3BL7A

Synthetic gene encoded dcps bound to inhibitor dg156844
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
LPFSGFRLQKVLRESARDKIIFLHGKVNEEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLTGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRQLNDVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLRLIRETGDDYRNITLPHLESQSLSIQWVYNILDKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGIRSLRDLTPEHLPLLRNILHQGQEAILQRYRMKGDHLRVYLHYLPSYYHLHVHFTALGFEAPGSGVERAHLLAEVIENLECDPRHYQQRTLTFALRADDPLLKLLQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Scavenger mRNA-decapping enzyme DcpS
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 286
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.59: 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase.
pdb deposition date 2007-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05652 DcpS Scavenger mRNA decapping enzyme (DcpS) N-terminal
A PF11969 DcpS_C Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3bl7A01
3.30.428.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich HIT family, subunit A HIT-like 3bl7A02
1ZWJA 4QEBA 4NDGA 4NDHA 5IPDA 3OMFA 1FITA 4ZGLA 3OHEA 2FHIA 3WO5A 2EO4A 3ANOA 3FITA 6RHNA 5CS2A 4ZKLA 1XMLA 4NJZA 1Z84A 1VLRA 3SPDA 5ED3A 1KPEA 2Q4HA 4QDVA 3O1XA 3L7XA 3O1CA 3R6FA 5I2EA 5IN3A 2FITA 3LB5A 3BL7A 3BLAA 5ED6A 1KPFA 4EGUA 4XBAA 5RHNA 1GUPA 4YKLB 3TW2A 3IMIA 4FITA 4INIA 2OIKA 3O0MA 3SPLA 6FITA 2H39A 3QGZA 1RZYA 3N1TA 1XMMA 4NK0A 3SP4A 1HXQA 3I4SA 4NDIA 4EQGA 5I2FA 3RHNA 5IPEA 1ST0A 4RHNA 1HXPA 4QDEA 1Y23A 1KPBA 4ZKVA 3O1ZA 4INCA 3KSVA 1KPAA 3NRDA 3OXKA 3SZQA 5BV3A 5IPCA 3N1SA 3P0TA 1GUQA 4NJXA 5FITA 3OJ7A 1EMSA 3I24A 4NJYA 4EQHA 4NDFA 1AV5A 1ST4A 4EQEA 3BL9A 5IPBA 1FHIA 1KPCA 5EMTA 2Q4LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GUEA 3F69A 1BLXA 3QD3A 4H05A 5J87A 5BVKA 3FI3A 4ZSAA 4R5YA 4GYGA 4FBXA 2GPHA 2X2MA 5CASA 1OVEA 3AKLA 4E4XA 2WEVA 3HA6A 3CTJA 4EC9A 1OIRA 4ZGLA 3NW5A 5M51A 4UV0A 5E91A 4I5WA 1Y6BA 2JKQA 2B53A 4FL3A 5EYDA 3WILA 5KNJA 1LEWA 1ZAOA 3AXWA 3PY1A 1J1CA 1QCFA 5TT7A 5DHJA 3NUXA 5A3XA 3RPYA 2Z2WA 2W5HA 3FPMA 5HCXA 1YW2A 4C38A 3C7QA 3FXWA 4FV2A 4EZ7A 2YERA 3LMIA 3O71A 1U5RA 5CX9A 1FOTA 3G6GA 3COMA 5T3QA 5JK3A 1YOLA 3RAHA 2C5NA 1ZYJA 1WVWA 1JWHA 3DQWA 4QMXA 3GQLA 4JG7A 2PVNA 4FUYA 4ZAUA 4AE6A 5CAPA 3E92A 3KK9A 4QDVA 4IC7A 3O1XA 4YGAA 4CFUA 3QKMA 4FKJA 4HZRA 4XS2A 4TW9A 5K5XA 2OW3A 4V04A 3D94A 3I0OA 2R7IA 3PPJA 3DAJA 2PE0A 2UW7A 4NJ3A 3OT8A 3NYNA 5EW8A 5HLPA 3RPRA 1FGKA 2R3OA 4G6NA 2VX3A 5EDQA 4QP3A 4FITA 4PP7A 4L6QA 3TWJA 2YM4A 3OTUA 4RGJA 3SPLA 4IEBA 4R3PA 2G01A 5D10A 3BE2A 4CTBA 3NPCA 4JDJA 1GZNA 4J8MA 4CT2A 4F1OA 1GAGA 3W32A 3ORTA 5EG3A 3QGZA 5E4HA 1LPUA 3CTQA 1G8AA 3QYWA 2W1EA 5K4JA 3O17A 4NK0A 3V8SA 2C4GA 5FP6A 3GCSA 4AQCA 4BC6A 2CGXA 5ETIA 4RVLA 3T9TA 5DEYA 5K5NA 3NUAA 4UZHA 5IDPA 4LQMA 3AKJA 3RHNA 4H1JA 4C61A 1K3AA 1YXUA 2IZRA 2SRCA 2W06A 3CQEA 2BCJA 4LRKA 4P2KA 1OL6A 2OICA 3C0HA 4LV8A 2OH4A 3KRRA 3GB2A 3OCTA 2XJ0A 4MX9A 4QYYA 4AT5A 3PFYA 3PXRA 4M7IA 2R0IA 2QOIA 2PVHA 3OZ6A 3VBWA 4AA4A 4USEA 3CKWA 3WE4A 3SG8A 3ZLWA 2QG7A 4GL9A 4QYGA 2A2AA 2BDFA 3QU0A 4TYJA 4GS6A 3NNVA 2Z7SA 2X0GA 3ODZX 2ZVAA 3FMHA 4FG8A 3NCZA 3UE4A 5E1SA 3ALOA 4QRCA 4DLJA 4RFYA 1OBGA 4EK8A 1R1WA 5ETCA 3PJCA 3C0GA 3DOGA 4ZMEA 3RJCA 4DF3A 3FQEA 2QKWB 2WTCA 4D55A 3IQ7A 2GS2A 4JRNA 4ZY4A 5K4IA 4GMYA 4I20A 4M97A 4D5HA 3KF7A 3C13A 5HTBA 3BZ3A 4CMOA 2IG7A 4I92A 1UNLA 2BALA 2GQGA 4TY1A 3UG1A 5CVHA 4O81A 4G0JA 5K9IA 2WFYA 2O0UA 4LDTA 4IAIA 3MJ1A 3FLSA 4EQUA 2RKUA 4LI5A 4HGSA 2PPQA 2V5QA 3BLRA 3PJ3A 1OKYA 3WZDA 3GC8A 2CCIA 4O38A 2R5TA 4E8AA 3RNIA 1UU8A 5AADA 4FIHA 4E4MA 4I4EA 5IZFA 3OOGA 3NUYA 3SRVA 3TUBA 4OBOA 2ETKA 4AWIA 4HVHA 5CF6A 3BELA 4EQEA 4BCNA 4J8NA 3QCYA 3MS9A 1XQZA 3DQXA 3FKNA 4EOQA 4BBEA 3RTPA 2XS0A 3HRBA 3R73A 4XNEA 1UU7A 2I7QA 3OWLA 3RP9A 4BKJA 3VULA 3LFSA 2P3GX 2C6DA 2G2HA 3IGOA 4MXYA 5ANOA 4AOTA 3TJCA 4I23A 5CI6A 3ALNA 2XK7A 4FKTA 4YJSA 4BGGA 2JC6A 2AC5A 3QC4A 1XWSA 4C59A 2P33A 5AV0A 4TYGA 4DA5A 2R7JA 4XG6A 4AFEA 3MWUA 2UZOA 4PF4A 3R71A 2PUNA 3FUPA 4GFOA 1RW8A 3GVUA 1H1WA 4AU8A 4M12A 2HENA 2JEDA 4F6SA 5FXQA 5HEZA 4CFWA 4AS0A 3D14A 4YKLB 3UPXA 3TW2A 2UV2A 5I4NA 4Z7HA 3F2RA 4CLIA 3EQIA 5ETFA 2H39A 2QVSE 2W17A 3LJ2A 5JRSA 2V22A 2ITYA 3R7YA 1MRVA 1XMMA 2WQMA 3DTCA 3UC4A 3PSBA 1WFCA 3D5UA 4XP3A 1WAKA 2XM9A 1ZYCA 4BDJA 3EQDA 3KXMA 4GJ3A 3UNJA 4GT3A 4F78A 5I0BA 1LR4A 4RVKA 5HO8A 3DB6A 3BQCA 5TKDA 4CTCA 2ITNA 4JNWA 2BRMA 3N4UA 3QKKA 4QTBA 4NM7A 4LGHA 4DEDA 3F9NA 5IPEA 1KSWA 3RK7A 2JLDA 4RWJA 2F7EE 2ZM4A 3ORKA 1Q8ZA 3OS3A 4K11A 4AN2A 4EJNA 5BUJA 5M07A 3E3BX 4FV0A 4QYHA 4TPTA 3SXSA 3QQFA 4XCUA 4Z7GA 4S32A 4MBLA 4FKOA 1B6CB 1H28A 4JRVA 3QCQA 2IW6A 2XKDA 4RJ4A 4AAYA 1KOAA 3HX4A 2I0YA 1JLUE 4NUSA 4Q9ZA 3ZM9A 4FSYA 3UPZA 3RCDA 4P7EA 5CSHA 1W83A 4A9SA 4I6FA 2PMOX 2UZLA 1YQJA 2VWWA 3DDPA 2BHEA 4NL0A 3U9CA 4BCIA 2BHHA 3CCNA 5HVYA 2ITUA 4F7JA 4AW1A 4CD0A 4EYJA 4W4VA 4CKJA 4F0FA 3FYJX 2PMNX 3QLFA 1PY5A 2CDZA 3K5UA 1CKIA 3AMAA 4AN3A 1JSTA 4DFYA 4ZS4A 4O0WA 1RE8A 5DG5A 2G15A 4PDPA 5M53A 4ERKA 2OKRA 4ACMA 5DVRA 5B2LA 3PTGA 5JSMA 3VBXA 2E9OA 4NCTC 4XG7A 3UOLA 3BGPA 3MGYA 2XZSA 4YC8A 5FGKA 4KIPA 5DOSA 5FEEA 5CF5A 2Q4LA 5DN3A 3PA5A 3KXXA 3ACJA 1PXLA 4FSUA 4FC0A 4KS8A 4C4GA 2WTIA 3MA6A 4QEBA 3R02A 5DGZA 3SG9A 4FKSA 3Q52A 1RJBA 4FOCA 4GU6A 1PMNA 5EDPA 3IW5A 1F0QA 5DIAA 4LOQA 5CSWA 4A7CA 2WIHA 5KCVA 1T46A 1STCE 4G1WA 2X1NA 5CNOA 1OITA 3DKGA 3D2KA 4RJ5A 3Q96A 5GNKA 5ANJA 2XMYA 5L6OA 5EM5A 3HV3A 3LQ8A 5LWNA 3MDYA 3R04A 1XMLA 1ZMVA 5JQ8A 4BF2A 4EJ7A 2RG6A 3DY7A 3F5PA 2VO3A 3OEZA 4AZEA 1WBSA 4RQVA 4L7FA 1ZMUA 4FI1A 4BIEA 3OOMA 4NSTA 3Q9ZA 3UOKA 1Q8WA 5IEVA 3AT2A 3MVHA 3QD0A 4WBBB 2ITXA 3EN7A 3VBQA 4QMTA 2UVZA 1XBBA 3K54A 4QYEA 3QHWA 4XG2A 1APME 4AXAA 4HVSA 5KMLA 3EKKA 4IVDA 5ANIA 3BLAA 3W2RA 3HRFA 1P5EA 2QOHA 1XH7A 5EI8A 1YHVA 3V3VA 3W2PA 4XBAA 3QX2A 3I60A 4G5JA 2XKCA 4EYMA 5F9EA 2J0MB 4J1RA 2OF4A 2AUHA 2PZ5A 1GZOA 4PMTA 5AIKA 3SC1A 3TT0A 5J5SA 4WNMA 3VS4A 3JYAA 2P0CA 4OGRA 4L01A 4QQCA 4UYNA 5FBNC 2UZWE 3NDMA 4E93A 3TZ8A 4HYIA 3JVRA 3VW8A 3BGQA 4FOBA 4KKEA 4PUZA 4MWIA 3N1TA 4KRCA 2QHNA 3UYSA 1SVHA 4MQ2A 1BL6A 3NVMB 2QOCA 2LAVA 3WIGA 4EOJA 5L2WA 5HD7A 2QCSA 3ML1A 5BVOA 1W7HA 3F61A 4PMSA 1OL7A 5DRDA 1FVVA 3NAXA 4DC2A 5HZNA 4I24A 2PSQA 2F2UA 3UZPA 1NVRA 2BDWA 3QQGA 3QALE 3QBNA 4ANBA 5F94A 3QTSA 3E7VA 3VAPA 4EQMA 3VBVA 4H36A 4DDIA 3TG1A 5B0XA 4CRLA 1O6LA 4JAIA 4O2PA 2OK1A 3FHRA 4O0VA 4KIOA 5EHLA 5I9WA 4YZBA 4O7LA 3VHKA 4CMTA 2HELA 3C51A 4LL0A 4X7QA 3ZHPC 5FP5A 2UW8A 3VRYA 4UXLA 3OW3A 5J8IA 1H0WA 1SVEA 4D2RA 3NMUF 5IH5A 1YHSA 4ZLYA 4I93A 1FPUA 4M8TA 1A48A 2A1AB 3GGFA 3D7TA 3PUPA 3V01A 4IW0A 5M56A 1YXVA 4TT7A 3W2OA 2XKFA 5EW3A 2XUUA 1J3HA 3SXRA 3DKFA 5F95A 3FMLA 4AUAA 2XJ2A 3SV0A 1M2PA 4FSWA 2V7OA 4QPAA 4IVBA 3I0QA 1ATPE 4XG9A 4FTQA 4XOYA 3R8VA 5IEXA 3FL4A 3VO3A 3BLQA 4XRLA 3W18A 2WQOA 1O6YA 4C4IA 2EXCX 2X2KA 5IEYA 4RJ3A 3DXNA 3WZEA 5IA2A 5D12A 4U45A 3IKAA 3RM7A 3TV6A 2PY3A 5IQAA 4DEIA 2C5OA 4C3PA 4DGGA 3W0PA 4E26A 2ZFYA 5AUTA 2W1IA 1J1BA 2Y6OA 3R22A 3DNDA 4L00A 3V5WA 4A4XA 4BCHA 2XK8A 3VUMA 1IG1A 3BKBA 4IH8A 1H1RA 3LMGA 4YSJA 2W99B 3L9MA 5LMKC 2QLUA 2PZRA 3EJ1A 4NZWB 4Y72A 4FT0A 2WU7A 4EOPA 3FC1X 1FITA 3VS2A 4DTKA 3A62A 4U8ZA 3G33A 3V5LA 4XRJA 1ZZ2A 1Q97A 2W1FA 4FV4A 4K18A 2BKZA 2JIVA 3QKLA 4OBQA 4MQ1A 4YHJA 2IO6A 3QRTA 3DLZA 1L3RE 3JY0A 2UVXA 5FXSA 4FTIA 4X3FA 3MBLA 3W0SA 3WF9A 5CS2A 2HOGA 4GKHA 4GW8A 4B7TA 2CJMA 2HXQA 1ZOEA 3HV7A 3KC3A 4C7TA 4NJZA 5KMNA 4PDOA 5HQ0A 1H1PA 4DHFA 2XP2A 3FZOA 1FVRA 5LOHA 2XVDA 3OCBA 1XBCA 3SAYA 3AOXA 5JGBA 1XHAA 4FEUA 4V0GA 4IZ5A 5B2KA 1UV5A 2X4ZA 4UYAA 4PQNA 2B52A 3F3TA 4U6RA 5FTQA 3ROYA 4A4OA 5A54A 3O50A 3RWPA 4AP7A 2W05A 3W0OA 1XR1A 3VUHA 2ZJWA 4W4YA 3E63A 3RI1A 4XUFA 5LMBA 4GUBA 3QXPA 3LCDA 4I21A 2W5AA 3GC0A 2YHVA 3MH0A 5JH6A 4BZOA 1OPLA 3A8XA 5E8XA 5HD4A 5C27A 2H8HA 2XIKA 4WNPA 3W33A 3NYXA 2QOLA 4DFNA 5M09A 2Z02A 3MIYA 5AV1A 2H96A 5ANKA 2C5XA 2I0HA 2XB7A 3A7HA 4S31A 4YC6A 5C8MA 5HCYA 3COHA 1OECA 4IM2A 1KWPA 3F66A 3ZUVA 4XG4A 3R2YA 3BU5A 3H9OA 2VTOA 4LL5A 4YNOA 5EQEA 4E6QA 5CEQA 5HNIX 5J1VA 3JXWA 4JR3A 4DGOA 5GJFA 5CAVA 3D15A 3N9XA 3UDBA 1XH5A 1KPAA 2YIYA 4RMZA 4TWNA 3QZHA 2W1HA 4JR7A 3QTUA 4Y5HA 3FSFA 4FEXA 5HVJA 1S9JA 2QHMA 3BEAA 3R1YA 5JZJA 4U3YA 5L2TA 3OMVA 3KL8A 5BV3A 4G6LA 1NW1A 4QP6A 4NTSA 3PA3A 2RFSA 4AX8A 4C58A 2XEYA 2Z7QA 4M69B 3Q4CA 1OGUA 2VO7A 4MD8E 2BZJA 5H2UA 4L7SA 1PXIA 1V0BA 4HPTE 4A06A 2Y0AA 4E4LA 2ERKA 3CR0A 3QTIA 5CZIA 4ASEA 3UTOA 4F0IA 4IZYA 1V1KA 3D5WA 3E62A 3HECA 2YA9A 5CYIA 3II5A 4FJVA 4BTJA 3DA6A 4WSYA 3P23A 4QMOA 3BYVA 3REPA 4NDFA 1Q3WA 1URWA 3CLYA 5DLSA 3UBDA 4BTMA 4R77A 1ST4A 4TWCA 3EZVA 3WZKA 3FMKA 1BYGA 2XK3A 2C3IB 3DBCA 3H30A 4QP9A 1ZZLA 5BMMA 2YCFA 1ZMWA 3QRKA 5A46A 5HLNA 1QMZA 3KRWA 1LUFA 3Q4TA 4FYNA 4KIQA 2XRWA 3UC3A 4M13A 4BDDA 3BU6A 3A7GA 1OIYA 4RX8A 3ZO2A 5IUGA 5LVOA 1M7NA 2IZTA 2R4BA 3QCSA 4CKRA 1U54A 3GOKA 2W1CA 4DBNA 1GIIA 1K9AA 4EI4A 1EH4A 4FZDB 1BKXA 3NFFB 3NLBA 5IF1A 4BHZA 2XJ1A 5FD2A 5EYCA 3ANOA 3FITA 3C1XA 3NNUA 4MXOA 4BGQA 5IQDA 3O8PA 4FIFA 4ZSEA 5KHXA 3R8MA 4MXXA 4PX6A 3O7LD 4FK3A 3P86A 4IBMA 2QOQA 1YI6A 3TMOA 3TUCA 4X2GA 5FQDC 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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