3W0OA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia, ternary complex with adp and hygromycin b
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 88
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0oA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0oA02
4DT9A 4FEUA 3LQ3A 3MESA 3W0QA 1J7IA 2PULA 2PUNA 3W0PA 2B0QA 2PYWA 3SGCA 3HAVA 5FTGA 2CKOA 4DFBA 4WZYA 4DE4A 5IQFA 2CKQA 5IQEA 5EQPA 5AFVA 4CG8A 4O7OA 3ZM9A 2Q83A 1ND4A 4GKIA 3TDWA 2IG7A 4DT8A 5FUTA 3W0OA 3N4TA 4R7BA 1NW1A 3F2RA 4U94A 3TDVA 3CSVA 5IQAA 5C4LA 5IQBA 3N4VA 2PPQA 5BYLA 3Q2JA 4FEVA 3TM0A 4DTAA 3DXQA 3FI8A 4PDYA 5EQYA 3W0NA 5IQDA 4ORKA 3W0MA 5C4KA 3DXPA 4FEXA 1J7UA 5IQHA 3G15A 2PU8A 1L8TA 2CKPA 2PUPA 3W0RA 3N4UA 4CGAA 5EQEA 3HAMA 3C5IA 3JR1A 4R78A 2PUIA 1J7LA 5IQCA 4GKHA 2I7QA 4O7PA 4DCAA 4DA5A 5IQGA 3W0SA 3SG8A 3FEGA 3SG9A 4FEWA 2OLCA 4R77A 4N57A 2QG7A 4BR3A 4U98A 4DTBA 4DFUA 5IQIA 4DBXA 3TYKA 3ATTA 3ATSA 4CG9A 4EJ7A 4H05A 2BKKA 3UZRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FSNA 5LMKA 4G17A 4G3FA 4MXXA 5JRQA 4FSYA 4EJNA 4GMYA 4AW1A 5IEXA 2PZYA 2JLDA 2J6MA 3KFAA 5CXZA 4JXFA 3MH1A 2ZV7A 3EQBA 3SGCA 4LV5A 1ZOHA 3VWAA 3ZLSA 5K4IA 3FZTA 5HQ0A 3OFMA 3CCNA 3OTVA 2R0IA 3WE8A 3CLYA 4JR7A 5JGAA 5CU3A 3U4WA 3CTHA 5EDQA 3FLYA 1SNUA 2Y4IC 3C4FA 4O7WA 4S30A 2Y0AA 4I41A 4ZS0A 1PHKA 4KAOA 1YOLA 4BDBA 2UV2A 4FT0A 4J7BA 3RCJA 1KV1A 2XIXA 4L9IA 2Y7JA 3NW6A 2YZLA 4CFVA 5DG5A 5AP6A 1KOBA 2V22A 4C4EA 1S9IA 3ZM9A 4KABA 5KHXA 4I5CA 1V0BA 3R8LA 5CANA 3E8NA 3ZTXA 4OUCA 4QRCA 2ITYA 3TZ8A 3OY1A 3DY7A 3SRVB 3HVCA 4P5ZA 2XJ2A 2W4KA 2Q0BA 4CKJA 4LI5A 3ET7A 4MNEA 5HG7A 3UIUA 4PMMA 2W1CA 2ZM3A 3EQHA 2PZ5A 2Z60A 3ORPA 2EB3A 2C47A 4MXCA 1JSVA 3SA0A 2IZSA 2Z02A 3NVMB 3M1SA 5KMOA 2WTCA 5KZIA 2EWAA 4E5WA 5EOLA 1Y6AA 3UO5A 4RFZA 4LMNA 4F6WA 2JDTA 2C30A 2V62A 4CFNA 3LZBA 3R8VA 1JSTA 1XJDA 5BVDA 2QQ7A 4RIYB 2BHHA 3G15A 3FDNA 2JKKA 5L8JA 3TV4A 3TI1A 3ZO3A 4UWBA 4FYNA 3S4QA 3ALOA 3BGQA 3EB0A 3SLSA 4FTNA 2R3IA 2CMWA 4LFIA 4U9AA 3NNWA 3Q9WA 4YBJA 1M17A 3QL8A 2HOGA 4UN0C 4FVPA 2UW6A 2CSNA 3OXIA 3CTQA 4UZHA 5F4NA 4A9TA 5JRSA 2J5FA 3UNKA 2WMRA 5A4TA 4B9DA 4J8MA 3AXWA 3U87A 3TWJA 5B0XA 3UVQA 4BTMA 4BZNA 3NFFB 1RE8A 1ZYLA 3AD6A 1ZAOA 4V05A 3MVLA 3ZMMA 3Q3BA 4OTWA 2I7QA 5HVJA 3QRUA 3CR0A 3FYKX 4ACGA 2XUUA 3W18A 4Y5HA 2BR1A 1Z57A 4GT5A 2ZM1A 2P2HA 1U54A 5EH0A 4UWCA 1PXOA 4CFXA 5ANEA 2BIYA 4RX9A 3VQHA 2WTDA 2OZOA 2X8DA 3PDTA 4RGJA 1TKIA 4F65A 5B2MA 3GU7A 3QUDA 3KGAA 4GYGA 1O9UA 2ITUA 4I6FA 5DR2A 3VS1A 5JGBA 3RK7A 2YDJA 3BI6A 3HMOA 3HZTA 4D2RA 3SXSA 4HYHA 2C3IB 2B52A 3R04A 3VBTA 3H9RA 4K0YA 5JSMA 3QCXA 4C4GA 2ZOQA 1H28A 4EK8A 4CFUA 4EC9A 1OKWA 4F4PA 3O96A 4XP3A 3QYWA 3RNYA 1UNGA 4QP1A 5HLNA 1OBGA 3QTXA 3IG7A 2QLQA 4EOQA 3MV5A 4QNAA 3BQRA 5AX9A 4CSVA 3GU6A 3FMKA 3MPMA 4FIJA 4I5PA 3M11A 4FL3A 3CD8A 3KXGA 3ZXZA 5JFVA 5M44A 3HRBA 2QHMA 3BYSA 4F6SA 3AOXA 5CVHA 5JN2A 4FL2A 4KB8A 4MBJA 1X8BA 4XLVA 4XS2A 4JBQA 4LL5A 4XOZA 5CWZA 3S3IA 4ANLA 4G9RA 5I5ZA 2QU6A 2A4LA 3NCZA 3QTQA 3OW4A 3KEXA 1KUTA 3G6HA 3G2FA 5HVYA 4C2VA 4O7OA 4JVGA 4YJOA 4CNHA 4NZWB 4ZK5A 3TNPC 4IVDA 3NUAA 3GUBA 4NTTA 4R6VA 2Q83A 4EH5A 4DH1A 4O7SA 4WIHA 3RGFA 5A4EA 4HPUE 1P14A 3LXNA 1JQHA 4HZRA 3BLQA 4TYJA 4BIBA 3O51A 3BBWA 4EBWA 2DS1A 4BB4A 5A6OA 3R8PA 1YWVA 2NP8A 1RDQE 3KK8A 1R0PA 4C34A 4PQNA 4AT3A 1YHWA 1B39A 3KC3A 4BCFA 1ZZLA 3H4JA 2PPQA 3QUPA 3L8PA 3R8MA 4ZJVA 4DCEA 2G2HA 3QHRA 4DYMA 2UZOA 4ASDA 4I6HA 2R5TA 3SRVA 4QTDA 2UZDA 2DWBA 2XIRA 3IPHA 1E9HA 3OWKA 2F49A 4H58A 4HYIA 4RVTA 4RT7A 4CTCA 3DGKA 3FV8A 5J9LA 3PXRA 3PE2A 3FLZA 3MA3A 3ZOSA 2PMLX 2JDRA 2CKPA 4CT1A 2C6EA 3DK7A 3NIZA 4I6QA 3R9NA 3BLAA 4FKRA 4AE6A 3POOA 4XJ0A 4DEBA 3LFNA 3EYGA 4TNDA 4BGQA 2BDJA 5IA5A 1YXUA 4DF3A 3IW5A 4PNKA 5A4QA 4D5KA 1Q8ZA 2WTKC 4FIFA 2GNGA 2EXMA 4JOAA 1QMZA 2CN8A 3KMWA 4A07A 3JR1A 4R78A 3UMWA 3OHTA 3QHWA 1P4OA 2OG8A 3DBDA 5ETAA 4LOQA 4FIEA 2FSLX 5FBOA 3VBXA 4FV3A 4YHTA 3KULB 1NVRA 3F6XA 1BUHA 1OL5A 3OXTA 4NL0A 4ZTNA 1U5RA 3FPMA 3ORTA 3QD4A 4WG4A 3FYJX 5M06A 4CCBA 1OIUA 2VN9A 2EU9A 3KQ7A 4U79A 4EHZA 4RPVA 3QTZA 4O83A 1P2AA 2XMYA 4UV0A 2G01A 5CEIA 3HYHA 2P55A 5CEMA 4XP0A 2P4IA 4WNMA 4O2PA 5EHLA 2JDVA 5ETFA 3OOGA 3FKLA 4WD5A 1FVRA 2PMOX 2VNWA 1ZLTA 2XB7A 4G31A 3R8UA 4FA2A 2VWYA 5B2KA 1YWRA 2W5AA 4H1MA 1YWNA 4BKJA 4HCUA 4DDIA 2HZ0A 5HLPA 4PV0A 3WF8A 3CBLA 3PYYA 2ZFYA 4DEHA 5BMMA 2JD5A 4AA5A 3W0QA 4BZOA 5IDPA 2W06A 5LWNA 1UA2A 3PZEA 4A9SA 3AC5A 3VW8A 1OL2A 4MXOA 5AV3A 1QPCA 3FMHA 2OJJA 4AOIA 3OOMA 1FQ1B 1EH4A 2XAOA 3H3CA 3OROA 3ORNA 4MVFA 4WUAA 4YO6A 3PZHA 4EH2A 4TYIA 3KXHA 3EKNA 1KWPA 3H10A 4ZTRA 3U8WA 3WZJA 3PWYA 3GB2A 2PVHA 4OBQA 3COHA 2FSTX 2VTLA 3LKMA 3GC9A 1AGWA 4MKCA 4RBLA 3P86A 2W5HA 2ZB1A 4Z16A 4X3FB 3NR9A 1OGYA 4JX3A 1CKIA 1MRVA 2YAKA 4U45A 5DEWA 5FTQA 2VRXA 3V8SA 1G8JA 5K5NA 4HVSA 4FL1A 2XM9A 4Z7GA 4U94A 1CKPA 4B7TA 2OFVA 3NUYA 4YZ9A 3I0QA 1OB3A 1XKKA 2KTYA 2VO3A 5I9UA 1UKHA 3DZQA 4GVAA 5ANOA 4L45A 5AP1A 2UZBA 3TZMA 3ORMA 2RFEA 3QRIA 3UDSA 1WFCA 2QNJA 1UKIA 4GK4A 2XK8A 3SOCA 5E8ZA 3AD5A 4L7SA 1H01A 2R3FA 3A61A 4RIXB 4UWYA 5E8SA 1APME 3UYSA 3TJCA 4G6LA 1ZRZA 4GH2A 4X2NA 4ZMEA 4EHVA 4JR3A 3NEWA 4EK6A 4DGGA 1O6YA 4FSMA 4IFCA 4NW5A 4L67A 3VS2A 3TKUA 4I6BA 3QYZA 4PL5A 4PNIA 5HHWA 3MS9A 2V55A 4DEDA 1Q41A 4YZMA 3IKAA 2FSOX 5C26A 1PMEA 3MN3A 3EQFA 3PIXA 4FV5A 2CGXA 3ROCA 1UNHA 3F69A 5FP6A 3JUHA 3ITZA 4QYHA 3F66A 3U54A 1OL1A 4O7LA 5BYZA 1Z5MA 2JFMA 4FK6A 3TUBA 2IZUA 3R71A 1UNLA 4RJ6A 5C9CA 2JDOA 5HEZA 3ROYA 3P08A 4V0GB 4XG7A 4O82A 5E8YA 4EOJA 3Q4UA 1Q4LA 3UP2A 4EH6A 1J1BA 5IEYA 3ZFYA 1G8SA 1R78A 3TZ7A 5HO7A 4DCAA 3QA8A 4FNYA 1O6LA 3ZLYA 3SG8A 4D9TA 3G90X 5M09A 4IM0A 5CI6A 2XM8A 3DV3A 3VULA 3TTIA 3SQQA 3ML1A 4MAOA 5D9HA 4FZ7A 3P5JC 2I0VA 4IJ9A 2AYPA 2XRWA 3PP1A 5HX8A 4FUYA 3R1QA 1WBTA 5A4CA 5KX8A 4MWHA 3LCTA 1Y57A 5IQIA 3SX9A 3IOKA 4TWNA 5CNOA 2UVYA 4IVBA 5EM8A 4IB0A 5LCJA 2JKOA 2GFSA 5E90A 2E2BA 4W4VA 1T45A 5HIDA 1V1KA 2BRHA 4RWKA 3SHEA 3WZEA 5C27A 3AD4A 4B6LA 4F78A 3CP9A 5HIBA 4BCMA 3D5UA 1OMWA 2O65A 1W83A 4BICA 1MQBA 2JBPA 1XH4A 2XNOA 4FBXA 4U8ZA 3MESA 3Q96A 2O64A 3FQEA 3W2QA 5I9XA 4R7HA 1F5QA 4EOOA 4EOPA 3NDMA 4U3ZA 5HBEA 3ZO1A 1SMHA 3OWPA 3PRIA 1GZKA 4AGCA 3EN6A 1WBPA 1V0PA 4MF1A 4C0TA 3QX2A 5E4HA 5IZFA 4IZAA 5IQEA 3A7FA 3QC9A 4NW6A 3QKKA 3LCDA 2OJFE 5DRBA 3WYXA 3NUSA 4LOOA 3SW7A 4MD7E 2BZJA 4FOBA 5FTOA 5AFVA 5CF4A 4TL0A 1H4LA 3AQVA 1XR1A 4YHFA 2YCFA 1Q24A 1KE5A 5LVNA 3MPTA 1FMOE 1MRUA 4TYHB 4AACA 3UC3A 3ZLXA 4GUEA 4E6AA 2BALA 2GFCA 3FZOA 3KN6A 3I5NA 3EIDA 4N70A 1ST4A 3CTJA 3W0OA 5HU9A 3LPBA 2WXVA 3P78A 3MY5A 4IWQA 4ZLZA 4Y85A 4DFNA 3S0OA 4ENYA 2C6DA 3R22A 5J1VA 3LFAA 3FXZA 1XMMA 2BDFA 3GCUA 2JGZA 4FGRA 2PE2A 4XX9A 3ZS5A 5IDNA 4LDTA 3PP0A 3B2TA 4BDGA 4JRVA 3VVHA 4DGNA 4OTQA 2G2FA 3G0EA 4I4EA 2DYLA 3C0IA 3ZFXA 4C62A 4CFMA 3AC1A 4IAZA 4I20A 4ALVA 4CKIA 3K2LA 4OTRA 3E3BX 4I93A 1AQ1A 5L3AA 1WBNA 4I5HA 4RLLA 5L2WA 4BCKA 4UALA 3BU5A 3L9LA 1SVEA 3A2CA 4F9AA 1WAKA 3D2IA 3UZTA 5HTBA 5JEBA 3Q9ZA 3OWJA 3UPXA 3NW7A 1M2RA 2IVVA 1QPEA 2RG6A 3CEKA 5E8XA 3FLSA 3RVGA 2PE1A 1PYEA 4LV8A 4YHJA 4O7NA 4EORA 3ZSGA 4M8TA 1SNXA 3GCPA 3OT8A 4FSUA 5FP5A 2Y6MA 4NT4A 2BZHB 4O7RA 2E9NA 4EOMA 2VTNA 5KCVA 1Q5KA 4O2ZA 1BI7A 4DG3E 3E5AA 4YZNA 2HAKA 5KMKA 3RAIA 3VS7A 1FMKA 4Z9LA 4BDEA 3MFUA 1PJKA 5AUTA 2QKWB 2UW4A 4FNWA 4RLKA 4EWHA 5IQCA 4L43A 3ZRKA 3C1XA 4YJPA 2QCSA 2Y9QA 4ACMA 1JSUA 1STCE 1UWJA 4QNYA 3W2RA 4AU8A 4RQKA 2JC6A 5KMNA 3BHVA 4K1BA 3B8RA 2WB8A 3TTJA 1H27A 3DTCA 3LCKA 4MUQA 4CMOA 1M14A 2GDOA 4ZOGA 4WNPA 4DGMA 4UXLA 4CCUA 3COKA 3BGPA 3PY3A 4JBVA 4FVQA 4CFWA 4AZSA 3BHHA 3BEGA 4DFUA 1OPLA 4UB7A 4H1JA 4QDVA 4NM5A 3PSCA 4CRLA 5HORA 5JK3A 4EH4A 4II5A 4XNEA 1Q99A 2YM8A 4CG9A 5JMSA 5AUWA 2G2IA 2HZNA 4H39A 3U9NA 3GC0A 3QTSA 5CU4A 2XYUA 4F08A 5IH6A 4EI4A 2I1MA 3NX8A 3KREA 2QOOA 3FZSA 3BL7A 3B8QA 5EK7A 4RZVA 2PVKA 3KRXA 4MYGA 4A06A 3MH3A 5C8NA 1KE6A 1HCKA 1U4DA 2UZTA 3RJCA 4MX9A 4D58A 4P5QA 2YIRA 2QODA 2J0MB 3OG7A 4G5JA 2ZAZA 3Q2MA 5KE0A 5BUJA 5M4IA 4WZYA 3KXXA 4R3PA 4Y46A 3NYVA 5ETCA 4JDJA 4QTAA 3SXFA 4AQCA 4EH3A 1NA7A 2ZVAA 2E9UA 2NO3A 5BNJA 3FMDA 4FZ6A 1FPUA 4ASEA 2C3JA 2ESMA 2WTJA 3MIAA 3IECA 5CX9A 2GHGA 3ZO4A 3VIDA 4G16A 1J3HA 3AT4A 4XG8A 2UVZA 5FXQA 4F9YA 3F3WA 4BHNA 2BTSA 4F7SA 4FV2A 4DGOA 3DK3A 2HELA 4QO9A 1Q61A 2OBJA 3QLFA 4L3LA 4QYFA 4XUFA 3VBVA 3UQCA 4FTQA 4MQ2A 2QO2A 3DZOA 2YISA 3KXZA 3IDBA 4XLIA 3TDWA 4A4OA 5HCYA 1WVWA 3W2CA 5ANDA 5KMIA 1ZY5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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