4BJJA

Sfc1-sfc7 dimerization module
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
SLKISDNEYALIEHPGFANNKDAFFQTLGGVQSIQKACQTSFQNPAAALLELNLRPKDKYHHPVQARVQSRNDLLVTIKKMDNSVQNVSRIRQVFLFRDMADFQYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title RNA Polymerase III-Specific General Transcription Factor Iiic Contains a Heterodimer Resembling Tfiif RAP30/RAP74.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Schizosaccharomyces pombe
molecule keywords TRANSCRIPTION FACTOR TAU SUBUNIT SFC1
total genus 18
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF17682 Tau95_N Tau95 Triple barrel domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.160 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bjjA00
4BJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4S34A 5IQDA 4MCVA 4YP8A 3BHHA 4GJ3A 3BU6A 1FGIA 4ASZA 2HIWA 4JIAA 3VULA 3OOGA 2A4LA 4EH4A 5IQGA 4AW2A 4EHVA 5AP7A 3LE6A 4ZAUA 5FM3A 2PVYA 3MSSA 3VVHA 2OJ9A 3MPMA 3UIMA 4TRLA 4O7ZA 3BBWA 4LUEA 4IWQA 4K0YA 1JOWB 2C69A 3R7YA 5HU3A 1YRPA 3E8NA 2C3LA 3LIJA 3SKCA 2Y0AA 1JLUE 2W1IA 4B99A 1E9HA 3OCBA 4LV8A 5EYMA 3VBTA 4DTAA 3QALE 2PMNX 1CKJA 2OFUA 3D7TA 2GNJA 3JY9A 5E8VA 2XA4A 3R9HA 5IZFA 5HEZA 2OJJA 4W4VA 3LXKA 3OS3A 4BCOA 4DFNA 5HO8A 3LW0A 4YBJA 4JRVA 2GS7A 2BFXA 4WNOA 3QC4A 1H25A 2LAVA 4FYOA 3UYTA 3AC3A 1ZOGA 3JS2A 5DH3A 4F0FA 2R3JA 2V55A 2I0YA 4EQCA 3C5UA 4ZXTA 2HW6A 5L2TA 2O0UA 2CN8A 5DEYA 3MDYA 5KZ0A 4NCTA 4XOZA 1J3HA 3BEGA 2C0TA 4ITJA 3KVWA 4YLLA 4DFLA 4KSPA 2Y6MA 4M0YA 4U3ZA 3AGMA 5C27A 3HUBA 1DI8A 3RAIA 1H01A 4F9YA 2VO0A 4ANLA 4I1ZA 2X7OA 1YKRA 3PPKA 4CRLA 3OWJA 2WTWA 4KIPA 4QTAA 4XNEA 1LR4A 4P5QA 4BRXA 1Q41A 5M4FA 2YABA 2JKKA 2QOHA 2YAKA 4JXFA 4CMUA 4KIQA 2P3GX 4IX5A 5CVHA 3RWPA 3TV4A 4RWLA 1R3CA 3QGYA 4YZBA 4I41A 4YJNA 3QTZA 5EDQA 5EQYA 2UW7A 3FMLA 4O7NA 1F5QA 1I09A 2B55A 3HZTA 4EQMA 5GINE 1AD5A 3S00A 3QQFA 3DU8A 4MBLA 4EC9A 2F7EE 5EDRA 2QO9A 4I5CA 2Z02A 4W8EA 3QRKA 2A1AB 2JITA 4FX3A 5G1XA 4AZWA 2ITTA 4GG5A 3RK7A 4MNFA 1UWJA 4D9TA 3EQGA 2FH9A 1OITA 3DK7A 3ZLXA 3RPSA 1M14A 3R01A 3W0NA 4F9AA 3MIAA 4PTEA 3LMHA 4BCKA 2PVMA 5CENA 3RINA 4C35A 4G1WA 4EOSA 3BHTA 3ZC5A 3OEZA 3I6UA 3CGFA 5T6KA 4OLIA 3VONA 3BHYA 4F99A 3NAXA 4IWDA 2E9VA 3QKLA 1Q99A 4USDA 4JX3A 5BMSA 1ZMUA 2O63A 2XK3A 2HXLA 2VWVA 3C4CA 3OWLA 1R39A 5J1WA 4QYEA 1HCKA 4E4NA 4AXFA 5C4LA 4J8MA 4AQKA 3O96A 3PWYA 4FIHA 2PSQA 2XUUA 2X4ZA 3Q2JA 5DT4A 4DEDA 3KXNA 4IAAA 1FGKA 3H9RA 2C6MA 3KF4A 3R71A 3PLAE 2DYLA 5AV3A 3P1AA 4JMQA 1KUTA 4S31A 1B39A 3TKHA 3Q32A 4FTUA 4AT3A 5BVFA 4U7ZA 2CKOA 4ZY6A 3R73A 3FMMA 4RG0A 3BLRA 4Q5HA 3ZONA 4DITA 2R5TA 3PXFA 4UXQA 4UV0A 4YGAA 4NTSA 5J8IA 4F4PA 3GU5A 4AAYA 4WNPA 3MTLA 5CXHA 1P4OA 3FZ1A 4MHAA 3RNIA 1ZZLA 4QTEA 4OBOA 2C3IB 2XYUA 3PRFA 1VEBA 1J7LA 3O8PA 5IH4A 2IWIA 3DTCA 5EM7A 4EBVA 1P4FA 3ZDIA 4YSMA 4U45A 5JGBA 4P4CA 4FKIA 2HW7A 1IASA 4X2FA 3BHVA 3NUSA 3V8WA 4ZIMA 4C37A 2ZV2A 3ZO4A 2GTNA 3HNGA 3JVRA 4KS7A 1OB3A 4AF3A 3V3VA 2ZFYA 1PMEA 5EQEA 4ERKA 1JSVA 4I23A 5E1SA 4XOYA 2WGJA 3AKLA 3ZH8A 3C50A 3MFUA 4L53A 3AG9A 3E8DA 4OBPA 4EI4A 3DXNA 4FSYA 3ENHA 3TNWA 3IONA 2HZ0A 4RC2A 4J1RA 3DK3A 4OTWA 2J7TA 2WPAA 3MY1A 4DEBA 4KB8A 4QNAA 4R77A 4AW0A 5ANOA 2OZAB 4ZTNA 4CG8A 4CTBA 4R78A 3ALOA 4GT3A 4RX5A 2X2LA 3IO7A 2R3RA 5EYDA 4N6ZA 5HI2A 4BTFA 4Y73A 1Q8YA 5HNGA 1ZMVA 2QU5A 4U3YA 2XK6A 3W0QA 2V22A 4F9BA 3QTRA 3T9TA 2GFSA 4RA5A 2YM4A 4F0IA 5JQ5A 3QYWA 4C38A 5KMLA 3ZFMA 4E73A 4EH2A 4FTJA 3TYKA 3VHEA 3R8UA 3V5WA 4AT5A 5IMXA 5LVNA 4CFUA 2Z7SA 4L45A 3CEKA 3KRWA 5C03A 4B8LA 3F5XA 3QGWA 2BHEA 5IUIA 3PY3A 4M0ZA 1XBBA 5HESA 1LPUA 5JT2A 3BRBA 4MUQA 2H8HA 1CDKA 1QMZA 3BBTB 4Y83A 2VX1A 5HG9A 4RJ8A 5TF9A 2R3LA 3FLQA 3CE3A 3A7JA 3O71A 4RJ3A 4V05A 3VRYA 4EONA 3COIA 3HP5A 5L2IA 2NRYA 1OUYA 1OIUA 4PP7A 5HICA 4CV9A 4UX9A 1U54A 3G5DA 4BDIA 1H0VA 4MQ1A 3EN4A 3R7IA 2QR8A 2B0QA 3BZ3A 1SVHA 4CZTA 1FBNA 1M52A 1YQJA 5HVJA 5KUPA 3K5UA 2QOOA 1FMOE 3PVBA 2PHKA 5JRQA 1W83A 4BTKA 3UP7A 3V5LA 4PL5A 3EJ1A 1OM1A 2WMAA 2XIKA 2WAJA 3ZO1A 5GIPE 3MYGA 3DK6A 4Y72A 5E8XA 3LAUA 1U59A 3MWUA 4OTRA 2WELA 3Q60A 3ZBXA 4EQUA 4ZLOA 1PMUA 3JUHA 4RBLA 3FMNA 4FIFA 4R7BA 2CKQA 2H9VA 2UVXA 4ZTQA 1YXXA 1G5SA 4AP7A 3NGAA 4HCTA 4LRKA 4ZSGA 2IZRA 5K4JA 5IQBA 4UWBA 3ZLYA 4CKIA 3HP2A 4JDJA 4IACA 2BZIB 2BCJA 3RM7A 3QCSA 3LMIA 3UPZA 1WAKA 5H2UA 4ZZMA 4IMYA 3DBCA 3R7VA 3ZS5A 1STCE 5M53A 3KCKA 4C3FA 1A48A 1RW8A 2ZM1A 3DKGA 5EM8A 3GFWA 3Q4ZA 4D2SA 2WO6A 4U40A 4DEGA 4QMOA 5A54A 3C9WA 5ETAA 5A14A 3MPAA 3HMIA 2X8EA 2ONLA 1Y8GA 4UBAA 4MXCA 1QL6A 3BX5A 5M55A 4G3EA 4BCIA 4MBJA 4A7CA 4F1TA 4GRBA 3D5UA 4MF1A 4MYGA 2YIYA 3BU3A 4AA0A 4CNHA 3PXKA 3SGCA 3ZDUA 2PY3A 3EKKA 4APPA 3TXOA 4LL5A 2WTKB 2J5EA 1UKIA 4L52A 4U6RA 3CBLA 5F1ZA 1OUKA 4L67A 2ITUA 1ZAOA 3PIXA 4FSRA 3JXWA 2ITWA 4KNBA 2J0JA 5BYZA 4D1XA 4F9CA 3COHA 3OXTA 1PXIA 4DHIB 2REIA 4M3QA 4PNIA 3G33A 3QZGA 2P0CA 1H1QA 1J1CA 2CN5A 1BMKA 2J9MA 4K77A 4YLKA 3MPTA 4J99A 5D1JA 4C36A 4QT1A 5M44A 4BBEA 5J1VA 3IW6A 3GGFA 2VNYA 3F5PA 2XALA 4O6LA 3FKNA 4I3ZA 4CFFA 3ZSIA 5HVKA 3TG1A 2ITYA 4KRCA 4M13A 1T46A 2OZOA 2Y6OA 4MKCA 4FSMA 3BWJA 4B8MA 1J7UA 3E3BX 5JGAA 4DH8A 4BHNA 3PIYA 4R1VA 1WMKA 3M42A 2PVFA 4V01A 4S32A 4XP3A 5B2KA 3GC0A 3ZUTA 3R04A 4FKPA 2XM8A 3SQQA 3SOCA 5AP4A 1O6KA 1JWHA 3CKXA 4PDPA 5ACBC 3KK9A 3RGFA 3GP0A 3TKIA 5HIBA 5DOSA 1XH5A 4QYHA 5ANEA 1YXTA 4K18A 4XBUA 5AFVA 2CSNA 2WTVA 5AV1A 2H34A 2B9FA 4P2KA 4BCFA 1JSTA 1UNGA 3MY0A 5ACKA 4ANBA 5JRSA 4FTOA 2I40A 4G34A 5A46A 5HX6A 3KKVA 3O2MA 3BLAA 5ETIA 4DAWA 3BCEA 3OFMA 1YXSA 3PZHA 3E64A 3ULZA 4LRJA 2B52A 1PXKA 4DYMA 3HV6A 4QQ5A 3GEQA 4FOBA 3WZUA 2H6DA 4C3PA 4FZ7A 3TZ8A 2R3NA 4U8ZA 3M1SA 1G8KA 2YA9A 3NRMA 2GMXA 4HVIA 2QNJA 3WZEA 2P55A 3MVMA 5CVGA 3GQLA 4R7HA 1M17A 3R1NA 4EK8A 4DFXE 1UV5A 4OTIA 3R9NA 3UG1A 1KSWA 3WZJA 4YJTA 1GNGA 4AWIA 3LCKA 4LUDA 3B8QA 3QL8A 3POOA 3VUMA 4MVFA 4FV7A 4CCUA 5M57A 5FEDA 2HCKA 2X4FA 3LZBA 3ITZA 3P7AA 2UZVA 2BALA 3PSDA 4O86A 3RMFA 4ZSAA 2PUPA 1OPLA 2UW3A 4JQ7A 3PTGA 4PL3A 4D2RA 4G6LA 1FVVA 3ETAA 5CEOA 1P2AA 4YO4A 3F3TA 5EM5A 4FJVA 1OMWA 4JAJA 3F5UA 4FEWA 4XBRA 3ZM4A 3UVPA 4FGRA 3I7CA 4JT3A 4EH3A 4IZ5A 3HAMA 4NT4A 3W33A 2BRBA 3LCTA 4YNOA 1V0BA 3FZSA 4FEVA 4EOIA 2FB8A 3QQHA 4C7TA 1W84A 4M67A 3PVUA 5AADA 2BAJA 5CEMA 2JIVA 1V1KA 4FICA 4GKIA 5IPJA 2PZPA 4L7FA 4YTIA 5H8BA 2OK1A 3MJ1A 3W2RA 4LMNA 5E7RA 4LOPA 4KBCA 2UVZA 3B2WA 2BZHB 5KMKA 3UDBA 4DG3E 1YI6A 2VTIA 3VC4A 1K9AA 3QRIA 3W1FA 2QKWB 3SA0A 3P9JA 4ZZNA 2QD9A 4RVMA 4G31A 4QOXA 3FSFA 4FK6A 5EQPA 4X2KA 1SZMA 2VTLA 2YM5A 4FSQA 4JQEA 4H1JA 4Q2AA 1YW2A 2BDWA 4XV9A 3BI6A 4IAYA 2WMBA 5FXRA 4E20A 3DNDA 1AGWA 4BI1A 4EUUA 5LJJA 2C68A 4GFOA 5J7HA 2O64A 3BYMA 2IN6A 2XZSA 3SW4A 4AN9A 3PP1A 2R7IA 4BYJA 5M4UA 1RJBA 3F5GA 3EL7A 1Q62A 3PRIA 5F95A 3COMA 4WA9A 3FKOA 3QD3A 4GT5A 5E8UA 4B9DA 1G8JA 3P4KA 4M14A 3OVVA 4ANSA 2R3FA 5AAFA 5DA3A 4I0RA 2KTYA 4Y46A 2QG5A 3VUHA 4U41A 1YI4A 4DLIA 3UIUA 3FDNA 2Y7JA 3E93A 3NIEA 3EQFA 3EQHA 5B7VA 3C13A 1H1PA 4FUXA 4F7NA 5DPVA 3Q6UA 4L44A 4EOLA 4ZTHA 3A8XA 3D14A 4AA4A 3AKKA 5HU9A 3GBZA 2VGOA 5KE0A 5L6WL 4AUAA 2FVDA 2EB3A 1XBAA 2WB8A 3HA8A 5AAGA 3PXZA 4QTBA 2BRNA 2VAGA 3ZO2A 3KCFA 4BGGA 4FV0A 4IM0A 3PG3A 4EZ7A 4RX8A 2QO7A 2G15A 4IVBA 5IDPA 2YISA 2CNUA 5DGZA 3OBGA 4WSYA 3PXQA 4FR4A 4QYFA 3TIYA 3OXIA 3F2NA 4BCQA 3QKMA 4I4EA 5HLPA 5M56A 4FEUA 4IZAA 4APCA 3QQLA 4KRDA 3FLWA 4QPSA 3LJ1A 2ITVA 4GU6A 5BVNA 5GHVA 5CSXA 3U6IA 3ORMA 4WUNA 4AXDA 2XKFA 3ZRKA 1YWRA 4IAIA 4QP4A 4I22A 3F9NA 4UXLA 3A7FA 4MX9A 4AGCA 5KMJA 4A9UA 4OR5A 4H3BA 4XRJA 3C0IA 4IX3A 3VW8A 4C4HA 4M7IA 5L6PA 4YJUA 3ATTA 4YHJA 2RIOA 4USFA 1SNXA 3FQHA 2XAMA 4TWNA 5FP5A 5M08A 4Y5QA 3KXZA 2R64A 3N4VA 4QQTA 5A4EA 4XJ0A 5IA5A 2ITNA 3U6HA 2W1HA 3LLAA 3QWJA 3ML1A 4U81A 5FD2A 2ZDTA 3LPBA 1SYKA 4PUZA 3DB6A 2C47A 5EM6A 5ETCA 4ALWA 4IM3A 3CSVA 5AA9A 2OIDA 4WNKA 3DJ6A 3FMHA 2NRUA 4O0RA 4O0XA 2QOLA 5CI7A 3GVUA 4IB3A 3U54A 3Q52A 4MNEA 3BHUA 2YM6A 5EI8A 1BKXA 1IA8A 4TYEA 2WKMA 3FSKA 3MA6A 3WF9A 4CZUA 3VS3A 3L9NA 2PTKA 5CU2A 2YM8A 1FPUA 5I9VA 3FPQA 4BDJA 5IA0A 3HMNA 3DKFA 4WNMA 3A60A 4CVAA 2JKMA 4HZRA 4S2ZA 2IVVA 2PU8A 4IE9A 3WF7A 1H1WA 3ZZWA 3LFDA 2HK5A 4K11A 4FMQA 1YXVA 4O2ZA 4LYNA 4WG4A 5GJFA 5BMMA 2WMSA 1JBPE 3O8TA 2GTMA 3PFQA 4BGQA 1LUFA 4E93A 3CP9A 4OTGA 4F9WA 3L8XA 5C01A 3KB7A 4L42A 4AZFA 2CJMA 4MWHA 4QYGA 2ZDUA 4FTRA 4UY9A 3RJCA 3ELJA 5DT3A 4DLJA 3W10A 2OJIA 3FXXA 4BCMA 4C02A 4G17A 5EI2A 4IBMA 4FT9A 4M69B 5LVMA 4E1ZA 4RJ7A 4M84A 3NNXA 5JK3A 3OF0A 2VU3A 1GZKA 3P7BA 2W06A 2XBAA 5GJGA 3VNTA 3R02A 5FTGA 2PK9A 3TN8A 4YBKA 1OIYA 2E2BA 2ZB1A 3QUDA 3VUGA 2F49A 4IDVA 4IM2A 4JL9A 2XS0A 4X2GA 4GVJA 4LDTA 3BWFA 4ITIA 3FMKA 2V7OA 2UZNA 2B54A 4RIWA 3BELA 3Q4UA 4EZ3A 5A4CA 3EYHA 5CT0A 3NZ0A 4O0YA 1G8SA 3L9MA 4FUYA 5FG8A 3W8LA 1GZ8A 2J50A 2BZJA 1S9JA 1ZZ2A 4NFMA 4BYIA 5IH5A 4RA4A 3W2OA 5M06A 2QOFA 4HOKA 2QOCA 2XIRA 2Z7LA 4ZTLA 4AZVA 2IPXA 4OTDA 3EFKA 1VR2A 3OY3A 3C4WA 4RFMA 4BJJA 5AP5A 5CYIA 1WBOA 5DVRA 4ZJVA 3NR9A 2YEXA 4GG7A 3FJQE 4NM3A 5GJDA 1FVRA 1VYWA 2VTAA 5AIRA 4IVCA 4DT9A 4J71A 2HAKA 2GCDA 4JDKA 2C6EA 4E26A 3VBVA 4E6AA 4EYJA 4ACGA 1JVPP 4LGHA 4NU1A 1A06A 5HE0A 5KO1A 3QZHA 3BE9A 2WTKC 2BMCA 3FY2A 3L9PA 4I93A 5H9BA 1H27A 3W32A 4CFNA 2P33A 5DT0A 1YDSE 3EQCA 3Q4TA 4O7VA 3NVMB 3ORIA 2C4GA 3LFFA 4FTTA 3SLSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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