1AIVA

Apo ovotransferrin
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of hen apo-ovotransferrin. Both lobes adopt an open conformation upon loss of iron
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 135
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA03
1YTVA 2ALUA 4RK2A 3W15C 5CC2A 4R74A 4LQ2A 1IXCA 2D3IA 4YKJA 3TTRA 1XOCA 1B3FA 1QW0A 3MVYA 5DVIA 2O6AA 3G3JA 2H5YA 1Y1MA 3K02A 3PPOA 5KDTB 1D3KA 1P1QA 4WKMA 4OMBA 5I57B 2H4IA 4QFPA 2OWSA 2XXIA 3Q25A 5AA4A 4R6YA 5FHNA 1B52A 3FV1A 1AL3A 4IGTA 4OHNA 3RTWB 3FV2A 3OSRA 3U92A 3U94A 2F6PA 4XXUA 5ISUA 3O6GA 2V3TA 3ZKKA 1MM7A 1DTGA 1XC1A 4ZZAA 1NNFA 1SDXA 1B4HA 2Q2AA 3IAZA 5KCJB 5H8NA 4TLLB 1MY3A 3QK6A 1B2HA 4F29A 4NEDA 2VGQA 1B7UA 3EQ1A 1FTJA 3IJXB 1TFDA 1VSOA 5L9OA 1TXFA 5AA2D 3UA8A 4P11A 4DXCA 1FTLA 3TZAA 5I2KA 4JWXA 3KZGA 5IAIA 1LFIA 1NNKA 4KQPA 1T0KA 3THIA 1MDP1 4O3BA 5L8DA 1B5HA 3PMXA 3TKDA 1QUKA 3MBPA 2HAUA 4LA9A 4P0IA 4MH5A 1B0HA 2I3VA 2Z8FA 3KSXA 1PBPA 5I2KB 4EQ9A 5ITOA 4F31B 4YMBA 1LAHE 1R9QA 1DPPA 3PMVA 2W7YA 2DXRA 3C35A 4OQOA 3VXCA 1O7TA 1R9LA 3C36A 1URSA 4JXIA 4BDNA 1GVCA 2P0SA 1P1UA 4U21A 3TFLA 1M5FA 4JWYA 4GWOA 4XTCQ 4ZEBA 3TEPA 1JEUA 1SYIA 3MVZA 4GL8A 2I3WA 5FHOA 3F11A 2I48A 3VFJA 5ICQA 3O2AA 1VE4A 1D9VA 3FASA 4F18A 1S9TA 1OLAA 2NOOA 3CG1A 1B32A 2P1SA 2XX9A 2A5SA 1SW1A 1IXGA 1PB9A 1B7ZA 3MVXA 3ZKLA 2RCBA 3T66A 2NWJA 4LP2B 3I5OA 1A8EA 2O84X 3UIFA 1ZU0A 3HHFA 4XKRA 3EHUA 3WAFA 4QRZA 1XVYA 3VVDA 4ELPA 4YB5A 2XXWA 4PP0A 3DLNA 3OO7A 1NKXA 3IOTA 4X9TA 1QKAA 3TMGA 5CMKA 3M8UA 4NF8A 2IEEA 3HHGA 4NWCA 3FXQA 3QAXA 3S9NC 2I0BA 4FE8A 4H0WA 3K6WA 4FORA 3G3GA 3MZBA 4H65A 5L9MA 2ZYNA 2DWAA 3EHSA 4FECA 4G68B 4QFLA 1WODA 1M5DA 5AA3A 1IXIA 3IL1B 5H8QB 4I62A 5AA4B 4KYEA 2F7AA 3OO8A 3RN8A 1N04A 4RYAA 5I57A 3SEYA 2P2AA 1EU8A 2FA7A 1B0LA 3PPRA 1SW2A 3D4GA 3QUJA 4F39A 1N7WA 1ZBMA 2ANJA 5DEXA 1WVJA 3H3GA 4EQBA 2PX1A 3QXMA 1URDA 5DEXB 2QL3A 1VFDA 4KPTA 3FXRA 4YAHX 4R6HA 1LSTA 2Y84A 3QUFA 2F6GA 3BKIB 4U1OA 1AH5A 4ZEFA 3UK4A 2RF1A 4GVOA 3CSBA 2RKMA 4I8CA 3OEMA 4G2ZA 1YAEA 3VVFA 4EXLA 3VV5A 4ZECA 1MXZA 2DE4A 3E3KA 3SEUA 5IKBA 1MG1A 2DSFA 4QFOA 1ATGA 1JW1A 3BFUA 3FUZA 1EZPA 4KFQA 3KFMA 2PT2A 4TQUQ 3TTMA 4YB6A 3MUQA 3E4RA 1HSLA 3KOTA 3SESA 1YPNA 4NF8B 2XXRA 4Q30B 3QSLA 1PBQA 5TPAB 5I56A 1MS7A 3CG3A 1B51A 3E13X 1ELJA 4NF6B 1MDQA 3IO6A 3FIRA 2OBGA 3IO4A 3PUVE 4I1DA 1JNFA 2I4CA 2Q9TA 2ZXTA 3K00A 5I2NB 1P1OA 3TODA 1P1NA 1DMBA 3AXFA 3K4UA 3Q27A 4GIZA 4IO6A 1Y1ZA 4BDMA 1RYOA 1POTA 5AA2A 4DCXA 1FQDA 1RKMA 3EPEA 2XXUA 3Q29A 3BFTA 1F9BA 4ESWA 4PE5B 3SEWA 1SVXB 1LB9A 4RY1A 1IUDA 1UTBA 3K01A 4HCYA 4RXLA 2Y7IA 2V3QA 1GTKA 4ELOA 5A5XA 1Q1KA 3SDFA 5B70A 4OTEA 1DPEA 1H3DA 2H9BA 3OELA 1B1XA 2X26A 2YLNA 3Q28A 2QRYA 4FEBA 1OLCA 2DE3A 2H99A 3FJGA 1Y9UA 1VFEA 4U1ZA 2V84A 3K1MA 4Z7EA 1QKBA 2REJA 4MFIA 1LFHA 4NF5A 3LBSA 2NUVA 1O63A 3H06B 4GXSB 4WXJA 4MLVA 1MY2A 3LR1A 3TPAA 4EF2A 1SQYA 2DVZA 1YCJA 3FD3A 3IK6B 4U2RA 3ZS6A 2R9JA 3MWBA 3TQWA 2FNCA 2XX8A 3M3FA 1UQWA 2QS3A 3ODBA 3TCGA 4F1YA 3ILUB 5EHSA 3VDFA 1WDNA 2F7CA 4WEPA 3O6IA 5H8NB 1I6AA 5KCJA 4M1VA 2Y7WA 4IY6A 4L17A 4AQ4A 1S7YA 4QSCA 3TCFA 2UYEA 4GD5A 2DOJA 4IO5A 3WAEA 1UTBB 2CMOA 3PUXE 1MXUA 1L5TA 2ZMBA 5AE4A 3S9EA 1SYHA 3KJ7A 1XS5A 3TCHA 1H76A 1LAGE 4ISUA 1OVBA 4NWDA 1TT1A 4O3CA 4OESA 1LAXA 1MRPA 4R2FA 5H8SA 3S2VA 1IXHA 3O9PA 4OEUA 5CMCA 3VXBA 3S9LC 2B65A 2THIA 4HS7A 1NNTA 5HBCA 3HCQA 3G3IA 3KG2A 4NTLA 3L6HA 3RUMA 4GXAA 4HW8A 2E1SA 5AA1A 1XHYA 2O68A 4LZ7A 1QULA 2HQ0A 3TAJA 3O66A 4ZEIA 2GFEA 2G29A 3CSGA 4P0GA 3PPPA 5TPAA 5TU0A 1Z7ME 3T9HB 4C0RA 2Z8EA 4U4XA 1LCTA 4RA1A 2AYSA 4I9DA 3O28A 5FHMA 2KLFA 1QUIA 3IR1A 4IO4A 2M8CA 3IB0A 3ILTB 3USDA 2GHAA 4EQ7A 2QSXA 4JB7A 3IJOB 3RTFB 1MPCA 3V8XB 5I58B 5AA2B 3PUWE 5I84A 4ELQA 4XKPA 4JBZA 4KCDA 3IB2A 1IQ7A 1N84A 3G3KA 4OYVA 4ELRA 3G3HA 4DCYA 2F7BA 3FATA 3SEVA 1S50A 4Q0CA 2OWTA 1ZKBA 2ZNUA 3MP1A 4TOZA 3G3FA 1B7HA 3H7MA 2F35A 3K6XA 2ONRA 3FJMA 4RPNA 4Q5TA 4H1XA 1IZ1A 3MP6A 3OSQA 4QFNA 3N6TA 3RY3A 1LLSA 3JZJA 2YJPA 4H8JA 4U23A 1CB6A 4E0WA 4FATA 4LZ8A 4KCCA 4DDDA 3RT8A 3H4ZA 3OOAA 4JSDA 3N6UA 4EXKA 1B58A 1A7LA 2O7UA 2ZYOA 3EN3A 1Y3QA 3LSLA 4F22A 1FTKA 3JV9A 4X1BA 1N3XA 3RLFE 4GFRA 1A99A 4JSOA 1B40A 2HEUA 2D21A 2UYFA 2HXWA 1RYXA 3K6VA 4FJPA 4HTGA 4F3PA 2F97A 2R6GE 4XIGQ 2PT1A 4RK9A 1AIVA 2V25A 3A09A 2WKYA 4GOTA 1LFGA 3FVGA 3N94A 4FIMA 2XXVA 4GRKA 1LBBA 4KI0E 4E0XA 3M3LA 4YKPA 2ZNTA 4PFUA 1GV8A 1ZLQA 3T22A 4QSEA 1FQBA 4JWOA 4LUBA 3OD7A 3KEIA 1D4NA 1R6ZA 5DYHA 2VD3A 2NXOA 2XXPA 4H8IA 4NF4A 3V89B 1B3GA 2XXTA 3OEKA 3OENA 3PU5A 3G7WA 1B1HA 1H43A 4G68C 4OFJA 4IGRA 2Q88A 4OEVA 4R9FA 2Q8JA 5B7DA 1D9YA 2XXQA 3OMBA 2ESNA 1I6QA 2DVCA 1CE2A 3KOSA 4TLMB 4LONB 1I6BA 3DP6A 2ZYKA 4IB2A 4EF1A 2DS9A 3KN7A 1NNPA 4H5GA 4NMYA 4PQJA 2Q89A 1Y3PA 4UACA 1FTOA 3TTNA 3H03A 3T96B 1B9JA 1A8FA 4G8NA 1TWYA 3B6WA 3MAMA 3PGFA 3TUSA 4PETA 2ZNSA 4YB7A 3SERA 2Y7RA 4AB6A 5CBRA 2QS1A 3R7XA 4R6KA 1UTHA 3O6HA 3MJNA 3RPWA 1EZOA 4Z0IA 4QHQA 2VP1A 1LCFA 4ZDMA 1I69A 2UVGA 4BDOA 3PD9A 1BLFA 2PVUA 3U72A 2O7IA 3GLBA 3H6WA 4GQOA 4OENA 3ONMA 4R73A 5ICTA 1MQGA 1M5EA 2PYYA 2H25A 3KN3A 1USYE 5A5XB 5KZTA 1DSNA 3EHTA 1MPBA 3M3KA 1N7XA 3CR9A 4KR5A 4R9GA 3U1OA 5TP9A 1N3WA 4ZE9A 2I49A 3MC2A 2B3FA 1OIBA 3P7IA 3TDJA 2XXYA 3PV0E 3B6TA 3RNNA 2F36A 2RC7A 4ESXA 5I2NA 2VHAA 1ANFA 4YU0A 2OZZA 2OLBA 1NL5A 1H44A 3FZVA 4NF5B 1II5A 1O64A 1QUJA 2D5WA 2X7QA 3GZGA 3IB1A 4KYSA 1BKAA 3S9MC 1HSJA 4YICA 2V3UA 5I56B 3JYRA 2E0SA 2DXYA 2VOZA 2H98A 5H8FA 2Y7PA 5EHMA 3RGYA 3TTLA 2F5XA 4F3GA 5FTHA 1MH3A 5DVFA 2GHBA 3BBRA 3LSWA 1FW0A 2ONSA 2ONKE 2Z8DA 5F1QA 4BDQA 3PPQA 2YPNA 5L9SA 1GR2A 2F8DA 3EF7A 4OWDA 4IY5A 4NF4B 1MQHA 3L6GA 1H45A 1SI1A 4ZEDA 3MVWA 4POWA 1BTJA 2VD2A 4WEDA 4YKIA 1B46A 5I59B 5ITPA 2I6EA 5H8HA 1OMPA 2XD3A 3MW0A 3FVOA 1US4A 3HO7A 2HCAA 1N0TA 1ZJLA 4KYDA 4YZZA 4ECFA 1URGA 3MQ9A 4OFLA 2XD2A 1JVXA 2QMXA 1B3HA 1M5BA 1SBPA 1Y4CA 2QJEA 2Z22A 3IOVA 4HCWA 4NF6A 5EYFA 4H6DA 2XX7A 1DTZA 1B4ZA 1AMFA 3KN8A 5CRYA 5H8QA 1XT8A 4LZ5A 3U8QA 1PEBA 3MP8A 4H67A 5HPQA 1P1WA 2Q2CA 1SW4A 4G68A 3C32A 3VLWA 1ZIUA 2IA4A 3MZ9A 1P99A 4RPOA 1MH4A 1QJMA 2CZLA 3K1PA 4R75A 2Y7KA 3UGWA 3W9WA 1Y3NA 1B5JA 4RNSA 4BDRA 3PD8A 3LSXA 4POXA 5DTBA 5H8FB 3V5AA 1KWHA 4ONYA 2OCUA 2RINA 4U22A 4M4GA 1EZ9A 1MQIA 3OO9A 5CI5A 3K2DA 2O1LA 4ZS9A 1A40A 3HN0A 2QPQA 4LATA 4R72A 3C34A 4F19A 2HFBA 3C9HA 3LUYA 2OK2A 1JW5A 4PFWA 2F34A 2Z23A 1LGBC 3VLVA 4F1VA 3CFZA 4N6PA 5K2XA 1NH8A 5H8HB 1IIWA 4LQ5A 3DELB 2NVUB 1MY0A 2ZYMA 1US5A 3Q26A 4C1TA 5I59A 3CIJA 1MXWA 1SI0A 5TP9B 1AOVA 1B3LA 4JDFA 3B7DA 3PMWA 1FTMA 2QMWA 4UA8A 4EDPA 4N13A 4F2OA 1FQCA 3SEXA 5BUUA 5BWJA 4PFYA 4AB5A 3IOWA 3N26A 1BP5A 3CI8A 4BLAA 4K3FA 1PC3A 1Y4TA 3CRBA 1JEVA 3PPNA 4ZZEA 2AL4A 1MM6A 1PB7A 4G8HA 5J1DA 5LOMA 4MF3A 4U4SA 5FTIA 1HSEA 1MPDA 1PB8A 1ZTYA 2REGA 4QFKA 2V93A 4DXBA 1M5CA 1MY1A 2FYIA 4OXVA 3TELA 4F1UA 3KGCA 2O69A 5HM4B 3A3CA 4YKKA 2XXHA 3DM0A 3DP8A 1UIUA 3IORA 3PUYE 2R71A 2A5TB 3T9UA 2I4BA 3K1NA 3KJTA 3FVKA 4DE8A 1JETA 3R26A 3R6UA 1JVYA 4IO7A 4GL0A 1N76A 1VR5A 2F78A 3OO6A 3DP4A 5DVJA 2I58A 3VLUA 5JEIA 1POY1 3K0VA 4OERA 2OJTA 2RC9A 5F7VA 2DWHA 1MXVA 1PDAA 3C4MA 3HSTA 4GLIA 2QS4A 3UN6A 1SW5A 3MPKA 1FQEA 4OVJA 5DT6A 2HZLA 3QYTA 3A3UA 3RQTA 3TTKA 1MXYA 4DXUA 1Y20A 3HPIA 4QF9A 2B3BA 1MXXA 4BDLA 2RC8A 3HV1A 1UIVA 4DZ1A 1A54A 4LVQA 4FEDA 2UVIA 1DOTA 1UTHB 1LBCA 1SD3A 2GRVA 3KBRA 3MPLA 3N5LA 3H6VA 3O29A 5KDTA 2A5TA 2DWIA 4X48A 5JK4A 4PFTA 5CBSA 1MQJA 5K2YA 3T93B 1OVTA 1GGGA 3TQLA 1B6HA 1USYH 2GH9A 3GXAA 2UVJA 1OQHA 3C31A 3GBAA 3CFLA 3QIMA 4R2BA 3D4CA 1EH3A 4GF8A 3E9XA 4F2QA 1LB8A 2XXXA 1FQFA 3K6UA 3FJ7A 4MLQA 2DWJA 1A55A 1ZMGA 1Q35A 3SETA 2O51A 3U93A 2AL5A 5JTYB 4KD5A 2DQVA 3GBBA 1B05A 1Z7NE 3B6QA 4NE4A 3VE1B 3IX1A 5CM6A 1MQDA 3FXUA 1BIYA 1JQFA 1NH7A 2G93A 3KSJA 1TFAA 4OETA 1B3EA 4YMAA 1FQAA 2ABHA 3H6TA 4O3AA 4KHZE 1NFTA 4ZE8A 4DIGA 1J1NA 4IO2A 3UORA 3PUZE 5M2VA 3SKPA 4G77A 4ZEKA 4RJZA 4N07A 2RCAA 2O1MA 4XKQA 3UP9A 3FGSA 2UVHA 2X7PA 3CVGA 4IO3A 2XHDA 5ELVA 2DP8A 3V83A 1FCKA 1IEJA 3ZSFA 3LC8A 4OZ9A 4THIA 3IOUA 5CMBA 3C33A 2DYXA 4Q8RA 4MBPA 4EUOA 5I58A 3CFXA 1JW4A 1OQGA 1B5IA 1XVXA 2QS2A 4C1UA 4G8MA 2UXAA 3O97A 4X1DA 3LSFB 4OFOA 2PMSA 3T9XB 2PBWA 3ECRA 3FVNA 1QVSA 4H5FA 2AIXA 4QSDA 3T9VA 3VVEA 3W9VA 4DLDA 2BJJX 4F3SA 3I3VA 3OXNA 5JTYA 2I0CA 2LAOA 3H6UA 4G4PA 1MY4A 3MZ1A 4ND9A 2DE2A 3RT6B 1R1NA 2HAVA 3I6VA 1NMUA 1IITA 2HZKA 4XKNA 3S4UA 5CMMA 4F3BA 4FAJA 1LAFE 3TYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W15C 1YYZA 4YKJA 3MVYA 1D3KA 1P1QA 5I57B 3FXBA 2OWSA 2XXIA 5AA4A 5FHNA 4IGTA 4OHNA 3OSRA 2OX3A 4HE0A 1MY3A 3QK6A 2VGQA 1B7UA 1JP4A 1VSOA 5L9OA 5AA2D 4DXCA 1FTLA 1NNKA 3TKDA 4LA9A 5I2KB 5ITOA 4UABA 3PMVA 1DPPA 2DXRA 4JXIA 1GVCA 1P1UA 3TEPA 4GWOA 3VFJA 3O2AA 5I7IA 3FASA 1S9TA 1SW1A 1PB9A 1A8EA 3UIFA 1ZU0A 4PP0A 3IOTA 4X9TA 3TMGA 4H65A 3KC0A 1FSAA 5AA3A 5AA4B 4I62A 1FBHA 2P2AA 1FJ9A 1EU8A 2FA7A 3QUJA 4NGUA 1ZBMA 5DEXA 5DEXB 3U65A 4KPTA 3FXRA 4R6HA 3QUFA 2FHYA 2F6GA 3BKIB 1LBWA 4GVOA 2RKMA 4I8CA 4G2ZA 1YAEA 4ZECA 2DE4A 3SEUA 4QFOA 3KOTA 1IMDA 1YPNA 4Q30B 2XXRA 5I56A 1B51A 1ELJA 3PUVE 2Y5KA 1P1OA 1IMCA 3TODA 3AXFA 4IO6A 4I3EA 1POTA 4DCXA 1FQDA 1RKMA 1FJ6A 3EPEA 1SVXB 4RY1A 1IUDA 1UTBA 5A5XA 4RXLA 4OVTA 4N91A 1DPEA 1H3DA 4PAFA 2YLNA 2DE3A 4U1ZA 2REJA 1LFHA 3LBSA 4GXSB 3LR1A 1UQWA 1WDNA 3O6IA 3S9EA 2Y7WA 1S7YA 2UYEA 2DOJA 1UTBB 1MXUA 1LBXA 1SYHA 1KA0A 1H76A 4PBHA 4R2FA 1OVBA 4O3CA 1MRPA 5CMCA 3VXBA 4OEUA 2THIA 3HCQA 4NTLA 3L6HA 3MSTA 4GXAA 2E1SA 4JVIA 5AA1A 3O66A 5TPAA 4P0GA 3T9HB 3PPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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