5M09A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis pkni kinase domain, c20a_r136n double mutant
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
256
structure length
246
Chain Sequence
MALASGVTFAGYTVVRMLGASAMGEVYLVQHPGFPGWQALKVLSPAMAADDEFRRRFQRETEVAARLFHPHILEVHDRGEFDGQLWIAMDYVDGIDATQHMADRFPAVLPVGEVLAIVTAVAGALDYAHQRGLLHNDVNPANVVLTSQDQRILLADFGIASQPSYPAPELSAGADVDGRADQYALALTAIHLFAGAPPVDQPPKLSAFRPDLARLDGVLSRALATAPADRFGSCREFADAMNEQAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PknI
publication title The crystal structure of PknI from Mycobacterium tuberculosis shows an inactive, pseudokinase-like conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 70
structure length 246
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5m09A01
1KE6A 3ZUTA 3FDNA 3QFVA 4K9YA 3W10A 3VRZA 1J7UA 4ENXA 2BRGA 2ZM3A 4G6NA 5H9BA 2UZBA 4M69B 3R63A 3SD0A 1W98A 1WZYA 2J51A 3ZZEA 5B7VA 3QQLA 1HOWA 3F88A 4FT5A 2W05A 5JGDA 1E1VA 3U6JA 1MRVA 4O0WA 3PPKA 4ZOGA 5E8TA 2J9MA 3DBQA 5FTQA 5IQCA 4XH6A 2XKFA 5JRQA 3LFBA 2XP2A 3ERKA 2JITA 2WD1A 2UVXA 3NNVA 4DGOA 4R3PA 1YQJA 2YM6A 3ORTA 5HX8A 1E1XA 2UZNA 2WO6A 2I0YA 2QOFA 5J9ZA 5CEQA 4J95A 4AN2A 2YA9A 3FI4A 4F0GA 4KAOA 5CSPA 2UZEA 4AOIA 4BDHA 2PMIA 4PDYA 5L6WL 3AMYA 5AMNA 3FXZA 4BZOA 4X6RA 1XBAA 2A19B 5HE1A 4ANQA 3FLWA 4NUSA 4RA5A 3PSDA 3UQGA 4C3FA 5JMSA 1WVYA 2CKOA 1URWA 3KREA 4RC4A 5TO8A 2BDWA 4BCJA 4WNOA 4MQ1A 4S33A 4EC8A 5EM7A 2YIXA 3Q60A 5D11A 2BHEA 4ALWA 4XG8A 4BIEA 3UPZA 1RE8A 4KS8A 2Z60A 2VWXA 3A7IA 3BU6A 3QD0A 4EH9A 3BHHA 4M3QA 4FV7A 4P4CA 4GL9A 3NUPA 3A99A 4HGLA 3W18A 2C6MA 4APCA 5LMKA 3PIYA 4FSWA 4GT5A 2YIYA 4CMTA 3FE3A 3GU8A 2BROA 3I6UA 4MK0A 4KSQA 4MBLA 2R0IA 3HAMA 5E8UA 4AF3A 3BIZA 3COMA 4CD0A 3H0YA 3OCBA 3HVCA 4BGHA 1CDKA 5KNJA 4BY9E 2CGUA 3BYOA 3ZM4A 3BGQA 2BZJA 4IAIA 3RAHA 2A4LA 2XNGA 3E93A 4MTAA 3SRVA 5B2MA 1R78A 2I0VA 5BYLA 5ICPA 2H96A 3VRYA 4M68A 3RI1A 3G6HA 3R02A 2BZIB 3OBGA 1ZMVA 3LQ3A 3SG9A 1XO2B 2YAAA 4GK2A 4RVKA 3DA6A 4YJVA 5JZJA 1ZYJA 4FVPA 5AX3A 4QQTA 2W4JA 3FHIA 4AGCA 5BVKA 1ZLTA 3EQGA 3LFQA 4ZZMA 4Z16A 3HRFA 3EHAA 2P33A 3RK9A 2J90A 4F9CA 3OHTA 2HZ0A 3W55A 3HX4A 1YWNA 3PP1A 3GU5A 3IDBA 3QAME 3CBLA 3RCDA 3D83A 3PRIA 4DFNA 3MY0A 3C4XA 3GU7A 3Q32A 1M7NA 5I9ZA 4OTWA 2OJ9A 3A7FA 5CSWA 5ANOA 3GXLA 3R9NA 4C61A 1JBPE 3D5UA 5IUIA 5C26A 2UW4A 3I5ZA 4I4FA 3P0MA 3FAAA 2OWBA 2BAKA 4D4YA 4DC2A 3GI3A 2IZUA 2GSFA 4DFUA 4F9AA 2W5AA 4U79A 3FLSA 3OWJA 4FZ6A 2E9OA 4AQCA 2CNVA 3IOKA 4GUEA 3UC3A 3MS9A 2G01A 5EI6A 2YM8A 3MFTA 4RVTA 3KVXA 1ZRZA 5GINE 4UBAA 3OTVA 2W4KA 4E4MA 5LJJA 1XBBA 3EN9A 2QQ7A 1IR3A 2ZAZA 4XS2A 4FSZA 1PXIA 4QP9A 2VWWA 3QRIA 5IMEA 5HCXA 5I4NA 4YC8A 4I0TA 3BLQA 1DI8A 4K33A 4OGRA 4FSNA 5CSXA 2FH9A 2R3FA 4ZTSA 3QTQA 3U4UA 4IBMA 4RIXB 4D1SA 3MFUA 5CI6A 1O9UA 1BL7A 4XRLA 3ORLA 2YDKA 2YAKA 3R9OA 1J3HA 5EW8A 4ERKA 3ZDUA 2F4JA 3CPBA 4AA5A 5AEPA 2FSOX 5FXRA 3NEWA 4RT7A 3QZIA 4D0WA 4X2GA 4TYIA 3RHKA 3V8WA 5HNGA 4DGGA 4AE6A 3N9XA 5AM7A 5CU0A 4GG7A 2W1FA 4WBOA 4X2JA 3G90X 5AA8A 3OUKA 4II5A 4PWNA 3QXOA 2BRBA 4FTQA 3SHEA 1PHKA 4EWQA 4O7ZA 5J1VA 2Y7JA 3OBJA 5CU6A 4BCPA 5CEMA 3HGKA 3JVSA 4O7TA 3BU3A 4HVSA 4C4GA 4EK3A 1APME 2GCDA 3O50A 4F0IA 3WYYA 1Y57A 5EG3A 2AUHA 3FZPA 2J0IA 2VGPA 3MA6A 2YACA 4ORKA 4H58A 2X4ZA 4XOZA 5DYJA 3R7IA 3DZQA 4QP3A 4C36A 3E64A 3W33A 4D1ZA 3D7TA 4AW0A 2QOQA 4U9AA 3EB0A 3MH3A 2UW6A 3DJ7A 3ROCA 4D2RA 4ALUA 4RFZA 5H8EA 2RIOA 4LUDA 3E92A 4GFGA 5IF1A 3LLAA 4OTQA 2BRMA 4ZEGA 2R7BA 3BGPA 4RJ8A 4Y85A 5JT2A 5GIPE 4ZY4A 1QPEA 2UW5A 4I20A 4LG4A 4FL2A 5IISA 3LMGA 1WBPA 4QMZA 3QTUA 3FMDA 4CEGA 1JKSA 3KXGA 4F70A 5C4LA 2PUNA 4L3LA 1CMKE 4FTCA 5DT3A 1J91A 3DXPA 4HW7A 2ZVAA 4AGUA 4D28A 3U4WA 3QQKA 3SLSA 4FV3A 2C0IA 4O6EA 2OXYA 3CPCA 3PZHA 3ZFMA 3TZ7A 4RIXA 4BVUA 2X9FA 5C9CA 4KBAA 3QYWA 4TTHB 3MESA 4S34A 2BIYA 1OL6A 3BWFA 4MKCA 4U0IA 2PUPA 2VWIA 4D4RA 3IW4A 3ALNA 3EQCA 4BCFA 2ZV8A 4FTLA 5ITAA 4O7NA 4R6VA 3ZCLA 3KRJA 3NNUA 4MXXA 5A4CA 3AGLA 3QC4A 2J50A 3KY2A 1I44A 1STCE 5BYZA 3ROYA 4FV4A 4X21A 2VO7A 4PL3A 4FMQA 4AT5A 2YIWA 1WFCA 2X4FA 2HZIA 2UW7A 1K3AA 4KBKA 4FEVA 3DV3A 3CGFA 2JD5A 3OUNB 3R2YA 4O7SA 4O7RA 3DBDA 5CU3A 3VW6A 4EK5A 5E1EA 4R1YA 3MV5A 3ZEPA 2C30A 2B1PA 4I24A 5HE2A 1GAGA 2BAQA 1BX6A 3OT8A 5FXQA 2GHMA 3GU4A 4C59A 2X7OA 3BE9A 4U44A 2XUUA 3OCSA 1YW2A 3Q4ZA 2HWOA 4FTNA 4KD1A 4W8DA 4YNOA 4IM0A 2WTKC 3MTLA 3ZM9A 2F9GA 2C4GA 2J7TA 4E20A 4E8AA 3UGCA 2XBJA 4BB4A 4UZDA 5D7VA 2R5TA 3Q2JA 2J0KA 4W8EA 3UOHA 4C34A 1Q3WA 1Q4LA 1VYZA 2R3PA 3EN7A 1Q41A 3RWPA 2X8DA 3LQ5A 4FSYA 1KWPA 1OITA 5M55A 4HVDA 4J96A 3ZXTA 4RSSA 2IZSA 4WNKA 1QPCA 1OVEA 5TOZA 3C13A 3PXQA 3VS7A 4O0TA 1OPLA 1GOLA 4CTBA 1GIIA 2WOUA 3QL8A 4CRLA 5IG1A 1H25A 3EQRA 2J6MA 3RPRA 2EVAA 3GNIB 2X8EA 4IAZA 4IE9A 3F82A 5IQDA 4ZJIA 4H39A 4CFUA 2ACXA 4M0ZA 2GU8A 4G16A 3KN6A 1DM2A 1OM1A 1SZMA 2H6DA 3CKXA 3VN9A 4RWLA 1H0VA 3UMXA 3BZ3A 3U9CA 1ZZLA 3E3BX 4X3FC 1UVRA 2Q0NA 1Q8UA 3P7BA 3FQEA 2OF4A 2C3KA 3GB2A 2NRUA 5HG7A 3KF7A 1FGKA 4ZZOA 3RKBA 4EQUA 2ETMA 4ONAA 5CAVA 2FYSA 3VBVA 1OUYA 1ZY5A 2PUUA 4WHZA 4M67A 5EW3A 4DYMA 4EZ5A 3LFSA 4U3YA 5GJGA 5JZNA 4PL4A 4QQCA 4R1VA 3PVBA 5M57A 4XCUA 5FEEA 5I9WA 5JH6A 1AQ1A 4JIAA 5FEDA 3F6XA 4AZWA 2R3LA 5H8GA 3TV7A 4FA2A 3EZVA 2XJ2A 3R1SA 4J8NA 1GNGA 5HLPA 4EUUA 2ZDUA 4BCOA 2R3NA 1TQPA 2JBPA 4X7QA 3ZLWA 2Y0AA 4FNWA 2UW9A 4D58A 3C4CA 4E4LA 5JFVA 3KVWA 3DNEA 2UZLA 4G3GA 4NJDA 3TNQB 3W16A 4FKRA 3HUCA 5E8WA 4ACHA 2WIHA 2KULA 4RQVA 1P4FA 3FKNA 2CLXA 4XJ0A 5BQ0A 4JS8A 3IGOA 3S0OA 4FG9A 5IH4A 1WBOA 3VNTA 4O0RA 1YHSA 1OB3A 3E87A 3Q4UA 3VW8A 4IDVA 4O7VA 1OKWA 2UZWE 4UXLA 4WNPA 4XX9A 3DBFA 3Q5ZA 3RNIA 4IB1A 3V8TA 3MPTA 1FVRA 5AP4A 1CKJA 3LCSA 2WHBA 2XS0A 1NA7A 3HV7A 4HZSA 4XUFA 3R1YA 3MVJA 2LGCA 2PE1A 3FHRA 3R8MA 2XKDA 4D4SA 5M4IA 3WF8A 4LRKA 2X0GA 1NY3A 3LCKA 3FJQE 3H9FA 4NKAA 2OU7A 4DG3E 2R3MA 3JYAA 2C6TA 3ZRLA 5HD4A 3CCNA 4CG9A 1IA9A 2RGPA 3SGCA 1H27A 1OL2A 4L00A 4D4VA 4MVFA 2F57A 2BDFA 3EFJA 2Y4IB 2ZM4A 1MQ4A 4DA5A 4W4YA 5M06A 2XIRA 2XNEA 4DITA 3KMWA 2IZTA 3JY0A 3HDMA 4JDKA 3LFFA 4FKWA 4ARKA 4WG5A 4ACDA 3B2WA 2OH0E 2HCKA 5CT7A 4CFXA 1UWHA 4GK3A 4YJUA 3UJGA 4FZFB 4MH7A 4OBPA 2ERKA 2PVMA 3DKGA 3QQUA 2XK8A 2I6LA 4AN9A 2YDJA 3DU8A 1VEBA 4AWIA 4PDOA 3KMUA 4G1WA 4GJ2A 2FVDA 2ZJWA 1W0XC 5CX9A 3KXNA 5I9YA 3C1XA 2PULA 3IQ7A 4N0SA 3OXTA 3P7AA 5HVKA 4DEEA 3PDTA 4WNMA 3VBWA 4LV5A 5EI2A 4TYJA 5IQBA 3Q5IA 3S95A 4ASEA 4YO4A 5I5ZA 2F7ZE 1JVPP 3QRKA 4QO9A 3LJ1A 4GV1A 3TM0A 3V3VA 2OJGA 2PSQA 3AD6A 2QI8A 3ORZA 3MW1A 4PP7A 2X9EA 1DAWA 2X6DA 4DAWA 2AC3A 3ENHA 2GS2A 4EH6A 3W2RA 1TVOA 4OTDA 3AT4A 4A9YA 3FUPA 2VTJA 3F61A 3VUMA 4GK4A 3JVRA 4LQMA 2WXVA 3MIAA 4JBOA 1UWJA 4DGMA 2CCIA 4FV2A 4L01A 4EJNA 3R71A 1PYXA 4EUTA 2E2BA 5ETIA 5CAPA 2W99B 3QHRA 4K8AA 4QQ5A 4AS0A 4BTFA 3CY3A 4Q2AA 2Z7LA 4TNBA 1H1QA 3TDWA 5C8MA 3VUGA 3ZRMA 4B0GA 1FVTA 2WEIA 2ITNA 3TIZA 1RJBA 4P5QA 3W32A 3A61A 4D2SA 3TUCA 3ENMA 2YCSA 4RFYA 2VNWA 2HXQA 2HW6A 4JG8A 2XK7A 4IM3A 3HMIA 2RFDA 1Z57A 3HNGA 1R0EA 4G5JA 3TI1A 2BILB 3PUPA 3DB6A 3R73A 2VWYA 3EJ1A 4QP1A 3FLNC 2UW8A 2AYPA 2PVHA 4BDKA 2Z7QA 4RIYA 5HU9A 4MD9E 3OG7A 5KBRA 3R28A 5D41A 2ZMDA 4M14A 2CNQA 1CM8A 4RWKA 3ITZA 1PRYA 2WQBA 4DFZE 5J1WA 3QQFA 4FYNA 4IMYA 5AJQA 3RJCA 3OWPA 2WTCA 4RLKA 5JK3A 5HLNA 4O21A 4ZXTA 2WKMA 4XP3A 3V01A 1PYEA 4UEUA 3C4FA 4FL3A 4X6QC 3DAJA 4IM2A 5M51A 5FQDC 5LCJA 2FUMA 3L8SA 4D5HA 3IW8A 4MX9A 4NSTA 4EHEA 3HRBA 2DYLA 4QMXA 4ZTNA 3PYYA 3Q9ZA 3UG1A 4FNXA 3HKOA 4EOLA 5C01A 2W7XA 3FI3A 3K3JA 3COIA 3C5IA 3DXNA 3R9DA 3S3IA 3VS0A 4GCJA 4FR4A 4KKEA 1FGIA 3CTJA 2QO9A 4I6BA 4RGJA 5EKOA 1PKGA 2XK6A 4FNYA 3MY1A 4C3RA 3QRUA 3V5QA 2PVFA 3R00A 4BCHA 2WMWA 1PXPA 4YO6A 2VTSA 3G0FA 1J1CA 3QZGA 1EH4A 4CNHA 3R9HA 2XIKA 5KMLA 5BVNA 3RGFA 2CGVA 5DEYA 4ZSEA 3FKOA 4EOJA 5IH5A 3E8EA 4FOCA 4JNWA 4U81A 4L46A 2OJIA 5HG8A 5ETAA 2PTKA 3KRWA 4NKSA 4C7TA 3F3VA 3FYKX 2G9XA 2EUFB 5FP5A 3NGAA 2YIRA 3SC1A 4I41A 1QPJA 4EOIA 4Q9ZA 2XK4A 3NPCA 2GNIA 1JSTA 2Y6MA 3Q9XA 3ZSIA 4EONA 3MYGA 3TKUA 5CAUA 5HQ0A 2DWBA 5IEXA 2GDOA 4PX6A 5HG5A 5DRDA 5BMSA 2IG7A 2CN5A 4IX4A 4F6WA 1S9JA 4CCUA 3BHYA 3UPXA 5BUEA 1T46A 1G5SA 3BWJA 5CSHA 3TUDA 1IRKA 3MB7A 4XG2A 3I7BA 2CJMA 4XV3A 4C33A 4BI1A 1G8AA 3KULB 3OCTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5M56 A;  4NFM A;  4A9U A;  3SXS A;  2O3P A;  5BVD A;  3FMJ A;  2WMT A;  2XEY A;  4NH1 A;  3PPZ A;  3PXK A;  3SG8 A;  4CTC A;  2QO2 A;  3PG1 A;  4BDB A;  4F4P A;  3D7Z A;  4BI0 A;  4ENY A;  4M84 A;  5FLF A;  1AGW A;  4CMU A;  1WBT A;  1H8F A;  3DBE A;  3SKC A;  3QQG A;  4CMO A;  4XLI A;  1JLU E;  2YCQ A;  3VS6 A;  3CS9 A;  4QYY A;  5DA3 A;  2JAV A;  2VTR A;  5E7R A;  5HBH A;  3IPH A;  5FBN C;  2JDR A;  4S31 A;  5IH6 A;  4CQE A;  4CRS A;  5K4I A;  3S00 A;  5A4T A;  3ULZ A;  2G2F A;  4C58 A;  1YWV A;  4FT0 A;  3OF0 A;  4WUN A;  4AXA A;  2VWB A;  3IK3 A;  2ITT A;  4FT7 A;  2CDZ A;  4B9D A;  3T8O A;  4GII A;  2JFM A;  3LXL A;  4EWH A;  5CF8 A;  3A8W A;  5M07 A;  1V0P A;  3AC4 A;  1UU3 A;  3DDP A;  4MBI A;  2IN6 A;  4Q9S A;  3PWY A;  3MVM A;  4KBC A;  4E73 A;  4L52 A;  1ZZ2 A;  2B9H A;  2ZFY A;  2VO3 A;  4BTJ A;  2C6D A;  2P4I A;  4GUB A;  5KHX A;  2C0O A;  4BIB A;  2C0T A;  5EDR A;  2R3H A;  1JKT A;  3ZBX A;  2X6E A;  1SVE A;  2UZO A;  4Y73 A;  3OCG A;  5EYD A;  3UMW A;  3R0T A;  5AP6 A;  3WF7 A;  4EHG A;  3HDN A;  4EOS A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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