3TYKA

Crystal structure of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
TATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and function of APH(4)-Ia, a hygromycin B resistance enzyme.
pubmed rcsb
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
total genus 89
structure length 295
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2011-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tykA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3tykA02
4GKHA 4DCAA 3TDVA 3HAVA 3ATSA 5C4KA 5C4LA 4CG9A 5BYLA 3DXQA 1L8TA 4DT8A 2PYWA 1NW1A 4EJ7A 2B0QA 2PUPA 4DT9A 4DFBA 2PU8A 1ND4A 3W0PA 4DE4A 5IQFA 3W0MA 4O7PA 3C5IA 4R77A 4WZYA 4FEXA 2BKKA 4U98A 2PPQA 1J7IA 4O7OA 4DBXA 3SG8A 2CKOA 3W0OA 4H05A 4DFUA 1J7LA 4GKIA 3UZRA 3LQ3A 3CSVA 3N4TA 5IQEA 2Q83A 2CKPA 3TM0A 3DXPA 2PULA 2I7QA 4PDYA 5EQYA 5IQGA 5IQCA 3W0NA 4CG8A 3MESA 4CGAA 4N57A 5IQBA 2PUIA 4FEWA 5EQEA 3N4VA 2IG7A 3FI8A 3HAMA 3TYKA 4BR3A 3SGCA 3W0RA 3W0SA 5IQAA 4FEUA 3W0QA 5AFVA 2PUNA 2QG7A 3SG9A 3ATTA 4FEVA 2CKQA 3JR1A 4ORKA 5IQIA 3Q2JA 2OLCA 3F2RA 5IQHA 4R78A 5FUTA 4DTAA 3TDWA 4DA5A 1J7UA 4U94A 3FEGA 3ZM9A 4R7BA 5EQPA 5IQDA 5FTGA 3G15A 3N4UA 4DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GNGA 1OKWA 4C62A 4HPUE 4JX7A 3QWJA 5CI7A 2PMNX 4FKLA 3RP9A 4XP3A 4CSVA 4O7NA 5KZIA 4AW5A 4EYMA 4A9UA 3W8QA 3MH3A 5M4CA 2G2IA 1ZY4A 4D28A 4E4LA 2VTQA 4NL0A 4O81A 4QDVA 2PVMA 3ZDIA 2W5HA 5CTPA 4KKEA 2BKZA 1GZ8A 4QQCA 5HBHA 4O7VA 2YDJA 2XK4A 2A4LA 2YERA 4J98A 2JDSA 4EHEA 4IZYA 2B55A 2XBJA 3TT0A 3UDTA 3W2SA 4HGTA 4EZ7A 3LXLA 2HELA 4IDVA 3VNTA 4YU2A 3RK7A 4EQMA 1ZMVA 2EVAA 4D2SA 2FH9A 3LOKA 4ZOGA 4P90A 4CFWA 4F1OA 3TKHA 3MFUA 2B9HA 2PVLA 3FBVA 4CFXA 3O7LB 4ZK5A 2VGOA 2WTVA 4QYYA 4AZTA 4AZVA 3DTCA 1BLXA 5GNKA 3MSSA 1JKLA 3PP0A 4RGJA 2Y6OA 4MD8E 4FKTA 4OTFA 4B8MA 1NVSA 3R8VA 1U54A 3AC3A 2FSOX 1YXUA 3MB7A 4L42A 1FVVA 3LJ2A 3LXKA 4OBPA 4FYOA 4I93A 3CLYA 4IX4A 4QQTA 3WZKA 3HECA 3O23A 2HXQA 2J5EA 2WMBA 3GOKA 5BUIA 3P08A 1URCA 3HMMA 4FT0A 2WHBA 4AXCA 4BKJA 4ENYA 4FTIA 4AP7A 4ASDA 3HMNA 2OIDA 3RCDA 1DAYA 4K0YA 3DKGA 3II5A 5HG9A 5L8KA 4CFMA 4O84A 4FSRA 3VQHA 5TT7A 4EONA 2NPQA 3ID6C 5EQEA 4X3FA 5CQWA 5JGAA 4XJ0A 4FKIA 5HVJA 4DH7A 4TL0A 5CEQA 2F49A 2WOTA 2R3NA 4QOXA 5FXQA 4WNMA 5ANDA 5BVKA 5I4NA 4C58A 3REPA 2H34A 3UJGA 3QTIA 4TXCA 4BCKA 2C6TA 1Q5KA 1U4DA 3BEAA 3UBDA 2WAJA 4TPTA 4CFFA 2ZJWA 4KBKA 4BDJA 4RFMA 2QG7A 5M07A 1SM2A 2W9ZB 3SQQA 4KBAA 4KINA 4QMVA 3EMGA 5DT4A 2YITA 4L01A 4OR5A 2I40A 4XH6A 2QOCA 2BRHA 3HA6A 3P86A 4IWPA 2RL5A 4FKOA 4ORKA 3E8CA 2V62A 4LL0A 5IQIA 1E1XA 3QRJA 2CMWA 1H01A 3VO3A 4F0GA 5JQ5A 2A0CX 2PUUA 1HOWA 2VD5A 4I5PA 2GNLA 2PZYA 3V01A 3UMWA 4R3PA 4TYIA 4QMYA 1JKKA 2XNEA 3GVUA 2OJ9A 4PY1A 3TTJA 5FXSA 3PUFC 4U43A 4R7BA 5E8XA 3SAYA 4F0FA 3PXYA 3NMUF 4O91A 1UU3A 4RIYB 1SVHA 2IZSA 4XOYA 5LARA 4UN0C 1YOMA 3I0OA 3OXTA 4FTNA 4Y85A 3NSZA 3EFLA 4U0IA 4I6QA 4GCJA 3UIMA 2C5XA 5HQ0A 4FVQA 4YBKA 2V7OA 3G33A 4GKHA 1G8JA 1H08A 4Q5HA 4RFYA 4MXZA 3RKBA 3N51A 3TN8A 2EB3A 2Q0NA 5DRDA 2XNOA 4EK5A 1K9AA 1YHWA 5I9ZA 2NRUA 1KE5A 2OH0E 4XG8A 3QLGA 5LWMA 2DWBA 1BL7A 4AZWA 2PMLX 2ZYBA 3KK9A 4G6NA 3HUCA 5IISA 3Q9ZA 4XS2A 4D0WA 3ML1A 5CXHA 3OS3A 3UNKA 1U54B 3TZ7A 3U9CA 2J51A 3OG7A 5EKNA 1F5QA 4ZTHA 4GFMA 5BMMA 5J87A 3C5UA 4XRJA 5DFPA 5J5SA 3TUBA 1XH7A 2FSLX 3FI3A 4FNWA 4XV2A 3E5AA 3W2CA 3DOGA 3EFJA 3VIDA 4RJ8A 3UYTA 1F3MC 5E8WA 3Q9YA 4CFNA 4ZZOA 4D5HA 3U6HA 1REKA 3PFQA 2IPXA 4S33A 3FI2A 4BI1A 3KXZA 4ZTRA 3PP1A 4C4HA 4G2FA 4X7QA 1Q3DA 2YM5A 3I1AA 4JBVA 3FLZA 5A54A 4WRGA 3KK8A 4RX7A 3UODA 2ITTA 3QCXA 2W4JA 1ZZ2A 2H6DA 1REJA 3RAWA 3MA6A 3V3VA 5ANEA 4DHIB 4XMOA 3ZOSA 4QMUA 2X7GA 4EH9A 5HX6A 3DXPA 3A99A 1Y8YA 2X8IA 2C6OA 3QD3A 4QP6A 4EZ3A 3FLQA 4V0GA 4YGAA 1BMKA 5M08A 4JG7A 4ANSA 1YHSA 1OGYA 3NUYA 3VONA 4OGRA 2J0KA 1CM8A 1A06A 5LVPA 4EH3A 4G3EA 3L8SA 1Y57A 4OTQA 5L6PA 4ZTSA 4O0UA 4O0TA 4OTRA 4M69B 2WMQA 2F2CB 3LAUA 4RFZA 5FP6A 3EH9A 4FV8A 1M7NA 2V22A 5B2LA 2ITZA 3COMA 4Z9LA 2XIZA 3PG3A 3PE2A 3MB6A 3BU6A 2QOQA 2VTPA 2XUUA 1JKSA 3QZHA 2OGVA 4D5KA 4AXEA 3ZDUA 4X2FA 3EB0A 3EQGA 2BTRA 3COKA 5HE0A 1T46A 3LCKA 1PXMA 4G3CA 3PIXA 2QCSA 3QZIA 3WZEA 3HP2A 4QT1A 4OTGA 4FKRA 1YKRA 3NYOA 4IX3A 4RSSA 4WBBB 2W05A 1QCFA 2BZKB 3PJ3A 1YDSE 3MH2A 4W4WA 2QLUA 3HRCA 3JYAA 3RPSA 2XYNA 3EQHA 3TNWA 1SYKA 3F2RA 5LVOA 3UDSA 3AD6A 3R9NA 3DZQA 5CVFA 2CJMA 3R83A 3TDWA 4AXAA 2ITNA 5AP4A 5AUWA 4AGWA 1IRKA 2XNBA 5HLWA 3NNXA 4EI4A 1W83A 3OCTA 4I6HA 1M7QA 4R5SA 4R5YA 3ZM9A 5EQPA 3GU4A 5BYZA 2JFMA 5A14A 2HWPA 2WOUA 3VUDA 5ANGA 2CN8A 3BKBA 4GH2A 3RZBA 4FKPA 2B53A 2QOOA 2ZDTA 3HYHA 2F7ZE 5EYMA 5BMSA 3P5JC 3V8TA 3G51A 3BBWA 2JDVA 4KKGA 3GT8A 3G0FA 3ANQA 3TDVA 4KA3A 2X2KA 3KXNA 4QP2A 4ZSJA 4UXLA 4YC8A 3K3IA 4AXFA 2QOBA 3HRBA 4BJJB 4ZEGA 4GRBA 2IZRA 4YHTA 3DXQA 3Q9XA 2Y4PA 3S00A 5EI8A 2KTYA 4DN5A 5A3XA 3DJ5A 4DEHA 2XAOA 5AP1A 3DLZA 4L7SA 4AZEA 3TJCA 5AV4A 2DQ7X 4XP0A 5EM5A 4MX9A 4FUYA 2HYYA 4B0GA 4U41A 4RQVA 3AGMA 3LLTA 4YC6A 4UZHA 2H9VA 3OOGA 5CSPA 1O6KA 2R3LA 3LMIA 1XBCA 4PV0A 4BTKA 1ZY5A 4A4LA 2C3JA 4NW5A 5AX3A 3UNZA 3KF4A 3RMFA 2C0OA 4CCUA 1WBNA 3FDNA 1J7IA 1URWA 2G2HA 2WO6A 3HLLA 4GT5A 1BI7A 3R7EA 4A9YA 1OL5A 4K8AA 3TNPC 1PXJA 2W1IA 1Y8GA 5HCXA 3SHEA 4XNEA 5AIRA 4TWNA 2GSFA 2UZEA 3W8LA 4G1WA 2VX1A 4CFUA 2R7BA 1LPUA 5TKDA 5DLSA 4WNOA 3R1YA 5L2IA 3PVGA 3MBLA 3A7IA 4MNFA 4MYGA 2E9UA 4I92A 5EW8A 4KAOA 3VHKA 1M52A 3QRIA 3TZMA 2PE2A 4DFZE 4FTJA 1Y6AA 1OITA 4H1MA 4RBLA 4TRLA 3FY2A 3ZTXA 3CY2A 4E4XA 3NGAA 5HICA 3NCGA 3LXNA 3W33A 3KXXA 4NT4A 4KUJA 4UZDA 5HD4A 3SVVA 4ACDA 5EW9A 3ZSHA 3FSFA 3R6XA 2OWBA 2WQNA 5DRBA 2IW9A 3CTQA 1FBNA 2ITXA 5KMLA 4G31A 3R1SA 4BI2A 4USEA 3QD0A 4ZJVA 4HJOA 3NW6A 1OL2A 4QMXA 3HRFA 4FKSA 4GIHA 4EOIA 1H1SA 3A8XA 3MI9A 3SRVA 4DGLC 2RGPA 2WTCA 1XWSA 3R1NA 3QHWA 4QMQA 1MRUA 2X6DA 3C4FA 3I6WA 4AG8A 3GOPA 3BQCA 5AV0A 4G9CA 4YSMA 2VTNA 4J96A 4L45A 3GENA 2J0JA 3JVRA 1OZ1A 3MTLA 3E62A 1DS5A 2VTOA 3UE4A 2BVAA 5D12A 1WVYA 5LMAA 4FZDB 2B54A 3V5QA 5HZNA 1TQIA 5F95A 5LVNA 1VLRA 3HA8A 5D7AA 1HCLA 4EUUA 4AT5A 1M2QA 3HP5A 3VS2A 3P79A 4DH5A 3E93A 2R5TA 3C0GA 4N0SA 3LE6A 3GP0A 4MXCA 4FTOA 3LFNA 5DH3A 3ORKA 4JQ7A 1PKGA 2UZOA 4L8MA 5I0BA 4BYJA 5KHWA 2A1AB 3R7IA 2IWIA 2YIYA 4X21A 3NS9A 3LQ8A 1YXSA 2ETKA 4BZDA 4FSTA 5HI2A 3ACJA 3HAVA 5BQ0A 1WCCA 3IKAA 4BCJA 3M11A 2R3PA 3ORTA 3FMMA 1KE6A 5DG5A 4BCMA 1K3AA 4CT1A 4E93A 4O2ZA 3R04A 5E90A 1KOBA 1OIUA 4PDPA 3V6RA 2PVHA 5CU3A 1BI8A 2PU8A 3W2RA 4AW1A 2PL0A 5IZFA 5CEKA 4FBXA 2UZDA 2FGIA 3QCSA 4FSWA 1QPDA 2UZBA 5CAVA 4IM0A 3KCFA 5AP6A 3EKNA 2BDJA 3COHA 4FSMA 4EC8A 2ITOA 4C2VA 1YXTA 5E1EA 3OZ6A 4BDIA 5HESA 3QUDA 2J90A 3DFCB 3THBA 2Y4IC 3EQFA 3VW6A 1VYWA 4GJ3A 1W0XC 3CC6A 5FP5A 5FGKA 2GQSA 3PPKA 1QMZA 4CTCA 3MPMA 5AUXA 4HPTE 4KS8A 4E4NA 2WELA 2GCDA 1H28A 3OBGA 4IH8A 1CKIA 4PL4A 4S31A 2R3RA 3ZYAA 4AAAA 4YPDA 4EK8A 2X7OA 2OFUA 1Z9XA 2CKPA 4GG5A 3VUGA 5DYJA 3LFSA 5HKMA 4C02A 3QZFA 3C0HA 3L1SA 4Y83A 3BGPA 3C4XA 3D5UA 3HV3A 3W0NA 2XNNA 4CG8A 5IA0A 3IS5A 5I5ZA 5BVEA 1UNGA 1XH6A 3FE3A 3WF6A 1OKVA 4Z55A 3SW7A 3BL7A 4NM0A 3R2BA 3GBZA 3KY2A 3Q52A 1JQHA 4MKCA 5CT7A 4YP8A 5LCKA 2OJJA 4ZP5A 5J9YA 3I6UA 3NUXA 3PXRA 5HLPA 3VAPA 1W7HA 4I1ZA 4IDTA 4M8TA 4IADA 3HDMA 2C6EA 4FG9A 2GTNA 4C61A 2WMTA 2CGXA 4P2KA 2WEVA 3C50A 2VX3A 3A7HA 3W0QA 1Q24A 2XIKA 4E73A 1DAWA 5AUYA 1H26A 2QU6A 3DNEA 3SG9A 1LP4A 4YJSA 5HG5A 2XRUA 5CAQA 2WB8A 2ITPA 2CKQA 2F2UA 4RT7A 4MVFA 4C0TA 2O5KA 2WQBA 3DK7A 1KWPA 2CGUA 4Q5EA 2OKRA 3M2WA 5IUHA 4R1VA 1H24A 1DM2A 2IZTA 2VO7A 3MS9A 3NYXA 3QYZA 4FT9A 4RIXA 4IJ9A 4O0XA 3D4QA 3R9HA 4CFVA 4FV7A 4AN9A 4DAWA 4F6SA 4X2KA 3HV6A 4QDEA 3FMNA 4DEDA 5DOSA 2Z7LA 3BI6A 3KRJA 2JIIA 3KMMA 3C9WA 3OFMA 5GIOE 3T3VA 5DVRA 1WVXA 5AM7A 3BE9A 2WTWA 1UWHA 3CQEA 3FQSA 2YACA 4ZLYA 5KKRC 4P7EA 2PZPA 5EH0A 2WU7A 3MH0A 4F7JA 3BYUA 3EN9A 3HKOA 4RJ3A 1JSUA 1PXIA 5JFXA 1QPCA 3BLHA 2AYPA 4O7LA 4AS0A 2OK1A 4G6OA 3ORIA 3V6SA 4ACMA 4ID7A 3VUMA 1LEZA 1MP8A 1P4FA 4FOCA 2VTSA 1OGUA 3A7JA 4B8LA 1NT2A 4R7HA 3P4KA 4O21A 4TZRA 5BVDA 1P2AA 5KZ0A 2G9XA 4IM2A 5C01A 3D5WA 3EQBA 3VS0A 1VZOA 3R00A 3RPRA 4FZFB 1KE9A 3SLSA 3DV3A 2C3IB 3ULZA 3AT4A 1ND4A 4O96A 4U79A 5FD2A 3ZONA 5KUPA 4YJNA 2XKEA 4EH4A 4NFNA 3VJOA 2Z8CA 3CD8A 1YI4A 3DDPA 3L9LA 5EOBA 2GS7A 3VUIA 3PSDA 3KMUA 2X4FA 4QMOA 5G6VA 4F7SA 2YABA 5JMSA 4FIIA 3LXPA 2WTDA 5H8GA 4DTKA 1PMEA 1ZARA 3DGKA 4RJ6A 4H39A 4L44A 4EBVA 5KHXA 2WTKC 3CGFA 4U81A 2I0EA 2VWUA 2C69A 1R39A 3RCJA 4C4GA 2C5VA 2OZOA 3SG8A 2R9SA 3F69A 4IAZA 4J53A 4F6WA 4FIJA 2WMXA 2YN8A 1JLUE 3QTUA 4LGGA 1GIJA 4W4XA 2JGZA 2IVTA 4L3LA 3QCQA 3BLAA 2C6MA 3LHJA 4RJ5A 3E8DA 5DR6A 5DIAA 3G9NA 4S34A 3EJ1A 4ZMEA 3WYXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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