3W0RA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n202a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSANVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0rA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0rA02
2QG7A 3TYKA 5BYLA 3Q2JA 5IQBA 5IQCA 4DFBA 4FEVA 4GKHA 2PU8A 4DA5A 3ZM9A 3FEGA 3TM0A 3W0QA 1NW1A 3W0OA 5EQPA 2CKQA 2PYWA 3SG8A 3G15A 2PUNA 3F2RA 4DTBA 4DT9A 4U94A 3N4TA 5EQYA 1J7LA 2PULA 3HAVA 4PDYA 2Q83A 4H05A 3LQ3A 4O7OA 4R77A 3UZRA 3W0NA 2CKPA 5IQEA 2PUPA 4R7BA 3C5IA 3ATTA 3DXPA 1J7UA 3TDWA 3MESA 5FTGA 3FI8A 4EJ7A 2PUIA 4WZYA 3W0PA 4FEXA 4BR3A 1J7IA 2CKOA 1ND4A 2OLCA 3SGCA 5IQFA 3DXQA 3W0RA 2IG7A 3JR1A 5EQEA 4DT8A 2I7QA 3W0SA 4DE4A 4DTAA 4N57A 5IQGA 3W0MA 4R78A 4CGAA 3CSVA 4O7PA 2PPQA 5AFVA 5IQDA 4DCAA 4DFUA 4CG8A 3ATSA 3N4VA 4U98A 4FEUA 5C4LA 3TDVA 4FEWA 5FUTA 2BKKA 5IQIA 5IQHA 4CG9A 4GKIA 3HAMA 4DBXA 1L8TA 2B0QA 3N4UA 3SG9A 5C4KA 5IQAA 4ORKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DVRA 3V5TA 3W1FA 5EM6A 2GS6A 3ORNA 2BRHA 3A7FA 3D0EA 2LAVA 4BIBA 5F20A 4IM3A 2JGZA 3Q52A 4FTRA 4EOMA 3DZOA 2XM8A 1Y6AA 5J8IA 3SOCA 4L6QA 1PMVA 3OZ6A 4GIIA 3ZM9A 2IVVA 2AUHA 3SVVA 1BKXA 2H6DA 4J99A 4ACHA 2B4SB 2CKQA 4CT1A 5LVNA 4U3YA 2UZLA 1MRYA 3MPTA 1W84A 3TN8A 1H4LA 4QRCA 3QTIA 4CTBA 5ACKA 1XMLA 4EZ3A 4RLKA 5E9EA 4XG8A 1LP4A 5DPVA 4AA0A 4DLIA 1W0XC 2V7OA 3BU5A 1AQ1A 5DE2A 4FV3A 4IE9A 5LMBA 1UU7A 4FA2A 1J7LA 4NT4A 3O7LB 4IM0A 4OT5A 2QO2A 4AZWA 4X2FA 2YIQA 3PLSA 2FVDA 3G0EA 4A9YA 1O6YA 1KE5A 2O2UA 3IW6A 3N9XA 3QGWA 4R3PA 3RAHA 4QMNA 4CKJA 4Z7GA 5FM3A 5IQEA 2PL0A 1B6CB 2VTTA 4FTIA 4D1SA 1TQMA 3VF9A 3E7OA 2J0KA 4BHZA 3RTPA 3K5UA 4FIJA 4FTOA 4TZRA 3KGAA 3R9DA 5KZIA 3KULA 2VWVA 3FI8A 3KULB 1QMZA 3R1NA 3M11A 4ACDA 2IVTA 4LOQA 1Q3WA 1SVGA 2ONLA 2QNJA 3ALOA 3OMVA 5FLFA 1YHSA 3TZ9A 2HZIA 4NK9A 4NSTA 2G15A 3UDBA 3UOHA 3FAAA 2CGUA 2DWBA 3WOWA 4EYMA 3KN6A 4RC3A 1FGKA 4XEYA 3DLSA 3NUAA 4LI5A 4YZCA 3SA0A 1G8JA 4BTJA 3AT3A 4FNZA 3ZLYA 4RJ7A 5L8JA 4RVMA 2C5NA 1MQBA 3O51A 4L00A 4RQKA 3RZBA 4CMOA 4BDAA 3MJ1A 5KMNA 4R5YA 2UW6A 1PYXA 2YDIA 4ZIMA 4BCHA 4R1YA 1Z5MA 3VHEA 4QMLA 4CGAA 3MB6A 3CR0A 4O7PA 3Q4CA 4I41A 4Z7HA 4DCAA 3U6IA 1PXIA 4DEDA 4S34A 3UIXA 4A9SA 1P5EA 2CNQA 2CCHA 4JMQA 5HG5A 4WG3A 5JSMA 2C5VA 4RSSA 3EOCA 4IX3A 3SXRA 5G1XA 3HMMA 3DAJA 4NH1A 3ZH8A 3FMKA 3R01A 3R04A 4EONA 5DEYA 4F7JA 3MPMA 2VGOA 4N4SA 4C3PA 3KU2A 3PIZA 1BUHA 4FIHA 4L3LA 3O23A 3PZEA 4Q5EA 4YJQA 4JXFA 3U9NA 3OTVA 2VUWA 5CZHA 5A4CA 3AXWA 3TMOA 1REJA 4DGGA 2GNJA 3FMMA 4OUCA 4CFFA 4L3PA 3BRBA 4GW8A 3BHTA 3U8WA 1BI7A 2XNPA 2B9JA 3C50A 4XG4A 2RKUA 4BB4A 1PMEA 1YXSA 2A0CX 4EOIA 2HY0A 4FE2A 3UDZA 3OWLA 2QC6A 1U5QA 4KKGA 2UW4A 4BKJA 4DG3E 5D9HA 2PU8A 3QRTA 4K33A 3NIZA 3W0QA 3W8QA 3TCPA 4HYIA 4G9RA 2JDRA 4YBJA 3SV0A 3NSZA 2R3KA 3ANQA 3G33A 4FKUA 4DDGA 5LVPA 3UIMA 4CCBA 1PKGA 1GZ8A 5CZIA 2WKMA 4F6WA 3VBYA 3RK7A 5LMKA 3CS9A 3VUMA 1M14A 4NYEA 3COIA 4QEBA 3ZSIA 2CNUA 1MRUA 4NWMA 3W55A 4AGCA 5A6OA 1E9HA 5IF1A 5JMSA 3NVKI 4GS6A 4ZTQA 4FKLA 1IAJA 2CPKE 3HP5A 2Y8OA 3C5UA 4TKSA 1J3HA 4M84A 4BI0A 2UZNA 3WE8A 2PHKA 2PVYA 3LFSA 3UVPA 5HGIA 3LQ3A 2Z7QA 4FJVA 4JQEA 3TNQB 2IO6A 2OZAA 3P78A 3LE6A 2OZAB 2JAMA 3E3BX 5BPYA 5IISA 3UPZA 5HG9A 2FGIA 3VS1A 4X6QC 3VNTA 1YXVA 2WMUA 2ETMA 4IZ5A 3RAKA 3C5IA 4CVAA 1BLXA 3LFFA 4ITJA 4OLIA 2X81A 3R8ZA 4DFXE 5CEMA 3QD3A 4XH6A 5JFSA 3D7ZA 4LYNA 2VO6A 4E6CA 3F61A 2WIPA 4PL3A 5DG5A 3A8WA 5HTCA 3QF9A 4K77A 1SM2A 4U41A 4V05A 2VNWA 2J0LA 4BICA 4DFLA 1YDSE 4HCTA 3AQVA 5HD4A 3KRLA 2AEGA 1OPKA 3F5GA 4RJ6A 5CX9A 1Z57A 5EI6A 4KBCA 3WZKA 3QX2A 4GL9A 2BFYA 5E1EA 4W8EA 1NXKA 2G2FA 3IONA 3KY2A 3QTZA 3UDTA 3TKHA 1M17A 2Z7LA 2QO9A 2J4ZA 4FT0A 4H3PA 4AXCA 4EQUA 3IGGA 5KKRC 3UYSA 2UVYA 4C62A 4JQ7A 2ETKA 4TYJA 4DEEA 5FDPA 4BBEA 5M4FA 1YI3A 3IW5A 3FZOA 3LOKA 3PVBA 5AP5A 5IA1A 4PRJA 4NM3A 4PF4A 1R1WA 3SRVA 3PJ8A 2GU8A 3MY5A 4NIFB 4WHZA 4U81A 3SRVB 5C8KA 5M4IA 3AC5A 5CSHA 5CI6A 3N4VA 1U59A 4I93A 1H1PA 5IA4A 2WELA 4ANQA 3HV5A 1OBGA 4E4LA 3PDTA 2G01A 5CEKA 3ZLXA 4FZFB 3KKVA 3PSCA 4LV7A 5BVWA 3OOGA 1IR3A 2ZV9A 5IQIA 3KA0A 4GYGA 2J5EA 4QP6A 1IRKA 4EEVA 4DHFA 3M1SA 2O5KA 4BY9E 5IQHA 4CG9A 4CZTA 4E5BA 3H9RA 5CF4A 2YWPA 4R3RA 4O21A 2YJSA 3HV7A 2WPAA 2VRXA 2C6IA 4UWYA 2X4FA 5HESA 3D5UA 3BQCA 4JDJA 1SVHA 2V62A 2W1IA 5E8SA 3FMDA 4AAAA 4DG2E 3WARA 1B38A 2ITPA 2RG5A 3BEGA 3VS4A 4EK5A 4F9CA 4GVAA 4MBLA 3LM5A 5K4IA 1RJBA 3TKUA 1EH4A 3FLWA 3OW3A 1WBWA 5D7AA 2ERZE 4G9CA 3R21A 3RAIA 5IQBA 4F0GA 3UG2A 4KBKA 1WBVA 2JLDA 3OCSA 1DI9A 3GU4A 3QYZA 4NFMA 4EI4A 3BE2A 3OXIA 4QMTA 1GZNA 4QYGA 4WIHA 1YOLA 3ORZA 5EG3A 3GU5A 4DHZA 2OSCA 1NW1A 4EJNA 2DUVA 4O7LA 3V8WA 3IKAA 3ACKA 4O0WA 4NU1A 4E5AX 4CXAA 1TFFA 3HV3A 3QQGA 5DBXA 1WVXA 4EOSA 5I9WA 5HU9A 5M53A 5JGAA 1VLRA 3UZTA 4KB8A 5CSPA 3KVWA 5J5SA 3QQUA 4C61A 3QXPA 1QPDA 3AGMA 1NVRA 1ZYJA 2BVAA 2X9EA 4FKJA 2VWUA 5JZNA 4MTAA 4TYGA 4YTIA 4O22A 3HV4A 3QQJA 4MF1A 1OPLA 4M68A 4X3JA 3Q9ZA 2GS7A 1Q62A 3OBJA 4QQCA 4AX8A 3NYNA 4DEAA 5C1QB 2RF9A 3QCSA 4EORA 3D9VA 4QTBA 4J97A 2WMQA 4I6QA 3ATTA 5I9ZA 2WMVA 4KS7A 3MYGA 4DGMA 2VTIA 5LWMA 4MCVA 4L68A 3QQKA 2W9ZB 1MUOA 2XF0A 4O7NA 4GK4A 2JFLA 3LFBA 3MY1A 2R9SA 4AACA 2F2UA 4X7QA 1J7IA 4EH4A 4W4YA 1WBTA 3DZQA 3JUHA 2O65A 2X6EA 1PMNA 5D1JA 1PKDA 5HX8A 5JFWA 1DS5A 4DT8A 4YJRA 5EQEA 5JFXA 4PMMA 2V5QA 4E5WA 4MUQA 4N0SA 1BL6A 4AT4A 3ZRMA 3W0SA 2XVDA 4YUQA 3FXWA 1Q24A 1KV2A 4NTSA 5L8KA 2PMLX 3V6SA 5AEPA 3QRUA 2XIZA 1B39A 5GJDA 1XH5A 3I7CA 4F7SA 2RFSA 2Z02A 3SKCA 3GEQA 3O5AA 1H27A 3ODZX 4IB1A 4U44A 1CSNA 3FY2A 4FV9A 5IPJA 5C4LA 4HZSA 3GOPA 4LRMA 1JKKA 4RPVA 3QD2B 2HENA 4HZRA 2IJMA 3HA6A 3FMLA 3U87A 2WTDA 5DH3A 2OKRA 2WTKC 4H3QA 4ZY6A 1F3MC 1P2AA 3NUNA 2A2AA 4J52A 4K6ZA 5HVYA 5M4CA 2WQEA 4P5QA 3R9RA 2XIKA 2ZYBA 2XS0A 3VS2A 4XBUA 3E8DA 4YJOA 4AW5A 2XANA 2UW8A 3MN3A 1XBCA 1A9UA 2X7OA 3O8UA 3KB7A 3DB6A 3UGCA 4WO5A 4C0TA 4D28A 3AMBA 2WOTA 2NRUA 4FSNA 1A48A 5AP7A 4PP7A 1A06A 2JDVA 2H96A 3T8OA 3VS5A 4ZY5A 3TEIA 5E1SA 4FKWA 4FR4A 3TL8A 4UN0C 5J9YA 3HECA 1WBSA 3FEGA 2JDTA 3WF9A 4OTRA 4DG0E 4BDKA 1CM8A 3PY3A 3SDJA 4AFEA 4C58A 2O0UA 5HIDA 2WD1A 4G3EA 2HOGA 2XJ1A 3CPBA 2ZV7A 4QP2A 4ZTRA 3LCTA 4XP0A 5AIRA 4K1BA 3AC4A 2XNMA 4WSYA 3VUGA 4FKGA 3UIBA 2BAJA 1YQJA 2C0IA 2FB8A 4E6QA 3ZBXA 1Y6BA 2WU6A 5IA0A 2IZRA 3PE1A 2VTQA 4J8MA 4ZK5A 3NYVA 3MBLA 3BV2A 4F7NA 3EYGA 1M2RA 4UXQA 1OM1A 3F88A 4QYYA 3FQHA 3VULA 2GNIA 1H01A 2Q83A 2VX3A 3L1SA 4L46A 3GOKA 5EW8A 2RFNA 3UO5A 2HAKA 2YCFA 1Q8UA 4ZLYA 2IZTA 3KRRA 1G8SA 1FQ1B 5KBQA 2BIYA 3AD4A 4RIYA 4XRLA 1PY5A 2BALA 4QMOA 4RIYB 3CD3A 3OD6X 2XNOA 1ZY4A 4YLKA 1Q97A 5L6WL 4DF3A 2VZ6A 4B8MA 5KMMA 3R1SA 1URWA 3MVMA 4F9AA 5FTGA 5M4UA 3D94A 4S32A 2W5BA 4C7TA 3ZM4A 4FIIA 4W4VA 4L9IA 4DLJA 5KE0A 5KHXA 2UW3A 3KMWA 3PRIA 5H8GA 4AGUA 3W2RA 3MTFA 1Q61A 3OUNB 3KRWA 4IZAA 2CLXA 4YGAA 2VV9A 3NAXA 2VAGA 3ROCA 2CGWA 1YVJA 1PXKA 3PA5A 3UQFA 3D7TA 3D7TB 3W18A 2ZAZA 1I09A 2GMXA 2G2HA 4I4FA 4MAOA 3CGOA 4IC7A 1REKA 3LMGA 1FPUA 1ZOHA 4ZSJA 2R3LA 4NCTC 3NZ0A 4TWCA 2QOHA 2XRUA 4RVLA 1E1VA 4IADA 4MYGA 2OK1A 2AC5A 3T3VA 4K2RA 3A2CA 3C4WA 1Y8YA 3CSVA 2PPQA 4ZSGA 4M12A 2FSOX 3OTUA 5IUIA 4I24A 3C0IA 3DNEA 4FX3A 2H34A 4EUTA 2WEIA 1RDQE 1XH6A 4V04A 3WF6A 3W2OA 3ZU7A 3PWYA 4DHIB 3OFMA 4A07A 4EH8A 3NNVA 1DI8A 2CMWA 2YZAA 2W1EA 4L45A 3F3VA 4L52A 4O0XA 3UVQA 4O83A 4PP9A 4TXCA 1FBNA 1QPCA 3B2TA 4RLLA 5A46A 2Z60A 3ZS5A 1YOJA 3AC2A 3I7BA 3QYWA 4KWPA 4Y72A 4BVUA 2YM7A 2PZIA 3THBA 3W2PA 2YEXA 4JBPA 3H0ZA 1XMMA 5EI2A 1HCLA 3TNIA 3HRCA 4AOJA 4FUXA 4Z9LA 1PXMA 4C4GA 5DR9A 3FHIA 3BZ3A 2WMTA 3SG9A 2LGCA 3NFFB 3LCSA 3UC4A 4EYJA 4PX6A 3EZRA 3PXKA 3FV8A 4IWQA 4YR8A 2X2KA 2WTCA 2XAMA 4J53A 3LQ8A 3CP9A 3GBZA 3KF7A 4M0ZA 3NUXA 1P4FA 2HZ0A 4IFCA 4KSPA 3R9NA 3I79A 3EMGA 4BCGA 3FZRA 2B7AA 2CN5A 2PZPA 3U54A 3QBNA 2QLUA 4QO9A 3CPCA 4ZOGA 2W4OA 3PXFA 4RJ8A 3RCDA 3CQUA 4EOPA 2XYUA 3IK3A 3DFAA 2V0DA 2HWOA 3FLSA 3QU0A 4ANSA 2R3NA 4CKIA 4WT6A 2WNTA 5HVJA 4CFXA 5KCVA 4CNHA 3BQRA 3EN9A 4WRSA 2YIWA 4A9TA 4I21A 2B54A 4FG7A 4AOIA 1APME 1XQZA 4LRJA 4MXZA 4E8AA 1WCCA 3FPMA 3EL8A 4YJSA 3OW4A 4EK6A 4R3CA 2ITWA 3D5WA 5AM6A 3RALA 3UZRA 2YIXA 4EBVA 4U80A 3G90X 4M3QA 4X2GA 4HGEA 3QUEA 5JRQA 5FP5A 4FSRA 3BYVA 3DY7A 4IWDA 4PQNA 5M08A 2CGXA 2GNLA 3NX8A 4JBOA 4G3DA 1OL5A 5ANEA 4F78A 3MH0A 3O50A 1U5RA 4Y5HA 4JG6A 4IW0A 5HCYA 3UYTA 5HZNA 2QOIA 3R7EA 1XO2B 1YWNA 3FZPA 5ANKA 3VVHA 4FL1A 5EH0A 5I4NA 2UVZA 5GHVA 5ANGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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