4AXFA

Insp5 2-k in complex with ins(3,4,5,6)p4 plus amppnp
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
435
structure length
410
Chain Sequence
EMILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFSQGGDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICREGRPLEAELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSGDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conformational Changes Undergone by Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase Upon Substrate Binding: The Role of N-Lobe and Enantiomeric Substrate Preference
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 134
structure length 410
sequence length 435
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4axfA01
3UDZA 4LV7A 4AXCA 2XARA 2XAMA 2XALA 3UDSA 4AXFA 4AQKA 2XAOA 4AXDA 4AXEA 3UDTA 2XANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JIIA 4L68A 1PXKA 2UZLA 5AV3A 4DG2E 4C0TA 3COHA 3PSCA 2O2UA 4Z55A 2XEZA 2HWOA 2JDVA 5IA0A 4I4FA 4TYHB 5I0BA 3WF5A 4CVAA 5CWZA 5IA2A 5CSXA 2X0GA 3UNZA 4U7ZA 1WAKA 3TXOA 3PZEA 3EZVA 3O51A 1XH5A 4ZTQA 1Q99A 1ST0A 4BHNA 4MQ1A 4CCBA 1CMKE 2IVVA 3LCDA 4FZ6A 5HNBA 4WIHA 2IVTA 2C4GA 4Q5HA 3WF8A 2B9HA 1F0QA 4IB3A 2GHGA 1DM2A 2V22A 4RWJA 3ZO2A 4AN3A 4QMQA 4WG3A 4L7SA 4ZEGA 3MTLA 3R8PA 1FMOE 4QMLA 2FUMA 2EXCX 4A4OA 5EQEA 4F6UA 3F6XA 2IWIA 3BYOA 5HU9A 2XIZA 2JAMA 1XR1A 4NM3A 5HIEA 3UOJA 1XH9A 3F3WA 3IOPA 4E20A 4QMWA 4RFYA 4XG8A 3SRVA 3TTIA 5BYYA 2Z7LA 3EKKA 3G5DA 3I1AA 3DNDA 4ITHA 5H3QA 5H9BA 4CV9A 5J1VA 2R3MA 1OB3A 2VGOA 2PZIA 4BVUA 1OITA 4FIHA 3RM7A 1RDQE 4F0FA 4YZMA 5EM7A 4O7WA 2OI4X 3MYGA 3PIYA 4FTQA 1M7QA 5EHOA 5KMMA 3PP0A 2JKMA 3JVSA 5DWRA 1P14A 2XRWA 3MI9A 4F0GA 1PYXA 5LCJA 3ZUVA 2VO3A 2X4ZA 4L7FA 5ETAA 5HG5A 1Y8GA 3QRUA 5EM5A 4O7ZA 4EC9A 2PZPA 1TQIA 2QO9A 4RIWB 4XV2A 4ZTNA 2QOIA 2VTIA 3VBVA 2XNNA 5E92A 3MH1A 3VQHA 4LMUA 4F9AA 1WFCA 3I7CA 3CQUA 3TL8A 4RFZA 4EK3A 4ENXA 4DG0E 1ZRZA 4YBKA 3R9RA 5CU3A 4RIYB 3KXXA 2J0JA 3CJGA 3ZOSA 3LMHA 3ZSIA 3CSVA 3PRIA 2XBJA 3PUFC 3KGAA 3SAYA 3QC9A 5CAOA 3FMHA 1Q8YA 5EQYA 2VTJA 3HL7A 2OF2A 4KS7A 4HYUA 4RX7A 2J7TA 2WGJA 4J71A 4O0VA 4USEA 5CQWA 3R22A 4GH2A 2R3NA 4C2VA 4WA9A 5HG9A 1QL6A 3ZO1A 1J7UA 1IG1A 4FTKA 3QRKA 2HWPA 1IRKA 4U43A 3O0GA 4KNBA 4FE2A 3KXZA 3QUPA 3SXSA 4M97A 2W05A 3D9VA 1YWVA 3K3IA 3R63A 3ELJA 3HKOA 5IQEA 4HNFA 2FSTX 3E87A 3LIJA 3NUXA 4FV0A 5F1ZA 5BYLA 4ASXA 4FMQA 5CXHA 5FP5A 2XNMA 1XH8A 4E6AA 2DWBA 2OXDA 4JG7A 4I20A 3ULZA 3EQFA 4K1BA 3VNTA 4BTMA 3OW3A 4JDIA 2QOKA 4GYIA 5IQAA 4MNFA 4NZWB 4M0ZA 1DI9A 4DBNA 2ZV7A 3Q6WA 1GZNA 3L8SA 3R8ZA 4O7SA 1PF8A 2R7IA 4QTEA 3ZO4A 3N9XA 4DITA 3ACJA 2NRYA 4B8MA 3C0HA 1O6KA 4JR7A 4RLKA 1GIIA 5CEPA 4DEBA 1WVYA 5KBQA 2YAKA 3ZDUA 2IPXA 1APME 1QPDA 4IH8A 1UWJA 3O7LB 3FLYA 4ZJVA 1UNHA 3EQDA 1OI9A 3QA0A 4RVMA 4FKWA 3MA3A 2WIPA 2WNTA 2X7OA 4BCKA 2Z02A 4NM7A 5EOLA 4H3QA 1OIUA 1Y8YA 2PVRA 5IZFA 4YJUA 4IADA 2OJGA 1KE6A 3R00A 4JQ8A 4FVRA 4EOLA 5IEVA 5A4CA 3AGMA 3RALA 2VO7A 4UWBA 3AD6A 1PMVA 4E4LA 3IW7A 4JQEA 4ASZA 4DCEA 1QPJA 4FV9A 1ZYLA 2OSCA 4ZXTA 4C37A 4QT1A 2XNBA 3OWKA 2GCDA 3F61A 2VTAA 2QURA 3VUDA 3QXPA 4Y83A 4S30A 5JT2A 5FDXA 3ORKA 4ACDA 4O7NA 1F5QA 2VTOA 2YIYA 4JBQA 2QOHA 4O6LA 4UBAA 4AAAA 4BDCA 5LMKC 1H27A 4U3YA 4EEVA 5D11A 4AN2A 4H39A 2O64A 3MB6A 3VS2A 4MD9E 4ACMA 5M57A 3O7LD 2WTCA 4A06A 4HW7A 3AKJA 3R0TA 4OTFA 4R3CA 2QNJA 4I6HA 1RQQA 5AP1A 3NFFB 3R7OA 3RPYA 4RMZA 2CN5A 3S2PA 4N57A 5GJDA 3ZONA 4C4EA 4LV8A 3PPKA 1MRUA 4K33A 4ZK5A 3BHYA 5I9VA 3DNEA 5FD2A 2XH5A 3DPKA 5AV2A 4RC2A 3G9NA 3CE3A 2OJFE 4D5KA 3EQCA 4AGWA 4P7EA 2C0TA 3C4EA 3FHIA 3DKGA 3QZFA 4DDIA 5DBXA 2PMLX 3HRFA 2ITYA 3KXNA 1H4LA 1KE7A 3LMGA 4KIOA 2C5OA 4GL9A 3KXMA 3LCOA 4FEXA 3A7GA 5KNJA 5HCXA 4E1ZA 1XBCA 3R7YA 3R8LA 3IW8A 5M51A 4O96A 5ANJA 5KE0A 4LG4A 4QMUA 2UW7A 3TIYA 3UZPA 3TNQB 3RMFA 2DUVA 5ANEA 2H6DA 4R3PA 2PPQA 3I5ZA 1JKLA 4CKRA 4GVJA 3SG8A 4JL9A 3HVCA 2VO0A 3QTZA 2H34A 3EN9A 2X9EA 1BI7A 2PMIA 2B0QA 4C02A 1STCE 2QOCA 3PJ1A 3DBQA 3II5A 4JOAA 4P4CA 5AP6A 3MBLA 1OIYA 4M0YA 4FEVA 1ZYCA 3KIOC 4MXXA 3FMLA 3WYXA 5AEPA 4EH6A 3P7AA 4RX5A 3R1SA 5DVRA 4BI2A 4NTTA 3NYOA 4YJOA 3C4ZA 2J5EA 3PRFA 2W5HA 3QHRA 4E4XA 1P2AA 1A48A 4YPSA 5DFPA 5HVKA 3Q9XA 3Q2MA 4EJ7A 3IK3A 4FL1A 2UZEA 4AN9A 2JKKA 3FLZA 4KINA 1ZYSA 2WQBA 3FL5A 4UN0C 4O86A 3FMJA 4N6YA 3R30A 4BCJA 3DB6A 2X2MA 2PUPA 1XJDA 2C6KA 3GT8A 4FZAB 4QMOA 3UDTA 3QRJA 3IS5A 5EDRA 3IW5A 5CAUA 3ANQA 4CZUA 4EOQA 4O2PA 3EN5A 4JR3A 3V5TA 1PMEA 3L8XA 3O50A 3C4CA 4E6CA 1Q97A 2WU7A 1LPUA 3IONA 3AD5A 3AC5A 1W8CA 3KULB 3MJ1A 1H26A 3OVVA 4KBCA 1SMHA 3U87A 4DN5A 2X8DA 5JMSA 4I4EA 4EH9A 2ETKA 3AMYA 5CSVA 3PDTA 4XNEA 3MVMA 3UPZA 4QP4A 3V5PA 4R5YA 5IG1A 3SV0A 2X9FA 2E9NA 4FKIA 3ZUTA 3MGYA 1ZARA 3ACKA 3BLHA 4ASDA 3QXOA 3W33A 2JDTA 4S32A 3W2CA 4F4PA 4PP9A 3V6SA 2XARA 3FEGA 5JGDA 1H25A 1XO2B 3HMNA 1IR3A 2J2IB 4DEHA 4DGLC 4EOSA 5KMNA 4RX9A 2ZV2A 3VULA 4C62A 2BIYA 3PSBA 4HOKA 2V0DA 2C1BA 4G6LA 2XZSA 5BX0A 2P33A 4RJ3A 5LVMA 3RPOA 4BYIA 2YA9A 3RM6A 2BUJA 4C35A 1NVRA 2R3KA 4FA2A 3H10A 2PU8A 4H3BA 4V0GA 5ACKA 2XCKA 3R71A 1FPUA 5EI2A 2HELA 1J91A 5JGBA 5HQ0A 3CD8A 3FPMA 2XJ2A 4JDKA 3VBYA 4BCHA 2HENA 3W2RA 4TWOA 5HE2A 5CAPA 3P5JC 4FYNA 4AAYA 3VF9A 4L3PA 4HZRA 1U4DA 4ZS0A 2ZMCA 3WZDA 5HICA 3TNHA 4BCOA 4FV2A 5IQFA 2ZB1A 2RKUA 2VZ6A 3GXLA 2Y4IC 4PTGA 4RLLA 5AADA 3QL8A 5LQFA 3UO6A 3P86A 3EQRA 4J96A 1H0VA 3OF0A 5CQUA 3FDNA 1P5EA 4MUQA 1OPLA 4DC2A 2C68A 4L67A 2B54A 3FLQA 2FSOX 1OKVA 3NAYA 4F09A 4LQMA 5HX8A 3U6IA 3UOLA 4NSTA 4D2RA 5K4JA 3ZLXA 1KOBA 2VTNA 2B52A 2BRMA 4ZOGA 3QZIA 3QTRA 5ANOA 4GT3A 3R28A 4GG7A 4K9YA 5HD7A 3SKCA 4ENYA 5BV3A 3Q6UA 1ZY4A 4F99A 3BU6A 4CQEA 1BMKA 4DG3E 2DQ7X 4O0YA 3R7UA 4HGLA 3S4QA 3WZKA 3D7TB 5KUPA 2VTQA 2RF9A 4HVHA 3OD6X 4J53A 3ULIA 3Q9ZA 2C6IA 4AT3A 4RX8A 1H08A 4YMJA 4QRCA 4M8TA 2J9MA 3H30A 2XF0A 4YPDA 4RJ6A 4CV8A 4O7TA 4E8AA 3NWWA 5CXZA 2QOBA 2UZUE 3W2SA 2OF4A 2BDJA 2W1EA 2YAAA 4U79A 3ZLWA 4CT2A 5LWNA 3DGKA 4WRGA 1J1BA 4PV0A 5C01A 4BYJA 3NX8A 4FT7A 4PQNA 3V5QA 3S00A 4O22A 5D10A 3TYKA 2JFLA 4MXOA 3L9NA 4MX9A 3LM5A 5HX6A 3V6RA 3NAXA 1P4OA 2CCHA 5E8VA 4GMYA 2JKOA 3BGQA 3KC3A 2BTRA 3ZZWA 2X6DA 4I6BA 2WXVA 2PVKA 3AT2A 3D5WA 5T68A 3EFKA 4KIQA 4OUCA 2VNWA 3VJOA 4B9DA 5C26A 3F7ZA 5CF4A 4RJ5A 4GJ2A 1L3RE 2ZDTA 3VHEA 4AT4A 5M4IA 3ROYA 3RNYA 4GKHA 3H4JA 3LFBA 5J8IA 4TL0A 1FGIA 1GNGA 1M2QA 3FQEA 4PF4A 1MQBA 1ZYDA 1SVGA 4FV3A 4NL0A 5EM8A 5IQBA 3VHKA 5I9YA 5IUHA 5L8KA 3O2MA 1HOWA 3DXQA 3FI3A 4M14A 4YTCA 4EK6A 1UWHA 3TDVA 1OIRA 4F9BA 2EU9A 4O0XA 3DB8A 1W83A 4LI5A 5DHJA 3RK9A 4E26A 3EQIA 1YI6A 3GBZA 3PG3A 3QWJA 3PY0A 3RWPA 3E92A 3UGCA 4AS0A 4OT6A 1QCFA 2J0IA 4F7SA 1CSNA 3NFGB 5LJJA 1H8FA 4EH4A 3TTJA 4ZLOA 4H1MA 4FTJA 2ITOA 4FSUA 1E1XA 3B8QA 3EN7A 1NXKA 3NUPA 4XH6A 3C0GA 2NO3A 5HEZA 3F82A 4I3ZA 4U0IA 3W2OA 4EOPA 3CY2A 3QCXA 4DHJA 4AE9A 2VTMA 3EKNA 3LM0A 4AW0A 4AZEA 1Y6BA 2XRUA 3C4FA 1OM1A 3QQLA 5CSWA 1OECA 2VWIA 5LVOA 1OL1A 1U5QA 3A8WA 5FXSA 2YEXA 4IIRA 3WILA 4JBVA 2C3KA 3W32A 1TQPA 3KMWA 3POOA 4I93A 3DQXA 3R9DA 4HGEA 4TNBA 3EN4A 4OW8A 5AV1A 4I92A 1R0EA 3D94A 4DEIA 1FGKA 3LJ1A 1Q8TA 2R2PA 2XA4A 4S31A 5AJQA 4O0RA 3FV8A 3MY1A 2E2BA 1NW1A 3GFWA 3HYHA 4JI9A 2BKKA 4JIAA 3BRBA 4C59A 4I5CA 5M53A 3D15A 1V0BA 4F9CA 3NVMB 1REKA 5E8XA 3Q9YA 4BDDA 3JS2A 2OKRA 3GUBA 5CASA 1QPEA 2PZYA 4P5ZA 5BUJA 5L2SA 4CT1A 4XP3A 2XUUA 4NTSA 3TWJA 3SXRA 5CT0A 2G1TA 2R3QA 4QO9A 2BKZA 4I0RA 1QPCA 3R73A 4DGOA 4BDGA 3FL4A 1OVEA 4TXCA 3PA3A 2HK5A 1NVQA 3U54A 3DBDA 3UVPA 2I0YA 3OW4A 4RG0A 2AEGA 4UXQA 4UX9A 4L00A 3ODYX 3EN6A 3NIZA 5JEBA 3MPTA 4FKQA 4D4YA 2HCKA 2PULA 4YHJA 2IZSA 5EHYA 4QQCA 2BVAA 4G9RA 4ID7A 3SG9A 5DG5A 3MV5A 3UODA 4X7QA 3FKOA 2JC6A 5E1SA 2VWUA 4XV3A 2W96B 3RPVA 1BL7A 3GC7A 3LXLA 4FEUA 2Y6MA 3I0OA 4IAYA 3TCPA 4BCMA 3R02A 5IU2A 3RK5A 4O0TA 4KKGA 2QD9A 3IOKA 3ZRMA 3SQQA 4BDFA 2RL5A 4YJQA 4ALUA 3NYVA 4FIJA 2UW9A 3DXNA 5IA1A 5IH6A 4BCPA 2BFXA 3DKOA 3EZRA 3LXPA 2VTPA 2REIA 2QI8A 3HMOA 2NRUA 1M52A 3BI6A 3KXGA 5DR2A 1SVHA 2QOOA 3LFEA 4AOIA 5GIOE 1OGUA 3FI8A 3QQKA 3VAPA 4RA4A 3BU3A 4CZTA 3GB2A 2WTVA 5GJGA 4FZFB 5EKNA 1FVRA 3G0FA 4D1SA 1S9JA 4F7LA 3RPRA 3GCQA 1Y57A 2X39A 3MN3A 3KB7A 4DFYA 1TVOA 4KUJA 2EUFB 3K3JA 3Q4CA 1U46A 4LGHA 5AP3A 1DAYA 2WMRA 3UJGA 4QP7A 3T9IA 4KIPA 3LFAA 2C69A 3HX4A 4R3RA 4RIXB 3PJ3A 2P4IA 4G2FA 1WBPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite