4AXCA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase apo form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
432
structure length
394
Chain Sequence
MILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLARVNAANVDTSHDSALILNDHSLCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSRNAWDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQ
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Conformational Changes Undergone by Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase Upon Substrate Binding: The Role of N-Lobe and Enantiomeric Substrate Preference
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
total genus 126
structure length 394
sequence length 432
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4axcA01
2XARA 3UDZA 4LV7A 3UDTA 2XAOA 4AXCA 2XAMA 2XANA 4AXFA 4AQKA 3UDSA 2XALA 4AXEA 4AXDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IVAA 2GPHA 4BKJA 4HYSA 1B6CB 3BHYA 3FZRA 4NU1A 2YHVA 3D5XA 3D9VA 3DB6A 5KZ0A 3WE4A 2W9ZB 1NT2A 3VS2A 2ZV7A 4BCFA 1M17A 4FKUA 3BRBA 4BI2A 5AA8A 5L2IA 4U79A 4C4HA 1J1BA 4M0ZA 3O8UA 4KSPA 2BKZA 1W84A 5CEQA 4F6WA 1Q24A 2VTLA 4E6CA 3S3IA 4FV5A 3SD0A 4IAYA 5IA5A 3Q4ZA 4MCVA 3SV0A 3VQHA 3IG7A 4QMOA 3U87A 1IRKA 2YJSA 3LCOA 1LR4A 3VHKA 3CQUA 2GTMA 4YZNA 3VNTA 2CDZA 3C4XA 3ERKA 1OGUA 1ZAOA 3D94A 1P4FA 4ZMEA 1Q97A 2CKEA 2YZAA 3AKJA 4HGEA 3VS4A 4C3PA 5TOZA 4CRLA 1GAGA 3QTIA 3KXNA 3FXWA 2RFNA 2R9SA 2YZLA 3UZPA 2P3GX 3LCKA 4J53A 4HVIA 5EW9A 2IVSA 5H8EA 4OT5A 1GNGA 2WEIA 4GCJA 2XKEA 5JMSA 5J5SA 5M57A 3V8TA 3QTWA 4CFFA 4D9UA 1YHSA 3EN5A 4GYGA 1SMHA 5M51A 4PNKA 2OWBA 4L52A 1IASA 2CKQA 2WIPA 1RE8A 3K54A 3MH0A 4D5HA 4YU2A 2WZJA 2J7TA 3LPBA 2GTNA 4F9BA 4YJTA 5I9ZA 5KMMA 2B52A 2E9UA 2G2IA 2Z7RA 4FUXA 3R8ZA 3ZBFA 5IQIA 3KXMA 4CFMA 4J71A 4P90A 4XG8A 4PRJA 4E6AA 4EOJA 3DY7A 3BELA 2OZAB 3Q9ZA 2R7BA 4PY1A 3OHTA 5AUZA 4C4FA 4FV0A 4TT7A 5CQUA 2WIHA 3Q6UA 5AIKA 4FEVA 3CLYA 3ZFYA 4WNPA 3UOJA 1PXMA 2JDVA 1FVVA 4YHFA 4U41A 4FTNA 4JBPA 3Q6WA 4U8ZA 3ZCLA 4AOIA 3F2NA 3QXOA 3EN6A 1P14A 3AMYA 3NX8A 2H96A 4IDVA 5LMAA 3UZTA 2NPQA 3F3VA 3FYJX 2B53A 2JDTA 3C1XA 2E9NA 3IQ7A 2WELA 5E7RA 4AOJA 2HZ4A 3THBA 4RFZA 5CSPA 2OZOA 3TJCA 3SRVB 3TI1A 3H9OA 4FC0A 3ZLWA 4FTCA 2F7XE 2JEDA 3R1YA 4R7HA 5HCZA 3G33A 3FZOA 4UZHA 3BV3A 2C1BA 3C9WA 2E9OA 3BLRA 4RLLA 1XH8A 2I0HA 3W16A 2XBJA 3BGPA 3I1AA 2J9MA 1PXIA 2UVXA 4ZP5A 4I6HA 3TZ9A 4UY9A 3HP2A 2R3GA 2VWIA 2YIYA 3CC6A 3RTPA 3V04A 3AKLA 3FEGA 3QKMA 4KUJA 4LV7A 4ZAUA 4I0SA 4O7TA 4FEUA 1R3CA 5F4NA 3GCPA 3DLZA 4EQCA 2C6EA 4QO9A 3WYXA 4FK6A 3V51A 3GCUA 3V5PA 1IA9A 2JC6A 4QMXA 4BCKA 3MFSA 3FMDA 4F9YA 4G3DA 4Q9ZA 4UWBA 2J5FA 4F0FA 3F61A 3L1SA 2OH0E 3EFLA 4PTEA 3BEGA 3FV8A 4IE9A 3ROYA 4ANSA 3TKUA 4CFNA 2QHNA 3JVSA 4HYIA 2GFSA 3O23A 5E9EA 5E8YA 1UWJA 1YI4A 4E4LA 2XK9A 3BLQA 4D9TA 4NZWB 2F7ZE 4Z7HA 4A9YA 1OKVA 2W4JA 4FODA 4P4CA 5TR6A 3NAXA 4P7EA 5ANKA 5BMSA 4RX9A 1BLXA 3A7HA 3T9TA 5HZNA 3QZGA 2FUMA 4GIIA 3AMAA 5T6KA 2RF9A 1UU8A 2H8HA 3I5ZA 2X7FA 3MY5A 2PHKA 3VRYA 1JKTA 4A9SA 5HTCA 3ANRA 3DCVA 2JIIA 4IAFA 4F0IA 5AUXA 1IAHA 2XCKA 1IR3A 2VTJA 3KXHA 4F99A 4ZZNA 2O0UA 3I4BA 3KB7A 2W1FA 4FL3A 4FZ7A 3VAPA 5BUIA 3C4WA 3HAVA 4B0GA 4DGOA 4RG0A 3PPZA 4U81A 3WZDA 5L2TA 1PYXA 5DR6A 1Q99A 2BUJA 4AN9A 4Y46A 4R5YA 2BRGA 3P1AA 4NL0A 5DBXA 1JPAA 1Q8UA 3FJQE 4BDCA 3QD2B 3R8MA 4MQ1A 2C6DA 1SVEA 2FSMX 1H26A 3LZBA 4XX9A 4D28A 5FDXA 3Q4TA 2IN6A 3R21A 4UB7A 5EHOA 4DHFA 4MWHA 2R2PA 5I5ZA 5DEWA 4QMLA 3GCVA 5HCYA 3LHJA 3OFMA 5AWMA 4BRXA 4BTKA 2A4LA 1ZYSA 4U0IA 1IAJA 4O7WA 5EG3A 1U5RA 2BIYA 2JD5A 5KMJA 5AIRA 5CAVA 4NM7A 4D55A 3DK7A 3IKAA 1YOMA 3E64A 3PFYA 4TTHB 2XJ2A 4G5PA 5FTQA 3RVGA 2EXCX 2PVRA 3BCEA 3ORXA 4FSQA 5J7HA 5EHYA 3WYYA 2BZHB 3QA8A 3TUDA 3DJ5A 3P7BA 4UEUA 4MNEB 1OL6A 1F0QA 2OK1A 3DZOA 3P5KA 2W5BA 3P5JC 5HD7A 3A2CA 3H0YA 3KMMA 4RQKA 5L8KA 4JG8A 4CNHA 3W8LA 2QG7A 5CT0A 3UBDA 4DH7A 4CV8A 2NP8A 5E1EA 3QCYA 3QQJA 1M52A 2LGCA 3A7FA 1JOWB 4QNYA 3QUDA 3NUXA 4FNXA 1W98A 3B8RA 3DK3A 5EYKA 3VUDA 5JRSA 4BZOA 4DTBA 5ACKA 4BJJA 2X8DA 3PJ2A 4EHEA 1U59A 4FTTA 2BIKB 4R7IA 2ITOA 4YR8A 5K4JA 3ETAA 4YJOA 4ZY5A 4DH8A 4YTCA 4L53A 3E7VA 3QBNA 4QMUA 5EHLA 3TNWA 4OLIA 5HTBA 3MTLA 3PY3A 1OKZA 1JAMA 2OIQA 1PYEA 4GS6A 4JIAA 5DRBA 4LRJA 5K3YA 3V8SA 4F9AA 1MP8A 3E92A 1T46A 2GHLA 1YXUA 2B9HA 3QWJA 4K6ZA 2PUPA 4NSTA 4AS0A 3HRFA 3QFVA 2Y4IB 2GHGA 3G6GA 3QXPA 3L8XA 4IIRA 2Q0NA 4LOOA 5FG8A 3W55A 3UC3A 1OL1A 4ZOGA 1H4LA 3CTQA 4R6VA 4LUDA 5IQBA 1H01A 4GFMA 3AT2A 4KWPA 2WMSA 3JY9A 3D2IA 2OXXA 2HYYA 3NYXA 3QC9A 4F6SA 1XBBA 1U54B 3OWJA 3QZHA 1ZYDA 1H24A 3TNHA 5I9VA 2GNLA 4E5AX 2GCDA 4O0RA 5FTGA 3TNPC 5BVOA 3CXWA 5FUTA 1OMWA 5C03A 4EHVA 3A7JA 3JUHA 3JY0A 4YJSA 3CTJA 3A4PA 4PV0A 3QCSA 1OI9A 4YHJA 2ZOQA 2QOHA 4QDVA 2H6DA 4OBPA 2Y7JA 4K33A 2JFLA 4RX8A 2X2MA 2XH5A 3I7BA 3MIAA 5JK3A 3FZPA 5E4HA 1BKXA 5I4NA 4B8MA 3R2BA 2XJ0A 4EEVA 1OZ1A 1JSVA 3PVGA 1NVSA 5CAUA 2YIRA 4BDFA 4ZTQA 3TZ7A 4WUAA 1J7UA 4XEYA 2V7AA 3S4QA 3OT8A 2C0TA 4XYFA 2QKRA 2W1EA 2C6TA 4MD8E 3BU5A 2W1CA 3SVVA 3OROA 5CNOA 4YPDA 2H34A 4KSQA 5CT7A 3VS7A 4AZVA 4MXOA 5JH6A 4HVGA 3I81A 3QHRA 4Y73A 5E8ZA 4ZSJA 4YURA 3PJ3A 3U54A 1G5SA 3G5DA 4DHJA 4DT9A 3W2SA 3SAYA 3QWKA 4IAKA 4ACDA 5HU9A 4Y8DA 4I41A 4EC9A 3LCDA 2W5HA 4BICA 2XK7A 5KE0A 4IAZA 4RFMA 4TXCA 2R5TA 4JBQA 3W2PA 4BCMA 5H8GA 3LQ8A 1ZMUA 4KIQA 3U4WA 2P2HA 2ERKA 4JX7A 2HENA 3SG8A 1PMNA 5J95A 3VW8A 1UNLA 3COMA 2CPKE 3ENMA 5FM2A 2GSFA 5HBJA 1PXJA 2HZIA 3DB8A 4XJ0A 4S30A 3C4ZA 3HV3A 3S2PA 2JKOA 2PK9A 4FSTA 2CNVA 4MD7E 4RWIA 4RX7A 5L6WL 1SYKA 4H58A 1BI8A 2JIVA 3O96A 3HV5A 4ZSLA 5AV2A 5B0XA 2W17A 1ZY4A 4DH5A 1QPCA 4PL3A 3NDMA 4U45A 4ZXTA 3MA6A 3PWDA 2JIUA 4UV0A 5E8WA 5LJJA 4JVGA 4TPTA 4NTTA 4WO5A 3QKKA 2BMCA 4H3PA 4IMYA 5DEYA 4DGGA 3NUNA 3KRXA 3V5LA 1RW8A 3LIJA 3VUKA 2R3OA 3MN3A 4FSUA 2QD9A 4YBKA 4LL5A 4AGUA 4TNDA 4C34A 4DG2E 2X6EA 3RCDA 5DHJA 1YI3A 4I94A 4Z55A 2X39A 5CVGA 2XNMA 3AXWA 4GK3A 4X3JA 3QQFA 5F20A 2O2UA 3GC7A 3SXFA 4JOAA 3ZH8A 5BMMA 4AF3A 3ORZA 4RIOA 5BVWA 3MJ2A 3EQRA 3MW1A 4FTUA 4EOPA 3R02A 3FSKA 4GMYA 1CDKA 4AXEA 3OY3A 2V0DA 4IWOA 4BCGA 4MXXA 4PMMA 5IQEA 5AX9A 5LVOA 4FG9A 4O6LA 3Q2MA 5EQPA 2Z2WA 4EOLA 4MXZA 4JDHA 2GS6A 3AG9A 4MHAA 4RJ3A 3SQQA 4BJJB 3FMMA 4AFJA 5A6NA 3AC2A 4QTBA 3HKOA 3OC1A 4R5SA 3LE6A 3NSZA 3QU0A 5K5XA 2WTIA 2IPXA 4C59A 3KRLA 3P86A 5EDPA 3MH1A 3PJ8A 5CEKA 2BAQA 1O9UA 3EQHA 1FINA 1SNUA 2JGZA 4XG9A 3BE9A 3QRUA 4X6RA 5HVJA 3TCPA 4DFYA 2PZYA 1CTPE 2GMXA 3JR1A 3QLGA 3B2WA 3IECA 2F49A 3IW8A 3FKLA 4ERKA 3CY2A 2XIYA 5EFQA 3K2LA 4DLIA 4DT8A 3QTUA 3RPSA 2VWUA 2VD5A 5B2LA 3H30A 2F7EE 1WAKA 4QRCA 2R3KA 3EQBA 3UMWA 4AZWA 2HXQA 3VS0A 3W18A 3GXLA 4G3FA 1ZARA 3JPVA 3E7OA 4FKQA 3KF7A 4CGAA 3QUPA 5IQCA 5AP3A 4GVJA 4AE6A 5LVNA 3Q5IA 2BAJA 2JKMA 4IB3A 1KOAA 1V0OA 3DS6A 4JR3A 4JR7A 5JFVA 3BYOA 1DAWA 4YZMA 2VX1A 4XMOA 3HYHA 3UE4A 4YMJA 3NYVA 5BYZA 5DRDA 3NFGB 4I4EA 2XZSA 2QQ7A 2WOUA 4GU9A 5HG8A 5BVFA 2B7AA 2QOKA 3ZUUA 5CU0A 3ZXTA 1R39A 5IMXA 4FKGA 4NCTC 2WU6A 3E88A 2ZMCA 4DEAA 2P0CA 3CP9A 4MQ2A 4OTFA 2X8IA 4K11A 3AC5A 4OR5A 4U9AA 2ITUA 1OBDA 5AUWA 4EZ7A 3UQCA 4FL1A 1KE9A 2GNJA 1DS5A 4BCOA 2ERZE 3D7TB 3F3UA 2VV9A 4QP4A 3U8WA 3PFQA 4D4YA 4L46A 3R30A 4GT5A 3NCGA 1XQZA 4DEBA 3FQHA 4J52A 3WF5A 4K9YA 2OF4A 4AW5A 4F65A 5DA3A 3II5A 2QU6A 3FLQA 3RPVA 1CKIA 4LL0A 3VVHA 4FGBA 1XH9A 2XIZA 2R3QA 3R22A 5D1JA 2ZMDA 3E93A 2Y8OA 3ODYX 4GEOA 3W0RA 1MRVA 3DKOA 3UMXA 4F08A 4X3FC 3PYYA 4ZK5A 2DS1A 4M97A 4WNOA 4AZSA 5I9XA 1U46A 2EXMA 4NM3A 5A4CA 4QMZA 4X6QC 2CGXA 2F4JA 3PVUA 1HCKA 3O17A 4M7IA 2BZIB 3DFCB 2JKQA 5M4CA 3P4KA 3O2MA 4RIXA 2CLQA 3E62A 4UN0C 1UKIA 2VWBA 1FPUA 2XS0A 3A62A 3QRTA 5AUTA 5DPVA 5DVRA 5C4KA 3EL8A 3PLSA 2XJ1A 3DGKA 5CEOA 3QC4A 1OIYA 2QO7A 4ZZMA 3G15A 3V01A 4DBXA 3EZRA 2VTQA 5CXZA 3MV5A 4YNEA 4I5HA 4JT3A 4L7FA 4PL5A 4XH6A 3MVHA 4JAIA 4U44A 5CVFA 3KMUA 4FKSA 2UZNA 2GHMA 2X0GA 4EOKA 3F3ZA 4QMMA 1ZOEA 2WOTA 4KA3A 4O0VA 3BKBA 4F4PA 1FGKA 3LVPA 3GCSA 4FTJA 3GENA 1YW2A 2NRYA 3QYZA 4H05A 3NIZA 2P55A 4GFOA 2C47A 3PY1A 2UZTA 3T3UA 1ERKA 2VTHA 3PDTA 4RIWA 4F7LA 2E2BA 2RGPA 1CKPA 4TYHA 1H1QA 2VX3A 3O7LB 5CU2A 4LFIA 2IZSA 2VTSA 3SG9A 5FBNC 4LRMA 3WARA 2UW6A 1VEBA 3LOKA 4H39A 3ZC5A 4AZEA 2HY0A 5BX0A 2YM7A 3IDPA 4PUZA 5FRIA 1OECA 1YXVA 3MIYA 4MF1A 4OW8A 1QCFA 1EH4A 1IEPA 4QP6A 3R7YA 3S00A 1XH4A 3CE3A 2QCSA 3ID6C 3OWLA 4KBKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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