3BLAA

Synthetic gene encoded dcps bound to inhibitor dg153249
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
LPFSGFRLQKVLRESARDKIIFLHGKVNEEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLTGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRQLNDVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLRLIRETGDDYRNITLPHLESQSLSIQWVYNILDKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGIRSLRDLTPEHLPLLRNILHQGQEAILQRYRMKGDHLRVYLHYLPSYYHLHVHFTALGFEAPGSGVERAHLLAEVIENLECDPRHYQQRTLTFALRADDPLLKLLQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Scavenger mRNA-decapping enzyme DcpS
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 286
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.59: 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase.
pdb deposition date 2007-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05652 DcpS Scavenger mRNA decapping enzyme (DcpS) N-terminal
A PF11969 DcpS_C Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3blaA01
3.30.428.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich HIT family, subunit A HIT-like 3blaA02
1KPEA 3O1XA 6RHNA 3LB5A 4EQHA 3L7XA 3P0TA 4NJXA 3ANOA 4FITA 3WO5A 4EQEA 1HXPA 5IPEA 4NDHA 1GUPA 2FITA 1EMSA 5FITA 5CS2A 3O1ZA 1FHIA 2H39A 5RHNA 3OJ7A 3BLAA 3OMFA 2Q4HA 3RHNA 1Z84A 6FITA 4INIA 3FITA 5IPBA 4NJYA 5ED6A 3SZQA 1RZYA 1XMMA 5EMTA 1ST4A 3R6FA 3TW2A 4NJZA 3SPLA 3OXKA 2OIKA 4ZGLA 1KPFA 4ZKLA 4RHNA 1ZWJA 3BL9A 1KPBA 3O1CA 5ED3A 1Y23A 1GUQA 4NDFA 2FHIA 5IPDA 4NK0A 3IMIA 5BV3A 1KPAA 4QEBA 1HXQA 4QDVA 3N1TA 4QDEA 5IN3A 4INCA 5I2FA 3NRDA 4YKLB 3SP4A 1XMLA 3I4SA 4NDGA 1AV5A 1FITA 4ZKVA 4EQGA 1ST0A 4NDIA 3KSVA 3O0MA 2EO4A 5I2EA 2Q4LA 3OHEA 3QGZA 5IPCA 3BL7A 3N1SA 1KPCA 4EGUA 3SPDA 4XBAA 1VLRA 3I24A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MS9A 3EN4A 2ITQA 1ZMUA 3DLSA 3TKHA 1G8KA 2EWAA 3GCQA 2VTPA 2BHEA 3NAYA 4WG5A 4A4OA 1H1WA 3E3BX 4FTQA 3R9NA 4F1OA 2VTQA 2XB7A 2O2UA 3ATTA 1JQHA 4GIIA 4AN9A 4CVAA 4R6VA 4RWLA 5HNIX 3MYGA 2WMUA 2JDRA 3FYJX 1MRYA 3HAMA 3VBQA 5CX9A 4BIBA 4E5BA 4ZMEA 5E4HA 4FKIA 3Q9ZA 4W8DA 3PWYA 2HXQA 3W55A 1GZKA 3DZOA 3ZOSA 2J90A 5C26A 1GUPA 2WEVA 4RJ5A 4EI4A 2UW6A 2QOBA 3D94A 2VWIA 4U41A 1OUYA 4YZNA 3FSKA 4XBRA 3V3VA 2ERKA 4DCAA 2WQMA 1J1CA 3OMFA 3MB7A 3BYUA 1W7HA 3PY1A 3F3ZA 4EH5A 2R4BA 2RG5A 2X8EA 4IWQA 1S9JA 2I6LA 2GNHA 3R9HA 4O7ZA 1PRYA 3W8LA 2YZAA 4IB0A 3QGWA 4G31A 2I0YA 1NVQA 1XH7A 3D7TA 4V05A 3R7YA 3W2CA 3GU7A 5IQAA 4NH1A 3A7HA 3UPZA 2C6OA 1WBSA 4I24A 3SLSA 3RWQA 5KKRB 4LGGA 3NUSA 5DWRA 1PXLA 3AGLA 3M1SA 3Q4ZA 4ZGLA 5K9IA 4CZUA 2BRHA 4BTFA 4CNHA 2RKUA 4E5WA 5A6OA 3D2KA 2X7FA 2WTJA 1OL6A 2PU8A 3BL9A 2F2UA 3Q2JA 1Y23A 2JDVA 1OM1A 3MN3A 4FV7A 4J71A 3F69A 2WU6A 2OJGA 4DFNA 4C62A 3S95A 4IWDA 3GT8A 5C01A 3WYXA 1RW8A 3DGKA 2HIWA 3LQ8A 4NSTA 2V22A 5ACBC 3EZRA 4EC8A 3BELA 1GZOA 5IDPA 2P0CA 4CEGA 4IQ6A 5KO1A 4ZSEA 5FD2A 2QURA 1T45A 2X2KA 2JEDA 4BCGA 1ZARA 4XV1A 3A7FA 3E5AA 3FL4A 5A4TA 2AUHA 3AT2A 5IMXA 4EHZA 4HVSA 3GI3A 3TDVA 4BCKA 3BIZA 1QPDA 3FL5A 3E88A 2ACXA 3H0YA 4RQVA 4DGOA 4C58A 1X8BA 2XALA 4C4EA 5IEVA 2Y6MA 4I94A 3E3PA 2IN6A 4I4FA 1OB3A 1WZYA 4ZJJA 3AD4A 4JQ8A 4QP3A 3UDZA 4A9UA 5HE1A 3ROYA 3I60A 3A8WA 4K1BA 3ZRKA 2W9ZB 1XJDA 4IM0A 4YMJA 5L2SA 5L8KA 4BGQA 4NKSA 3RHXA 2JC6A 5BYZA 5C4LA 3GU6A 3PXZA 4JDJA 3OOMA 5BQ0A 3VUIA 4BHZA 1YWRA 1ATPE 5HD4A 5M44A 2B7AA 4MF1A 3HZTA 3JVSA 3QTIA 4ZIMA 1GOLA 4BCPA 3REPA 4BN1A 4DTKA 1QPCA 2VO3A 1U46A 4DTBA 2ITPA 3ZH8A 3QUEA 2PVMA 2R3JA 4BJJA 4RC3A 3O8TA 4PMTA 3ATSA 5BVOA 1NW1A 2W7XA 4F1MA 4HVGA 2ZM4A 4ZY5A 4FMQA 4O84A 2O5KA 4LV8A 3QRJA 2J2IB 3V5QA 3UP7A 2BZKB 3NLBA 4CMUA 3QQHA 4E8AA 2C6DA 4NU1A 3FUPA 1H0WA 2XZSA 1JOWB 1IG1A 4RVTA 4TYHA 4WHZA 3O71A 4X2KA 2HW6A 2R3HA 4DAWA 2CKEA 4YJPA 2J0MB 4B8MA 4EQEA 1MQBA 2OO8X 5DNRA 3LFDA 4FTCA 4DGGA 3UG2A 4J7BA 5FM2A 2QO2A 4IVDA 4NDHA 2P33A 3DFCB 2WMSA 3AMBA 5H9BA 3ZO2A 1EH4A 2FSOX 5IQIA 2DYLA 4FT7A 4IDVA 3PE1A 4AGWA 3IKAA 4EC9A 3MIAA 2XIKA 1Q62A 2Z7RA 3FZOA 2WAJA 4BBEA 5CLPA 3KEXA 2WQOA 3DFAA 3TNWA 4YPSA 2ZM1A 4YZMA 3FXWA 3KCKA 5HVYA 3PIXA 5AUUA 2B54A 3EZVA 4KWPA 5ANIA 4HGEA 4O81A 4ZSJA 5HG5A 4L3PA 4USFA 1XMMA 3Q6UA 3ZHPC 4TYIA 3LMIA 4L42A 4BYJA 1CDKA 4Y46A 4I6LA 1ZOHA 3OXZA 4FG8A 1R39A 3C50A 3MBLA 3KIOC 4D4YA 2PY3A 4BB4A 4JNWA 4FZ7A 3O96A 2BAKA 5HCYA 1KPBA 4RWJA 1GJOA 2OJIA 4AT4A 3OS3A 4RWIA 3R9RA 2W17A 2QO7A 2OG8A 4KRCA 4WT6A 3DJ6A 2WKMA 4O22A 4G9RA 2JAVA 4CTBA 5FUTA 5A4EA 5I0BA 4QMQA 2P55A 2BMCA 2VTIA 3PPJA 5H3QA 3ORLA 5HU9A 2WQNA 3UE4A 3D5WA 1BUHA 3E62A 4DT9A 5H8EA 1Q8YA 4WNMA 4NFNA 3UNJA 3I0OA 1HXQA 3AC1A 5AWMA 5L2WA 3ORNA 3TTIA 5EYMA 4X2FA 4AOTA 4O96A 4ZTSA 3FY2A 5TR6A 3OWLA 3QTSA 4WBBB 5EYDA 4RX5A 5CASA 3ZFYA 4MVFA 2GS7A 2QLUA 2QQ7A 1Q8ZA 4GW8A 3S0OA 2F7ZE 4YJQA 2FSLX 2BRMA 3ZZEA 4DN5A 4FKRA 5KE0A 4IAAA 4QYHA 5CF4A 1OL5A 3LKMA 4EZ3A 4JRVA 5DBXA 4HVIA 1U4DA 4IX4A 3TXOA 1LP4A 4HCVA 2BILB 4AWIA 2J7TA 2A0CX 2OJ9A 3NYOA 5EI6A 2VUWA 3WI6A 1CKIA 4G1WA 4IANA 4EWHA 5I9WA 4L68A 3ORXA 3SRVA 4ANQA 5CU2A 3CTHA 3GOKA 3GFWA 3CTJA 3HEGA 4IM3A 3VS0A 1PY5A 5JK3A 2PZRA 2IPXA 4EGUA 3LMGA 4DC2A 5JFVA 1PXIA 4AT5A 4O2PA 4QRCA 4AE9A 4XBUA 3C0GA 4DEHA 5IG1A 5HKMA 5FEQA 4PTCA 3KN6A 2ZJWA 3UOLA 4L53A 3ANOA 2IZUA 1JVPP 2GDOA 2JBPA 2W0JA 4I0TA 4ANMA 5LARA 5ETAA 3UYTA 1MP8A 4TYGA 3RAWA 2GHGA 3Q9WA 5CF5A 5IPEA 4EOPA 1A9UA 5GHVA 4CKIA 4U9AA 3LHJA 3MIYA 2XRUA 4HZSA 4LUDA 1YI3A 2CJMA 2XA4A 3A60A 3Q6WA 3NNVA 3HKOA 3JUHA 3TNIA 4DEIA 3KVWA 3CR0A 4TWCA 5DRBA 1GZ8A 3UVQA 4GIHA 2GSFA 3GVUA 4CSVA 5JEBA 3VC4A 2Q4HA 3FQEA 4U5JA 5CS6A 3NW7A 3ERKA 4FNZA 2A2AA 4HGLA 4DEGA 1VEBA 4E1ZA 3SHEA 5DVRA 1OKZA 2DUVA 3UOJA 3DBCA 4XS2A 4IADA 4ZSAA 4AUAA 3OOGA 1ZWSA 5LVLA 3FC1X 4O83A 4FKOA 3D15A 3Q4UA 1W82A 3RCDA 5FP5A 4BI0A 2CLXA 3FQHA 4FNXA 5A4CA 2OIKA 2R3FA 2XK3A 1F5QA 1JKSA 3UYSA 5BPYA 3H9RA 2B9FA 4B6LA 4U0IA 4MHAA 4WNKA 4F0FA 4BDBA 3R2YA 4L67A 3DDPA 3L9NA 3DK6A 3EMGA 3F9NA 3QX2A 4GFOA 4GV1A 3PFYA 4AN3A 3LJ1A 2R3MA 1YXVA 4TWNA 4XRJA 1Y57A 1Z9XA 5CNOA 2BRBA 5CSWA 3KQ7A 1MUOA 3MSSA 3F5GA 5IEYA 3R83A 2ZV2A 3HA6A 2JGZA 2UVZA 5BV3A 1H08A 3OEZA 2HENA 3AD6A 3BV2A 3QTXA 3FJQE 3FV8A 2BROA 3FLNC 2V62A 4FYNA 1YI4A 3NIEA 4FSUA 5E8WA 4ZY6A 2CKPA 2W96B 3D9VA 3ODYX 2GNLA 3HAVA 4H3QA 3WIGA 3FEGA 2XF0A 3R7EA 2A1AB 1QPJA 2PE0A 3NW5A 4NT4A 3UMXA 3ZBFA 4ANBA 2Z7QA 5FXRA 2WTWA 1YHWA 2Q0NA 4O0WA 5DR9A 3EFLA 2EVAA 1IA9A 2VTJA 4H58A 2VTAA 2WXVA 5BVWA 2WPAA 5E9EA 4UZHA 2C5NA 2W9FB 3UO4A 3S00A 2IVVA 3L8XA 5HLPA 2PMIA 4G6OA 2VO7A 4BDEA 3C4EA 4U3ZA 4ASXA 4BDIA 5CQWA 1ZMWA 4X6RA 1BLXA 5HBHA 1OIQA 3BU3A 4E6DA 5A6NA 3D14A 2P4IA 2CNQA 3MFUA 5BUIA 3P7AA 4WNPA 1OIUA 5CSPA 4PL5A 4C4HA 3GENA 2ZV7A 1GZNA 4ZZNA 4RFYA 2ZAZA 3BHVA 4O27B 3CLYA 4AZWA 3F3UA 4PMPA 3NZ0A 3AC3A 3C13A 1OZ1A 2VTRA 4XP2A 1STCE 2C5VA 2OFUA 3EL7A 3NYNA 4O0XA 4XUFA 3BQCA 5E91A 5C8MA 4AG8A 4NCTA 5AV1A 1XR1A 3E7OA 5IH4A 3EFJA 4UWYA 2XNGA 4J53A 4YPDA 2ZMDA 3N4UA 4QYEA 2OJFE 3G90X 1PHKA 2ETKA 4DEDA 2Y0AA 2W1EA 2R7BA 1XBCA 2XCKA 3MFRA 4EH2A 4JBVA 1TVOA 1ZYJA 2UZLA 3OY1A 4HVDA 3TUDA 5FEDA 4U97A 4HVHA 3A8XA 5IQCA 1PMNA 4TZRA 3G9NA 3P0MA 3I5ZA 2VX3A 4ACGA 1BI7A 3ZU7A 1FINA 1YWVA 1UNGA 2BRGA 1J3HA 2NO3A 3HDNA 3TM0A 4AX8A 4A9YA 5CEOA 3SAYA 3R7UA 3DK7A 4MWHA 3R8UA 3WE8A 2H8HA 5ANOA 4CV8A 5JFSA 3BYSA 4JDIA 2P3GX 4AW0A 2C1AA 4IBMA 3COMA 1IR3A 5JZJA 2X6EA 4V01A 4N0SA 3NIZA 4F08A 3FKNA 1H1SA 3VUGA 2PVNA 1KWPA 4GYIA 3VBXA 2LJWA 1OMWA 4KAOA 2HELA 3VF9A 4I23A 3QCXA 5FDXA 1ST4A 4FTAA 3TZMA 4AQCA 3QQJA 1KOBA 1BL7A 3A99A 3GCSA 3NWWA 4I92A 4AOJA 1PXPA 2QOKA 3GU4A 4PL4A 2X8IA 3V5PA 5IUGA 1B6CB 2QG5A 3TYKA 1GIIA 4LDTA 4P7EA 1PMUA 4FV6A 5EW9A 4JAJA 4QPSA 5DGZA 3IOKA 3QTRA 2YM6A 2HCKA 5FXQA 5GNKA 1Q8WA 5CAQA 1VYWA 3CY2A 2GFCA 4BZDA 3KCFA 4JBPA 3G51A 1J1BA 5ED3A 3OG7A 4G6NA 2Q83A 5CZHA 1SNUA 2F7XE 2RFNA 2ZYBA 3CS9A 4D9TA 4JMQA 5CI7A 2UZWE 2JIVA 3RM6A 3O8PA 4IHPA 2XK9A 5CEPA 4GMYA 2CPKE 1WFCA 4WD5A 4YLLA 2ETRA 4IB1A 3VIDA 2WELA 3KMUA 1KPAA 2HW7A 2RIOA 2FO0A 2OBJA 5HNBA 1DS5A 4L46A 3G15A 4Y5QA 4ZLYA 2J5EA 4WRGA 4YJNA 5IPJA 2E9OA 3FLYA 3MJ1A 1SVEA 3NUAA 3QTUA 4G3CA 4KKEA 4ONAA 4ZTLA 2R2PA 3FLWA 4DFZE 3H0ZA 1L3RE 3LCDA 3BEAA 2Z7LA 3MESA 5D7VA 4XRLA 3W0QA 2XH5A 4KIQA 3WILA 1AV5A 1L9VA 3AQVA 4X2JA 4I5CA 3MA6A 5AIKA 5HCXA 2FVDA 2XNEA 5AUTA 4GKIA 1NT2A 3T9TA 3SW7A 3BGZA 4YHTA 3ZONA 4IDTA 3PXFA 4YJRA 2OGVA 2ESMA 1P5EA 1Y6AA 4ASDA 4DLIA 2OF2A 3MH3A 1YHSA 3N4VA 4FZFB 2GQGA 4WA9A 3RJCA 4M0ZA 4XEYA 4FUYA 5EG3A 3C0HA 3LLAA 4P5QA 3FAAA 4AAYA 4RA4A 3GB2A 4GVJA 1WMKA 3KL8A 3PE2A 2XKFA 1KPCA 3KGAA 2YCFA 2YM5A 4RVMA 2YZLA 4QMNA 4O0VA 3R8MA 5HVKA 3LXPA 4F1TA 4JR3A 3O1XA 4ANSA 3LQ3A 3FZRA 4C2VA 5KMNA 2CNVA 5AUVA 1PXOA 4GG7A 1V1KA 3S2PA 3DV3A 1ERKA 4AGDA 1PYXA 5IQBA 4NW6A 3KXNA 3VBVA 4EKLA 2R3OA 2F49A 5J9YA 1G8JA 2C6IA 5AP5A 4EZ5A 5AAEA 2POFA 5KMLA 3QC9A 4YZDA 3QALE 2W5BA 4YZBA 4FL1A 1H1RA 1Q8TA 3DKFA 3R63A 4GK4A 3UG1A 5I9XA 4BCOA 3JXWA 4BCJA 5CWZA 4CT1A 4J97A 2W5HA 3II5A 3P08A 4U40A 4RJ8A 2PHKA 3D0EA 3FMLA 3R73A 3R8LA 5JH6A 4HCTA 4FOBA 4RIYB 2G01A 1Z84A 3PJ3A 2NP8A 5HE0A 6FITA 1PYEA 3CQWA 2IZRA 3PWDA 4J8MA 4AN2A 1H01A 2W99B 3V51A 3E63A 1FPUA 3KVXA 3SKCA 4BCNA 1E9HA 1OPLA 5GIPE 2XJ0A 4H05A 2VTHA 3G9LX 3BWFA 3PSBA 4IZ5A 1YVJA 2X9FA 4FTJA 3JYAA 3IG7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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