3W0NA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia, ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/antibiotic
source organism Escherichia coli
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
total genus 87
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0nA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0nA02
3N4UA 3W0MA 3N4TA 2B0QA 4FEVA 4FEUA 2Q83A 4N57A 2CKOA 3ATTA 3MESA 4DE4A 3SG8A 5EQEA 3W0OA 2QG7A 3TDWA 3TYKA 3CSVA 1J7UA 3UZRA 4DT8A 2PPQA 5C4LA 2PUPA 2PU8A 5BYLA 1J7IA 5IQAA 4CGAA 3W0SA 4FEWA 4GKIA 4DFUA 3F2RA 3FI8A 3ZM9A 4R7BA 2I7QA 3HAVA 4DFBA 2PUNA 4DTBA 4GKHA 4DCAA 4DA5A 5IQHA 4CG9A 4R77A 1J7LA 4R78A 3SGCA 3FEGA 4FEXA 1NW1A 5FUTA 5AFVA 2BKKA 2IG7A 4CG8A 3W0RA 4DTAA 5IQCA 4DBXA 5IQGA 4DT9A 3W0NA 3N4VA 5IQIA 5IQFA 4O7PA 4WZYA 4BR3A 5FTGA 5IQEA 4U98A 1ND4A 4PDYA 2CKPA 3DXQA 3TDVA 2PULA 1L8TA 3JR1A 5IQDA 3W0PA 2PYWA 4U94A 5IQBA 2OLCA 5C4KA 2CKQA 3C5IA 3Q2JA 5EQPA 3W0QA 4EJ7A 4ORKA 3G15A 3HAMA 2PUIA 3LQ3A 3SG9A 4H05A 4O7OA 3TM0A 3ATSA 5EQYA 3DXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XH6A 2OF4A 4RJ6A 5CASA 4YJRA 2CHLA 3ZCLA 4AE9A 4FEVA 5AUVA 4G2FA 5FTOA 5GINE 4O81A 4AT3A 2Y4PA 3II5A 3AT3A 3FMHA 4D55A 3KVXA 4XHKB 3KFAA 5LMBA 2NRUA 3FZOA 4ACMA 3TKUA 4YLJA 4FKRA 2Z7QA 3L8VA 4JG6A 4OGRA 4YJVA 4D0WA 5E90A 3SDJA 2JITA 4FKWA 4QYFA 4IE9A 5B2KA 3F3ZA 4Q5HA 1AD5A 5L6WL 3FLQA 4ZZOA 4D4VA 3VW6A 2PWLA 4YNEA 4E73A 4ZXTA 4EQUA 3GGFA 3A8XA 2YM3A 4E26A 2WPAA 4QP3A 3DK3A 4AG8A 1HCLA 2QONA 3TJCA 1M2PA 4M15A 4ITJA 3TV7A 3ZRMA 2J0MB 3NPCA 4IJPA 4MAOA 4BI0A 3R7UA 2PVMA 4R5SA 2J0IA 4KB8A 3UDTA 2J5EA 1XKKA 1UU8A 3NR9A 3ORKA 4WNPA 5HO7A 2YM5A 3BL9A 4KS8A 5JEBA 3OFMA 3CQWA 4EKKA 4LOOA 3A8WA 4AOJA 3BYOA 4G3GA 4U0IA 3UOHA 5B2LA 4FKJA 5JRQA 4J71A 4KUJA 4QYHA 3K3JA 3FL5A 4EH9A 2X4ZA 4PDPA 5AUTA 4IM2A 3BHUA 3TUBA 3F3UA 5HG8A 4F9CA 5EM7A 4O2PA 2AC3A 4F9AA 4NSTA 2PVFA 1CKIA 1Z5MA 4DITA 3HV3A 2UW6A 3E8NA 2YIRA 3IG7A 5DGZA 3QD3A 1B6CB 2UZLA 2XIZA 2ZOQA 3UMWA 4CCUA 3SRVB 4EH5A 4F6SA 4ID7A 4PWNA 3QWJA 3HV7A 4U9AA 5JZJA 3BIZA 2CKPA 2FSOX 5J9LA 1OKVA 1YDSE 2QOKA 2QURA 4RIWA 4DLIA 3KQ7A 3FLSA 3EQIA 4I6HA 4WNKA 3JR1A 4XV1A 1P5EA 4LV8A 3PWDA 4G3DA 4HNFA 4C7TA 4A9TA 4QMNA 2J50A 1OIYA 1QL6A 5EHLA 5BMSA 4IB0A 3QTUA 2Y6OA 3UODA 4BHZA 2YAKA 4O83A 5IQBA 1JAMA 1LEWA 2GQRA 4IDTA 3AD5A 4FKTA 5CZIA 1OIUA 2F2UA 3UGCA 4A4XA 4BCJA 4G31A 2UVYA 3WE4A 1OL7A 1EH4A 5BVDA 2LAVA 4CKRA 3Q32A 3Q2JA 1YOJA 5HESA 3LFSA 5JH6A 3NIEA 3PUPA 2GNLA 4GU6A 4RX9A 4IVDA 4J95A 2C1AA 2QOOA 2V0DA 3OXTA 1DI9A 5TOZA 4IAYA 4RT7A 3HAMA 3PJ2A 4IJ9A 4LMUA 4RJ7A 1J1BA 2BZHB 5JSMA 3D5VA 4GT3A 3GU4A 4EH6A 1YI3A 2C4GA 4OW8A 1KE6A 3R1SA 4BZDA 2UV2A 3KULA 5HORA 2CCHA 2B9HA 4FJVA 5CSVA 4O7TA 3N4TA 3DLZA 2E9NA 1XH7A 4KNBA 4M0YA 3SKCA 4JG8A 3P9JA 3U4UA 2IPXA 2W0JA 4FL1A 4G5JA 4XP0A 3BQRA 4EK6A 1XBAA 4AU8A 3KN6A 5IUHA 1XHAA 2HWOA 2XRWA 4C4HA 4QPAA 4UALA 2YJSA 4PMTA 4U7ZA 4MKCA 4FTRA 1SVHA 4JOAA 4DEBA 2OICA 4AXAA 2PE2A 3EN5A 4FA2A 3PJCA 3QKMA 3SQQA 4C3RA 3BBWA 4FEWA 2Z60A 3DJ5A 4GL9A 4QMOA 2BZKB 2ESMA 3ROYA 3NAXA 3MH0A 4DFBA 4JIAA 2W99B 3R7YA 2JDVA 5IEXA 2J51A 4HPUE 3A7FA 3COIA 3D5WA 4X2GA 5EOBA 4PNKA 3EIDA 2JDOA 3ZLSA 3ELJA 3LCSA 4BTFA 1OM1A 5HTCA 2CNVA 1KV1A 3ZLXA 4CT1A 4ERWA 2XS0A 3ZBFA 3PIZA 2B1PA 3EFKA 4OBQA 2Y7JA 1Y8GA 3U6IA 1PXKA 5J87A 4FOCA 4UYNA 5JK3A 4DTAA 3TZ9A 5KKRB 5T6KA 4JRVA 3ZDUA 3GB2A 1Q99A 2JDSA 3LW0A 4HVIA 4BR3A 4GS6A 5AWMA 3NUAA 4UN0C 2Z02A 3CKXA 3OEFX 3THBA 3LLAA 2RKUA 3E7VA 1UNGA 4L45A 3SRVA 1JNKA 4YJUA 1YI6A 5IH5A 3OOGA 2UZUE 3OW4A 4MHAA 2C5XA 2JC6A 4YJOA 4C58A 4A4LA 3OW3A 1OZ1A 3PPJA 5K3YA 3LAUA 5EI2A 2FSLX 4XP2A 4CZTA 3MBLA 4O82A 2O2UA 4I94A 5CAPA 4OTIA 1OL6A 1XH8A 3Q60A 3FXWA 4FZ6A 4X21A 3RMFA 3SAYA 3D5XA 3OVVA 4FR4A 2PZPA 4OBOA 1ZYSA 4YC6A 2OF2A 3EN9A 4B99A 2BILB 5CXZA 3QL8A 3SA0A 4G6NA 3O8TA 4D9TA 3QRKA 3SW4A 3VS1A 4CFFA 2XALA 3CPCA 4V04A 2JFLA 2C6DA 4X6RA 3RZBA 4AW0A 2VRXA 4EZ5A 3IOPA 4ZLYA 4UWCA 5KCVA 1FVTA 4DG3E 3PE2A 2XNBA 5D41A 1JKLA 5G1XA 2UZEA 1CTPE 2E9VA 3F61A 1Y8YA 3GVUA 3F7WA 3P4KA 4HYSA 4BY9E 5TF9A 3BEAA 4DF3A 5BPYA 1OBGA 2QKRA 2JEDA 3ZMMA 4FVRA 4IWPA 2VTQA 3ZLWA 3UZTA 3WYXA 3QCXA 1OIRA 3AC1A 3UG2A 3H30A 4TTHB 2ZV2A 1DI8A 4GMYA 2RL5A 3CLYA 4GFGA 3VO3A 3VUHA 4CFVA 3E87A 2YDKA 1ZMVA 3LQ8A 4ENXA 2JD5A 3FUPA 3HUCA 4D9UA 2IW6A 2PK9A 4RSSA 1K3AA 3UPXA 3KMUA 1O6KA 1LP4A 2PHKA 2VU3A 3DLSA 3P23A 4FNXA 3CTJA 4H1JA 3C0GA 5J95A 4CKJA 3W0OA 3Q4ZA 2YACA 2BHEA 3K5UA 1WAKA 2BPMA 3B2WA 1IRKA 3R8PA 4DDGA 2X1NA 5DR9A 2C47A 2IVSA 2XAMA 2OJJA 1M17A 5IISA 1H1PA 3PPZA 5E8YA 4IH8A 4O7NA 4XOZA 4OTFA 3UTOA 5BVOA 5HD4A 1PYEA 3C9WA 4DFUA 2NO3A 4IWDA 5A4QA 1V0OA 2OH0E 1H26A 2WMRA 2XARA 3BWFA 4M13A 3FJQE 4M12A 4OT6A 3CR0A 5A54A 3FV8A 3MN3A 4NJ3A 2WGJA 2QO7A 3CQUA 2C3KA 4U45A 3QLGA 3UIUA 1Y57A 4CG9A 4R3PA 4FKIA 5C26A 3ORTA 5EI6A 1R0EA 3G51A 5CEQA 4UX9A 1YXVA 4BF2A 4O0WA 3KL8A 2Y8OA 2BRNA 4G6OA 1WMKA 1RDQE 4H1MA 2R0IA 2XUUA 4LMNA 3G90X 1H1WA 4JIKA 3DNDA 3BLAA 3UO6A 1JPAA 3CJFA 3ML1A 3Q4CA 4YZDA 4YPDA 3EN6A 3RKBA 4YO4A 5IMXA 5M44A 3W0NA 2IVVA 3PA4A 3G33A 1Q8ZA 3VBYA 4QP6A 4IW0A 3U51A 4ANLA 2J4ZA 4FSRA 5HNGA 2E2BA 2UZTA 5EDQA 4U98A 3MDYA 3TIZA 4S31A 2ITXA 3F5UA 3KF7A 5HG9A 4QMWA 2YM7A 3BELA 4D2SA 3E8DA 2G2IA 3QTQA 4QP7A 5JQ8A 4MEDA 4OT5A 1PKDA 4C2WA 4NU1A 4EOMA 5KNJA 3CD8A 4ZSJA 1H27A 4QYEA 4DFYA 2FA2A 3R9DA 2PZYA 3G5DA 2B9FA 4QDEA 4BDJA 3FQHA 1T45A 5EI8A 3TUDA 5LXMA 1Q41A 3AD4A 5CI6A 5M4IA 5JGDA 2YIYA 3AGLA 3DZOA 4HW7A 1H1QA 2R64A 3LOKA 2XANA 2F4JA 4DG0E 4EWHA 4DCEA 4BCGA 1LUFA 1YWRA 3DBEA 4I5CA 4ALWA 4EH8A 5ETFA 1GOLA 1YHVA 3LXPA 4ANMA 4IACA 4WIHA 5HVKA 4RIYB 2A27A 5DH3A 3Q53A 3EFWA 3RVGA 2FB8A 4AFEA 4FG8A 4PP9A 4TW9A 1XH5A 4F65A 5IA4A 3GU8A 3PVGA 3NUXA 2YM4A 3HMIA 4IWOA 5FDPA 4IZAA 1H1SA 5H9BA 3KA0A 5LJJA 4DDIA 5F95A 4NCTC 4Q9SA 2XK6A 2ZMDA 1TFFA 3W16A 3FPMA 3QCQA 4P4CA 3AMBA 4HYUA 5AEPA 3R00A 1E1VA 3C7QA 3QQGA 4O21A 5J1WA 2WTVA 4MXXA 5T3QA 4X3FA 2OJGA 2QCSA 3DY7A 4QPSA 4R1YA 5K4JA 5LWNA 2GHMA 4MQ2A 4G3FA 2IO6A 5EYCA 4D0XA 5DPVA 3RM6A 1UU9A 3HYHA 4MBLA 2VTHA 4ANSA 3V5JA 3QYZA 3DXNA 3Q5IA 4MBJA 5CXHA 5HIDA 4QMQA 1PXLA 2OZAB 4Y95A 1KOAA 1Y91A 3NIZA 5LWMA 5CSHA 3IS5A 4FTCA 3PJ1A 4G16A 5H8BA 1YRPA 2VTTA 2YN8A 2PU8A 3WI6A 1LR4A 3QF9A 1SM2A 3BGZA 3JXWA 5CX9A 2X8DA 4BIDA 1GY3A 4NT4A 3CCNA 4LYNA 3TV6A 4NYEA 3C51A 4L43A 2P33A 4AFJA 3E7OA 2BZIB 2JKQA 2X7FA 2KTYA 3DA6A 3HAVA 3EQCA 2B7AA 5CU2A 3R21A 4FT3A 4X7QA 5J9ZA 4RWJA 4NTSA 3DS6A 4C4IA 3QQHA 2FGIA 3WF5A 4CFUA 3EL7A 4IZ5A 3R7IA 4C3PA 5M4UA 5DG5A 3VS3A 4DGMA 4OR5A 4E6CA 3UOKA 1WBPA 2YZLA 4F1MA 3HRBA 3JVSA 4Y8DA 4HCTA 3RALA 4EH4A 4ZY5A 2Q0BA 3UBDA 1ZZ2A 5L8KA 2UZOA 2UW3A 3HRFA 2QODA 2C6OA 1YVJA 4MXYA 1VYWA 2OIBA 3OY3A 2XKDA 3NYVA 2W1EA 1ZYJA 3PP0A 4BDCA 4RPVA 3BYSA 2HELA 4E4NA 4ZSEA 3NNUA 5IQGA 4KA3A 3ZH8A 3FY0A 3KEXA 5IQIA 2ETMA 4F0FA 3P7BA 4D5KA 3FY2A 1JWHA 3JS2A 3R7OA 3ZTXA 4EOPA 3QD4A 2GNJA 4GSBA 2BFYA 4ZP5A 1OL1A 3R83A 4CSVA 3ZXTA 4RA4A 5AP7A 3RI1A 4XX9A 4GW8A 3WILA 3DCVA 3LFDA 1FINA 4IMYA 5AAGA 1H1RA 2KULA 4AAAA 2WMUA 3W8LA 3HA8A 4YLKA 2Z2WA 3IQ7A 3PY3A 3W10A 4ZTLA 4I0TA 4FTQA 2ZMCA 3U6HA 2FVDA 4RVKA 5L8JA 3BHHA 4ACDA 3NX8A 2IZRA 4U6RA 4FKOA 5DLSA 3UJGA 2WB8A 4IANA 3ALOA 3A7IA 5JMSA 4QMUA 3H0YA 1GZOA 2J5FA 5EYKA 4J96A 4AN3A 1Z9XA 3PRIA 4RA5A 5AV2A 5BVFA 5HLNA 5M51A 1H25A 4ASDA 1ZMWA 5CALA 1BYGA 3VONA 1U5QA 2RIOA 2ZDTA 3DB8A 2BAJA 3EHAA 2E9OA 4WOVA 4DN5A 2BRHA 5LMKA 4FTIA 4USFA 2WMSA 5DT0A 3H9FA 5K5XA 3K5VA 3KY2A 3IW8A 4UV0A 4IB1A 4UY9A 4YPSA 4HVSA 4A9RA 2QHMA 4FIHA 2IW8A 3DFCB 4YZBA 4L67A 2I0VA 4ASZA 4LQMA 2ZV9A 2QOQA 3IDCA 3MVLA 2YA9A 3QRJA 4K1BA 4O7OA 4R6VA 4OTWA 2I0EA 4RVTA 3COMA 2ITTA 4JDIA 4FKGA 5BVNA 3DFAA 1ZYCA 3LMIA 5L6OA 5DEWA 4IQ6A 4KIOA 5DHJA 4LG4A 2XF0A 4IHPA 3OC1A 4WHZA 5AV0A 4AZSA 3HL7A 2XNPA 4JQ8A 4O7VA 3PFQA 5FXQA 5FBOA 3EFLA 3EL8A 3KXZA 4DAWA 2WMXA 5EM6A 3TYKA 3I81A 3CGOA 4GIHA 5AA8A 3L9LA 1J7UA 4IB5A 2CPKE 3FQEA 3UZRA 2OZAA 4KRCA 4FV7A 4WUNA 5EM8A 2YISA 2BAQA 1Z57A 4FKPA 1YDTE 2O0UA 4E4MA 2WTWA 3F2NA 3TEIA 3NUSA 1PXMA 3PSCA 5KE0A 1V0BA 4E5WA 3U8WA 2GMXA 2QOLA 3FI8A 5BVEA 4AA4A 4PTEA 4F7LA 1OGYA 4Q5EA 4QQTA 2YCFA 2OZOA 3VC4A 5CF5A 4MCVA 3VUDA 4DH3A 5I9WA 1ZYDA 2EXCX 3FMEA 3UOLA 2BDJA 3EQRA 4FIGA 4MXCA 2A19B 2VZ6A 3WZKA 4K11A 4MXZA 2F9GA 3FHRA 5IUGA 1L3RE 4FV0A 4C35A 2YIQA 4MYGA 4XLIA 3HNGA 5HBHA 3VRYA 5BV3A 1KE8A 2C6KA 4XV9A 2R0UA 1WZYA 4KINA 3D7TB 5EFQA 3VS7A 2J6MA 1ZWSA 2OU7A 3NNXA 2HZNA 3RNIA 1YHWA 3MWUA 4TYHB 5IMEA 5AFVA 5A46A 2FH9A 3PG3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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