3TM0A

Crystal structure of 3',5"-aminoglycoside phosphotransferase type iiia amppnp butirosin a complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
AKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Aminoglycoside 3'-phosphotransferase
publication title Structural basis of APH(3')-IIIa-mediated resistance to N1-substituted aminoglycoside antibiotics.
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus faecalis
total genus 80
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.1.95: Kanamycin kinase.
pdb deposition date 2011-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tm0A01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3tm0A02
3KF4A 4FV4A 4CFWA 5L6PA 4AX8A 3QA8A 4KBCA 4TW9A 5B7VA 5E8SA 3WZJA 2XK8A 3TUBA 2XYUA 3IG7A 4O96A 3CPCA 5BUEA 2XEYA 2JFLA 3IDPA 4ACHA 4ZLYA 4QPSA 4BBFA 4F7JA 3FMDA 5HD7A 1PW2A 4TY1A 4C2VA 4TL0A 1Y8YA 3SAYA 5HTBA 4JG8A 2UZLA 3LQ3A 2BZKB 4WNMA 3JUHA 1H07A 4BR3A 4D2SA 4FKLA 2W5HA 4DGGA 3DCVA 2UW3A 3K2LA 4PP7A 4BCPA 3L8SA 1YDTE 4TYGA 5BVWA 3TNQB 4ARKA 3H0YA 4FC0A 2F2UA 3LKMA 4S30A 4K77A 4M7IA 5HHWA 5CEKA 3G9NA 2WB8A 3TNPC 2XK3A 3O0GA 4RFYA 5EDRA 2W06A 3A60A 3F3VA 3Q53A 5LVLA 2GPHA 4J53A 3LXKA 4S34A 3UP2A 5AUWA 2ITUA 1BUHA 2PVLA 3TI1A 1FINA 1P4OA 1OL1A 3VVHA 3KMMA 3LFCA 2E9UA 5L2TA 3S2PA 2OK1A 3D2KA 1K9AA 2C1AA 3EHAA 4J52A 3R8LA 2Y0AA 3EJ1A 3PIZA 2PE2A 3VUMA 2OW3A 5C01A 5KO1A 2Z2WA 5AJQA 3RPVA 3SLSA 3BIZA 3QKKA 1OL6A 2PU8A 2W7XA 5FUTA 3UC4A 3VUDA 4C3FA 4DBNA 4UEUA 5BYYA 4DTAA 4OR5A 3PRIA 2UVXA 3QQLA 4RJ4A 5FXSA 5F95A 3KKVA 4JIAA 2PMLX 5A9UA 4K6ZA 4FV7A 2XBJA 5CENA 3HA6A 4UV0A 2GNGA 2Z7QA 4AZEA 1J7UA 4JOAA 2F57A 3V5PA 4CFUA 1FPUA 2XKEA 2IW6A 5IUHA 4NSTA 5EYMA 2BRBA 2UZDA 4GT5A 4MF1A 2UZNA 3VULA 4D4VA 2WTKC 4M68A 5M4UA 1W84A 2WMTA 2G9XA 3RTPA 4NTTA 5FP6A 4BDJA 5A4LA 5BQ0A 4AA0A 3ULIA 2IW9A 4EQMA 4YJSA 2BFXA 3LLAA 3D5XA 3ORZA 3QGWA 1LEZA 2PMIA 3GENA 4FV0A 1O9UA 5AP4A 4J7BA 4S31A 4E26A 5B2LA 1Q8YA 1STCE 3FMHA 1XH9A 4YC3A 5KZIA 4EZ7A 2WMUA 1KSWA 3BHTA 3V51A 4CCBA 5AUVA 4FSTA 1SZMA 3EFJA 4G6NA 3LCDA 4E4LA 3FKOA 1Q99A 2XUUA 5BNJA 3KY2A 2JKMA 1OVEA 2VD5A 3RPYA 5I9UA 3UMWA 3H3CA 4H05A 2XS0A 3D5UA 2VTAA 3CY3A 2ZAZA 3MB6A 3KXMA 1UKHA 3EOCA 3ZS5A 3E7VA 3UO4A 4CXAA 4RX9A 3SRVA 5LCKA 1CMKE 2C3JA 1P4FA 5CYIA 3EFWA 3VWAA 4A9TA 2I0EA 3DJ5A 4JG6A 4FT3A 3DXQA 3KRXA 2HIWA 3AC5A 1DS5A 3UNKA 4C36A 2G15A 4CG9A 4GUEA 3FUPA 3FMEA 3EQPA 4KBKA 2R5TA 4TYJA 4XLVA 3MSSA 3OUNB 3NVKI 2IO6A 4LRMA 4O0YA 4AGUA 3TCPA 5DRBA 2PK9A 4C4EA 5H8EA 1G8SA 4FTNA 3W0NA 5A6NA 3UPXA 5BUIA 3R00A 3FAAA 5T3QA 3SW4A 4LV8A 5FGKA 3N9XA 2Y8OA 3QD2B 2UW7A 5LJJA 3ZO1A 1KOBA 5ANOA 2BUJA 3PLSA 2EXCX 2HW7A 1UVRA 4X2NA 2FSMX 3G51A 5AWMA 2C5XA 4MBJA 5BX0A 2R3IA 4R78A 4AW2A 4IACA 4QQTA 3KXNA 4IAZA 4YBJA 5ETCA 1B38A 3QQJA 4DC2A 4PTCA 2CLXA 2NNWB 5L2WA 2BZIB 4M0YA 1J3HA 3PPJA 5HZNA 1IAJA 3C9WA 2CGXA 3DZQA 5IQCA 3HMNA 1AD5A 4Z55A 3DAEA 5K9IA 4J98A 5IA2A 3NUYA 4E6QA 3GCVA 3D4QA 3RAIA 5L3AA 2XYNA 5ANDA 5IDNA 2CJMA 4CFXA 4FKVA 4YURA 1ZRZA 3ZBFA 1YDSE 4O7PA 5A4TA 5IA3A 3KK8A 3EKKA 3FZTA 2ZMDA 2ZV7A 4FYNA 3SW7A 4FEQA 1BKXA 1DM2A 5IEVA 3A4OX 4ACGA 1JKKA 1O6YA 4X21A 5CNNA 5EOLA 4BC6A 1CTPE 4O81A 1J1CA 4W4WA 3OEZA 3TDWA 3FY0A 3OD6X 5AUYA 2PVFA 4U40A 1W8CA 1PXIA 3KREA 4HZRA 3ORKA 4HNFA 2C6EA 4MBIA 4G9RA 4V05A 1URCA 3EL7A 3V5LA 1AQ1A 2PHKA 4XV2A 4XG4A 3F3UA 5CSHA 5LARA 4ANQA 3PVGA 4ASEA 5I9ZA 3D2IA 4ORKA 2C5VA 3QTWA 3ZFYA 3FI2A 4QT1A 3VBYA 4FODA 4JAJA 4ANSA 3RALA 4DEIA 3W0PA 3ZH8A 2PL0A 3OZ6A 2XCKA 3KK9A 1H27A 3QTUA 2IWIA 5HG8A 5J5SA 4G31A 5DN3A 1JLUE 2BR1A 1WMKA 2RGPA 4KKGA 4QMVA 4TKSA 5J87A 4IEBA 4TPTA 3Q9WA 4LQMA 2AC3A 3PSBA 3MN3A 2XCHA 2X7FA 4XG7A 2VTJA 5CNOA 3TV7A 4EKLA 3DAJA 4EEVA 2XIRA 1V0PA 4QTEA 1LP4A 3PA4A 3LXLA 4AZVA 4FKIA 3C7QA 4CFNA 4DITA 5ANKA 5DT3A 1XH7A 1XQZA 1Q5KA 4C2WA 2YZLA 5HIBA 2WIPA 4DFLA 4QMPA 3KQ7A 2I0YA 4P2KA 3BWFA 2C3IB 1F0QA 2GS7A 4PQNA 5KHWA 4OTQA 1L3RE 3FI4A 4I92A 1YRPA 2WO6A 2F7ZE 3MV5A 4C4JA 5HX8A 3R73A 3VRZA 3TDVA 4FX3A 5HCYA 4AG8A 4DT8A 5CAVA 2VO0A 3CD8A 4DBXA 3HMPA 2EU9A 3S3IA 4U3YA 4X7QA 1GZOA 2WEVA 3MTFA 3QZHA 3IKAA 3W2OA 2YABA 2W1ZA 4KUJA 5H3QA 2UZWE 3LAUA 4CG8A 3NYOA 3E93A 4EOJA 2J5EA 3R9HA 1M2PA 2QHNA 4W8DA 1OL2A 3FC1X 3R0TA 2CLQA 4WNOA 2FA2A 4QMZA 5C4LA 3ZBXA 4EQCA 2C5NA 2E9OA 3BU3A 4NFNA 4U94A 2EB2A 4CT1A 5J7HA 2BZJA 3KGAA 5IQBA 3SQQA 2VTSA 4EOIA 2VZ6A 2ZVAA 3BV3A 4C59A 4FSNA 4AW0A 4GU9A 3NCZA 3Q9YA 2R3QA 3WYXA 2X6EA 4IZAA 3Q04A 3C13A 2WFYA 2RIOA 3SXFA 3VHKA 3PIXA 1UWHA 4M69B 4WO5A 3KXXA 5TR6A 4X3FA 1MRUA 2PZIA 3MPAA 4AACA 3AD4A 3AT2A 4RWJA 1BMKA 4GVJA 3RAHA 4HVIA 2G01A 3PRFA 5IEYA 4XH6A 5CSWA 2VGPA 4RIYA 4PTGA 4CEGA 4BGHA 4RC2A 2YM6A 3QTIA 5CU6A 4FT9A 3DKGA 4DTBA 4JLCA 2C6MA 2QI8A 1SVEA 4XG8A 2I40A 3K3JA 4W4VA 1Q97A 4WHZA 4YZNA 4B4LA 4ALWA 4B99A 4HVSA 4RRVA 1YXTA 4G9CA 3SRVB 4EOLA 4BN1A 4JNWA 3QU0A 5G6VA 4GS6A 5AAEA 1ATPE 2UZUE 1ZY4A 3PJ3A 3ZOSA 4J8NA 4AE6A 4FTIA 5GINE 3ERKA 5EW8A 4RVTA 5CXHA 4CKIA 4DFNA 4ZLOA 3H0ZA 1FVVA 3C0HA 3GB2A 1Y57A 2J2IB 3AC3A 3GU7A 2WMAA 3WF5A 1XH4A 4AF3A 4DFZE 2VN9A 4AGWA 5JN2A 5EQYA 1CKJA 4XP0A 2IZTA 3HNGA 2FVDA 1OIUA 5HO7A 4IB0A 1H28A 4F63A 5HIEA 3P86A 2XK4A 1H0WA 5I4NA 3GGFA 1UU7A 4NJ3A 4TYHB 3ZLYA 3GC9A 3VBXA 1R3CA 2EVAA 4IB3A 4M8TA 4MH7A 5DH3A 5DLSA 5HU3A 4FIIA 3O71A 4XG3A 2CGWA 4RJ8A 4MAOA 3AXWA 2JC6A 3JPVA 2HXQA 5IQDA 2XK9A 3WI6A 1WAKA 5K5NA 1FGIA 3R9DA 3KC3A 3LQ8A 4PWNA 1UNHA 4S32A 4ERKA 4R7IA 4FEWA 1PMUA 4FZDB 3PP0A 3DQXA 4GMYA 4U80A 2NPQA 4H36A 1F5QA 3SD0A 1IEPA 3PZEA 4EQUA 2ITYA 2QU5A 1U54A 3DT1A 3ZLXA 2BRGA 1DAWA 4MBLA 1JVPP 3HP2A 2J0IA 3DB6A 4ASDA 3FEGA 4U0IA 2PUPA 2XNGA 3RM6A 3FLSA 3FZOA 4XBRA 3FY2A 3OS3A 4FZ7A 3R2BA 1YHWA 3LZBA 1TQIA 2WKMA 4JG7A 5DRDA 4FNYA 5EI8A 4F4PA 4UY9A 4AN3A 4H1MA 5L8LA 1PF8A 3VUKA 1Q41A 3PJ2A 4IJPA 3F3TA 5FRIA 2ZM3A 3FWQA 5JK3A 3TJCA 1Q8UA 3RINA 2XJ0A 3FQEA 3WBLA 4G34A 3LFEA 3U4UA 2Y6MA 4GH2A 5GJDA 5EQEA 3LCOA 2W99B 3ZRLA 3BYOA 4BZDA 4DH8A 2P55A 5FLFA 2J50A 4L3LA 1E9HA 3EIDA 5GIPE 3O23A 2QO2A 3ET7A 3KVWA 4AAAA 4WZYA 3EQCA 3QRUA 4RMZA 1UU8A 5CU3A 4A9UA 4EOPA 4CT2A 5JKGA 4UX9A 3FI8A 4E6AA 3A99A 3I6WA 4FTQA 4BDIA 1PXKA 4I24A 3QC9A 3ZO4A 5CAUA 5M56A 1ZYSA 5HBEA 5HNIX 1OECA 3MJ2A 3ZXTA 1FVTA 2X9FA 1OKZA 5FXRA 2CN5A 3VUIA 4KAOA 3Q5IA 3JYAA 5BYZA 5AUZA 4QQJA 5CTPA 4A07A 1PKDA 2RFNA 4FTKA 4IHPA 1W82A 2RG6A 3QQFA 4J8MA 3M1SA 5HKMA 4BCGA 3QALE 3AGMA 4CTCA 2WMXA 4DFBA 4PRJA 4C35A 3KULA 3QUEA 5EHOA 4QTDA 2FSLX 4C02A 2CNVA 2BIKB 2J0JA 2QOLA 3VRYA 5HLPA 5IMXA 4EYJA 3QGYA 2CHLA 4QP3A 3ORTA 4YNEA 4A9RA 3COHA 2HENA 5C27A 3F3WA 3FMJA 3P7CA 3BPRA 4JX7A 3AT3A 1PXLA 3PA5A 3LFDA 1OM1A 3OG7A 4MD8E 4D1SA 3TTIA 1OKYA 4FV2A 4FKGA 3QYZA 3NS9A 1LEWA 3FDNA 5FBNC 1YDRE 3W0QA 2CMWA 4JBVA 3P23A 4AZWA 3UNZA 3DDQA 5CZHA 4RWLA 5EI2A 5BVDA 1A06A 5H8BA 4MNEB 4OBOA 4KIOA 2PPQA 4HYUA 3D94A 4FTOA 1ZOHA 3T9TA 3ZRMA 2BRHA 4E1ZA 3TWJA 2C69A 3UODA 2J6MA 2QONA 5JQ8A 3AC1A 3MWUA 3F9NA 5AP0A 5DPVA 5K4JA 4QYEA 2VNWA 5HX6A 3GT8A 3MW1A 4I23A 1PYEA 4Q2AA 2BALA 5CSVA 2DUVA 4IBMA 1IAHA 3GP0A 3BU5A 4M84A 4LL5A 4IX4A 2I0HA 3BWJA 4DG3E 4L43A 2W9ZB 4O38A 4O21A 3EN5A 3MH0A 4PP9A 4E4MA 3GVUA 4FZFB 2ONLC 3PPKA 4KIQA 4KS7A 5CVHA 4FTCA 3LCKA 4XV9A 3B8QA 4S2ZA 5AFVA 4EK6A 4BDCA 4Y8DA 4TRLA 2VGOA 4L7SA 5IH5A 4Y46A 3CKWA 5EG3A 4AN2A 3UGCA 3PZHA 2Y9QA 2YN8A 1OGUA 3ZO3A 2UVZA 3HP5A 3N4VA 4GU6A 3HAMA 3LE6A 1H1PA 1OBDA 3L9NA 4NW6A 2X8IA 3N51A 4O2ZA 4ONAA 4RLLA 4DGOA 3W0OA 2OG8A 2WAJA 3F6XA 5FG8A 3AOXA 2R0IA 1TQMA 1WBSA 3R01A 2WXVA 4FA2A 4RIYB 3S4QA 3TUDA 5IUGA 5KKRB 1H24A 2I6LA 2P2IA 2WNTA 3U6IA 4EC9A 1U5QA 5IPJA 3QF9A 2X81A 4NFMA 2R2PA 4F0GA 3P0MA 3VW6A 2W1CA 4QYGA 2GFCA 1G8AA 2QO7A 3C4WA 3CGOA 4M15A 4RA4A 5AP3A 5E8UA 3UP7A 4X3JA 3PXQA 3QQGA 5T68A 5BMSA 5I9XA 1VZOA 5M09A 2XF0A 3ORMA 4ASXA 4WOVA 4RGJA 2XNPA 3QYWA 2DS1A 2QCSA 4JX3A 3RHXA 5K4IA 4XX9A 1BLXA 3G2FA 2VNYA 2X7GA 3FSKA 1AGWA 3MH1A 3UG1A 4AGCA 3OWLA 3GI3A 2ERZE 3PG3A 3ZZWA 3W8LA 2WHBA 2WU6A 4DEGA 4CFFA 2WU7A 3IPHA 1ZYCA 1WCCA 2YFXA 5KMKA 1FBNA 3BU6A 3PJ8A 3OC1A 3BKBA 3DK7A 4G3FA 5D12A 3UDBA 4E20A 2PUUA 3CBLA 2BAJA 4IVBA 3L8VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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