1AIVA

Apo ovotransferrin
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
b'APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords OVOTRANSFERRIN
publication title Crystal structure of hen apo-ovotransferrin. Both lobes adopt an open conformation upon loss of iron
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
total genus 135
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA03
2I6EA 4DLDA 2F6GA 1H76A 2DQVA 3CG3A 5I57B 1FQDA 3VLWA 3ODBA 3QSLA 2PVUA 3K02A 4OFOA 3U72A 4IY6A 2ONSA 1PBQA 3S4UA 1B5HA 5TPAB 2QRYA 4QFPA 3SEVA 2DE2A 1QKBA 1B0HA 5TP9A 3FIRA 1R9QA 4GWOA 4F19A 1YTVA 3RTFB 2E0SA 4GLIA 2I3VA 4EF2A 1UTBB 1Y1MA 3VDFA 3TMGA 4YMAA 2Y84A 4GF8A 3HPIA 2V93A 4KCDA 5CBSA 2Q9TA 3L6GA 3G3FA 4FEDA 4LATA 4XTCQ 2HQ0A 4ZEDA 5KCJA 1NMUA 2OZZA 4ZEIA 5B7DA 3UORA 4NTLA 4OQOA 2F7AA 3FJMA 3KFMA 2HAVA 4R72A 5KZTA 1USYH 1MPBA 4YU0A 3G3IA 2VGQA 1Y4CA 2I58A 2UVHA 3IOUA 3VE1B 4UACA 1B7HA 4G68C 1P1QA 1AMFA 2Y7KA 3A3UA 4NF4B 3K1MA 1URSA 4U1ZA 4NEDA 1LB8A 1B7UA 3IR1A 1XVYA 3ZKLA 5I2NB 2Z23A 2QS4A 5F1QA 1XS5A 1NH7A 4U23A 3GZGA 4KCCA 3B7DA 4BDMA 4QFKA 1OLAA 4HCYA 1NNFA 5HM4B 1S50A 2F7CA 4ONYA 2O1MA 4WXJA 1URDA 2F34A 3H7MA 4NWCA 4ZEBA 3UP9A 3VVDA 4IGTA 3S9LC 2O6AA 4H65A 3D4GA 3IOTA 2A5TA 4F3PA 1CE2A 4F3GA 1B05A 3L6HA 1SW4A 2R9JA 1QUIA 1NNPA 5FHOA 1MY0A 2F5XA 1BKAA 1IZ1A 1LAFE 2Y7PA 5I59B 1M5CA 3OO8A 1SYIA 4RA1A 2VD2A 4JWYA 5A5XB 3W9WA 5AA4A 4G77A 4BDLA 4F29A 1QJMA 1ZIUA 4OWDA 2Z8DA 4X9TA 4EUOA 3C9HA 2ABHA 5AA2A 2QS2A 3LSXA 3T9VA 1OVBA 3T96B 4O3BA 1Y3NA 3I3VA 3T9UA 4Z7EA 3T9XB 3MP8A 4FECA 1IXHA 1S7YA 4R2BA 4IB2A 1PEBA 1FTOA 4I8CA 2GHAA 4NF4A 5DYHA 2QMWA 1J1NA 1MRPA 3Q29A 4EDPA 4NF6B 1B7ZA 3KGCA 2NVUB 3WAEA 4GL0A 1FQAA 5DVIA 2F36A 3Q27A 2X7PA 4E0XA 2PT1A 4OTEA 1NL5A 1JETA 2XXXA 3CR9A 3O29A 3OELA 2F78A 4G2ZA 2O1LA 2FA7A 2VHAA 4QSEA 1A99A 4C0RA 3MQ9A 4ZZAA 2Q2AA 3CRBA 4DZ1A 1EZPA 1AL3A 3UA8A 1DTGA 1P1NA 4ELQA 5CBRA 5I59A 3FGSA 3TAJA 1Y9UA 4DCXA 5ICQA 4NWDA 1AIVA 4MFIA 3CG1A 1OQHA 4G4PA 2Y7IA 2G93A 1N04A 4ZE9A 3E9XA 3CI8A 4FJPA 3FUZA 2VP1A 4MF3A 1MXUA 1AOVA 3TKDA 3TTNA 2DYXA 2CMOA 1TXFA 1P99A 3KJ7A 4LQ5A 4XKNA 3S9EA 3KOSA 2PT2A 4R74A 2ANJA 3PUYE 1YPNA 3HHFA 4HS7A 4KPTA 2VOZA 3T22A 1M5BA 2OLBA 3G7WA 3FVKA 4F1VA 1B32A 4G8HA 4RY1A 2I4CA 1IEJA 1D9VA 3PD9A 4OHNA 4OZ9A 4NF6A 1H45A 3M8UA 1MS7A 3MAMA 1B4HA 3FVNA 4ZZEA 2PBWA 2I48A 1SBPA 2OCUA 1LFGA 3K1NA 1ATGA 2XXHA 3A3CA 3R26A 3MW0A 3KZGA 3IOVA 2NWJA 5JEIA 4KQPA 4KHZE 2ZNTA 1Y20A 4M1VA 2REGA 2O69A 4GXAA 4JDFA 2H9BA 4PE5B 1JQFA 1I69A 4XKPA 4AB6A 3SEWA 1HSJA 3HV1A 1VFEA 2OBGA 1PDAA 4OMBA 4GIZA 3BKIB 2E1SA 2AL5A 4LZ8A 1MM7A 4BDNA 1TWYA 3SDFA 3N6TA 3SEXA 1LLSA 2VD3A 4XXUA 4R6YA 2I4BA 1SYHA 2I0CA 3MVWA 3O2AA 5BUUA 1H43A 4X1BA 4QRZA 5I58B 4H5FA 3QXMA 1MXVA 1H44A 4WEPA 1EZ9A 3O66A 4XKRA 3TTMA 1TT1A 2XXYA 3HCQA 3LR1A 4QFOA 3VXBA 3H06B 4P11A 3IO6A 1YCJA 3PUWE 1I6QA 3O9PA 2O7UA 4O3AA 2DWIA 3E4RA 1SI0A 2HZLA 3VXCA 1FQFA 3B6WA 1Z7ME 2WKYA 4NF5A 3RPWA 2H98A 4POWA 4MLQA 3TTRA 5KCJB 4MLVA 4EQ9A 3B6QA 4P0IA 3KSXA 1ZU0A 2AYSA 4IO5A 2RC8A 1RYOA 1OQGA 3A09A 4NMYA 1MY2A 2H99A 4XKQA 3M3LA 4OXVA 4ZE8A 2V3TA 1JVYA 1IXIA 2ZNSA 2ZMBA 1WODA 4EXKA 3PPNA 5TU0A 3MP6A 3THIA 2XXPA 1MQJA 3V83A 2O84X 4K3FA 3RQTA 2B65A 3S9MC 4FAJA 2XXVA 2UVGA 1QUJA 1KWHA 4YB6A 3RLFE 3B6TA 4QSDA 1LAHE 1SW2A 4KI0E 2B3BA 2DWJA 4LVQA 3MZBA 2A5SA 4RNSA 1JNFA 1QW0A 1P1WA 3H3GA 3PPRA 2V84A 3C31A 4DXUA 2Z8EA 4NF8A 1UTHA 3IO4A 1B40A 5I58A 4QSCA 4H8IA 1D4NA 2A5TB 3N26A 3R6UA 5EYFA 3PMWA 3HO7A 4LZ7A 5I2KB 1GTKA 3USDA 4ELRA 3RGYA 1B58A 1ZMGA 4KYSA 3O97A 3IK6B 1LCFA 4M4GA 1RYXA 1LSTA 4ND9A 3HHGA 2ONKE 3PPQA 5AA4B 4F2OA 3TEPA 1MPDA 4PQJA 4ESXA 1EZOA 2HFBA 2P1SA 2RC7A 3K4UA 4F3BA 5AA2B 4THIA 2ZXTA 2DE4A 3PV0E 1RKMA 4OESA 3UK4A 4EF1A 4GL8A 4R6KA 2DXRA 4G8NA 4UA8A 1MPCA 3KBRA 3VVEA 2H5YA 3DP6A 4WKMA 3KOTA 2ALUA 5ISUA 2F97A 5B70A 3LBSA 5HPQA 1B2HA 3MVYA 4ECFA 4Z0IA 3T66A 5ELVA 1GGGA 1PC3A 2F8DA 2Y7RA 3TYHA 4HW8A 3DELB 4OERA 1M5DA 2F35A 2YJPA 2IA4A 4G68B 4H8JA 2D5WA 2H25A 1LBCA 1USYE 1MDQA 1B5IA 5ITPA 3P7IA 4GQOA 3K6XA 4PFTA 3Q28A 3HN0A 5AA1A 1N7XA 4PETA 4PFWA 3RT6B 5FHMA 1FTLA 3O6GA 3FATA 5I2KA 4HTGA 1M5EA 3EQ1A 3RNNA 1VR5A 2QL3A 4LONB 4QF9A 2QJEA 2DS9A 3O6HA 3GXAA 3UN6A 2Y7WA 1B52A 3I5OA 1LAXA 2LAOA 2HZKA 4YKPA 3K2DA 3FV2A 3N5LA 2XXWA 1IIWA 3IB2A 1US4A 4KFQA 1JW1A 2DVZA 1GV8A 2XXRA 2D21A 3U92A 3O28A 3QAXA 3EHSA 4LA9A 3Q25A 2HCAA 4POXA 1B3HA 1Y3QA 3IB1A 3BFUA 5DVJA 3SERA 3FV1A 3E3KA 4OEVA 4OYVA 1FW0A 3RT8A 1QUKA 1P1OA 1IXGA 4ZECA 3PGFA 3LSLA 4R73A 3H6WA 2XXTA 1A8EA 1LGBC 3S9NC 4YB7A 4YB5A 3QUJA 4FORA 3H6TA 3TCHA 1MXXA 3PUXE 4MH5A 1OVTA 3K0VA 5H8NA 5L9OA 4G68A 1O64A 2QSXA 1FQEA 2UVIA 1A55A 5DEXB 2UYEA 5H8QA 5H8FA 1A8FA 3C35A 2R6GE 4OEUA 3IAZA 2GRVA 3EF7A 3EN3A 5AE4A 3CFZA 1MXWA 3OEKA 1B1XA 3RTWB 1B51A 3TTKA 4R9FA 2H4IA 1MQHA 5FTIA 1FQBA 1R6ZA 1OMPA 3BBRA 3ECRA 3MC2A 1DTZA 3V8XB 1DPEA 4Q5TA 1MY1A 2XX9A 3KG2A 3S2VA 2UXAA 3QUFA 5CMKA 2GHBA 4U1OA 2AIXA 1MQDA 4DXBA 3WAFA 2I3WA 4U4XA 4PFYA 4F31B 1ANFA 1URGA 3OENA 3FXUA 2DVCA 2X26A 2M8CA 2Q88A 4LUBA 2P2AA 1Y1ZA 1B3GA 5DT6A 4ELOA 4BDRA 3CFLA 5JTYA 3TCFA 4EXLA 4NF5B 4LZ5A 4Q30B 1I6AA 4FIMA 4YICA 1FTMA 2KLFA 4EQBA 5IKBA 2OJTA 2O7IA 1POTA 4N6PA 3H6UA 2HAUA 3C36A 2NXOA 1TFAA 1MY4A 3M3KA 2F6PA 4P0GA 5CM6A 2DXYA 1LCTA 4JWXA 5DEXA 5DVFA 1XHYA 3SETA 2ONRA 2RF1A 4IY5A 4U4SA 2DSFA 1N7WA 4RPOA 2RC9A 1B3EA 1D9YA 1DSNA 4NE4A 3MZ9A 1EU8A 1WVJA 5CMMA 1JEUA 3G3HA 3V89B 1JW5A 4R6HA 2OWSA 5ICTA 1ELJA 3FVGA 1FCKA 3U8QA 1B9JA 2Q2CA 1MQGA 3CFXA 4Q8RA 4NF8B 3F11A 1UTHB 4LP2B 3V5AA 3IX1A 3M3FA 3LC8A 1NNKA 1N84A 2NUVA 4YZZA 4GOTA 4DDDA 5CRYA 1NNTA 1FTJA 4ZS9A 1VE4A 4RYAA 2HXWA 4DCYA 2XHDA 2ZYMA 2ZYOA 3RY3A 1A40A 3Q26A 4F39A 4BDQA 4N13A 1DPPA 4JSDA 5FHNA 1ZJLA 3FXRA 1B46A 4KYDA 3TPAA 4IO4A 2ZYNA 5L9SA 4WEDA 1BP5A 2O51A 2OWTA 3CSBA 5KDTA 3FZVA 4F22A 4GRKA 2ZNUA 1POY1 2O68A 1CB6A 1SQYA 1US5A 3K6UA 1B3LA 3TCGA 1WDNA 3VFJA 4YKIA 3PD8A 2V25A 4N07A 2D3IA 2I0BA 2V3UA 3LUYA 1HSEA 5J1DA 1PBPA 3SESA 4GFRA 3IJOB 2Q8JA 1MDP1 2PYYA 2QPQA 5IAIA 4JBZA 3W9VA 2I49A 2RCBA 5EHSA 1DOTA 2R71A 4RPNA 2DE3A 3H4ZA 4RJZA 4AB5A 1VFDA 2DOJA 4BLAA 1P1UA 3PUZE 1LAGE 3TQWA 3UIFA 3KN8A 3FJGA 3G3JA 3IORA 4KYEA 3OO7A 3SEUA 3VV5A 3KEIA 1OLCA 4FATA 3ONMA 2RINA 3U1OA 1I6BA 3QK6A 1IQ7A 1JEVA 4Q0CA 4DXCA 4RK9A 2Z8FA 3K00A 4BDOA 4JXIA 1UIVA 1PB9A 4H5GA 1L5TA 1NKXA 1N0TA 4TLMB 5I56A 2XX7A 4OETA 1JVXA 4XIGQ 2AL4A 3DM0A 3ILTB 3OMBA 1TFDA 3H03A 1XVXA 1NH8A 2Z22A 1NFTA 4QFNA 4X48A 3RN8A 1PB8A 1SD3A 3C34A 5AA3A 1IUDA 4GVOA 2NOOA 3OSQA 4MBPA 3K01A 3H6VA 2QS3A 1ZKBA 3MPKA 5K2YA 5I57A 4GXSB 5H8NB 3TTLA 4YAHX 1Q1KA 4R75A 4DIGA 5CI5A 4JB7A 5H8QB 5H8FB 3QIMA 3MWBA 3FD3A 5H8HB 3DP4A 1FTKA 2QMXA 5TPAA 3ZSFA 4ELPA 2YLNA 3RUMA 1O7TA 4YMBA 4EQ7A 2FNCA 4FEBA 3G3GA 2G29A 5EHMA 3FVOA 1BTJA 3K1PA 5F7VA 1UTBA 4KR5A 1M5FA 1N76A 4QHQA 3E13X 3D4CA 3G3KA 3U93A 3N6UA 3CVGA 1B0LA 3VVFA 1ZLQA 3VLUA 3OSRA 5JK4A 4ESWA 5AA2D 4ZEKA 1QVSA 3MJNA 4AQ4A 4H0WA 2ESNA 2UVJA 4OFLA 3TQLA 3MBPA 1IXCA 3IOWA 2UYFA 3GBBA 1B6HA 4ZEFA 3IB0A 3AXFA 3ILUB 4U21A 1R9LA 3VLVA 5DTBA 5JTYB 3T9HB 3KJTA 2QS1A 1MXZA 5CMCA 4F2QA 3JYRA 2IEEA 1R1NA 3PPPA 4U2RA 3IJXB 4IO2A 5I2NA 1MXYA 2DWAA 2DP8A 4KD5A 2XD3A 2W7YA 3UGWA 1S9TA 1IITA 5H8HA 4F1YA 1AH5A 3MZ1A 1A54A 2PX1A 4IGRA 1GR2A 4QFLA 1B3FA 3TZAA 4TLLB 3OD7A 3QYTA 2RKMA 3OOAA 4TQUQ 1UQWA 2PMSA 1N3XA 1OIBA 3MVZA 3PMXA 3W15C 2BJJX 1MH4A 1SI1A 3HSTA 5L9MA 1D3KA 3T93B 4X1DA 3FXQA 1DMBA 1JW4A 3TELA 1BLFA 2XXUA 1MM6A 1H3DA 4C1TA 2ZYKA 2B3FA 5A5XA 4YKKA 1MQIA 1B4ZA 1MY3A 1ZBMA 3SKPA 4FE8A 3JV9A 5H8SA 2F7BA 3FASA 1GVCA 3IL1B 3C32A 4ISUA 3R7XA 3MUQA 2GFEA 4JWOA 1VSOA 2DWHA 1MH3A 1LFHA 3I6VA 1ZTYA 4OVJA 3ZKKA 3PU5A 5I84A 3OO6A 4L17A 5L8DA 3LSFB 4C1UA 3EHUA 3N94A 3EPEA 3O6IA 4U22A 3FJ7A 1UIUA 4H1XA 4H6DA 4F3SA 3U94A 4RK2A 4IO7A 2XXIA 3TODA 4R9GA 3K6VA 5ITOA 1F9BA 3TDJA 3CIJA 5KDTB 1XOCA 4JSOA 1LFIA 3DP8A 1T0KA 3CSGA 1HSLA 1O63A 1SW5A 3OEMA 1B1HA 3DLNA 4OFJA 3TUSA 4ZDMA 2V3QA 1Y3PA 4R2FA 5HBCA 3K6WA 4G8MA 2HEUA 2P0SA 4TOZA 4F1UA 3SEYA 2XD2A 1B5JA 2OK2A 1II5A 3OO9A 3TFLA 5CMBA 1Q35A 3GLBA 2Q89A 5BWJA 4I1DA 2XXQA 3PPOA 3LSWA 1QKAA 2X7QA 1EH3A 2YPNA 1Y4TA 1XT8A 2FYIA 3KN7A 3C4MA 2GH9A 4YKJA 3C33A 1BIYA 4RXLA 5K2XA 5TP9B 4I62A 3ZS6A 1YAEA 2THIA 1FQCA 3KSJA 4H67A 4PFUA 1SVXB 3MPLA 3JZJA 1QULA 3MVXA 4I9DA 3PUVE 1LB9A 5M2VA 3OXNA 3GBAA 3BFTA 4IO3A 4OENA 4GD5A 4IO6A 1MG1A 1SDXA 1LBBA 1A7LA 4O3CA 1Z7NE 3PMVA 2REJA 1XC1A 4LQ2A 2XX8A 5I56B 1SW1A 5LOMA 3EHTA 3MP1A 4HCWA 1PB7A 4F18A 5CC2A 4DE8A 2CZLA 3KN3A 4PP0A 2RCAA 5FTHA 4E0WA 1N3WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I6EA 4DLDA 5FBPA 2F6GA 1LBZA 1H76A 2B4MA 2DQVA 3CG3A 2PCRA 5I57B 1NUWA 1FQDA 3VLWA 3ODBA 3QSLA 2PVUA 3K02A 4PGPA 3B8BA 4OFOA 5IGAA 1NUZA 2P3NA 4OVTA 2Q74A 3PTYA 3U72A 4IY6A 1NV1A 2ONSA 2PFZA 1PBQA 3S4UA 1B5HA 5TPAB 2QRYA 4QFPA 3SEVA 2DE2A 1QKBA 1B0HA 5TP9A 1FRPA 3RPLA 3FIRA 1R9QA 4GWOA 4MNPA 4F19A 3T1BA 1YTVA 3RTFB 2E0SA 4GLIA 4P47A 2I3VA 4EF2A 1UTBB 1Y1MA 4PF6A 3VDFA 3TMGA 4PBHA 4YMAA 2R8TA 2Y84A 4GF8A 3HPIA 2V93A 4KCDA 5CBSA 2Q9TA 3L6GA 3G3FA 4FEDA 4LATA 4XTCQ 2HQ0A 4ZEDA 5KCJA 1NMUA 2OZZA 1KZ8A 4ZEIA 5B7DA 3UORA 4NTLA 4OQOA 2F7AA 3FJMA 3KFMA 2HAVA 4R72A 5KZTA 1USYH 1MPBA 4YU0A 3G3IA 5IM2A 2VGQA 1Y4CA 2I58A 2UVHA 3IOUA 3VE1B 4UACA 1B7HA 4G68C 4O7IA 1P1QA 1AMFA 2Y7KA 3A3UA 4NF4B 3K1MA 1URSA 4U1ZA 4NEDA 4DI4B 1LB8A 1B7UA 3IR1A 1XVYA 2B4LA 3ZKLA 5I2NB 2Z23A 2QS4A 5F1QA 1XS5A 1NH7A 5F24A 4U23A 3GZGA 1NV0A 4KCCA 3B7DA 4BDMA 2ZZWA 4QFKA 1OLAA 4HCYA 1NNFA 1KA0A 5HM4B 4N4UA 1FTAA 1S50A 2F7CA 3IFAA 4ONYA 2O1MA 4WXJA 1URDA 2F34A 3H7MA 4NWCA 2L5VA 4ZEBA 3UP9A 3VVDA 4IGTA 3S9LC 2O6AA 4H65A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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