3PDTA

Crystal structure of the c-terminal truncated alpha-kinase domain of myosin heavy chain kinase
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
254
structure length
251
Chain Sequence
TGEMGILWEFDPIINKWIRLSMKLKVERKPFAEGALREAYHTVSLGVGTDENYPLGTTKLFPPIEMISPISKNNEAMTQLKNGTKFVLKLYKKEQQASRELYFEDVKMQMVCRDWGNKFNQKKPPKKIEFLMSWVVELIDRSPSSNGQPILCSIEPLLVGEFKKNNSNYGAVLTNRSTPQAFSHFTYELSNKQMIVVDIQGVDDLYTDPQIHTPDGKGFGLGNLGKAGINKFITTHKCNAVCALLDLDVKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Autophosphorylation Activates Dictyostelium Myosin II Heavy Chain Kinase A by Providing a Ligand for an Allosteric Binding Site in the {alpha}-Kinase Domain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Dictyostelium discoideum
molecule keywords Myosin heavy chain kinase A
total genus 71
structure length 251
sequence length 254
ec nomenclature ec 2.7.11.7: [Myosin heavy-chain] kinase.
pdb deposition date 2010-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02816 Alpha_kinase Alpha-kinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel Protein kinase-like fold MHCK/EF2 kinase 3pdtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pdtA01
3LFAA 3MTLA 4FKVA 1QCFA 2ZV2A 1H01A 3AD4A 2Z8CA 2OBJA 4NKAA 5M4IA 3A60A 3JYAA 4YSMA 4U3YA 1BL6A 2GQSA 5EYCA 3PXKA 1AD5A 2QOBA 3BELA 2UZDA 1U54B 3Q4UA 4FL3A 5EK7A 3KVXA 2EU9A 4NT4A 5HG5A 4YHFA 1SVHA 4BDBA 1W8CA 5KUPA 4EH7A 4ZS0A 4EONA 5E8ZA 4EYMA 2CGVA 3BYUA 3BWJA 5KMKA 1RDQE 3MH3A 3DXNA 3OCTA 4O86A 3BWFA 4JXFA 4FOBA 4K1BA 5AIKA 2HIWA 3GU4A 4DINA 3MY1A 3C4XA 4BBMA 4CZUA 5CEKA 4LV8A 2C6KA 4FT5A 3E8CA 3Q4TA 4J52A 4UEUA 5KZIA 1J3HA 2Y0AA 5AV4A 5I9ZA 4WKQA 2Z7SA 3QU0A 3HZTA 2ITZA 2JKMA 3FAAA 1U4DA 4U79A 4NCTC 5HCYA 5HI2A 3TKUA 4CRLA 3FWQA 3NUAA 3TNIA 3NCZA 5GINE 3BEAA 5AUUA 4D1XA 1ZMUA 4JDJA 4F7LA 4FT0A 4LMNA 3P78A 3SW4A 4EI4A 4JBOA 4ANQA 3W33A 2UVXA 5GJFA 3ZLSA 4RGJA 5FEDA 4FG9A 2CKOA 1KE7A 4WNPA 4XG4A 3FQHA 4YZCA 5KBQA 3BIZA 4Z7GA 2R3IA 4FSNA 4U6RA 1QL6A 4NH1A 2ZJWA 4CFWA 5DOSA 2ETMA 4YTCA 4RIWA 3SW7A 4IFGA 3RPYA 2YACA 1IG1A 3TG1A 1F5QA 4P90A 3PG1A 1FOTA 3ID6C 5JRSA 4L00A 4IX4A 2WOUA 2IJMA 4Q2AA 2B0QA 3MH1A 4D5HA 3BHHA 3F7ZA 3RHKA 3RINA 4XYFA 3RJCA 3Q9WA 2YIQA 3SVVA 4GV1A 4LGGA 1UNHA 4ZMFA 2ONLC 1JLUE 1OKZA 2OZOA 2ITPA 2F2CB 3ZFYA 2YCSA 3NNWA 4TYHA 5HE3A 1H1PA 4YP8A 4AE9A 4JG8A 4DFUA 4U7ZA 4DEGA 5CASA 4U0IA 4W4WA 4AW5A 3VF8A 3B8QA 3PSBA 4QP7A 5E8YA 3QTSA 5IQCA 4G1WA 4IWOA 3IW6A 4QMYA 4UYAA 4J98A 4I21A 3EJ1A 3K2LA 4MXOA 5KE0A 4NJDA 3LXLA 4NJ3A 3EQGA 3MFUA 2OIDA 3FKLA 3NYXA 2PE0A 2PMIA 4X2NA 3U4WA 4RFYA 3CQUA 4DLIA 5CU0A 4J71A 5B7VA 1G8SA 4ACGA 4M3QA 3ZLWA 1U46A 2UVYA 3FY2A 1EH4A 2IZUA 3NYNA 2Z7RA 2G2HA 2P33A 2YABA 5ANGA 2VGPA 2A4LA 1H8FA 5B2MA 3K5UA 4UZDA 1MRUA 2QG7A 3GUBA 2JD5A 3DS6A 4FR4A 3ZZEA 4DG2E 3L8XA 5DRDA 4RVLA 2FSMX 3PRIA 5HLPA 1DI9A 4D4SA 1PJKA 4QYHA 4ITHA 1XH7A 2O65A 3DA6A 3VS2A 4DTKA 5M53A 3SV0A 4Y8DA 3V5WA 1H24A 1M7QA 4FV0A 3SG8A 4AGDA 4FG7A 3EFKA 2ITXA 5C27A 2F9GA 3UC3A 2YM6A 3WF8A 5HG7A 4Z9LA 4UX9A 2G1TA 2Q0NA 3QF9A 5IA0A 1OKVA 4QMMA 4FKJA 2R64A 4C02A 4FKWA 1S9JA 2I0EA 4ANBA 2CHLA 4FNYA 4EH4A 3I60A 4FVQA 5FXRA 4RJ7A 4RX8A 3OOGA 1LP4A 5F4NA 5IG1A 2WTWA 3V8SA 4GKIA 1XBCA 1KWPA 3KL8A 5HGIA 2VAGA 3VS1A 3QRUA 5FP6A 2BRBA 4C2VA 4FEUA 4F7SA 2FSLX 2QLUA 4RX5A 3BKBA 3QYWA 4BCGA 5CENA 1PKGA 4E6DA 5JFSA 4EHVA 5HNGA 4NWMA 3OW4A 2PWLA 3BHYA 2OIBA 1WVWA 5CYIA 2GHGA 2VRXA 5LMAA 5TOZA 1B38A 3W10A 4B0GA 4CNHA 4MAOA 3QBNA 3FLWA 1RW8A 2OJIA 4JAIA 2GU8A 4YMJA 4CTCA 3D5UA 1YDRE 3E7VA 2CJMA 5IA1A 3MV5A 4X2GA 3RAKA 1BKXA 2JAMA 1LEZA 2ZM3A 3Q5ZA 3QFVA 3NPCA 4H1JA 4KSQA 4XG9A 4EHGA 4IADA 4NIFB 2XIZA 3H10A 3ZUTA 4QP4A 3TACA 3SRVA 4F0IA 4G3FA 4ZEGA 2WTKC 3R1QA 2OWBA 2UW5A 2WZJA 2ZV8A 5IA4A 4XOYA 3MYGA 3DKCA 4ACDA 2OFUA 4QMOA 3OWJA 4B99A 4NM5A 4B4LA 1FGKA 3LFFA 3D94A 2RFNA 2UVZA 4RJ5A 1H25A 2IVTA 3ZO4A 1M2RA 3A7IA 3H30A 2C0IA 3QHRA 2X7OA 4FV8A 5EW3A 4HVIA 5LXMA 1PMUA 2X2LA 2NO3A 2ZMCA 3A8XA 4G17A 4HPUE 5FGKA 1GZKA 4KBAA 4JNWA 3ZRKA 4EQUA 2XNEA 3UG2A 4AZSA 3ORPA 4ZP5A 5EW8A 2UW0A 4BDGA 4GUEA 2WMRA 3ZMMA 2JBPA 3FZ1A 5TT7A 2NPQA 3E63A 4BI2A 5M4FA 3OBGA 4D2RA 4NUSA 4IM0A 2Y6MA 4YLKA 4X2FA 4RC3A 3VBVA 2W17A 3LKMA 4BCQA 3L9PA 4Z7HA 3WZDA 2UW8A 3Q3BA 3PSDA 4O84A 2RG6A 4I6BA 5LQFA 2QO2A 5CI7A 3UIUA 5CX9A 4EOPA 1MUOA 3SGCA 4RJ3A 3QQHA 4BBEA 1NVQA 1OIUA 3V51A 1KV1A 1OKWA 4U8ZA 2XCHA 3O96A 5LVNA 2C6OA 5CVGA 5EYKA 4FKSA 3F66A 3Q52A 3FY0A 5FDPA 5FXQA 1O6YA 2FSOX 5IUIA 3UE4A 3R8VA 3Q53A 5CT0A 5K5XA 3I7BA 5AAGA 4FG8A 4O2ZA 4GSBA 1DS5A 2R7IA 2V22A 4EQCA 3P7BA 2R3HA 2C1BA 1H1QA 4I3ZA 5EM8A 2OZAB 2HZ0A 2I1MA 4APCA 3FMKA 2V62A 3AC1A 3N4VA 4KRCA 3DBEA 2I0HA 3OCSA 3E3PA 3WYYA 2HW7A 3COIA 2XVDA 3QQJA 4ALUA 4LUEA 4AZEA 4XUFA 3G6GA 4K77A 2J4ZA 4L44A 3GGFA 2J0KA 3G2FA 1ZY4A 3VIDA 3ACKA 3S95A 2OFVA 3JR1A 3UQCA 5E4HA 4AU8A 2WQBA 1VYZA 4L42A 2EB3A 4M12A 3HP2A 4C4EA 1OITA 3O0GA 1I44A 3GOPA 5AWMA 5HE0A 4K33A 3GCSA 3I79A 4QTAA 4MBJA 3PVGA 2H34A 1YWRA 2ZM1A 4L3LA 3RCDA 4IVCA 3FL4A 2R9SA 4BDCA 2RFDA 3JVSA 2ETRA 3ET7A 5BNJA 4IAKA 4PUZA 4HCVA 1LR4A 3MVHA 4ID7A 1P2AA 2IZSA 2XKFA 1BLXA 3WIKA 4MCVA 5KKRB 3Q04A 1FVVA 4KSPA 4E5BA 4EH2A 3C50A 4BTKA 5IA3A 3QX2A 2JEDA 2WTVA 1Q24A 3NVKI 2W5HA 3CKXA 3TNWA 2PZ5A 3TZ7A 4ERKA 3DBFA 3RMFA 4NW5A 3GFEA 3F5XA 1QPJA 5ANEA 2XNOA 4IACA 4JLCA 4JG7A 4O7SA 2I6LA 4MD8E 4HGTA 2P2HA 1O6KA 4BGGA 4GK3A 4I0TA 3GC0A 5LARA 3EN9A 4AA4A 3I5ZA 2P55A 4I0SA 1Z9XA 3ANQA 4YPSA 3FC2A 4YGAA 4BZOA 5D9HA 1MP8A 1JKKA 4FTCA 4ENXA 4Q5HA 3BGZA 3KRRA 4DEBA 5AAEA 1YXSA 2VU3A 3BLQA 4XH6A 3U6JA 2OXDA 5EQYA 3HRCA 4F0FA 4YR8A 2WIPA 2QOOA 2B7AA 4MXAA 3HMMA 4CCUA 1L8TA 2PVLA 4JRNA 2XB7A 2GPHA 2PMOX 2IO6A 4ACMA 2YDKA 3KFAA 3F7WA 2O0UA 2H6DA 4BF2A 3MVLA 5CT7A 5TKDA 5KMNA 1WVYA 5E1SA 3DAEA 2J0MB 4DGLC 4UYNA 4O7NA 3HV5A 4MHAA 3ZSHA 4F08A 4R7IA 5AMNA 2PVHA 3BV2A 2YEXA 3DDPA 3E62A 3PG3A 1FMKA 3BBTB 3QRIA 5DH3A 4F9AA 1YHWA 4Y5QA 3II5A 3AQVA 3NIZA 4RZWA 4C4JA 2OJ9A 1XH9A 4IWDA 3C0HA 1UV5A 4I94A 4FGRA 4AOJA 3VHEA 2BCJA 3CCNA 1XH6A 4NU1A 2JFMA 1SZMA 2CN8A 4WNMA 4M69B 2PVKA 3IW7A 2UZUE 1W84A 3GQIA 2XK6A 3SXRA 2JBOA 4EJNA 1ZOHA 3GVUA 5HHWA 4DN5A 4NM0A 4L52A 3H9RA 1MQ4A 4I5CA 2QC6A 4PP7A 4HPTE 3U8WA 5J1VA 1QPCA 3PVBA 3EN7A 3TKIA 4ZMEA 1OI9A 5LWNA 4E6QA 3TV4A 3UJGA 3JPVA 5T6KA 5CEQA 1ATPE 4XV3A 5LVMA 2J9MA 4GK4A 1SNXA 1PXNA 4KKEA 3ZHPC 3HAMA 4I24A 3WF9A 2EVAA 5CF8A 4G34A 4AXAA 2J0IA 1WBWA 4X2JA 5CQUA 2GNFA 4AN2A 4RA5A 5HTBA 3QTQA 2PHKA 3COMA 3PXYA 2JIIA 3I6WA 1O9UA 4IB1A 4FTRA 4FVPA 4EL9A 5EOLA 2XJ0A 5HEZA 4E6AA 3NNVA 2J5FA 2YERA 3I81A 3UTOA 3PJ2A 1NT2A 4FSMA 4IVAA 4BB4A 4RLLA 4WO5A 1OL6A 1REKA 4PL3A 4FOCA 4YU2A 3ZFXA 3T3VA 5FD2A 5GJDA 2VTMA 2EXMA 3I0QA 2EWAA 2O2UA 3SD0A 3KREA 4XMOA 4QTDA 3PRFA 3SOAA 2DS1A 3F5GA 5L6WL 3E7OA 2WMAA 4JDKA 5DLSA 3HP5A 5D7VA 3VBWA 4EYJA 3HMIA 2PPQA 4R3PA 5T68A 4JBVA 2VTQA 4RFZA 3WARA 2G15A 3OROA 4YBJA 3T9IA 4Y5HA 4ANSA 5A4LA 1H00A 3QZFA 4IB3A 5E92A 1OIYA 2O64A 3L9MA 3UC4A 3VQHA 1WZYA 1AQ1A 2BMCA 4JIAA 3O71A 4D28A 5IEYA 4I6QA 4N6YA 5LVPA 3Q4ZA 3WF6A 2EXCX 4L7FA 4OLIA 5CZHA 3ZM4A 4A9SA 5CEPA 2J0JA 4FEVA 3CR0A 4DFNA 2BZHB 2WTKB 1SYKA 3DDQA 4G6NA 3V5PA 3DKOA 3KVWA 3QX4A 3A7GA 3MI9A 4D9TA 1Y6BA 5K3YA 3QCQA 5F9EA 4ONAA 4YSJA 2XBAA 3QCXA 2OZAA 1WMKA 2F57A 2GTMA 3ORKA 3F88A 3FZRA 4FTNA 4K8AA 3VWAA 1FQ1B 3ZBXA 2VTIA 3RWPA 3VAPA 1XWSA 4FEWA 4APPA 1XH5A 1PYXA 1HCKA 4EOKA 3LFDA 4C35A 3QRKA 5L3AA 1OPLA 5JMSA 3HV3A 5DI1A 1E1XA 4HGEA 4G2FA 4B9DA 3W2RA 2WQMA 3TUDA 4O0RA 4L9IA 3BLRA 2EB2A 3EZRA 3S00A 5AA8A 4Q9SA 1VJYA 2GSFA 3C4EA 3V8WA 5FUTA 4FSWA 2PVYA 5HICA 1XH8A 3KRJA 2C5YA 3OP5A 4HZRA 3O17A 4TRLA 4ALVA 4E1ZA 3CKWA 2BVAA 4BICA 5A4EA 1RE8A 2ITWA 2YWPA 5E8WA 5EW9A 5I9YA 3F2RA 4LI5A 4C34A 5H3QA 3B2WA 4JDHA 4OBOA 3H3CA 3LE6A 4FTQA 3UNZA 2PUNA 3PJ8A 4BDFA 3LXNA 4ZTQA 4B8LA 1UWJA 3F2NA 3LFQA 2XRWA 2ZDTA 4XHKB 5M06A 2XM9A 4M7IA 1JBPE 3F2AA 1UNGA 2C6IA 3D5XA 4PMMA 2GS6A 2LGCA 2VTTA 3AD5A 4O2PA 3EQPA 4D2SA 3OOMA 4A4OA 5CAPA 5CU6A 4CKIA 3EKKA 3QKMA 4GFMA 4RIOA 1Q8WA 3ULIA 1PXPA 1Q97A 3BE9A 4OTFA 4HVHA 3DK3A 2IW8A 4MXZA 3VUGA 4EK6A 4DEAA 2V7OA 2VTOA 4NTTA 3R28A 4U41A 4NM3A 2A2AA 2X8IA 1UU3A 5G1XA 2BRGA 2UZTA 2R3NA 4GU6A 4KB8A 4L3JA 3NGAA 2GNIA 3IK3A 2FYSA 4ZS4A 3D7ZA 4MQ2A 1PKDA 2BDJA 2QVSE 3UOHA 4BIBA 4WSYA 3F82A 3SKCA 5KBRA 4F6WA 2J5EA 5E7RA 2XYNA 5E8XA 5D12A 5FQDC 5HLNA 2QOHA 5HNBA 4RJ8A 3U9NA 5CAOA 5GIPE 2C3LA 3NLBA 4ACCA 3M1SA 4JJRA 4QQTA 4J96A 4C7TA 3QWJA 3LPBA 3HA8A 2B9JA 4FSTA 1WBTA 2Y4PA 4J8MA 3LIJA 3QQKA 5H9BA 1BYGA 2W4JA 3PSCA 2C3JA 4KBCA 3FSKA 4GS6A 4DGNA 4U45A 5EH0A 1ZZ2A 4UBAA 5AUTA 3F3VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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