4O3BA

Crystal structure of an open/closed glua2 ligand-binding domain dimer at 1.91 a resolution
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3bA02
1USYH 3LBSA 5DEXB 5AA3A 4U23A 4BDOA 4GVOA 1SYIA 4H67A 4LZ5A 1DPEA 4H5FA 1GTKA 3VVFA 1VSOA 1XVXA 3D4GA 1MQIA 2UYEA 3USDA 4YAHX 5ICQA 2A5TB 3TODA 4DXUA 4ONYA 4NF6B 3E13X 1Y4CA 5TP9B 3N6UA 4JWXA 4TQUQ 3G7WA 1OMPA 2X7PA 4QRZA 3KN3A 2OBGA 1B3FA 3IB2A 4G8HA 4I9DA 1SD3A 2Q89A 3RT8A 3TYHA 5A5XB 1CE2A 1SW5A 3BFTA 4NF5A 5CBRA 4QSCA 3KOSA 3G3JA 4FE8A 5H8QA 4MFIA 1PEBA 3QXMA 1B1HA 1DPPA 3LC8A 4WKMA 3U1OA 2ABHA 3OO6A 1QKAA 4OTEA 1B3GA 3BKIB 3KG2A 4P0GA 1MY1A 1LCTA 2QPQA 2F36A 1B6HA 3PUZE 3DP8A 3OELA 4DDDA 4BDMA 1J1NA 2DYXA 3TKDA 3PGFA 1MPBA 1B46A 1HSEA 1NMUA 3H4ZA 3PD9A 3O6IA 1RYOA 1BIYA 3VLVA 4AB6A 2I58A 1VR5A 2E0SA 3CSGA 3FD3A 1H3DA 2Q9TA 4YB5A 2Q2AA 3PPQA 3OO7A 3MVXA 1B3LA 2I0CA 5I2KA 4H6DA 3WAEA 4UA8A 3TCFA 3OMBA 2P2AA 3O66A 4NE4A 5CMMA 3C35A 1Y3QA 2DXRA 2V84A 1Y3NA 4G77A 4G68A 3FVKA 4GQOA 3UIFA 3O28A 4RA1A 5F1QA 4EXLA 3ONMA 1MY4A 2I3VA 5AA2A 1H43A 1VFEA 1EU8A 1MXYA 2V25A 4YB6A 1IXHA 3TAJA 3SETA 4KYSA 4YB7A 3D4CA 4PFTA 4ELPA 2Y84A 4TOZA 5H8FB 2XX8A 3EQ1A 2VOZA 3RLFE 2O6AA 3PU5A 3C31A 3MVZA 1IIWA 2O7UA 3MP8A 3VXBA 5AE4A 4RJZA 1JNFA 2XHDA 3IOUA 4G2ZA 4KYEA 3M3FA 2O69A 3S9MC 2H5YA 3H6UA 1O7TA 2XXWA 3N26A 1N7XA 1POY1 3MC2A 5L9SA 1XOCA 3RPWA 1XHYA 1UIVA 4O3BA 1LBCA 3VV5A 2DWJA 3KBRA 4I1DA 4QFOA 5I56B 3V5AA 4M1VA 2DWIA 3SKPA 5EHSA 1B7UA 5ISUA 3PPOA 1Y4TA 3MQ9A 2ZNSA 4EF1A 4QFNA 4WEPA 1S9TA 5TPAB 2ONSA 1BP5A 1TT1A 5I84A 2REGA 3BFUA 1PC3A 1B4HA 2VD3A 2OJTA 1URSA 1PBQA 3MVWA 1OVBA 2PBWA 4KI0E 1LB9A 3KSXA 2XXPA 4X1BA 4TLMB 3TTNA 4PFWA 3K4UA 4R6HA 1M5EA 4DLDA 1QKBA 2OZZA 2ZMBA 3RY3A 1FQFA 1DTGA 3R26A 1RYXA 4ISUA 4OXVA 4C1TA 3PMWA 4RNSA 3IJXB 2QJEA 3M8UA 1TWYA 4BDQA 4ZZAA 1IEJA 3HSTA 3TMGA 1B05A 2XXYA 1ZKBA 2XD2A 1NH8A 2HAVA 3PUWE 1M5FA 4ZS9A 2R6GE 4GD5A 3PMXA 4H8IA 4JB7A 1B3EA 1ZBMA 1LBBA 1LCFA 4JWYA 5ITOA 2HFBA 2RINA 3MP1A 4YICA 3EHSA 4K3FA 3IB1A 2B3FA 2GH9A 1ELJA 3CG3A 1D9VA 2F97A 1T0KA 4HCYA 1Y20A 5I2NB 2F6PA 5H8SA 3RTFB 3K0VA 5L8DA 2REJA 4ELRA 3O29A 2CMOA 3JYRA 2FYIA 4RXLA 4YKKA 3KJ7A 2O7IA 3GBBA 2DE4A 2XXHA 3K1PA 1XS5A 4OMBA 2ESNA 5HBCA 2D21A 1B1XA 1P1OA 2G93A 3FASA 3ECRA 1HSJA 5I57B 1N84A 2AYSA 2Q8JA 2UYFA 2YJPA 4NTLA 5K2XA 4F31B 3PPRA 1FTOA 3ILUB 4F1YA 3JV9A 4FEBA 4GRKA 3W9VA 1HSLA 1P1QA 1MM7A 3OO8A 4X1DA 3G3HA 2Z22A 3HHGA 4IO6A 4IB2A 5H8QB 3IJOB 2PT1A 4R6KA 1FTJA 5ELVA 2H25A 3QSLA 1MXWA 3N6TA 4H5GA 3K1NA 3IL1B 4MLQA 3H06B 3TTMA 1TFAA 4OEUA 5FHNA 4Q30B 4R72A 2XD3A 1ZMGA 1SW1A 2GRVA 3UA8A 3FGSA 2HCAA 1URDA 5IAIA 5AA4A 3JZJA 4H0WA 2PX1A 3HV1A 5J1DA 3O9PA 5DVFA 3KZGA 1O64A 4IO3A 2F7AA 2O68A 4ZEFA 1B0HA 4U21A 4L17A 1XVYA 3SERA 3GZGA 5I2KB 4BDLA 4ZEDA 1M5DA 1MY2A 4R2BA 4JXIA 1MDP1 3TTLA 4GWOA 5K2YA 5L9MA 3QAXA 4PE5B 1JVXA 3MWBA 2THIA 4RY1A 1Y1MA 4U1OA 3V83A 4R74A 2DS9A 3ZS6A 1MXXA 2QS2A 2B3BA 1LGBC 4E0WA 4HW8A 3FVNA 1NKXA 3TFLA 3C32A 3ZKKA 3V8XB 1Z7NE 3Q27A 3KOTA 1XC1A 3FATA 1EZPA 3UGWA 1B9JA 3G3FA 1N04A 3CRBA 4R75A 2Q88A 4JDFA 4IO2A 4Z7EA 3TZAA 4H65A 2NXOA 2PVUA 3KSJA 4NWDA 3LSWA 4JSDA 1EZOA 4F19A 2PT2A 4N07A 1N3WA 2RC8A 1I6QA 2ZNUA 2F7BA 3FJ7A 3U8QA 4QSEA 4JWOA 4ZEIA 3C4MA 1P1UA 3OOAA 1FQCA 1VFDA 2I4CA 2I0BA 4HCWA 5AA2D 2YLNA 1M5BA 4DCYA 2Z8FA 3O6GA 3FXQA 3EHTA 4MBPA 4X48A 1PB9A 5CC2A 3ODBA 3K2DA 1M5CA 3TQLA 3DP4A 2QSXA 5I59A 2R71A 2G29A 2GHAA 2UVHA 3GBAA 4BLAA 3B6QA 4KYDA 4DXBA 2O1LA 5JTYA 4QSDA 1QW0A 1D9YA 2DWHA 1JW1A 1ZLQA 3RTWB 1B58A 1FTLA 1LAFE 4XKNA 1R1NA 2H9BA 3FXUA 3S2VA 2VD2A 2XXRA 4C1UA 3HPIA 1UTBB 1URGA 3RGYA 2RKMA 1B7ZA 3OO9A 3L6GA 2XXUA 4F3GA 3T9HB 2DQVA 2IA4A 2XXVA 4YU0A 1MM6A 3UORA 2UVGA 1US5A 4BDNA 3OSQA 3FJGA 2QS1A 1LLSA 1NNTA 3TCGA 4R73A 4OFLA 3MJNA 4O3CA 5EYFA 3B7DA 5LOMA 1AL3A 3F11A 4PFYA 4U22A 3QIMA 4LP2B 3KFMA 2NWJA 1Y9UA 5KCJA 5CRYA 2O84X 3H6VA 2Z8DA 1N0TA 1P1NA 1NNFA 3OENA 3KEIA 3PUVE 4ZDMA 1QUJA 2XX7A 3Q28A 4OFJA 1Q35A 2VP1A 1B32A 3KJTA 1WODA 1TXFA 4Q0CA 4N6PA 3B6WA 3H6TA 1LAGE 3R7XA 3MPLA 3K6XA 2NOOA 3H3GA 3WAFA 2XX9A 4KPTA 1MXVA 1B7HA 3TTKA 4QFKA 3C33A 5H8NB 3TDJA 1P1WA 1MS7A 4LONB 3FJMA 2HEUA 4DXCA 4YMBA 4EUOA 3PUYE 4R6YA 3M3KA 3DM0A 1S50A 1FQAA 3PPPA 4EQ7A 4LATA 2AIXA 3C9HA 2A5TA 3S9LC 3OEMA 2Y7PA 4M4GA 3DLNA 4NF6A 1MRPA 4KHZE 3A09A 4ZZEA 1UTHB 3RT6B 3N5LA 2VHAA 3DP6A 2P1SA 2YPNA 1IXIA 2D5WA 4FJPA 1VE4A 1MXUA 5ITPA 2WKYA 3H03A 3SEYA 4DCXA 1IUDA 3T22A 4R9GA 5A5XA 2DSFA 3P7IA 5AA4B 4XKQA 4RPNA 5CM6A 4F3SA 3TEPA 1R9QA 1GGGA 2B65A 4GXAA 1B40A 5DTBA 4PP0A 4EQBA 3CI8A 1SW2A 5B70A 1SI0A 3GXAA 5FTHA 4Q8RA 1LAHE 3VXCA 1YAEA 3OEKA 3TCHA 3THIA 4NF4A 3CFLA 5BWJA 5CMBA 3FV2A 1PDAA 2RCBA 3KN7A 4MH5A 3G3GA 3KN8A 1L5TA 4RK2A 5I58A 3TUSA 4F1VA 5FTIA 3SDFA 3PPNA 3LSXA 1MY0A 1SQYA 1FTKA 1MPDA 3T9UA 3I3VA 3CFXA 3IORA 5ICTA 2O1MA 1ZIUA 2FNCA 1PB8A 2Y7RA 1H44A 1H76A 1B0LA 5B7DA 3FUZA 4ESWA 4GLIA 1F9BA 3QK6A 1ZTYA 4YZZA 1POTA 1FQEA 1DOTA 4ELOA 4WEDA 3MZ1A 3K6UA 1LSTA 4LZ7A 2O51A 1WVJA 4NF5B 1QUKA 3K1MA 4FIMA 4KR5A 3CIJA 2V3UA 1FQBA 2IEEA 3OD7A 4KQPA 4IGRA 2ANJA 1IITA 3ZKLA 1SDXA 1GVCA 1QVSA 1LFIA 4XKPA 3U72A 3UP9A 1IXGA 1JW5A 4YKJA 5KZTA 5TPAA 4R9FA 4G8MA 3IX1A 5CBSA 4NMYA 2FA7A 4AQ4A 4IO7A 1D3KA 4XXUA 3EHUA 2HZLA 3VVDA 2DOJA 1N3XA 4LZ8A 2UXAA 4NF8A 4UACA 4F2QA 4P11A 4KCDA 4U4XA 2Z8EA 4Z0IA 3V89B 1JW4A 3SEXA 4G68B 2W7YA 3VVEA 1UQWA 3S4UA 1FW0A 3RUMA 2V93A 2QS4A 1NNKA 4ESXA 2V3QA 5AA2B 5EHMA 3AXFA 2XXQA 1N76A 2UVJA 3U94A 2F6GA 2RCAA 5FHMA 4GFRA 4OYVA 3OXNA 1B3HA 3RNNA 4U2RA 5BUUA 1PB7A 1A8FA 1I6BA 1USYE 2BJJX 1A55A 1FTMA 3E9XA 4OVJA 1MY3A 1OLCA 1TFDA 2LAOA 1MH4A 1OIBA 4FEDA 4FECA 3E3KA 1AMFA 1ZJLA 3PV0E 4LUBA 5I2NA 2ZXTA 4KFQA 2AL5A 1ATGA 1US4A 4POWA 2R9JA 5JEIA 1N7WA 4F1UA 3I5OA 4RK9A 4C0RA 5I57A 2GHBA 3T66A 2DXYA 4GL0A 4OFOA 4QF9A 2HQ0A 3UK4A 2H98A 4OERA 1B5JA 3N94A 3L6HA 1ANFA 4F18A 2P0SA 2F7CA 5H8HA 4DZ1A 1DMBA 2DVZA 1PBPA 3PD8A 4IY5A 2E1SA 3MZBA 2F8DA 4ZECA 1IZ1A 3FV1A 5CI5A 3GLBA 1MQDA 1QJMA 4YKPA 3EN3A 3U93A 2PMSA 2I48A 2UVIA 3SEVA 4XTCQ 1JQFA 3VFJA 1LFHA 3H6WA 4RYAA 1OLAA 2M8CA 2V3TA 4U4SA 1O63A 4NF4B 3TPAA 3VE1B 3PMVA 4R2FA 2ZYKA 3VDFA 2GFEA 2QS3A 1BLFA 1B52A 2QMWA 2DE2A 3MAMA 1FCKA 3LSFB 5M2VA 3QYTA 3T93B 3K6VA 2DE3A 1NNPA 2DWAA 1B5IA 2OK2A 3T9XB 3IB0A 4GOTA 3SEUA 3A3CA 4BDRA 1MPCA 1RKMA 3CVGA 5I58B 4ELQA 3S9NC 4G68C 1MG1A 3IO4A 1NL5A 2F78A 3H7MA 2VGQA 1YCJA 1I6AA 3CFZA 1S7YA 4OETA 5KDTA 1NH7A 3IO6A 5F7VA 1MH3A 3T9VA 2CZLA 3TELA 4F29A 1OQGA 5DEXA 2Z23A 1LB8A 2F34A 3IOVA 2A5SA 4ZEKA 2AL4A 2OLBA 2KLFA 1Z7ME 3CG1A 5DVJA 1H45A 3A3UA 4IY6A 3FVOA 4XKRA 4LQ2A 3E4RA 4P0IA 1GR2A 2X7QA 1AH5A 2F35A 2DVCA 1KWHA 3MVYA 4YMAA 5CMCA 4JSOA 4Q5TA 2ZNTA 2ZYMA 1BTJA 5TP9A 3TTRA 3Q29A 2H99A 3QUFA 3K6WA 1A40A 3I6VA 3C36A 1SVXB 4HTGA 1MDQA 5AA1A 3MZ9A 4KD5A 1B2HA 4EXKA 2XXXA 3SESA 2I3WA 4RPOA 1SBPA 1OVTA 4NWCA 3MUQA 2RC9A 4ND9A 1IQ7A 3HO7A 4GF8A 2I4BA 3KGCA 3IOTA 3O6HA 3S9EA 3K01A 3B6TA 4NF8B 4PFUA 1A8EA 3R6UA 4FAJA 1B5HA 2HAUA 3MPKA 1JEVA 1YPNA 2Y7IA 3G3IA 3VLWA 4EQ9A 3FZVA 2QRYA 2DP8A 4H8JA 4OESA 3RQTA 4I62A 1AIVA 2ONRA 1UTBA 4PQJA 4DE8A 1A99A 4ECFA 1EZ9A 2OCUA 4EF2A 4LVQA 1YTVA 3HCQA 5HM4B 3K02A 4POXA 1EH3A 4QFLA 3QUJA 4YKIA 4F2OA 1AOVA 4ZE9A 2X26A 5CMKA 4OQOA 1IXCA 1B4ZA 1QULA 3CSBA 3Q25A 1JEUA 4QHQA 1CB6A 2OWSA 1R9LA 4OHNA 4OEVA 3FVGA 2I6EA 1D4NA 4IO4A 4N13A 4MLVA 3OSRA 2ZYNA 3LUYA 3BBRA 3LR1A 4X9TA 4F39A 3ILTB 4JBZA 3ZSFA 1A54A 1LAXA 1SW4A 4F22A 1DTZA 1MQJA 3O2AA 5H8FA 2QMXA 4H1XA 1B51A 3W9WA 2H4IA 2HXWA 3O97A 1R6ZA 2PYYA 4EDPA 5H8NA 3CR9A 3C34A 3PUXE 3SEWA 4TLLB 5I59B 1FQDA 3HN0A 4GXSB 1UIUA 4OZ9A 5JK4A 4FATA 4LA9A 2RF1A 3LSLA 1LFGA 3Q26A 3MBPA 4U1ZA 1JETA 5JTYB 1Q1KA 3UN6A 5DT6A 5H8HB 5I56A 3G3KA 2NUVA 5HPQA 1MXZA 2Q2CA 3FIRA 4G4PA 3IR1A 3FXRA 3MW0A 3IAZA 4AB5A 4PETA 1UTHA 2HZKA 4GL8A 4G8NA 1GV8A 1A7LA 1SI1A 3W15C 1QUIA 4MF3A 3M3LA 3DELB 1JVYA 2Y7WA 4NEDA 4KCCA 1DSNA 4IO5A 3EF7A 4F3PA 3T96B 3MP6A 3RN8A 4E0XA 3U92A 1WDNA 4QFPA 2ONKE 5DYHA 3IK6B 1II5A 1P99A 1OQHA 2XXIA 2OWTA 3TQWA 4GIZA 4FORA 2ALUA 5TU0A 1MQHA 4ZEBA 3EPEA 4THIA 1NFTA 5IKBA 1XT8A 3IOWA 5DVIA 2QL3A 5L9OA 2Y7KA 2I49A 5KCJB 2F5XA 4WXJA 3VLUA 1I69A 4XIGQ 2RC7A 1Y3PA 2ZYOA 5FHOA 2NVUB 4O3AA 4I8CA 4F3BA 4DIGA 4IGTA 1MQGA 1Y1ZA 1BKAA 4HS7A 2XXTA 4OWDA 1ZU0A 4OENA 3K00A 5KDTB 4ZE8A 2D3IA 4LQ5A 3HHFA 1SYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1USYH 3LBSA 5DEXB 5AA3A 4U23A 4BDOA 1FBDA 4GVOA 1SYIA 4H67A 4LZ5A 4P9KA 4PGNA 1DPEA 4H5FA 5T3JA 1GTKA 3VVFA 3ROJA 1VSOA 1XVXA 3MYUA 3D4GA 1MQIA 2CEYA 4MIJA 2UYEA 3USDA 4YAHX 5ICQA 2WBBA 2A5TB 3TODA 4DXUA 4ONYA 4NF6B 3E13X 1IMAA 1Y4CA 5TP9B 3N6UA 1FPBA 4JWXA 4TQUQ 3G7WA 4PFIA 1OMPA 2X7PA 4QRZA 3RYDA 3KN3A 4PF6A 2OBGA 1B3FA 1FBFA 1LBYA 4P56A 1KA1A 3IB2A 4G8HA 4I9DA 1SD3A 2Q89A 2B4MA 4AS4A 3RT8A 3TYHA 5A5XB 4N4UA 4NAPA 1CE2A 1SW5A 3BFTA 4NF5A 5CBRA 4QSCA 3KOSA 3G3JA 4FE8A 5H8QA 4MFIA 1PEBA 3QXMA 1B1HA 1DPPA 2WEFA 3LC8A 4WKMA 3U1OA 1LBZA 2ABHA 3OO6A 1QKAA 4OTEA 1B3GA 3BKIB 3KG2A 4HE1A 4LN5A 4P0GA 1MY1A 1LCTA 2QPQA 2F36A 1NUZA 4NN3A 1B6HA 3B8BA 3PUZE 3DP8A 3OELA 4DDDA 4BDMA 1J1NA 2DYXA 3TKDA 3PGFA 1MPBA 1B46A 1HSEA 1NMUA 3H4ZA 3PD9A 3O6IA 1RYOA 1BIYA 3VLVA 4AB6A 2I58A 1VR5A 2E0SA 3CSGA 3FD3A 1H3DA 2Q9TA 4YB5A 2KR0A 2Q2AA 3PPQA 4PE3A 3OO7A 3MVXA 1B3LA 2I0CA 5I2KA 4H6DA 3WAEA 4UA8A 4PAIA 3TCFA 3OMBA 2P2AA 3O66A 4NE4A 5CMMA 3C35A 1Y3QA 2DXRA 2V84A 2WX9A 1Y3NA 4G77A 4G68A 2XXKA 3FVKA 4GQOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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