3W0NA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia, ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 87
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0nA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0nA02
5EQEA 4DFBA 5IQHA 2PYWA 5IQIA 4U98A 4CGAA 3C5IA 4R7BA 3N4VA 5IQCA 3TYKA 4O7OA 5IQAA 2IG7A 2PU8A 4GKHA 3MESA 3W0MA 2OLCA 2PUNA 4DA5A 4DTAA 5IQBA 4DBXA 4WZYA 1J7LA 2CKOA 5C4LA 1ND4A 4BR3A 5AFVA 3ZM9A 4DTBA 4CG8A 3G15A 2PULA 4CG9A 2QG7A 3FI8A 4DT9A 2PUPA 3LQ3A 3N4UA 3TDWA 4FEUA 5IQGA 3W0NA 1L8TA 3SGCA 4H05A 3Q2JA 5EQPA 3HAMA 4EJ7A 4U94A 4FEWA 3ATSA 5IQDA 3W0SA 3TM0A 4DFUA 5C4KA 2B0QA 3DXPA 4DT8A 2Q83A 3JR1A 4ORKA 2PPQA 3W0OA 3SG9A 2CKPA 1J7UA 4DCAA 3ATTA 3W0PA 3DXQA 3W0QA 3FEGA 3TDVA 2PUIA 4DE4A 5EQYA 4O7PA 5BYLA 2CKQA 5FTGA 5IQFA 1NW1A 3W0RA 1J7IA 4R78A 3HAVA 4PDYA 4GKIA 5IQEA 2BKKA 3F2RA 3CSVA 3UZRA 5FUTA 4FEXA 4FEVA 2I7QA 3N4TA 4N57A 3SG8A 4R77A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FGIA 3GCPA 4EQCA 5L6OA 4TW9A 5IQHA 4OTIA 4F9CA 4DEBA 3EQBA 4RLLA 3RAKA 4BDHA 3N4VA 4IZAA 3D5XA 2VV9A 3GEQA 4BN1A 5IQAA 2GPHA 2PL0A 2UZTA 3Q9YA 4YU2A 4KD1A 4QPAA 5DOSA 3PUFC 2W9FB 1YXTA 2BFYA 3VJNA 1ZWSA 3UQFA 1YDTE 3WZKA 4ZMFA 4FTRA 4BTFA 3ZO1A 4DA5A 3GU4A 5M4IA 1ZYDA 4LQMA 1BUHA 3H0ZA 4JG6A 5AIRA 4I4FA 4FTQA 4G31A 1JKLA 4WUNA 4E5BA 1Z57A 4ZAUA 3CD3A 5LVNA 1RE8A 2VNWA 3F2AA 1SYKA 2F57A 3HGKA 2Z7RA 4O2ZA 2A19B 2ONLA 5B7VA 4DFNA 3E63A 3VF9A 4QMYA 5E8TA 3TUDA 4LV8A 3GC7A 5GHVA 3LQ3A 2J0MB 2PVYA 3PXYA 4KIPA 4C3RA 1WBTA 3EZVA 3N4UA 5HBEA 4DFYA 3BI6A 5A4EA 3TUCA 4A4OA 5KNJA 3QQFA 1LEZA 3O7LD 4IADA 3VW6A 4R3PA 5AUYA 5IPJA 2YAKA 4LM5A 2FYSA 3SXSA 4YURA 2QONA 3R04A 3VVHA 2YM5A 5A4TA 3HRCA 5FXQA 5JFVA 3GC8A 1ZOEA 4OLIA 3ZC5A 3KXXA 3AGMA 4FNWA 5EHLA 2RFSA 2R9SA 2UW3A 2WTJA 2QI8A 3L8VA 4FZ6A 4ZXTA 5L6WL 3QF9A 3VONA 3NW5A 4RA4A 4MXZA 3NUPA 3TI1A 2VWVA 4EEVA 3BYUA 4IBMA 4D0WA 3SKCA 4BDIA 2WTCA 2Z7SA 5HG7A 1FVRA 2JC6A 5ETCA 1NVRA 3F3UA 4LRJA 4BCNA 2RIOA 4DH3A 1Z5MA 3L1SA 3RPRA 4E8AA 2GNJA 3PA5A 3BYSA 3B8RA 3OW3A 5J5SA 3E7VA 5E90A 4PX6A 2AYPA 4BCPA 1F0QA 4I1ZA 3NNXA 3JY9A 2OH0E 3ZEWA 3SC1A 3ZZWA 2C5XA 4IMYA 4FOCA 1U54A 4YHJA 1Y57A 5J7HA 5HD7A 3Q4TA 1OIQA 2HOGA 3R71A 4EORA 2WTWA 2GNLA 4GVJA 3JUHA 3BHVA 5HTBA 4HCTA 3O51A 4P2KA 1P2AA 2GS2A 3V5PA 5CXZA 3QZGA 4AT4A 4QTDA 4XP3A 3W2CA 5IQEA 3I5NA 4EHGA 1J3HA 2I0EA 3SDJA 4U9AA 2YM6A 5AP3A 4USDA 3KMWA 4EOIA 3ELJA 4RLKA 2ZJWA 4YC3A 4O38A 1STCE 3V5LA 3KCFA 3KL8A 4ASDA 3COMA 4KKHA 4LOPA 4C3PA 4JL9A 2OXYA 1H27A 5DR6A 1WVWA 4XOYA 3BX5A 3UZPA 4AN2A 1AQ1A 1XWSA 3DKFA 4A9YA 1ERKA 4B99A 3IGGA 4WRSA 3OS3A 4F7SA 2XARA 4O27B 3DKGA 3QTSA 3PJ3A 4QTCA 2JITA 1KE8A 1PMVA 5DA3A 2H8HA 2J5EA 4DGNA 5JH6A 3OUNB 5LMKC 2VTLA 3NYOA 3OCBA 3NSZA 4YO6A 3TEIA 5IUHA 5JZJA 4LV5A 1O6KA 3ORMA 3RNYA 2C0IA 4WBOA 1PXLA 2UW9A 4MD7E 2XUUA 4FKOA 2W4OA 2ITWA 2B9IA 4IB0A 3IKAA 3UMWA 2WD1A 5D7AA 2CKOA 4BCQA 3DT1A 3QA0A 3VBYA 1H1PA 3HKOA 2G15A 3IW7A 3IECA 4QYFA 4RQKA 5J95A 5EDPA 3U9NA 4CVAA 3EN4A 3BLQA 3FI8A 4R6VA 5BVKA 4DT9A 1OECA 2EU9A 4UYAA 5DBXA 4EC8A 4EOSA 3NAXA 4I6BA 4ALVA 1XHAA 4UZDA 5CU4A 4BY9E 3U6HA 3KU2A 3TDWA 3HMMA 5BVNA 2VO6A 5JMSA 4DDIA 2ITOA 4TNDA 3HV7A 4TTHB 3TKUA 4Y83A 2EVAA 4M69B 3FSKA 3GT8A 2F2UA 3REPA 1QMZA 3HAMA 5AP0A 4JR3A 4RIWB 4ZTSA 3PSCA 4O7LA 5I0BA 5IA0A 2CN5A 4RZVA 3ZSHA 3FV8A 4ZMEA 2VTPA 3P78A 4I21A 3ATSA 4IFCA 1URCA 3KULA 3EH9A 4YSJA 4AT3A 5FD2A 1OPLA 2VAGA 4QYHA 5E92A 1SMHA 5DLSA 3KXHA 4MXYA 3NRMA 5AV0A 3LPBA 4R3RA 3K5VA 1GAGA 2XEYA 4MVFA 1WFCA 4FZFB 5BUJA 4HCUA 2YHVA 4JAJA 4O7SA 3O17A 4EH2A 2OIQA 4D55A 3PIXA 5DVRA 3EOCA 5LWNA 3DB8A 5DN3A 3ZRKA 3IONA 5EM5A 3E3BX 3WYXA 4Q9ZA 2BZJA 3DTWA 3KF7A 4L8MA 4IW0A 4ZJVA 2GDOA 1OKZA 4IZYA 5HO7A 2VN9A 1KOBA 4IM3A 5CU0A 2XJ2A 4I92A 2R5TA 2VTMA 3BYMA 3VHKA 4W4YA 4K11A 1H26A 5L2WA 1H1WA 3EYHA 3HYHA 4Y72A 1Q8UA 3FZRA 5LOHA 3PRIA 4I5HA 4F78A 3MFRA 4M8TA 4CFMA 1PXPA 2C5VA 4O91A 4YTCA 2UUEA 1OKYA 3PUPA 1R0PA 1J7IA 5ANIA 4PDYA 2YCFA 3OBGA 5FGKA 4E6CA 4V0GA 2R3OA 2J90A 3FLZA 3R0TA 5BVWA 2UVYA 4P5ZA 2HZIA 3MA3A 4S30A 5E91A 2WQNA 2R7IA 4U40A 3V51A 2VTAA 4I6QA 3I7BA 2I7QA 2QC6A 4WHZA 3CBLA 1Q41A 2B55A 1I44A 4GS6A 3QUPA 4USFA 3GB2A 3AC8A 2I6LA 5AIKA 3UC3A 2ERKA 2YFXA 4BZOA 4GG5A 4AGDA 3UDSA 5CXHA 5D10A 3R8PA 5JQ8A 3ZO3A 5KX8A 3OCSA 3Q52A 4NM3A 4GCJA 4PDSA 4XOZA 4FODA 1CMKE 3V8SA 1OITA 2YISA 5JT2A 3DQXA 1CSNA 2I0HA 4FT7A 5A6OA 5GJDA 4X3FC 3FLQA 3CQWA 2VO3A 4FV6A 2KTYA 1ZARA 1BYGA 1QL6A 2JAVA 1MQBA 2PUNA 2XK8A 3PSDA 5AP2A 2C69A 1O6YA 3L8XA 4R5SA 4GIHA 3DK6A 4FVRA 4YZBA 5DH3A 5G6VA 5CY3A 3SW7A 3LMIA 3DPKA 3HX4A 2OFVA 2CGUA 3IOPA 4MD8E 4EOKA 2XRUA 4H36A 3ZM9A 1GIHA 1OM1A 2HIWA 5ANGA 3E64A 3DV3A 5GJFA 3LFFA 4O0TA 2UZVA 2OH4A 3VS5A 3FI4A 5LWMA 4K8AA 4CTBA 4ACMA 3Q5ZA 3HNGA 2FSMX 5CENA 4RBLA 2YACA 5GJGA 3DBDA 3E8NA 3TTIA 4AZVA 4AA5A 4CCUA 3RK9A 3SOCA 3QTZA 4QTBA 3EQPA 3I0QA 5CU2A 5AADA 1FGIA 1W8CA 5IZFA 3A61A 3GGFA 2WMUA 3R1SA 4JDHA 2QO9A 4H05A 4IB1A 3RPYA 4IANA 1WBOA 4GK3A 5J9ZA 1OIUA 4RJ6A 1PXIA 2ZM4A 1ZYLA 4RMZA 3ODYX 4X3FA 5D1JA 1PXNA 2P0CA 4JDJA 3UVQA 3Q2MA 4RIYB 3VJOA 3NUXA 5EFQA 3CTJA 2XK6A 1XH4A 3OP5A 4QDVA 2BROA 4XG2A 5E8SA 5HI2A 5D7VA 4YZDA 4MHAA 3C1XA 4YMJA 3KRLA 4RWIA 4CNHA 4KWPA 4EH6A 3TNWA 3F5GA 1WBSA 2QHMA 3FC2A 3HUCA 2JGZA 1Q97A 4QP7A 1TQPA 4QNYA 1H0VA 4O0XA 4FTOA 4UXLA 4DHFA 1OKVA 3CPCA 5GINE 3F7ZA 5JFXA 3NGAA 4JXFA 5AV3A 1VYWA 3VS6A 3HMOA 1R3CA 4FTUA 2YJSA 3WIKA 3DQWA 2HWPA 3HLLA 1ZMVA 3IQ7A 4PY1A 4GK2A 3CKXA 4NIFB 4O7WA 5IUIA 2W5BA 2EWAA 4E73A 1KV2A 4BCJA 3AC1A 3A60A 1IAJA 5C03A 3MA6A 2Z8CA 2R3IA 3LCOA 1G3NA 4JBOA 4U5JA 5FQDC 3AT4A 5EHYA 4EH7A 4PL3A 5AV2A 4LOQA 1JBPE 2IVVA 3D0EA 3VS4A 4YGAA 3KMMA 3TG1A 2VTOA 3QX2A 4NM5A 4FV2A 4U42A 2PVKA 4JLCA 2WQBA 2DWBA 3L8SA 4AAAA 2BZKB 2HAKA 4JMQA 4OTFA 4FEVA 2VWXA 3OXZA 4MNEA 3RZBA 4FT3A 4BDBA 4YLKA 1YQJA 1YXUA 3DB6A 2B52A 3UGCA 3OCTA 4FV0A 4XG8A 2V55A 2WU7A 1OI9A 2PYWA 3NFFB 4RWKA 3R28A 1ZYCA 4IAAA 4O22A 3QTQA 2CNVA 4LUEA 5HIEA 4ZSEA 1T45A 1V0PA 3ZEPA 4MEDA 2UZOA 4K18A 4XNEA 3GENA 3UG2A 4MTAA 4AP7A 3KXGA 3UPXA 3KRRA 4BZDA 4IDTA 5KE0A 4DHJA 3G5DA 3KULB 1P4FA 3GU7A 4HCVA 3QC4A 2C6TA 2GTMA 2WTIA 3HV3A 4XRLA 5CSXA 5HNBA 2OXDA 3LFAA 2BHEA 4EK3A 4HGSA 4CKRA 5EK7A 1U4DA 4O0VA 5TT7A 3MTFA 1PYEA 4CG8A 4CKJA 1KE5A 2VWZA 3VUHA 3EL8A 2OIDA 3TKIA 2JLDA 2UVZA 4L68A 1Q8ZA 2R3FA 5AUTA 5A46A 1W82A 3BZ3A 3UYTA 2WOTA 3CXWA 3LW0A 5DRDA 3UDBA 3HRFA 4AXFA 3FXZA 5JRQA 3FY2A 2VTRA 3OROA 4GH2A 3QHWA 2ZFYA 2ZMCA 3N9XA 2QOCA 3DAEA 4X7QA 3CGFA 3Q60A 4AGWA 2BTSA 2XIYA 3W2QA 4IZ7A 3I5ZA 4EJ7A 4U94A 3HL7A 2ZMDA 5HICA 4ZY4A 4HZSA 4EOJA 4EHEA 1Y6BA 1YVJA 2OZOA 1KWPA 3ZBXA 4CMOA 3ZM4A 4IX4A 2YIRA 4I6FA 4F6WA 2Q83A 4GT3A 4MF1A 4O0UA 4FIIA 3MB7A 3W0OA 3SLSA 4TL0A 2WMVA 1O9UA 3II5A 4O86A 2QNJA 4BCFA 5DE2A 5JZNA 4AACA 3OTUA 3W0PA 4WKQA 4Q2AA 2X8DA 4B0GA 2FSOX 3F82A 4RG0A 4FNZA 3QXPA 3EKKA 3F3VA 3LXKA 3T3VA 3BELA 3MVLA 3MYGA 3NYVA 4FICA 4EZ3A 4TRLA 1GOLA 3MDYA 3QQGA 3SAYA 3I7CA 4U41A 2C3KA 2IVTA 1OL7A 3AD4A 2OGVA 1Q62A 2UZEA 1H4LA 3DNDA 3LXPA 3PWYA 3PXFA 4M0YA 4O21A 2C5NA 5DG5A 2VTNA 4NTTA 4AA4A 3ET7A 4RC4A 5ETAA 3W8LA 3QD2B 3WF7A 5CT0A 2YAAA 4OUCA 3W0RA 2WFYA 1PXJA 2BAJA 3Q96A 4E5WA 3LOKA 4BDKA 3EYGA 4K1BA 3F2NA 4GMYA 2PMIA 2NP8A 2BR1A 4JIAA 5FUTA 2HK5A 4ENYA 4AU8A 1ATPE 3PZEA 2YZLA 2ZV8A 4AUAA 4ZLZA 5IUGA 2W4JA 3VBVA 5AV4A 3CS9A 4R77A 3AMBA 2J6MA 2JFMA 5IEYA 3EQFA 4KIQA 4MAOA 3FL4A 5IQIA 2JD5A 2OU7A 2C6OA 2JKKA 3OW4A 2VGOA 1R0EA 2X7OA 5EHOA 5HZNA 3UOKA 1H00A 1TFFA 2I1MA 5ICPA 3QALE 4OTHA 3RINA 3P5KA 3KVWA 5DR9A 2WEIA 2VD5A 4MUQA 4DG3E 4GKHA 4ASXA 4OGRA 4HGTA 4AZTA 4AW0A 2UVXA 2YM7A 4X3FB 4C2VA 2PMNX 4CFFA 2E9UA 4FV4A 4YTHA 2HZ4A 4DEDA 4Z16A 3P23A 3HZTA 3F3WA 4Z9LA 3ZUVA 4BI0A 3PXZA 2W06A 4ALUA 1UKIA 2J7TA 1FVTA 4D1SA 4FV5A 3SW4A 3CC6A 3BGPA 2X2KA 4RX5A 3P86A 2QOLA 3DJ6A 1MRYA 3QA8A 2RG5A 2JKQA 3ACJA 3ZXTA 5EOLA 4FKWA 5LVLA 2X9EA 3Q9WA 4F9AA 5HVKA 4B9DA 4EC9A 3PP1A 5CSWA 3QKLA 1ZY4A 1TQIA 2Q0NA 4JG8A 5A4CA 2OFUA 4H1MA 4AX8A 3H3CA 3LXNA 5EKOA 3WILA 4FKVA 2UW7A 1S9JA 3SRVA 1H25A 4ZY5A 4E6QA 4A7CA 1M2PA 4JS8A 3KMUA 3R7IA 4LL5A 2WAJA 3GOKA 4NK9A 3W0SA 3MY5A 4YJVA 1YHSA 4OBPA 4ASZA 5C4KA 1XH6A 4QMNA 4MK0A 5HG8A 4ZTMA 3AOXA 1YDRE 3R30A 2WMTA 3JR1A 4YLJA 4ARKA 3QQLA 4CT2A 1KE7A 1CTPE 3EN7A 4ORKA 5HKMA 3TNHA 4DDGA 4K77A 4FSUA 5IA2A 3CR0A 3ODZX 4MNEB 4KIOA 4PMMA 4CZTA 5M57A 2UV2A 3BLAA 4F0GA 5BUIA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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