3TQWA

Structure of a abc transporter, periplasmic substrate-binding protein from coxiella burnetii
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
237
structure length
235
Chain Sequence
MVRVGTIAGPETQLMEVAKQVALNRYGLHVNIITFSDYNTPNEALADGSVDANMFQHLPYLKAQIEMRGYKIVSIGKTFVYPMGLYSKKITALTQLKTGAKIAVPSDPSNEARALLLLEKAQLIQLKTHINATPMDIASNPKKLKIVELDAAQLSRSLGDVDLAAINTNYAIPAGLSPSRDALLTEGPNSPYANVVAVREDDKNDPRLKQLVSALHSPAVLSAAKKIFGDGAIPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural genomics for drug design against the pathogen Coxiella burnetii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Coxiella burnetii
molecule keywords Methionine-binding protein
total genus 69
structure length 235
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tqwA02
1ZU0A 5TU0A 4YAHX 2I3WA 5AA3A 3R7XA 2E1SA 2HFBA 3TCHA 5F1QA 4P0IA 2Z22A 2DYXA 5L9OA 4NMYA 1VFDA 1NMUA 1H45A 1M5DA 1I6AA 4XKNA 3Q29A 3JYRA 1P1QA 1FTOA 4OEVA 3TAJA 1LBCA 3IORA 4ELOA 4ZE8A 4MFIA 3RLFE 5AA2A 1US5A 3D4CA 1IXCA 3CI8A 3TEPA 3IB2A 2HCAA 4I62A 2VD2A 1P1OA 2DE2A 3A3UA 3FV2A 2XXQA 5HBCA 1N76A 2RCBA 1I6BA 3TTMA 1MH4A 1B5HA 1LLSA 3BKIB 4ZEIA 1SBPA 1PB7A 4H5GA 5ELVA 4RPOA 1LFGA 1JEVA 2G93A 4ZEFA 1LAFE 1AOVA 1MY0A 4X1DA 3FV1A 3CFXA 1ANFA 3L6GA 3VVEA 4QHQA 4NF6A 1N7WA 3OELA 4LZ5A 3VE1B 2OCUA 4BDLA 3C33A 4ZECA 3H03A 4ELPA 3MAMA 1P99A 1Y4TA 4Q0CA 3N94A 4FECA 1B9JA 3G3HA 2F35A 1VFEA 3LSLA 2XD2A 3VXCA 1UQWA 2UYEA 4Z7EA 4HTGA 3VXBA 3K1NA 2A5TB 3FUZA 3K02A 3G3IA 1WVJA 1N7XA 4QFNA 1ZBMA 2F6GA 3C36A 2HZLA 2UXAA 1FQFA 4OFLA 4KHZE 4XTCQ 4MF3A 2F7BA 3ZSFA 4R75A 4H5FA 3QYTA 4Z0IA 4QFLA 1R1NA 3FJGA 1CE2A 4G8NA 1GV8A 4AB5A 4YZZA 2FNCA 2YLNA 4RK2A 2ZMBA 1SVXB 1B0HA 2H25A 3TZAA 5TPAB 3FVNA 1B6HA 1ATGA 3KEIA 2F7CA 2V3TA 5I84A 3PGFA 1B1XA 4KI0E 3V8XB 1MXUA 2QJEA 5I58B 2PT1A 4P0GA 4LONB 4ZZEA 1CB6A 4G2ZA 3TUSA 2YJPA 3TCFA 4C1UA 2A5SA 4U4XA 1MRPA 1JEUA 4JSOA 3TQWA 3OSQA 1AIVA 3O2AA 4LZ7A 5I2NB 1LAHE 4F2QA 4C0RA 2F6PA 4NF8B 1DTGA 1GVCA 3SERA 3OOAA 3A09A 3FXQA 2I3VA 1B52A 4YKPA 4OHNA 4OMBA 3PUWE 2OZZA 2Q8JA 1AL3A 1PBPA 3DP6A 1FQDA 3I3VA 3S9LC 3PUZE 4GVOA 3TODA 1I69A 4KCCA 4IO7A 4WKMA 4N13A 1Q1KA 2I0BA 2H5YA 1JNFA 5KCJA 2X7QA 1ZIUA 5AA4B 3K1PA 5DEXB 2PT2A 2XXWA 3TTRA 5KDTB 4K3FA 1TT1A 4F22A 3K6XA 3W9WA 2IEEA 3H06B 1PB9A 1B7UA 1JETA 3C4MA 2Y84A 3PPOA 2DVCA 4RXLA 2Y7WA 3UK4A 2ANJA 2YPNA 2DS9A 2D3IA 1SD3A 1HSEA 4QSDA 4G68A 2QS2A 3OEKA 1GGGA 4PFTA 2QMXA 2DWAA 4R72A 1LSTA 1M5FA 1MXXA 2FA7A 4EQ7A 4KCDA 1B3LA 5CMCA 1DOTA 1II5A 4H6DA 4MBPA 4GWOA 4YB6A 3LC8A 3KN3A 4OESA 4OEUA 1LAGE 1MY2A 2D21A 1Y3PA 3MP6A 3TDJA 2E0SA 3THIA 3VLVA 5EHMA 4F3SA 1N0TA 2Z8FA 3PPQA 1EZOA 1MPBA 3WAFA 4IY6A 3CG1A 3FATA 2RC9A 3OSRA 1S9TA 1MG1A 1GTKA 1SW2A 2I4CA 4XKPA 1P1WA 1SI1A 4YMBA 3OO8A 1ZJLA 1B05A 2P1SA 4MLQA 2XXUA 2O7UA 5A5XA 3QUFA 3T9XB 5ITOA 3FASA 1DSNA 1JVYA 5B7DA 1EZPA 3E4RA 4JXIA 4JDFA 1BTJA 2QS1A 1FQCA 3RNNA 1H76A 5HM4B 4WEPA 3A3CA 4O3BA 5AA2B 2CZLA 3KSXA 1A8EA 1MPCA 1MH3A 3MZBA 4NF4A 3Q26A 4R74A 2I49A 3KOTA 1ZKBA 3KN8A 2OBGA 1D4NA 1A54A 1XT8A 3IL1B 4OYVA 3MC2A 4IGTA 4BDRA 3HCQA 4POWA 2F34A 2XHDA 4IO6A 4C1TA 2PYYA 3OXNA 3VLWA 3W15C 1EH3A 4BLAA 2QPQA 1PBQA 2Y7RA 3MZ9A 3N6TA 3EHSA 3MVXA 4G8MA 4JWXA 1MY1A 1IIWA 3SEVA 4NF6B 1B4ZA 4UACA 2Z23A 4TQUQ 1J1NA 3OO7A 4LP2B 4NTLA 3PUYE 1MPDA 1N3XA 3FZVA 3BFTA 3OMBA 5AA2D 1SYHA 3V5AA 4PETA 3V83A 5DVJA 2XD3A 2R71A 1MM6A 1RKMA 3HHGA 4OQOA 4YU0A 4FAJA 2PBWA 4ND9A 1MXZA 5IAIA 1FQEA 2V84A 1A55A 1XVXA 1NH8A 1QVSA 3SEWA 5AA1A 5CBRA 3B6TA 1MM7A 2CMOA 1LGBC 4ZDMA 4QFOA 4QFPA 4EQBA 4R6YA 3MBPA 4NWDA 1ZTYA 2XX9A 2AIXA 3VFJA 2AL4A 1QUIA 5H8HA 5FHNA 1MS7A 3FGSA 1IUDA 1IXGA 4KQPA 5H8NA 2Q2CA 1M5BA 1VE4A 3IO6A 4I1DA 3Q28A 2D5WA 1EZ9A 2RC8A 4KYEA 4X9TA 4GL0A 5LOMA 2XXPA 3DELB 3KFMA 3ZKKA 1MXYA 3PD8A 4X48A 4I9DA 1B3GA 3SETA 1Y3QA 4FJPA 4QF9A 2QS4A 1Y9UA 1N3WA 4F39A 1LFIA 3PD9A 3PPRA 1B1HA 2I4BA 1B2HA 4DIGA 1B7ZA 3C34A 3KZGA 3M8UA 3UGWA 3MP1A 4QSEA 3EQ1A 2DSFA 3MVYA 3F11A 2F36A 4OVJA 1MXVA 3C32A 3MPLA 1XHYA 5KCJB 4DCYA 1DTZA 4WEDA 5K2YA 2DOJA 2DXRA 4EQ9A 3E9XA 2V3QA 2UYFA 3H4ZA 5ITPA 2RC7A 4KPTA 3K6VA 3MWBA 2VGQA 2NOOA 2RCAA 4IGRA 3LUYA 3JZJA 3H3GA 4DZ1A 3VV5A 3MVWA 1WODA 4G68B 3S9EA 4JWYA 3TQLA 1A8FA 1PEBA 1FW0A 4XIGQ 2DWJA 3G7WA 1NH7A 2NXOA 1MQDA 4RJZA 1Y4CA 4ZS9A 1BKAA 1OVBA 2OLBA 4U23A 3LR1A 1B3HA 5CM6A 5JK4A 2XX7A 2ZXTA 2H99A 3IOTA 1Y1MA 4LATA 3K00A 4OENA 3ILTB 2HEUA 3K1MA 3BBRA 4NF5A 2ESNA 5JEIA 4OXVA 3IB0A 4PFUA 1B46A 2O1MA 1QJMA 4RYAA 4ISUA 3B7DA 3DP8A 2P2AA 3IK6B 4MLVA 2VOZA 4PQJA 4FE8A 2PMSA 5A5XB 4GF8A 3IR1A 3KOSA 4G68C 3U8QA 4YKJA 4DE8A 1NFTA 1HSLA 3TTKA 1VR5A 3SEUA 4F1UA 1JW1A 2O51A 5JTYA 2KLFA 1LB8A 5I57A 2Q89A 2AL5A 3PMWA 3RQTA 4DDDA 1URSA 4LZ8A 1B4HA 5I56A 3O29A 3FVGA 3HHFA 1O7TA 4IY5A 3U1OA 1SDXA 1POY1 4U22A 5ICTA 1B5JA 4H1XA 4NF4B 4QFKA 1B0LA 4LQ5A 2ZYMA 3TMGA 3TTNA 1GR2A 2XXYA 2FYIA 3E3KA 3K01A 3K6WA 4EDPA 1A40A 3IB1A 1OQHA 2V93A 4M1VA 3O6IA 3ZS6A 4FATA 4TOZA 1R6ZA 3P7IA 4ESXA 5HPQA 2F97A 2QL3A 3HO7A 3KG2A 4BDMA 4ZEBA 3EPEA 3RPWA 3OEMA 5M2VA 2H4IA 5I59A 1JVXA 2P0SA 3FJMA 1URDA 1POTA 3RTWB 2ZYNA 3UA8A 1QULA 3D4GA 3Q27A 4O3CA 3T66A 3CVGA 3FXRA 1L5TA 3SEYA 3UP9A 4F1YA 4M4GA 3SDFA 1B32A 2IA4A 4GLIA 1UTHA 3HPIA 4YB5A 3OD7A 3I5OA 4HW8A 3UIFA 2Q88A 2UVGA 1MQHA 3MW0A 3QIMA 2H9BA 3RUMA 3C9HA 2RF1A 1R9QA 4U4SA 2X26A 1IITA 4PP0A 4F3GA 4JB7A 1LCTA 1N04A 5DT6A 4KYDA 4KFQA 2XXHA 1P1NA 4ESWA 1I6QA 4RA1A 2PVUA 3CSGA 3EN3A 3LBSA 4KYSA 3SESA 3GBBA 1B3FA 3MQ9A 3UORA 3FVOA 4H67A 3IOWA 3RTFB 3TKDA 3OO6A 1NNPA 4F19A 1IQ7A 3QUJA 1SW4A 5H8HB 5H8QA 2GFEA 2ZYOA 1Y1ZA 4GIZA 2DE4A 2OJTA 3RN8A 5H8NB 5DVIA 3JV9A 4G8HA 2ONKE 3RT6B 2R6GE 3K6UA 3PU5A 2B3BA 2BJJX 3M3FA 4TLMB 4YMAA 4BDQA 3KGCA 3N5LA 1FQAA 1UIUA 3U92A 1RYXA 2QS3A 4U21A 2Y7KA 1B5IA 4EF2A 1B40A 4R9GA 3VVFA 3ZKLA 4IB2A 1QKAA 3H6VA 5FTHA 4ECFA 1YPNA 3EF7A 2GH9A 3SKPA 5EHSA 4L17A 3T93B 4BDOA 1BIYA 4EXKA 5I2KA 2DE3A 3E13X 4F31B 5H8FA 1NNFA 2O7IA 3PUXE 3T96B 3TELA 1MY3A 2GHBA 4EF1A 4F3BA 3USDA 2RINA 1H43A 2XXVA 4KD5A 3T9HB 2F8DA 1Y3NA 2B65A 3KJTA 2REJA 4N6PA 1Z7NE 3K4UA 1PB8A 4MH5A 4YKIA 1NNKA 3VVDA 5EYFA 3L6HA 4OTEA 5TP9A 1EU8A 1OVTA 2Q9TA 4IO3A 3EHTA 4P11A 4ZEKA 3CSBA 1TXFA 3G3JA 1FTJA 4F1VA 4OFOA 3U94A 5J1DA 3CIJA 3GBAA 4IO4A 1A99A 4NF5B 4BDNA 1XC1A 2O1LA 5K2XA 3N26A 4QRZA 1OMPA 4OZ9A 4F3PA 1NNTA 4ZEDA 3AXFA 4DLDA 4NE4A 4IO5A 4YKKA 3C31A 3K2DA 3DP4A 2O68A 4R73A 1D3KA 3RY3A 3W9VA 1QUKA 1ZMGA 4H8JA 3G3KA 4ELQA 2O84X 3QSLA 3BFUA 3M3LA 2REGA 3DLNA 2ONRA 2Y7PA 3GLBA 3PPPA 1MDP1 4GXAA 1S50A 1LBBA 2NUVA 5JTYB 1FQBA 5I57B 4DXUA 1ZLQA 5I56B 1JW4A 2ZNTA 4R9FA 1B7HA 5F7VA 3N6UA 4ZE9A 1Y20A 2QMWA 3O66A 4QSCA 1QUJA 2VD3A 3KJ7A 4F2OA 1YCJA 3MJNA 3ONMA 3U72A 1PDAA 3UN6A 1Z7ME 1MQGA 2HZKA 4AB6A 2F7AA 1URGA 1SW5A 5IKBA 1BP5A 3IAZA 4YICA 5L9MA 4DCXA 2HXWA 2O6AA 1Q35A 4G77A 3VDFA 4LUBA 1B51A 1ELJA 5CRYA 1P1UA 1MXWA 3T9VA 3R6UA 4FEDA 1UTBA 3K0VA 2NVUB 4NEDA 5I59B 1M5EA 4H0WA 4R2FA 4G4PA 2I58A 3T9UA 1VSOA 3H6WA 4GD5A 4AQ4A 1A7LA 2ZYKA 1YAEA 4TLLB 5CMKA 3LSFB 1FTMA 2X7PA 4PE5B 1UTHB 3QXMA 3KN7A 4GFRA 2ZNUA 2HAVA 1USYH 3IX1A 3MP8A 1JQFA 4HCWA 3FVKA 2B3FA 2XX8A 4XXUA 1O63A 3MZ1A 1IXHA 5BUUA 3O6HA 2UVHA 2ZNSA 4HS7A 2HAUA 2GRVA 3PV0E 3MUQA 4X1BA 2OK2A 3IJOB 1OLCA 4PFYA 4OWDA 4F29A 1D9YA 1AMFA 4U1OA 5KZTA 2DXYA 1IZ1A 4ELRA 3G3FA 3MPKA 1TFAA 5L8DA 3RT8A 4UA8A 3T22A 4E0XA 2ABHA 1MQJA 4JSDA 3OENA 3EHUA 4GL8A 1OLAA 1MQIA 5H8QB 3PPNA 4GOTA 1FTKA 2F5XA 2V3UA 3CG3A 1US4A 3G3GA 4JBZA 1O64A 2DVZA 4GXSB 3TFLA 2UVIA 3PMXA 1UIVA 4NWCA 4HCYA 1KWHA 4O3AA 5DVFA 1XOCA 4RY1A 1F9BA 3QAXA 4LQ2A 4R6HA 4E0WA 2RKMA 4KR5A 1TWYA 4FIMA 4RPNA 4R6KA 2I48A 2PX1A 5FHMA 1RYOA 3IOUA 1IXIA 1XVYA 5I2KB 4Q8RA 2VHAA 1FCKA 3QK6A 2Q2AA 3GXAA 3MVZA 5CC2A 2A5TA 5CBSA 5H8FB 3FIRA 1LCFA 3ILUB 4EXLA 2I6EA 2HQ0A 3ECRA 1T0KA 1JW5A 1QKBA 2DWHA 3OO9A 1LB9A 1MY4A 1BLFA 4OETA 4FORA 1NL5A 2DP8A 1HSJA 3WAEA 2LAOA 3CRBA 5CMMA 2F78A 2WKYA 2OWSA 4DXBA 5AE4A 5TP9B 2R9JA 5BWJA 5TPAA 5FHOA 1NKXA 4GRKA 1FTLA 2XXRA 3H7MA 3ODBA 3C35A 2Z8EA 5I58A 4LVQA 4OERA 1OIBA 2H98A 4EUOA 5DTBA 4POXA 5FTIA 3TYHA 1H3DA 2QRYA 1PC3A 3LSXA 5L9SA 2M8CA 3S9NC 3O9PA 4RNSA 5I2NA 3KSJA 4NF8A 5H8SA 3LSWA 1SW1A 1DPPA 3HN0A 4U2RA 4LA9A 2W7YA 1MDQA 1B58A 4XKQA 4N07A 2DWIA 3O28A 3H6TA 4H8IA 2AYSA 2Z8DA 4I8CA 3S2VA 4Q5TA 2DQVA 1AH5A 5CI5A 2I0CA 3S4UA 1LFHA 3M3KA 3CFLA 2QSXA 4DXCA 1H44A 2ALUA 1LAXA 3O97A 3IJXB 3FJ7A 3Q25A 2ONSA 1N84A 1SYIA 3O6GA 1QW0A 1DPEA 4YB7A 1S7YA 3TCGA 4WXJA 3I6VA 5AA4A 3U93A 5DEXA 3B6QA 5KDTA 3S9MC 4U1ZA 3H6UA 4OFJA 3KBRA 4XKRA 1USYE 3TTLA 3FD3A 4R2BA 2NWJA 1TFDA 3IO4A 3CFZA 4JWOA 3V89B 2V25A 4GQOA 3HV1A 3FXUA 4THIA 1M5CA 4ONYA 4Q30B 1R9LA 1D9VA 5B70A 2UVJA 3PMVA 1DMBA 3HSTA 3VLUA 3CR9A 4PFWA 4ZZAA 5ISUA 4H65A 4IO2A 1SI0A 2Y7IA 1YTVA 2G29A 1UTBB 3SEXA 5ICQA 4F18A 2XXTA 2O69A 2OWTA 1B3EA 2XXIA 3GZGA 5CMBA 5DYHA 3RGYA 4FEBA 1OQGA 3R26A 2VP1A 3PUVE 1XS5A 2GHAA 4RK9A 2XXXA 2THIA 3TPAA 1WDNA 3B6WA 1SQYA 3DM0A 3IOVA 1IEJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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