3PUFC

Crystal structure of human rnase h2 complex
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
155
structure length
127
Chain Sequence
AIERHRVHLRSATLRDAVPATLHLLPCEVAVDGPAPVGRFFTPAIRQGPEGLEVSFRGRCLRGEEVAVPPGLVGYVMVTEEDRFIGATANFSRFTLWGLETIPGPDAKVRGALTWPSLAAAIHAQVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural and biochemical characterization of human RNase H2 complex reveals the molecular basis for substrate recognition and Aicardi-Goutieres syndrome defects.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Ribonuclease H2 subunit A
total genus 13
structure length 127
sequence length 155
chains with identical sequence F, I, L, O, R
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF08615 RNase_H2_suC Ribonuclease H2 non-catalytic subunit (Ylr154p-like)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.130 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pufC00
3PUFC 3P5JC 3KIOC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1R78A 4EYMA 3P0MA 3KL8A 2ETRA 4E4XA 5AP4A 4BCIA 3VBVA 2RIOA 1JBPE 4XOYA 3FMJA 3F5XA 1XHAA 3OTVA 5DRDA 2FSTX 4BTJA 3EFLA 3E93A 3PPZA 4X2FA 3KXMA 5KX8A 3EKKA 2VTPA 4PTGA 3BGPA 4KSPA 5CAPA 3C4CA 4FBXA 3DTWA 4V04A 2WU6A 3EN7A 1PXJA 3V8SA 1IRKA 5HEZA 4XS2A 4FR4A 4RC4A 4O0XA 5B7VA 4XG2A 5CEIA 4E5WA 4MQ2A 4RIWB 5DWRA 4D9TA 3I5ZA 1XH6A 4M84A 3OT8A 5HTCA 4YJPA 4AOTA 3R28A 4PTEA 3ZZWA 3LM0A 1CMKE 5EI8A 5H2UA 4JQEA 5IDNA 4JS8A 4A9SA 1TQMA 2BPMA 3PRFA 5EDPA 5KNJA 2WGJA 3R2YA 3EN4A 4O7RA 4L68A 5DG5A 4AGWA 2OLCA 1RE8A 1CKPA 3GI3A 4AZSA 2Z7QA 2ZV2A 4B6LA 1WBOA 2CNUA 4PRJA 3MTLA 3L9MA 4ZIMA 3VRYA 3ZC5A 5IQGA 1Q8YA 3ZDIA 1WVXA 1HOWA 4Z9LA 4GH2A 4BIBA 3H30A 4LV5A 1UKIA 4K11A 4XX9A 4ZOGA 4YLKA 4DN5A 5I4NA 3F3ZA 4BIEA 4HYSA 1J1BA 2R0UA 3R63A 2G01A 2YM5A 4E20A 4D0WA 2YACA 3H9OA 4J53A 5AP7A 2WQBA 5CSVA 1O9UA 2J0LA 5C03A 3V5JA 4O0TA 3UVRA 3VS3A 2OICA 5CVGA 3C7QA 5ETFA 4EK4A 5ITAA 4BIDA 4UBAA 3E3BX 3THBA 1XH9A 2J51A 2XKFA 5EOLA 4IC8A 4CFMA 4MBLA 2ZMCA 3MPTA 2C6TA 4RQVA 3TUCA 2WMSA 1H01A 3W32A 4CV9A 4NM3A 4YZBA 4E6QA 4UX9A 3GT8A 3TZ8A 1MRUA 4ALWA 5IH5A 4DG0E 4FEVA 2QVSE 3GC7A 2BZKB 5EG3A 4AF3A 3QTUA 2QOKA 3OCSA 5AP6A 2QO2A 3A61A 2FVDA 2PMLX 1O6YA 3IW8A 4EOSA 2OSCA 4O7ZA 1E1VA 5L8JA 3HDMA 5JMSA 3DU8A 2ETMA 1VZOA 3FZRA 4IZ5A 4XBRA 3F61A 3R2BA 4BCMA 4XG7A 2C5OA 4U42A 5L2TA 2R3FA 2RG5A 4I92A 2A1AB 5KMJA 2X0GA 4MD9E 2UW9A 3L1SA 3ZSHA 2XNEA 3FQHA 4Y83A 1W7HA 3R83A 4D5HA 5B2LA 3HV6A 4F7SA 5JK3A 3CCNA 3KEXA 3GU7A 4FTLA 4HPUE 2C5VA 4I5PA 4IACA 4EH5A 4FT7A 2YM8A 5DPVA 3QALE 4Q2AA 1UU8A 1ZZ2A 3IW7A 2B55A 2NRUA 3FDNA 3NPCA 5HX6A 2W99B 4A4OA 4BCNA 4XV3A 3QC4A 4CD0A 5IA4A 5M57A 2QNJA 4BCPA 3P7AA 3IDCA 4FKWA 1PXOA 4FL1A 2XA4A 3RINA 2J2IB 3OUNB 1FMOE 4AN3A 3C0HA 2X6DA 3OOGA 5IEYA 2XRWA 3UGCA 2R3KA 2OK1A 4U97A 3LLTA 2ONLC 4C4EA 2XK3A 4BGQA 4FTKA 3IK3A 2ZV9A 1BLXA 2ERKA 3NYNA 1OPJA 3W2SA 3TEIA 2JKKA 1BKXA 2PVYA 4YSJA 3FMDA 4TYHA 3QTZA 2UW7A 4IX3A 4Y95A 5LXMA 3PJ2A 3FKLA 2CCIA 1URCA 2GS7A 3NW5A 1ZZLA 3KULB 3Q2MA 3BU3A 4OT5A 1OBDA 4G3GA 4GW8A 5M4CA 4ZTNA 5ANKA 3I5NA 4JAIA 1OB3A 5LCKA 4EOIA 3E8NA 5LMAA 1Q41A 3CEKA 4ZS4A 4ITJA 2VZ6A 2HENA 3M11A 3RMFA 2J5EA 3AC8A 4GUBA 3DLSA 4ZS0A 4EH3A 5AP3A 4IBMA 5BUEA 2PPQA 3AT3A 3CXWA 2GHLA 2OJIA 4WIHA 3V04A 4FTIA 4QMTA 5HQ0A 4EYJA 4RX5A 3VBXA 2WXVA 4XOZA 5DA3A 1H1PA 4E4NA 3DBFA 5CWZA 5DFPA 5LOHA 3E7OA 2QLQA 5BVEA 4FTUA 4TNDA 4BDAA 3A99A 1LEZA 2ONLA 3NW6A 5C8NA 2J0MB 4BBMA 5EHYA 3PVBA 4R7IA 3FSFA 5FM3A 4J98A 3LVPA 3OWLA 3ATTA 2O3PA 3S00A 2QHMA 3H0ZA 3KFAA 3HMMA 3G6GA 4C36A 2XAOA 3FQEA 4JOAA 5A4CA 4Q9SA 2I6LA 4UWBA 2BRMA 4BB4A 4G9CA 4AQKA 3P7CA 3QTXA 2PULA 2OG8A 3H10A 3P5JC 4BICA 5DYJA 1VLRA 2PVFA 5CTPA 3A8XA 5DOSA 1XR1A 3QUEA 4JNWA 4H3PA 1Q8WA 4YO4A 3KCKA 3L8VA 4FTJA 4GFGA 4KWPA 2WHBA 4BZDA 1SVGA 2QR8A 5CAOA 5HLNA 2PZIA 3FL4A 5C27A 3HNGA 1OITA 4QYEA 2PVLA 3FZOA 1MQ4A 3PE2A 4FVPA 3QRKA 4L01A 4BCOA 1P4FA 3NSZA 4U0IA 5KKRC 2UVYA 3PG3A 3EQDA 3E92A 4CCBA 4QYYA 1ERKA 5HLPA 5J9LA 4APPA 3FHIA 2QOLA 3TNIA 4QDVA 4Y46A 4D28A 3LIJA 4QP3A 2J0IA 3BHYA 2B0QA 3OY3A 3IW6A 2QODA 3RCDA 3R8MA 3GC9A 1TFFA 1BX6A 3DB6A 3O8PA 5HCXA 3UODA 5EKOA 4F99A 1ZMUA 1CM8A 4TXCA 2UW4A 4FODA 4RLKA 2VTSA 2ITQA 3WI6A 4BDCA 3ORMA 4AS0A 3FL5A 5CZIA 4C59A 1H0VA 3QZGA 4IJ9A 4I6HA 3MH1A 4PUZA 2YIRA 1PJKA 3AXWA 5K4JA 1JSVA 4RWJA 3W2OA 2CSNA 4O83A 2BKKA 1VYZA 2R7BA 3R8PA 4IX5A 4K9YA 4JXFA 3BCEA 4HPTE 3D7ZA 4BDKA 3I6WA 3F69A 2YWVA 2W4KA 5LVOA 2UW6A 4GT3A 3MVLA 3MI9A 5HU3A 2VV9A 3KRRA 4NWMA 4RVTA 3NLBA 3PVGA 3ODYX 3QKKA 1PY5A 1OUKA 3MFUA 3E5AA 1PXLA 3HMIA 3CY3A 4WSYA 1J7LA 1M14A 1O6KA 4ZJJA 5CENA 4C58A 4WBBB 4FE2A 4XLIA 4OW8A 2J5FA 3P86A 4X3JA 2JDTA 4U3YA 3HYHA 4ACMA 4C2WA 3I6UA 4II5A 4LGGA 4GRBA 2KTYA 2VO6A 3CPBA 3UDTA 4O82A 4PX6A 4FT0A 1FBNA 3E8DA 2OF2A 4Z55A 4FKVA 3BIZA 2Z02A 2OIBA 4O2PA 1WAKA 2YCSA 4V0GA 4MBJA 4X2NA 3RWQA 4YJRA 1F5QA 4IAKA 3BEAA 1PKDA 3BL7A 3DFAA 2CHLA 4GCJA 5AP5A 1R3CA 4BN1A 2CGVA 3VONA 4AAAA 1W98A 2JFLA 3OMVA 2PVHA 4DYMA 3S2PA 3C4WA 2J0JA 3HEGA 3Q5ZA 1R39A 3FLSA 3QCYA 5TR6A 4DG2E 2QOOA 1J7IA 4F6SA 4RQKA 3C5UA 3WOWA 4AU8A 2WMAA 2XH5A 4AAYA 4IE9A 3BLRA 3VVHA 3ZUTA 1BUHA 1FVTA 2C47A 2CNQA 2WD1A 3D5WA 5BYLA 5HVYA 1YOMA 5ANOA 3ZRLA 3FLZA 3MFRA 4GT5A 3NGAA 4IH8A 5ICPA 5JH6A 3COKA 1IAHA 3KB7A 4O22A 2NRYA 5AM7A 5E1SA 5CAQA 2WPAA 3FE3A 2IN6A 3OC1A 1PYEA 3Q32A 3OHTA 5JQ5A 1U59A 4G31A 3ZXZA 3M42A 3RAWA 4RA4A 3TTJA 3Q9WA 4YJSA 4BJJB 4TW9A 4BTFA 3VBTA 1DI9A 3NNXA 4JBVA 3OXTA 4R3CA 4ZTSA 2ZDTA 4MNFA 5F1ZA 2WTKB 3FLQA 4FYNA 4N0SA 4QMLA 4WOVA 1OPKA 2O5KA 4HGLA 5H3QA 4RGJA 5EYDA 3UMXA 3HMOA 3NIEA 3VJNA 4FC0A 4QT1A 2DUVA 3LQ5A 4HJOA 3A7IA 4UY9A 1YWNA 2YCRA 4KIOA 4KAOA 5L8KA 4NTSA 5KZIA 1Z9XA 4Z3VA 1UWJA 4O0VA 3HECA 3QQGA 4XYFA 3AD4A 4H58A 3ZLYA 1XKKA 1TQPA 3A60A 5JZNA 4RVKA 2EXCX 2QONA 4CG8A 3CGFA 1H0WA 3QD3A 2EB3A 2VWYA 3KXGA 4KNBA 4AFJA 2XS0A 4KKEA 2ZAZA 2ITXA 4A7CA 4ZY5A 3TIZA 3NUNA 5C8MA 3W16A 3FUPA 3ENMA 4MYGA 4ACDA 2O63A 2YJSA 5JT2A 2CLQA 4CT1A 3P79A 4GFMA 5M51A 4ZMEA 4CQEA 2GQSA 4NIFB 4C4IA 3FYKX 1I09A 4WNKA 3ML1A 2R5TA 3HV5A 3QYWA 1REJA 3OZ6A 4M68A 2J4ZA 4NZWB 4WKQA 4ZY6A 3CJGA 3QXPA 4BR3A 4HW7A 3UBDA 3PZEA 4C61A 1Y91A 2YM7A 4MTAA 4TTHB 4F1TA 3FMLA 2G2HA 3MPMA 1WCCA 3TM0A 5HVKA 1IA8A 4NT4A 1A48A 5AV1A 3KIOC 1NY3A 4HGSA 4TKSA 4XHKB 2C30A 4WUAA 3ZMMA 4EEVA 2ESMA 2HXLA 2WAJA 2VTJA 4LGHA 3WZKA 3DS6A 3R04A 3SLSA 4XCUA 5HZNA 4JQ8A 3FMEA 3NWWA 5CT7A 5DR9A 5IEVA 5M09A 4U5JA 2JLDA 5GJFA 1PYXA 4IHPA 5HNIX 5D9HA 3QGWA 3LMGA 4ERKA 4IVAA 3KKVA 5EQPA 3RPVA 1HCLA 3PXQA 2GNJA 5CASA 3QQFA 1NW1A 1SYKA 1F3MC 3AC3A 3FXXA 4ANLA 1ZYSA 3NW7A 2C0OA 2HK5A 4X6QC 4UXLA 1OGUA 4AP7A 1G8KA 4DT8A 3VUGA 3IW4A 5HVJA 3COIA 1WBWA 3BLAA 2J50A 4RVMA 3I7CA 4L3PA 3VIDA 5C4LA 3VW6A 5I9YA 1P2AA 1YRPA 2PYWA 3UNKA 5AUWA 5DIAA 4R7HA 2PWLA 4FSNA 3CD3A 3EL7A 3SV0A 4O7SA 3VS4A 1R1WA 3DY7A 5LVPA 1SNUA 3VUDA 3UDSA 2JIVA 2O65A 2YCFA 3C1XA 4RIXB 4PTCA 3PXYA 4HCVA 2EWAA 3QCXA 5AUVA 2I1MA 4NSTA 4UWCA 3ENHA 2B1PA 3HUBA 1OKWA 5CZHA 2EB2A 3Q9ZA 2P3GX 4D0XA 3BQCA 1PMNA 3DXNA 4QO9A 5AUXA 4AN9A 4V05A 4YHJA 1K2PA 3DBCA 3AQVA 3SKCA 1UNGA 1H08A 4FKSA 4O84A 1M17A 3SOAA 2X9EA 3FY2A 1ZAOA 4PP9A 3ZDUA 4EC9A 2BIYA 3F82A 3SQQA 3DK6A 2GNFA 2X8DA 5B2KA 3HMPA 3ETAA 2XF0A 3ALNA 3DNEA 2ZM1A 3ELJA 3AMBA 4TY1A 4ANQA 4L43A 4QTDA 3QCSA 4IDTA 3PXRA 1ZYJA 3DKCA 5EQEA 3PY0A 3BQRA 4RIYA 4CFXA 3UO5A 4K33A 4EJNA 5DEYA 1UNLA 3EFWA 3HV7A 5BPYA 3PPKA 4RWLA 4YR8A 3ZH8A 3ZZEA 1FVVA 3DBDA 3OOMA 4IAIA 4R78A 3EQPA 3NUYA 4O86A 4WT6A 3C9WA 2Z7RA 4MNEA 3QD0A 4D4SA 1AQ1A 4GUEA 4M12A 2KULA 3PE1A 3KN5A 3GOKA 4QQ5A 3DBEA 4QP7A 1G3NA 3QQKA 5E8ZA 2E9NA 3RWPA 3ZBXA 4DHJA 2R3OA 4FKGA 2XK8A 3BELA 1KE9A 3QKMA 3WZUA 5B0XA 4LOQA 4OTQA 3FYJX 4X3FC 2C6OA 4YPDA 2CMWA 2Y6OA 2XNGA 4GVAA 5HHWA 3PWDA 1PXKA 2UW0A 4E4MA 3TG1A 2C6EA 5CU0A 5LMKC 2V62A 4I24A 2OJFE 3D5XA 1A9UA 2F49A 2UZEA 3EOCA 4GV1A 4H1MA 2CPKE 3Q4ZA 4YC3A 4DH1A 2A2AA 2HY81 2XIZA 5EW8A 2OFVA 4XV1A 1TVOA 2ACXA 4Y72A 3EQGA 4B99A 5AFVA 2YITA 5CT0A 4WNMA 4Y85A 4CXAA 4L53A 1VJYA 2IVTA 2C3IB 2GU8A 2Q0NA 1ST0A 3E8EA 4FJVA 2BFYA 4J97A 3MYGA 4PDPA 4FKRA 1YXVA 4YBJA 2W1CA 2XYNA 4HOKA 2A4LA 2VN9A 4RX9A 3GP0A 5K3YA 3U9NA 3ANQA 4NFMA 4AX8A 2XM9A 3NCZA 3QRIA 4J7BA 3GQLA 2IZRA 5CI7A 3R8ZA 1O6LA 2YDJA 4YURA 5LWMA 3I1AA 3HKOA 1XBAA 3ET7A 5EM7A 2PE0A 2VX0A 3RAKA 1ND4A 5AIRA 3CTQA 3LLAA 4X3FA 3UYTA 4BDEA 2WMVA 2BRGA 2YAAA 3KRLA 1NA7A 4XP3A 4JDHA 4R3PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PUF C;  3P5J C;  3KIO C; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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