3W0MA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia, apo form
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
VEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
total genus 92
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0mA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0mA02
4DT8A 3FI8A 4O7PA 3ATTA 3W0OA 1J7UA 4CGAA 5FTGA 3SGCA 3N4VA 2PUPA 5IQHA 4PDYA 5AFVA 3C5IA 2I7QA 4WZYA 3TM0A 2PU8A 4U98A 5IQDA 3W0NA 4CG9A 3N4UA 5C4KA 3W0SA 1L8TA 3ZM9A 4DCAA 3W0MA 3TYKA 4FEUA 4N57A 4FEVA 2OLCA 2CKPA 5IQIA 2PULA 4DE4A 4DTAA 2CKQA 4EJ7A 3W0QA 4R77A 3FEGA 3HAMA 2QG7A 3JR1A 4DA5A 3TDVA 5C4LA 3G15A 5IQFA 5BYLA 4DT9A 4H05A 3UZRA 5EQYA 3TDWA 5IQEA 4DFUA 4ORKA 5IQGA 3Q2JA 3W0RA 4R7BA 5EQEA 4FEXA 3CSVA 4FEWA 4GKIA 1ND4A 2CKOA 4DTBA 4U94A 5IQAA 1NW1A 1J7IA 2PPQA 5IQBA 3SG9A 5EQPA 4GKHA 3MESA 3F2RA 4CG8A 4R78A 5IQCA 4DFBA 2BKKA 3W0PA 3SG8A 2B0QA 1J7LA 4BR3A 2IG7A 3N4TA 2Q83A 3DXPA 3DXQA 2PUNA 3LQ3A 3HAVA 2PYWA 3ATSA 4DBXA 4O7OA 2PUIA 5FUTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ANIA 1Q8TA 1TQMA 3UOKA 3MGYA 1YOLA 1VR2A 5E8YA 3CBLA 4DAWA 5CAQA 2ZV2A 4CTBA 3SGCA 3PXRA 5A4CA 3ULIA 1YDSE 4K18A 3UDZA 4D1ZA 4QQTA 3C50A 2Z8CA 5FXQA 3DKFA 3OXZA 3EIDA 3UQGA 2VTMA 4Y8DA 2JDTA 3OWJA 5M56A 2YDIA 4RZWA 1KE9A 1XH6A 4DHIB 2XK7A 2EXMA 3DOGA 4U97A 2PY3A 2DYLA 4BIBA 2E9UA 5AADA 4J52A 1KOAA 5IPJA 4WUNA 4F0IA 4O7ZA 3EWHA 4IH8A 5AP1A 3IONA 3SXFA 2GNHA 4YMJA 2UUEA 2XM9A 2J6MA 4FIIA 4DCAA 3QWJA 5CANA 4JS8A 2VX0A 4FKGA 3UVPA 4L52A 2A1AB 2NPQA 3KXZA 3VHEA 4A9RA 4DINA 4FTIA 2DWBA 3GU6A 4AA5A 5HG9A 3ITZA 3TEIA 4OTGA 4I41A 4DE4A 5IEXA 4TRLA 3QTSA 4QP3A 3IS5A 4L7SA 3BYMA 4U44A 4FT3A 4XNEA 2WTDA 3TKHA 3FEGA 2W9ZB 2A4LA 2XK8A 3KFAA 2VZ6A 3ORTA 4BC6A 4K0YA 5IQFA 3PWDA 3NSZA 5JN2A 4YBKA 2CGVA 3QA0A 3CTQA 3HMOA 4FV8A 1TQPA 1H25A 4JX7A 3ZC5A 3QRUA 3PA3A 3PDTA 4UWBA 1H28A 3R02A 3GOPA 2PVLA 3VRYA 3COMA 3L9PA 2BHEA 3HMNA 3FMJA 4YC8A 2HIWA 3EKNA 3NMUF 4OTHA 4C4EA 5L2IA 3ZLXA 4EZ5A 4KIQA 4FV0A 3LCSA 3HV5A 4NU1A 3DDPA 3AMYA 2XNNA 4FEWA 4XG2A 4AXEA 3D9VA 4P7EA 1OUKA 3K3JA 2BIKB 2G01A 3F3UA 4NJDA 3HZTA 4O91A 4ZEGA 4A9UA 5TO8A 2UW5A 4GS6A 4I5HA 3KRXA 1Q99A 3C9WA 1Q8UA 2YCSA 3SG9A 3HLLA 3NX8A 4NK9A 4L9IA 3TNHA 4DHZA 3QZFA 4JMQA 3KULB 4YJVA 2C3IB 2IN6A 3GCQA 3P0MA 5LMKC 2WMUA 2Y0AA 5EYKA 4C4IA 4AFEA 3F5PA 2OZOA 5KO1A 4FV3A 4BR3A 5L2TA 3RM7A 3O51A 5L6PA 2R3PA 5HICA 3QQJA 4DBNA 3M2WA 2W4OA 2WQBA 3AGMA 5KMNA 1YW2A 2JITA 2R3LA 3E8DA 4CZTA 4EKLA 3ATSA 2JDVA 3MBLA 4O7OA 4DH7A 1GAGA 4AGDA 4H36A 3MY1A 4MXZA 5FUTA 4RIWA 5CYIA 4DEBA 4E4XA 3WE8A 1PJKA 3ATTA 1YXSA 4R3RA 2EVAA 2OIDA 4FTUA 3KRRA 4DEAA 4MYGA 4GSBA 5E91A 3OTVA 4FKTA 4O7TA 3FMHA 1M17A 4FVRA 2P2IA 1G8AA 3QCXA 4AOTA 2GHMA 5BX0A 4FSTA 1Z9XA 2JAVA 3NW5A 2W06A 3KMWA 3PRIA 3UP2A 3D5XA 1YHSA 2C6OA 2X4ZA 3FKLA 3I79A 4QQCA 2XYUA 2G2FA 2VV9A 3OVVA 3QHRA 2Y4IB 4PDOA 5CY3A 3FHRA 3II5A 3VUKA 4I3ZA 5EYCA 3DJ5A 3MN3A 3B2WA 3P86A 3QX4A 4RA5A 3GCPA 1OL5A 3BX5A 2ETMA 5B0XA 1P5EA 5FEDA 4BI1A 3W0SA 4U81A 2C5YA 2Z7RA 4WNOA 4YPDA 2CCHA 5E8SA 3LJ2A 3PJ8A 4AP7A 3LQ8A 3PG1A 2J4ZA 2V7AA 3BYVA 2I0HA 3NFGB 4LQMA 4HGEA 2G2HA 4PWNA 4WIHA 5HO8A 4F99A 2OXDA 1FVTA 2OH4A 2W5BA 4RSSA 3R7EA 1H1WA 5IA2A 4O27B 4DGGA 5H8EA 2IW9A 2XH5A 3LFAA 2Z7QA 4O96A 2IO6A 4PQNA 2YIXA 5E8WA 4W8EA 5E8XA 5EHOA 2X9EA 4RIYA 2P0CA 4YO4A 3G2FA 4IFGA 3LCOA 3WARA 3TG1A 2WTJA 3EYHA 4H3BA 3AGLA 4IDTA 4KS8A 1JKKA 5AWMA 2HZIA 4L45A 3UTOA 3ORXA 3ZBXA 4F08A 4LRJA 4MXOA 5B2MA 4ZMFA 2CMWA 4BDJA 4IEBA 4V0GA 3AKLA 4YLLA 3O5AA 4E5AX 3VW8A 4J71A 3QZGA 4E6AA 4XOYA 1O9UA 1URWA 1BLXA 3RI1A 3PUPA 2YCQA 2B9IA 4FTKA 2QOCA 4TYIA 2WTKB 2BKZA 3U8WA 4O7NA 3COKA 4IM3A 3TNWA 4EL9A 3AC5A 4IAIA 5IH5A 3MYGA 5DH3A 4YLKA 3I6UA 2QLQA 4JQ7A 3R7VA 4F1MA 5HNGA 3ROCA 2XNBA 4EHVA 1Q8ZA 1YDRE 2LGCA 3BZ3A 4YC3A 5FLFA 4FE2A 3MVLA 3R00A 5CWZA 3WF6A 3P5KA 2VTQA 2VWVA 2HW6A 4YZMA 3ZDUA 2ZDTA 4G3EA 4R78A 4AGWA 2QVSE 5I5ZA 3NCGA 5F94A 3G5DA 4XS2A 5HE2A 4AA0A 5KX8A 3R01A 4HGSA 5M06A 1WBPA 4F09A 2JDOA 3CPCA 1Y8GA 2OBJA 4H1JA 4KAOA 3COHA 3WZKA 3V8SA 2WTCA 4F4PA 1LP4A 4EOJA 3RPRA 1PRYA 4YZBA 4G16A 4MBIA 4M84A 4AZTA 5K5NA 3SXRA 2HY0A 2X6EA 1Y57A 5C27A 4QRCA 3B2TA 3DBDA 3LZBA 2PUUA 2B7AA 3FLSA 5AV0A 4D1XA 3E88A 4EOQA 3F61A 1XR1A 1JVPP 4N6YA 1PKGA 1ZAOA 3O71A 5E1EA 3VIDA 4ENYA 5L6OA 1A06A 4EHEA 2WMTA 2YA9A 1VEBA 4QPAA 2JIVA 3IKAA 3W2OA 3ZSGA 1V0BA 3DCVA 3OT3A 5ANJA 5C8MA 4XP3A 1HOWA 1JNKA 4HOKA 5M4CA 5EK7A 4C2VA 2BRHA 3FXWA 2ZM1A 3W0NA 4I6LA 3ML1A 3R6XA 4AE6A 4O7WA 1ZY4A 3CTHA 3P23A 1RE8A 3QCQA 1PYEA 4JDHA 2PMOX 5J9YA 2WQNA 2YAAA 4ERKA 1CKPA 1KE5A 2E2BA 4ZJJA 3SXSA 2BDFA 2YWPA 4JT3A 4LFIA 2IZTA 3KF7A 3O50A 4ZTMA 4B0GA 3HVCA 5HVKA 3U4WA 4FKIA 1H07A 2SRCA 4TWNA 4TWPA 5CEKA 4O83A 2ZAZA 1G8SA 1GZ8A 1JKSA 3ORIA 4JBOA 1YRPA 4PP9A 2EB2A 5HG7A 3R9DA 4BBMA 4D9TA 5CXZA 4H58A 4OW8A 2YM4A 4UN0C 5ICPA 2XKDA 2VO0A 2FB8A 1X8BA 4L46A 5DI1A 3R8VA 1QPCA 3ZXTA 5ITAA 5DHJA 4BHNA 4FV9A 3KEXA 2GNGA 3EFLA 1K9AA 3VS2A 4CFVA 1SZMA 2VTSA 3ZBFA 2GS2A 2HZ0A 4QMZA 4FTTA 4PRJA 4EQUA 2GQSA 2PWLA 3ENHA 2QLUA 4HNFA 3ZO2A 3HRFA 4ZSEA 3UZTA 4FBXA 5EOBA 3E8CA 3QWKA 5IMEA 5TKDA 1Y8YA 4BTKA 4DFUA 4MCVA 4QMQA 4DH8A 1YXVA 2ACXA 5CSPA 3UMWA 1XBCA 3QU0A 2YJSA 1R39A 3MVMA 3DTWA 1DI9A 3OG7A 2BILB 2GQGA 2ITWA 4YNOA 3JY9A 4R7BA 3IDPA 4BCPA 5CF6A 5ANDA 1GZOA 4KBAA 1NVRA 3FMKA 5IDPA 2BZIB 2QOBA 5AEPA 4JDIA 3FJQE 5CEIA 4K2RA 4QMOA 1M2RA 2WHBA 3ACKA 2BRBA 3DBEA 4RIYB 4BCFA 4CT1A 4O81A 5EYDA 2WNTA 4FKQA 1J7IA 2JKMA 3NW6A 3G51A 1G8KA 3NYVA 4AE9A 3TI1A 1LR4A 3RPSA 2A27A 4CG8A 2HXLA 3ERKA 3ZSHA 4AXCA 4M7IA 4HGLA 3MSSA 4IDVA 4LMUA 4DFBA 5CAPA 3W55A 1UNLA 1WAKA 1EH4A 5E8ZA 3SQQA 4CMOA 4FZ6A 2Y4IC 3VF8A 1J7LA 4ASXA 3DXNA 4DEGA 2OJIA 3V5QA 2GNJA 3QC4A 3DK3A 1H8FA 3DXQA 4ZMEA 1YWVA 4NWMA 3A60A 3ZFMA 4CMTA 2NYAA 4TYJA 5J8IA 4JQ8A 3TIYA 4FTQA 2W0JA 3TZ7A 2XP2A 4F6WA 5HBHA 3UODA 2UW7A 3FI8A 1W0XC 3W2CA 3W16A 3E3BX 3FI3A 3HV7A 2G1TA 4M97A 4UB7A 3W0OA 2R2PA 1IASA 2BMCA 5FTGA 1STCE 2YHVA 2RG6A 4ANLA 1ZYCA 5AAGA 2BVAA 2VTRA 2PUPA 4PTGA 3EZRA 4CLIA 4BI0A 5I4NA 2A19B 5E1SA 3V51A 4O0UA 3FMMA 4ASEA 2I7QA 3HA6A 1XMMA 2GNLA 3NIEA 3V6RA 2QNJA 4MTAA 5DN3A 2VN9A 4WOVA 3FXXA 2ETKA 3PZEA 3IECA 4F7JA 2CNVA 5CU0A 4BCGA 3W2QA 3RALA 3ZLWA 3OFMA 1OM1A 3PXZA 2WMBA 3OP5A 1NVSA 4O2PA 5C01A 5IU2A 4JG6A 5LVOA 2W4KA 4PDPA 2XRWA 5IA0A 1FINA 2JDRA 4F9AA 3NYXA 4FYNA 5BMSA 4PDSA 3VUHA 1YXXA 2GFSA 5AJQA 5CNNA 1I44A 3K54A 4Z7GA 2JKOA 3UOJA 3NUSA 1P14A 4BBEA 2X2LA 3PLAE 1AD5A 3DKGA 2BUJA 1SNUA 3UDSA 2HY81 4EJ7A 3W0QA 1P4FA 2PVHA 3DK6A 4L42A 5IUIA 3QGYA 4G34A 4ZK5A 4KABA 3BE9A 4Q2AA 1Z5MA 2R3NA 4Z16A 3ZZWA 3D7ZA 4FNZA 4XCUA 4GFMA 3LXNA 3RPOA 3TV7A 4Y5HA 4NSTA 5CU4A 3FUPA 5HLPA 4ERWA 2R3OA 3GXLA 5FQDC 3OF0A 3BYSA 3UZRA 3FL4A 1BUHA 3D7TA 1VJYA 4XV2A 4EONA 3G9NA 4MBJA 3LFFA 1Q3WA 3MIYA 4OR5A 4EYJA 3SA0A 1XHAA 4TWOA 2UZVA 4G3GA 4GJ3A 3TJCA 3NVMB 4JQEA 4RMZA 5FBNC 4OTWA 3W2RA 2FVDA 4L3JA 2PHKA 2UZNA 3W2SA 5EQEA 4MH7A 4DGOA 3DZQA 3DAEA 3S0OA 4FTNA 2BR1A 2GU8A 2CN5A 2UZOA 2X2MA 4TW9A 4D2SA 4U0IA 1SNXA 4QMVA 4NH1A 5AP6A 2XK9A 3RAHA 2OIQA 3PVBA 5HIEA 4EBVA 3E92A 2UVYA 2VAGA 3VHKA 5JGBA 1Q41A 2PE0A 4M69B 4ANBA 3FKOA 5CZIA 4X3FB 4ACMA 2CGXA 3D5WA 3QD2B 4AX8A 5IDNA 4M14A 2IZUA 2W1FA 4S32A 4IAFA 4CV9A 2EU9A 4QTEA 4OTQA 4O0WA 3OT8A 5HE1A 4M15A 4ZAUA 4D4RA 4CD0A 4FNYA 3QYWA 2XAMA 3EQCA 3HV3A 4Y72A 4XG7A 4AQKA 2UZTA 2XB7A 3UNZA 4GT4A 4AAAA 3FL5A 2ZFYA 3N4TA 3NWWA 3K5UA 3SLSA 1YDTE 4XJ0A 1ZMVA 4FKWA 2WOTA 3WZDA 3S4QA 2PUNA 5EM8A 4C4HA 4XOZA 4E6DA 4E6CA 3R63A 4LL5A 3UE4A 3ZMMA 5BPYA 4C02A 2IZRA 4MNEA 2V7OA 3SDJA 3KK8A 2DS1A 2PZ5A 3CD3A 4KBCA 3TL8A 3T8OA 4CZUA 3KXMA 3D2IA 2H9VA 2WMRA 4UYNA 3ZO1A 2CSNA 4BCMA 4TPTA 4R1VA 1OUYA 2XIKA 5C9CA 4YUQA 4EH9A 5HLWA 5D41A 3OOGA 2QURA 1FBNA 5K9IA 4AZWA 4J98A 4I92A 5KMOA 5DR6A 4FKPA 4JRVA 4G3CA 4GVAA 4M13A 4TT7A 4W4YA 3FY0A 1YHWA 4RIXB 4RLKA 4U3ZA 5HG8A 5E92A 3WZUA 2OWBA 4GYGA 4X21A 2V22A 1CSNA 4ZLOA 3KQ7A 3E87A 2QOFA 1OB3A 1ZZ2A 3ZCLA 5G6VA 4FR4A 2GNIA 2V0DA 4N0SA 2BALA 4IX5A 1OKWA 3Q4UA 3ZO4A 1QL6A 4BCKA 3KIOC 4FEUA 3BLQA 2QOKA 1A9UA 3V5WA 2C3LA 4QPSA 3TV6A 2OFVA 1DAWA 4O0SA 5CEOA 5F9EA 5M4FA 2QO9A 4YZNA 2O2UA 2ZMDA 4BDFA 1OKVA 2O0UA 2EB3A 2W1EA 4LYNA 3GUBA 3JR1A 3W33A 3HMMA 2XYNA 4IANA 5AIKA 5AA9A 5BV3A 4EEVA 2PZIA 3MFSA 4BDGA 5BUJA 4EK8A 2CGUA 2QKWB 3ELJA 3ORMA 4CCUA 3R0TA 2HWOA 3NCZA 2RG5A 3QA8A 3JVSA 4D28A 5AUUA 4RJ5A 1YOMA 5H8GA 2CNQA 4YTHA 5CEPA 4IACA 4E1ZA 5L6WL 1OGUA 2YM7A 1JBPE 4TNBA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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