3BL9A

Synthetic gene encoded dcps bound to inhibitor dg157493
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
293
structure length
286
Chain Sequence
LPFSGFRLQKVLRESARDKIIFLHGKVNEEDAVVILEKTPFQVEQVAQLLTGSPELQLQFSNDIYSTYHLFPPRQLNDVKTTVVYPATEKHLQKYLRQDLRLIRETGDDYRNITLPHLESQSLSIQWVYNILDKKAEADRIVFENPDPSDGFVLIPDLKWNQQQLDDLYLIAICHRRGIRSLRDLTPEHLPLLRNILHQGQEAILQRYRMKGDHLRVYLHYLPSYYHLHVHFTALGFEAPGSGVERAHLLAEVIENLECDPRHYQQRTLTFALRADDPLLKLLQEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title DcpS as a therapeutic target for spinal muscular atrophy.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Scavenger mRNA-decapping enzyme DcpS
total genus 81
structure length 286
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.59: 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase.
pdb deposition date 2007-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05652 DcpS Scavenger mRNA decapping enzyme (DcpS) N-terminal
A PF11969 DcpS_C Scavenger mRNA decapping enzyme C-term binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3bl9A01
3.30.428.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich HIT family, subunit A HIT-like 3bl9A02
1ST0A 1ST4A 3BL7A 3QGZA 3OMFA 4NDHA 3OHEA 1HXQA 3O1CA 3I4SA 4ZGLA 3SPDA 4QEBA 3OXKA 5BV3A 4NK0A 3BLAA 5CS2A 5I2FA 3I24A 6RHNA 3P0TA 1KPAA 4NJXA 1FHIA 1XMLA 3SZQA 3KSVA 4QDEA 5FITA 1Z84A 2FHIA 2EO4A 3SP4A 4NDGA 2Q4HA 3WO5A 3NRDA 4RHNA 4EGUA 4EQEA 5IPBA 3ANOA 1KPEA 4EQGA 4EQHA 4NDIA 2Q4LA 3TW2A 5IPEA 3RHNA 4YKLB 2FITA 4INIA 6FITA 3N1SA 3O1ZA 1KPBA 5IPDA 5IN3A 1Y23A 3O1XA 1EMSA 5ED6A 4NJYA 1KPFA 3L7XA 4FITA 4ZKLA 2H39A 4QDVA 4INCA 1XMMA 1GUPA 3O0MA 1GUQA 3LB5A 3N1TA 3SPLA 1RZYA 4ZKVA 1AV5A 5EMTA 1FITA 1ZWJA 4NJZA 3IMIA 5RHNA 3OJ7A 1VLRA 2OIKA 5I2EA 1KPCA 5ED3A 1HXPA 3R6FA 3FITA 4NDFA 4XBAA 5IPCA 3BL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GNGA 3D0EA 1ST0A 5H8GA 2HYYA 3ZFXA 2W5HA 3BHHA 3BL7A 3CIKA 4KAOA 4FTLA 3Q32A 2HY81 3JS2A 4ZTQA 3Q52A 2FSTX 3CY3A 5EHLA 4DF3A 3QTXA 4DEAA 2B9HA 2R3NA 3CXWA 3BYVA 3I6WA 4FSUA 4FZ7A 3DDPA 3H9OA 2RFEA 4P2KA 3EZVA 4RIOA 4AZSA 2QO7A 2UW4A 1GNGA 3F2AA 2X4FA 5I9WA 2WMVA 2YCRA 1NVSA 3ORTA 2HWOA 5CANA 3SPDA 4YJPA 5DBXA 3QD3A 2C5YA 3R7EA 4X3FB 5AP4A 3VUHA 4AACA 3LFEA 3OXKA 1I44A 3BU5A 4LV8A 3P23A 4RJ3A 1YW2A 3DJ5A 5DT3A 3UZRA 1JAMA 3VULA 4CCBA 3BHYA 4FV6A 4OT6A 4YJNA 3D5UA 4NM0A 3W8QA 2F7ZE 4PX6A 3ATTA 4IAFA 2R3RA 5DT0A 3C4XA 4YZBA 5CAQA 1KV1A 4O7RA 1JQHA 4QQCA 3BKBA 3AMBA 2WTKB 4ACDA 4XG7A 4XS2A 3KCKA 3FXXA 3N4TA 4TWPA 4YSMA 4A9UA 2JIUA 1ZYSA 3KN5A 4TNDA 2W06A 2PZIA 4CV8A 3A8XA 1KPEA 4RSSA 4S31A 4FV2A 3FMDA 3IECA 2O65A 1Q8ZA 2BVAA 2XJ2A 2PZYA 4ASXA 2W0JA 5IPEA 3EFLA 4J8NA 4I0TA 4Z7GA 4BI1A 3BYSA 3QCYA 4FIFA 4QMWA 5IQFA 4DEDA 1PF8A 5KCVA 5L8KA 3E93A 5IPDA 1T45A 4I4FA 3DBCA 3DK6A 4IZ7A 4L00A 4YP8A 4O0RA 2B4SB 3UNKA 1CKJA 1ZZLA 4FYOA 4FZAB 3E3BX 4DLJA 2VX3A 3NYXA 4XG2A 5AUXA 5KMKA 4FITA 4H39A 3QAME 3OFMA 5FGKA 3UVRA 1W0XC 3LPBA 3DB8A 5HNBA 4HYSA 5GJDA 5HCZA 4HJOA 1JOWB 5AMNA 4RIWA 1DS5A 2IPXA 4EK5A 3QTWA 1ZMVA 4ZS0A 5IA2A 1GZOA 3SHEA 3NMUF 2UW8A 4AT4A 5KMMA 2UW9A 3W0PA 4I20A 4JL9A 3PXRA 2VGPA 1SVEA 4Q5HA 4BY9E 4Z55A 4EEVA 5AV1A 4C02A 3TNQB 4EI4A 3OY3A 3TUBA 4IVCA 2BFXA 3OWJA 4HZRA 4A9SA 5M4UA 1NXKA 3KRXA 2XKFA 3FQSA 4IH8A 1H28A 3H30A 4O2ZA 2A0CX 3RZBA 3UP2A 3VBTA 2R8FA 3DJ7A 3V6RA 4DEEA 5FBNC 4WBBB 2PE2A 3OVVA 4FV8A 2YISA 2AC3A 5CSWA 3MYGA 5CQUA 1YWVA 4DHFA 4EONA 5CQWA 5JT2A 3IW4A 5I2EA 3ZYAA 1CKPA 4M13A 3PY0A 5CU6A 3FITA 4WO5A 3N51A 4HVGA 4XCUA 4I21A 2CGXA 4DBNA 4GIIA 3TYKA 5T3QA 4BTKA 2OKRA 2ZYBA 1QCFA 3WZKA 2YIWA 3FLQA 5D10A 5DGZA 2YIXA 1WBWA 3FKNA 1CDKA 2G2FA 5HE3A 3V3VA 4RIYB 3W0RA 2WPAA 5A4CA 3PJ3A 3ZEPA 3VS3A 2YERA 2C3JA 2W1DA 1R0PA 2J0LA 3KCFA 2BDWA 4U8ZA 1H01A 2BR1A 2YZLA 4FIJA 3RAHA 5BMSA 3MPAA 1OECA 3I79A 3COKA 4YBKA 5ANDA 4YPDA 3NVMB 4KIOA 4BCJA 2IW6A 2PL0A 5BV3A 5D7AA 3RHKA 5E8XA 2GU8A 3RPSA 3HA6A 3BE9A 3W2SA 3IS5A 3NNWA 4O84A 4IVAA 3FZRA 3WZJA 3VF9A 5BVDA 2JKQA 1YVJA 4DTKA 3CE3A 3MB7A 4S34A 4MBJA 5L3AA 3GC8A 4O91A 3RI1A 4K77A 4F7LA 3MBLA 4J71A 5CWZA 4O38A 3QA0A 1I09A 5H9BA 4DH5A 4LI5A 5DN3A 3P0MA 4BJJB 2VTRA 4QMUA 5C1QB 4F9CA 5HLNA 4I41A 2BUJA 3SC1A 4FTRA 1UKIA 5H2UA 3UQFA 3QRJA 5IU2A 1WVXA 5FXRA 4BF2A 4C4FA 4YZMA 2AC5A 4RVKA 3TG1A 2X7FA 2YABA 4WRGA 3KREA 2I0EA 2XEZA 4HYIA 3NYOA 4TT7A 5TO8A 3FPQA 2ITNA 3WOWA 4F9WA 4AZVA 4EQMA 2QOHA 1Y57A 3RKBA 1JVPP 3LCKA 3U87A 3RNYA 5LQFA 4D1XA 3H0YA 3G6HA 4F0IA 2PUUA 4PMTA 4ZTRA 3PDTA 3HUBA 4EL9A 4EZ7A 2X2LA 2LGCA 4IB3A 2QKRA 3L7XA 1Q3WA 2ITZA 5DR9A 3RAWA 2P4IA 3F66A 1FBNA 4FV3A 3Q2MA 2UVZA 2XYUA 3LLTA 4MXAA 4AXFA 2G2HA 1K2PA 3ROYA 1IA9A 4I5PA 4CFXA 4F78A 2OG8A 1P5EA 3FMLA 4FKGA 4JXFA 4Z9LA 4BB4A 3QKMA 4FEXA 3RAIA 1XO2B 2XNPA 1GZNA 4J97A 3KC3A 2OLCA 3RJCA 3S2PA 3T3UA 1YOJA 3O7LD 4X2GA 1W98A 4EOOA 4GVAA 1LEWA 3R8VA 3OP5A 4KSPA 2X4ZA 4NM5A 2JC6A 1W83A 3PXKA 4CV9A 4XRLA 3QQLA 5L6OA 1FGIA 4NTSA 3S95A 3IGGA 4H1MA 1PXLA 3SXFA 4YTCA 4U81A 4O7YA 4NCTC 4H05A 4GG7A 1DM2A 1OBDA 4MD8E 2CNVA 1FOTA 1Q41A 3FWQA 3GI3A 3I0OA 1ZXEA 1PMEA 4FNZA 2R7PA 3B2TA 3C0IA 4AT5A 5TKDA 3ELJA 5KO1A 4I94A 3HV3A 5IA0A 2PVKA 3NUSA 2OH4A 3IK3A 4O7TA 1ZMUA 4X6QC 4XV3A 5L8LA 2CCIA 3HMOA 4FTQA 4JJRA 2Y8OA 3NDMA 3ZCLA 2WNTA 2GMXA 2Z02A 4X21A 3SD0A 3SXRA 5HG7A 3EN7A 1M2RA 4DGLC 2OZAA 5LMKA 1ZYJA 1UU9A 4APPA 3HV7A 1GJOA 2CGUA 1L3RE 5GNKA 4BGHA 2Y7JA 3EOCA 4OTGA 1J1BA 2J4ZA 3BZ3A 2POFA 3EN9A 1UNGA 4UYAA 3VBQA 4I5VA 2XIKA 3AC1A 1PXIA 2JDVA 2F7XE 4KS7A 3PA3A 3QALE 5A4LA 5CVGA 4YJSA 5EYDA 5LCJA 2DS1A 3VBVA 4GFMA 2OO8X 2H6DA 4E5AX 2XYNA 2HWPA 4TKSA 4NCTA 4RC2A 4ACGA 4DEIA 4E6AA 4E6QA 2VO0A 3F2NA 3MV5A 4GYGA 5M09A 4HVSA 4TXCA 4ZMEA 1MQ4A 2UW7A 4D0WA 3UDSA 4ZS4A 3VUGA 3OG7A 5BYLA 2XK4A 4BC6A 4IAAA 3Q4ZA 1PMUA 4F1TA 4RGJA 2YIYA 3I4BA 1QMZA 2FB8A 2VTQA 3IQ7A 2XK6A 4IX4A 3C51A 4EQEA 3LZBA 5IISA 1W7HA 4ITIA 4S32A 4ASEA 3B2WA 3N4UA 3C0GA 5CEOA 5F9EA 4MKCA 4FJVA 4IM0A 4U97A 1BL7A 2C0TA 3PPKA 3QU0A 2XRWA 3NAYA 4E26A 4JVGA 5HQ0A 4IZAA 4NJDA 2GS2A 4WG3A 5CU2A 2R7JA 4C59A 2UZDA 3F61A 4M15A 2AUHA 3PVBA 4WKQA 3RHNA 2UUEA 4KA3A 3LM0A 4PL3A 2YDKA 1OIRA 3LFBA 3DFCB 3MVLA 3PXFA 4Z3VA 4F6UA 1Y23A 3NGAA 3F3WA 5TR6A 3UP7A 4E93A 3THBA 5J87A 5IA4A 3GU7A 3WYYA 2PE1A 4OW8A 3MIAA 4FTCA 5D9HA 3U6HA 5E91A 2UZTA 4LMUA 1VJYA 3FC1X 4JR3A 3UPZA 5CXZA 4E73A 2WQBA 2UZLA 4FV0A 2HY0A 3UMXA 4AXEA 2E9VA 5CT0A 4DG2E 3Q9ZA 4HGTA 2PTKA 4J95A 3RK9A 3ZONA 4QMOA 5DNRA 3SDJA 2WIHA 3PA4A 5L2WA 2QR8A 4A9RA 3W2RA 3Q4TA 4AP7A 4C4JA 2J0MB 4LV5A 1GUPA 1XBBA 3O0MA 3MN3A 2O8YA 2ITTA 3QFVA 4FVRA 3R7OA 3RK7A 3V51A 2OI4X 1OVEA 2CN5A 3O8UA 2R3FA 4I5MA 3TUCA 3OCSA 4FIHA 1UWJA 3ZZWA 4FKPA 1H24A 3MY0A 3FUPA 2BALA 5ETCA 5IEVA 2FYSA 3HMIA 3L9LA 3O2MA 5IMXA 5FTGA 4FKTA 2XK3A 2XP2A 4DTAA 3HX4A 4HYUA 4K0YA 1OB3A 5CEIA 1GIIA 4DGNA 1FITA 3ITZA 1ZYCA 2ZV7A 3AGLA 5JEBA 3DQXA 4FT3A 4J52A 1XH6A 5C8MA 4DC2A 1OPJA 2W7XA 1SNXA 4AGUA 2ZJWA 2B54A 4MCVA 4TZRA 3C1XA 2HENA 2OIKA 5KKRB 1G8AA 3BBWA 4O7ZA 1W84A 2ZB0A 3H3CA 5I4NA 3PLAE 2GNJA 4LFIA 2ITUA 4RWKA 3P1AA 3IKAA 3D83A 4GFOA 4F1OA 4JDJA 4R3CA 3C5UA 4EOQA 4PF4A 2XKCA 3NWWA 4DEGA 5L2SA 4A4LA 3D14A 3O17A 4IC7A 4I0RA 2R7IA 2Z7LA 5M08A 2IO6A 5JFVA 2IJMA 3ORKA 3JPVA 3GUBA 2ZMCA 4TWOA 5H8BA 3DS6A 4DHIB 3ID6C 2IZUA 5EG3A 2XMYA 4EH3A 3EQPA 3G9LX 5HO7A 4RLLA 3UDZA 3S1HA 3Q6UA 2HW7A 1YI6A 4KKHA 3UC4A 3DBDA 1A06A 5HORA 1A9UA 2VX1A 4D4VA 4C34A 4G6OA 2XZSA 5DPVA 3F5PA 4EYJA 3R01A 3A7JA 1CTPE 2RFSA 4IM3A 5KNJA 2GDOA 3EN6A 4HGEA 3R9DA 3W10A 1XH7A 5DH3A 5DEYA 3FMMA 4AFJA 4QP7A 2VGOA 3E62A 4WA9A 4UXQA 3KEXA 4FMQA 4O96A 2G15A 2JDOA 1OIQA 3QGWA 4BCOA 3SV0A 2PZ5A 4I6LA 5CXHA 4C4EA 1JSUA 2OF4A 2JKOA 4G3FA 4N57A 4NH1A 2QODA 5DYJA 4NDGA 3NRDA 1PXKA 3KXGA 1RE8A 4RWLA 4AOTA 3NUYA 5IF1A 3AOXA 1XBCA 4P4CA 4ZSEA 1G8KA 2OZAB 2IW9A 3ZO4A 4O0VA 4QQ5A 4EH2A 2OXDA 3D15A 3LCDA 1UU3A 4MTAA 3PG3A 4FYNA 4DH7A 2HCKA 2WU7A 3L9NA 1M7QA 3MH3A 4FKIA 2OFVA 3AKKA 5FEDA 3LM5A 5EM6A 2R3KA 3R8UA 2XJ1A 2GHLA 3SXSA 3UBDA 3SAYA 4ZY4A 4DHZA 1R3CA 5AAFA 4V0GA 1M17A 3HMPA 4YR8A 4UBAA 4BCQA 4ZJJA 3A62A 3ETAA 2W4KA 3MIYA 4L44A 3ZLYA 2BZIB 3K3IA 2I7QA 4GIHA 4BCIA 4F6SA 2WGJA 3K5VA 3UTOA 4C58A 5F4NA 5IA1A 4EJNA 3WF8A 5GJGA 1SVHA 2AEGA 4X3FC 2XK7A 5T6KA 4H36A 2GNIA 2E2BA 3ZO2A 3N1TA 4GVJA 3R6XA 3SW4A 2O64A 3FSFA 3FY2A 5F1ZA 4AXCA 2ITQA 1WVYA 2WD1A 4U5JA 5IQIA 5TOZA 4D58A 2XNMA 2QG5A 4D4SA 4FNXA 4FTMA 5CLPA 4QRCA 3HP5A 5JKGA 5M56A 3SVVA 1XHAA 4EC9A 1VLRA 1ZOEA 3LE6A 5J5SA 4HW7A 1J1CA 2ONLA 3TNHA 3M11A 3KRRA 3PLSA 2BRNA 4JMQA 4BIBA 4FSWA 5ED3A 3NFFB 5LVOA 3COHA 3BX5A 4FZDB 1H08A 1OL6A 2GNFA 3H10A 1ZAOA 4HCUA 1REJA 4D5KA 3BLRA 4CVAA 2V62A 4UXLA 3QKKA 2R3IA 1PRYA 1WFCA 4G34A 2XVDA 5CF5A 5JGBA 4AZFA 5FXSA 3NCGA 4DHJA 4DFXE 2G2IA 1YKRA 4AA4A 4ERWA 2R64A 4X3FA 4NDHA 2WTIA 4C4HA 3R8ZA 3TNWA 3VONA 3EL7A 3EYGA 2IG7A 2WTCA 4MXYA 4A7CA 4BDEA 3QD0A 5ITAA 5M51A 4TYJA 3MFRA 3F88A 1J7IA 3H4JA 3M2WA 3UJGA 4B0GA 3BV3A 3WIKA 3R21A 4L3PA 4KUJA 3DXPA 3BQCA 1OBGA 1YDSE 4J99A 3TZ9A 4R7HA 3RGFA 3QD2B 1Q5KA 3Q4UA 4IAKA 3VS1A 5L2IA 2PUIA 4AQKA 1K9AA 5A46A 4AW1A 2A19B 5E8YA 4W4VA 1OPKA 3ULZA 3FZSA 2VTMA 4XBRA 2VD5A 4ZSGA 4NJXA 5A4QA 2V55A 4OTQA 1IG1A 3DKFA 2W99B 3R30A 4HGSA 4F4PA 5HX6A 3KSVA 3OBGA 4DCAA 3TWJA 4RVLA 2C5OA 5CAUA 5IZFA 2R7BA 3VBWA 2WEVA 3R22A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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