4EJ7 | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	270
structure length	270
Chain Sequence	SHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYRWARDNVGQSGATIYRLYGKPNAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-guided optimization of protein kinase inhibitors reverses aminoglycoside antibiotic resistance. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase AphA1-IAB
molecule tags	Transferase
source organism	Acinetobacter baumannii
total genus	81
structure length	270
sequence length	270
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 2.7.1.95: Kanamycin kinase.
pdb deposition date	2012-04-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01636	APH	Phosphotransferase enzyme family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4ej7A01
3.90.1200.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	4ej7A02

3ENMA 1I09A 4ONAA 5C27A 3OXIA 4BR3A 5KNJA 2ETRA 3L9PA 3AG9A 2GQRA 1KE5A 4H1MA 4R1YA 3BU6A 3Q6WA 3R0TA 5AIKA 3MIAA 4DEIA 2BTRA 2OLCA 2YIXA 4F9YA 3S1HA 3CD8A 3FZTA 4O0SA 2QOCA 3PYYA 5DWRA 5CZHA 1PXIA 2QO2A 2OGVA 2PUUA 3DXQA 3Q9WA 4YHJA 5CAPA 4OTQA 4MBJA 4EK8A 1ERKA 3A99A 3WF9A 2Y4IC 4IZYA 2B4SB 4L53A 3R30A 3VULA 2C6IA 3SC1A 3NNVA 4DFNA 3HEGA 2VNYA 3ZRLA 3M2WA 3RAIA 1E1XA 4L00A 5A54A 3AOXA 2CNUA 2VTMA 4K11A 5DRDA 5KUPA 4RRVA 2GFCA 1REKA 4A07A 5HNBA 4RA5A 1CKPA 4YJRA 4QYFA 3FMHA 3BLRA 4DFYA 3SD0A 2ZVAA 4OBQA 2PZIA 4LYNA 3A7IA 4M0YA 2V7AA 2B7AA 2F7ZE 3CTJA 4UYAA 4L3PA 3AMAA 3QQLA 4L7FA 3TNWA 5AP0A 2ETMA 1XJDA 3KXZA 4A9RA 3HVCA 4IFGA 4M69B 4C62A 2P4IA 5KMJA 5FTOA 4R78A 2ZOQA 3AC8A 3GOPA 4D28A 4E26A 3UVQA 2YWVA 5AP4A 4GT4A 5AUZA 3T8OA 4K18A 5EDPA 4JAIA 2PMIA 4BDFA 2PE1A 1M14A 2WQOA 3W0NA 3KK8A 3PVGA 4RVTA 3JY0A 3D5XA 4GUBA 4K0YA 4ALUA 3RMFA 2Y4IB 2VWXA 5E8TA 5A4QA 3CTQA 2EWAA 5L6OA 4TYHB 4OT6A 3RVGA 5CZIA 3R21A 1HCLA 2R5TA 3BZ3A 1H1PA 2WOTA 3GCQA 2JBOA 4G5PA 5ITAA 4HNIA 5FXSA 1U46A 3RP9A 4FTTA 5CTPA 3MFUA 2E9PA 3H0ZA 4UY9A 5AAEA 4EJ7A 4UALA 5EOBA 4CMTA 3I7BA 5HE2A 1W82A 3PSDA 4R3RA 2X2LA 3DDQA 3TT0A 2X1NA 2PVLA 3UO6A 5IA2A 3E93A 2WELA 4I0SA 1HCKA 2WTDA 4BHNA 3A7GA 3F3TA 1ZRZA 2J9MA 3ZH8A 3V6SA 1OUYA 4WBBB 1JBPE 3GCSA 5L6WL 3ZRMA 4G17A 4O7VA 3FLWA 4YHFA 4RA4A 2VTRA 2IG7A 3DT1A 4E4LA 5IH4A 5LVNA 3QRKA 2YERA 2C5XA 4IAAA 4FI1A 5E8SA 3KN6A 2HW7A 3ZM4A 2YM3A 1OVEA 3V5TA 4AZVA 4F7NA 3D14A 2OIBA 4XG2A 2A2AA 3U6IA 4YJOA 3QC9A 4ZS0A 5B0XA 4BBEA 5AEPA 4BKJA 4OBPA 5CSVA 4L3LA 4F08A 3UQCA 2P2HA 4E4NA 4M7IA 4YGAA 2W5AA 4PNIA 3DFCB 1OMWA 4YNEA 3WIGA 4D0XA 2GDOA 3P78A 4XBUA 3Q9YA 2BRBA 2C1BA 4KBKA 2WTKC 4FIJA 2ITUA 4DTAA 3ZS5A 4MNEA 3FY2A 2R9SA 5EM7A 2GU8A 4HYHA 3ACKA 3QUDA 5EK7A 4XMOA 4U3ZA 1YXUA 3G0FA 5C01A 2UZDA 4TYEA 4UX9A 2IPXA 4V01A 4DINA 3C0HA 3Q9XA 1E9HA 2OIQA 4QP3A 3NUXA 5KMKA 2I7QA 2XNOA 4U45A 1YDRE 3SKCA 4XOYA 2CPKE 3PLSA 3PVUA 3KGAA 3FZRA 4PUZA 3RCDA 3KEXA 3A62A 2QKRA 4NWMA 3TNQB 4AF3A 1VZOA 5KMMA 3EFKA 2BALA 3OXTA 4WUAA 4O0TA 4NYEA 5HCXA 1YWVA 3OWJA 3L9LA 2UUEA 2R7IA 4L67A 4W8DA 4ZSAA 3NS9A 1KE9A 4NM0A 3KXGA 2ONLC 2HAKA 3ERKA 3QRJA 5CQUA 5C26A 2UW7A 4A9YA 4ZZOA 4E1ZA 3DDPA 3OW4A 4I3ZA 4EWQA 2G1TA 4JR7A 2WTKB 3TJDA 3P1AA 1UV5A 4QTDA 4EK6A 4FV5A 5AM6A 3UC3A 3DXNA 2BVAA 3MA3A 4GVJA 4ZXTA 4WA9A 1W84A 3DJ6A 5EW8A 3CY3A 4UWYA 1JSVA 4GG7A 4XRLA 2X7OA 3HZTA 5TKDA 4LOOA 4FTIA 1SZMA 2JKQA 4U97A 5DFPA 1B39A 5GJDA 3V3VA 4QMZA 2F2CB 4Y85A 3UO4A 3QYWA 5KCVA 2FYSA 2ZB1A 2J6MA 1H01A 2B52A 3R8VA 2XS0A 3Q53A 3KMMA 3MH0A 1AGWA 4CG9A 3OOMA 4EOJA 4J8MA 2UV2A 2E9OA 4TWPA 3RWPA 5A46A 5CU3A 4KAOA 1WBVA 5CU2A 5TO8A 4E6DA 2FB8A 2Q0NA 3ZU7A 3EKNA 4I1ZA 2YDJA 2VWBA 4FNZA 3DKOA 4FUXA 1WBWA 3W2RA 2F9GA 3PIXA 3FMLA 2VTLA 4MD9E 4O38A 2PUPA 4P5ZA 5LVMA 3BHTA 4OTFA 5GINE 3QUEA 4FK3A 3EZRA 4BRXA 4DBNA 3S95A 2QONA 1QPEA 3KK9A 2OWBA 1OKZA 4B0GA 4H3PA 3LMIA 4ZSEA 4MCVA 4KKHA 4QMXA 5CI6A 3ZXZA 2XK7A 4DBXA 2UW0A 4QYYA 3JR1A 1G8SA 5M56A 3FC1X 3C5UA 5K9IA 5FGKA 4ZTHA 1PRYA 3F88A 1R3CA 2Z7SA 3NUNA 2WQMA 2BIYA 3BGQA 5E8XA 4UEUA 4PDYA 2PWLA 3E8DA 1U5RA 4LGGA 2HZIA 3QGYA 3DAKA 4A4XA 1J7LA 2GHLA 2HYYA 4RIXA 3FKNA 4Y83A 3SLSA 4WSYA 3UPXA 5L2TA 2WIPA 4RJ6A 5IEXA 3OP5A 4CTCA 3AGMA 5L2IA 4X2JA 3TZ9A 1FVTA 5BVWA 3C13A 4BDCA 4RFMA 3ELJA 3F9NA 3PY0A 2IO6A 2WPAA 3H0YA 1P4OA 3HUBA 3GBZA 2XKDA 3Q32A 5CI7A 4IVCA 4U81A 3HRCA 2OO8X 2W1FA 4FV1A 4AE6A 2BZJA 3WE8A 2OZOA 3UIXA 4FSRA 3VS1A 2PVFA 3P9JA 1TQPA 5EI8A 2RL5A 4EYJA 3AT3A 4U98A 2C69A 2C47A 3GI3A 3BWJA 3AT4A 3HMMA 3ZO2A 4XS2A 5FEEA 3VHEA 3P86A 2FSMX 2VO6A 1J7UA 1H27A 1A9UA 1VJYA 3CQEA 3NAXA 4FYOA 4CFUA 2HXQA 3DNEA 5CQWA 3BKBA 3NUUA 4HVDA 3GU4A 3PFQA 3MBLA 5CWZA 1UA2A 4YSMA 3AD4A 4ZTNA 3UOKA 3P08A 3IPHA 1OPLA 3GQLA 3LQ8A 3EQCA 3PWDA 4XLVA 3I81A 5ANKA 3RPVA 4U8ZA 3HMPA 3R8ZA 4UWBA 2IVUA 1TQMA 2O65A 2WU7A 4RMZA 4E6AA 2PU8A 5AUYA 4CV8A 5CF5A 5T3QA 2H96A 2PMLX 1JNKA 2CN8A 2DWBA 2UZTA 4FVRA 2ZM3A 5AADA 1H0VA 1WBPA 5FRIA 5J1VA 1GJOA 3OEFX 2XBAA 2XIYA 4JRVA 2NNWB 4X3JA 5DR9A 4IVAA 4DEAA 4C38A 3O2MA 2UW6A 4J99A 4PTEA 4LUEA 4K1BA 3NRMA 5AV2A 2XRUA 3MIYA 3NUYA 1Q4LA 5C9CA 3CGFA 4AUAA 4NK9A 2VUWA 1KSWA 2XNNA 3EN6A 3KREA 3OUNB 4YBKA 4CMOA 3SOAA 4EOQA 2P33A 3F82A 3NNXA 1S9JA 5EI6A 5A6OA 4IB3A 3QLFA 2B9JA 3LCOA 5F20A 3FPQA 2W1IA 1BMKA 3TKHA 3ZO1A 4FV2A 4ANQA 3VS0A 2WMAA 4FK6A 2BZKB 3VQUA 4O91A 5IA4A 1OKYA 3A7JA 5FDPA 3PUPA 4CLIA 2AC3A 4CCUA 3UIBA 3OT8A 5I9XA 5L3AA 4AA4A 1U4DA 4NKSA 2WXVA 2JIIA 2UW5A 3O96A 4FGBA 5JZNA 3V6RA 5H2UA 1CM8A 3PPJA 4C3RA 2LAVA 4ANBA 2QU5A 4AZEA 5IH6A 3L1SA 4DFLA 1KE8A 1DAYA 4RX9A 5LMKA 4I4EA 4WHZA 3A4OX 5DEWA 3OCTA 5CENA 3EWHA 3NSZA 4BGGA 5I9UA 2HCKA 3HP2A 5HZNA 3FI2A 4AU8A 2JLDA 3ORNA 1BKXA 4TRLA 1MRUA 3AD5A 1BX6A 3BQRA 4NIFB 4ANLA 3P7BA 1SVHA 4LOQA 5EG3A 4FEWA 2YIWA 3DCVA 2OF4A 4I0TA 4PL4A 2UZEA 3G5DA 2QKWB 2AUHA 4QMSA 1VEBA 4AG8A 2IZTA 2W5HA 3HV6A 4IACA 3OZ6A 3Q6UA 4IZ5A 1RJBA 3W2PA 4IZAA 5F94A 2OXXA 3WBLA 3SRVB 4ALVA 2QOHA 4KA3A 3WZJA 3MV5A 2J5EA 1SNXA 5HI2A 3S0OA 3K2LA 5JFSA 3NCZA 2W1HA 3UC4A 3U6JA 1IASA 2I6LA 2XK4A 2CLXA 2XNBA 3DLZA 3G2FA 4FC0A 2CNVA 4YJVA 2Z7LA 2R3QA 3MFTA 1OZ1A 5GIOE 4CD0A 3W2QA 3VNTA 2VO0A 3G15A 4RZWA 1EH4A 2A4LA 1OPKA 4UB7A 4HYUA 4QMVA 5FBOA 1FVRA 1LP4A 2OJ9A 3D5VA 4FTQA 3BYMA 1YXSA 2XK3A 2W9ZB 2GS2A 2YIYA 3HMIA 3KCFA 2G15A 4IJ9A 4IZ7A 4IWPA 4YPDA 1LEWA 4BGHA 4FTAA 3PA3A 4HPUE 5D9HA 5I0BA 2W4KA 1OL2A 1YKRA 3BV3A 5EHYA 4APPA 4RIWA 4DITA 3MFSA 5GHVA 2HIWA 1Q5KA 3S4QA 3FSFA 1QCFA 2XM9A 4BIDA 4IM0A 3PLAE 4LV5A 5ETCA 2CNQA 3NEWA 2GMXA 3R1SA 2IVSA 3BYOA 4PMTA 4EI4A 3E92A 3VW6A 3LQ3A 4FTMA 2X4ZA 4BI0A 2QR8A 3E3BX 3LFDA 2OH0E 4MQ2A 3IW4A 2REIA 4LRJA 2QCSA 4IX3A 1GY3A 1PXOA 4NL0A 4BBFA 3CXWA 3DK7A 5B7VA 1JQHA 2HZNA 4R3CA 3ZOSA 5BUIA 1M17A 2QODA 4O0RA 3RCJA 4BCFA 2WAJA 4UYNA 4HVHA 5K5XA 4QTCA 4HW7A 4BVUA 2E9VA 4EH3A 1FPUA 4DGGA 4II5A 3FMMA 4HYIA 3D7TB 3LFFA 4B6LA 5CU0A 1PXLA 3IOKA 4JG6A 4DLIA 4F1TA 4FTRA 3D4QA 3MVLA 1PXPA 1XR1A 4XRJA 3SXFA 3O0GA 5JK3A 3MW1A 3QYZA 3TV7A 3HLLA 3FXWA 2UZVA 3DZOA 5GNKA 4J96A 4O7OA 1UNGA 3M1SA 5CSWA 5IQGA 5IZFA 3TUCA 4G34A 4MHAA 2ZM4A 5IQAA 3V51A 4R7BA 4JQ7A 2RG5A 3AC1A 2W1ZA 3OXZA 5KBRA 4GKIA 4R7HA 1GNGA 3IG7A 2ERZE 4O7PA 3FI3A 3ZCLA 4RWJA 1X8BA 1XWSA 3FV8A 5H8GA 1NVQA 1OL6A 5FDXA 1P5EA 3MJ1A 5FP6A 2BDFA 3KMWA 2BFXA 4X6RA 4O7SA 3PZHA 3BCEA 3GENA 3NYNA 4F0GA 4Z7HA 5B2LA 5EHLA 3CJGA 3VBQA 5FXQA 1XH4A 3KRWA 4Y73A 4AW1A 3QX4A 4DGLC 1XQZA 3R8LA 5HBJA 4MTAA 4U44A 5EKOA 5LOHA 1XBCA 3P5KA 4BCIA 4BC6A 3EOCA 4ALWA 1P4FA 4YHTA 3R7IA 3U6HA 2CHLA 4WKQA 2VWVA 3SX9A 3VUDA 4N4SA 4X2KA 5E91A 4ITJA 3WZUA 5FQDC 3IDCA 4AOIA 2ZDUA 4FTUA 5E90A 3V8WA 3JUHA 3W33A 4ITIA 4F0FA 3FEGA 2OZAB 3P79A 4NFMA 4DAWA 5A4EA 5TT7A 5BYLA 3ZM9A 2FVDA 4O7NA 2VZ6A 3TCPA 4EHZA 4ASDA 5M51A 3GP0A 1Y6BA 4IAZA 4FEVA 4JRNA 4WNMA 4D4RA 1BI7A 2R4BA 3KRXA 4O7YA 2WGJA 3D9VA 3JYAA 5HVKA 4TWOA 5I4NA 3RALA 2RFSA 4IAYA 3I0OA 4IH8A 4FKGA 1OB3A 4U94A 3II5A 4G6NA 4XOZA 4YTFA 1PY5A 4RJ3A 2ZV8A 3B8RA 1PF8A 3BHUA 1V0BA 2XKCA 3QWJA 2XNPA 4G3CA 3RWQA 3ZC6A 2C6DA 4JIKA 4AWIA 4O0WA 2UVYA 4D5KA 4DEEA 4EOMA 4I0RA 4EBVA 4F9AA 3D15A 3OG7A 4YC8A 3V5PA 3MVMA 2J4ZA 5IA3A 5E8UA 4ZLZA 1LUFA 5T68A 3QZHA 3HV5A 4KRCA 3CQWA 1YRPA 3FPMA 4CFMA 4KBCA 5DLSA 3LCSA 4GL9A 3BWFA 4CFNA 2CDZA 4IM2A 4RLKA 3W0SA 3GNIB 4FNWA 3G6HA 4D58A 5HHWA 5KZ0A 5F9EA 1G8AA 4RQKA 1P2AA 3PWYA 5HESA 3LFEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DDG A;  2BTS A;  4JBV A;  5HEZ A;  2QU6 A;  1ZYJ A;  3SG8 A;  3C4X A;  3EQI A;  2O8Y A;  2WMQ A;  3UVP A;  2PK9 A;  2X2K A;  4BDD A;  5A4C A;  4YZM A;  4EC9 A;  4DH3 A;  2YCR A;  5AX9 A;  2WMV A;  5BX0 A;  2YDK A;  3VS5 A;  3EQD A;  4NCT C;  3EQP A;  3PA5 A;  5EM6 A;  4QQT A;  5BVD A;  5E92 A;  5JZJ A;  4GMY A;  5DR2 A;  3QQK A;  5CY3 A;  4EJN A;  2WTW A;  3P7A A;  2BRM A;  3LM5 A;  4H1J A;  4OW8 A;  2BZI B;  4YLK A;  4HOK A;  4XLI A;  3U9C A;  3T3U A;  3QTZ A;  4B4L A;  4IDV A;  4DHZ A;  3NNW A;  1FBN A;  4HGS A;  2HWO A;  4CGA A;  1W0X C;  5J9Z A;  3KF4 A;  3ANQ A;  4CTB A;  4ZTL A;  4QP9 A;  3SVV A;  4BB4 A;  2JDS A;  3PSB A;  4NUS A;  5DA3 A;  3NYV A;  3REP A;  3R01 A;  4GFM A;  4AZS A;  2H34 A;  3CIK A;  2YZA A;  1R39 A;  2GNH A;  3LLA A;  4MX9 A;  3D83 A;  3O17 A;  2RF9 A;  5EOL A;  5TOZ A;  5BUE A;  1JKS A;  4EH2 A;  4NJD A;  3DAE A;  3QTQ A;  1K9A A;  3DPK A;  4JNW A;  4EH6 A;  5CAU A;  1U59 A;  4QP2 A;  4BCK A;  4O84 A;  3UE4 A;  5M4U A;  1JOW B;  4JBO A;  2AYP A;  4G1W A;  2A27 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EJ7A

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations