1AIVA

Apo ovotransferrin
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords OVOTRANSFERRIN
publication title Crystal structure of hen apo-ovotransferrin. Both lobes adopt an open conformation upon loss of iron
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
total genus 135
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA03
4IO2A 1OVBA 3MAMA 1A7LA 1IXGA 2HFBA 5HBCA 1LAGE 1NNKA 3FXUA 5I2KB 4G4PA 1UIVA 2DQVA 4GRKA 1LSTA 2I0CA 3H3GA 1BKAA 5F7VA 4F1VA 4GF8A 3IO4A 1B5JA 1MG1A 3FD3A 5L9MA 4BLAA 5TPAA 2WKYA 1MDQA 1GTKA 3M3KA 5FHMA 4LQ5A 3FJMA 3VLVA 1B3GA 3SEWA 5B7DA 1MY1A 3FATA 4OQOA 4G8MA 4PFUA 5H8NA 5FHNA 1SI0A 3SEYA 1XHYA 1QKAA 1YTVA 2O1LA 4H8IA 2F5XA 4F18A 2H25A 3Q28A 5I57B 2RKMA 1SYHA 4F19A 4R6YA 1DPEA 2Q88A 4M4GA 1BLFA 3A3UA 2GH9A 1MXYA 1DTZA 4U23A 3B6QA 3OSRA 3W9VA 4DCXA 1MY3A 3MVYA 1B0HA 3T22A 3IOUA 3MBPA 2V84A 1PB9A 3G3HA 4ND9A 2UYFA 2DE2A 3T9XB 2GHBA 4PE5B 1EH3A 4DIGA 3PUWE 3Q25A 5CMBA 3G7WA 1AOVA 3O66A 1D4NA 3LC8A 4H1XA 3LBSA 1T0KA 4F2QA 1MXVA 4XKNA 4NEDA 1S9TA 1B52A 1XT8A 4KHZE 3N94A 4FEBA 2YPNA 1SYIA 1ZLQA 4IGRA 1B1XA 3TUSA 3HHFA 4XKPA 3O6HA 4ZEKA 2V93A 4YAHX 3TQWA 3CSBA 4UACA 3FUZA 1QUKA 3M3LA 3MVXA 1LB8A 1PB8A 3RTWB 4YMBA 5H8FB 3IB1A 4H5FA 3TQLA 3UN6A 5I2NB 1B51A 2GRVA 5K2YA 4PFYA 4WEPA 3L6HA 5FHOA 3I6VA 2I6EA 4POXA 1MY2A 5I58A 4BDOA 3C34A 5ISUA 3MZ9A 3OO7A 3T66A 1TFAA 2DE4A 2ZNSA 1I6BA 3OMBA 2F7CA 1SD3A 5H8QB 4KI0E 2DSFA 3ZKLA 3KJ7A 5AA3A 1GGGA 1ZU0A 5CC2A 1JEUA 3JZJA 4P0GA 1JW4A 4OENA 4F3PA 4L17A 5L8DA 2XXRA 4ZS9A 2GHAA 4ZEFA 2UVJA 4RA1A 5I2NA 4EQBA 4LZ7A 5ELVA 2QMWA 1GVCA 4WEDA 2R71A 4H65A 4GWOA 3FV1A 3S4UA 1YPNA 3S9LC 5KCJA 2ZYKA 1MDP1 1OMPA 2REGA 1P99A 3PGFA 1IZ1A 1FTKA 1POTA 2O1MA 2P1SA 1MY0A 2PMSA 5A5XA 3JYRA 1GR2A 1Y4TA 2AIXA 2FNCA 3K2DA 1UTBB 3U94A 1O63A 1PDAA 2Y7RA 4RJZA 3H7MA 3EHTA 2P2AA 4X48A 3K6VA 2QJEA 4U22A 3FVGA 2QL3A 5ITOA 1FTJA 3PPNA 1M5CA 4IY6A 5JEIA 2UVHA 4RNSA 4LP2B 4KYEA 1WODA 4OESA 4KYSA 4KQPA 1I6AA 3SKPA 4NWDA 1UTBA 3G3FA 4NMYA 2PT2A 3MP8A 3T93B 1B05A 1ZJLA 2VP1A 3KOSA 2DYXA 3LR1A 2AL5A 4F29A 2HQ0A 3VV5A 2HZLA 4R75A 3SESA 4XXUA 1FQAA 1N84A 2HAUA 4DXCA 2RC7A 2B3FA 5DEXA 3HO7A 1B2HA 1IXHA 1S50A 1US5A 3MZBA 1SW4A 1D9YA 3LSLA 2XD2A 1FW0A 3K01A 4PETA 1Y9UA 1B3HA 1N0TA 4GXSB 2XX9A 3MC2A 5AA4A 4JB7A 2DP8A 2RC8A 4G68A 4Q0CA 4NE4A 3G3JA 3EF7A 1VFDA 4HCWA 5HPQA 1B46A 5CMCA 2XXQA 2XXTA 3IK6B 4EUOA 1H3DA 3OENA 1DPPA 2LAOA 1SW2A 3RN8A 4Q8RA 3H6TA 3U1OA 4X1BA 2UVGA 1HSLA 3C33A 2HEUA 4DZ1A 3FXRA 3VDFA 2I48A 4TLMB 3PMWA 3TAJA 5KDTA 5I56A 3SETA 4THIA 4QRZA 2F7BA 4QSDA 3PPPA 4NWCA 4QF9A 4O3CA 2F34A 4GIZA 4R9GA 1XOCA 2XXWA 4R6KA 2QPQA 3QUFA 3DLNA 1B58A 1B5HA 1F9BA 4AQ4A 4R73A 1R6ZA 2KLFA 4KFQA 3TCGA 4GFRA 1ANFA 1LAXA 3MP6A 3UORA 2H5YA 4F3GA 4OFJA 3RT8A 2X26A 4LZ8A 1H76A 4ZZAA 4Z7EA 3E3KA 1LFIA 2I3VA 3TTNA 3TPAA 2D5WA 4ZE8A 1OLCA 2HCAA 1MM6A 4GQOA 2XHDA 4I9DA 4U1OA 3FXQA 5EYFA 1YAEA 1NH8A 1UIUA 4JDFA 3H4ZA 2DE3A 3MJNA 3H6UA 5AA1A 2I58A 3JV9A 4FJPA 3KG2A 2VD2A 4H8JA 1SVXB 5FTHA 3B6WA 4PP0A 1ZIUA 3PPOA 1MPDA 1IXIA 4ELQA 4QFNA 2Q89A 3HN0A 1MY4A 3MUQA 5IKBA 3B7DA 1TWYA 1LCFA 5DT6A 1ZKBA 1TFDA 5CRYA 1JEVA 2DVCA 3N5LA 2O51A 4YKJA 2I0BA 4GXAA 1YCJA 3MWBA 1ZBMA 1IXCA 4Q5TA 1IIWA 2PT1A 3A09A 2DVZA 4OFOA 1URDA 4C1UA 5FTIA 4F3SA 2Y7WA 3FGSA 3QSLA 3O6GA 3K00A 2Y84A 4QFOA 1IITA 2DXYA 4GOTA 1US4A 5AA2B 2E0SA 4ZE9A 3K6WA 3V89B 2HXWA 3IX1A 4I8CA 1IQ7A 2QS4A 3RQTA 1PEBA 2A5TA 2UYEA 3GBAA 4TOZA 3C35A 1S7YA 1M5BA 3C36A 1Y3NA 1Y4CA 2NWJA 1DMBA 2ZYMA 3OEKA 2DWAA 2CMOA 4WKMA 4E0XA 2Z23A 3BBRA 5EHSA 1USYE 4JWYA 5I2KA 1QW0A 4IO7A 1KWHA 3TYHA 4UA8A 3ODBA 2RCBA 4I62A 4YMAA 5H8HB 2Y7KA 2Q9TA 4EQ9A 1H44A 3VXBA 2A5SA 3U8QA 4FECA 3SDFA 4TQUQ 1SW1A 1JVXA 1JVYA 4QHQA 1A99A 4F1YA 4BDMA 2W7YA 1PB7A 3Q29A 3B6TA 3ZSFA 4F1UA 3QUJA 1QKBA 1B1HA 2V3QA 5M2VA 4H0WA 1MQGA 4KD5A 5CI5A 3N26A 5CMMA 1MH3A 4XKRA 4OEVA 1N3WA 3RNNA 3BFUA 4RY1A 4TLLB 2ONKE 4ELPA 1URSA 5DYHA 5I57A 4RXLA 3TTLA 2OWSA 4ZZEA 4OETA 1HSEA 4LVQA 2VD3A 3E13X 3TODA 2H4IA 5IAIA 1PC3A 2Q2CA 1EZ9A 4YKPA 1Z7NE 1WVJA 1BTJA 2RINA 1I6QA 1H43A 3CFLA 2F8DA 1MXZA 4DXUA 2XXVA 4OTEA 3BFTA 1XS5A 2IA4A 4F3BA 2ZYNA 4POWA 4LONB 1A54A 1NKXA 3RTFB 1M5EA 2X7PA 5ICTA 2NOOA 4JXIA 2NUVA 3O97A 3GLBA 1LFHA 3C31A 1P1WA 4XKQA 3E4RA 1A55A 5CBSA 1CE2A 2QRYA 3VE1B 5H8FA 3CG3A 1NNFA 3KGCA 2RCAA 2Z8EA 1J1NA 2XXXA 2NVUB 3CG1A 3O28A 1LCTA 2H9BA 2DXRA 3TTRA 2OCUA 1EU8A 1Q1KA 1B6HA 5K2XA 1O7TA 3IOTA 1NH7A 4WXJA 4FE8A 3H6VA 5H8QA 3LUYA 3UGWA 3EPEA 3CRBA 1MM7A 3OSQA 2PX1A 1P1UA 1D3KA 4OFLA 4YKIA 4HTGA 3KN3A 1MPBA 3DP8A 4RK9A 2V25A 2O6AA 3TZAA 1JW1A 4MLVA 4E0WA 1OVTA 1R9QA 3KBRA 1LBBA 3TEPA 2YJPA 3O2AA 4OWDA 4R9FA 4R72A 3FVOA 3KFMA 1ZTYA 4ZEIA 3ECRA 1OIBA 2F7AA 1LAFE 2Z8FA 4ESWA 3CI8A 1FQDA 3SERA 1OQGA 1II5A 2OJTA 3MZ1A 2B65A 3GXAA 1NNPA 1NL5A 3MPKA 2H98A 4OHNA 1QUIA 1MQDA 3T9HB 1B32A 4MF3A 2QSXA 3QIMA 4X9TA 2D21A 3RLFE 1PBQA 3PMXA 5DVIA 2UXAA 4LUBA 4YKKA 4N6PA 1N3XA 5KZTA 3OEMA 3VVFA 4YB7A 1L5TA 3T9VA 1RYXA 1DTGA 2ANJA 1XC1A 4AB5A 4M1VA 3H6WA 2ONSA 3IR1A 2ZNUA 5DTBA 3RY3A 1POY1 2F6PA 4IB2A 3G3IA 1QUJA 4KCDA 3IL1B 3IJOB 1NFTA 5ITPA 3VFJA 2AYSA 4G77A 1B5IA 4YICA 1MS7A 2Y7IA 3CVGA 4AB6A 3ILTB 3O9PA 2G29A 1VR5A 2PBWA 3P7IA 3FVNA 3SEUA 4EDPA 4OXVA 3TFLA 4JSDA 5I59B 1IEJA 5AE4A 3IOVA 3PUYE 3F11A 2Q2AA 4Q30B 4ZEDA 3MPLA 5CBRA 4U4SA 4FATA 2XX7A 4QFPA 1VSOA 5JTYB 1D9VA 4QSEA 2P0SA 2QS3A 1RYOA 3U72A 3VXCA 3MP1A 3TCHA 3HV1A 4XTCQ 2Z8DA 2O7IA 3OD7A 1PBPA 3FZVA 1B4HA 3PUZE 2ZXTA 3U92A 4MBPA 4YB6A 2V3UA 2XXPA 1JW5A 3K1MA 3HCQA 3C4MA 4F31B 2M8CA 2HZKA 4IY5A 5F1QA 3UA8A 4JBZA 1QJMA 2OK2A 4GD5A 5ICQA 1GV8A 1N76A 4BDRA 3UK4A 4IO3A 3K02A 5TP9B 4IO4A 2VGQA 1B3EA 3QAXA 4NF8B 1N7XA 3OXNA 4PFWA 2B3BA 3SEXA 2G93A 3N6TA 4G68C 4ZDMA 4OZ9A 1B4ZA 1TXFA 3KN7A 3OOAA 4G8HA 3WAFA 3TDJA 3OO6A 3ZS6A 1RKMA 1MQIA 1EZPA 4H5GA 5TP9A 4JSOA 4N07A 2OLBA 5CMKA 2XXIA 2F78A 4G8NA 4MH5A 1WDNA 5B70A 3TELA 5L9OA 2X7QA 3A3CA 3E9XA 3V5AA 5I84A 1URGA 1QULA 3LSFB 2FA7A 3Q27A 4ELOA 3EQ1A 2F35A 1M5DA 2AL4A 3TCFA 2DWJA 2ZYOA 1FTMA 5H8NB 1NMUA 2Z22A 3MQ9A 3MVZA 1Y1MA 4ONYA 3ILUB 3FV2A 3IOWA 4F2OA 2DOJA 1FQFA 1ZMGA 3PUVE 3CR9A 4LZ5A 4KCCA 1MRPA 3TKDA 1B40A 1JQFA 2Q8JA 2CZLA 4LA9A 4RYAA 1A8FA 5BWJA 3UIFA 2YLNA 5AA2A 4EF2A 4F22A 2R6GE 3UP9A 3TTMA 1H45A 2V3TA 5HM4B 1LB9A 1FTOA 4I1DA 3HPIA 4K3FA 2REJA 5DVFA 1P1NA 2VHAA 4JWOA 1B9JA 2H99A 4YB5A 1BIYA 1FTLA 1P1QA 4RPNA 4LQ2A 2QS2A 3IB0A 1NNTA 1LFGA 5EHMA 1VFEA 5H8HA 4OEUA 2GFEA 4LATA 1JNFA 4X1DA 2I49A 4GVOA 4FORA 3GBBA 3Q26A 3OELA 2ONRA 1SW5A 4NTLA 2ESNA 1P1OA 1BP5A 3G3KA 3QXMA 3RT6B 2DS9A 4ESXA 1MH4A 1JETA 3K4UA 2HAVA 3R26A 3MW0A 3TTKA 5LOMA 3KEIA 1USYH 1LAHE 1XVXA 2OBGA 4U1ZA 1AH5A 3DELB 4U2RA 4O3BA 4QFLA 5I58B 2NXOA 5CM6A 3THIA 4MLQA 4C1TA 3SEVA 1FQBA 3KZGA 3K1NA 3HSTA 3FASA 3RUMA 3IJXB 2D3IA 4DLDA 3IO6A 3H06B 4ZEBA 4P11A 3S9EA 5KCJB 1SI1A 3EHSA 1AIVA 3PD9A 4RK2A 3PUXE 4KPTA 5TU0A 3VLWA 5A5XB 3U93A 1ATGA 1FQCA 4GLIA 5J1DA 4QSCA 4YU0A 3K6XA 4FAJA 5BUUA 1OQHA 3GZGA 1UTHB 3C9HA 4ECFA 1N7WA 3O29A 3QYTA 4IO6A 4GL8A 3D4CA 3K1PA 2I4CA 1HSJA 5L9SA 1FCKA 2ZMBA 3KJTA 4IO5A 2O7UA 1CB6A 3RPWA 1B0LA 1MXXA 1R1NA 4ELRA 1LGBC 3DM0A 4NF4B 3PPQA 3USDA 2ALUA 3PU5A 3V83A 1Z7ME 3VVEA 2OZZA 3IB2A 4HS7A 1R9LA 1B3LA 1SBPA 1UTHA 4QFKA 2IEEA 3LSWA 1AL3A 3R7XA 4R6HA 3R6UA 4EXKA 2XX8A 5DVJA 4DCYA 2DWIA 4NF4A 1MXUA 1M5FA 3PMVA 4N13A 1UQWA 4G2ZA 2F97A 1B7HA 4BDNA 5DEXB 4YZZA 4OERA 3S9MC 3T9UA 4FEDA 3VVDA 3M3FA 4NF5B 4EQ7A 1SDXA 4RPOA 3KSJA 3KN8A 5H8SA 1LLSA 5AA4B 3BKIB 3AXFA 2XD3A 1B7UA 4U4XA 1VE4A 4XIGQ 4EXLA 1Y20A 4G68B 3CIJA 4H6DA 4HW8A 2PYYA 4NF6B 4GL0A 4DDDA 3OO9A 4IGTA 3V8XB 3OO8A 1TT1A 2BJJX 2RC9A 4FIMA 2RF1A 4OYVA 1Y3PA 2I3WA 3K6UA 1DSNA 1FQEA 4NF5A 3PPRA 2O84X 1B7ZA 4P0IA 2R9JA 3DP6A 3RGYA 2FYIA 5KDTB 3N6UA 5I56B 3CSGA 2E1SA 3ONMA 4NF6A 4HCYA 3TMGA 3WAEA 1MXWA 3H03A 4MFIA 2Y7PA 2QS1A 4Z0IA 4OMBA 3FVKA 3DP4A 3S2VA 1Q35A 2XXUA 1A40A 4H67A 2XXYA 2F6GA 3IORA 3PV0E 1LBCA 4F39A 3T96B 3KOTA 3I3VA 3L6GA 1IUDA 3FJGA 1N04A 3C32A 2ABHA 1MQJA 1Y1ZA 4R2BA 2DWHA 5I59A 1QVSA 2I4BA 3KSXA 3CFZA 4R74A 1MQHA 3M8UA 4O3AA 4U21A 5JTYA 2OWTA 3S9NC 4JWXA 2PVUA 3G3GA 4BDQA 5AA2D 2VOZA 1I69A 1O64A 4R2FA 4OVJA 2THIA 3FJ7A 4BDLA 4DXBA 3EHUA 2UVIA 4KR5A 3MVWA 1XVYA 1B3FA 3W15C 3QK6A 3D4GA 5JK4A 1MPCA 1EZOA 1OLAA 3PD8A 1SQYA 1ELJA 4ISUA 2O68A 3HHGA 2QMXA 3I5OA 4KYDA 3LSXA 1AMFA 3O6IA 1Y3QA 4NF8A 4DE8A 4EF1A 2A5TB 3FIRA 2F36A 3K0VA 2ZNTA 5TPAB 1A8EA 4PQJA 2O69A 4PFTA 4C0RA 3IAZA 3W9WA 3EN3A 2XXHA 3VLUA 4ZECA 1DOTA 3CFXA 3ZKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IO2A 1OVBA 3MAMA 1A7LA 1IXGA 2HFBA 5HBCA 1LAGE 1NNKA 3FXUA 5I2KB 4G4PA 4MNCA 1UIVA 2DQVA 4GRKA 1LSTA 1LBXA 2I0CA 2Y5KA 3H3GA 1BKAA 5EYHA 5F7VA 4F1VA 4GF8A 3IO4A 1B5JA 1MG1A 3B8BA 5EQ7A 3FD3A 3FBPA 5L9MA 4BLAA 5TPAA 2WKYA 1MDQA 1GTKA 3M3KA 1FPDA 5FHMA 4LQ5A 3FJMA 3VLVA 1LBVA 1B3GA 3SEWA 5B7DA 1MY1A 1AWBA 3FATA 4OQOA 4G8MA 4MX6A 4PFUA 3BIHA 5H8NA 1FPEA 5FHNA 4H46A 3PTYA 4XEQA 1SI0A 3SEYA 1XHYA 1QKAA 1YTVA 2O1LA 4H8IA 2F5XA 4F18A 2H25A 3Q28A 5T3JA 5I57B 2RKMA 1SYHA 4F19A 4PGPA 4R6YA 1DPEA 2Q88A 4M4GA 1BLFA 3A3UA 2GH9A 1MXYA 1DTZA 4U23A 3B6QA 3OSRA 3W9VA 4DCXA 4PGNA 1FBEA 1MY3A 4LN5A 3MVYA 1B0HA 3T22A 3IOUA 3MBPA 2V84A 1PB9A 3G3HA 5FBPA 4ND9A 2UYFA 2DE2A 3T9XB 2GHBA 4PE5B 1EH3A 4DIGA 3PUWE 2FBPA 3Q25A 5CMBA 3G7WA 1AOVA 4OVRA 3O66A 1D4NA 3LC8A 4H1XA 4PC9A 5I5PA 3LBSA 1T0KA 4F2QA 1MXVA 4XKNA 4NEDA 1KA1A 1S9TA 1B52A 1XT8A 4KHZE 3N94A 4FEBA 2YPNA 1SYIA 1ZLQA 4IGRA 1B1XA 4MAGA 3TUSA 3HHFA 4XKPA 3O6HA 4ZEKA 2CEXA 2V93A 4YAHX 3TQWA 3CSBA 2HPGA 4UACA 3FUZA 1QUKA 3M3LA 3MVXA 5I7IA 1LB8A 1PB8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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