3TQWA

Structure of a abc transporter, periplasmic substrate-binding protein from coxiella burnetii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
237
structure length
235
Chain Sequence
MVRVGTIAGPETQLMEVAKQVALNRYGLHVNIITFSDYNTPNEALADGSVDANMFQHLPYLKAQIEMRGYKIVSIGKTFVYPMGLYSKKITALTQLKTGAKIAVPSDPSNEARALLLLEKAQLIQLKTHINATPMDIASNPKKLKIVELDAAQLSRSLGDVDLAAINTNYAIPAGLSPSRDALLTEGPNSPYANVVAVREDDKNDPRLKQLVSALHSPAVLSAAKKIFGDGAIPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Methionine-binding protein
source organism Coxiella burnetii
molecule tags Transport protein
total genus 69
structure length 235
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA02
3QAXA 2DWJA 3EPEA 3BFTA 4FE8A 4ZEIA 4BDNA 5H8NB 3PPQA 3FD3A 4MLQA 4OHNA 3SERA 1MM6A 1GTKA 4H6DA 3IR1A 5I58A 5I59A 1OQGA 5LOMA 1B5IA 5K2XA 3K1MA 3HPIA 5H8FB 5DEXA 2AL4A 3PMWA 4F22A 4P0IA 3HN0A 1MPBA 5CMBA 3LSFB 1MXWA 5H8QB 1OLCA 2NOOA 1OIBA 3MP8A 2P1SA 2G29A 2R6GE 4BDRA 2RC9A 1LGBC 3IOWA 4KYSA 4L17A 3T9VA 3SEUA 3S2VA 4U1ZA 4H8IA 5ELVA 1EZOA 2H5YA 3T22A 1Z7ME 1PB7A 2LAOA 1XT8A 1I6BA 3CG1A 3I5OA 1PBPA 4OEVA 4EXKA 1PBQA 1MPCA 3V83A 2FA7A 3L6GA 2V3TA 2Z22A 1M5DA 2DE4A 1FQDA 3F11A 3KN3A 5I58B 3PGFA 4F3GA 3S9EA 1Y9UA 2HAVA 3IB0A 5DEXB 3RQTA 3W9VA 3CG3A 1P1OA 3JZJA 1B9JA 2A5TA 2GHAA 1AOVA 1Y4CA 5JTYA 5FHNA 2HEUA 3K6VA 3RT6B 3FXQA 2ZYKA 1LFHA 3BBRA 1N3XA 1SW1A 1TT1A 3KFMA 2HAUA 4XIGQ 2XX9A 4YKIA 3TZAA 1I69A 2Y7KA 3OO9A 2ESNA 1NL5A 3HHFA 3K1NA 2HXWA 1TXFA 4YB7A 3MZ9A 2QRYA 3E4RA 3M3KA 4ESXA 3QYTA 1B46A 4U1OA 3PD8A 4GXSB 4O3BA 1D9VA 1L5TA 4HCYA 5BWJA 2ONSA 2RCAA 1A8FA 2OCUA 4Q8RA 1CE2A 2F78A 1IUDA 1N04A 1Q35A 3O6GA 3TELA 3G7WA 4IGRA 2RINA 1M5FA 1P1UA 2A5TB 2V3QA 4XKRA 2YLNA 4EQ7A 4F18A 3TTRA 2IEEA 3EN3A 2REJA 1B1HA 5HBCA 3O2AA 2O84X 5ICQA 4JWXA 1O7TA 3VXCA 1TFDA 5KCJA 1IITA 2OLBA 4GLIA 3VLWA 3QK6A 2XHDA 3A3UA 1ELJA 3C35A 4ELOA 4XXUA 3VXBA 1B05A 4R9GA 2HZKA 1UTHB 3N6TA 1ANFA 1XHYA 1FQBA 2KLFA 1EZPA 4KR5A 3OEKA 3UGWA 2UVHA 5AE4A 4DXUA 4OMBA 3O9PA 4I9DA 2DWIA 4H67A 3C34A 3RN8A 4HTGA 4QFLA 2HQ0A 2DE2A 3MWBA 4G8MA 2HZLA 1MPDA 1XC1A 5EYFA 1FQFA 5TP9A 5AA4A 2O68A 2ANJA 5I2KA 4FORA 3GBBA 3OSQA 4ONYA 4H5GA 2OBGA 4R2BA 5DT6A 3MP1A 4KI0E 4U2RA 5KCJB 2PMSA 5KDTA 1J1NA 1B4ZA 4KFQA 4YKKA 3FXRA 5I2NA 3I6VA 2P2AA 5CBRA 4BDMA 2ALUA 4U4XA 2XXXA 1A7LA 5FHOA 3DP4A 4R74A 2O1LA 4Q30B 1MH4A 3G3KA 5JEIA 4G2ZA 3OD7A 2F36A 3MPLA 3EHTA 4XTCQ 1F9BA 1OLAA 2Z23A 3PU5A 1H43A 3CFZA 3O28A 3PUVE 5CMCA 1USYE 5DTBA 3KBRA 4F39A 1SW5A 4O3AA 4IY5A 4GL8A 4UACA 4YMAA 1DOTA 4F3BA 3FUZA 1QULA 3CSGA 3IOVA 5TP9B 5AA4B 1Y1ZA 3ZS6A 4X1DA 5B70A 5I2KB 2QS4A 3GBAA 4OETA 1O64A 4M4GA 1SW2A 2PBWA 3G3JA 1M5EA 3BKIB 3B7DA 4AQ4A 1PDAA 5I84A 3MP6A 1IXIA 5I2NB 1B3FA 1NNPA 2OJTA 3U93A 1H44A 3LBSA 2G93A 4OFLA 1VSOA 5DVJA 3JV9A 1T0KA 1DPPA 1QJMA 2OWTA 5I56A 1LBBA 1SI1A 2F34A 4GVOA 2IA4A 2OK2A 2PVUA 3H4ZA 2XX8A 3T93B 1FW0A 3RTFB 3K4UA 2Q8JA 1AH5A 2QS1A 3Q25A 3HV1A 1N84A 1JW5A 4I8CA 1FTJA 1Y4TA 5ITOA 4HCWA 1LB9A 4OFJA 1URSA 3PUZE 1JVXA 4TLLB 2I0CA 4E0WA 3RUMA 5TU0A 2W7YA 3MZBA 3UA8A 4DDDA 2DE3A 3QXMA 3ONMA 1WVJA 1MXXA 1MS7A 1URDA 2I0BA 5DVFA 4IB2A 4F3SA 5L9MA 3P7IA 4NF8B 2DP8A 3ZKKA 4QFNA 5F1QA 5H8NA 4YKPA 2DWHA 1SVXB 4GWOA 3G3FA 4BDLA 3FZVA 5DVIA 2H9BA 2B65A 4KYDA 4YU0A 1NH8A 3TCFA 5H8FA 2THIA 1JW1A 1B6HA 2E0SA 3ODBA 4DE8A 1B4HA 3FVGA 1BLFA 2REGA 3FASA 3CFXA 1NNKA 3N6UA 3Q26A 3T9UA 3H06B 4ELPA 4BDQA 4ZECA 4NWCA 1MQJA 5H8HB 2O7IA 4EXLA 2B3FA 4BDOA 3H6UA 1QUJA 3SEYA 3MJNA 1Q1KA 4DCXA 3KOTA 3VVEA 1MY0A 4KYEA 1DTGA 3R6UA 3CIJA 2I4BA 2AIXA 3R26A 4NMYA 1B7ZA 2XD2A 1NFTA 1EU8A 1MRPA 2ZYNA 4Z0IA 1PC3A 3FV2A 4LZ7A 4G8HA 4R72A 4PETA 1ZLQA 4I62A 4RK2A 1Y3PA 3VVDA 2DVCA 3N5LA 2NWJA 4FATA 1XS5A 4P11A 1QW0A 2I49A 1AIVA 2DWAA 3U94A 3D4GA 3EHUA 4U21A 4ZEBA 4ZEFA 3PD9A 4GFRA 3RLFE 1JVYA 2ABHA 1DTZA 3MUQA 2F7AA 1RYOA 1A99A 3USDA 1XOCA 3H6TA 5KZTA 1B40A 1HSEA 1FTOA 4EDPA 1B32A 1B51A 3ILTB 3MZ1A 4EF2A 1R9LA 3K6XA 5H8SA 1B52A 3LSXA 1N7XA 5BUUA 1POTA 3RGYA 4LZ5A 1LCFA 3K6WA 4G68C 3LR1A 1POY1 1MXVA 4IO5A 3U92A 1P1WA 3EHSA 3HSTA 1MQIA 3PPPA 3SETA 4NF6B 1VFEA 4K3FA 1WODA 4R2FA 4IO3A 4QHQA 3R7XA 1Y1MA 4ISUA 4LQ5A 3L6HA 3KOSA 2Q2AA 4OQOA 4C0RA 5CMKA 2FYIA 1ZBMA 4RPNA 2F6GA 3A3CA 3C31A 1IIWA 1MDQA 1TFAA 3ZKLA 3S9MC 1LAGE 2UVGA 3EF7A 1IEJA 3OXNA 2ZXTA 3T96B 1VE4A 4QFPA 2HFBA 5ITPA 3E13X 2VOZA 1B3GA 2Q9TA 4RNSA 1NKXA 1D3KA 1SBPA 5L9SA 2AL5A 4MF3A 1SW4A 4LVQA 3LUYA 1JETA 1US4A 1UTHA 5CBSA 3GZGA 1IQ7A 3S9LC 3M8UA 4THIA 4F29A 4F1UA 4P0GA 1MY1A 1DMBA 3KSXA 3RPWA 4F1YA 3TEPA 2RF1A 4NF4A 3OO7A 2R9JA 4WKMA 4YMBA 3FIRA 4I1DA 4H5FA 2B3BA 1R9QA 1URGA 1S7YA 3H6VA 1I6QA 1LSTA 4YZZA 3FGSA 3V89B 4IO4A 2XXPA 3CRBA 3HCQA 4FECA 4U4SA 2DXYA 2DYXA 3PMXA 1R1NA 4NE4A 1ATGA 4WXJA 2X7QA 1BP5A 2Y7RA 3B6WA 4OERA 4ZEDA 4O3CA 1RYXA 2YPNA 3PV0E 2RC7A 4OXVA 1SYHA 3T9HB 4JXIA 1D9YA 1US5A 3IJXB 1SDXA 4OTEA 3O29A 4QSDA 2GH9A 4NF4B 4KD5A 1Y3NA 2UVIA 1MY3A 4LUBA 1YAEA 3CI8A 4XKPA 4GL0A 1SYIA 5DYHA 1P1QA 1I6AA 2VD3A 3E9XA 3WAFA 1N0TA 3S9NC 3PUWE 4F19A 5L8DA 2ZNSA 3K00A 1MY4A 4LA9A 3PPOA 1ZJLA 1MQHA 3UP9A 4R75A 3KJ7A 1N7WA 3M3FA 5A5XA 2O1MA 3QSLA 3CSBA 3H03A 3U1OA 1A55A 3CVGA 3MW0A 2Y84A 3IAZA 2XX7A 4F1VA 3KN7A 2O69A 2BJJX 4H0WA 1USYH 4XKQA 3DELB 4H8JA 1FCKA 4G68A 1B7HA 4OWDA 3OMBA 1QVSA 4JB7A 2XXTA 1PB8A 4ELRA 3K01A 1B3HA 3O6HA 3SKPA 3KJTA 2I58A 3RT8A 2OZZA 4MFIA 3TFLA 4DCYA 4NF8A 1EZ9A 2ZYOA 3FJMA 3SEXA 1IZ1A 1II5A 1NNTA 3K6UA 1LAHE 2Y7WA 5HPQA 1PB9A 3MVZA 4GIZA 2DQVA 3OELA 1NH7A 3KG2A 1MY2A 2XXRA 2FNCA 4IO2A 1A54A 2Z8DA 5A5XB 2DOJA 3E3KA 1MXYA 3Q29A 3TMGA 3JYRA 4LP2B 3QIMA 4C1TA 3Q27A 4F31B 1H76A 5K2YA 2V84A 2OWSA 5H8HA 3THIA 4EF1A 3M3LA 4OEUA 4MBPA 3MQ9A 4G68B 3N26A 2GRVA 2QMWA 1Z7NE 2XXYA 1FTKA 4KCCA 4OFOA 3DP6A 1DSNA 4R6HA 3S4UA 3Q28A 3MBPA 2YJPA 2DVZA 5CRYA 4U22A 3RY3A 4PFUA 3FVOA 4JSDA 2DSFA 3K1PA 1VFDA 2O7UA 1B3LA 4KPTA 3HHGA 2Q88A 4WEDA 3O97A 4RA1A 2NXOA 4F2OA 3VVFA 3SDFA 3IJOB 4PQJA 4ZEKA 1M5CA 4IO7A 3TYHA 1MQDA 4DIGA 4JWYA 5ISUA 2H98A 4R6YA 4R73A 3KEIA 4N6PA 2QS3A 1IXGA 1IXCA 1LBCA 4OESA 2F8DA 1BIYA 4E0XA 4GXAA 4RY1A 4FJPA 1S9TA 4GRKA 3W9WA 1FTMA 1HSJA 2E1SA 3UK4A 3DP8A 3VV5A 1UIVA 3UORA 2R71A 1UIUA 1QUIA 2I4CA 4X9TA 1M5BA 4NF6A 4N13A 5B7DA 3TTLA 2M8CA 1MG1A 1O63A 3PPRA 3TCHA 3V8XB 4C1UA 3IORA 4YB5A 2CZLA 1QUKA 1B0LA 3VLUA 5FHMA 2O51A 1H45A 3OO6A 4G77A 5J1DA 1MH3A 4FEBA 4FIMA 1HSLA 2VD2A 2NUVA 2VHAA 1JNFA 2D21A 3TPAA 4HW8A 3EQ1A 1KWHA 1XVYA 4POWA 2QJEA 4BLAA 2ONKE 1RKMA 2A5SA 3IOTA 3KN8A 1AL3A 3RNNA 2QMXA 3TKDA 3RTWB 1UTBA 3OSRA 4U23A 1SQYA 3TDJA 1JQFA 3AXFA 5F7VA 2Y7IA 3TTNA 1NMUA 3T66A 1LFIA 5I59B 4QRZA 2F6PA 2I48A 3IB2A 1B58A 5JK4A 4QF9A 2NVUB 2UXAA 1Y20A 1ZIUA 2PYYA 1SI0A 3V5AA 3PUXE 3OENA 1A40A 1LFGA 1MM7A 2GFEA 3FXUA 3IK6B 1BTJA 1OVBA 2QPQA 3MVYA 3C4MA 1YCJA 4QSEA 4ZE9A 3SEVA 1PEBA 2I3WA 2D3IA 2XD3A 1GVCA 1XVXA 3ECRA 1S50A 3MVXA 4NF5A 3N94A 3IO4A 4H1XA 2XXWA 5AA2A 3U8QA 1UTBB 3IO6A 4Q5TA 3VE1B 3OOAA 2DXRA 1MDP1 3GLBA 1WDNA 2VGQA 1MQGA 3G3GA 2WKYA 4R9FA 2ZMBA 1ZMGA 1ZTYA 3LSWA 3FVNA 1B7UA 4IGTA 4QFOA 3DLNA 2Q2CA 1LLSA 1B3EA 2H25A 3SEWA 3SESA 4OENA 4ECFA 5I57A 1B0HA 3CR9A 4DXCA 2XXUA 2H99A 3VFJA 5CMMA 4ELQA 4DXBA 1H3DA 2HCAA 5JTYB 2XXVA 2I6EA 4F3PA 1B2HA 4NTLA 2ONRA 4G4PA 3D4CA 3FJGA 2VP1A 1YPNA 2RKMA 1FQCA 3W15C 2ZNUA 4NF5B 3MAMA 4ZDMA 3PUYE 1MXUA 3H6WA 1FTLA 3KGCA 4YKJA 1MXZA 1UQWA 4OZ9A 2XXHA 5AA2B 3O66A 4LQ2A 3QUFA 4F2QA 4WEPA 2V3UA 2H4IA 4ZZEA 4FAJA 4UA8A 4AB6A 2QSXA 4GD5A 3UN6A 4Z7EA 3HO7A 2PT2A 1LAFE 4TQUQ 3GXAA 1LB8A 1LCTA 1GV8A 1A8EA 4NEDA 3LC8A 5FTIA 3CFLA 2UVJA 3OEMA 5I57B 1NNFA 1B1XA 4YAHX 4EQ9A 4G8NA 5L9OA 2X7PA 2P0SA 3IL1B 1Y3QA 2PT1A 4NWDA 5EHSA 3IX1A 2Z8FA 4KQPA 4ESWA 1P99A 4MLVA 4JBZA 1DPEA 4RK9A 5ICTA 2V25A 4JSOA 3TQWA 3PPNA 2UYFA 1ZKBA 1CB6A 3H3GA 1OQHA 3TAJA 4PFWA 3PMVA 5FTHA 3H7MA 2F35A 4Q0CA 2X26A 3DM0A 5HM4B 1AMFA 4OVJA 3ILUB 3FV1A 4JWOA 4TLMB 1B5JA 5TPAA 4MH5A 4ZZAA 1R6ZA 4PE5B 3MPKA 4DLDA 4ZE8A 4AB5A 4FEDA 1EH3A 4RJZA 3WAEA 2ZYMA 4LATA 1JEUA 4R6KA 3FVKA 1GR2A 1SD3A 2Z8EA 4RPOA 1ZU0A 2Q89A 3I3VA 1VR5A 4GQOA 3VLVA 2O6AA 4JDFA 4DZ1A 1GGGA 3C32A 3K0VA 4OYVA 5EHMA 2UYEA 3ZSFA 2XXQA 1TWYA 3TTMA 4X48A 5IKBA 3TODA 4GF8A 5IAIA 3C33A 1N3WA 4H65A 4RYAA 5KDTB 4KHZE 4ND9A 2V93A 1JEVA 4RXLA 3IB1A 4GOTA 3FJ7A 3K02A 2QS2A 4PFYA 5CM6A 3UIFA 5TPAB 1IXHA 2I3VA 4EUOA 3B6TA 3TCGA 1BKAA 5AA3A 2QL3A 4ZS9A 3KZGA 4N07A 3G3HA 3TQLA 2F7CA 2Y7PA 4PP0A 1FQAA 3MC2A 2F7BA 4IO6A 1P1NA 2GHBA 3C36A 3VDFA 1N76A 4PFTA 2F5XA 2F97A 3OO8A 5AA2D 1YTVA 5CI5A 2AYSA 1OMPA 2PX1A 2DS9A 3TTKA 3TUSA 2RC8A 1LAXA 4LONB 1QKAA 2RCBA 3MVWA 3C9HA 3BFUA 3B6QA 2D5WA 3QUJA 3FATA 3G3IA 5I56B 4HS7A 5H8QA 4EQBA 1D4NA 4LZ8A 3T9XB 3O6IA 1QKBA 3LSLA 1B5HA 4M1VA 4POXA 4QSCA 3IOUA 1OVTA 5AA1A 5CC2A 4TOZA 5M2VA 1FQEA 4YB6A 4YICA 4KCDA 3A09A 4IY6A 1JW4A 2ZNTA 2CMOA 3KSJA 4XKNA 3U72A 2XXIA 4QFKA 3K2DA 4X1BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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