4AXDA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase in complex with amppnp
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
434
structure length
433
Chain Sequence
MEMILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRNDKAIKNSNGVVSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLARVNAANVDTSHDSALILNDHSLFSQGITSGGDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICREGRPLEAELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSRNAWDSEPGDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational Changes Undergone by Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase Upon Substrate Binding: The Role of N-Lobe and Enantiomeric Substrate Preference
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 141
structure length 433
sequence length 434
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4axdA01
4AXCA 2XAMA 4AXFA 3UDSA 3UDZA 2XALA 4AQKA 4LV7A 2XANA 2XAOA 3UDTA 4AXDA 4AXEA 2XARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IANA 3HV4A 4QO9A 2XNEA 3D14A 3QUEA 3QTUA 2FYSA 2HYYA 2VTIA 4DFYA 2VWVA 2VWBA 4CGAA 4JBQA 3NFGB 2BCJA 5DEYA 3DA6A 3TTIA 3E8DA 3IOKA 3FZ1A 4CSVA 4DG3E 4XLVA 4ENXA 4GT5A 2W1EA 4XCUA 5ICPA 2GNFA 4QMOA 3ET7A 4ERKA 1YWRA 2VWIA 2A2AA 5J9ZA 3P08A 3R7OA 3TMOA 1NY3A 3Q2JA 4IDTA 2WTKB 3DLZA 5KMIA 2F7EE 4P2KA 3D2KA 2BZKB 3FYJX 1Q3DA 3FLQA 5BVEA 3UOHA 4BCOA 4O0XA 5LQFA 1UU3A 3LJ0A 2EB2A 4ZXTA 5IQAA 1UA2A 3TDWA 4DG0E 3AD6A 4RJ7A 4O91A 4C33A 4ANMA 3Q6WA 3LCTA 4NM5A 4O7NA 5LMBA 2WU6A 3E5AA 4TWOA 1S9JA 4IVCA 5CU6A 4R78A 4L45A 4AGDA 2BIYA 4FOCA 4HCTA 3QU0A 3SDJA 4TRLA 4EUTA 1JQHA 5DT0A 4BIDA 4F09A 3QQHA 5LWNA 4Y46A 4LRKA 3HMIA 5DBXA 3ZTXA 1STCE 2I6LA 4IVDA 4I5MA 2HZ4A 3MY1A 2CHLA 3UO6A 3I5NA 3PXQA 2A1AB 3KMMA 3Q3BA 1IA8A 4FZ7A 4IE9A 4YJRA 4YZCA 5HG5A 3V6RA 3W32A 2GNIA 4F9YA 4NKAA 3FDNA 4TYHA 4U42A 3W8LA 4L8MA 4I22A 1P14A 4TT7A 4NT4A 2H8HA 2VWYA 2WNTA 5LVOA 3MPMA 1XJDA 5HTCA 2XNPA 4EORA 4G6NA 4O7TA 4D5KA 3ZFYA 1ZOHA 4JT3A 3ZYAA 3TL8A 2WTVA 4JDIA 3SKCA 4A9TA 3QLFA 3OT3A 5HLWA 3HA8A 3VBVA 2YWVA 2Z60A 4UY9A 1IEPA 2P0CA 2WMQA 2YHVA 1M2RA 5AFVA 3ZBFA 3RK5A 2UZBA 1OL5A 5ANIA 3UIXA 1OKZA 1G8JA 3CQEA 4GT3A 3DQXA 4HVDA 5CEKA 4ALUA 1BI8A 4EC8A 2PTKA 4L42A 5IEVA 3KXHA 4DFXE 2XJ2A 3OD6X 1NVSA 2Q0BA 4QYEA 4D4YA 3GCPA 3NMUF 3I5ZA 1YI6A 4FG9A 3EN9A 4O0VA 3RKBA 4BTKA 4FC0A 3BPRA 3GU6A 3DNDA 4P5ZA 2QD9A 3OCSA 3OY3A 4ZTRA 3TUCA 3HX4A 3IPHA 3WZUA 2J0IA 4YPDA 5B2MA 3I1AA 2LAVA 2IWIA 2X6DA 3ZLYA 1OGUA 4RZVA 5EM6A 3HV5A 3TACA 1CMKE 3C13A 3MIAA 5IDPA 4I0SA 4EHEA 5D11A 3TM0A 4YO4A 5F4NA 5BVFA 3G2FA 3RVGA 3ZEPA 5HCXA 3FLSA 2PZ5A 1UNGA 5AAGA 2QVSE 2PPQA 4RIXA 5HE0A 4AXDA 1RE8A 5AP4A 3LPBA 5GIPE 2R0IA 3A62A 2YM6A 3H30A 3S4QA 3OXIA 3VW6A 2QU5A 4RIWB 2BRGA 1JLUE 3W2QA 5FRIA 3T3UA 3IONA 3UP2A 3V8TA 3COKA 1MRVA 2YABA 3AT4A 2LGCA 2GHLA 1OKYA 3A99A 4C58A 4M7IA 2R2PA 3EQDA 2VU3A 3R1SA 4MD8E 4DN5A 3W0OA 4NWMA 4UWBA 3GENA 3MTLA 4YP8A 4G3DA 4KUJA 3QQKA 3UIMA 4USEA 3WZEA 1XMMA 2R3OA 3IS5A 3MVHA 4RZWA 3FXXA 5CS6A 3MFRA 3IW7A 4D2RA 3MW1A 4FBXA 4D0XA 3BEGA 4AQKA 4RVTA 4QYGA 4F7LA 3PVUA 5J9LA 4R3RA 4QMUA 2JKMA 3OW3A 2ERZE 4YLJA 4IFCA 3UGCA 3Q96A 5LMKC 4F7NA 3VF8A 3G6GA 5JFXA 4ACMA 2X7OA 3VUIA 3OCBA 3O5AA 2R3JA 3VBWA 5CANA 5HTBA 4F0FA 2OFUA 4LDTA 3Q9YA 4BI0A 3BIZA 2ZM4A 3UVQA 5CSXA 1G8KA 2B54A 3R1NA 3LE6A 5JKGA 3R2YA 2CKPA 3KN6A 3QQUA 3MJ1A 3JVRA 3L1SA 1E9HA 2WOUA 2GU8A 5AP2A 1URCA 5EYKA 2VTHA 4KSPA 3NFFB 1E1XA 3DXPA 4FTNA 4XBRA 3RAIA 2CGWA 5J8IA 1NVQA 5CSPA 5C1QB 2A19B 2ITPA 1U5RA 2OXDA 2PVNA 2R3LA 2GFCA 4WIHA 3V5WA 4IQ6A 4DH3A 2EVAA 3GP0A 4GVJA 2G1TA 5EI8A 2CGVA 4RC2A 2R3QA 3VQUA 3CTQA 4HCUA 2PYWA 5K9IA 2VNWA 5LWMA 4FV7A 4RRVA 5CU0A 1VZOA 4DHIB 3R30A 2CN5A 3ORPA 4ANLA 3EHAA 4ZS0A 4LGHA 4QMNA 2VWZA 3GT8A 5CWZA 5DT3A 2QURA 4USDA 5E4HA 3UPXA 4D1SA 1GZKA 4F08A 3M42A 5A4QA 4GT4A 4JJRA 3RPVA 2ZMCA 5BX0A 4HGTA 3VAPA 2QLUA 2O0UA 2WEVA 4D9UA 5L8KA 4NM3A 2YIQA 1Y57A 5JGDA 4EYMA 4J53A 1P4FA 4U79A 3UYTA 4OTWA 2C1AA 4G3EA 4P5QA 5CVGA 4MBLA 3ELJA 3VS6A 2H34A 3DFCB 4EZ3A 3KXXA 3EKNA 4W4XA 1FVTA 4WNKA 4M0ZA 3CY3A 3OOMA 5JMSA 3WF6A 4DHJA 4FT7A 4FOBA 2XKEA 4UXQA 3NLBA 2PMIA 2YDJA 2ZDTA 3BX5A 4GK4A 3R7VA 2IW9A 4WD5A 4U3YA 3G90X 3NAXA 3IW4A 4D58A 1KSWA 2XK8A 3CJFA 3QKKA 4XJ0A 3OFMA 3KEXA 4DDGA 2ZYBA 3Q4CA 4C38A 1FGIA 1JOWB 4GJ3A 4RVMA 3FMDA 3QXOA 4F4PA 2VTNA 4FKSA 3HEGA 1XBCA 3IGGA 3MIYA 3QTQA 3PUFC 1MRUA 4EQMA 1J7LA 3MYGA 1SMHA 5JK3A 3RAKA 5L6OA 1BL7A 3O50A 3ZUVA 3NPCA 4K8AA 5DI1A 3OWLA 3CIKA 4IJPA 4DITA 1QPCA 4C2VA 5I9WA 3R9DA 2XIZA 1Q8WA 2WD1A 2R3RA 3R8ZA 2Y6MA 1YHSA 3LFDA 3WARA 2J0MB 1UNLA 3GU5A 3ML1A 5KUPA 3II5A 3UJGA 2H96A 4L6QA 4ZTLA 2AYPA 2V7AA 4MAOA 4Y85A 3PE2A 3QCQA 3FZPA 5ETAA 1QPJA 4O96A 4U97A 3O96A 2CNVA 2ZV8A 5ETCA 5G6VA 3ZSIA 1YXUA 3PLSA 4G6LA 3ORZA 5AAFA 4C4HA 2QO9A 3D7ZA 5E9EA 3PJ3A 2OWBA 2XIXA 4IX5A 3Q9XA 2OZAA 2NRYA 3KK9A 3UC3A 5JFWA 3U6JA 5M44A 4QYYA 3R28A 5CQWA 2XIKA 5GJGA 5IA4A 4RVKA 5KMJA 2QOLA 2OSCA 2RG5A 2YM7A 3LIJA 5L6PA 3F88A 4QNYA 5DIAA 2Y0AA 5HESA 4O7ZA 4XOZA 4YUQA 2WB8A 4MXYA 4O0TA 2WTJA 4EK3A 1PMEA 4J71A 4ONAA 4WG3A 4PL4A 3PYYA 4BKJA 2W5AA 4AWIA 3ID6C 1U46A 2W1HA 4IAZA 5IDNA 1Y8GA 3QQFA 4O0WA 2YWPA 4DTBA 4MBJA 2BRBA 3CD8A 2HELA 2XIRA 3OBJA 4LOQA 4XMOA 3U9CA 5F9EA 4BTFA 4TYIA 5HCZA 5IMEA 4XRJA 5HGIA 5FP5A 1UWJA 3MFTA 5CALA 3ZEWA 4J1RA 3NNXA 4TYHB 5DT4A 2X81A 3ALOA 2JEDA 3DKGA 1KE7A 4FODA 3F5XA 4QQCA 2V55A 3AKLA 1KOAA 3FJQE 3LFFA 2V7OA 2JFLA 4FTOA 4AA4A 2YAAA 4EYJA 4PMPA 4ZZOA 4HVHA 4X7QA 5M51A 4QDEA 2B0QA 3ZZEA 3PSDA 4AZEA 5EK7A 5BVOA 3BL9A 1FGKA 1O6YA 3DNEA 4TN6A 5F95A 4ITHA 1AGWA 1ST0A 3IG7A 1MQBA 4AT4A 1TVOA 3BYVA 4ARKA 4KWPA 3DBCA 2X9EA 2J5EA 4TZRA 3SG8A 3H0ZA 3DGKA 2X4ZA 3FC1X 3HDMA 4UWCA 3FMLA 3K54A 1P5EA 5JGBA 2WO6A 5B7VA 3R01A 1SVEA 3V5QA 3FXWA 3CS9A 3IO7A 4YLLA 4E73A 4P90A 4ZK5A 2RG6A 4FV2A 1H0WA 3UC4A 3CJGA 2HIWA 3VBQA 4DEEA 1JKLA 4F7SA 2AUHA 4OTQA 4NTTA 4WG4A 5AM7A 2NPQA 2WPAA 5CEQA 5KZIA 4F9AA 4D1ZA 1ERKA 5GHVA 2JKOA 4JL9A 3I0QA 3GQLA 4IVAA 2PVLA 4C0TA 4CKRA 3VS4A 4CV9A 4FIJA 2JFMA 4YTHA 3T9IA 3E92A 4RIXB 3VUKA 2YM5A 3D5WA 5CZIA 3COHA 3ORNA 4BN1A 1JAMA 4JR7A 5IISA 2ETRA 2IG7A 2PVJA 4CMOA 4Z3VA 3E8NA 2F7ZE 3F66A 4V0GA 4R7BA 2CNQA 3JY9A 4O86A 2XZSA 2YA9A 2CMWA 3MB7A 3TIZA 4LL5A 1OL6A 1SNUA 2XEZA 3ZRKA 4C3PA 5T68A 4Q9ZA 4FIGA 3KB7A 3L9NA 4FEWA 3MESA 4O0YA 3BZ3A 3EFLA 4GS6A 5D10A 3C50A 4IC7A 4MHAA 1KE8A 4FGBA 1XKKA 3EN4A 4RQVA 3HL7A 4RIOA 3AC3A 1OIRA 3UZPA 4FT5A 4EH2A 2NRUA 3SX9A 4DFZE 1YQJA 5EH0A 3VULA 3WF5A 5GNKA 4HGEA 5HU9A 3QTIA 3RHXA 1YVJA 4X2KA 1XH8A 4C34A 2OXYA 3ZC5A 4QP1A 3HNGA 2Y4IB 4QTBA 4H36A 4EOMA 4E8AA 4IZ7A 5HNBA 1PXOA 2GCDA 5HG7A 2QR7A 1OM1A 3GC8A 4BZNA 5KHXA 5CF8A 4F0GA 4G3FA 1Q61A 3FQSA 4DH7A 4EK8A 2GPHA 4GK3A 1Z5MA 4IAAA 4OBQA 2OBJA 1JVPP 3PJ2A 4BBMA 5ANOA 5AWMA 1A48A 2C6EA 3EL7A 4C59A 3OHTA 1OECA 2QO7A 3DTWA 4TTHB 5HE3A 1ND4A 4BCFA 2R7BA 2QG5A 2F2CB 3I7CA 4KIQA 3TXOA 3BEAA 3QQLA 2Y7JA 5M57A 2PULA 4FSMA 4PTCA 2GDOA 4XV3A 3C7QA 2HENA 5ANEA 3ZHPC 4ZJIA 2BIKB 2OJ9A 3LFEA 3ZSGA 4IVBA 2B1PA 3RK7A 4QMPA 4IC8A 3QALE 3UOLA 5E91A 4DFBA 1BL6A 4WG5A 4YTIA 4JQ7A 3LCDA 4K6ZA 4EONA 3LJ2A 4MTAA 1W82A 3TNQB 4C4EA 4GJ2A 4MEDA 4H1MA 3R7YA 2PE0A 5ETIA 4ACCA 4RLLA 1FBNA 4L67A 1FVRA 4Q5HA 4D4RA 4MUQA 1VLRA 3KVWA 2OH0E 3KQ7A 3PFYA 4M15A 4I5CA 5HVYA 3ZXTA 5HQ0A 3TUDA 4PV0A 1OMWA 2HZIA 4IHPA 4RG0A 4RWJA 3QYZA 4R7HA 4AFEA 2GHGA 5AIKA 3OUNB 4YJTA 1PXMA 1XH9A 2A0CX 1ZOEA 2J50A 3ERKA 4DFUA 2YM3A 5A6OA 5K4IA 4RA5A 3G0FA 4ZSEA 4MNFA 3NUPA 5JFVA 4MWIA 1J91A 4O2ZA 1A9UA 5J1VA 2HZ0A 1H01A 4AW5A 1L3RE 3Q9ZA 4F1OA 5KMNA 4RJ8A 4QTEA 4TNDA 2DYLA 2IW6A 4JXFA 3A4PA 4BDIA 5BYYA 3HRBA 4E4NA 5CT7A 3ZU7A 3DDQA 1NT2A 3NIZA 3LXPA 3MJ2A 3NS9A 4FVRA 4E26A 3LFQA 3N4UA 2QU6A 2R3HA 4I6FA 1T46A 4X3FA 3QX2A 5IH6A 1H08A 2CLQA 2CKEA 4ASDA 3FUPA 4YZMA 2GTMA 4CRSA 1Q3WA 4FKGA 1R39A 4R7IA 3CKWA 4X6QC 3EQBA 4AG8A 2JDTA 2IVVA 2IZTA 3NRMA 3PVBA 1OPKA 3EN6A 2BHEA 4FZAB 4ZZMA 4EBWA 2WIHA 3MH0A 2W05A 3CLYA 3LFCA 4ZTSA 3QHWA 4HJOA 3W8QA 1GIHA 4D9TA 2YITA 2VTQA 3P9JA 2EU9A 5IA3A 3QFVA 4A9RA 2JDSA 3HZTA 4C37A 1RDQE 1HCLA 4HYIA 2GS7A 3U51A 3L9LA 1BYGA 1YOJA 2UW9A 3DDPA 5CEMA 3CSVA 5ETFA 4EOLA 4FEQA 5EQYA 4O83A 5HKMA 2QOFA 3F2AA 3G15A 1Q41A 5T6KA 4BDGA 4DEAA 2OO8X 2O3PA 4K11A 3TKHA 1DAWA 3R63A 4YZNA 3TNIA 4FKLA 2Y9QA 2YIYA 3KXZA 4R6VA 3MPTA 4N6YA 5AEPA 3FKNA 3FQEA 4GYGA 4EL9A 4EOQA 4C62A 4XG7A 2ERKA 2QOBA 3DFAA 4JDHA 5CLPA 2C30A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite