3W0RA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n202a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSANVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
total genus 89
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0rA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0rA02
3JR1A 4DBXA 2BKKA 3C5IA 3W0NA 3W0QA 3MESA 4FEWA 3FI8A 3DXQA 2Q83A 3W0MA 5FTGA 5IQEA 5EQEA 5IQDA 3TYKA 4EJ7A 3TM0A 2OLCA 3DXPA 3ZM9A 4N57A 2CKOA 5BYLA 4PDYA 5C4KA 1L8TA 4FEUA 2CKPA 2PYWA 3W0RA 4DT8A 4DTBA 5IQCA 4O7PA 5AFVA 2QG7A 2PUNA 4DFUA 3ATSA 3UZRA 3SGCA 4FEXA 2PPQA 5FUTA 4R7BA 3Q2JA 2PU8A 5IQAA 2B0QA 3N4UA 1NW1A 5EQPA 3CSVA 4U94A 4CGAA 3TDVA 5IQFA 4ORKA 3ATTA 4DFBA 4WZYA 4DTAA 2PULA 4GKHA 4CG9A 1ND4A 5EQYA 5IQHA 5IQGA 1J7UA 2IG7A 4DA5A 3TDWA 3HAMA 4H05A 4R78A 4R77A 3LQ3A 3W0SA 4BR3A 5IQBA 4DT9A 4CG8A 4DE4A 5C4LA 1J7LA 3FEGA 3N4TA 5IQIA 3SG9A 3W0OA 4O7OA 1J7IA 2I7QA 2PUPA 3N4VA 2PUIA 4GKIA 4DCAA 3G15A 3HAVA 3F2RA 4U98A 2CKQA 4FEVA 3W0PA 3SG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IIRA 4OT5A 4FSMA 5HX6A 3NFGB 4PMTA 1KE8A 2VNYA 4MQ1A 3R71A 4Q9ZA 4IVAA 3P5JC 2ZV9A 3F2NA 3FLZA 3MB6A 1P4FA 4MBJA 4WNKA 5L3AA 3SC1A 3V8TA 3L8XA 3IW6A 3TZ8A 1RW8A 3QRKA 5CY3A 2PMLX 3U9NA 4MCVA 4IVDA 5EM8A 1OPKA 1V0PA 3EN7A 4I0RA 5JZNA 3VN9A 3BBTB 2WEVA 3DK7A 4N4SA 2UZEA 4I0TA 4N6ZA 1ATPE 5FTGA 4U3YA 5JGAA 5L8KA 2Z02A 4FTNA 3UGCA 4HVDA 2RIOA 4RZWA 4UYNA 1QPJA 3SW7A 3DK3A 3KXGA 1BMKA 1LR4A 4M8TA 1PXIA 2YM3A 3AC4A 4O21A 3V01A 4AXEA 5CU3A 4PTGA 5BYLA 3CP9A 2XZSA 3KRWA 4YHJA 5CF4A 4CMOA 3QCXA 4L01A 5D9HA 5FP5A 2GQGA 3VS1A 4EHGA 5LWMA 3AGLA 3IS5A 3G90X 3R02A 4IM3A 3R7OA 3QGWA 4DN5A 3ZXZA 3GI3A 3DB8A 4AFJA 4FOBA 2YAKA 1H1QA 3PZEA 4J71A 1CM8A 2OWBA 3G2FA 5AV3A 5M08A 3L8SA 3GC9A 3PSDA 1U54A 4IWDA 3DV3A 3DU8A 5A4EA 4MK0A 4U7ZA 2WMAA 3MDYA 3LFSA 2GU8A 5A46A 1DM2A 4G6OA 3W33A 4DG3E 4D4RA 4PMPA 4U97A 4QNAA 1FPUA 3PXKA 1PW2A 2GFCA 5DN3A 3VBYA 5JRQA 2ZDUA 3BU6A 2C5VA 3MTFA 3WIKA 5BUIA 1ST0A 2WELA 5M09A 3COHA 3WF5A 2WTVA 4GVAA 1Q8ZA 4JT3A 4I41A 4RJ8A 4X2JA 5E8SA 5E91A 5LVMA 2I0EA 4BCNA 2XNOA 2G9XA 2XARA 4HYUA 4O27B 3KEXA 3OVVA 4WT6A 3SG8A 5AADA 2WU6A 4JIAA 4F4PA 4HYSA 4ACDA 2IW6A 2JDTA 3GU6A 4ANLA 1H08A 2R2PA 2UZUE 2ITXA 4PY1A 3OCTA 5DYJA 5CSXA 4H05A 3NMUF 4BRXA 3FI3A 2JKOA 1PMVA 3FMEA 3LQ8A 3NX8A 3RAKA 4FVQA 3R7VA 4WNOA 1NT2A 3NYNA 4FT0A 4E73A 4HCVA 1AQ1A 3KF4A 4HNIA 4FT9A 1H25A 3R04A 1AGWA 2XK8A 4IJPA 5AUVA 5C4LA 1IAHA 3GEQA 4TWPA 2GTNA 5C1QB 2BFXA 5EDQA 1F3MC 4H39A 4PP9A 5IQIA 5IH4A 5CAQA 2B9JA 2FYSA 3C4CA 4LGHA 1XBBA 3BV2A 1H1SA 4G5JA 1YOMA 3KFAA 3VHEA 2XKFA 4KAOA 3PTGA 4J1RA 5IPJA 2YDIA 2OBJA 4D28A 4ZS4A 4II5A 4Y85A 2BCJA 3ENHA 2CNQA 3DA6A 2PVJA 1ZMUA 2UZLA 2EXMA 3C13A 3U6HA 4AGCA 4QMMA 5CU4A 3EQPA 5E4HA 2YZLA 3HL7A 3C5IA 3HYHA 3MSSA 4G6LA 3QQHA 4QYHA 3BEGA 3D14A 3QUDA 4OTQA 2XRWA 2WMWA 4RIWA 5GJDA 2R3OA 3FI8A 4FL1A 3DXQA 4D4YA 1J91A 5F9EA 3I7CA 4I6QA 4QP9A 5D7AA 2GPHA 3QQLA 5CEMA 4GT3A 5M06A 4FYNA 3W0MA 3F3ZA 2V22A 1JOWB 3K2LA 3NCGA 5IQDA 5EM7A 3R6XA 1FVRA 4XLVA 1PKGA 3R7YA 1TKIA 2BHHA 4AX8A 3SDJA 3DZOA 3OWPA 3DBQA 5GINE 4RC2A 4DEIA 2UUEA 2BRNA 3G51A 3VUKA 4AZTA 1KE9A 1XH4A 2VTSA 3HGKA 4O7RA 5HI2A 1R0EA 3UO4A 1U5RA 4BIBA 4IZ7A 3O0GA 4C62A 4YJNA 1BI7A 2AYPA 4GU9A 4FKGA 3BEAA 2HYYA 4WO5A 3BI6A 4R1VA 1EH4A 3W0RA 4RC3A 3MIAA 2QOIA 2X4ZA 4JBVA 2XYUA 3LVPA 4CFXA 4DT8A 4MWHA 2PUNA 3A60A 3AMBA 4XG2A 1JPAA 3NW6A 4IB0A 4JAJA 5HD7A 3UNKA 4FBXA 4G3FA 3KRXA 4ANMA 1TFFA 4EZ5A 3CD8A 4R7BA 3Q2JA 5FEDA 5BYZA 3HRBA 3U51A 4IHPA 4B7TA 5AUZA 1TVOA 3OY3A 2R3GA 2B0QA 1RQQA 3GB2A 1PHKA 2IVSA 3GFEA 3IG7A 4MD9E 4PUZA 3N4UA 2R7BA 3VNTA 4OBQA 1PMNA 3IK3A 4AA5A 4EKKA 1H26A 5A4QA 4IDVA 2Y4IB 3PXQA 3PPKA 3WOWA 3SRVA 4CMUA 3Q9ZA 3GU8A 5K3YA 4X3FB 3O8PA 4YJRA 3EFLA 3D5WA 3V5WA 1MRVA 3QTZA 3QBNA 3FMKA 3BLHA 4MVFA 3VJNA 1KUTA 4DTAA 3UODA 1PMUA 3QTUA 4J53A 3Q5ZA 5IQHA 3PG3A 1W0XC 4RJ7A 3S4QA 2WQMA 1JSVA 4FMQA 4YBJA 3MN3A 4CKRA 2ZVAA 3DKCA 2A4LA 4YZNA 4ARKA 1YRPA 2J51A 3HMIA 1G5SA 2VTNA 4ERWA 3TXOA 4O7SA 3OXTA 4BTMA 4EH4A 1TQPA 3MJ2A 4JRVA 4YJSA 5KMKA 4EHVA 3QFVA 2C6IA 5ACKA 5A6OA 3ZSGA 4A9SA 3H3CA 4KIQA 4JDHA 3QHRA 1KE5A 1H01A 3O51A 4APPA 2JIIA 3FPQA 4G34A 3ZXTA 5CS6A 2YCRA 1IA9A 4DEHA 4MNFA 5FM3A 4O7OA 3PVGA 3B8RA 4OLIA 3OT3A 3OWKA 4MF1A 3NUXA 5BVNA 5JGBA 2C3IB 3ZSIA 3QRJA 4XHKB 3SHEA 5CU2A 4Y95A 3VQHA 5DBXA 2CGVA 4XLIA 2WKMA 3OS3A 4BHNA 3OUKA 4CT2A 3MH3A 4NSTA 4IAFA 4DH7A 4GSBA 3UIXA 5L6PA 3SQQA 4FV4A 3D83A 4AF3A 4BDIA 4XV2A 2XCHA 3ZUVA 1WBOA 2YJSA 3KMMA 4H36A 2C6KA 4FOCA 5KCVA 2XEYA 2ZB1A 4IAKA 4JX7A 4RGJA 4RWKA 4I3ZA 4O7TA 4ZTMA 1WBNA 5C03A 3KXMA 3W0QA 3M1SA 1M7NA 2I1MA 4QP3A 4BICA 1URWA 3VONA 5AX3A 3F3VA 3OZ6A 4HGSA 4O84A 3EFJA 3H10A 4H1JA 3Q3BA 4JOAA 1FGIA 4I5CA 1XH6A 4JBQA 5I5ZA 5IH6A 5J9YA 2HZIA 2CCHA 4U43A 2XNGA 2Z7LA 1OKZA 1Q99A 4XJ0A 4ZTNA 4L53A 4ZZNA 3DCVA 4B6LA 2PVNA 1J1BA 4FTIA 2OLCA 3AC5A 3NCZA 3KK8A 1ZOGA 4JBPA 3TNWA 5I9WA 3UOJA 4IFGA 2G2HA 4B4LA 2H6DA 3A61A 3W55A 4BCJA 3BGQA 1OUYA 4X0MA 5CX9A 1E9HA 1VR2A 4YLJA 2V62A 4QPSA 3WYYA 2CHLA 3C0HA 4EBWA 2HZNA 5FBNC 3W16A 4O7ZA 5HBHA 2ITNA 5C8KA 4EQUA 4O0RA 3WF8A 5GJFA 3UOKA 5AP5A 4PTCA 4HCUA 3UZPA 4XX9A 5F20A 2PPQA 1FVTA 5EK7A 5HU3A 1KOAA 3NZ0A 3DNEA 3VRZA 4JIKA 4AU8A 4AG8A 4QMNA 5ANIA 4CZUA 4TYEA 2RGPA 4B8LA 4K77A 3UYTA 5DVRA 4QQJA 5CAOA 3ZC6A 4IFCA 4FICA 2WMTA 2X2LA 4CGAA 4UXLA 1OMWA 3MVHA 2W06A 3NR9A 1PKDA 5EHYA 2A27A 3DKGA 3OG7A 4U0IA 3H0ZA 4FIFA 4RQKA 3ZSHA 4QP7A 4DLIA 4QNYA 3QA8A 3R22A 4P2KA 3S1HA 3DKFA 4F7JA 3FZSA 5EQYA 4H3BA 1OM1A 2GS2A 4Y5QA 1OGUA 3GP0A 3PDTA 4FNYA 4U5JA 5ETFA 4IX6A 2P4IA 2WTWA 4ASDA 4FODA 3I1AA 2PVHA 4YHTA 3EHAA 4FV6A 5HQ0A 3P1AA 1UA2A 2VN9A 3AT4A 1GZ8A 3FY2A 2HIWA 3R1SA 4G3CA 2QD9A 4JQ8A 4QYGA 5J8IA 2XUUA 2PVLA 3VVHA 3RK5A 3SXFA 3PP0A 4UBAA 5IQBA 4LM5A 4I93A 3NYVA 3SX9A 4O0UA 2OH0E 2WIPA 3NIEA 4L7SA 4APCA 4NK9A 2XK4A 2WIHA 4E4LA 3IONA 4FT7A 2OZOA 4NYEA 3LM5A 4Z7HA 1XQZA 4G1WA 4XV9A 1KE6A 4USEA 5HLWA 4LUDA 1CTPE 2BDWA 4RIXA 4YZCA 5AAEA 5EOBA 2ITPA 4RLKA 4FIGA 3A7GA 4FEVA 4AQKA 4ZTQA 4B8MA 5H8GA 2RG5A 2YN8A 5KMJA 4ASXA 4YBKA 4CD0A 1AD5A 1M2QA 4XP0A 1OL1A 2BKZA 5JN2A 3OD6X 1VJYA 3KA0A 2ERZE 5FD2A 3H4JA 4EK3A 2Z2WA 3KB7A 5E9EA 3ZFYA 2VX3A 2VV9A 3O7LD 4IW0A 3WIGA 4C3PA 3COIA 3Q53A 3FL4A 4YO4A 3QTQA 4WSYA 3OCBA 3UG2A 2QCSA 4CFUA 4I6LA 4R3CA 2YJRA 2R5TA 1ZZ2A 1ZYDA 1W98A 3R63A 2F7ZE 3BYMA 4FSZA 5E8YA 3EQBA 2GHGA 1PXPA 4OTHA 4YC8A 2W1FA 3EFKA 3QRUA 2J2IB 5I9ZA 1T46A 5IMEA 3F9NA 4KABA 4FKJA 4AW2A 3PVBA 1ZY5A 5BUJA 3D15A 2PK9A 3MY1A 2G1TA 2C6EA 1M7QA 3E7OA 3FHIA 3OCGA 3FQSA 4PQNA 2HY81 4XH6A 1IEPA 4UB7A 5CSPA 4Y5HA 4JDJA 5EI2A 4LL5A 4C4GA 4MXYA 2RKUA 2X4FA 2XK7A 4YMJA 1Q41A 5KX8A 3A7JA 4FNWA 4YHFA 4DDGA 2C4GA 5IA3A 3HLLA 4YZMA 1O9UA 1ZAOA 4I5HA 3NNVA 4IQ6A 4IAYA 3QCQA 1FVVA 3ANRA 3PFQA 2YITA 5CANA 3Q04A 4F78A 4YLKA 5JSMA 4TYIA 1OGYA 5M4IA 4XRLA 4I92A 5L2WA 1NW1A 2X8IA 3ZZWA 5AMNA 2VTOA 3R2YA 1WCCA 4X21A 3WF7A 4MHAA 2UW4A 3FZPA 3PIXA 3UO6A 3SVVA 4V0GB 3MW1A 1YW2A 2WNTA 4EJNA 4EEVA 2BMCA 2HW7A 5B2LA 1NVRA 5CXHA 3OF0A 4LV5A 4QOXA 4R5YA 3QQJA 2C69A 3FLSA 4RRVA 2DQ7X 2OU7A 4R3PA 4QO9A 3Q9WA 1GNGA 1ZMVA 2QNJA 1SVHA 3GCUA 5CZHA 4AGDA 3HRCA 3OXIA 2IWIA 3P7CA 3VJOA 4IACA 1P4OA 3FPMA 4JMQA 3Q2MA 3T3UA 4TYHB 1XKKA 5CASA 4BBEA 3ANQA 2QLUA 4MH7A 1KWPA 2E9PA 4GT4A 4AOIA 2B7AA 2YCFA 4GG5A 3NAXA 1STCE 3EQRA 4LQMA 1YXVA 4DFNA 2XF0A 2GNHA 4MXCA 4ERKA 3VUGA 4BYIA 3KGAA 3BU5A 3S95A 5CVHA 1PRYA 3ODYX 3E62A 4QTEA 5BV3A 2WXVA 3C4XA 3PA3A 4FUXA 4RJ3A 3F6XA 4FV9A 4DGLC 4R6VA 2WO6A 4EBVA 2B54A 4GFGA 3EOCA 3JVRA 4AZWA 3IDPA 3CIKA 4XCUA 1UU3A 4NW5A 3RI1A 2F49A 3C50A 4MBLA 4QMOA 3ITZA 4DBXA 4LV7A 4ZP5A 2OXXA 3RGFA 3E8CA 4EH9A 3Q4UA 2V7AA 3G9LX 4G17A 3AGMA 4DAWA 3FMLA 5CXZA 3P5KA 4EC8A 4MWIA 2W7XA 3R01A 3KK9A 3BL7A 3PUFC 5DPVA 4PRJA 5J87A 4FX3A 4F6SA 4JX3A 4RFMA 1GIIA 4RA5A 5AM7A 5ETAA 2W5BA 4IMYA 5EQEA 3O8TA 3RHKA 1SZMA 5M56A 4BDFA 2J0IA 5K4IA 2VX0A 3R8ZA 2V55A 5DT3A 4ITHA 4RLLA 4RMZA 5HO7A 2WTIA 4AE6A 4K33A 3QAME 2REIA 1BX6A 4WNMA 3TACA 3L9LA 3VHKA 2NRYA 3EN5A 5D1JA 2UZVA 2YWVA 5B2KA 2GDOA 1UU7A 5LXMA 5HNBA 4D2RA 4M12A 4O0WA 3OT8A 4FZ6A 4O6EA 2QG7A 1Q24A 5M4CA 4DFUA 4K9YA 3KL8A 4YJVA 2VTPA 4R7HA 4H58A 4YGAA 4E1ZA 5CALA 1Q62A 2X0GA 1H27A 4K6ZA 3EFWA 4FC0A 5F4NA 4DDIA 2IO6A 4FKTA 2VWXA 4KKGA 5KZIA 1UVRA 4FKLA 3H30A 5M07A 4X3JA 3K5UA 4IB5A 3ZBFA 4E8AA 2OK1A 2JBOA 5AV2A 4EHEA 3R8MA 2X2MA 4XRJA 3A62A 3T3VA 3W2CA 2OJJA 4E5WA 2ONLC 5HESA 4CFWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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