3N4VA

Apo aph(2")-iva form iii
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
MRTYTFDQVEKAIEQLYPDFTINTIEISGEGNDCIAYEINRDFIFKFPKHSRGSTNLFNEVNILKRIHNKLPLPIPEVVFTGMPSETYQMSFAGFTKIKGVPLTPLLLNNLPKQSQNQAAKDLARFLSELHSINISGFKSNLVLDFREKINEDNKKIKKLLSRELKGPQMKAVDDFYRDILENEIYFKYYPCLIHNDFSSDHILFDTEKNTICGIIDFGDAAISDPDNDFISLMEDDEEYGMEFVSKILNHYKHKDIPTVLEKYRMKEKYWSFEKIIYGKEYGYMDWYEEGLNEIRSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure and kinetic mechanism of aminoglycoside phosphotransferase-2''-IVa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Enterococcus casseliflavus
molecule keywords APH(2'')-Id
total genus 101
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3n4vA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3n4vA02
3ACKA 2OBJA 2UW3A 2RFDA 3Q9XA 3TKIA 3D14A 3W32A 4U94A 1OL5A 4RZVA 4ZZOA 3EMGA 1P4OA 1TQPA 1UWJA 4J99A 3V8WA 3DV3A 3DQXA 3CQWA 4IWDA 1FVRA 3ZEPA 2ERKA 5E8WA 4P90A 3VF9A 2J0JA 3HEGA 3HNGA 5BNJA 2WHBA 4EZ7A 3UNJA 1F3MC 2B53A 2HWOA 3QQKA 4DEDA 2ITNA 3PYYA 3HRBA 4TYIA 2YIQA 5CVGA 1PKDA 5E7RA 4CFWA 3R8VA 3LJ2A 3PA5A 2G2HA 4J97A 4PTGA 4XG4A 2GNIA 3ANRA 1QCFA 1SVGA 3A7IA 4QTAA 4IZYA 3TIZA 4CGAA 3RM6A 4C4JA 2ZM3A 4DG3E 1BL7A 3PJ1A 2FVDA 4G6NA 3BHVA 5C03A 3R7EA 4YURA 3MH2A 1YDRE 5EW9A 1NVSA 4EWHA 2QLUA 2OFUA 4TL0A 1YXXA 1U5RA 2PVYA 3RK7A 3DPKA 4AZWA 4J53A 1IAJA 4HZRA 4CT2A 4UXQA 4EK8A 1GJOA 4F63A 4RLKA 2RKUA 3FHIA 3E8NA 3PDTA 1CKJA 2F2CB 2IVUA 5E92A 3RGFA 4FL3A 3RTPA 3MY5A 5E8VA 5IQGA 2G15A 2B7AA 2PMOX 4AAAA 1M52A 3V5QA 3TNIA 3QF9A 2GHMA 4B8LA 5HESA 4CLJA 4CG8A 3Q96A 4U5JA 3O8UA 5L2TA 3NW5A 3S95A 4AN9A 3VVHA 4APPA 4II5A 2DUVA 2YFXA 3QLGA 4NH1A 4BGQA 1MRUA 1QPJA 1YOJA 5HNGA 5M4UA 3WF7A 2HZNA 4Y8DA 2Z2WA 3MBLA 4RIYA 3JR1A 3QRIA 4NWMA 4XRLA 5ANKA 4BTKA 3UQFA 5EYDA 2OZAB 4IVAA 2I0EA 4AT5A 4R5SA 2XB7A 5I9YA 1H1RA 4ERKA 2FSLX 3IGGA 3MH0A 3FKLA 3CP9A 4O83A 5DNRA 4IM0A 4C3FA 4QMUA 4D4SA 4DGNA 5C8KA 3ZUVA 1T45A 3LCTA 1OITA 2XJ1A 3GOPA 3OHTA 4LG4A 2JGZA 4NK9A 4P2KA 4TT7A 1YW2A 2J0IA 4F09A 3AC5A 2P0CA 2XBJA 5EI6A 3WF5A 3C4CA 1RE8A 5DVRA 4W4WA 5A9UA 4IANA 1XH5A 4FC0A 2XNBA 3RNIA 3EFJA 3VBXA 4P5ZA 5DT0A 4QP3A 3HX4A 2CJMA 2O5KA 3MWUA 4FV1A 5AAEA 4ZS4A 4MWIA 4R7IA 4O86A 3TI1A 2CNUA 3FSKA 3L8XA 4L00A 4L52A 4FVRA 2IVTA 2Y8OA 4FUXA 1ZOHA 4IVDA 3U9NA 4F0IA 2BRMA 4GYIA 4DHFA 1WVYA 3MJ2A 4EBWA 3PPJA 3T8OA 4XG9A 2ITPA 3R7VA 4CXAA 4DEBA 4MBLA 4HVHA 3BQCA 3EKKA 4EK3A 4O0XA 3UVPA 4HVGA 4ZTNA 2PZ5A 4U81A 3CGFA 3PVBA 3BYSA 4ZXTA 3MTFA 4FBXA 3VBVA 4UALA 2I0YA 5DT3A 5IISA 4IZ7A 3HAVA 3LCDA 3ZU7A 4C38A 4ERWA 1YRPA 2QURA 5FTQA 5DIAA 4AE9A 4I6QA 3FL5A 5L6OA 1M2RA 3DY7A 4G3EA 3HDMA 1O6LA 3AC3A 3SXRA 1HOWA 3ROCA 2IZTA 3MA6A 3ZZEA 1Q3DA 2C0OA 3EQIA 3MESA 3NUPA 2PVLA 2CNVA 4V04A 4TPTA 2GNHA 3QQLA 5EDRA 4HGEA 2OW3A 4GUEA 3V5WA 2C6DA 3Q04A 5AV4A 4JQ7A 3MN3A 4EH8A 4XLIA 5GNKA 4DN5A 3C4XA 4GG5A 4YO4A 3S00A 3GC8A 3HA8A 2IVVA 5EOBA 2ITZA 4DTBA 1OMWA 3H9FA 3UO6A 3FWQA 1UU7A 3LFQA 1OIYA 5HE1A 3V3VA 3DLSA 1LUFA 5IQDA 2FA2A 4YJQA 3ZO2A 2WTKC 3D7ZA 3VRYA 3KEXA 3RPYA 4DYMA 4BYJA 3CQEA 3AMYA 3QRTA 3CEKA 3DU8A 4TYEA 1URCA 4YJSA 3W8LA 4AS0A 4BCQA 2UW0A 4F7LA 4FKVA 3OY1A 5I0BA 3BYOA 1R39A 5HE3A 2VTMA 4NL0A 3SXSA 4BGHA 4E26A 4RX5A 3TUCA 2GQRA 3F6XA 4IX3A 4DEEA 2BVAA 5HX8A 2ITVA 3FY2A 3CGOA 4YLLA 4GIIA 3CS9A 4EUTA 3NAYA 4IZ5A 3NDMA 4AW0A 3E92A 4IAYA 2VWIA 1J7UA 4KIPA 1WBPA 2E9OA 2HW6A 2ITWA 3LFBA 2RGPA 5AIRA 4QT1A 4DEIA 5KZIA 3E93A 3A7FA 4ZSEA 5A4LA 3Q9ZA 4BCNA 4FIHA 1W0XC 2WTVA 2UZWE 3F3TA 3L9PA 2VTJA 5DE2A 1I44A 1WFCA 5DR9A 5GINE 4GH2A 3CIKA 3KB7A 4EH7A 4TNBA 4M84A 4IACA 2HENA 5H9BA 4IFGA 3WBLA 2X7GA 4Z7GA 3UP2A 1U5QA 4ANLA 4BVUA 5CAOA 3O7LB 3DQWA 4EOMA 4ZTHA 4FTMA 3R7OA 2P2IA 2PVMA 3NYVA 4YP8A 3C51A 5DGZA 2HY0A 3V5JA 3QWJA 2I6LA 2W4KA 3H10A 2RIOA 4O7TA 5LVOA 3FMHA 5AFVA 2XCHA 3BYUA 3RINA 4ALVA 1ND4A 3AC8A 3ACJA 2WTJA 3QZFA 4ARKA 3UZTA 2A4LA 4UN0C 5DN3A 3DTWA 2R3NA 2PL0A 4XBUA 5ICPA 4IB0A 2R3QA 3MH3A 3NIEA 2C6OA 3QAME 3R1SA 4X2JA 3KF7A 4D9UA 3I1AA 4NU1A 1CM8A 3I0QA 5CEPA 3GFWA 3MVMA 2YHVA 4FSWA 5BVEA 2GS2A 3NS9A 1WVWA 3B2WA 3RMFA 4HOKA 4N0SA 1WZYA 1ZLTA 5JGDA 3V8SA 3GENA 1P5EA 4QP1A 5EI2A 3ZFYA 4FV3A 3ZM9A 5JZNA 4YBKA 1Q8ZA 3JY0A 3LE6A 5AAFA 4D4YA 4AW5A 4DBXA 3RAKA 4RJ5A 3HV4A 4EK6A 5K4JA 1ZARA 1H0VA 1YQJA 4QQTA 4FOCA 3EN4A 4EZ3A 4O7PA 2HY81 3JYAA 2QU5A 4GT4A 4MHAA 4QNAA 4HJOA 4R1YA 4APCA 4DH8A 2ETRA 5AP1A 3PWDA 3QZGA 3VAPA 4F6UA 1OUKA 3DKOA 3LOKA 5BVFA 3PG3A 1MRVA 5GJDA 1UNGA 2R3MA 3OOGA 4FKOA 5HKMA 4XX9A 4EI4A 3U54A 4DTAA 4PL4A 3CSVA 4U79A 4YMJA 3SOCA 3FMJA 4HYUA 2H6DA 3TXOA 2BDWA 4FIIA 3PXZA 5J1WA 3QKLA 4WNPA 1H4LA 1PXIA 5AMNA 3FMMA 1U46A 4JL9A 3JY9A 5A6NA 3QL8A 4CFNA 4BB4A 1NVQA 5LWNA 2PY3A 5JFWA 3V51A 5CZIA 5TOZA 1NA7A 3C5UA 3RJCA 2QLQA 5AX9A 2QR7A 4AA4A 2E9VA 5EM6A 3GU5A 4NIFB 4XG6A 1JNKA 4ZY5A 3AC2A 4U6RA 2XH5A 5CF4A 3ZLSA 2X7FA 4FV0A 5D7AA 1DI8A 3PRFA 4QMYA 4RWLA 4A07A 4DFYA 4HZSA 2FSTX 2JIVA 3ORKA 3R04A 2RFSA 3QTRA 5M57A 4BY9E 2BKZA 3L9NA 4GW8A 2WOTA 4GT3A 4I6HA 1M17A 1O6YA 2RF9A 1YHWA 4JAIA 1CKPA 3A60A 5LARA 4UZHA 2J5EA 3F7WA 5FP5A 2W5BA 1Y8YA 2F7XE 5HO8A 1U59A 4FV7A 3U87A 1H1SA 2C3LA 4AF3A 4RJ6A 4G3GA 4XS2A 5TR6A 4NZWB 2W4JA 2R7BA 4H1JA 4FZAB 4GFOA 5C9CA 5DG5A 2X8DA 4GVAA 4I92A 4H3QA 1CKIA 2R5TA 2WTDA 3ATTA 4Z55A 4EWQA 4C59A 4BDEA 3E88A 3R8MA 2F7ZE 4FTNA 4D5KA 3ENMA 4KBKA 4GSBA 3DCVA 3VF8A 5CAQA 3QX4A 3RKBA 2OI4X 3C4FA 4OR5A 3G9NA 4JS8A 4V0GB 3HUBA 4LV5A 2KTYA 1KV2A 3FXWA 4JRNA 3EWHA 3OWJA 4ZIMA 3TEIA 4F99A 4O21A 5DOSA 4EK4A 1WAKA 1U4DA 3LCSA 4ZLOA 5HGIA 1XQZA 2HOGA 2C6TA 3QQUA 4HYHA 3ANQA 4CZUA 5GIOE 4L42A 3TUDA 2YJSA 4KRDA 2I0HA 4QMWA 2VD5A 5B7VA 2XJ2A 1GOLA 3Q4CA 3EYHA 2QG7A 5M51A 4GK3A 3OTUA 4M69B 2QKWB 3FLYA 4B8MA 4HGLA 4YLKA 3TNWA 4IM3A 5IEXA 2XM9A 4K9YA 2BTSA 3I0OA 4G6LA 3QCXA 3ZRKA 2J7TA 2XNPA 4FKLA 4AW2A 3OWLA 2WEIA 2ZV8A 4PUZA 5JEBA 4UY9A 1W98A 4PF4A 5AP5A 3VJNA 4ASZA 5M55A 3UIMA 2PE0A 3FZTA 3OXTA 4C4IA 2YM7A 2O8YA 3OUNB 3OVVA 3ZTXA 3EQPA 3N4TA 2VO0A 4ORKA 4PTCA 2F2UA 2BHHA 4FTOA 1PMUA 4M97A 3U4UA 3QZIA 2UVXA 5KBRA 3V04A 5LOHA 5F95A 1M2PA 3SG8A 3QC9A 4QTBA 5M4CA 1FBNA 5DT4A 2VO7A 5KMIA 3F5UA 3ORLA 4I23A 3LVPA 3ZYAA 5BVDA 3O0GA 5JT2A 4I0SA 1F5QA 3LFEA 4OTHA 5AP2A 3FZRA 5AX3A 1XWSA 3U8WA 3BLHA 3EL7A 3GU6A 4OTWA 4RBLA 2B1PA 2V7OA 2ONLA 2OLCA 2PYWA 2WD1A 5EM7A 3V6SA 5IA3A 1Q5KA 4AA0A 2OKRA 1XBBA 5CF6A 4L01A 2Y6OA 4FKWA 4WUAA 2V0DA 2GS7A 4RIWB 4DH5A 4ZTMA 2JDTA 4YGAA 1A06A 2W9FB 2F9GA 1OI9A 3VS4A 3TV6A 2BFXA 1LP4A 3I60A 4L3JA 4WRGA 2JC6A 5J87A 5CSWA 5CU2A 5EYMA 3BELA 2GHLA 1J1CA 4JX3A 2NPQA 4WOVA 2XIKA 4QTDA 4HCTA 3BCEA 3K3IA 4FSQA 2G2IA 5FRIA 5KCVA 4O7VA 2R3KA 3F82A 3NRMA 4F9WA 4EH6A 4DH3A 4HCVA 3MY0A 5I9ZA 5FP6A 4FSNA 2QO9A 4OTFA 5HCZA 4IB3A 1DS5A 3QCQA 2WMAA 3ULIA 4EOLA 4F4PA 4F9YA 2B0QA 4ANSA 2VTSA 5E8UA 1YWVA 4IWOA 5HBHA 4D0WA 5J9LA 2XYNA 4O7WA 4A7CA 3UMXA 2GHGA 4WO5A 3UG1A 4MNEB 3ODZX 2XRWA 3ZRMA 3TT0A 1UA2A 3QUPA 1ZYSA 4I6BA 3ZH8A 4DG0E 1SZMA 4GYGA 2FYSA 3Q52A 2BAQA 3E8CA 1JSUA 4X3JA 3V5LA 4F08A 4X3FC 2WMRA 3KMMA 2RG5A 3MW1A 5HE2A 1H27A 2WB8A 4O0VA 4UYNA 2HYYA 4R5YA 4DLIA 4QYGA 3VS3A 4BHNA 1L8TA 2EVAA 4UBAA 2QO2A 4E5AX 4M67A 2OSCA 3CLYA 4G5JA 4C37A 4RT7A 2C47A 2E9UA 2XEYA 4KSPA 4M0YA 4ZSJA 2JDRA 1OIRA 4NJ3A 4XMOA 4ZTSA 5HBEA 3KN6A 3TZ9A 2V62A 4E1ZA 1OPLA 3VS0A 4EH9A 4UX9A 2XNOA 4EH5A 3IOKA 1XH4A 4RX7A 5IMEA 4NKAA 3QZHA 3C4EA 5ANJA 3EQRA 3A99A 2HXQA 4L9IA 4FSYA 3NYNA 4X3FB 4QNYA 4CFUA 4DC2A 4ZLZA 4QMPA 3AXWA 5CEKA 3UPZA 4WA9A 4Q9SA 3S0OA 3RK5A 4W4XA 3QYZA 4PDOA 1YXSA 3PPZA 4K77A 3VUHA 5CF8A 3U55A 3PY1A 5JN2A 5CEIA 4O2ZA 4FGBA 5EI8A 5ANDA 3FQHA 4FKTA 4FZFB 4F7SA 1FVVA 1OL7A 4YJUA 4YHFA 4BRXA 2JKMA 4H1MA 3QA0A 3EL8A 4B7TA 1AGWA 4XG8A 4F9CA 3KRRA 5EHOA 3R8LA 3W8QA 2QOLA 3F7ZA 4CNHA 4CRLA 4XHKB 3VHKA 4GU6A 3IKAA 4XH6A 2I40A 3R9RA 2J5FA 4OT5A 2HK5A 4AACA 2EB3A 4E73A 1YWNA 2C5NA 4RIXB 5CENA 4XLVA 4BIDA 2JFLA 3KMUA 4DCEA 3KA0A 4UWCA 1OKYA 4V05A 2X6DA 2YZAA 4H05A 3T3UA 3LKMA 3Q3BA 2ITQA 2OGVA 2QHNA 4RVLA 3P78A 4H39A 3TL8A 4E4LA 4F70A 2JIUA 2JDOA 3I6UA 2CKEA 4D9TA 3C0IA 3LFDA 3AD5A 3LMHA 2B9IA 4DITA 3HGKA 4FSMA 2YDJA 4QRCA 1Q61A 5C8NA 3DKFA 3VULA 3I5NA 3CBLA 2VWVA 2EB2A 1WCCA 4YTIA 4X21A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3TNP C;  4GJ3 A;  2YIS A;  1H08 A;  4JG6 A;  1ATP E;  1NY3 A;  2ZV2 A;  4O0T A;  4DEH A;  4G3F A;  2VTT A;  3RPS A;  3VID A;  4E8A A;  3SOA A;  1AQ1 A;  4W8E A;  5IDN A;  2C30 A;  5M06 A;  4RWI A;  5E8Y A;  3GVU A;  4GFG A;  3W0N A;  3FC1 X;  2O64 A;  4KKH A;  4RIX A;  5BYZ A;  3KU2 A;  3MVH A;  1BKX A;  4M7I A;  4G5P A;  4ZZM A;  3CJG A;  2YJR A;  4O0W A;  4Y72 A;  4EKL A;  5I5Z A;  2YZL A;  3FE3 A;  1KE7 A;  1GZN A;  3UNK A;  3OD6 X;  2W9Z B;  3HMN A;  3DK3 A;  4CMO A;  1PXK A;  3T9T A;  3R9D A;  2NNW B;  4EYJ A;  1IA8 A;  3G5D A;  3UPX A;  4ACD A;  3NFF B;  2Y4P A;  3SRV B;  2PUL A;  3LMI A;  2YWP A;  2QI8 A;  2PUI A;  4I22 A;  4K18 A;  3Q5Z A;  2SRC A;  5JFS A;  4OUC A;  3UC4 A;  2XKF A;  1UU8 A;  3IW8 A;  3K3J A;  4JDK A;  2ITX A;  5DI1 A;  2OID A;  1YOL A;  2RL5 A;  2WMQ A;  2WO6 A;  3E7V A;  3ZMM A;  3LLA A;  4YZC A;  4RC3 A;  4B9D A;  3E63 A;  1G8K A;  1UNH A;  5HTB A;  5L3A A;  3ZDU A;  2XF0 A;  3BHY A;  3C0G A;  3DBC A;  4OTD A;  3R0T A;  3FY0 A;  5H3Q A;  3Q4Z A;  4AXD A;  3ZO4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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