4O3BA

Crystal structure of an open/closed glua2 ligand-binding domain dimer at 1.91 a resolution
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3bA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3bA02
3MQ9A 2P1SA 3RTFB 1ANFA 2LAOA 3OOAA 3PUWE 4YB5A 4MF3A 4E0WA 5KCJB 4NF4A 4FEDA 2DQVA 5H8HA 3PUYE 1Y4TA 4DLDA 3IAZA 4R2BA 2XXUA 2H9BA 2I58A 5CRYA 4LQ5A 2Y7RA 4HCYA 2XXTA 4H5FA 2QMWA 4XIGQ 3M3LA 4ZEKA 3IR1A 4RPOA 4OFJA 3PPQA 1XVYA 3PD8A 1B7ZA 3HO7A 3QYTA 1VFDA 4FJPA 4JB7A 3RTWB 5DVIA 3WAEA 1ELJA 3LBSA 1DTGA 2VD2A 1GGGA 3OSQA 2RKMA 1ZU0A 4NF8A 5ICTA 3PMWA 1GV8A 3B7DA 2ALUA 5CMBA 3K6WA 3H6WA 2HFBA 2UYFA 2QJEA 3RT6B 1MS7A 1JEVA 5EHMA 1QKAA 2DXYA 3DM0A 3TODA 3MVWA 2F78A 3N94A 4F3BA 2QS1A 1IUDA 4GWOA 2XD2A 2PMSA 2Y84A 4YKJA 4BDRA 1A8FA 1JW5A 3TCFA 4FE8A 4FECA 2F5XA 3P7IA 2V3QA 4R9FA 3KZGA 1LFGA 1MPCA 1QVSA 1B4ZA 1P1NA 4IY5A 4YB6A 5H8FA 1MH3A 4WKMA 2QS3A 5AE4A 3V5AA 2DE2A 3VLVA 2RC9A 4QF9A 1D3KA 1SYIA 1TT1A 4U4XA 1B5IA 2FA7A 4R74A 4GL0A 3ILUB 3KJ7A 3PPPA 3O9PA 1DPPA 1NFTA 3HHFA 3D4CA 2XD3A 1US5A 1NH7A 3RLFE 3FIRA 4Q30B 1P1QA 2ZYKA 1QULA 1B4HA 1JQFA 1XC1A 4I9DA 1EZPA 3RT8A 1RYXA 4I1DA 3TDJA 2O1MA 3RNNA 5JK4A 3SEYA 4KI0E 3TTRA 3FXUA 1UIUA 3VFJA 5FHOA 1LFHA 3FVNA 4PP0A 4XKRA 4F3SA 1QUKA 2DXRA 4OFLA 1A8EA 3E3KA 3PV0E 1R6ZA 3MAMA 5J1DA 4F1YA 1MY1A 5AA3A 1WVJA 1Z7ME 4G68A 3IJXB 4LP2B 1FW0A 3L6HA 4UA8A 2F7AA 2DWAA 5H8FB 3OMBA 2I6EA 3QUJA 5ITOA 2UYEA 4QFNA 4LA9A 3PUXE 1MPBA 4IB2A 2RC8A 4AB6A 1NNTA 1Y1ZA 3FV2A 3TELA 2O69A 3Q25A 3UK4A 1O7TA 4HTGA 3CFXA 3VDFA 3ZKLA 4RK2A 4ECFA 1FQCA 4H6DA 1B40A 3M3FA 4IO2A 1DOTA 4PFUA 2Q9TA 4NF6A 1A7LA 3H4ZA 3GXAA 4G8HA 2DS9A 1YAEA 3E4RA 1BTJA 3M3KA 3KJTA 4YICA 4LUBA 4GD5A 1ZBMA 4JBZA 2Q89A 2PVUA 4F19A 4R6YA 3PPRA 2X7PA 4LATA 2DWHA 2PX1A 5AA1A 2YLNA 3UGWA 3RN8A 3FUZA 1EZOA 5B7DA 1Y20A 2Q8JA 4JWYA 4DZ1A 1JW4A 3K1NA 4G68B 3LSXA 3TAJA 4H65A 4KYEA 2OJTA 4R73A 3OD7A 2G29A 4G8NA 3K6XA 3DP6A 4DDDA 3C4MA 4H8IA 1OMPA 1SYHA 2Y7IA 3HN0A 3TUSA 4H67A 4OERA 3CIJA 3PUVE 2M8CA 3DP4A 3Q27A 4EQ7A 3K2DA 3OSRA 4DE8A 3LR1A 5K2YA 4OENA 4X1BA 4GXSB 3OO7A 2D3IA 4ZECA 1URGA 1H3DA 2NOOA 4H8JA 3EF7A 1TXFA 4C1UA 5K2XA 2PT2A 1LLSA 4O3AA 3T22A 4BDOA 4DXBA 1B3FA 2F36A 5CI5A 4P0IA 4JSOA 3G3KA 1IQ7A 3FXQA 4TLLB 1IZ1A 2IA4A 4PQJA 2QRYA 1L5TA 5EHSA 1D4NA 1NNFA 5BWJA 3K6VA 1JETA 2XHDA 3DP8A 3TYHA 1MXUA 5I84A 3MP8A 4DXCA 4BDQA 4F29A 1VE4A 1F9BA 2V25A 1MH4A 4NTLA 5TPAA 1LB9A 1UIVA 4GL8A 2I3VA 1D9VA 4ELQA 5CBSA 2R9JA 4N13A 1JW1A 4N6PA 4XTCQ 1VR5A 2I49A 2ONKE 3SEUA 1FQDA 2REGA 4XKNA 3T9XB 3LC8A 4Q5TA 1MY0A 1H43A 3K02A 1XOCA 5I2NA 2DE3A 4X1DA 5HPQA 1RYOA 3IOWA 3L6GA 4DIGA 1NH8A 3H6UA 3PD9A 3EPEA 2UVHA 5L9SA 3I3VA 5AA4B 3D4GA 1PB9A 2XXIA 4MH5A 3QSLA 3VLUA 2DWIA 1BP5A 3W9VA 4X9TA 4I8CA 4M1VA 1JVYA 4IO6A 2XXVA 5F7VA 1SBPA 2X26A 3MP6A 2V93A 2KLFA 1J1NA 2F8DA 2CMOA 3JZJA 5DT6A 3N6UA 4ESWA 3IB1A 2ZMBA 1ZJLA 2P2AA 1MXZA 3KOTA 4P0GA 3DELB 3HPIA 1B05A 1I6BA 1PBQA 2XXQA 3DLNA 4Q0CA 3AXFA 1PEBA 4HW8A 2ZXTA 2XXPA 3C9HA 1IXHA 3V8XB 1BKAA 2XX7A 1LAGE 3Q26A 4ZEBA 2ZNSA 1SW1A 1LGBC 3H6TA 1AL3A 4Q8RA 1EH3A 4F3PA 5CC2A 1ZKBA 5TPAB 4F22A 3K1PA 1TWYA 4FATA 3TTMA 4QFPA 2AL5A 2H5YA 4G68C 4GFRA 3MP1A 5CMMA 4QSCA 5JEIA 1Q35A 4N07A 4YAHX 4ELOA 4GRKA 4R9GA 5I2NB 3KGCA 3O66A 3O97A 1XS5A 3I5OA 1N76A 4YU0A 3TFLA 3QAXA 3T93B 2PYYA 5CM6A 4ISUA 5I57B 4WXJA 3T9UA 4KD5A 3MZ1A 1MDP1 1MY2A 3TKDA 3V83A 4OWDA 1IITA 3LUYA 5CBRA 4QSEA 1IXCA 5HBCA 5CMCA 3N26A 3PU5A 3U1OA 3MJNA 4ZS9A 3ZKKA 4YB7A 3I6VA 2AL4A 4WEPA 1US4A 2DVZA 2D21A 1S7YA 5H8SA 2OLBA 1PBPA 1QKBA 3HSTA 5ISUA 2DVCA 4YKIA 1XHYA 1ZIUA 4R6KA 3CFLA 2BJJX 4POXA 4ZE8A 1N3XA 3FV1A 3OXNA 3UIFA 4PFWA 1MQDA 2DE4A 3CG3A 1S50A 4KYDA 3TCHA 1II5A 2REJA 4ZEDA 4YZZA 1URSA 2HZLA 2ZYNA 3JYRA 1MRPA 3HV1A 1VFEA 3M8UA 5DYHA 1HSEA 4OZ9A 2ZNUA 4NF5A 4OXVA 1MM6A 3C35A 1QUIA 4RA1A 1NNKA 1TFDA 2RCAA 1UTHB 3CSBA 4LZ8A 1GVCA 4MFIA 4F1VA 3LSLA 4GVOA 1MPDA 4THIA 3VLWA 4HS7A 3T9VA 3A3CA 4POWA 4ND9A 4F1UA 5FTHA 3IO6A 1MQGA 4MLVA 3U93A 5DEXA 1B1XA 2RCBA 2VP1A 3SEXA 2O7UA 4OYVA 4RJZA 3GZGA 4MLQA 1EZ9A 1JEUA 1B6HA 4M4GA 4ZDMA 4KCDA 1XVXA 3ONMA 3VXCA 4PFTA 4KYSA 3W9WA 1H44A 4LZ5A 4GXAA 2YPNA 3ODBA 3MPKA 1YCJA 2I4CA 5IKBA 1Y9UA 2F7CA 2XX8A 2HAVA 1USYH 4F2OA 4U4SA 4OESA 3B6WA 2OK2A 3BKIB 3BFTA 4JWXA 2RINA 1VSOA 3C34A 2F97A 2DOJA 3RUMA 3B6QA 4GF8A 2GHBA 4GOTA 3TTKA 3VE1B 4NF5B 1H76A 1ATGA 4QFLA 1FTLA 2XXHA 5I2KA 4QSDA 3O6IA 4RPNA 4NWDA 3RPWA 4H1XA 5KZTA 1R1NA 5DEXB 1B3LA 1DSNA 3UORA 5LOMA 3GLBA 1EU8A 1LAXA 1S9TA 3Q29A 5F1QA 4EXLA 4YMBA 3MC2A 4EF2A 1I6QA 1RKMA 4XKPA 2I4BA 3K0VA 1IXGA 1NL5A 1OVTA 4LVQA 3Q28A 3C31A 3MWBA 2OWTA 1A99A 3B6TA 1OVBA 3KOSA 1SVXB 2E1SA 1FTMA 3PGFA 1LCFA 3H6VA 3ILTB 2XXRA 3G7WA 5BUUA 3N6TA 5AA2A 3O28A 1SQYA 1LAFE 1HSJA 5HM4B 1UTBA 3T9HB 2H4IA 3U94A 2AYSA 5AA4A 4YMAA 3MUQA 5JTYB 4C1TA 1JVXA 2HCAA 1Y3PA 3CSGA 1OIBA 1GR2A 2PBWA 4RNSA 5M2VA 5ITPA 1I69A 3RQTA 3OENA 4NMYA 3IORA 1ZMGA 3IJOB 3IOUA 2A5TB 1O63A 4IGTA 1QJMA 1FCKA 4U1OA 3TMGA 3MBPA 2HAUA 4YKKA 3ECRA 5I2KB 3HHGA 1B3EA 5CMKA 2OWSA 3TPAA 5B70A 1A40A 1LBCA 1AH5A 1FTKA 4BDLA 2I3WA 2Z8EA 3EHTA 2Y7WA 3EQ1A 3F11A 4FORA 4QFOA 3V89B 5TP9A 3THIA 1B5HA 4KR5A 3IOTA 4PE5B 2W7YA 3QXMA 2X7QA 4TQUQ 3RGYA 3C32A 1P99A 1N04A 4H0WA 1KWHA 1M5EA 2Q2CA 2AIXA 4F3GA 1P1UA 2HEUA 3IX1A 3TZAA 2Q88A 1M5CA 2D5WA 5AA2B 1DPEA 3MVZA 4QHQA 1UTBB 1YTVA 2DYXA 2QL3A 1OQGA 4OHNA 2ZYMA 5I57A 1N3WA 3SKPA 3FVGA 1WDNA 1LAHE 1FQFA 1I6AA 2DSFA 1Y3QA 2ABHA 1TFAA 4U21A 1WODA 2ANJA 2DP8A 2GFEA 3FJ7A 4KHZE 3R26A 4IGRA 4RYAA 1XT8A 2DWJA 4XXUA 3C36A 3PPNA 1AIVA 3OO6A 1A54A 4R2FA 4OQOA 3TCGA 4ESXA 4FIMA 2H99A 3FJGA 1N7XA 2UXAA 3IO4A 4BDNA 1MXXA 5H8NA 4TLMB 2UVIA 2H98A 1MG1A 3UA8A 5TP9B 3G3HA 4G8MA 4IY6A 1FTJA 2Y7KA 3KBRA 3LSWA 5FTIA 4ELRA 4Z0IA 3CR9A 1OQHA 3OO8A 1B32A 1B46A 4RXLA 3EHSA 4G2ZA 1R9QA 4R6HA 5L9MA 2HQ0A 2QSXA 1LCTA 3PMXA 2QS4A 2XXYA 1NKXA 2XXWA 1AOVA 1USYE 1Q1KA 4OEVA 3E9XA 1Z7NE 4EUOA 5AA2D 5FHNA 3R6UA 4KFQA 1UTHA 3SEWA 3KG2A 2O84X 2ONRA 3SETA 2OZZA 3IK6B 4EQBA 3G3IA 3LSFB 4OFOA 2Z23A 1B0LA 2FNCA 2ZNTA 4C0RA 1QW0A 1A55A 1SW2A 3S9EA 4G4PA 3GBAA 3IL1B 1Y4CA 1PB8A 1N7WA 1T0KA 4ELPA 4TOZA 3FVKA 2O6AA 4AQ4A 5DTBA 1PB7A 2GRVA 3CFZA 1B5JA 1B51A 1B7HA 5I59B 3C33A 5FHMA 4U2RA 2I48A 1YPNA 2HXWA 4F31B 3EHUA 5H8NB 4E0XA 3KN3A 3SEVA 4NF4B 1PC3A 1SDXA 4OETA 1SI1A 5H8HB 4ZZEA 3SDFA 2O1LA 3TQWA 3FJMA 1SW4A 3O29A 4EDPA 2FYIA 4UACA 4JDFA 3KFMA 1Y3NA 1ZLQA 3G3GA 3SERA 1B3GA 1MQIA 1NNPA 2WKYA 1B58A 2A5SA 3PPOA 4MBPA 5I58A 4QFKA 4KPTA 3W15C 4FAJA 3FD3A 5L8DA 3SESA 4G77A 2I0CA 4EXKA 1B2HA 3UP9A 2Q2AA 1MXWA 3KN7A 4NWCA 3T96B 4OTEA 1BLFA 3U92A 3U8QA 4NF8B 2VGQA 4DCXA 4X48A 3FATA 2O68A 2CZLA 5EYFA 4IO4A 3H3GA 1CE2A 1POY1 3K1MA 2VD3A 4HCWA 5DVJA 3KN8A 3S2VA 1B0HA 3BFUA 4R72A 3H7MA 1O64A 3MVYA 3PMVA 2B65A 1ZTYA 4ZEIA 3VVFA 2R71A 4U1ZA 4NE4A 3K4UA 3H03A 1IXIA 1N84A 3A09A 3FVOA 4KQPA 3IB2A 1IIWA 2F34A 1MDQA 1B9JA 3A3UA 3WAFA 2UVJA 3KEIA 4F2QA 2NUVA 4PETA 3TTNA 4AB5A 2RC7A 1MY3A 5JTYA 1CB6A 3S9NC 1QUJA 5I56A 2A5TA 2F6GA 2F6PA 2V84A 2ZYOA 2XX9A 5I58B 1OLAA 2ESNA 2OBGA 4RY1A 3MW0A 3FZVA 3VVEA 4GLIA 1M5DA 3IOVA 3UN6A 3TTLA 4U22A 4LONB 1D9YA 5KDTA 3O6HA 1MM7A 4QRZA 3K01A 1MY4A 2Y7PA 3GBBA 3OEKA 2B3BA 3ZSFA 2G93A 2F35A 4L17A 3G3FA 3O2AA 3S4UA 3T66A 1N0TA 3KSJA 1GTKA 2E0SA 1UQWA 4ZEFA 1PDAA 1URDA 5H8QA 1P1OA 2GH9A 1LB8A 3TQLA 4GQOA 1LBBA 1OLCA 2NVUB 2O51A 5A5XA 3FXRA 3CVGA 1M5FA 4ZE9A 4FEBA 1DTZA 1DMBA 4JSDA 3ZS6A 3CI8A 2QPQA 4WEDA 1AMFA 3N5LA 1B52A 2O7IA 4Z7EA 3VVDA 1H45A 1SD3A 3PUZE 1IEJA 3TEPA 1HSLA 4R75A 4BLAA 2VOZA 1FQBA 1Y1MA 3BBRA 3JV9A 2B3FA 1BIYA 5I56B 3G3JA 1FTOA 5L9OA 3FASA 3MZBA 2GHAA 4ZZAA 5ELVA 3R7XA 2H25A 3HCQA 3MZ9A 2Z22A 3S9LC 4IO5A 2V3TA 5TU0A 5ICQA 2YJPA 3K6UA 3VXBA 4F39A 1P1WA 1LFIA 3OELA 5KDTB 1SI0A 2RF1A 3QUFA 1B7UA 3CG1A 2PT1A 2Z8FA 4LQ2A 4NF6B 4JXIA 2QS2A 4F18A 1MXYA 2P0SA 5KCJA 4O3CA 3U72A 4DCYA 3MVXA 3OEMA 2VHAA 5H8QB 1B1HA 3USDA 2Z8DA 3K00A 2ONSA 4IO3A 4U23A 4BDMA 2NWJA 1POTA 5A5XB 4DXUA 1R9LA 1MXVA 1LSTA 2IEEA 4OEUA 4I62A 5IAIA 1MQHA 3IB0A 2OCUA 1MQJA 2THIA 3S9MC 3O6GA 4OVJA 3KSXA 3QK6A 4EF1A 2QMXA 4XKQA 1B3HA 3QIMA 1NMUA 3EN3A 3MPLA 1FQAA 4K3FA 2F7BA 2NXOA 3H06B 4H5GA 2UVGA 4RK9A 4PFYA 4O3BA 2R6GE 1SW5A 3FGSA 4OMBA 2XXXA 2I0BA 3E13X 4KCCA 5DVFA 4ONYA 4P11A 4YKPA 4EQ9A 1JNFA 3OO9A 3CRBA 1M5BA 5I59A 4JWOA 2V3UA 3RY3A 4IO7A 3VV5A 1FQEA 2HZKA 4GIZA 4NEDA 4LZ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DI4B 3MQ9A 2P1SA 3RTFB 1ANFA 2LAOA 3OOAA 4O7IA 3PUWE 4YB5A 3CHGA 1FBFA 4MF3A 4E0WA 4NF4A 5KCJB 4FEDA 2DQVA 4OVTA 5H8HA 3PUYE 4N81A 5J16A 1Y4TA 3EKIA 4DLDA 3IAZA 4R2BA 2XXUA 2H9BA 2I58A 5CRYA 4LQ5A 2L5VA 2Y7RA 4GX4A 4MNCA 1NV2A 4HCYA 2XXTA 4H5FA 2QMWA 4XIGQ 3M3LA 4ZEKA 4X04A 3IR1A 4RPOA 1FBEA 4OFJA 3PPQA 1XVYA 3PD8A 1B7ZA 3HO7A 2CZHA 3QYTA 4PDDA 1VFDA 4FJPA 4JB7A 3RTWB 5DVIA 3WAEA 1ELJA 3LBSA 1DTGA 2VD2A 1GGGA 1FPKA 3OSQA 2RKMA 3IFAA 1ZU0A 4NF8A 5ICTA 3PMWA 1GV8A 3B7DA 2ALUA 5CMBA 3K6WA 3H6WA 2HFBA 2UYFA 2QJEA 5ESYA 1DBZA 3RT6B 1MS7A 1JEVA 5EHMA 1QKAA 2DXYA 3DM0A 5A5LA 3TODA 3MVWA 2OX3A 2F78A 3N94A 4F3BA 2QS1A 1IUDA 4GWOA 1IMDA 2XD2A 3U65A 2PMSA 2XA5A 2Y84A 4YKJA 4BDRA 1A8FA 1JW5A 4PFBA 3TCFA 4FE8A 4GWZA 4FECA 2F5XA 4OVSA 3P7IA 2V3QA 4R9FA 3BIGA 3KZGA 1LFGA 1MPCA 1QVSA 2P3VA 1B4ZA 1P1NA 4IY5A 4YB6A 4N15A 5H8FA 1MH3A 4WKMA 2QS3A 5AE4A 3V5AA 2DE2A 3VLVA 2RC9A 2XWKA 4QF9A 4P47A 1D3KA 1SYIA 4U4XA 1TT1A 2CZIA 1B5IA 4MEVA 2FA7A 1FPFA 4R74A 4GL0A 3ILUB 3KJ7A 3PPPA 1FPGA 3O9PA 1NV5A 1DPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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