3W0PA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (d198a), ternary complex with adp and hygromycin b
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHAAFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 84
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0pA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0pA02
3MESA 5FUTA 4DTBA 4GKIA 2I7QA 2B0QA 2PU8A 2PYWA 3CSVA 4WZYA 4DFBA 2PUNA 3W0PA 3ATSA 4FEUA 5IQDA 4H05A 4DFUA 4R7BA 4BR3A 3ATTA 4U94A 3C5IA 3HAMA 4O7OA 5BYLA 4DTAA 4DE4A 3LQ3A 5IQIA 3N4UA 4R77A 5IQHA 3TDVA 4DBXA 2QG7A 3TDWA 3UZRA 4ORKA 3W0RA 5FTGA 4CG9A 1J7UA 4CGAA 5C4LA 3JR1A 1NW1A 2BKKA 2IG7A 5EQPA 5IQEA 4DA5A 5EQYA 3FI8A 5IQBA 4R78A 4U98A 3FEGA 4O7PA 3ZM9A 3Q2JA 4PDYA 4FEVA 2CKOA 2OLCA 3DXPA 4DT8A 3N4VA 5IQCA 3W0NA 4N57A 2PUIA 4DCAA 1ND4A 3TM0A 1J7IA 5IQGA 3W0SA 2PULA 2CKPA 4DT9A 4GKHA 5AFVA 2CKQA 4FEWA 3SGCA 2Q83A 3SG9A 3W0MA 1L8TA 4CG8A 3F2RA 5EQEA 5IQAA 3G15A 2PUPA 2PPQA 3SG8A 3TYKA 3HAVA 3DXQA 5C4KA 5IQFA 1J7LA 4FEXA 3N4TA 3W0QA 3W0OA 4EJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GQGA 3GT8A 3QTQA 3ZSIA 1CKJA 3KRWA 3GFWA 2JLDA 1KSWA 4YC6A 4WZYA 2QONA 3AC2A 2C5XA 3TACA 3W0PA 3ALNA 2OZAB 4FTMA 4BY9E 4PDPA 4WNPA 4DEEA 4IANA 4E20A 3WILA 4XP2A 5HIBA 5I9YA 3ANQA 5JRSA 3G9NA 4G3CA 1PRYA 3L8SA 4AZTA 2JIVA 2UW9A 3QZFA 4C61A 1YHSA 3DBEA 4F6UA 3EN7A 2ZB0A 5LMBA 5AUWA 4CFUA 4M0ZA 5DGZA 3FQHA 2P33A 2WTIA 3HMOA 3MY5A 2O8YA 5FEQA 3ZFYA 4DBXA 5L3AA 3O23A 4U3ZA 4D28A 3PXZA 3VUIA 5ACKA 3QTSA 5TR6A 3DKCA 4UX9A 3R9HA 5JEBA 3E5AA 4JOAA 2R3MA 4PWNA 5FTGA 4PL3A 3KXGA 3LZBA 4AAYA 3IPHA 5IPJA 1U5QA 5J7HA 5FM2A 4Y5HA 3MH0A 3JVRA 4QNAA 5BVOA 2X8EA 2YIWA 4ACDA 2R2PA 3U6JA 1XBAA 4KSQA 1V0PA 3L8PA 3MTFA 3E7OA 4ACMA 4K2RA 4CLIA 2NNWB 4Y83A 4CEGA 4CZUA 4EOQA 3OUNB 2VO0A 1G8AA 4M7IA 3EYGA 3F3WA 3VS5A 4S34A 3KY2A 4XG4A 5HG8A 2GS6A 1GY3A 4DT8A 2QU5A 3P86A 4JQ7A 4NT4A 4PNKA 5D12A 4WNOA 2CNUA 4N4SA 4BJJA 3AD4A 3U87A 4JDKA 4RJ7A 5CF6A 4HYSA 3MJ2A 3S4QA 2YWPA 2G9XA 1Q3DA 5ANEA 4BGQA 4RIYA 4AZWA 2G15A 1KE8A 1VYWA 2BPMA 2WQNA 4WUAA 4CCBA 3VBWA 4C3FA 4CTCA 5HNIX 3BU3A 5KKRC 1OB3A 4DGLC 3MVLA 2ITQA 2FO0A 2P2HA 1OL5A 2Z2WA 3ELJA 3HMIA 3OCSA 4U5JA 4GKHA 4UWYA 4OTRA 1YOJA 5C9CA 4DLIA 3VUHA 5JKGA 1Q3WA 1WBNA 1GJOA 1VJYA 2OJIA 2YERA 3FMKA 3V8SA 4F0GA 1IEPA 3PDTA 1GAGA 1YHWA 5DFPA 1JKTA 1LPUA 3FKOA 5EDRA 4ZTNA 3ODYX 5HCZA 5A6NA 4UYNA 5LVLA 2PWLA 3EQRA 3MYGA 4NM5A 3QUEA 2X8DA 3SXFA 4CMTA 4K8AA 3U6HA 3KF7A 3DXQA 4RGJA 1JKSA 5L6OA 2ERKA 3BL7A 5IMXA 5EDQA 1W7HA 4A9RA 3LFSA 2PK9A 4IWQA 5A4CA 3W0OA 2X2LA 2YM5A 1PXMA 4AQKA 1J1BA 4BTFA 3PJ8A 3O96A 2QURA 5EYMA 1GZKA 3ZFXA 2OICA 4C4JA 3NX8A 3F7WA 4ENYA 3NFGB 4ZTLA 2BDJA 4TNBA 4MNFA 3ZMMA 4IQ6A 3TN8A 4F7JA 5CQWA 1UNGA 3OUKA 1NVSA 2O65A 4EUTA 4BDCA 3PE2A 4CFXA 3HLLA 3F69A 2ERZE 4PRJA 2W5BA 3QGYA 4ZLZA 3VS4A 3SRVA 4FL1A 1GZNA 2W05A 1BMKA 3OD6X 4L7SA 3DT1A 4QPAA 3LFAA 3ATTA 2RFNA 3DNEA 2QOFA 2JKOA 2WXVA 2CLXA 1M17A 2WELA 3VBQA 4GIHA 4ZY6A 4NZWB 5DBXA 4FUYA 5HI2A 2EB2A 3KN6A 3QLFA 2ITTA 3DLSA 4II5A 5M4FA 4MK0A 3SW7A 5T3QA 1H4LA 3OBGA 3CR0A 4OTHA 2A0CX 1BI7A 1YI3A 1XBCA 2BTRA 4GG5A 2PSQA 5H2UA 3HV4A 2BVAA 3UG2A 3RAWA 4J1RA 1J91A 4WIHA 3UMXA 2GHGA 4QQTA 2QO9A 1PMNA 3GC7A 3Q6UA 3HRBA 3K5VA 3L8XA 4YP8A 4HVHA 4QYHA 2NRYA 3GCUA 3IECA 2E9NA 2W1FA 3GEQA 5HBEA 5HO7A 3NFFB 2CGVA 3E88A 4PNIA 3QA0A 2WIPA 3CKWA 3GC8A 2P0CA 3BE2A 2PVJA 3FI8A 4A9SA 4QMMA 5EK7A 3F5XA 5CLPA 2I40A 4O38A 4M84A 3TNQB 3CTHA 2B53A 3VC4A 4LOQA 3QRTA 4FKSA 3S3IA 4ASXA 4G9CA 3BEGA 3C0HA 4FNWA 3IKAA 4RJ3A 5IEYA 3P7CA 4RG0A 1YHVA 4O0YA 4FTCA 4HOKA 3R7OA 3P0MA 3SAYA 1IASA 4ASZA 5I4NA 3OZ6A 4XX9A 5JGDA 5CXZA 3HP5A 3UC3A 3DK3A 2DYLA 1ZOHA 2GNJA 3MBLA 5CEQA 5TF9A 1YI4A 3DXNA 4UZDA 4FTLA 4W8EA 4YJSA 5I9UA 2IVUA 3V5WA 5HZNA 5EM8A 5J9LA 4ARKA 4LYNA 2ONLA 3GGFA 3VWAA 3V01A 2GNIA 4CV8A 3RINA 4WG4A 4OTWA 5CAQA 4FVRA 3IOKA 3CIKA 4FEWA 2VUWA 4I5MA 3A4OX 5AUZA 3FLNC 1ZY4A 2C0IA 2YM6A 4EKLA 1U54A 3F5PA 3LMIA 3P08A 1YWRA 4IX3A 2R3LA 4FTIA 3BX5A 4DBNA 2PUPA 4PMTA 3QKKA 3PJCA 4E4MA 5AV4A 2IN6A 3HV3A 2YDKA 4TWOA 5CU3A 3OEFX 4LL0A 1Q97A 4DFNA 2C6MA 4AZSA 5EI2A 2WMAA 4HCVA 3EKNA 4EYMA 3OF0A 3JS2A 5E1SA 2CGWA 2W96B 3VS1A 1H1QA 4ITHA 4NKSA 5M51A 3FMEA 4AW5A 3AMBA 3PWDA 5JFXA 2ESMA 4BDIA 3OFMA 4ZEGA 1K9AA 3RTPA 3NUXA 5AP4A 5J9YA 2UVZA 4CSVA 1W83A 3ZUTA 2YCQA 3DKGA 3OCGA 3ZXTA 4CD0A 3LMGA 2HY0A 4EHEA 4JR3A 5AWMA 3FPQA 4PTCA 5CS6A 2F4JA 4IDTA 5HICA 3C50A 3COHA 2ITVA 1GOLA 3C4XA 4UN0C 4FEUA 2X6EA 4F99A 1XH5A 4IJPA 4WBOA 4L52A 2XA4A 5CZIA 2IVSA 5KZIA 4YO6A 3COKA 4XG9A 5HD4A 3NYXA 3PG3A 5H3QA 1KV1A 4NTTA 1RDQE 2Z7QA 1G8JA 3HAMA 1W84A 3WI6A 2VTPA 4FT7A 1UNHA 4FT0A 3BHHA 1YXTA 3FL4A 2CHLA 4K11A 3E64A 4J95A 4AGUA 4BDGA 3HMMA 1FVVA 2ITXA 1YVJA 3VF8A 4FSZA 4C37A 1FVTA 3KL8A 3G5DA 4FV7A 3UZPA 1H01A 2REIA 3R8UA 4O7ZA 4CT2A 4KSPA 4LL5A 4NM3A 2OO8X 3R9DA 5C27A 4QQJA 1ZYSA 2ZV2A 2RGPA 3ZLWA 4C2VA 2CMWA 3WZKA 4F9WA 1G3NA 2BR1A 3DJ7A 4GU9A 3VS0A 3NYNA 2XRUA 4EH3A 4EWHA 2YDIA 4M67A 3LLTA 4E93A 3W10A 4O0SA 4GFOA 2YIQA 5FTOA 2OH0E 3LQ5A 3SXRA 3VQUA 3FI4A 3UP2A 2YDJA 4MWIA 3POOA 2X7OA 3FC2A 3GB2A 3HMNA 2UZVA 5HCYA 4CKRA 1YKRA 4PDYA 4PMMA 5FXQA 1CSNA 4NUSA 2BUJA 3QD0A 4IACA 5E91A 2WMXA 2G1TA 3DXPA 3UNZA 4OLIA 3QL8A 5AIKA 5CWZA 3V51A 2A2AA 2WTWA 2XIZA 5DNRA 4G5PA 5JGAA 3E3PA 3V5PA 3ZRMA 3TNIA 5L6WL 4E6AA 2R3IA 2PE0A 1PXPA 3ORTA 4UWCA 3FMDA 5IA2A 2Y0AA 3PIXA 3DQXA 2X7FA 4HVSA 5ANGA 4BCHA 4ERWA 2UW4A 1REJA 4U3YA 4IX4A 3VONA 2R7BA 1O6LA 3AQVA 2IVVA 3LCSA 2ZFYA 4O7TA 5AX9A 2HZIA 3K2LA 3BYMA 4WT6A 5CYIA 2DUVA 4F1TA 2R0UA 2YM7A 4C34A 2C6EA 3R7UA 1OGUA 4FV0A 2XKCA 5HBHA 4BBEA 2XCHA 3EYHA 3UGCA 3RK9A 2JDSA 4DHJA 5LWMA 2GTNA 3HX4A 2Y4IB 3NUSA 3HNGA 4HNFA 4YHTA 2CLQA 2EVAA 1OIRA 2Q83A 4D0XA 3PY0A 4YZ9A 4F6WA 5FDPA 1BYGA 3BPRA 3UO6A 3BQRA 3V6SA 1S9IA 4GJ3A 1OBGA 4NFMA 3GUBA 1PXLA 3SX9A 5LMAA 2BAQA 3KEXA 4MD7E 1NY3A 1OZ1A 3HAVA 4F7NA 3GU4A 4A06A 4C0TA 3DLZA 1UU3A 4O22A 3TIYA 1JSVA 2X39A 3FLZA 5HTCA 2R3KA 4IVDA 4YR8A 1PW2A 1PXIA 4QP7A 4EK4A 3ZLXA 4QDEA 3FL5A 3KRJA 3OOGA 5I9ZA 2GHLA 3VQHA 1M2RA 2HXLA 2XJ0A 5E90A 2YCRA 4EEVA 3DAJA 2PVKA 3NLBA 4GKIA 3PWYA 5LVPA 2SRCA 3HDNA 2QR7A 3LM0A 2PU8A 3G6GA 3MWUA 3DOGA 3ZFMA 3V5JA 4JRNA 2QHNA 3E8DA 4JQ8A 3NYVA 4DFXE 3OEZA 5K9IA 3MFRA 1VYZA 5CAUA 4LV7A 2IJMA 4I5HA 2C6TA 3PXFA 4G6LA 4YJRA 3CD3A 4FR4A 5DT0A 4ZJJA 3Q9ZA 5EYCA 5L2SA 3C5IA 2B9HA 3KVWA 4FV2A 4BIEA 1Z5MA 3LXNA 4YZNA 4IAKA 4KUJA 4AG8A 5CT7A 4LGHA 4UEUA 5JK3A 4G5JA 3RHKA 3HVCA 5BUJA 2R5TA 5IQIA 3UOKA 1ZXEA 3S00A 4A07A 3BCEA 4OT5A 5HE0A 4HCTA 3U4UA 2E9PA 1H27A 3LXKA 3BI6A 2OK1A 3Q32A 1YXSA 4NSTA 5CTPA 5T68A 3W0RA 3UPZA 4ZTSA 4U9AA 4HVGA 3I5ZA 3ZU7A 4BBFA 5IDPA 3WBLA 5A4LA 1R78A 3QZIA 4HVDA 5A9UA 2XEZA 3NRMA 3LQ8A 2OSCA 4FKGA 5C26A 4CT1A 1OUYA 1WBOA 4QMZA 5HE3A 1Q8YA 3MTLA 2I0YA 1R0PA 4AXDA 3QWKA 2A4LA 3FYJX 4JS8A 4USEA 3RMFA 3GU6A 2WMRA 4L8MA 4QMPA 4ACCA 5GIPE 4AW2A 4ZTQA 4X6QC 3HZTA 5C01A 4AN3A 2VX0A 5AP6A 3E7VA 3WIKA 3RZBA 5IQCA 4EOPA 2B52A 4L53A 4DH1A 5B7VA 4OTDA 4BJJB 5I9XA 2PUIA 3WF6A 1CKIA 4ZOGA 2Y6MA 2XARA 3DB6A 3LMHA 3M11A 4DG0E 4P7EA 5LOHA 3QA8A 4DITA 5KBQA 4OUCA 4RIYB 4C4EA 3UDZA 3AXWA 4C3PA 1M52A 2C0OA 4MEDA 4PP7A 4BHZA 1SYKA 2ZAZA 3AOXA 5FEDA 4AXCA 1P4FA 4AP7A 3VBYA 1GZOA 3UPXA 4UZHA 5IQGA 3CQUA 1SVHA 4XG3A 3R8MA 3RNYA 3SOAA 4DH5A 2V0DA 3IW7A 1A9UA 2I6LA 2BROA 4O0RA 5B2MA 4EH8A 3ENMA 3O8TA 3OT8A 3HEGA 5AEPA 2PL0A 3D5VA 5E8VA 3GNIB 4KBCA 2RFSA 5IA0A 3Q4UA 5GINE 3SW4A 5F1ZA 4PUZA 5HLPA 5AAEA 4O7YA 3TYKA 3IGGA 4PDOA 2WMTA 4F09A 4AW0A 1FOTA 5JGBA 1OIYA 2R3JA 4O86A 3W0QA 2X8IA 4WHZA 2XBAA 3NPCA 4J97A 4YTCA 3ULZA 4HZRA 3TKIA 5LVOA 4PX6A 1RE8A 4G34A 5CSHA 2RL5A 2GS2A 4RQVA 3ZRKA 3PJ3A 1ZYJA 3N9XA 3ZCLA 4EK8A 2I7QA 3H30A 3ZO3A 4FKWA 3T9TA 1IAJA 2PYWA 5M57A 3GQIA 3LIJA 3MV5A 2C5VA 3PVBA 4QP4A 2EWAA 4I0RA 5DEYA 5KHWA 2RG5A 4IWPA 4MVFA 4TYEA 2W17A 4WBBB 1WFCA 3RPYA 2PVMA 1ZWSA 4FTJA 4H05A 5IDNA 3FY0A 1OIQA 5AV1A 3SRVB 1V0OA 2XYUA 3QZGA 4JX7A 3FSFA 3NNVA 4FTTA 5DRBA 1KWPA 5K5NA 2G2FA 4IB3A 3PPZA 2JD5A 3TI1A 5JH6A 3JUHA 4QTDA 2J5FA 3DZQA 4EONA 3N51A 4GYGA 1BLXA 5I9WA 4R1YA 3W2QA 1F5QA 2QOBA 3L9MA 3A8XA 4AOTA 5DR9A 4J8NA 5IA1A 5F4NA 1CKPA 3CCNA 4U81A 3HV5A 4OBQA 3JVSA 3HRFA 2WTCA 2PVRA 2X0GA 4QP2A 3UZRA 1RW8A 4HW7A 1AD5A 1YW2A 3CQWA 2VTHA 3AD6A 3PVGA 3GP0A 3DTCA 3ORLA 4FKIA 4EKKA 3KULA 5CI7A 4F7SA 3KXHA 3OW4A 5C4LA 3DAEA 2JAVA 2YM4A 2F49A 2HW6A 2C6KA 2OI4X 5F95A 4BICA 4FVPA 3FI2A 2OJFE 3BL9A 1PJKA 2WKMA 4FNZA 3UOHA 3EN9A 1OL6A 3WOWA 1PXKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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