3W0QA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (n203a), ternary complex with amp-pnp and hygromycin b
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
ATSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNAVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0qA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0qA02
2PUPA 4GKIA 3C5IA 2BKKA 2IG7A 4O7PA 3N4VA 3FEGA 4CGAA 3MESA 4EJ7A 4N57A 4PDYA 4R7BA 5EQYA 3W0NA 5IQAA 5FUTA 4FEWA 4DTAA 5IQCA 3SG8A 2CKQA 4DT9A 5IQGA 3CSVA 3ATSA 5FTGA 2I7QA 3ZM9A 2B0QA 4DA5A 5C4LA 5IQEA 4DFBA 3FI8A 5IQDA 4H05A 2CKPA 3TDVA 1J7UA 4DTBA 4DT8A 3SGCA 3UZRA 2PUNA 1J7IA 5C4KA 3W0PA 3TYKA 4U94A 5IQBA 5EQEA 3W0OA 2PYWA 3W0SA 2PUIA 4DFUA 4WZYA 4GKHA 3HAMA 3Q2JA 1L8TA 4CG8A 3N4UA 3TM0A 2Q83A 3F2RA 2PULA 3N4TA 3W0MA 3DXQA 4DBXA 1ND4A 5IQFA 5AFVA 3W0QA 5IQIA 4BR3A 3DXPA 1NW1A 4DE4A 4ORKA 5BYLA 4CG9A 4FEUA 3LQ3A 4FEVA 4DCAA 5EQPA 4FEXA 2PU8A 3JR1A 3W0RA 3ATTA 4R77A 4O7OA 2OLCA 2CKOA 4U98A 3HAVA 3G15A 2PPQA 1J7LA 4R78A 3SG9A 5IQHA 3TDWA 2QG7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1O6LA 4MTAA 2W1EA 4G17A 4D4VA 3EFLA 5KMLA 4L6QA 2UW9A 3QRJA 3DY7A 3NNWA 4MXCA 4H1MA 3LFFA 3QZFA 5G6VA 3BHYA 3ZO2A 4DGGA 3B8QA 2QHNA 2ZFYA 4BDCA 4EBWA 2QOFA 4ZTSA 2XK9A 2QOBA 3IK3A 3P5KA 4UEUA 4FICA 3NPCA 2UZLA 3UC4A 5CU0A 4IDTA 4CXAA 4F1TA 1NVQA 4I41A 4YR8A 4PTGA 4NL0A 3QRUA 4BI2A 1NT2A 3KGAA 4MBJA 1W84A 1QL6A 2PVRA 3TWJA 4WT6A 3QQKA 1P14A 3KREA 1STCE 2RGPA 3QTWA 4PDOA 5AWMA 4C3FA 4DFBA 3FI8A 3HX4A 2JGZA 3BL7A 1PXKA 1XKKA 3OXIA 2PE0A 4MK0A 4PTEA 4USDA 5KMOA 2YCRA 2ZJWA 3NAYA 3H30A 4QTAA 4RWLA 4YPSA 3QD2B 5KE0A 1MRVA 1UU8A 3R1YA 2Z60A 3E7VA 1J7IA 5HG9A 2BDWA 2QO7A 3KRWA 3MJ2A 3KMMA 4ITHA 4O0UA 4O0YA 4W8EA 4A4OA 3P79A 3SDJA 5M44A 2PMIA 2OZAB 4O81A 4AACA 1SZMA 4HZSA 5EQEA 5B2KA 3L1SA 3AKJA 4JDHA 4X2KA 3R02A 4PMPA 5EHLA 4GVJA 4FKSA 3RCDA 1TQIA 2GCDA 5E8YA 1OMWA 4D28A 2R3RA 2P4IA 3AD5A 2X6EA 5H9BA 5EHYA 4I5MA 2C5XA 1PMVA 2HY0A 2VTAA 4OT5A 3II5A 2FO0A 2W96B 3FHRA 4U80A 3OW3A 5C1QB 5IMXA 4GCJA 2QLQA 2VWXA 4XV1A 4ZTHA 3IS5A 4W4XA 4GK4A 5K5NA 3AC4A 1VZOA 2ZB1A 4I22A 3SLSA 4M13A 3D5WA 3QTUA 2ITNA 4LOOA 5FBNC 4M7IA 4Y83A 3BBTB 3FPMA 5DG5A 4M68A 4L3LA 3NYVA 5KMKA 1O9UA 3TNHA 3DBCA 4BF2A 1RW8A 3GQLA 2NPQA 1FPUA 2HXLA 3ORZA 1PYXA 4I93A 3JYAA 2QR8A 4HCUA 2WTCA 4EK3A 3VIDA 3VO3A 3Q96A 4FEUA 4QMUA 3UMWA 4QP6A 2EVAA 4BI1A 5FEEA 4WSYA 1OPJA 3MN3A 3NIEA 4IWDA 2VTMA 2OJFE 3FJQE 3L9LA 4IZ7A 3NFGB 2XMYA 3RGFA 4AX8A 5CS6A 1OL5A 2XJ2A 5HCYA 5CAUA 1Q4LA 3PXFA 4YZDA 3W0RA 4ZXTA 2C47A 4O7OA 4CMOA 4TNBA 4L3JA 3PZEA 2YM8A 4HVDA 5FP6A 4FTRA 4ZP5A 2OZAA 3AD6A 5TF9A 4C0TA 4FKJA 5D7AA 3QKMA 3DLSA 4XX9A 4EZ3A 1K9AA 2OZOA 5L2WA 2ZM3A 2HOGA 3FLWA 3Q4ZA 3Q6WA 4I24A 4C36A 4YO4A 4F6UA 3VQHA 4AOIA 4DFNA 4U40A 5IUGA 4FC0A 3ZRMA 4E5BA 1SM2A 2QG7A 4BTMA 4CFXA 5CT0A 4Y5HA 4U42A 4MQ1A 3AGLA 3QALE 1O6YA 4N70A 3PA4A 4TN6A 4FK6A 3FXWA 3LMGA 4IWOA 3EYHA 3IW6A 3ZYAA 4TWPA 4BCJA 2OIDA 3K3JA 3KKVA 5EOBA 3WE8A 3QYWA 3PVUA 1WMKA 2A4LA 4MQ2A 2C6OA 3MV5A 2XIXA 2BAKA 4TKSA 3ORXA 1IEPA 3MH0A 4R7BA 1W8CA 2WFYA 3QYZA 4IAIA 4UWBA 3IOPA 4O83A 3TZ8A 3UOKA 3WE4A 5IDPA 1G8AA 5JMSA 4XG4A 1RDQE 3T9TA 4E20A 3PUFC 3LLAA 3MY1A 3FE3A 1ZMVA 3QWJA 3G6HA 4HOKA 4P90A 4DA5A 4EOQA 4C33A 5C4LA 1WBPA 1JSTA 2YM7A 3C0HA 3RK9A 4F4PA 5LMAA 4RX8A 1BI7A 4ZSGA 1B6CB 4BZNA 4EH3A 1Q61A 5KMNA 2XNNA 2I1MA 2UV2A 3V8SA 4RX5A 4KBAA 3PTGA 1PXLA 1UU7A 3L9PA 3Q4TA 4TT7A 5JQ5A 5D41A 2XNPA 4JBQA 2BIYA 2XNMA 2YA9A 3R2YA 4FE2A 3NDMA 5ETIA 1KWPA 2C3KA 4F9YA 4IVDA 5F1ZA 1TKIA 1DI9A 3AOXA 5HEZA 4ZK5A 3GGFA 2PZ5A 4F99A 5EKNA 2VGOA 5HE3A 2PUIA 3ETAA 3OG7A 4DFUA 3I5ZA 2R3NA 1XH4A 3QRKA 5HX6A 1UNHA 1PKGA 2R64A 2Q83A 2O65A 4RJ6A 3ROYA 3UNZA 4WD5A 3S1HA 4EOIA 4I6LA 4DH5A 3BLHA 4ANMA 3DXNA 5CI6A 3VF8A 2XJ1A 2AUHA 4WKQA 4O27B 1YWRA 2XK3A 3DNEA 4FKUA 4O96A 4F9AA 5EI2A 1S9JA 5C9CA 3M42A 4F7JA 2R3MA 3FMLA 3R7IA 4EOOA 2BFYA 4I1ZA 3TZ9A 1M2QA 2XK7A 3MBLA 3TZMA 2XEZA 2UZDA 3BI6A 3LAUA 4BGGA 1O6KA 1FGIA 5TT7A 4C2WA 2IO6A 2ITUA 3NS9A 3UNJA 4FX3A 4RJ8A 3VULA 4E93A 4AA5A 3BU6A 4QTDA 5DFPA 3TKUA 4DTKA 4JI9A 4NZWB 4DHZA 5EQPA 2XARA 4UYNA 3FQSA 4AGCA 5J7HA 4QTBA 3A4PA 3BLRA 2OXDA 1R39A 1UNGA 3FYJX 4BYJA 4IX3A 4Z16A 5ACBC 4ALWA 2ZYBA 3KF7A 4KAOA 1SYKA 3SXFA 4BBMA 4QYEA 2LAVA 2IVUA 2J5EA 3OHTA 5IH5A 4XG7A 3GCPA 4QQCA 4FIJA 4F65A 3V6RA 2JDSA 4J71A 1M7QA 3K5VA 4RC3A 3V5PA 2EXCX 4TPTA 3O5AA 3BYUA 4MBIA 1IAHA 4CFUA 2R3OA 3QX4A 4IH8A 4JXFA 3ZO1A 2XKEA 3ENMA 2BILB 1Q8UA 2CNVA 2YAKA 5T3QA 3RAIA 3GCQA 3FC1X 3RALA 4D9TA 4GKIA 4F9WA 4FTNA 2XBJA 2WTVA 2C0IA 3IGGA 1LEZA 2WXVA 3UO5A 5F9EA 3H0ZA 3C4XA 3ORNA 4X6RA 4U8ZA 3FMEA 4P4CA 2OKRA 4FEQA 2ONLC 3LFAA 5C8KA 5KCVA 3MVMA 2W9FB 3LFSA 2OXYA 1BL6A 2CPKE 4OBQA 4YZ9A 4RIYA 3OWJA 2XNOA 4FBXA 3UTOA 2VNYA 3NNXA 4FSNA 5A54A 5AV2A 3TV7A 2B0QA 2HAKA 4RVKA 2CCHA 2RL5A 3Q04A 4ZJIA 3ZLWA 4D0XA 2I0EA 2NYAA 2PVYA 3F69A 4HNIA 5E1EA 4S2ZA 3V5QA 5IQDA 4YLLA 5ANEA 4QP4A 5EI6A 3I0QA 3CS9A 1IRKA 4CTCA 2C1AA 3VC4A 3U4UA 3HV6A 4K9YA 5E7RA 1J7UA 5AUTA 2EB2A 4NTSA 4DHFA 4K18A 3R28A 4O0VA 5DT0A 4XJ0A 4QPAA 4MCVA 4BJJB 4FG9A 1KOBA 2W5HA 2FSLX 3IO7A 4MKCA 5IQBA 4EYMA 4EK8A 4G3CA 4ACGA 4QMOA 5HG5A 3H9FA 2Z7QA 3PXRA 4I20A 3PJ2A 5E92A 3F6XA 4R3RA 4XV9A 3V5JA 3UQFA 2F49A 4RVTA 3U9CA 4WRGA 2BR1A 3DTWA 4XP3A 3W0SA 2XA4A 3HMIA 3P0MA 3SX9A 5K5XA 3ZDIA 3Q2JA 5DA3A 2ETKA 4HVSA 4U41A 3AXWA 3ORPA 4EORA 4FT9A 4MXXA 3QRIA 3R63A 3FMNA 5AAGA 5AM6A 3UMXA 5IEXA 3U9NA 4QMSA 5LWNA 4IHPA 3ZMMA 4L7SA 3FBVA 1H27A 2SRCA 3ACKA 3NUPA 1CMKE 4HCVA 5GHVA 5H3QA 3UJGA 3EQIA 3KXHA 4D9UA 3C4CA 2RFDA 2KTYA 5IQIA 4EH2A 4U7ZA 3MH1A 2VWVA 2CMWA 4X21A 4QNAA 3TNPC 2IW6A 1Z9XA 3U6IA 3CD3A 5BVOA 2ITWA 2X9FA 4RIXB 3HV7A 4DEAA 2QKRA 4FK3A 4I3ZA 2P2IA 1XMMA 5CYIA 1V0BA 3SOAA 2YCFA 2YZLA 2WO6A 5LCKA 4L52A 3V5LA 4B0GA 4JMQA 4DCAA 3W1FA 3FLYA 3GCSA 3OEZA 4IX6A 5HIDA 3EKNA 3RZBA 4EWHA 2YJRA 4Z55A 2YZAA 3EQFA 5EW3A 3RHKA 1OL1A 4WRSA 3ZO3A 4A4XA 2X9EA 4NK9A 3I79A 1CKIA 4JQ8A 2O2UA 1WVYA 4PWNA 4IACA 4BJJA 4NSTA 5L6OA 4CV9A 2J6MA 4RC4A 4KRCA 3SXSA 4I6FA 2PY3A 2F7ZE 1GZKA 3ZXZA 2CGVA 2PPQA 4G34A 5D7VA 3OTVA 5CAPA 3LZBA 5KKRB 3B2TA 4E6AA 3MTFA 3OD6X 5B7VA 4F1OA 3ZCLA 2YWVA 4EWQA 3R8MA 1LUFA 3UO4A 4ZTMA 4ITJA 2JDRA 1YHSA 3U4WA 3BYMA 3OWPA 2PVMA 1TVOA 3MS9A 4FV3A 2X8DA 2C3JA 4UALA 4AT3A 2BUJA 2NP8A 3A8XA 4ACHA 4IM0A 4MEDA 3PDTA 3FMJA 4IZAA 1OKZA 2H6DA 3PSCA 2X2LA 1Z57A 2Z7LA 2J0IA 4GVAA 5AX9A 4YHJA 5AV0A 1BMKA 3ELJA 4ZZNA 2IZTA 4AXEA 1H0VA 2C5NA 2BAJA 2E9VA 3BZ3A 4RIXA 3O7LB 5HBHA 3SW4A 4DTAA 4MBLA 3O17A 5EYKA 1MUOA 3F3ZA 3OY1A 1AGWA 3KB7A 3VUGA 5JFXA 2QCSA 4G6LA 3U8WA 4JQ7A 5EDRA 4YP8A 4RA4A 2JKQA 3O7LD 5CF4A 2I0YA 3FI3A 3OBGA 3QA8A 2RG6A 3PVGA 4X0MA 3FHIA 3ZDUA 5KMIA 1WBTA 4H05A 5C8NA 1QMZA 5KMMA 3EQRA 1Q24A 3F5XA 2R5TA 3KXNA 4IE9A 1YOLA 2X2KA 3F2NA 1P4OA 1H24A 3NR9A 4O7RA 3O8UA 4DEDA 3AC3A 3MY5A 4ZOGA 2B9HA 3EFWA 5HD4A 1URCA 4PF4A 4JBOA 3W2OA 4EONA 3QQGA 3T9IA 4C7TA 3REPA 3QC4A 2WOUA 5KHWA 2OSCA 2UZWE 3P5JC 3Q9WA 3E8CA 4C02A 3MJ1A 3TL8A 3KA0A 3DAJA 3MVLA 4JJRA 3WZJA 4GRBA 4FIEA 3HAMA 3QFVA 4RJ7A 3UG2A 1Y57A 4AGWA 4D1SA 3I6WA 2YWPA 4EH9A 2RIOA 2IVSA 1J3HA 3MIYA 1E1XA 4I4FA 3DDQA 3BWJA 4K77A 4DBXA 3WBLA 4MUQA 3GEQA 4PMTA 5IDNA 1BUHA 3IW5A 4IFGA 4EUTA 3GFEA 3ID6C 5E8SA 4GH2A 1Y6AA 4O7LA 3QCQA 2VTOA 4ZJVA 1PW2A 3D4QA 2YDKA 2BZKB 2DWBA 1Y91A 4ORKA 1DI8A 3HZTA 4N0SA 4WG3A 2WTJA 3LM0A 1ZARA 1P2AA 4F63A 4QYGA 5CT7A 4R5YA 2F2CB 4QDVA 4BCQA 1Q8ZA 1Q62A 4UXQA 3WARA 4B8LA 1FQ1B 4QQJA 1TFFA 5I5ZA 1JNKA 3OOGA 2PK9A 2P2HA 4X7QA 2AC3A 4YJPA 1NA7A 2WQMA 4FYOA 2XAMA 5HHWA 2Y4PA 3T3UA 2X4FA 3EYGA 3HV4A 4EC9A 2W4KA 5CI7A 5K9IA 2VNWA 4FKOA 3R9HA 3OWLA 4W4YA 3IGOA 5HVJA 2DUVA 3FXXA 3DB6A 4I6BA 2WQOA 4ERKA 3BV3A 1J7LA 2X0GA 3H3CA 1ZMWA 2PSQA 4XHKB 5AUXA 4PX6A 3BPRA 2B9FA 3PZHA 3QU0A 3P7BA 2XCHA 2ITTA 2JFLA 5DHJA 4B9DA 3WZUA 2G1TA 2DQ7X 3GNIB 1F3MC 3GU6A 3H10A 4FV5A 4L8MA 4TRLA 5EFQA 3G33A 1SNUA 5LMBA 3KRRA 3RM6A 3DDPA 2WKMA 1SVGA 3EN6A 4E5WA 3ZSIA 1UV5A 5H8GA 3I1AA 3DFAA 5HZNA 1ST0A 3TKHA 4YLKA 5HG7A 4IANA 3U87A 5E9EA 3OCTA 5BVEA 4UZDA 4BDGA 4L3PA 5FUTA 5IQCA 1XJDA 4FSWA 2CKQA 2BZJA 3MVHA 3VN9A 5IPJA 2BRGA 3TXOA 3PSDA 2Y7JA 4FV4A 4JAJA 3ZM9A 5IA4A 4JLCA 1QPJA 4LG4A 4MWIA 5M55A 3W16A 4F7LA 2WMWA 2GMXA 1W7HA 2JFMA 2W05A 2O3PA 2YIWA 4JR3A 2WNTA 3TUBA 4WG4A 3OMVA 3U55A 4AAAA 3UGCA 3FMMA 2VTNA 4R5SA 4ASXA 3RK5A 4DTBA 2PE2A 4GG7A 1B39A 1W83A 3MI9A 4QT1A 4BICA 4IJPA 3P4KA 1JOWB 3VS3A 4D5KA 4TZRA 4BI0A 3PJ3A 2C30A 5C4KA 5CAVA 3GU7A 2X8IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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