5M06A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis pkni kinase domain
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
255
structure length
245
Chain Sequence
MALASGVTFAGYTVVRMLGCSAMGEVYLVQHPGFPGWQALKVLSPAMAADDEFRRRFQRETEVAARLFHPHILEVHDRGEFDGQLWIAMDYVDGIDATQHMADRFPAVLPVGEVLAIVTAVAGALDYAHQRGLLHRDVNPANVVLTSRILLADFGIASQPSYPAPELSAGADVDGRADQYALALTAIHLFAGAPPVDRSLQPPKLSAFRPDLARLDGVLSRALATAPADRFGSCREFADAMNEQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of PknI from Mycobacterium tuberculosis shows an inactive, pseudokinase-like conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknI
molecule tags Signaling protein
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 75
structure length 245
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m06A01
2VWZA 4M97A 4IANA 4EYJA 3AD4A 4IFGA 4FSRA 2OH4A 2VTNA 4PX6A 5I4NA 3UODA 2BPMA 2C5YA 3QKMA 2PL0A 3C5IA 3R73A 3NW6A 5JQ8A 5F94A 2CDZA 3OC1A 3QBNA 2BZHB 2R3LA 3MH3A 3B8RA 2WQEA 4EH6A 1O9UA 2ERKA 3DNDA 4G31A 4BCQA 3OT3A 1FMKA 4LM5A 4EHGA 4J53A 3B2WA 3HP2A 3WE8A 5LVOA 4A9TA 4BCJA 4JR7A 4ZMEA 3JR1A 4YJVA 3NVKI 5AP5A 3R71A 3PXRA 3PFQA 4RJ8A 4DLJA 2IZTA 3KRLA 5JZNA 3PZHA 5L2SA 2XK7A 4H1JA 4JX7A 1YDSE 3ZM9A 4CFFA 4O0TA 3EZRA 3PVGA 3RPYA 4E73A 1OUKA 2XA4A 3HVCA 2B55A 2ONLA 3F82A 5E8XA 4JR3A 3GC9A 4CT2A 5CAUA 3R9DA 4KIQA 3PRIA 3OROA 3RPSA 4ZSGA 5FQDC 3LFSA 3RMFA 4U0IA 4KRDA 1KE8A 4K0YA 4RPVA 2ZYBA 4F7LA 3VBTA 3PPZA 2VNYA 3UG1A 5KHWA 1KV2A 4FV1A 3KFAA 5AP4A 4IVBA 5C4LA 2I0VA 2R3RA 3NNUA 5IZFA 1V1KA 3LCDA 3GQLA 3QRIA 4E6DA 5M09A 1OB3A 2Q0BA 2QURA 3SXFA 5LVNA 3QKKA 5E8TA 2O65A 2YITA 2JIIA 1JBPE 5IA3A 3ZSGA 2PYWA 2GNFA 4FKQA 5DH3A 4BCIA 3E8EA 3SX9A 2W96B 4Z55A 4OBPA 3AC3A 3RALA 4EK3A 3W33A 4ZTSA 2WELA 3GU4A 3LFQA 4CCUA 3S1HA 4UWCA 5HICA 3LMGA 2QOHA 3R2YA 2XK8A 4C3RA 3K5UA 4HVHA 3ANRA 2BIKB 1WVYA 4MTAA 2W1FA 3A7IA 2F7ZE 3RZBA 2VO7A 5JMSA 3U6IA 4PL4A 5L3AA 3QTWA 4U41A 4FEWA 2UW6A 3A4OX 5DR2A 5AIRA 3G6HA 1UV5A 2VV9A 1Q97A 3V5LA 3IW6A 2WTKC 3GP0A 4EKLA 3EFJA 1H26A 3A61A 4FV3A 5LQFA 2PE0A 3VS4A 4WNMA 3VBWA 5EDQA 1PHKA 1LUFA 4XNEA 4TL0A 2YN8A 5DPVA 3CTQA 3UVQA 4EORA 3ZEWA 3V8WA 4OTHA 1Q8TA 3BQCA 4PNKA 4H36A 1H1PA 4DA5A 2OICA 2J0KA 4FI1A 4W8DA 1OMWA 2BDWA 2C6LA 4FVRA 5H8GA 5EH0A 4ZTRA 4D5HA 3CQWA 5EHYA 4RT7A 5EQEA 4XRJA 2XK4A 4K18A 3FQHA 3W2CA 4OT5A 3RCDA 3OXZA 2GCDA 3NUYA 5JN2A 2GDOA 2XNBA 3TZ9A 3UQFA 4AFJA 5AJQA 3C4WA 3H10A 3PIYA 4K33A 1ZRZA 2PUPA 3HAMA 3MY5A 3VW6A 1W84A 2GFSA 3HUBA 4O81A 3ROYA 2W1DA 4DHFA 1I44A 4O7SA 1RW8A 4RZVA 3BHYA 1ZY5A 4A06A 4BTKA 2JITA 5E4HA 3ZCLA 4Y46A 5CAVA 4GG5A 4AA0A 3R1QA 1ZAOA 3UOLA 2OF4A 3W2QA 5T3QA 4IB5A 2B9HA 4FKJA 4YZ9A 3D7ZA 4DH7A 5IQBA 1J7UA 1DS5A 3A99A 2PTKA 4BIBA 4R3RA 4X6RA 1ZZLA 4J95A 4C34A 1H1SA 2P2HA 2R3NA 4KNBA 4M69B 1CDKA 4C7TA 2XKEA 3NRMA 4DT9A 5GJDA 2YCRA 4PRJA 2HY81 1MRYA 4FV0A 5DT4A 5FTGA 5CU6A 4I4EA 4YJRA 3S0OA 3E5AA 2QOKA 4LOPA 4FE2A 3NUSA 4ZSAA 4YHJA 4GJ3A 3VWAA 2FSLX 3QRUA 2J9MA 4D9UA 4ASEA 1CTPE 1FINA 1PXKA 4LV8A 4FSUA 4KABA 1J1CA 2YM8A 3FXXA 4F63A 1MUOA 2OU7A 3PY1A 4YNOA 5HE1A 4OBOA 2R3QA 3VF8A 4DCAA 1JKSA 3E8CA 3SQQA 4QNAA 2BAJA 3ALOA 4KBCA 4TWOA 2BRGA 3OEFX 1Q99A 3R7YA 2XBAA 2BMCA 2BCJA 5HIBA 4ORKA 3BGZA 3VIDA 5JEBA 2LGCA 1ZY4A 3OS3A 2ITYA 3FC1X 2UZNA 1UA2A 2ONLC 5A4CA 4LUEA 5CVGA 4EOSA 2G2FA 3QZIA 3JUHA 2C6IA 3L1SA 4L3JA 4NJ3A 4YC8A 2ZB0A 3MIAA 3MPTA 2ACXA 2PHKA 4XV1A 2XIZA 3NIZA 1AGWA 4I24A 2KULA 3TIZA 3VF9A 5EKNA 1R3CA 4ZS4A 2XH5A 2BKZA 3FBVA 3HV4A 5AV1A 5KKRB 3PE1A 5HCZA 4BGGA 2GSFA 4YLKA 3PE2A 2WU7A 4AE6A 3PIXA 2HELA 1QCFA 2C1AA 3OEZA 4YUQA 3EIDA 2GHMA 2ZV8A 2RFEA 3DXPA 4B8LA 4DEEA 2OJIA 3OCSA 2W99B 3ZZEA 3EZVA 4QOXA 3IECA 4DBNA 3OFMA 1VJYA 2A27A 4DG2E 3TKUA 4C61A 1LR4A 2BRMA 3QL8A 3MVMA 1Q24A 4EBVA 4IJPA 3EN9A 1YWVA 4I5PA 4J7BA 4JBVA 3K3IA 4CTBA 3NCZA 1PMVA 4ANLA 2X2MA 4F7SA 4EH9A 3N9XA 3VUGA 3W2RA 4IDTA 3ZM4A 4YJTA 5L8LA 1ZMUA 2G01A 4M8TA 5DE2A 5HCXA 2WTIA 5E1SA 4DEDA 3HV3A 1V0BA 5IA2A 5ANEA 2X1NA 4FNWA 1JPAA 1H08A 2XJ2A 1QMZA 2WIHA 3SDJA 3SG8A 4BF2A 2XCKA 3Q32A 1T46A 4N57A 5FBNC 4CLJA 2R7IA 5ITAA 4D0WA 2WTJA 1KE7A 3QAME 4RBLA 2Z7LA 4EWHA 1QPDA 3FZTA 3TCPA 1J1BA 1FOTA 2C6EA 1IG1A 3VUDA 4JI9A 4QP6A 5KMLA 4FSNA 4RVLA 4K1BA 2BVAA 4EOLA 3LJ2A 5HBJA 3D4QA 1Y8GA 3HMOA 4E6AA 4W4VA 3V5WA 5BVOA 2O3PA 2OXDA 4WSYA 2C5NA 3LFNA 2PK9A 3QRKA 4O6LA 1MRUA 2OIDA 1IA8A 5CAQA 3KF4A 4AZWA 4L3PA 2ZJWA 4AX8A 1OPKA 3E3BX 4PL5A 4YZBA 3VS0A 3PVUA 4CSVA 3O7LD 4CZTA 2QLUA 5JRQA 5DT0A 2B9FA 2UZLA 2XRUA 5CF8A 3Q3BA 5FEEA 5I9UA 5IQFA 5KZ0A 4CXAA 4UXLA 2R3IA 4QPAA 4O84A 2ZOQA 3U4UA 4RQKA 4CT1A 4NUSA 4EOIA 3VS5A 3G33A 4QTCA 5DR6A 5J87A 1YDRE 4EZ5A 1YQJA 3EMGA 3UC3A 3Q60A 4IZAA 2IVUA 4GKIA 2YACA 2JAVA 4GYIA 4IB3A 4TN6A 4WD5A 3GFWA 3LHJA 3NYVA 4WIHA 4Y72A 4BC6A 3BHVA 2R5TA 3MVJA 5DWRA 4IWOA 5KE0A 4UN0C 4FV8A 3BEAA 2WZJA 2C0IA 3KMUA 3NDMA 4C62A 3QA8A 4ZY5A 4XBRA 3PWYA 1S9JA 2VTSA 3I7CA 3QZHA 1GOLA 3R1YA 2B4SB 1GY3A 2IJMA 2X7OA 3COIA 3CCNA 3ZC5A 1YOMA 3R9NA 4BCMA 2YJSA 3HA6A 3SOCA 4YHTA 1PXPA 1NT2A 3CKWA 3HRCA 3KGAA 4RJ6A 4RWKA 4EHEA 3C4EA 4G5PA 4MD8E 4YBKA 4AW5A 4RWLA 4FV5A 2CNQA 2QLQA 2BUJA 2Y8OA 3QALE 4IBMA 2PE1A 4GU9A 2XK3A 3D2KA 3COHA 4JT3A 4WRSA 2GPHA 5FRIA 3O2MA 3RPOA 4AE9A 3F5XA 1UKIA 4YPSA 3FAAA 3OWJA 2OZOA 4JJRA 4FTLA 2GHLA 3PDTA 2P4IA 4W4YA 5BX0A 5J9ZA 4DG0E 3LXPA 4NTSA 3CGFA 4JBQA 4I20A 4U42A 5HG5A 4G9CA 4ZZOA 2FVDA 3LQ3A 2OFVA 1Z9XA 3GUBA 4O0WA 2CHLA 1P4OA 3C51A 4XOZA 1PXJA 3NR9A 4E7WA 3ATSA 3OZ6A 3WZEA 4FGBA 4QP1A 4XV2A 4JDIA 4ANBA 4TWNA 3KXMA 5EW9A 4DGMA 4PMPA 4E6CA 5KUPA 3EQIA 4QP9A 3TEIA 4FV9A 4F09A 3FI2A 3QRJA 5AAFA 3MJ2A 3W1FA 4ZAUA 3UC4A 5M57A 3E92A 4MK0A 4GT5A 2WPAA 3GXLA 1X8BA 3W10A 3AC4A 1OL5A 3PXYA 3KU2A 4II5A 3U6JA 3C50A 4PP9A 2W17A 4C4GA 2YM4A 3EN7A 4I93A 4OTGA 4EYMA 3V6SA 4BCNA 5HVKA 1XH6A 2OKRA 4H05A 2CGUA 5CVFA 2JC6A 4FX3A 3I6WA 4HYSA 2G9XA 5M56A 4V04A 3U9NA 3AC2A 3THBA 1SMHA 3I7BA 4RJ7A 1UU8A 4IAZA 2BKKA 2YDIA 4FTIA 5CLPA 4ARKA 4ACHA 5FUTA 4NZWB 3PA5A 3CPBA 5HE3A 4QYGA 4DE4A 4BDDA 1SZMA 1WVXA 4QTDA 4OTIA 3LFEA 1WBTA 2WMWA 3S00A 5BMSA 5HKMA 4I0TA 4KKGA 5DN3A 5IH5A 3CKXA 2VTLA 3SC1A 4D1SA 2I7QA 3ANQA 2WTVA 4IVAA 3VUHA 3EH9A 3WF5A 4R6VA 3Q96A 4R78A 2W1IA 3LCTA 2GNLA 2ETRA 1XKKA 5EKOA 3OTVA 4J71A 4UEUA 5CU3A 4KB8A 1M7QA 3FUPA 2PMLX 3UOJA 4JXFA 2OBJA 4EONA 4GKHA 2ITOA 2DUVA 5IA0A 2X7GA 2W05A 3P4KA 1JOWB 3K2LA 1PMEA 3T3VA 5CYIA 3WZUA 2VTHA 2OJ9A 3R7VA 5F4NA 5IUGA 3NNXA 4HYHA 1RE8A 2FYSA 4CV9A 4O7LA 1XHAA 4YP8A 3C1XA 2CKQA 4G6NA 3P08A 1YXXA 3FLYA 3DFAA 4KKEA 4OTRA 4G34A 2UVXA 3UPZA 1LPUA 4YJPA 3F5PA 3FLSA 3R1SA 2G1TA 2JBOA 3AGMA 3EKKA 4I1ZA 4AZTA 4C58A 3HGKA 3H9FA 4AGUA 3SOAA 1QPJA 3ENMA 3VN9A 4ASXA 5B0XA 3PXZA 4PMTA 3KMWA 5I9WA 2XIKA 1PMNA 4HCTA 5CU0A 2NRYA 3TTJA 2ZV9A 3PXKA 3EKNA 4QP2A 3UPXA 5JGAA 3AD6A 5DI1A 3ZFMA 3L9LA 4E93A 5HE2A 3NW7A 3EQHA 4RSSA 3VO3A 5CSVA 4E4MA 3LQ5A 1ZMVA 2XIRA 4IB0A 4X0MA 5M06A 3Q9XA 4GG7A 4XHKB 3UP7A 2GNJA 1Q4LA 5DT3A 3EN5A 5A4LA 3I6UA 5CF6A 3Q5ZA 3DV3A 5FXSA 3BYSA 4AZFA 2UVZA 3S2PA 4FTRA 3VJOA 2DQ7X 3ORZA 2QOFA 2WHBA 4IJ9A 5ANGA 3UIXA 4OTQA 4E5AX 4UY9A 5HX6A 4EK6A 4GFGA 2UVYA 5JGBA 3DXNA 5CSXA 5ANIA 2OXYA 4E5BA 4O0XA 2QOCA 3R8ZA 3OF0A 3SLSA 3VW8A 5HE0A 4EKKA 1Q8WA 3DBEA 4J96A 3ZDUA 1BL6A 2ZMDA 1O6YA 4AAAA 5I9XA 5CENA 2H34A 4O0RA 1RJBA 3VRZA 4AS0A 5A6OA 3ZFYA 4UZDA 2KTYA 3QQJA 3P7AA 2XVDA 4R7IA 3F2RA 1PXNA 3DJ5A 3H9RA 3TJCA 4BDHA 3QTZA 3E88A 1OBGA 3RINA 5CXZA 2BRBA 1U46A 2IG7A 3GU8A 4DGOA 4B0GA 3BCEA 3QQHA 1KWPA 4XG9A 3DDQA 3ZEPA 4C35A 5FG8A 4GW8A 5B7VA 2FGIA 1OIQA 1YKRA 4NW5A 3CSVA 3TV6A 2WMXA 4V01A 1GZ8A 5E90A 1I09A 4ASDA 4AUAA 4CFVA 4O96A 2OIBA 3KRJA 1IEPA 3V01A 4I94A 4YJSA 4BDGA 5HZNA 1YXSA 2PE2A 3DY7A 5BVDA 5H8EA 4EOOA 5AUWA 2WOTA 3K5VA 2B7AA 3C5UA 2HAKA 1FQ1B 4E5WA 2CN5A 4G6OA 5GINE 3PYYA 3CY3A 4Y8DA 5M44A 4AT4A 2OIQA 3NZ0A 4JL9A 1L3RE 2XM8A 5CT0A 4ACGA 3JPVA 4FOCA 4O86A 3NAXA 4EL9A 3JVRA 1Q8UA 3DS6A 2VWXA 3VUIA 4J97A 5AUZA 4B7TA 4BDCA 4PDSA 2BIYA 4QMNA 3NWWA 1H07A 2ITUA 5GIOE 2X8EA 3EWHA 1JLUE 1PXMA 3LJ1A 4KBAA 5FGKA 2WTWA 3ROCA 5KMNA 1GIHA 3A8XA 1W8CA 3CJFA 1FVTA 2C3LA 3EL8A 3WF8A 3QTRA 3KY2A 4O7TA 2WOUA 4IAYA 3A7JA 4NM5A 2C6MA 4U3YA 4EK5A 3BV3A 5BQ0A 4C0TA 3A7FA 4ZS0A 3MDYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4DTA A;  5I9V A;  4X6Q C;  3ZOS A;  1U5Q A;  3IW8 A;  4L52 A;  3GEQ A;  2BFY A;  3PJ8 A;  2BFX A;  1DI8 A;  1SNU A;  2WTK B;  1S9I A;  4NM3 A;  5KZI A;  3RNI A;  3TV7 A;  4O22 A;  1KUT A;  3EHA A;  1BKX A;  3BU5 A;  2NNW B;  3HX4 A;  3QQF A;  1YHS A;  2R3O A;  2WMB A;  1SVG A;  1CM8 A;  1U54 B;  3OUN B;  5IPJ A;  4M84 A;  3DPK A;  2OK1 A;  2X6D A;  4Y85 A;  2Y9Q A;  1GII A;  1XH7 A;  3MA6 A;  4QMX A;  4B99 A;  2QU6 A;  5T6K A;  1GIJ A;  4CNH A;  3G9N A;  3WZK A;  4DDI A;  3ZO4 A;  1URC A;  1YOL A;  2Y4P A;  3UGC A;  3ZZW A;  2EUF B;  2F49 A;  3OBJ A;  1ZLT A;  4G1W A;  4F0I A;  3ACJ A;  3IS5 A;  4ZZN A;  3QC4 A;  2EXC X;  3M42 A;  4LOQ A;  3F6X A;  4RC3 A;  3UBD A;  4C33 A;  2W5B A;  2J0M B;  2QOQ A;  4I6H A;  4C38 A;  3SGC A;  3V5Q A;  5BUE A;  2VWI A;  3AT4 A;  3R7U A;  5CF4 A;  5M07 A;  4N4S A;  3DOG A;  2QNJ A;  5AP7 A;  3KCF A;  4ZSE A;  3VC4 A;  1ZOE A;  3HRB A;  3BIZ A;  4OLI A;  2R0U A;  2FST X;  4LL5 A;  5JZJ A;  4QEB A;  1DAY A;  1NW1 A;  4BHN A;  4BDE A;  5EI6 A;  3WZJ A;  4NFN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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