4AXDA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase in complex with amppnp
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
434
structure length
433
Chain Sequence
MEMILEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRNDKAIKNSNGVVSVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLARVNAANVDTSHDSALILNDHSLFSQGITSGGDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENMLKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSEDGHRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICREGRPLEAELSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSRNAWDSEPGDYVSLKPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational Changes Undergone by Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase Upon Substrate Binding: The Role of N-Lobe and Enantiomeric Substrate Preference
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords INOSITOL-PENTAKISPHOSPHATE 2-KINASE
total genus 141
structure length 433
sequence length 434
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4axdA01
2XAOA 4AXFA 2XARA 4AQKA 4AXCA 2XALA 4AXEA 3UDSA 3UDZA 2XANA 4LV7A 3UDTA 2XAMA 4AXDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EW3A 3PPZA 3F2RA 2YWPA 3I0QA 4BN1A 3R22A 2WIPA 1OBGA 3MY0A 4ALWA 4TWNA 3CP9A 2PVYA 4GK2A 1YI6A 4RVKA 4CEGA 3SXSA 5IA0A 3W55A 3VUKA 5BVNA 5CZHA 2YM3A 4FL3A 3CQUA 3TG1A 1TQMA 2VTJA 4QYFA 3ZEPA 4M97A 3POOA 3R28A 3LJ2A 2QCSA 4Q9SA 5IA4A 3EN6A 4AAAA 1GZNA 1YXXA 2X7OA 4ZS0A 3ULZA 4J53A 2WPAA 3VBYA 4JR3A 4FZ7A 3LLAA 5JK3A 2GHLA 3B8RA 3F5UA 3NIZA 5AP1A 1H1RA 5AX9A 4C4EA 2QC6A 2WMAA 4CKJA 3G15A 2FGIA 5FQDC 3K5UA 4FIEA 1CKJA 3IOPA 3OUKA 4I1ZA 4BDKA 4YO4A 2SRCA 3TV6A 5LMAA 5IH6A 5BV3A 4UV0A 2QLQA 3OXIA 4I0TA 2JAVA 5FEQA 5KKRB 1K2PA 3BL9A 2UZNA 3A4PA 5CU3A 2GS2A 5I0BA 3ORMA 5IPJA 3SKCA 3Q2JA 4YJVA 2WMUA 4HGLA 5AEPA 2QOKA 1J3HA 1NXKA 3N51A 1RJBA 2VTNA 3MGYA 4AT5A 2UZOA 3BYUA 4JX7A 3R7VA 5HCZA 1PMEA 2Z02A 3QYZA 3TDWA 1SNUA 3N9XA 5EDQA 3T9IA 3GGFA 4LYNA 3DLZA 3F66A 1MRVA 4QMOA 2E9VA 4O6EA 4L42A 2YCQA 4NL0A 5DNRA 4YU2A 2YHVA 3PXRA 5FXRA 3E64A 3QZHA 4JRNA 4CFWA 2UZVA 2G9XA 3MH0A 4XG6A 5ETAA 4EORA 1WBPA 2BZIB 3F88A 3ZM4A 4FV8A 2X6DA 2W06A 3FI4A 1PXKA 3TIYA 1PMNA 4LG4A 4C59A 4FSNA 2VWVA 4K33A 5CNOA 3VBXA 4IIRA 2ZAZA 4FZDB 3SRVB 3QUDA 5H3QA 2R3OA 4GS6A 3ORPA 3RPVA 1GZ8A 2H96A 4RZWA 5JN2A 4IX6A 3FKLA 3I7CA 4BCKA 3JPVA 4GFMA 4Z7GA 4Y46A 3ORIA 4DH1A 3PE2A 4EC8A 4G9CA 3MH1A 4UWBA 3MS9A 4I20A 2V7AA 3OEZA 2HW6A 1P4FA 5IQIA 2E9PA 4QMVA 2XS0A 3IGGA 4I0RA 4JQ7A 2DQ7X 5F9EA 2ZM1A 3R7EA 4NTSA 4FIJA 5BUEA 3EN9A 4BGHA 2YM7A 4AN2A 4WRSA 4CLJA 3AOXA 4AGWA 4ASXA 4E7WA 2VV9A 3IK3A 4ZTRA 4O7TA 3RJCA 1OIQA 2FSTX 3QZGA 3LCDA 2ITWA 2CCHA 3AXWA 5C8MA 4DGLC 3TUBA 2HOGA 3DY7A 4J99A 4QTBA 3IPHA 1L8TA 4OBQA 3D83A 1G8SA 2R3JA 2R3RA 3U4WA 2KULA 2W7XA 1XH9A 4ANBA 4G6OA 3MI9A 5M57A 4F7NA 5L3AA 4IAZA 4QT1A 3ZZEA 5C01A 1TKIA 4F6WA 3DU8A 1Y91A 4PX6A 3UYTA 2OIQA 4IJPA 1WBOA 4DA5A 4D5HA 4MHAA 5AP6A 4CT1A 2I0YA 1XMMA 2A19B 3BL7A 4PQNA 4FVPA 4ASEA 4YJTA 3MPAA 4ASZA 3SA0A 2DUVA 3TWJA 4CD0A 3V01A 4QP7A 3RAKA 3HRFA 3U6HA 4FE2A 2WQOA 4FTCA 3PWYA 3LOKA 2HWOA 3CY3A 3NZ0A 4E26A 3HAVA 2VO0A 4FUYA 2OW3A 4BDCA 3MESA 4E6CA 4IVDA 4EZ7A 3QXPA 4CKIA 1TFFA 4RG0A 2OF2A 2IVUA 2XF0A 4XOYA 3CS9A 1OL5A 3P23A 2WMRA 5J9LA 3KIOC 2WQBA 5DT3A 3KK8A 3PXZA 4YHJA 3GVUA 5AM6A 2VTRA 5FRIA 2QOHA 1JBPE 2BRHA 2PU8A 1NVRA 4OTHA 4WG3A 3TL8A 2G2HA 1H8FA 2W9FB 3DK7A 3Q3BA 2BKZA 4YUQA 3OT8A 4Y8DA 5E1SA 3MH3A 1JQHA 4YJPA 5B7VA 4GH2A 2UZDA 3L8XA 4IVCA 4Y95A 1WMKA 4KIOA 2FH9A 3TZ7A 1ZAOA 3OCSA 2XJ0A 3PZEA 3F7WA 3EFWA 3ULIA 3VHKA 2CN8A 5KE0A 3RVGA 4DEHA 3RWQA 3BWFA 4YC3A 4W4YA 3UNZA 2W9ZB 3HA8A 5DEWA 1KE5A 3FQSA 3PXFA 1STCE 4ZTHA 2W1ZA 4FIFA 4FYOA 2PZ5A 2W5AA 3MW1A 2XK8A 4C02A 5AV0A 4BDHA 2CGUA 3P7BA 4G3DA 2R3PA 3FC2A 1ERKA 4FV6A 5BMSA 2PSQA 3BYVA 2PMNX 4M0ZA 4O7WA 5FDXA 2W17A 3R7UA 2HY0A 3CKXA 2XJ1A 4PDYA 3GC8A 5K5XA 3POZA 4NTTA 4QMLA 4X2KA 4WUAA 2WQNA 5FXQA 2XALA 3G6HA 3VW6A 4R1VA 3OFMA 1H0WA 1YI3A 3E63A 2JKMA 3LW0A 3F5XA 1U5QA 4M7IA 2UZTA 3F7ZA 5EW8A 3SW7A 3Q5IA 5KZ0A 4HVIA 3H3CA 3BU3A 5FP5A 2ZV2A 2WIHA 3Q5ZA 4DFBA 1R3CA 3MB6A 2QO7A 4KS8A 2PVJA 3DPKA 3DBQA 3JVSA 4FKLA 4MXXA 4CFVA 4RC3A 3TJCA 4LOPA 3PXKA 2QOLA 4RVLA 1P2AA 3F69A 5FM2A 3ZYAA 4FOBA 2C5OA 4V04A 5C27A 3F2NA 4AW1A 2R64A 3VBQA 5EI6A 4EOLA 5CT0A 3KB7A 3LCTA 5HX8A 4KKGA 3GOPA 5E9EA 3NX8A 3Q52A 3UMXA 4R5SA 3V5WA 5KBRA 3FI2A 4HCVA 2ETMA 3EL7A 3FKOA 3W2QA 4M14A 4EOMA 5FLFA 4BCPA 1JSTA 2XYNA 5HIEA 1BI8A 3OS3A 3UOJA 2XNEA 3BRBA 4L67A 4J96A 5FTQA 4Y5HA 3E88A 4LUDA 4U42A 5AIKA 4AN3A 3BWJA 2OIDA 1OL2A 3FE3A 3KA0A 2F2CB 4Z16A 4IZYA 4P5QA 4ZSAA 3UMWA 4YZNA 5C8NA 4RBLA 5CASA 5HE2A 3GU8A 2YIQA 4O0UA 4HGSA 3HV3A 2R4BA 3DFCB 3GUBA 3NIEA 2J2IB 2ITNA 2Y8OA 2Y0AA 3GFWA 5D12A 2QG7A 2WQEA 4RVTA 2FVDA 4OTFA 1NY3A 3KF7A 2X1NA 2ITUA 4B9DA 3KRWA 3KN6A 3C5UA 5IEYA 2BHEA 4MNEA 3UQGA 5J1VA 3MJ1A 4RWLA 3I81A 4JDIA 2IW8A 3ZONA 1QPCA 3BE2A 4K6ZA 3WIKA 3W32A 5AP0A 5KO1A 3BLQA 2C30A 4FMQA 4A9UA 5E90A 2P2HA 4AA5A 4C0TA 4CFFA 4Y72A 4ENYA 4XG7A 3WF9A 4RJ3A 2JBOA 3WZKA 4EOJA 4J97A 4Y83A 4IZ5A 4O7LA 4WT6A 3LMHA 3RINA 3PJ2A 4MF1A 4CTBA 1KV2A 2W1CA 4G6NA 4IB0A 4GYGA 4WUNA 1ZRZA 2X4ZA 3QA8A 2OFVA 4FKOA 3IW8A 3FY2A 4FNZA 1DAWA 4FICA 1H01A 4MD8E 4PDSA 4C58A 3MDYA 3KRRA 4MCVA 4PNIA 4U5JA 3GU7A 5FD2A 5IQAA 2WO6A 5F4NA 2P55A 3VUIA 5ACBC 4DH7A 3ZBFA 4ZAUA 4IAIA 3DK3A 1P5EA 2CCIA 4FOCA 5L2SA 1U4DA 3P5JC 3OBJA 4F7LA 4U3YA 2I40A 4DFZE 2AYPA 4F6SA 5D41A 1ZYLA 2BRBA 4U79A 3C4XA 4BZNA 4BGGA 1PXNA 4KS7A 1A06A 3M1SA 5HBHA 2HZIA 1SZMA 3IGOA 4DCAA 4F9BA 2PZYA 3EN7A 4I6BA 3D5XA 3QAME 1BUHA 3BV2A 1WBWA 5JFSA 4FV0A 3PFYA 4RPVA 3E87A 3TV4A 4U0IA 4EEVA 2B52A 2C47A 2JDRA 3CD8A 2HENA 2JBPA 4C62A 3TNPC 5AUXA 4DEGA 4BVUA 5CU2A 3U6IA 2GFCA 1Q8UA 3GBZA 3GENA 3ODZX 4MK0A 5FG8A 4B8MA 4EL9A 2UVXA 5CT7A 4G6LA 1VLRA 1YOJA 4CFXA 2VNYA 3QX4A 4FKIA 4PMTA 3PJCA 3C4WA 4FSUA 4O22A 3G0EA 3OOGA 4YBJA 3V5JA 5CF4A 1IRKA 3LHJA 5E8SA 4EH2A 2GNHA 5E7RA 2P33A 2P0CA 3MVHA 4QMTA 3F61A 1H4LA 1XBAA 3KXMA 4O0WA 5CAQA 5E8YA 4OR5A 2VGOA 2X8EA 1IR3A 3OW3A 2OH4A 4GRBA 5HICA 3WOWA 4AGCA 4BB4A 1H0VA 2WMQA 3UIBA 1IAHA 4R7HA 1BX6A 3KMMA 5DH3A 5ANKA 3RPOA 2V0DA 3SAYA 2GQGA 1H1WA 3A7IA 5JGAA 2BZKB 2VRXA 1UNHA 4PF4A 5EI2A 3V8SA 4I5CA 1EH4A 2VTTA 4CFMA 3ORXA 2YACA 5EK7A 2WB8A 5FXSA 5L8KA 3QZFA 3PG3A 2YISA 3NUYA 4AAYA 3C4CA 3UOLA 1XH4A 3MVJA 3ZSHA 5CQUA 2BKKA 2VTSA 3AT3A 3R1YA 2Q0NA 3SOAA 5L6PA 4D4YA 3QALE 2YCFA 1OKYA 1TQIA 2ZM4A 3TDVA 2J0KA 1QPDA 3DB8A 4I41A 4M15A 4R3CA 2UZWE 4UY9A 5DGZA 3R7OA 3ROCA 4EBWA 5BPYA 3UQCA 4J7BA 3ATTA 3R02A 3VIDA 1GIHA 1SVHA 4FV3A 3NUXA 5GIPE 1Q8WA 1Q24A 3DK6A 4X3FA 4ZLOA 5L8LA 3GFEA 3NYVA 3ZEWA 3LCOA 2HCKA 4KRCA 5CSHA 4AQKA 1YDTE 3NLBA 4G17A 3DJ7A 4EQCA 5JMSA 5K9IA 3EFJA 2ZV8A 4XH6A 3ZC5A 3QD2B 3O2MA 5JSMA 1REJA 4XRLA 1VYWA 3PTGA 2X7FA 1MQ4A 4ZSEA 4A4XA 3SC1A 4B99A 2C5VA 3BELA 2GMXA 2XCHA 3CQEA 3LVPA 2C1AA 4X2FA 5LWNA 4MXZA 4EI4A 3CC6A 3TKIA 4DITA 4AA4A 5C4KA 4QMNA 3FLQA 1KWPA 3PE1A 4MNEB 2XK6A 3Q2MA 3EQGA 4YZCA 2HZ0A 1Q62A 1ZMUA 4FKGA 4X2GA 3BGZA 3ACKA 3KFAA 3ZTXA 1I44A 3HRCA 2XB7A 4HYHA 5IA5A 2UUEA 3RK7A 4AZSA 5IF1A 5JT2A 2X2MA 4NT4A 4ZS4A 3F3ZA 1BL7A 2XNPA 3U9NA 4D9UA 3KXGA 5IEVA 2GTMA 5ANGA 2PE2A 4KKEA 4CFUA 1WBNA 3TNWA 2AUHA 2F4JA 1HCKA 4R3RA 4X6RA 5AUUA 5BVFA 4DDGA 3MA6A 4JG6A 5CAUA 4XJ0A 3LFCA 5AMNA 5AP5A 5EYDA 1XH7A 4EBVA 4L8MA 4O7SA 5LWMA 5KHXA 4BDGA 3NUNA 2JFMA 1AQ1A 3DAKA 3GNIB 3NYNA 5DHJA 4EC9A 5AADA 3FSFA 3AC2A 4W4WA 2YDJA 3DT1A 5DVRA 3RPSA 3KXNA 3RPRA 4AE6A 4TL0A 3DXNA 4RX7A 3R83A 4OTIA 4QTEA 5CLPA 4Z3VA 4M67A 2OZAA 3W0QA 5KHWA 4CV8A 3O8PA 2JAMA 1WCCA 4QNAA 2BFXA 3D15A 1UU3A 3QBNA 4DT8A 2R5TA 5M4CA 2VO6A 3MTFA 5B2MA 1ZXEA 3HMOA 4AXAA 3PY0A 1UU9A 5AWMA 2UW5A 4FT3A 5HE3A 2CGXA 2HK5A 2CDZA 3D5WA 3DGKA 1J7LA 4MWIA 2IO6A 3O7LB 4FG9A 4BYJA 4O7VA 3PYYA 5AFVA 3LQ8A 1T46A 1OBDA 5HG5A 3UVQA 5B2KA 3G2FA 1JOWB 2R0UA 4DEDA 3ZXTA 1H27A 2ONLC 1UKHA 1B39A 1MRYA 1NW1A 1Y6AA 4L3JA 4YC6A 2WFYA 1KOAA 3MN3A 3N4VA 4GIHA 3W2RA 4KIQA 3CPBA 3FXWA 3I7BA 4GG7A 4O27B 2XK7A 1SVEA 3F2AA 5HNIX 5K5NA 1OIYA 2UVYA 4KSQA 2R3MA 1UNGA 3HL7A 3NUPA 4HOKA 2ACXA 4JI9A 5M51A 2PVLA 3QRKA 4E20A 2WMTA 1RW8A 2JEDA 3W0PA 4ACHA 2Y4IB 1Q8TA 5KBQA 2VWIA 1PMVA 1APME 3ORZA 5FEDA 3HP5A 2UW3A 2VU3A 3PXQA 3OOMA 3LJ1A 4LV8A 3AC1A 4L53A 3AG9A 3OY1A 2R3HA 2W1IA 3BIZA 2W1HA 4JXFA 3UTOA 2W4JA 3PPJA 5F95A 1OPKA 4PWNA 4LL0A 3G5DA 3DZOA 4QP9A 3FLSA 4J8NA 5ETIA 4E1ZA 4F0IA 4LV5A 4YR8A 4PL5A 2X9EA 3ZDIA 2A4LA 2R9SA 4GMYA 3R9RA 4RX9A 4XG8A 3W8QA 3CXWA 4JBQA 4BBMA 3PSCA 2VWYA 4FKQA 3CSVA 3EHAA 3D7ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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