4EJ7 | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	270
structure length	270
Chain Sequence	SHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYRWARDNVGQSGATIYRLYGKPNAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-guided optimization of protein kinase inhibitors reverses aminoglycoside antibiotic resistance. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase
source organism	Acinetobacter baumannii
molecule keywords	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase AphA1-IAB
total genus	81
structure length	270
sequence length	270
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 2.7.1.95: Kanamycin kinase.
pdb deposition date	2012-04-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01636	APH	Phosphotransferase enzyme family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.200.20	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Phosphorylase Kinase; domain 1	Phosphorylase Kinase; domain 1	4ej7A01
3.90.1200.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2	4ej7A02

4MAOA 4YZNA 3ACJA 3QQLA 5JFXA 3R8MA 3JY0A 2QO7A 4ZLZA 3R04A 3MB6A 4KKHA 4O21A 2YZLA 2GCDA 4GT3A 4EEVA 3O8PA 1JLUE 1URCA 2QR8A 3HAVA 5L2SA 3O7LD 4RBLA 1HCLA 4I4FA 4GMYA 1UNHA 1ZMWA 3FI4A 4FVRA 3UVPA 3FL4A 3P0MA 1JPAA 1YRPA 4KWPA 4TTHB 3TZ9A 5JT2A 3EQPA 1WBNA 4H3PA 5FBOA 3WOWA 2UW0A 4HCVA 3UC4A 3WF9A 4D4YA 3RVGA 3VWAA 5B2LA 2PULA 3H9FA 3OHTA 4IFCA 4Y83A 2AC3A 3BI6A 5DA3A 2WMSA 4FSNA 2UVYA 4KSPA 4NU1A 2FSMX 1O9UA 1ND4A 3TM0A 3TYKA 2G2FA 5JFWA 4LRJA 1Q3DA 3QUEA 4M0YA 3A4PA 3CC6A 1JKTA 2C1AA 1G5SA 3COIA 3R02A 3DXQA 3PXZA 5AUVA 4GU6A 4XG4A 1M52A 1J1BA 4O7NA 5DLSA 4F65A 4ORKA 4E7WA 2NPQA 3P08A 4BIBA 4F09A 4JIKA 5JGAA 3FHRA 3UZRA 3W18A 4AT4A 5DG5A 3IK3A 4UALA 2GSFA 4NM7A 3U4UA 2C0IA 3KULB 5CSHA 4AFEA 3V5JA 2WTJA 4FODA 3NIEA 3I0QA 5KE0A 2VN9A 3VUHA 1Y8GA 2IZSA 3PJCA 4KIPA 4LGHA 4TXCA 3TN8A 3FI3A 4I23A 4MYGA 2R7IA 2BILB 4ANMA 4AP7A 3QCQA 4FVPA 3ORPA 2XIXA 3ALNA 4IAFA 5BMMA 1KWPA 4USDA 2VTHA 3FY0A 3KXXA 4U40A 1YVJA 3SQQA 3EKNA 5HORA 4AFJA 4YJNA 4B8MA 4I92A 3PJ1A 3TNQB 4D5HA 3UIUA 2GQGA 5HG9A 4F7JA 3PIYA 4IX5A 1WVWA 4FGRA 3VBQA 2QO9A 4CZUA 4R7HA 1ZOHA 4TWNA 2BKKA 4TWOA 3QRKA 2R3OA 2XKCA 2QC6A 3KVXA 4Y8DA 4EHVA 5B7VA 5EM6A 1ZAOA 3P7BA 3OCSA 5G6VA 2JEDA 2JKQA 4U3YA 4XLIA 4Q9ZA 3FUPA 3V8TA 3C4EA 2OH0E 4GFOA 2QHNA 3KN6A 2XEZA 3GOPA 5L8KA 3VO3A 4YLLA 5HLPA 4L44A 4YSMA 1R78A 3IO7A 4K9YA 3F88A 2VTQA 1B39A 3LVPA 2IZRA 4XRLA 2QI8A 4KB8A 3UGCA 3CLYA 4PX6A 4N70A 4A07A 4CCUA 4EUUA 3S0OA 2HIWA 3TDWA 4CT1A 4WBBB 3BYMA 2XMYA 1VR2A 3D5WA 4FSMA 2PMIA 3BE2A 3LFNA 3ZC5A 2GQSA 4QOXA 3C5IA 3NWWA 3ZDUA 3JVRA 4IWDA 3QZFA 4X2KA 4F0GA 2C47A 5T68A 1XWSA 2RIOA 3LMIA 4JBPA 3RALA 2W0JA 3KGAA 3HDMA 2IZUA 3NNWA 3Q52A 4UX9A 4C02A 2W1FA 3GQLA 3TV4A 5FGKA 4BCHA 4WHZA 2UZTA 3EQDA 2YAAA 1NW1A 1PYEA 5E8SA 4DBXA 2YIRA 5A6NA 4ANSA 1W7HA 5HTBA 5FXSA 4WG3A 4WNMA 5HVYA 1ZOEA 4FMQA 2B9FA 2QKRA 3LHJA 4IVAA 4DGGA 4EKLA 3FSKA 2BIKB 1H00A 3BWFA 4XP2A 3RPVA 3WYXA 1PXMA 4E6DA 4BDDA 4QMOA 3IOKA 5JGDA 2OU7A 4K33A 2XUUA 3F2RA 4I0SA 3WE4A 5BVDA 3UVQA 4PTEA 1IASA 5HNGA 2BAKA 3FPQA 1VEBA 3DKFA 4H05A 4ZMEA 5AAGA 2ZV8A 4AW0A 5L3AA 3VN9A 2H96A 4CMUA 1H1RA 2IVUA 4LGGA 4ZSJA 5FTOA 3R9OA 2C6OA 4CKRA 3TI1A 4DH1A 4XNEA 1ZZLA 3AT2A 4DEAA 5IQFA 3DOGA 2P3GX 2W1GA 4HYSA 1OM1A 2YIXA 3HP2A 3NYVA 3QQJA 4QP7A 3PPKA 3IS5A 4IM0A 4GFMA 4BHNA 3PY3A 3ODZX 4USEA 2GTMA 1CKJA 4ANQA 4AZSA 3G0EA 1GY3A 2XZSA 1YDTE 3EQBA 3JPVA 4D4VA 2O3PA 1Q8WA 3C7QA 2A4LA 4EJNA 4QRCA 4PRJA 4QYHA 3ORMA 4IDVA 5J87A 3SRVA 4F4PA 4EOQA 4I5HA 3DBQA 3O7LB 5I9VA 1CTPE 2YITA 3FZSA 5EM8A 3RPOA 1IAHA 3H10A 3PE2A 1ZYCA 4K11A 4V01A 4Q9SA 4O7RA 4FK6A 4A4OA 1FINA 3R1QA 5F94A 3R9NA 4BGHA 3GNIB 5AUTA 1H27A 1WCCA 4D0XA 4FIEA 5CNOA 3RI1A 3F3WA 3LXNA 4IJ9A 2R2PA 3LOKA 3R1NA 2PMNX 4OTIA 3V5WA 2CJMA 4DG0E 3UJGA 2QODA 5CEPA 4RX5A 1LEZA 3QCXA 4I20A 4ZY6A 3F61A 4ONAA 4FL2A 2VGPA 2UZWE 3ZBFA 5FXRA 3NVMB 2JAMA 5AWMA 5IUGA 2YM7A 4BBMA 2C3IB 3PFQA 5HICA 1YI4A 3AD4A 3F7WA 3ZFYA 1GIJA 4YR8A 4JXFA 4O38A 3AC4A 1V0OA 4O7SA 2IVTA 2BTSA 2HWPA 3NYXA 2C3KA 2CNUA 3ORTA 5HX6A 3UQCA 5M08A 5DT4A 3ZOSA 4CFMA 3OWKA 2JKKA 4P90A 3FAAA 4FSYA 3N4TA 3HMIA 5HEZA 2ZVAA 3I4BA 4FKTA 3G5DA 3TZ7A 4HGEA 3LLAA 2ZB0A 2NNWB 2XKEA 3A8XA 3D5UA 5FEEA 3VQUA 3DU8A 4JI9A 4LRKA 5J9LA 2WTWA 1PF8A 3QD0A 1JAMA 2OLCA 2VZ6A 4A9TA 2ETRA 3CGFA 4G3DA 3C0IA 1UKIA 3R7YA 2XIZA 4DGMA 3QYZA 4D55A 4IZ7A 2UW6A 4J8NA 3AD5A 1W83A 3W2CA 4BDEA 3Q9ZA 4C58A 5ANOA 5ICPA 3ZUVA 2PZPA 2Y4IB 4ZSEA 3LCTA 4IX3A 4JX3A 5CXHA 5I9XA 4YU2A 3IOPA 4UWCA 4M15A 2AYPA 4KA3A 4KINA 3VUGA 4AE9A 3P79A 3WARA 5CF4A 4G16A 1JKSA 3SOCA 3BV2A 4N57A 4YMJA 4RG0A 3W2PA 4PL3A 2RGPA 3KRJA 5JZJA 2XH5A 1A06A 2R3HA 3CIKA 3HMPA 5M57A 5AV2A 3DBCA 3NX8A 4YC8A 5M44A 4N0SA 2Z2WA 2W5BA 1ZWSA 4E4LA 4F1OA 4XS2A 4D5KA 5K5XA 2WEIA 2RF9A 3OY1A 2UW8A 4V05A 5DYJA 2HOGA 4AX8A 3QU0A 4TYGA 3WF7A 1JVPP 4ZSLA 4QP9A 3R22A 4O6LA 1MQBA 2FVDA 2X6DA 1YXUA 4RA4A 3E64A 3I79A 4BZDA 2ZB1A 4XOZA 4CCBA 2O64A 3SRVB 3F6XA 2PE1A 2OJ9A 3CJFA 3CY2A 3BGQA 4DTBA 1REKA 1ZLTA 3O2MA 4OTQA 1IAJA 5AV1A 1XKKA 4RMZA 2YCRA 3WF5A 2BDJA 2O8YA 5LMBA 3ZDIA 4CEGA 3OWLA 2WGJA 2GS6A 3PDTA 1FVVA 3FXWA 2HZ4A 3NGAA 2XNEA 4F9AA 4MX9A 3EN7A 2FB8A 3D7ZA 3MI9A 4DINA 4X6RA 4LYNA 1QCFA 1OL5A 1XH4A 3QUDA 3RJCA 5J9YA 3BGPA 4QPSA 4QMPA 4FBXA 3NNXA 2WNTA 2DS1A 4NT4A 4K0YA 4BIDA 3W0OA 4MCVA 3Q2MA 3NW7A 1CKPA 3QD3A 5CI6A 4FTMA 4PUZA 4NUSA 2C6MA 3HRCA 4JRVA 4U98A 3OY3A 2YZAA 5AAEA 2ITZA 5JEBA 3ZRKA 3R1SA 4ZTMA 3DFCB 3R8UA 4A9YA 4RC3A 1QPDA 3UMWA 3U6IA 4RIWA 2R3FA 4ANLA 5DI1A 5EDRA 2BHHA 3RCJA 3HGKA 4Z3VA 3RHKA 2F2CB 5BUJA 1JSUA 4KNBA 5ANIA 4G3FA 4PDPA 5KMLA 4EH6A 3OBJA 5LWNA 1ZXEA 3DKOA 2ESMA 1CSNA 2JIUA 4ZIMA 3JYAA 3N9XA 1R0PA 4GG7A 3OS3A 3U54A 3HV6A 4M69B 1OL1A 4FKRA 2BUJA 2XNMA 2PE0A 2UZDA 1PKGA 4PP7A 1NA7A 2A2AA 2J50A 3G9NA 5HLNA 3EQHA 2BAJA 2VTRA 3PJ2A 3FLZA 3AC8A 3QLFA 4FX3A 3UP2A 4E8AA 4ZK5A 3C13A 5BVFA 3HNGA 5CX9A 3EFWA 4EOLA 4CRSA 2WOTA 2C69A 3R7UA 4AZVA 4XCUA 3C4CA 5IQDA 1OKZA 2JITA 3NUPA 4K2RA 4HNFA 3I5ZA 4TYHB 3GP0A 1PYXA 4XG9A 4EONA 2ITWA 3PVGA 3GBZA 2OWBA 3QRIA 4MEDA 4MVFA 3EZRA 4XV1A 4KIQA 2W05A 3QQUA 2XKFA 3ZCLA 2C5VA 2QOFA 3MN3A 3Q53A 4IBMA 1JBPE 4FZ6A 2WQNA 5B2MA 4GIIA 2WQBA 4WNPA 1MRYA 3ERKA 4PDYA 4QMLA 3TT0A 3KB7A 3HKOA 4QMUA 2UZVA 3I81A 3NUXA 2WMTA 2XYNA 1O6YA 3HMNA 1KV2A 5JN2A 3L8VA 5AX3A 3P23A 3MPAA 4I5PA 5DEWA 4FKPA 3ZU7A 4B9DA 2X81A 3MTFA 3VRZA 4DT9A 3MWUA 2UW7A 2OIDA 5M07A 2XJ1A 3QCSA 5D9HA 2HY81 4C4EA 4TKSA 2F7ZE 4JG8A 4P2KA 3VULA 3TZMA 1U5RA 3FZOA 1XH9A 2JBOA 4L8MA 1OZ1A 3GENA 1YHWA 2ZDUA 3PIXA 1WBOA 2XNGA 3EFKA 3C51A 3ZFMA 4E20A 4F0FA 2OK1A 4RJ6A 5A4EA 2UZBA 3BRBA 3T3UA 4EK6A 4C3RA 5AEPA 4XV2A 3MPMA 3RPRA 4WG4A 4ENXA 2XRWA 5HVKA 4WUAA 1STCE 3E88A 3NAYA 4YZBA 2VD5A 4EH8A 1H1QA 5DH3A 3KU2A 2HAKA 5A6OA 4PF4A 3Q60A 3RMFA 4U41A 2QKWB 4D4RA 3RP9A 1BYGA 4OR5A 4FICA 2Y9QA 4C37A 5I4NA 3K2LA 4R1YA 3LXPA 4W8EA 4C34A 3QKMA 3QRTA 1NVSA 4HZSA 5AP0A 3DKCA 3DPKA 3ATSA 2B9JA 3E92A 2CNQA 1FQ1B 1Z5MA 2XCKA 3G2FA 4R6VA 5AP4A 3VW6A 5AV0A 4UY9A 3POZA 3UOLA 3E63A 5EYCA 3BYUA 3ORZA 5DBXA 3LCDA 4KRCA 3ZO2A 4AOJA 3EZVA 3MH2A 2I1MA 4C3PA 3PXRA 4M97A 3WF6A 4H1MA 3CPBA 4NZWB 4G2FA 3E93A 3UZPA 4DLJA 2W5AA 4RRVA 1BL7A 3GEQA 4FSWA 4V0GB 5CQUA 3ANRA 4DN5A 2F49A 4XEYA 4O83A 3RK7A 4ZXTA 3DJ5A 3QHRA 3KVWA 4QMZA 4YJOA 4C2VA 4PV0A 3EYGA 4DG3E 1WFCA 3DDQA 3V51A 3LCKA 5BPYA 3CPCA 3LJ0A 1UVRA 4BYJA 4CMTA 5EW9A 3P7CA 4FKIA 5M06A 2VAGA 2VTIA 4YTFA 1ZYDA 5CAUA 4IAYA 4FUXA 4BHZA 3F69A 3UOKA 1S9IA 5C27A 1KOBA 4LG4A 4DFZE 2W5HA 2R0IA 3TACA 2B54A 4F63A 4U97A 5CU2A 3FXZA 2ZOQA 4ZSAA 4LI5A 4RX7A 4R1VA 4LOOA 5L2TA 4AZTA 4WNOA 2A19B 3LFCA 3DXNA 4NH1A 5C8NA 4WO5A 3OVVA 5M55A 4RJ7A 3W32A 3E5AA 1PRYA 1Q99A 3OMVA 2QOKA 3IW5A 5CSPA 1BUHA 3MVJA 4KS7A 2WIHA 2G15A 4YPDA 5I0BA 1W98A 2P2HA 2ZV9A 2C5OA 1FVRA 5E1EA 3D7TA 4FTTA 2VO0A 3PG3A 2XM8A 4U44A 2YCQA 1RQQA 4AN2A 4IB1A 3I60A 4O7PA 1W84A 4FKJA 3MS9A 3OWJA 3KA0A 4FIIA 3TEIA 4DE4A 4GIHA 4LMNA 2FA2A 2ERKA 3HLLA 5KO1A 3HRBA 3QGWA 4DBNA 1WBVA 1UU7A 2HK5A 4LQMA 5KMKA 2QURA 3BE9A 3DNDA 2BZIB 4O0VA 3NW5A 4CFXA 3CQWA 1Q4LA 2I7QA 2C6IA 4CKIA 4RC2A 3QHWA 3I5NA 2VWBA 4PMTA 2EB2A 3K5VA 5BYZA 2LAVA 3ZONA 3CQUA 5CF6A 3SA0A 3RNIA 5EQEA 3OROA 1H01A 4AW2A 4UEUA 2JKMA 3BYSA 3EN5A 3I1AA 4KIOA 4X7QA 3GI3A 3TJCA 3ZO1A 4PL4A 1SNUA 4DG2E 3F7ZA 1FOTA 1KE9A 4F6SA 4FIJA 4L9IA 4N6ZA 3HAMA 3QBNA 4OUCA 3ZZWA 3SKCA 2R3PA 3D83A 3SC1A 4RJ5A 3R8LA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EJ7A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations