3UDTA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with adp and ip5.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
431
structure length
385
Chain Sequence
LEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENILKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSGDYVSPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inositol phosphate-induced stabilization of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase and its role in substrate specificity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
total genus 122
structure length 385
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3udtA01
2XALA 4AXEA 2XAOA 3UDZA 4AXDA 2XANA 3UDTA 3UDSA 4AXFA 4LV7A 2XARA 4AXCA 4AQKA 2XAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LMAA 2QG5A 4C33A 2CGWA 5CNOA 4QQJA 3TZMA 2Q0NA 4FKVA 2YN8A 4YU2A 3R8VA 3UG2A 3KN6A 2HWPA 3HA6A 4JQ7A 4KBAA 4NFNA 4YGAA 3PLAE 2FSLX 4FKLA 1YHVA 4DYMA 2VTJA 2C6MA 2R0IA 4FIFA 4ZS4A 4AU8A 3EFLA 4KAOA 4ZSGA 5LJJA 2BR1A 4GU9A 1FPUA 1VZOA 3DNEA 2RL5A 1MUOA 4I22A 3RVGA 5A6OA 2X7OA 1XO2B 4ASDA 4HYSA 5EYKA 3TN8A 2A19B 2WMBA 2BROA 2C3KA 1K3AA 3MS9A 3PXFA 4WBOA 5HIBA 5JK3A 2CNVA 3D4QA 2CHLA 4II5A 3BHTA 3BQRA 3NUNA 1PMNA 2IJMA 3FLYA 4OT5A 3U6JA 2XVDA 1JVPP 4MNFA 5F95A 4RIYB 2PUNA 3P08A 4NYEA 2C6EA 3BRBA 4UZDA 2VV9A 3NNUA 3R9OA 2WKMA 3LFQA 2VGPA 2AUHA 5E8YA 5DWRA 4FZ6A 3NCGA 3VBTA 3MTLA 4NM0A 3W2SA 4D4SA 4L45A 3E63A 1IG1A 4ZP5A 3GCVA 5AP4A 4A4OA 1LP4A 3D5XA 5CF5A 4EK8A 5EQYA 3U54A 4XLIA 1U46A 3MY5A 2IZSA 4GEOA 4I4EA 5DN3A 5CTPA 4IEBA 2WNTA 4O0XA 3KRRA 3M42A 5HCYA 4BCHA 2XNGA 3LMIA 4LUDA 1Y91A 4LM5A 4RC3A 5HE3A 4DEGA 5KMNA 4ZLZA 4F65A 2CGXA 3ZXTA 3GQLA 4J8NA 3V51A 3JY9A 2JDSA 2PVFA 3NIEA 4MK0A 2NRUA 2C30A 3OF0A 4TKSA 3VUIA 1BYGA 2OXXA 3G6GA 1RQQA 4XG2A 3B8RA 4KWPA 5CVGA 2XARA 1AD5A 5CVFA 3TT0A 2Z8CA 3DGKA 4G31A 4BZNA 5CZHA 3UVQA 3T3VA 2WTCA 3EN9A 5E90A 4EYJA 2XKEA 4IB5A 3IECA 5CYIA 2H8HA 5CX9A 4BDDA 3SKCA 4EKLA 1QL6A 1YRPA 4BZDA 3S3IA 4DAWA 4M8TA 3PIZA 4JDIA 4YTCA 3QTUA 5HX6A 4I0TA 3PY3A 2JGZA 4ZSEA 4C4EA 2PVKA 5C8MA 3OWJA 1XMMA 4KS8A 4RC2A 5DYJA 4RVTA 4IAZA 2GFCA 3UNZA 4F0IA 4UYAA 4FOCA 4E5WA 3D7ZA 3QA0A 3QXOA 4BICA 1UV5A 4G2FA 4UBAA 4PTCA 3C50A 3II5A 3AGMA 3FBVA 4WT6A 5CT0A 2UW8A 4MVFA 4QTCA 2CLXA 2UVZA 4DEIA 5IISA 4WNKA 4F6SA 2VTRA 2ZAZA 3O23A 4KB8A 3V3VA 1H00A 2PZIA 4FEWA 4EH3A 1BKXA 5BMSA 5DEWA 4EKKA 3EL8A 4TWNA 1PXIA 1JSVA 3FC1X 3GC8A 4JG8A 1YDTE 2W4KA 2ZMCA 3LPBA 4I3ZA 3V6SA 4AN2A 4O27B 3SGCA 3UPZA 4IANA 3QD0A 4YJOA 5CSHA 5H8EA 3EQFA 4FZFB 4ZLYA 2UW3A 4C61A 3BHYA 2R3JA 3KREA 3KRWA 4RBLA 1OBGA 3HUBA 3FYKX 3C4FA 4D4YA 3EZRA 3FKNA 4MHAA 1YKRA 3OOMA 2QOIA 4GK4A 5B0XA 3UIUA 3ZM4A 3QD3A 4A4XA 5BUEA 5AAEA 3FZRA 2Z7LA 1FMOE 5EHLA 3A7FA 2CGVA 2A2AA 1UU3A 4I5CA 1P14A 3HKOA 4NFMA 1JSTA 1W83A 4A9SA 4EBWA 3LMHA 4QMVA 4GSBA 1XBAA 3NW5A 3NNWA 4F1TA 5TOZA 2R3IA 4G5JA 3P1AA 3MV5A 3Q4TA 4IFCA 4G6LA 2A4LA 4DEHA 3NVKI 4K77A 4QNYA 2YFXA 1G8AA 2PMLX 2JAMA 2VO6A 4WA9A 2YIRA 4JR3A 3HDNA 4EHZA 3VS4A 3D15A 3UZRA 3OXIA 4R7BA 4Y73A 3FL5A 4O84A 2YM3A 3QLGA 4IZ7A 4FKUA 5ANDA 2PVNA 1FBNA 5HZNA 2OU7A 2R3HA 3TDVA 1W8CA 2GNFA 1UU8A 2R3NA 3PPKA 3NNXA 4ZZMA 1Q41A 4C4HA 3F5XA 3M11A 5HCXA 4BI0A 2F2CB 3UC4A 4OTDA 4BCFA 4ZY6A 3EQDA 5C9CA 4GVAA 4D5KA 2OF2A 4CT1A 4HVGA 2GQGA 2GS2A 3NUSA 4J95A 1YDSE 2FSOX 3DKFA 5AUWA 4ALVA 1R0PA 3C51A 4TRLA 3PG1A 1PF8A 5BYLA 3OS3A 3QAME 3LFCA 3W0PA 2OXDA 2W4OA 4ITHA 1JKKA 1WFCA 3AT3A 5JZNA 4FEUA 2OJGA 2VNYA 3IOPA 1OPLA 4G3FA 4IX4A 3RJCA 4UX9A 2B52A 3MI9A 5IF1A 3TEIA 3R9HA 3P5KA 5IU2A 4D1ZA 5EHOA 4CMTA 5LQFA 4TWOA 1OIQA 2WQNA 3R28A 2YM4A 2JDRA 4IC7A 4UN0C 1OKWA 2C3LA 5E8TA 4CFVA 3QGYA 5DOSA 1WBWA 5HD7A 2J51A 3P5JC 4OLIA 3JY0A 3G2FA 5KKRC 3H30A 3PSCA 5JT2A 5TF9A 2AC5A 3MFTA 4PP7A 3SV0A 4G3DA 4IW0A 5L2TA 3KXHA 2YZAA 2UVYA 2XBAA 2CKEA 3DS6A 5GJDA 2ITOA 3MVJA 1OBDA 3BYSA 5ACKA 4FJVA 3C13A 3PVUA 5CI7A 2ZB1A 4YLLA 3IW8A 4FSNA 3HLLA 3EQIA 2W1GA 4FKIA 3WZUA 3QL8A 4RLKA 4G3CA 4R6VA 1OIUA 2O0UA 2ZM4A 3FMJA 3GFEA 1OKZA 2W9ZB 4GFGA 1TQIA 5LCJA 3KXGA 5H9BA 4JBQA 4PWNA 3EQRA 3C4WA 3RTPA 4FVRA 4F7LA 1HCKA 3KF7A 2F4JA 3MJ1A 4JG6A 3GXLA 2PYWA 3RM7A 2J4ZA 3C9WA 4V0GB 3CSVA 4G3EA 2UZVA 5IA1A 4XRJA 3I0QA 4I5MA 4F4PA 3BZ3A 2HK5A 4PP9A 4E6DA 2C1BA 4PL5A 5CEIA 1BMKA 4OTRA 3SQQA 4FV6A 4OTHA 4RVMA 2ZM3A 5L2WA 4I5HA 4O96A 2H34A 2OIBA 3P79A 4C58A 3ZTXA 3WF5A 3KN5A 3EKKA 1JSUA 2XH5A 2PWLA 3UOHA 2JD5A 2V5QA 4EOIA 2GTMA 5AAFA 1PXOA 3V04A 5DPVA 4RX9A 4LV8A 2ETRA 2WFYA 5HLNA 3HMPA 3F2NA 2ITTA 3AQVA 3PLSA 4PMPA 3HRFA 4OUCA 5GINE 4U79A 3EQBA 4KIQA 4QMOA 4DHJA 3VBWA 3PPZA 3QYWA 3MVMA 3ORNA 5HQ0A 3HRCA 4ZLOA 4BI2A 4ZTSA 4E6QA 1XH9A 2XALA 3GP0A 3UQGA 4LRMA 4FV4A 1U54A 1PXJA 1OUKA 3NUXA 4OT6A 3NGAA 1ZYDA 5CAVA 4O0UA 4U3ZA 4YHTA 5FUTA 3AT2A 3AKJA 4EYMA 2CSNA 4QOXA 3ACJA 3HMMA 4I5PA 3DTCA 2HZ4A 3S2PA 5IZFA 4CGAA 5KHXA 4GCJA 4ZIMA 1ST4A 3BGPA 4HZRA 2W1HA 4R7HA 1U5RA 4EC9A 5LMKC 3E8CA 4L8MA 1M2PA 3PZHA 4FTUA 1H1QA 5D1JA 3O7LB 2PE2A 4FNWA 3VAPA 4FTAA 2HAKA 4D58A 4YHJA 3QRIA 1UU7A 3DFAA 4EH6A 3KEXA 4FV2A 4CFNA 2J90A 3Q5IA 4I24A 3Q04A 4DHZA 2PUPA 4XG6A 3QQFA 4RZWA 3OMVA 2OWBA 4USDA 3VO3A 5LMKA 2QR8A 3OXTA 4QP7A 2WGJA 4A06A 1YXVA 2X2LA 3DXPA 4FT5A 3PA4A 3UZTA 3E3PA 2JBPA 4IZYA 4TYHA 4HCVA 3VF8A 4ANQA 4EZ5A 3KIOC 4EWQA 3WE4A 4NH1A 3ZXZA 4XLVA 5F1ZA 4H58A 4JRNA 4FTCA 3GENA 5KZ0A 4V01A 3R8MA 3ULZA 1ZRZA 4L44A 1U54B 5EKOA 4NJDA 2HELA 3NIZA 2P0CA 4YNEA 5E9EA 3GCPA 3RAIA 4OTWA 1ZZLA 5D7VA 2BIKB 3NWWA 3B2TA 4ZK5A 5EDQA 2QO2A 4YBKA 3ZSIA 3AKKA 1WAKA 5J1VA 2OK1A 3DTWA 5HLPA 3NUAA 2UZDA 4FVPA 3FZSA 4I6QA 4WUNA 3O8PA 3TNPC 3VNTA 4YHFA 5ETCA 1K2PA 4BDAA 4Z16A 2OBJA 4JS8A 4FIEA 2REIA 3SOCA 2PSQA 4QTBA 4NTTA 4X7QA 4ENYA 5JFWA 4X6QC 1F0QA 1YVJA 2C6KA 3UJGA 3IOKA 4C2VA 2J5EA 3V5JA 3A99A 3RPSA 4CKIA 3SLSA 2IZUA 3A7JA 3Q9ZA 5FXSA 5J8IA 4E1ZA 4XP3A 2FVDA 3NW6A 4YJUA 1DS5A 1OUYA 4FOBA 4AT5A 3W0NA 1FVVA 2JAVA 2VWXA 3DK6A 2W0JA 3G0EA 3ZUVA 5HICA 1WBVA 1GNGA 3FE3A 3SDJA 4E5AX 2WMVA 2PY3A 4CFMA 5D10A 1M7NA 2FA2A 2YCSA 3Q9WA 3W10A 3G9NA 4CFXA 2CN8A 2GNGA 4UYNA 3E87A 3OBJA 4PTGA 4IZAA 1UWJA 3PYYA 5IQGA 4UWBA 2XZSA 4AS0A 5FXQA 3CD8A 4X3JA 4XG3A 1Q99A 4NW6A 5IA4A 4DEAA 3DCVA 3OROA 2YM6A 4OBOA 1FGIA 1J7UA 3WZKA 1VR2A 2Y9QA 2UZTA 2WTDA 1REKA 4O7YA 5IA3A 3NCZA 4G17A 3TNQB 2HCKA 2BFYA 1SVEA 2JDOA 4I0SA 4CG9A 2I0HA 3MH3A 4YTFA 5BVNA 3VULA 1KE9A 4FKQA 2XAOA 3EN5A 1XKKA 3HV4A 4MUQA 3TTIA 1IA9A 1PMVA 3F3VA 4DG3E 3MYGA 4L3JA 3F2AA 2NPQA 4FSYA 4KUJA 4KRCA 2RIOA 1TKIA 4C2WA 4DH7A 4QMQA 4QTEA 4BHZA 3F5GA 2BRGA 1PXMA 3F3UA 4M0ZA 4N0SA 2GMXA 4E6AA 1LEZA 3W32A 1WMKA 2UZOA 3R71A 1P4FA 2B0QA 3VS5A 5IA2A 1OB3A 4KINA 2HY0A 4EWHA 5HO7A 2JKQA 3UOKA 5HG8A 3EIDA 4CNHA 4HVHA 3Q6UA 1CKJA 4RWLA 4S34A 2OI4X 2PTKA 2VWYA 3BGZA 2UZUE 4I20A 3QTSA 5EOBA 3TWJA 2ITUA 3ALNA 5J9LA 5CAOA 3Q9XA 4H05A 4AXFA 2WXVA 3EYGA 2OH4A 3R1NA 4G34A 5EM6A 3R9RA 1CKPA 3LCDA 4FT7A 4EBVA 2YIXA 5DNRA 5M08A 3BU6A 4GT5A 2VRXA 2JKOA 2IW6A 3F3ZA 3QCXA 4XOZA 3TV4A 3FEGA 5H2UA 2IW8A 1UWHA 3JR1A 4I92A 4JNWA 4YMJA 5BX0A 2F7XE 3DJ7A 3WOWA 4MWHA 3NFGB 1KOBA 4YO6A 5CALA 1YOLA 3LFBA 3ZBFA 4RIWA 5FEDA 2QURA 4ACDA 2Z02A 4FZAB 5J95A 5AIKA 4KSQA 4PX6A 3ACKA 4BIBA 2X6EA 4MKCA 4ONAA 1GZOA 4FV7A 1YWNA 4PMTA 4YLKA 2UZEA 5FBNC 3TNWA 5FP5A 1GZNA 3OC1A 3QFVA 3OOGA 3H0ZA 3V6RA 4IWQA 2BHEA 4DBXA 2ESMA 4FSQA 2ZYBA 5CENA 4BCJA 1QPJA 3GT8A 3COHA 3QYZA 3LXPA 2E9VA 2XKDA 4G3GA 2ITPA 3OWLA 2E9NA 2WIPA 3GQIA 4WBBB 3HP2A 4AAAA 3PXRA 3MSSA 1JQHA 3TXOA 4UWYA 4ACGA 4BDEA 4ZZNA 3R7UA 4YPSA 4U42A 4LL5A 3NUPA 1T46A 4ACCA 4CLIA 3W0OA 3FLSA 1BL7A 3NDMA 4D5HA 4WNMA 2C1AA 4WRSA 4XV2A 5C26A 3VS1A 3LCKA 4JT3A 5CT7A 4H36A 5JH6A 3S0OA 2XNOA 3PSDA 3QUPA 5LWMA 2R3QA 1Q8TA 4X2JA 4F9WA 4O7RA 4W4VA 4KS7A 2JIIA 2WMAA 3EJ1A 3ENMA 4IJ9A 4MD7E 3PVGA 4AUAA 5BV3A 4IM2A 3A8XA 3OTUA 5LMBA 5GNKA 3NYNA 4HYUA 4RIWB 4X6RA 3UC3A 1B6CB 3A2CA 1REJA 2O63A 3OCSA 4FKSA 3WF7A 5CVHA 4QP6A 4BF2A 5A4TA 4RC4A 3B8QA 3PIYA 3QQUA 4M7IA 3OWKA 4TN6A 2WQEA 3ZEPA 3I7BA 5IH6A 4CMOA 4DFLA 4XG7A 3Q5ZA 4YLJA 3WE8A 2VTQA 5IDPA 4IBMA 2XCKA 4DFNA 5A9UA 3PA3A 1YI6A 3L8XA 3ELJA 4IE9A 2W99B 3K5VA 4AGUA 5BVFA 4FI1A 4ERKA 4GU6A 2BAQA 1UA2A 3IS5A 3EB0A 4WOVA 5AIRA 3VHEA 3V5WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite