1AIVA

Apo ovotransferrin
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
publication title Crystal structure of hen apo-ovotransferrin. Both lobes adopt an open conformation upon loss of iron
pubmed doi rcsb
total genus 135
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA03
1B5IA 3JYRA 2Y7IA 3PMVA 5CC2A 4F1YA 3M3LA 2XXIA 1B3LA 4BDRA 2H25A 1B7HA 5I59A 3IR1A 4KHZE 1B7ZA 4EF1A 4O3CA 3HPIA 3IOVA 5ICTA 3KJTA 1IEJA 4THIA 3RUMA 3K02A 3K1PA 3MP1A 4F2OA 2QMXA 4POWA 1PB9A 1J1NA 4YKJA 1KWHA 4PFYA 2Y7PA 1B9JA 1JVYA 1Y3NA 3IX1A 4JBZA 3I5OA 4KCCA 3D4GA 1B32A 1Q1KA 2F35A 5J1DA 4FJPA 3K00A 3G3KA 5DEXB 1MXYA 2GFEA 3D4CA 3H7MA 2HAVA 4DCXA 3DP4A 1ZJLA 4U4SA 1MPDA 3E4RA 1B3FA 4GL0A 4YZZA 2I48A 1URDA 5CMCA 1LB9A 3JZJA 4P0IA 1BKAA 3N5LA 3IORA 4N13A 4H67A 4I8CA 3DP8A 5CBRA 4BLAA 3WAFA 3TAJA 1GVCA 1I69A 2R9JA 3KJ7A 1SYHA 3OSQA 3C31A 4H8JA 4EDPA 4G4PA 1S7YA 2QL3A 1HSJA 1FTJA 3C34A 3SETA 2PT2A 1M5DA 4X48A 1FQAA 3N6UA 4P0GA 2NVUB 1QUIA 3KGCA 4NF4B 1NNKA 3EHSA 3T93B 2DE4A 4N6PA 3CI8A 1LB8A 4RJZA 2DOJA 3KOTA 2E0SA 4OVJA 3LSXA 3S9NC 4ZE8A 5F7VA 4NF5A 4GVOA 4WKMA 2RC8A 1Y1MA 1US5A 5CMMA 2R71A 1P99A 4M4GA 3HV1A 1YTVA 2XXRA 2H5YA 4F29A 2B3FA 3LR1A 2HZLA 2X7PA 4IY6A 3IO4A 5AA4B 5DVFA 2Q89A 2DSFA 1USYE 1B3HA 3CRBA 1FTKA 2V84A 3TDJA 5JEIA 1OVBA 1QUKA 5H8NB 4XTCQ 2OLBA 3KN7A 4ZZAA 1QUJA 2R6GE 4TLMB 4M1VA 5H8HB 2XXVA 4JWOA 5AA2A 2REJA 4DE8A 3TTLA 2DVCA 2G93A 2PYYA 1B51A 3EPEA 4FEDA 3O97A 4OFJA 2V93A 2UYEA 3VE1B 3T9UA 4OYVA 3T9HB 3O6GA 1TT1A 4XIGQ 5EHSA 3KBRA 3V89B 4K3FA 3WAEA 4GXSB 2OK2A 4KYDA 1SI0A 1M5EA 2Q2AA 2DVZA 3VLVA 4EQ9A 3O6IA 3PUYE 5I57B 1MRPA 4POXA 3FD3A 2QMWA 3OO8A 2Q88A 2YJPA 5K2YA 3M3FA 2F97A 5H8QA 4NF8A 4L17A 1S50A 4R75A 3OEKA 4RY1A 1FQFA 2A5TB 1ANFA 2ANJA 3CIJA 4FECA 1ELJA 3IO6A 3G3IA 4N07A 3W9VA 3H6UA 5AA3A 4ZEKA 3RT6B 1PBQA 1CE2A 1GR2A 3CFXA 4R6KA 2HFBA 1LSTA 3E13X 5I2NA 5KCJA 3GZGA 2FNCA 2ZMBA 1MQHA 3HCQA 5A5XA 3U92A 2P0SA 2QS1A 3H4ZA 5JTYB 3OXNA 5FHOA 3CR9A 2O1MA 3KZGA 3QSLA 2ONRA 3C32A 4I9DA 1QKBA 3G3FA 1WODA 1B05A 1EH3A 4GOTA 2UXAA 2VHAA 1IZ1A 3DLNA 1QVSA 2NOOA 4PP0A 2V25A 4BDQA 4AQ4A 1B0HA 1MY1A 5LOMA 2I4BA 1A54A 1OQGA 3LSLA 2IA4A 1OVTA 3T66A 3CSBA 2CZLA 2V3TA 1MY2A 1N3XA 1B0LA 1DOTA 2F8DA 3FXRA 4EF2A 3LSWA 1UTBA 2P2AA 4QSDA 3VDFA 3PPOA 4MFIA 4PFTA 3TPAA 3MZ1A 4YAHX 1D4NA 2H9BA 1N84A 4H65A 5TPAA 1B4ZA 1DSNA 4OQOA 2DWAA 3RLFE 3MP8A 1Y1ZA 1B58A 2THIA 2IEEA 5IAIA 2D5WA 1B3EA 4FIMA 3TKDA 1PB7A 4ECFA 3A3CA 2F6PA 1US4A 3I6VA 3R7XA 3E3KA 4H8IA 1MXVA 4IO6A 1D3KA 4IGRA 3PUWE 1O7TA 5K2XA 4IO5A 3V8XB 4F3PA 2Z8DA 3R26A 3MVWA 3PUVE 1EZOA 1SQYA 5ITPA 4QFPA 5I2KA 3B6TA 3TTRA 1FTLA 1NKXA 2F78A 5L8DA 4ELPA 3FVOA 4OZ9A 2NWJA 4P11A 3U1OA 4LP2B 3O29A 1H76A 4XKNA 1LLSA 4LZ8A 3MUQA 1A40A 3TQLA 2V3UA 3OSRA 2F36A 3FVNA 4GXAA 3IOWA 1B1XA 1BIYA 1LBCA 1LFIA 5I59B 5TP9A 4PFUA 5TU0A 3V5AA 2KLFA 1JQFA 3S9LC 4EQ7A 2DE2A 5DYHA 3U72A 2Z22A 3U8QA 5FTHA 2HCAA 3FVGA 3FJMA 1JW4A 3DELB 3VLUA 4U2RA 1M5FA 4QSCA 2Q9TA 4IY5A 4Z0IA 3FVKA 2LAOA 1BLFA 1M5BA 1B40A 4OFOA 1IUDA 2DXRA 1FTMA 2I3VA 4H6DA 4NWDA 4AB5A 2DS9A 3TTMA 2B65A 3IOTA 3VVEA 3Q29A 1ZIUA 3PV0E 1OLAA 3L6GA 2E1SA 1OIBA 1II5A 3G7WA 1N76A 5JK4A 4IGTA 3SEVA 1GGGA 4LATA 1EZPA 5KDTA 1HSLA 3USDA 1B3GA 2QS3A 1Y20A 1LGBC 4WXJA 2H98A 4BDNA 4JSDA 4LONB 1DPEA 1O64A 3THIA 5DT6A 3RN8A 1XHYA 5ICQA 1Y9UA 3EHTA 1USYH 1N04A 2XXWA 3TCHA 3EHUA 2F5XA 3C33A 3G3GA 3ZS6A 3M3KA 2ZYMA 3TYHA 1SDXA 5FHMA 4IB2A 4LA9A 1MXZA 3ILTB 4RPNA 1VE4A 2Y7KA 1M5CA 4NF5B 1PC3A 3QIMA 4NEDA 1TXFA 2I4CA 3C9HA 3QUJA 1FCKA 4MLVA 3FJ7A 3PUXE 4ZZEA 5FTIA 4YU0A 3MPLA 1UTHA 4DDDA 2VD2A 2FA7A 4GQOA 3GBBA 1DTZA 3HO7A 4H5GA 3C35A 4ZEDA 1A8EA 3C4MA 3UORA 1QW0A 1FTOA 4ELRA 4KCDA 2X26A 1PB8A 3MW0A 3T22A 5AA2B 1UIVA 1LAGE 4KYEA 2GH9A 3G3HA 1JW1A 4H0WA 1MG1A 1H45A 1JVXA 2HAUA 3B7DA 2GHBA 4FAJA 3MWBA 5I58A 3CFLA 3O2AA 1BTJA 3KEIA 3CVGA 3IJXB 1Z7NE 2XX9A 1T0KA 4NTLA 1IXCA 5AE4A 1MQGA 2XD3A 1AL3A 5AA2D 1MQDA 2ESNA 3T9VA 1JW5A 4OESA 1NMUA 3IL1B 3SEWA 4R6YA 1F9BA 2DQVA 4HTGA 1NNFA 4Q30B 4X1DA 2QJEA 1YCJA 3IB2A 3KG2A 4JSOA 1P1QA 2ONSA 5I84A 1P1UA 1I6QA 1FQDA 3L6HA 4G68A 2Q2CA 1A99A 2NUVA 4GWOA 4F2QA 5H8QB 3VFJA 4NF8B 4YMBA 1B1HA 4QSEA 4YMAA 5CI5A 1NH8A 3SERA 3H3GA 4QFLA 3FGSA 4C0RA 2D21A 1POY1 2O7UA 4MBPA 3B6QA 2Y84A 2DP8A 4R2FA 4IO7A 4KFQA 2QS2A 3U93A 4QFNA 1MH3A 3PUZE 1B5JA 2B3BA 4G2ZA 1A8FA 1R9LA 1TFAA 1VFEA 3PGFA 4IO2A 4G8HA 1VR5A 5CBSA 1LCTA 4PQJA 2DWJA 5HBCA 4ONYA 3TTKA 3FJGA 1R1NA 5I2NB 1AMFA 5KCJB 4RXLA 1XOCA 4C1UA 2M8CA 1PBPA 1A55A 3RGYA 4OENA 2BJJX 5A5XB 1OQHA 1GV8A 2F7BA 3LC8A 3S4UA 1NNPA 4FATA 1IXHA 3FZVA 1GTKA 3RNNA 4ZEBA 1SI1A 3MPKA 3HN0A 5I56A 3K6UA 4KD5A 4F19A 1NNTA 3BFTA 4LQ2A 1JNFA 2G29A 4JB7A 3ZSFA 4QFKA 1B7UA 1IXIA 4MF3A 3MJNA 1D9YA 2VD3A 4RA1A 3ZKLA 1LAFE 3K1NA 1SW4A 2A5TA 3EQ1A 2W7YA 3VV5A 4JDFA 1ZU0A 1XT8A 2F6GA 1MM7A 2H4IA 1S9TA 3MQ9A 4QRZA 4DXUA 2HEUA 1FQEA 3MZ9A 3S2VA 1AOVA 3O6HA 4OHNA 1Y4CA 5CRYA 3VXBA 1ZKBA 2WKYA 3IAZA 3E9XA 4JXIA 1UTBB 1N7WA 1QJMA 4F22A 1MXWA 4DZ1A 3T96B 4GIZA 3PPPA 3K1MA 5HPQA 4MH5A 3TCFA 4LVQA 3BFUA 3KN3A 3OD7A 2Y7RA 1Y3QA 3DM0A 5TPAB 4ESWA 2O6AA 4NF6A 4BDOA 3ILUB 1H44A 4ELQA 2QPQA 4JWYA 4OEVA 3EF7A 5L9OA 4F1VA 3OO9A 2CMOA 3MBPA 2HXWA 3ECRA 4U1ZA 1IXGA 1ZLQA 2VGQA 3ODBA 1EU8A 5CM6A 3K0VA 4YB7A 2RC9A 1MDP1 3QAXA 1SYIA 3RTFB 4QHQA 2A5SA 3FIRA 3RTWB 1FW0A 4F3BA 5I2KB 4PETA 1VSOA 1NFTA 3IB0A 4YB5A 4C1TA 3PPRA 5EHMA 4LZ7A 4TLLB 2UVJA 4ESXA 4EUOA 1R6ZA 4R6HA 4F18A 2P1SA 2ZYNA 2XXXA 4F1UA 2YLNA 4OFLA 4KYSA 4HCYA 3T9XB 3SDFA 3MVZA 3A09A 1JETA 1O63A 5TP9B 3PPNA 4U1OA 3EN3A 2XXYA 3GXAA 3VVDA 4F31B 3KFMA 2O1LA 3K6XA 1URGA 2F7CA 3H06B 3M8UA 3Q27A 1Y3PA 4ND9A 1MY4A 1MXUA 5H8FA 1MY3A 3QUFA 3H6WA 4QFOA 3PU5A 3W15C 4LZ5A 3MVYA 4NWCA 2XXTA 2DWIA 4E0XA 2PMSA 5IKBA 4OETA 1MPBA 3IOUA 4LUBA 2O51A 1N7XA 4BDLA 2QSXA 4GLIA 3FATA 2Z23A 4X9TA 4H5FA 5ELVA 4OTEA 3O66A 4I1DA 4DCYA 1IQ7A 3H6VA 3N26A 2VOZA 4F39A 5BUUA 5KDTB 3JV9A 2PX1A 3GBAA 1JEVA 1AIVA 4G77A 2RCBA 2ZNTA 2ABHA 2F7AA 3O28A 4Z7EA 3UP9A 3B6WA 5DVIA 1L5TA 2RINA 1LAHE 4EQBA 4HCWA 3KN8A 2D3IA 3W9WA 1FQCA 3TODA 3U94A 3OO6A 4G8MA 5H8SA 2OBGA 4UA8A 3LUYA 1RYXA 1PDAA 1JEUA 3PD9A 3TEPA 4GD5A 3RQTA 1NL5A 1SW5A 4ZEIA 1XVYA 3K2DA 1LFGA 1A7LA 3VXCA 3IK6B 3O9PA 3KSJA 1LCFA 5CMBA 2OWTA 5DEXA 3VVFA 3MC2A 3SEUA 3TUSA 2GRVA 1SW1A 1MY0A 1SBPA 5B7DA 3N94A 2UVHA 3PMXA 1SD3A 3TQWA 1MPCA 2O68A 1UTHB 1H43A 3RT8A 3TELA 3TFLA 4XKPA 4OMBA 3TTNA 2PBWA 1N3WA 3P7IA 3CG3A 2OJTA 2ZYKA 2Z8FA 4X1BA 4YICA 2DE3A 1B5HA 1ZTYA 1POTA 1TFDA 4YKKA 4F3SA 4KQPA 3SESA 2XX7A 4U22A 4LQ5A 1N0TA 5BWJA 2DYXA 1P1WA 3MAMA 1LAXA 4RK2A 5L9SA 2ONKE 3H6TA 1UQWA 1B6HA 3N6TA 4R74A 4RPOA 4JWXA 2I0BA 3PPQA 4NF4A 4U21A 4Q8RA 4OERA 5I58B 2UVGA 4Q0CA 1LBBA 5KZTA 1OLCA 2PT1A 2XXPA 1DMBA 4H1XA 1R9QA 1MH4A 3S9MC 1MS7A 5DVJA 1XC1A 5AA1A 2NXOA 2ZXTA 4YB6A 3UIFA 4OWDA 3QYTA 2H99A 3SKPA 2RF1A 4U4XA 4DXCA 1QKAA 5AA4A 1URSA 3OOAA 3TCGA 3Q28A 3CG1A 3KOSA 3UA8A 4G68B 3OENA 3KSXA 5HM4B 4FE8A 2O7IA 3K4UA 3ONMA 3TMGA 3Q25A 4I62A 1D9VA 5H8NA 1ATGA 5B70A 4PE5B 1Z7ME 3ZKKA 2QRYA 2RCAA 2UVIA 4R9FA 2HQ0A 5H8HA 1IITA 1UIUA 3QXMA 3OO7A 3LBSA 1QULA 3RY3A 1CB6A 2UYFA 4FEBA 2ZNSA 1WVJA 4GRKA 5L9MA 3QK6A 4UACA 3FV1A 4F3GA 3MZBA 2I3WA 2V3QA 4O3BA 2ALUA 2AIXA 4AB6A 5EYFA 1H3DA 3RPWA 4IO3A 4E0WA 4ELOA 4KI0E 3TZAA 5I56B 1Y4TA 1TWYA 5FHNA 5I57A 2RC7A 3LSFB 4TOZA 4R73A 1ZMGA 1WDNA 4G8NA 4U23A 1XS5A 2X7QA 3R6UA 2DWHA 4IO4A 1SW2A 3PMWA 3UK4A 3V83A 4RK9A 1B46A 3FUZA 2AL4A 2O84X 2I58A 2I0CA 5F1QA 3SEXA 3OMBA 2ZNUA 3FV2A 2OZZA 1DTGA 1HSEA 2YPNA 2I49A 2XXQA 3K6WA 4RYAA 4WEPA 4ZE9A 3UN6A 1Q35A 3CFZA 4YKPA 3S9EA 4ISUA 4O3AA 4NF6B 1MQIA 4G68C 1I6AA 1IIWA 3A3UA 3I3VA 1RYOA 3IJOB 2OWSA 3F11A 4ZDMA 4R2BA 1MDQA 2AYSA 3VLWA 5JTYA 4EXLA 3HHFA 1YAEA 1RKMA 3G3JA 1OMPA 3GLBA 3CSGA 4R72A 2QS4A 3FXQA 3MVXA 2PVUA 3IB1A 4WEDA 2XX8A 3DP6A 2Z8EA 4NMYA 4XKRA 1B4HA 1SVXB 5ISUA 3BKIB 4EXKA 1P1OA 3PD8A 2F34A 5DTBA 2HZKA 4GFRA 4OEUA 3AXFA 4DLDA 1B2HA 2XHDA 4PFWA 3SEYA 3Q26A 1I6BA 1YPNA 5ITOA 4BDMA 2Y7WA 4GL8A 4YKIA 2FYIA 3BBRA 2AL5A 1XVXA 1BP5A 3UGWA 4Q5TA 3FXUA 4ZECA 1MXXA 4DXBA 1AH5A 3C36A 4HS7A 3HHGA 4FORA 4MLQA 2Q8JA 3K01A 3K6VA 4GF8A 4ZS9A 1VFDA 1P1NA 2XXHA 3FASA 2VP1A 2GHAA 5M2VA 1ZBMA 3H03A 4HW8A 2XXUA 5H8FB 3MP6A 4R9GA 4TQUQ 1EZ9A 4NE4A 4QF9A 1MQJA 4ZEFA 4XKQA 2I6EA 1MM6A 5CMKA 1LFHA 3OELA 1DPPA 4DIGA 2XD2A 4RNSA 1PEBA 1FQBA 4XXUA 2DXYA 1NH7A 2O69A 3HSTA 4KPTA 2RKMA 3OEMA 4OXVA 2ZYOA 2REGA 1B52A 2OCUA 4KR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KA1A 1B5IA 3JYRA 2Y7IA 3PMVA 5CC2A 4F1YA 3M3LA 4P3LA 2XXIA 1B3LA 4BDRA 2H25A 1B7HA 5I59A 3IR1A 4KHZE 1B7ZA 4EF1A 4O3CA 3HPIA 3IOVA 5ICTA 3KJTA 4PCDA 1IEJA 1FPKA 4THIA 3HFUA 3RUMA 3K02A 3K1PA 3MP1A 2P3VA 4F2OA 2QMXA 4POWA 1PB9A 1G0IA 1NUZA 1J1NA 4YKJA 1KWHA 4PFYA 3RPLA 2Y7PA 1B9JA 1FPFA 1JVYA 1Y3NA 3IX1A 4JBZA 3I5OA 4KCCA 3D4GA 1B32A 1Q1KA 4N6DA 2F35A 5J1DA 4FJPA 3K00A 4OANA 3G3KA 5DEXB 1MXYA 2GFEA 2XWVA 3D4CA 4DI4B 3H7MA 2HAVA 4DCXA 3DP4A 1ZJLA 4U4SA 1MPDA 3E4RA 1B3FA 4GL0A 4YZZA 2I48A 1URDA 5CMCA 1LB9A 3JZJA 4P0IA 4GWUA 1BKAA 3N5LA 3IORA 4N13A 4H67A 4I8CA 3DP8A 5CBRA 4BLAA 4I3EA 1NUYA 3WAFA 3TAJA 1GVCA 1I69A 2R9JA 3KJ7A 1SYHA 3OSQA 3C31A 4H8JA 4EDPA 4PAKA 1NV0A 4G4PA 1S7YA 2QL3A 1HSJA 1FBFA 1FTJA 3C34A 3SETA 2PT2A 1M5DA 4X48A 1FQAA 3N6UA 4P0GA 2NVUB 1NV2A 1QUIA 3KGCA 4NF4B 1NNKA 3EHSA 3T93B 2DE4A 4N6PA 1FPGA 3CI8A 1LB8A 4RJZA 4XF5A 2DOJA 3KOTA 2E0SA 4OVJA 3LSXA 3S9NC 4GX6A 4ZE8A 5F7VA 1DCUA 4NF5A 4GVOA 4WKMA 2RC8A 2QVRA 1Y1MA 1US5A 5CMMA 2R71A 1P99A 4NG7A 4M4GA 3HV1A 3MSTA 1YTVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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