3KJ7A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with dextrin at 1.9 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Specific interactions of C-terminal half (C-lobe) of lactoferrin protein with edible sugars: binding and structural studies with implications on diabetes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A02
3KFMA 3O6IA 4JSOA 1GV8A 5H8NA 4F31B 1XVYA 5L9OA 3S2VA 2DS9A 4H8JA 2QPQA 3Q25A 4RA1A 2I3VA 1T0KA 5I57B 3QAXA 1USYH 1IITA 3C35A 3KN3A 5I59A 4QSEA 3TZAA 4DE8A 1MPDA 2ZYNA 3K1NA 1JW4A 3MWBA 5EHMA 2REJA 2YLNA 1I6AA 3FVGA 5ITOA 3FJGA 1B7HA 1HSLA 1SW5A 4JBZA 2NWJA 4R73A 5I84A 1N76A 4FJPA 2NVUB 4HTGA 5CC2A 3TELA 2ESNA 4IY6A 3DP6A 3PPRA 1SBPA 3QXMA 1DPPA 5KZTA 3U92A 1Y20A 3SEYA 3S9NC 2UYEA 2WKYA 1N7XA 1B3FA 4GL8A 4RY1A 5TP9A 4QFOA 1UIVA 3JV9A 2XXVA 1IEJA 1YPNA 3FV2A 3FD3A 1B7UA 3LSWA 4JWOA 1B5JA 5IKBA 3EPEA 3K01A 1JETA 4KQPA 2XD2A 3TQWA 1AH5A 4AB5A 3LSXA 1QJMA 1FQEA 1LBCA 4U1OA 2XXHA 4U2RA 5LOMA 3RY3A 4ND9A 2XHDA 3PD9A 2UVGA 1YCJA 3CSBA 2QS1A 3IK6B 4HCWA 3TCGA 3UGWA 3FXQA 3TTNA 3W9VA 4YAHX 4NE4A 3HO7A 1RYXA 1WDNA 3C31A 1EZ9A 2OWSA 3IJXB 4ELPA 5CM6A 3I6VA 4H5FA 2O84X 4OETA 1QKBA 1H43A 1II5A 1OMPA 1LSTA 1VR5A 3MPLA 3UP9A 4DXCA 1AIVA 1XHYA 2HEUA 3P7IA 3W15C 3ZKKA 1UIUA 2ONKE 4DLDA 4BDLA 4AQ4A 4OESA 3CFLA 3LC8A 3RQTA 4BDNA 2D3IA 2ZYOA 1N7WA 4KFQA 3KJTA 4LVQA 4OTEA 5FHOA 3EQ1A 3LSFB 4NMYA 4FECA 3FATA 3LUYA 3PMVA 3KN8A 1XT8A 5JTYB 1R1NA 3T66A 3CSGA 2Y7PA 1TFDA 3G3KA 3B6WA 1O63A 1MXWA 1J1NA 2GHBA 5CMCA 1OIBA 3KSXA 3VLUA 5KDTB 1H44A 4XKQA 2A5TA 2OK2A 3IL1B 1MQHA 2XXUA 3FXRA 3VXCA 1LGBC 1MY4A 2I0BA 2LAOA 4QFNA 2O6AA 2Q2CA 4KPTA 4H65A 4YU0A 2F6GA 3FASA 1BTJA 3C34A 3CVGA 5KCJA 3H4ZA 4ESXA 5DVFA 3S9LC 3IOVA 4JWYA 4HS7A 1LCFA 3PUWE 4X9TA 3T9HB 4EQ7A 5B70A 1MXZA 4NF8B 4FIMA 4OZ9A 3O66A 1SYIA 4OFLA 2DWJA 4ZECA 1B4HA 3THIA 2Z23A 1PB7A 5BWJA 4LZ8A 1SW4A 2DSFA 1GR2A 3GBAA 3M3LA 3MUQA 1S7YA 4U4XA 1NNFA 3PU5A 1O64A 1O7TA 2A5TB 1URDA 1SW2A 3KSJA 1IXIA 3PV0E 4IO4A 5TU0A 3T9VA 3VLVA 1N84A 5AA1A 3V8XB 1MPCA 5DVIA 5JK4A 1JW1A 3MP6A 3T9UA 4FEBA 1MH3A 2HCAA 1BLFA 2R9JA 3MP8A 1Y1MA 2AYSA 4PFUA 1LAXA 1OLAA 3TCHA 1LCTA 2HFBA 3N5LA 3MVXA 4NEDA 1TWYA 1FQFA 4OENA 2OCUA 4OXVA 3FZVA 1SYHA 1M5CA 2B3FA 1MS7A 4GIZA 4PP0A 4LZ7A 4N6PA 4ZEKA 4OVJA 1A55A 2I48A 2Y7IA 3S4UA 4GFRA 2RINA 2XD3A 3IO4A 3QYTA 4X1DA 1Y1ZA 1MDP1 5FTIA 5I58A 3MZBA 1MQIA 2Z22A 4GL0A 2UXAA 4XKPA 4EDPA 4QFPA 1S50A 5TP9B 2QMXA 1LAGE 3CFXA 3Q29A 1QULA 1SD3A 2I3WA 4EF1A 4ECFA 1DTGA 3VE1B 1PB9A 4G68B 1IXHA 2RC8A 4MLQA 4DIGA 2FNCA 1WVJA 3DLNA 3HSTA 4MF3A 4PETA 3T22A 2PT2A 1D9VA 3IB2A 1P1WA 2AL5A 3RT8A 3JYRA 1FTOA 2FA7A 2XXYA 3HHGA 3A3UA 3E9XA 3H03A 4JXIA 2KLFA 2AIXA 2V25A 4YMAA 4F1YA 3O29A 2PVUA 1B46A 2VHAA 2OJTA 3TAJA 3K4UA 5AA2A 4BDMA 3EHSA 3E13X 3I3VA 1B7ZA 2IEEA 3O97A 3PPNA 1MH4A 2FYIA 3H3GA 2DE2A 1A40A 3H6UA 3PUXE 5HM4B 2IA4A 3GZGA 3QSLA 4G4PA 4I9DA 3VFJA 4THIA 4IGTA 5CRYA 1M5FA 1MM6A 1YAEA 2I6EA 3ZS6A 3PPPA 2OZZA 1B3HA 1MY0A 2RKMA 3MZ9A 1Q35A 3TODA 3RTFB 4C1TA 4EF2A 1FQAA 1UQWA 4U22A 5K2YA 1AMFA 3SEWA 1ZMGA 4OHNA 4FAJA 1UTHA 3FVNA 5AA4B 5ICQA 4C0RA 3V83A 5H8FB 5H8QA 1B3EA 3O9PA 1OLCA 3K0VA 3GLBA 3K1PA 4H1XA 3BFUA 4O3BA 4POXA 4TOZA 1PB8A 1PC3A 3KG2A 2ONRA 3UORA 4DDDA 3EHTA 3KZGA 2Z8DA 4F3GA 3SKPA 4FORA 5AA2D 3TTMA 1SQYA 1MQGA 2O7IA 2ZNSA 3KOTA 3L6HA 4G8MA 4PFWA 1N0TA 2R6GE 3G7WA 4JSDA 4ZEIA 3R26A 2DE3A 2YJPA 2D21A 3UA8A 1LAHE 1XC1A 4H6DA 3MW0A 1IXCA 1B5HA 4DCXA 3K6WA 4LATA 1TT1A 2ZNTA 1Z7ME 3C32A 4UA8A 3TCFA 2F8DA 3OSQA 3PUZE 2ABHA 5H8FA 4G2ZA 3LR1A 4R2FA 4XXUA 3RUMA 3FXUA 4MH5A 5ISUA 2O68A 2F7AA 2DWAA 3OELA 4RK2A 4U21A 1MDQA 1B32A 1FQCA 5BUUA 4RXLA 4EQBA 1MQDA 4PFTA 1ZTYA 4RPNA 5CI5A 1HSJA 5CMBA 1ZLQA 3TFLA 2DVCA 3TPAA 4E0XA 3B7DA 2XXPA 3MPKA 4EQ9A 4ZEDA 3PD8A 4O3AA 2QSXA 4H5GA 3MP1A 3RPWA 3IX1A 4YB6A 2H25A 1LLSA 4KCCA 3G3FA 3VLWA 5J1DA 4Z7EA 4PQJA 4ZS9A 3PGFA 1I6BA 2XXTA 1ZKBA 5FTHA 2XXWA 1B1HA 1PEBA 3OOAA 3OO7A 4LONB 3KBRA 3BBRA 3MVZA 4X1BA 2RCAA 3TEPA 4FE8A 2Q2AA 4M1VA 1POY1 4KR5A 4NF5A 4OEUA 4Q30B 3MQ9A 3N6UA 3SERA 4H0WA 3FJMA 4IGRA 1B58A 3FGSA 4KYEA 4NTLA 2V84A 4ZE8A 4JWXA 3WAFA 5L9SA 3OO8A 2QS3A 1JVXA 4MFIA 4N13A 4PE5B 3ZKLA 1M5DA 5CBRA 1LBBA 3RN8A 3ODBA 4KYDA 4TQUQ 4WXJA 4H67A 3CG1A 3GBBA 1DSNA 4GXAA 3U94A 4F3SA 4HW8A 4IB2A 1B9JA 3VDFA 3FJ7A 4OMBA 5B7DA 4OQOA 3GXAA 4R75A 3HV1A 2I49A 3OD7A 3HHFA 5I2KA 2RCBA 5I56B 3BFTA 3QK6A 4G8NA 4GRKA 4RJZA 3C33A 1Y9UA 4E0WA 4NF5B 1XS5A 1IXGA 2OBGA 2AL4A 4GLIA 2ZMBA 2ZYKA 5DT6A 3TMGA 2P1SA 4R74A 1FQDA 2HAVA 1BP5A 3S9MC 3QUFA 2Q8JA 3ILTB 4YZZA 4Q0CA 1D9YA 1R9QA 5KDTA 5ICTA 2ALUA 2R71A 3A09A 3Q28A 1NNTA 5K2XA 1RYOA 1PBQA 4QRZA 1CE2A 1M5EA 1NMUA 3CG3A 3K1MA 3E4RA 4GQOA 1ZJLA 1JW5A 3U1OA 1MY3A 4ELRA 5I58B 5EYFA 5I56A 1OQGA 4H8IA 2ANJA 3BKIB 1XOCA 2QL3A 4KD5A 2THIA 2Q89A 2XXRA 5DTBA 3IOTA 3PMWA 2PYYA 3OO6A 4KYSA 1BIYA 1B0HA 4IO2A 3UIFA 4KI0E 2GRVA 1A7LA 1BKAA 2Z8FA 3V5AA 1FTKA 1B05A 3V89B 3M3KA 3E3KA 3PUVE 2BJJX 4R9FA 3IB1A 2DWIA 1B51A 1DMBA 1H3DA 1QKAA 2X26A 3FV1A 3DP8A 1DOTA 3N26A 4LA9A 4LQ5A 5L9MA 5JEIA 2H98A 3T9XB 2XXXA 4X48A 3R6UA 3OXNA 2HZLA 3CFZA 1CB6A 1LB8A 2G93A 2I58A 4OYVA 5CBSA 1ATGA 1FTJA 1Y3QA 3B6TA 4P0IA 2VP1A 1MM7A 3OO9A 3U93A 3VVFA 2H99A 4QSDA 4M4GA 4O3CA 4F1UA 1R9LA 1UTBA 3FUZA 2PX1A 1LFGA 1QW0A 4YKPA 1P99A 1B2HA 4JB7A 4NF6B 2DYXA 5I57A 4QSCA 2NUVA 4AB6A 4Q8RA 1POTA 2DXYA 2I0CA 3H7MA 1KWHA 1N04A 2RC9A 1OVTA 4R72A 3H06B 2VD3A 1TFAA 1B4ZA 4ISUA 2HXWA 3L6GA 4QF9A 2VGQA 4NF8A 2H5YA 3MBPA 5TPAB 3O6GA 5H8QB 3HPIA 5HBCA 3KJ7A 3SDFA 3R7XA 2DE4A 4ZE9A 3SEXA 3CIJA 3IB0A 3MZ1A 4G68A 2VD2A 3RTWB 3IORA 4GOTA 5CMMA 1SW1A 1VFDA 4P11A 1S9TA 2UVJA 3IOWA 3Q27A 4BDRA 3T93B 4GVOA 2CMOA 2REGA 3EN3A 3OSRA 4NWCA 4OWDA 1IIWA 1D4NA 3W9WA 3KN7A 4F19A 3MC2A 4EXKA 3PPOA 2VOZA 1B6HA 4EUOA 3EF7A 4YB5A 1P1NA 4R6KA 2OWTA 3FVKA 2CZLA 4XKRA 5H8SA 3TTLA 4NF4A 1EZOA 4XTCQ 1USYE 1OVBA 1R6ZA 4R9GA 4OFJA 4NWDA 2GFEA 4I62A 4WKMA 3PUYE 3FVOA 2O1LA 3LBSA 3MAMA 1P1UA 3JZJA 3UN6A 4ZEFA 3KOSA 3C36A 2Q9TA 2X7QA 4RYAA 1LAFE 3SEVA 2DP8A 3TTRA 4DZ1A 4WEDA 1WODA 3B6QA 3K00A 2UVIA 3IJOB 4F39A 5AA3A 1H45A 5DEXA 1I69A 1MY2A 3ECRA 2XX7A 3K2DA 4G8HA 3TTKA 2Q88A 4IO5A 3IR1A 4KCDA 2G29A 1MQJA 3IOUA 1ZIUA 5F1QA 1L5TA 5EHSA 2XX9A 3C9HA 4U4SA 5AA2B 5JTYA 1GGGA 2HAUA 1LB9A 3CRBA 2A5SA 2F36A 1I6QA 3O2AA 1A8FA 4YKIA 3F11A 1DPEA 3SESA 2F5XA 1JQFA 1LFIA 2ZYMA 1QUKA 2XX8A 3M3FA 4LUBA 4ZEBA 4TLLB 2I4BA 3G3GA 4IY5A 3A3CA 2GHAA 1MXYA 2Y7RA 5DYHA 4OERA 3RLFE 4BDOA 4DCYA 5I2NB 4JDFA 3WAEA 1AL3A 3OEKA 3OMBA 4FATA 3EHUA 3K6XA 4N07A 4TLMB 4ZZEA 4ZZAA 2P0SA 4FEDA 1UTHB 1MPBA 5KCJB 2W7YA 1A8EA 1P1QA 2V93A 3DELB 4GWOA 1SDXA 3UK4A 1LFHA 2B3BA 1FCKA 1VFEA 3C4MA 2O69A 3U8QA 2QS2A 3FIRA 2H4IA 4IO3A 3TYHA 3PMXA 2ONSA 2V3QA 1ZBMA 4KHZE 4YB7A 5FHMA 1A99A 4YMBA 4XIGQ 1AOVA 3D4GA 4RNSA 4F2OA 4C1UA 4Z0IA 2F6PA 5IAIA 2ZNUA 4ESWA 2E1SA 1XVXA 1ANFA 4EXLA 3O28A 4WEPA 5ELVA 1SI0A 1SI1A 4F18A 5A5XA 4K3FA 1MXVA 5FHNA 3QUJA 5DEXB 4GD5A 4F1VA 2DXRA 2F34A 1B0LA 4R2BA 1RKMA 3TKDA 5I59B 2F78A 1OQHA 2XXIA 3MJNA 4I1DA 3USDA 3K6VA 4LQ2A 1Q1KA 1US5A 3H6TA 3DP4A 4OEVA 2RC7A 4L17A 4XKNA 2PMSA 2F97A 3QIMA 4F29A 1B1XA 1GTKA 3N6TA 1NL5A 4IO7A 3G3JA 1JEVA 4P0GA 2O1MA 3VV5A 2F7CA 3HN0A 5F7VA 1Z7NE 4F3BA 2Y7WA 3VXBA 4LP2B 3RT6B 3SEUA 5I2NA 5AE4A 2M8CA 1FQBA 2QJEA 2P2AA 1Y4CA 2QRYA 3G3IA 4G68C 4U1ZA 3T96B 3G3HA 2QS4A 3PPQA 3H6WA 4MLVA 3Q26A 4ELQA 3RNNA 3KEIA 1ZU0A 2NXOA 1QVSA 1TXFA 3H6VA 3VVDA 2UYFA 1GVCA 2HZKA 1FW0A 3K02A 4DXUA 2Y84A 5ITPA 1IUDA 1URSA 1NKXA 2DVZA 3TUSA 2F35A 4U23A 2UVHA 4PFYA 2Y7KA 1EU8A 3TDJA 3ZSFA 4ELOA 1M5BA 1URGA 1VSOA 4RK9A 4MBPA 2E0SA 1B3LA 4F2QA 5H8HB 4BLAA 1NNKA 3SETA 1Y4TA 3HCQA 5I2KB 2DQVA 1FTLA 5H8NB 3IO6A 1PBPA 2HQ0A 3I5OA 1EH3A 1H76A 5L8DA 3CR9A 1PDAA 2QMWA 4HCYA 1IQ7A 4QFLA 5A5XB 3MVYA 3OEMA 1MY1A 4QHQA 2PT1A 2PBWA 3IAZA 4OFOA 2DWHA 5AA4A 4ZDMA 1IZ1A 1JVYA 1SVXB 2OLBA 2V3UA 1JEUA 1NH7A 1FTMA 1YTVA 2NOOA 2ZXTA 3DM0A 3M8UA 4LZ5A 2F7BA 4QFKA 4YKKA 1MXUA 1UTBB 3KGCA 4BDQA 5CMKA 3CI8A 3RGYA 1NFTA 4NF6A 4Q5TA 1N3WA 1P1OA 4I8CA 5TPAA 1EZPA 4R6HA 1B3GA 5M2VA 1US4A 4DXBA 1B40A 4UACA 4POWA 3D4CA 3U72A 2I4CA 4YICA 2Z8EA 4IO6A 4ONYA 2H9BA 1DTZA 1NH8A 1QUJA 1B5IA 2V3TA 4F22A 1A54A 1D3KA 1MRPA 1Y3NA 1Y3PA 2O51A 2XXQA 3ILUB 3N94A 3LSLA 3OENA 3ONMA 1JNFA 3MVWA 5DVJA 2GH9A 5HPQA 4F3PA 1VE4A 3K6UA 1B52A 1MG1A 1MXXA 2DOJA 4GXSB 4YKJA 3S9EA 1HSEA 2X7PA 1F9BA 2YPNA 3O6HA 4GF8A 4RPOA 3VVEA 4R6YA 1NNPA 1N3XA 1QUIA 2B65A 2O7UA 5H8HA 4G77A 2RF1A 3TQLA 3AXFA 2D5WA 4NF4B 1ELJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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