA 3LCDA 4KS7A 4L44A 3UC4A 4APCA 4AUAA 4AXCA 3DA6A 4XBRA 4EHGA 2VTAA 5M4IA 3LVPA 3GQLA 5CU4A 4ANQA 3R1SA 5IZFA 1Q41A 2P4IA 4NT4A 2J0JA 5CENA 5EM7A 4B99A 3ROYA 3V5TA 5I9UA 3L9PA 4YZCA 4FV2A 3LPBA 2B7AA 3G6GA 2YFXA 3ZLYA 4F7JA 3CGFA 3IONA 4EH2A 1UU7A 3EIDA 4J53A 4OBOA 2YACA 4QTBA 5EW3A 3ZSIA 5KMNA 4WBBB 3NYVA 3OT8A 4FKTA 4MXCA 5M06A 4XG2A 1FBNA 2G1TA 5FUTA 4LMUA 1BL7A 4F78A 2WGJA 3GGFA 3PXRA 2W5BA 3QCQA 3DXQA 4CMUA 3UQCA 4AGUA 4FSNA 4MNEA 5HG7A 2R7BA 4FTUA 3F3TA 1OECA 4JIKA 3PUFC 4EKLA 1U5QA 5GIPE 3SC1A 2PHKA 3LFCA 4DDGA 3OVVA 4OTFA 2YZLA 3JUHA 1G3NA 4I5HA 3R22A 3I6WA 4CFVA 4GCJA 3OHTA 1YWNA 4FL3A 4BZDA 1DAWA 4EWHA 2UW4A 3IW5A 2BUJA 4AXFA 2BROA 3DQWA 4PQNA 4QEBA 4GH2A 4AN3A 3TNWA 5DE2A 3QC9A 4FKUA 3VBQA 5F9EA 4C34A 2BAJA 2CNVA 3EN5A 2B54A 3Q52A 4U80A 4L00A 4CCBA 1KOAA 2O63A 3EFKA 4C7TA 2UW0A 3QGYA 4MEDA 4EONA 3VUKA 4DBXA 2XALA 4YPSA 4WUNA 4NSTA 3AC3A 3UDSA 3FMJA 3NFGB 2X7OA 3G51A 3K3IA 4A07A 4RJ6A 3VC4A 3VS7A 2WMQA 4OW8A 2JDOA 4FV8A 3PE1A 4XP0A 3CTJA 4KUJA 4ASDA 3WZJA 1E1XA 3BWJA 3JY9A 3S00A 1Q3WA 2WMBA 2YCQA 3AT3A 3DY7A 5HCZA 5IA3A 3W0NA 3EQGA 4FKPA 1M2PA 3I0QA 4BZOA 3PDTA 3QD2B 4XOYA 5LVPA 3BCEA 3DOGA 3R1NA 5DT4A 3D15A 2ITPA 4ZLOA 4IX3A 2CKEA 5CQWA 4ALWA 2OF2A 1FVTA 4O96A 4F0GA 5BVOA 3V8TA 5AP3A 4HZRA 4D4YA 3TI1A 4OLIA 1OVEA 1EH4A 3PWYA 1IG1A 4AZVA 3JY0A 4DG3E 4WOVA 5CZHA 2W4OA 3QHWA 4FA2A 4BBMA 2HWOA 3RVGA 1KE9A 4ZJIA 3LQ8A 1YRPA 2PE2A 4OTRA 1XQZA 2VD5A 5BVEA 4ZIMA 5DPVA 3DGKA 1KE6A 4IWOA 4M0YA 1JKSA 1UKHA 1WVYA 3DDPA 4IWQA 4XJ0A 3PY0A 3SHEA 4Y46A 3VUDA 2WMXA 5HICA 5FM3A 3FMLA 2WEVA 1OB3A 2C6EA 1WCCA 2JFLA 3FMNA 4LUDA 5CU3A 1ZLTA 3HX4A 4QMPA 3W0QA 3PVUA 3G9LX 2WKMA 3BZ3A 1XHAA 2WMWA 3LFSA 5EHYA 3TV7A 3AMAA 3AC1A 3DAEA 3RPRA 4A9RA 1ZMUA 2J5FA 5E1SA 1SMHA 2IZSA 1XMLA 4X3JA 4HYIA 2ITYA 4FKOA 4V05A 2UW9A 1PKDA 3W10A 2BDJA 3QHRA 4IAFA 3COMA 4JIAA 4KIQA 4LRJA 3PVWA 5L2IA 4QMWA 3AD5A 4FTNA 4XS2A 4AW1A 1ZYCA 4BDDA 5IDNA 4TY1A 4QTAA 3TDVA 5LVNA 3H3CA 3MY1A 4JX3A 2NRUA 2EXCX 4N6YA 4TWOA 2PVHA 3TIZA 3PSDA 3MN3A 4MD7E 3LCSA 4WNOA 3VS5A 4DGMA 4U0IA 1MRYA 4IACA 3S95A 2UZVA 2YWPA 4HCVA 4U6RA 3TJDA 3A4PA 4C2WA 4F0FA 3UYTA 4C33A 4LFIA 2XIRA 3FMMA 3RNIA 3LQ3A 1UVRA 4FZAB 3MIYA 4F9BA 1H0WA 4E4LA 4F70A 2XNNA 4AP7A 3L9MA 1WAKA 4RPVA 2C5NA 4KWPA 5GINE 1Q97A 3N4UA 3GOPA 2VWIA 2B9JA 3EKKA 3QRIA 3FBVA 4MNFA 5EI8A 4CMTA 3GCQA 2J7TA 4FI1A 4PTEA 4L42A 4L46A 4N0SA 4ZTHA 3RTPA 4ZSJA 2C6DA 2WPAA 2JAMA 3BU3A 1E9HA 2R4BA 2XUUA 3TNPC 4WG3A 5C8KA 1H00A 1YHVA 3D2KA 2VTJA 3NEWA 4FKRA 3UZRA 3KKVA 3KB7A 2DS1A 3C50A 3RCDA 5B7VA 4F9WA 3EMGA 3FQSA 3NSZA 1BL6A 1DI8A 2VNWA 4FSMA 4ZSLA 3HA8A 5LWMA 4ANSA 4GL9A 5AA8A 3BE9A 4X6QC 3MH3A 4I0SA 4AG8A 4C02A 4FBXA 4EH3A 3PXKA 3RK7A 4ACMA 1LR4A 4ZJJA 2C5OA 3QL8A 2B53A 1STCE 3FPMA 4QP9A 4FT0A 4J1RA 3UG1A 4CNHA 5F1ZA 3EQRA 5HIEA 2Y4IB 4S32A 5M51A 4BTKA 3EL7A 2XANA 4BCOA 1U46A 2WZJA 3FLZA 5CSVA 3AC5A 1IASA 3QLFA 4OT6A 5AV4A 3WARA 5JFXA 4PMTA 4Y5HA 5KUPA 3BIZA 1M2RA 4N6ZA 3E7OA 3WZUA 4TN6A 1KE8A 1AQ1A 4F9AA 4EOPA 1G8JA 4QNYA 3E5AA 2XS0A 1PW2A 5D1JA 4XG6A 3E92A 4YURA 3LFAA 5JZNA 4BTJA 4QDEA 5AV1A 4IZAA 3ULZA 5AFVA 4BVUA 4R1VA 3KN6A 3MV5A 3MVJA 4NKAA 5FBOA 4BN1A 2VNYA 2XK9A 3HA6A 4O7LA 5M55A 5ACKA 3OROA 1J3HA 3PPJA 4XOZA 3SW4A 4RLLA 3UIXA 2Y6MA 4DG0E 2W1HA 3E62A 2W96B 3AG9A 2QG7A 3I60A 3D0EA 4CV9A 2ITQA 5A4EA 3C13A 1FQ1B 1URCA 2XARA 3V5LA 3PA4A 5M09A 3LXNA 2UZBA 5LMKC 2GQGA 3QAME 4O7ZA 3JPVA 4DT9A 4FIFA 1QPEA 4Q5EA 5J7HA 1PF8A 1H4LA 3CEKA 3RP9A 5IQIA 3AC8A 5HNBA 3QRKA 3FHRA 4AT3A 3VBWA 4CRSA 3BQRA 3QRUA 4QYHA 4DH8A 2CPKE 1TFFA 3HP5A 4O6LA 2OXYA 4F1MA 5A14A 4GG5A 4E4NA 1H1PA 5A9UA 4M67A 4QP8A 4EQUA 5AP1A 2OO8X 2XB7A 1WBOA 3AC4A 3E3BX 5DHJA 4FEUA 4I92A 3MJ1A 5HO7A 2XK4A 5G1XA 3IKAA 2BAQA 4KB8A 4Q5HA 1GZ8A 1WZYA 4UXLA 4G5PA 2HELA 1YHSA 5EQYA 2GNGA 5TT7A 2QU5A 4M15A 3E8NA 2PUNA 3NUNA 3Q60A 4I93A 3R8ZA 4WHZA 5KMOA 4EK4A 4D0WA 5CI7A 4LMNA 3FY0A 5J9ZA 1Y91A 4CMOA 4YJQA 3UDBA 3EL8A 5ETAA 3QTRA 5DLSA 5AUXA 3SXFA 4ERWA 1DS5A 4FNZA 3QQGA 3UNJA 2IVTA 2W06A 4RBLA 3UQGA 3BU6A 4BY9E 1WBVA 3O23A 3LFNA 2EVAA 4G3GA 3LCTA 5HD7A 5I5ZA 1ZARA 5IQGA 4P5ZA 5KX8A 2VO3A 3NIEA 4AZEA 3NUXA 4ZAUA 3PJ3A 3GU7A 3HVCA 4N70A 4B8LA 3KVXA 4FK6A 4FTQA 4FT3A 4I4EA 5IUHA 3GENA 5C26A 5KMJA 4BCNA 2WO6A 4BCMA 3WF9A 3LW0A 3KCKA 4A9SA 3K3JA 5E8TA 4LGGA 3TNQB 4BDJA 3FI8A 4M8TA 2QCSA 2R5TA 3U4UA 4FEQA 4RVLA 1VEBA 2XA4A 2YA9A 2REIA 4U41A 3SG8A 4MAOA 4PDYA 5HCXA 3DJ5A 4ITIA 1Y6AA 1M52A 1PY5A 4YLJA 3V51A 3AKLA 3R9RA 3HAVA 4RIXA 3EJ1A 4YTFA 3EQCA 5IQHA 3D83A 3LOKA 1Q8YA 1M7QA 3NUAA 5GNKA 5AUTA 4BDBA 4EUTA 1R78A 1XH4A 1H1WA 1YOJA 4ZTNA 4XUFA 4I6QA 4RC2A 3UG2A 4D2SA 4KBAA 3UP7A 4AU8A 1IR3A 4P90A 3SW7A 4HYHA 3UOKA 3OXZA 3VUMA 3CPBA 2Y4PA 3BGQA 3DBFA 5C8NA 3ULIA 3ZU7A 1L3RE 3I4BA 2RFSA 3KA0A 4EKKA 4FSYA 3NUUA 4J7BA 1SVEA 3SDJA 3TKIA 2ZVAA 4O7RA 1M2QA 2XH5A 4E6CA 3KVWA 2Q0BA 1XKKA 1XR1A 4CGAA 1WBNA 2ETMA 2GS6A 3DAJA 4A9UA 3UQFA 3BLAA 5IA1A 4A06A 3KULA 4EJNA 4DCAA 3C1XA 4JG6A 1NVSA 1MP8A 5J9YA 1Q4LA 3ZCLA 3PG1A 3V5QA 4YJNA 5CT0A 1UV5A 1XH8A 1CM8A 3ORPA 1YXVA 5JT2A 4G9RA 3OOGA 4DINA 3RM7A 3QF9A 4M68A 1OL2A 4G9CA 5HCYA 2WQBA 5AA9A 3PIXA 2HXLA 3WF7A 4D58A 3OCSA 3OW4A 3TL8A 4ZZNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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