4O3AA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.80 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3aA02
4KI0E 3O2AA 3L6HA 1XOCA 1B52A 2OK2A 4N6PA 1FCKA 3IL1B 3OENA 1I6QA 1FQDA 3N5LA 3MBPA 1SW2A 2HCAA 3QXMA 3GLBA 1MH4A 5ICQA 3VDFA 1BKAA 3O28A 1D9VA 5CBRA 3TTRA 4LATA 3PPOA 2X7QA 3UGWA 4FE8A 4YKKA 1H45A 2B65A 3T22A 3OXNA 1TT1A 4U1OA 3VLWA 3FJ7A 4U2RA 1BLFA 4IO2A 1NMUA 1POY1 2ZYKA 4FEDA 1SD3A 5LOMA 4GL0A 2IEEA 4JSDA 2ZMBA 4BDOA 5CMCA 4HTGA 1TWYA 4F31B 2OWTA 1QUJA 1P1QA 2I58A 3H7MA 4F2QA 2ABHA 1OIBA 3TELA 1URDA 5JK4A 1N76A 4OFLA 1LAGE 3R7XA 3ZKLA 4KCCA 1SDXA 1I6BA 4OERA 4R75A 2F35A 1MY3A 3H06B 4WXJA 4ZZEA 4KR5A 1B3HA 2KLFA 3W15C 5H8SA 4QFOA 3K6VA 5FHMA 2LAOA 1XVXA 2UVJA 2FA7A 2VHAA 1H76A 2H98A 3RGYA 5I2KA 4Z0IA 4F3BA 4PP0A 3MVXA 2V3UA 3LC8A 1DTZA 1B05A 2QMWA 2R6GE 1FTLA 4R74A 3L6GA 1D3KA 2F5XA 4LONB 3F11A 4NEDA 2Q88A 3K00A 2I3VA 1N3WA 5EHSA 5HBCA 4NF5A 4TOZA 1JETA 2RF1A 1XHYA 3RTFB 4X1DA 5B70A 4YB6A 4OHNA 4ZEDA 4EF2A 3H6VA 3BFTA 3PD8A 3U8QA 1A8EA 5I59B 2ZXTA 2ONRA 2DWHA 3EN3A 5DVIA 3CIJA 2AYSA 4P0GA 1JVYA 4LZ8A 3OOAA 1RYXA 4RXLA 3FXUA 3TEPA 4X48A 2OZZA 1ZKBA 3CFXA 2ZNSA 4H5GA 3ZSFA 3N26A 4GIZA 1MPDA 3RLFE 3IOTA 1PB9A 3SERA 3GXAA 1B3FA 4KYEA 4R9FA 4THIA 4WKMA 2ZYNA 4P0IA 4TLLB 2A5SA 4I62A 4U4XA 3LR1A 5KDTB 1MY2A 3HSTA 3MAMA 4WEDA 2HAVA 4O3CA 3CG1A 4F2OA 5I57B 1IQ7A 1SW4A 5CMMA 3DP8A 3H4ZA 3TCHA 3ODBA 1B51A 2OWSA 1S9TA 1LBCA 3ZS6A 3M3KA 2YLNA 3UIFA 2PVUA 4N13A 3I3VA 4JWXA 3JZJA 2DVZA 4MF3A 5FTHA 1D4NA 2QS3A 1P1WA 3EHSA 5JEIA 1M5DA 3IK6B 5I58B 1VFDA 5AA4B 2QL3A 4QSDA 1IZ1A 4NTLA 3S9NC 3IJXB 3A09A 4F19A 5ITPA 1DMBA 4K3FA 3ILUB 3DM0A 4HW8A 3SETA 3EHTA 1SVXB 1FTOA 2I48A 3MUQA 1ELJA 1YCJA 2AL4A 2ANJA 1MDQA 2DS9A 4DLDA 4Q5TA 4GF8A 4GRKA 2RC8A 1URGA 1ZTYA 3O29A 4MFIA 3S4UA 2F7CA 1CE2A 1MXVA 1WDNA 3PUWE 2Q9TA 2Q8JA 3K1MA 4ZEFA 1LCFA 2QSXA 3TFLA 4H0WA 1M5BA 4JSOA 4LUBA 2OCUA 3T9UA 4EXLA 4XKQA 1F9BA 3KJ7A 4LZ5A 3V89B 5CC2A 2F7AA 4G68B 4ELPA 3O97A 3K6XA 1PEBA 2G29A 3H03A 2XXQA 4WEPA 5TP9B 1LLSA 4ZDMA 3TQWA 4IY6A 2XXXA 3FXRA 1EZ9A 1BP5A 4RJZA 2D5WA 2RCBA 2UVGA 1YTVA 4FATA 1QUKA 5I59A 4OMBA 2F6PA 2GRVA 1QULA 1MQJA 3UA8A 3ECRA 3HV1A 1MRPA 4OQOA 4ZEBA 2O51A 1MQHA 1LB8A 3E4RA 2FYIA 3D4GA 1SI0A 3G3HA 1NNFA 1WODA 5DYHA 4H8JA 2DSFA 1ZIUA 2XXPA 1Y3NA 1LAFE 1B3GA 1MY4A 1QVSA 4NF6B 1OQGA 5CMKA 1JEUA 3FUZA 1I6AA 4DZ1A 4QSCA 3MQ9A 4I8CA 5FTIA 4F1VA 3OELA 2HQ0A 3TTKA 3U94A 3SESA 4I9DA 4N07A 4OFOA 1LFIA 1B9JA 3GZGA 4ZS9A 3QUFA 3H6WA 3T93B 1TXFA 4F1YA 2ZYOA 3THIA 3Q25A 5KDTA 5AA3A 4I1DA 3TDJA 4U1ZA 4ZECA 3W9WA 2XX7A 3CFZA 4JBZA 1ZU0A 3MPLA 4IO3A 1B4HA 1MXWA 2NXOA 3WAEA 4PFTA 3K6UA 1Q35A 4OESA 4FEBA 5I58A 4G2ZA 3TPAA 5AA4A 1CB6A 1S7YA 3TMGA 1FW0A 3G3GA 1PDAA 1VE4A 1ZLQA 4C1UA 1PBQA 1OMPA 4G8HA 1MQIA 1VSOA 2ESNA 2DQVA 3KN3A 2RCAA 4IO4A 2XXVA 4R9GA 3HPIA 3S9EA 2DWJA 4OTEA 3N94A 3IO6A 3IAZA 1BIYA 2XXTA 2GFEA 5DVJA 3PPPA 1O63A 4G8NA 1DPEA 3JV9A 2BJJX 3KGCA 3SEXA 1B5IA 5CI5A 3QIMA 2OJTA 4POWA 2AL5A 5BUUA 1US4A 3PMVA 2Y7PA 3MP8A 2RINA 4G68A 1AOVA 1MDP1 4EDPA 4M1VA 2W7YA 2DXYA 1B4ZA 5A5XB 1PC3A 1B46A 4GXAA 3UN6A 1R1NA 3MVWA 2WKYA 1UIUA 1ANFA 1Y3PA 5TP9A 4ZE9A 3KN8A 4ESWA 3SEUA 4GFRA 3FJGA 4MLVA 1B3EA 2F34A 4YKIA 4MBPA 4XKNA 2XXWA 1NNTA 3KSJA 3PMWA 3EQ1A 1Y1MA 3OO9A 3QSLA 3KOSA 2Z8FA 1A99A 1BTJA 5AA1A 3T9HB 4NMYA 3VVDA 3E9XA 3O9PA 4FIMA 4LVQA 3RT8A 4G8MA 2RKMA 4QFNA 1LAHE 4LP2B 3U92A 3TCFA 1IXIA 2DP8A 4F3PA 1GV8A 4PFUA 2Q89A 4NF6A 5ELVA 1A54A 3SEWA 5L9OA 3O6GA 4DCXA 1MPBA 1IIWA 4ZEIA 1ZJLA 3LBSA 3E13X 1FQEA 3C35A 3S2VA 3P7IA 1N7WA 5IAIA 3B6TA 1H43A 3IB0A 2QPQA 3HN0A 3R26A 1S50A 1FQCA 1TFDA 2RC7A 5F1QA 4NF4B 1M5CA 2PMSA 4HCYA 2Z8EA 4M4GA 4Z7EA 1NNKA 1MXXA 2ZNUA 4DIGA 2E0SA 2NVUB 3I6VA 1NH7A 3SKPA 4OYVA 1UQWA 4F3GA 5AE4A 3C32A 1IEJA 3FGSA 4ESXA 3R6UA 2REJA 3HHGA 1LSTA 1B0HA 4H65A 3CI8A 3SEVA 4P11A 3E3KA 1XVYA 3IORA 1O64A 1QJMA 4QFLA 3TQLA 3ILTB 4UA8A 4KFQA 3PMXA 4YMAA 3PUVE 2Q2CA 3CFLA 1FTJA 4ELOA 2A5TB 3KBRA 3S9MC 4FAJA 4EQ7A 2DWIA 1M5FA 1MM6A 1R6ZA 3AXFA 4F1UA 3B7DA 1YAEA 4EQ9A 4L17A 1VFEA 1DOTA 2I0BA 4XTCQ 2DVCA 1Y4TA 4IO6A 3IX1A 4H6DA 2REGA 2ZYMA 2I4BA 3KFMA 2R9JA 5A5XA 3S9LC 4ZZAA 4G77A 4BDQA 3MP6A 3N6TA 3DELB 3K0VA 3MW0A 4EXKA 4OFJA 2ALUA 2XX8A 3VLUA 5BWJA 1MH3A 2DOJA 3PPNA 2XXUA 3PUXE 1ZBMA 4DE8A 1Y20A 2YPNA 1XT8A 1MM7A 2Z8DA 1EU8A 4G68C 4JWYA 3OEMA 2F6GA 4IY5A 4POXA 1LFHA 3PU5A 3C4MA 1JNFA 1NL5A 5ICTA 4ELQA 3UORA 3RPWA 2PX1A 3G3FA 4NE4A 3EF7A 3H6TA 3ONMA 3FVNA 1P99A 1XC1A 3VVFA 2Y7WA 1IXCA 2H5YA 3W9VA 2Z23A 2B3FA 4BDNA 2GHAA 4XKPA 2XX9A 1I69A 2D21A 4R2FA 3FVGA 3MP1A 2H9BA 4NF4A 3OD7A 2Y7IA 2V93A 3U72A 1EH3A 1IUDA 4OXVA 2CMOA 4GWOA 2F97A 2PT1A 3WAFA 2QMXA 4RK2A 3VVEA 1IXHA 3OO8A 1MQGA 4R6KA 4QRZA 2QS4A 1II5A 4UACA 2VGQA 2V3QA 3VFJA 2H99A 3IR1A 3K1NA 4DXCA 1B6HA 4IGTA 2Z22A 1KWHA 5H8HA 5K2YA 1LCTA 4JXIA 1LGBC 3MC2A 2NUVA 3U1OA 1L5TA 3TAJA 1AIVA 2VP1A 5K2XA 3UP9A 3JYRA 1USYE 4GD5A 2O7UA 5J1DA 3EPEA 1N0TA 2UXAA 1SBPA 2F8DA 1YPNA 2HZKA 1JW5A 5HM4B 2A5TA 4GXSB 1LBBA 2FNCA 1B7ZA 1Z7NE 5FHNA 4XXUA 3VE1B 4C0RA 3SEYA 4DDDA 1N7XA 5AA2D 3G3KA 4LZ7A 5IKBA 2QS2A 1SW5A 4IO5A 1DSNA 3DLNA 5EHMA 2I6EA 2PYYA 3DP4A 3KN7A 3FXQA 1EZPA 1SYIA 2PBWA 1JEVA 3MZ1A 4ISUA 5L8DA 1H3DA 2HAUA 4PFWA 1B1HA 5I2NB 2NOOA 2XXRA 4U4SA 2G93A 1GVCA 1Y3QA 2XD3A 5EYFA 3Q28A 3RNNA 3PUYE 3TYHA 3Q29A 1UIVA 4JWOA 1MQDA 2O6AA 1DTGA 4RNSA 3K6WA 2E1SA 3K1PA 3V8XB 4KPTA 3RT6B 1XS5A 2UYFA 3FVOA 3HCQA 4AQ4A 2UYEA 3CRBA 4YMBA 2H4IA 1N84A 1GGGA 4PE5B 4AB6A 2XXYA 4TLMB 1J1NA 4YICA 3KEIA 1A7LA 3A3CA 1TFAA 2I49A 3CSBA 4FORA 3IOWA 4Q0CA 5AA2A 1B5HA 2ZNTA 4XKRA 4U23A 3G3JA 4KYDA 3MZ9A 5F7VA 3TTLA 4OEVA 3VV5A 1UTHB 3QAXA 3FATA 3UK4A 1HSJA 1PB7A 3TCGA 3MVZA 3C31A 4O3BA 1FTKA 2YJPA 4GLIA 2H25A 2GHBA 4H67A 5ISUA 1SYHA 2Y7RA 3C9HA 3C33A 1Y1ZA 2XD2A 4FJPA 4KHZE 3OO6A 1DPPA 2I4CA 4YAHX 5I56B 3OO7A 4DCYA 3H3GA 5L9MA 4YZZA 4TQUQ 2IA4A 3FJMA 3ZKKA 3KG2A 3OSRA 1QKAA 4LA9A 3T96B 5H8NA 4PETA 1JW4A 2O69A 4GVOA 2XXHA 5JTYA 3M8UA 2QJEA 4F39A 1JVXA 4QHQA 4Q30B 3G7WA 1O7TA 1ZMGA 3O66A 2V84A 2HZLA 2HXWA 3IOUA 3QUJA 2GH9A 3EHUA 3T9VA 2X7PA 5KCJB 2DXRA 1JQFA 1P1OA 4HS7A 5KZTA 1N04A 3HO7A 2I3WA 5I84A 2B3BA 4G4PA 4LQ5A 3O6IA 3T9XB 3TKDA 1WVJA 4R6YA 5I2NA 4ZEKA 2P0SA 4IB2A 1FQAA 1FQFA 5H8FA 4R72A 3TUSA 3OMBA 5H8HB 3PUZE 4BLAA 4RY1A 3PGFA 1B7HA 2F78A 2QRYA 1RKMA 5FHOA 2CZLA 4ONYA 1GTKA 4F3SA 3M3LA 4GOTA 1LAXA 2DE2A 4KD5A 2F7BA 5CMBA 1FTMA 2V3TA 5CBSA 5TPAB 3FZVA 2HEUA 2QS1A 4RPNA 1D9YA 1UTBB 4NF8B 4RK9A 4O3AA 1P1NA 1PBPA 1QUIA 1SQYA 5H8QB 3IOVA 3QK6A 4NWCA 3VXCA 3PV0E 1H44A 4H5FA 3BKIB 4X9TA 1FQBA 1P1UA 4F29A 1B1XA 3PD9A 1UTHA 1Q1KA 1US5A 5DVFA 4DXBA 1OVTA 3OEKA 4GL8A 2UVHA 2RC9A 4RA1A 3QYTA 3V83A 2VD3A 3KOTA 3FV1A 2PT2A 1B2HA 1MXYA 3CG3A 1T0KA 4GQOA 3OSQA 5L9SA 4BDMA 3M3FA 4JB7A 1M5EA 1OVBA 4MH5A 2O84X 2AIXA 3IB1A 3MWBA 4PFYA 1RYOA 1MY1A 3D4CA 5I56A 3BFUA 1B7UA 1MXZA 3CSGA 1EZOA 4ELRA 1NFTA 3TTMA 3TZAA 5TU0A 1MPCA 2DWAA 4QFPA 1LB9A 2O68A 5M2VA 1R9QA 3B6QA 4LQ2A 2UVIA 4EQBA 2O1MA 3O6HA 4U21A 4KQPA 3IB2A 2F36A 4R73A 1LFGA 4YKJA 2X26A 1USYH 1Y4CA 4AB5A 3KSXA 4RYAA 3MPKA 4OWDA 4R6HA 1JW1A 3CVGA 4BDRA 3GBBA 4QSEA 4OZ9A 1IXGA 5DEXB 5AA2B 4OEUA 1QW0A 1SW1A 4ECFA 3TTNA 2ONKE 4OENA 1MS7A 1QKBA 3VLVA 3FV2A 4Q8RA 5KCJA 1AH5A 3LSWA 4H8IA 1ATGA 1SI1A 3C34A 5DT6A 4HCWA 4EUOA 3K2DA 3GBAA 2XXIA 1OLCA 1A8FA 3FD3A 3Q27A 1AMFA 4DXUA 4ND9A 2R71A 3SDFA 2Y84A 4QF9A 2DE3A 5DTBA 3C36A 3FASA 4RPOA 3LSXA 1B0LA 1OQHA 4BDLA 3IJOB 1N3XA 1GR2A 3K4UA 2DE4A 1A55A 3KZGA 4NWDA 1B5JA 4F18A 2O1LA 2OLBA 3FVKA 4F22A 5H8NB 5CRYA 4PQJA 3RN8A 5TPAA 3B6WA 3DP6A 3BBRA 1UTBA 4NF8A 1NH8A 2OBGA 3RTWB 1MY0A 5JTYB 4YB7A 1HSLA 4IO7A 2NWJA 3K01A 4EF1A 5ITOA 3A3UA 5H8QA 4KCDA 4YKPA 4XIGQ 4X1BA 1B58A 4IGRA 3PPQA 3U93A 3MZBA 3I5OA 3RY3A 3N6UA 3LSFB 3MVYA 1URSA 5I2KB 1HSEA 2P1SA 3HHFA 3USDA 1A40A 3PPRA 2V25A 1PB8A 4MLQA 3FIRA 5HPQA 2VOZA 1OLAA 2THIA 1B3LA 3K02A 4FECA 5I57A 3VXBA 2DYXA 4H1XA 1B40A 3TODA 4QFKA 3LSLA 3LUYA 3KJTA 1NKXA 4NF5B 4KYSA 5H8FB 2HFBA 1IITA 4U22A 2M8CA 1VR5A 1AL3A 3RQTA 4YB5A 4E0WA 4C1TA 5B7DA 1Y9UA 4R2BA 1Z7ME 1POTA 3RUMA 1R9LA 1MG1A 2I0CA 3H6UA 3IO4A 3G3IA 4OETA 2D3IA 1MXUA 1B32A 2VD2A 3Q26A 3CR9A 4E0XA 4YU0A 4JDFA 3MJNA 5CM6A 2O7IA 2Y7KA 3T66A 2P2AA 4ZE8A 5DEXA 2Q2AA 2ONSA 3V5AA 2XHDA 4OVJA 1NNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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