3TYKA

Crystal structure of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
TATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Structure and function of APH(4)-Ia, a hygromycin B resistance enzyme.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 89
structure length 295
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2011-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tykA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3tykA02
4DFUA 2PUPA 4DA5A 3F2RA 2OLCA 4ORKA 5EQYA 3W0MA 3TDVA 1J7LA 4DT8A 4R78A 5BYLA 3W0NA 1L8TA 4FEUA 4DCAA 3MESA 4R77A 3N4UA 5C4LA 5IQBA 4N57A 4U98A 3FEGA 4O7OA 4EJ7A 4GKIA 5IQEA 5IQFA 3W0PA 5IQDA 3CSVA 3N4TA 4CG9A 2CKPA 4DE4A 3TDWA 4FEWA 3TYKA 3W0QA 3ATTA 3JR1A 2PUIA 5IQIA 5EQEA 3TM0A 3SG9A 4DT9A 3HAVA 2PUNA 3W0RA 2CKQA 5IQAA 5FTGA 1J7IA 4BR3A 5IQGA 5C4KA 3N4VA 1J7UA 3W0OA 3LQ3A 2IG7A 3HAMA 4R7BA 4WZYA 2BKKA 2I7QA 2PYWA 3Q2JA 4FEVA 4PDYA 2QG7A 2B0QA 3DXPA 4GKHA 4O7PA 3SGCA 5EQPA 4DTBA 3DXQA 5IQHA 3ATSA 2PU8A 3FI8A 3G15A 4U94A 5AFVA 4CG8A 3UZRA 5FUTA 2Q83A 4CGAA 4DBXA 3SG8A 1ND4A 4H05A 2PULA 4FEXA 2PPQA 5IQCA 2CKOA 4DFBA 3W0SA 1NW1A 3ZM9A 4DTAA 3C5IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LRJA 4TN6A 2WQBA 3EZVA 3QLGA 4IVDA 4IWQA 2IVSA 4ENXA 4G6LA 4AN3A 3PJ3A 3PPZA 2IW9A 2IPXA 4AACA 5DLSA 2PTKA 4OTRA 2C0TA 2A1AB 3PJ8A 1ZMVA 4XH6A 3BWJA 5AADA 3MFUA 2QG5A 4X3FC 4YC8A 5CZHA 3WE8A 3LMIA 3RWQA 1G5SA 1W8CA 2H96A 2X6EA 3TACA 2G2HA 5AM7A 3QZIA 4AE9A 4FZ7A 5L2IA 3Q4ZA 2J0JA 4JR7A 3OXTA 4I6LA 5HO8A 4YTIA 3HA6A 2ZV7A 3NIZA 4XG3A 1P4OA 4ONAA 4QYYA 5FM2A 4CLIA 5KMMA 3PXZA 1PKDA 3I79A 2W4KA 4EK5A 3ID6C 2PWLA 4P5QA 1RQQA 3PYYA 1PXLA 3RGFA 2CDZA 1CM8A 3VF9A 3VUHA 4CFXA 3W0PA 1EH4A 1P2AA 2O64A 3PY3A 2CNVA 5IA2A 3F9NA 1GAGA 3H3CA 1P5EA 3QFVA 1B39A 4ASXA 3R9DA 2PMIA 1H07A 3LFSA 4KWPA 4YZNA 4YHFA 2A27A 4ENYA 4RWKA 1XBCA 4NCTA 5FBNC 4U45A 4YJTA 1QL6A 5AV4A 2I0EA 3DK3A 4ANSA 4IIRA 3W2QA 3I6UA 3QRKA 3CPCA 4HGEA 3D7TA 4LOQA 3W0QA 3F66A 3QAME 2QO9A 2WMUA 1GZOA 1NY3A 1OI9A 1ZMWA 1XO2B 4YTCA 3QZGA 2YWVA 3TI1A 3JR1A 3DDQA 4DH3A 2A0CX 4XG8A 3NYNA 4I20A 2GNGA 4IM3A 3L9PA 3OW4A 2X6DA 3M42A 5HIEA 5IH6A 2PZ5A 4M68A 4G3GA 1Q8YA 4BR3A 2W1IA 3PY1A 3AT2A 2V7OA 2CMWA 2YCRA 3N4VA 3NNVA 2ZDTA 3OCSA 5KE0A 1UA2A 4GK3A 2I0VA 4IAAA 1R39A 1UNHA 3Q2JA 5LVLA 4LV5A 5BPYA 5CU0A 4YLJA 4RWJA 5HNIX 1T46A 4YGAA 3QXPA 4L01A 3UIBA 4BGHA 4L46A 4Q9SA 4GKHA 1UU3A 4D1ZA 5CT7A 3K54A 3Q9WA 4DTBA 2UZNA 3BBWA 4LUEA 4OTWA 4LL0A 4Z55A 4C2VA 3PSBA 4LGGA 1OKZA 5BVWA 4NT4A 3BHYA 4KKHA 3VBWA 3DDPA 4HZRA 5A4CA 4KINA 4BCGA 1PY5A 4MQ2A 5C9CA 2AC3A 3IGGA 3L9LA 3UC4A 1G8JA 4S33A 1R1WA 1CSNA 3D15A 3AOXA 4CFFA 2Y0AA 4GJ2A 4YTFA 2J2IB 3KULB 4FEXA 4RC2A 1MUOA 3K3IA 4MXOA 3PA3A 4KNBA 4MKCA 5EI8A 3AKLA 2ZFYA 4OTHA 4UB7A 4DEIA 3EKNA 1HCLA 4DGOA 4E26A 3F3ZA 3UP2A 2YAAA 2PMOX 2YIWA 5DA3A 5G1XA 5I9WA 4NL0A 1U46A 5HU3A 1FMOE 2B9FA 2VTNA 1YHSA 2F7ZE 1I44A 3B2WA 5DHJA 4IFCA 4KABA 3MH3A 3R28A 2UZOA 4BHNA 4DFUA 2R3IA 5GNKA 3BZ3A 4AA0A 4NW5A 1AQ1A 3OUKA 3PY0A 5JMSA 4WNOA 5HHWA 2XNOA 2QCSA 3CP9A 3E63A 4MWIA 3OROA 3C7QA 3MV5A 1H00A 2A19B 1KE9A 2BVAA 3TTIA 3HZTA 3ZC6A 3GCPA 4FG7A 1W0XC 3C13A 4RQKA 4DITA 5HVJA 3HECA 4FIJA 4HPTE 3FZRA 2P4IA 4FZFB 1OIUA 3S95A 4TYIA 1H24A 5DOSA 1YI6A 2WU6A 3QC4A 3LCTA 2YJSA 2P0CA 5CX9A 4YZ9A 3O7LD 4IACA 5A14A 4DHJA 4XX9A 2HZNA 2I40A 4ZTQA 1PMUA 3I1AA 2HWPA 4BDIA 3PSCA 3FKLA 3K5VA 1ZXEA 2CGXA 4K8AA 4NKSA 4D28A 3O51A 4DEBA 4H36A 4BCPA 3QALE 4YZCA 2VWYA 2WMRA 3PE1A 4HOKA 4J97A 2ITTA 3ORKA 2OJGA 3QYZA 4ZIMA 2RKUA 3G9NA 4NYEA 5AIRA 4IAFA 4HCUA 3IKAA 4GFOA 4WG5A 4IB0A 2ETKA 1XH8A 2X7FA 4DE4A 4EHVA 1R3CA 3W8QA 3LXNA 2WTVA 3RVGA 4BCNA 2Z7SA 1QPEA 4RJ8A 3VUGA 4IW0A 4QQ5A 5CWZA 3NUSA 3QZHA 3ZZWA 4XP3A 5IMEA 4OTIA 4X3JA 5IUHA 3DAKA 3E7OA 2XCKA 4MNEA 5FTQA 3KXMA 1U59A 4QMWA 2XP2A 3DV3A 3U87A 5ANGA 1Q3DA 2R3FA 4ZP5A 4HCVA 3R8PA 3FZOA 3WZJA 5BNJA 3DTCA 2HWOA 5EM7A 4YU2A 4FKVA 4AOJA 5JQ8A 4ZJJA 4DTKA 5A9UA 3SKCA 5F94A 3VWAA 2BKKA 4HYHA 3EQPA 3ODZX 2RFDA 3TEIA 4DLIA 1JAMA 5AP7A 1HOWA 1RJBA 4RA4A 3EFJA 3MGYA 4K2RA 2HXQA 3PXFA 3PVBA 1SVGA 4TWCA 3TUBA 1AD5A 2YN8A 2AEGA 2VO6A 3DKFA 3HMPA 3OW3A 3QKKA 3QD4A 1IA8A 5GJFA 4AXEA 4LOOA 5H3QA 3MA6A 4QQJA 3EWHA 3R9NA 4DGGA 1OL6A 3ATSA 5A54A 4FYOA 5HX8A 3EYGA 2RFEA 3RAKA 4AZFA 3U8WA 1ST0A 4BCJA 1V0OA 4QMOA 4QP6A 5ETAA 5LCKA 5B2KA 2PVLA 2J4ZA 2W5AA 4CG8A 4IM2A 2VTAA 4G17A 4AFEA 5B2LA 4G3EA 5IDPA 5IMXA 5L3AA 1FVTA 4FT7A 5CI6A 2G15A 4HNFA 4UY9A 2C3KA 3NS9A 2XIYA 2XNEA 2EUFB 3TUDA 4BCMA 4H05A 3R0TA 4IX6A 2QOLA 3OWPA 3BGPA 5L2SA 4NK9A 4EOMA 2ZOQA 1F5QA 4FKRA 4IC7A 3RPOA 3ZSGA 3AKJA 4ZTMA 3L8XA 2ETMA 2X4FA 4XHKB 5A3XA 3ZCLA 4CMTA 4D4SA 3MVHA 3SW7A 3FL4A 3KB7A 2GU8A 5FD2A 4W4VA 4DA5A 3CTHA 4XG7A 5E1SA 4GS6A 5J87A 3R8LA 4USEA 5AP1A 3TDVA 3NFFB 1J7LA 3BRBA 3VS4A 4HGTA 3GC9A 4A7CA 5KMKA 3W33A 4X21A 3RK9A 4N0SA 4DCAA 1G8AA 4IE9A 4JRVA 3HNGA 1BL6A 3EQCA 3L8VA 4AN9A 2BZHB 2GQRA 4FIHA 3H0ZA 4O7YA 1YRPA 2AUHA 2F7EE 3W2RA 4NTTA 3ZBXA 4MYGA 3TTJA 2P2HA 3BI6A 4CV9A 1SM2A 4KUJA 4U9AA 1YWVA 2O63A 2Y4IB 3QGWA 5DR9A 2UVXA 3V5LA 3QCXA 5CEKA 3T8OA 3QTIA 1GZ8A 3MIYA 1J91A 2UZLA 2OWBA 3RPRA 4CEGA 2VTOA 3EN5A 2IZSA 4V04A 1DI8A 3DLSA 2KULA 1SZMA 3TDWA 4IADA 3MIAA 3ZXTA 5CQUA 3AQVA 1IR3A 4WG3A 5J7HA 2QOBA 4ZZNA 3O8TA 4DEGA 4F7JA 2BFYA 2XYUA 1Q8WA 2X7OA 2G2FA 3BLQA 3CQUA 4AS0A 3HUCA 4NH1A 2WOTA 5A46A 4FKIA 5J9LA 1Q61A 3MJ2A 2WMVA 3SV0A 4J95A 2VWVA 1J1BA 4HGLA 3MH1A 2VTJA 5F20A 2ERZE 2DS1A 2ZMCA 3W0RA 5HI2A 4D5HA 5FG8A 4EK3A 3B8QA 5M4CA 3HL7A 4FSNA 3OF0A 3N51A 1V1KA 3QX2A 4O7ZA 3SDJA 2UZEA 5HVKA 3KIOC 4JDJA 4M12A 4IJ9A 4A9TA 3KF4A 3EQFA 3AD6A 3P5JC 2W4OA 4RIYB 4DG0E 4QP4A 5AP6A 5AAFA 3EL8A 1H0WA 4YSMA 2XKCA 5JKGA 3SRVB 1MRYA 1ZOGA 3CJGA 4CVAA 4MBIA 2W5BA 2DYLA 3NYOA 3DXPA 4BI1A 4F64A 1Q24A 2GFSA 4J99A 5D10A 5M56A 3ULIA 3M1SA 5BVOA 5E8VA 4C4EA 2W99B 3NVKI 5HLPA 4O83A 4XG6A 5IUIA 4DGNA 1REKA 2J0KA 5AFVA 5JFXA 3TZ7A 3UZPA 3RPVA 4GV1A 3AC2A 4X7QA 4EQMA 4ZLZA 4RBLA 5CAVA 4NCTC 1YXTA 4FKOA 3RK5A 5HZNA 2GHGA 3NFGB 2WO6A 3DJ5A 4GEOA 3E64A 4EOSA 4HVSA 2C4GA 4BGQA 3I5NA 3I5ZA 3IQ7A 2PE0A 2YM8A 3PP1A 4HPUE 4G31A 2QURA 3K2LA 4S32A 4KD1A 2PZPA 4BTKA 3BV2A 4RIXB 2BKZA 2R2PA 4JI9A 4LG4A 3IS5A 4BBEA 2GS6A 3PVWA 2VZ6A 3GQLA 5DH3A 4R7IA 2R3RA 4F0GA 4A4OA 4FKQA 4O21A 3AD5A 2P33A 3IW4A 4LUDA 3VW6A 4EKLA 3NCZA 4I24A 2V62A 2YZAA 4IX5A 3O50A 3WE4A 2BAQA 2R3JA 3FYKX 3LQ5A 3QD3A 1MP8A 2R0UA 3QXOA 4FEUA 4FE2A 1PXOA 3AC5A 3KRXA 4GT5A 1YI3A 3FMJA 4RJ5A 5HIDA 3H4JA 3WF6A 3FLZA 4Q5EA 4FV7A 4O7SA 2E9NA 3A7HA 4UEUA 3FWQA 3QLFA 4RX9A 3CGFA 4ZTLA 3ZYAA 3UBDA 3DB6A 3W16A 1JWHA 3FDNA 2YWPA 4W8DA 3ZSIA 3CY2A 4MUQA 5EW9A 4IWPA 4YJQA 3A62A 3KN5A 5L2TA 5DI1A 2C5YA 4FNXA 1F3MC 5EI6A 2XBAA 4CG9A 4IAKA 3GNIB 4PMSA 1FBNA 1PF8A 4G6OA 3VS7A 4FOBA 3KMWA 1SMHA 1H4LA 3WZKA 4XCUA 1JKSA 3IDCA 2Z8CA 1DAWA 2JAVA 2NO3A 3NAXA 2WTWA 3O7LB 1Y6AA 4MH7A 4LYNA 3AKKA 2YM7A 5T6KA 2XK7A 4KAOA 3TZMA 5EFQA 2X4ZA 4FJVA 3EN7A 3NEWA 1OL7A 3FKNA 2UVZA 5IQIA 1UWHA 2H8HA 4FV3A 3W2OA 4EH3A 2HYYA 2LAVA 3DT1A 3ZLYA 4MHAA 3FLYA 3VONA 3ZO4A 5DVRA 1WMKA 1KV2A 3PJ1A 4I22A 3VS0A 2VWIA 3U4WA 3SW4A 4DG3E 4EHGA 2OXXA 2OH0E 2IJMA 3EQHA 3Q96A 4B0GA 4EHEA 5CAPA 3LXLA 2I7QA 4FV6A 4USFA 3KY2A 3NYVA 3V3VA 4ANMA 4BDJA 4PMPA 3VS3A 5AAGA 4YLLA 1M14A 4FNWA 2LGCA 4DC2A 3TMOA 3A4OX 5C8NA 1YVJA 1OKWA 4K77A 1BMKA 2UW9A 2OIBA 2X2MA 3SC1A 4YO4A 4I93A 2VGPA 3L9NA 4APCA 4PMTA 4CCUA 3QCSA 1G3NA 3UMXA 3OVVA 5IDNA 2V5QA 3FXXA 2W5HA 4BYJA 2NRUA 4ACMA 2UZBA 4LRMA 3A61A 1ND4A 1YXVA 3DK7A 3EYHA 2PULA 4QTBA 2F9GA 3EQBA 5HU9A 1Q4LA 4EQCA 2QD9A 3FYJX 1KSWA 4YPDA 1Y6BA 4FTAA 4G3DA 4YR8A 4NFMA 1MRVA 3IK3A 2PY3A 4GJ3A 3RAHA 3DGKA 2JBPA 4JR3A 3HRCA 1GJOA 1LEZA 2WHBA 3HUBA 4GVJA 3UDTA 4DEEA 4BDGA 2OI4X 4R6VA 1UV5A 2CNQA 1PMEA 2WIPA 2XNNA 2CCIA 5EYMA 3VF8A 3ZM9A 3RI1A 4A07A 4B8LA 4BDDA 2QC6A 5AX9A 2XNMA 1YOJA 4QMTA 4YZDA 5CF5A 2VTTA 4J8MA 4AZEA 3IDBA 3QWKA 5AV0A 1BKXA 5AP2A 2Y6MA 3FUPA 5ETIA 4XP0A 1GNGA 1K9AA 5KKRC 3OS3A 1ZY4A 4JT3A 2QU5A 4M84A 4KIOA 3ZUVA 3QC9A 5E8WA 5AV1A 4RIYA 2JD5A 4BIDA 4QEBA 5LMKA 3QTRA 4JJRA 3N4UA 1JSUA 4YLKA 2R4BA 2YM5A 3DAEA 2W1EA 5JEBA 3E8DA 4PP9A 2QO2A 5DFPA 3VS5A 4AXFA 3CPBA 5AMNA 3TIZA 2J5FA 3Q4UA 3BEGA 2JKOA 3AGLA 5DPVA 3ZEPA 1M2RA 4BBMA 4U81A 4PQNA 5IQDA 1PJKA 1OECA 3OT8A 4S31A 3R63A 3R9HA 3BIZA 4M7IA 4RQVA 3BPRA 4QYHA 4KBAA 4JIKA 2HELA 3ZFXA 4DHZA 4UWBA 3ORPA 4PMMA 3ZONA 1UU9A 3MTFA 3KMUA 2UW5A 3F61A 2UW8A 2YCFA 2XUUA 3QHWA 4FTLA 2QLQA 3C0IA 4IVCA 5ETCA 4BKJA 2HZIA 2IZUA 5FGKA 4C33A 4AE6A 3HVCA 5M08A 2ITVA 3Q4TA 3BU6A 3OC1A 2R3QA 2J5EA 4ACGA 3GU5A 4BCKA 2VWZA 3O8UA 1M2PA 2X9EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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