3KJ7A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with dextrin at 1.9 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Specific interactions of C-terminal half (C-lobe) of lactoferrin protein with edible sugars: binding and structural studies with implications on diabetes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A02
3OMBA 3HHFA 5H8HB 1FTKA 2DXRA 4PQJA 1SDXA 2HZKA 4OFOA 2ONRA 4KYEA 2Q8JA 4RNSA 1H44A 4NWDA 1Q1KA 5DYHA 1LAGE 5EHMA 3W9VA 2Z23A 4F18A 4X48A 2Q88A 2QS2A 3FIRA 1IXHA 4X9TA 3O6GA 3UIFA 4QHQA 5H8HA 5CBSA 4TOZA 1FQFA 1H76A 3B6WA 5JEIA 1FTJA 1LGBC 3K6XA 1NH8A 1URSA 3PUXE 3GBAA 3OXNA 4Q5TA 2H5YA 2D3IA 2XX8A 4WKMA 4U4SA 4H5FA 1LB9A 2FYIA 4G77A 1NNTA 1GV8A 3LSWA 3IJOB 3QSLA 3K6UA 5FHMA 4FE8A 1JW5A 3ODBA 2I3WA 1MG1A 1LB8A 2YPNA 1GR2A 1T0KA 1XOCA 2REGA 1MXZA 5AA4B 3N5LA 2O7IA 1MQIA 2ZXTA 1WDNA 2VHAA 4OHNA 4BDRA 4MLQA 4NTLA 4ZE9A 3PPOA 4YB7A 4R74A 3SKPA 4N07A 4ELOA 1POTA 4O3AA 3KOTA 4FEBA 3IB1A 1ZLQA 1US5A 4QSCA 4WEPA 4EF2A 4RPOA 3UK4A 2E0SA 4GXAA 1MXWA 3RUMA 2OWSA 1Q35A 2PMSA 4LUBA 4OQOA 1OLAA 3I5OA 2F6PA 4GRKA 3SDFA 2F78A 3MQ9A 4ZDMA 3G3GA 2XXWA 2ALUA 4MF3A 4LP2B 3O97A 1RYOA 4OYVA 1A99A 5M2VA 5TU0A 1B2HA 4ZEDA 3GLBA 4RYAA 1ZIUA 3OO6A 1R9LA 1XS5A 3QIMA 1PB7A 3OD7A 4PETA 2VGQA 1B5IA 1FTOA 2QS1A 5HBCA 1B9JA 4DXUA 1P1NA 3T96B 3IB2A 3SEWA 1Y1MA 1S7YA 2I48A 5H8QA 1RKMA 4Q30B 1B7HA 3IX1A 3DP4A 2Y7PA 2F6GA 2H25A 3JV9A 1NMUA 4ZECA 1IXCA 3OSRA 2PVUA 2I0CA 4K3FA 5CMKA 4NF8A 2AYSA 3Q29A 4IO7A 1Y4CA 3FZVA 1ZTYA 1N76A 4M1VA 1M5BA 4JBZA 4U21A 4F1VA 5CRYA 5KCJB 3IK6B 5F1QA 2DSFA 4F29A 3S9MC 3MVXA 4OFLA 3CI8A 4U23A 1YCJA 1DPPA 1LLSA 4IO4A 4XKPA 1B3LA 4WEDA 1IXGA 2BJJX 3VV5A 1N04A 4KCCA 3K1PA 1MXVA 3MZ9A 2XXQA 4ZEIA 2ZYMA 3O28A 3MPLA 2RF1A 3LC8A 3HPIA 4U2RA 3TTRA 1P99A 3S9NC 4JWXA 5KCJA 1AH5A 2YLNA 3Q28A 3G3FA 3TQLA 4EXLA 1Z7NE 2XXRA 1BLFA 3PPQA 4F1YA 3FVOA 1FQCA 4NF6A 2A5SA 1OQGA 1Y3QA 4YB5A 5K2XA 4FJPA 3S9LC 3D4CA 1FQDA 2F8DA 1QJMA 4ELRA 1MS7A 4RY1A 1US4A 3OO9A 4NF5B 1B3EA 5H8FB 1IEJA 1DTGA 2V3TA 2QPQA 1B7ZA 3M3FA 2NUVA 4GXSB 1FQBA 3RLFE 3N94A 4MFIA 3C4MA 3VXCA 3PD8A 1IUDA 2DOJA 1SYIA 1TFAA 3IAZA 1B5JA 1JVXA 5I57B 4NF5A 3RTFB 2QMXA 2XX7A 3T22A 4RJZA 1SVXB 1NNPA 4YMBA 1JQFA 1ZMGA 2XXXA 3VVDA 4NWCA 1BIYA 2Y7RA 2DWAA 1QUIA 3UORA 1B46A 1NH7A 2HEUA 3MZBA 3OEKA 3H03A 3I6VA 4YZZA 3E3KA 2ZYKA 4ELQA 2A5TB 3FJ7A 3PUYE 4Q8RA 3MZ1A 4YKPA 4OEVA 3O9PA 3QUFA 4Q0CA 1XHYA 5I57A 1QVSA 3U92A 2X26A 3TTKA 3TODA 4OESA 1MH3A 4F1UA 2V3QA 4OMBA 2OZZA 3LSLA 4NF4B 4QFLA 1URDA 1XVXA 4GVOA 1Y3PA 3RNNA 4R73A 1QW0A 3H6TA 1EZ9A 2DWJA 5I2NB 3SERA 5TPAA 1H45A 5CM6A 2ABHA 3FXRA 2GHAA 2Y7KA 2H9BA 2CZLA 2IA4A 2GRVA 1TFDA 4C1UA 4H6DA 2Y84A 5J1DA 3A3CA 2I4CA 4R75A 4HCWA 4KFQA 4OVJA 1EU8A 2F35A 4G8HA 1NL5A 4KPTA 3G3HA 2KLFA 3RN8A 3RQTA 3FXUA 3CFXA 3PUVE 3ZKKA 4YKKA 2VP1A 1FTLA 3A3UA 3HN0A 1FTMA 3N26A 2Y7WA 3OOAA 4KYDA 3FJGA 1N7WA 1IITA 4UACA 4QRZA 1B51A 1LFHA 1NNKA 3QYTA 3OO8A 3PPRA 4GIZA 1MPDA 1PB9A 3VE1B 2UVJA 4EXKA 3MP6A 4PFWA 1ATGA 1LCFA 1WODA 1HSEA 4F3GA 4IB2A 3R6UA 4IO3A 2RC9A 3FV1A 3M8UA 3DP8A 3IOUA 1LFIA 5ITPA 1OVTA 3K6VA 1URGA 4AQ4A 1AL3A 1N7XA 4BDMA 1YTVA 2V25A 1PB8A 4ELPA 1USYE 3EF7A 1B40A 4X1BA 4IO2A 2H99A 1IXIA 1B05A 3U72A 4DCYA 4ZZEA 1LFGA 3K2DA 3KSJA 2F36A 1ZBMA 4MLVA 1LAHE 2I4BA 1N84A 4R9GA 4I8CA 1USYH 2X7QA 2R6GE 2DQVA 1SI0A 3IR1A 1MQDA 3O66A 5DTBA 3C35A 1VFDA 4FATA 3TCFA 3FVKA 3T9HB 2RCBA 2HAVA 1MPBA 4JDFA 2UVGA 5KZTA 1H43A 2E1SA 3C36A 4XKRA 3KGCA 2XXUA 3H06B 4DDDA 3O6HA 3FVNA 4RPNA 4OZ9A 4DIGA 3V83A 2FA7A 1Y20A 4GWOA 4EQ9A 4F2OA 2I6EA 2Z8DA 1TWYA 1B0HA 3R7XA 2UVHA 1MY2A 1XC1A 1BKAA 2O1MA 3K00A 2ZNSA 1VFEA 2HZLA 3TFLA 3T9UA 3CG1A 1MM7A 3O6IA 1CE2A 4ISUA 1BP5A 4DE8A 3M3KA 3SEXA 1O7TA 1MDP1 2Q89A 3FD3A 2NWJA 3N6TA 1B3FA 3PMWA 2AIXA 5HPQA 1PC3A 5CI5A 1Y4TA 4NEDA 5H8QB 4XKNA 1LBBA 3MVYA 3TCHA 4E0WA 3KN7A 1I69A 4BDQA 4I1DA 3TYHA 1EZPA 4OEUA 3K4UA 5FHNA 2Z8FA 3HO7A 5L8DA 1EH3A 3DP6A 2O51A 1KWHA 2F5XA 1NFTA 3LUYA 4NF8B 2O84X 4F3PA 4HW8A 3SETA 1SBPA 4JSDA 1MY3A 1H3DA 2R9JA 1SW1A 4ECFA 5AA2D 5LOMA 2Z22A 3K1MA 3B6TA 4ZZAA 3VLVA 2V84A 3UN6A 4IY6A 4QSEA 1R9QA 4F2QA 1LAXA 2HXWA 2RCAA 3G3KA 3WAFA 3OEMA 2DVZA 4KQPA 5TP9B 2HFBA 3OSQA 3V89B 4DLDA 1I6QA 2AL4A 2DWHA 4U22A 4EQBA 3BBRA 1MXXA 3CSBA 2FNCA 3FXQA 4G68C 3TKDA 3L6HA 3H3GA 2PX1A 3EPEA 2IEEA 2GH9A 1A7LA 2D5WA 5BUUA 3ZS6A 4MBPA 3GBBA 4GLIA 4KD5A 4ZEBA 2VOZA 2XXHA 3B6QA 1QKAA 3TAJA 3Q26A 3O2AA 2DE2A 3H6VA 4G68A 1MQGA 5TP9A 3IOVA 4QFOA 3KN8A 2RC8A 4NF6B 1CB6A 2LAOA 2DP8A 3VDFA 3SEVA 5I2KA 4RK9A 2OLBA 3PV0E 1EZOA 4R6KA 4TLLB 2REJA 2NXOA 4QFNA 3TQWA 2I49A 1OMPA 3KJ7A 2OJTA 1HSJA 3S2VA 1PEBA 3GXAA 5ISUA 3TCGA 2OWTA 4YKIA 3TEPA 2UXAA 1MY1A 3TTLA 1O63A 4O3BA 3BFUA 3RY3A 4L17A 3VFJA 4H1XA 4BLAA 4U1ZA 1PBQA 4QF9A 3MP1A 4G8NA 4OFJA 5EHSA 2NOOA 3CR9A 3ILTB 4AB6A 5CMMA 4R2BA 2HCAA 5AE4A 1YPNA 5ITOA 1FW0A 5IKBA 3SEYA 5IAIA 3C34A 3FV2A 3QXMA 2RINA 3C31A 1XT8A 2XXIA 3RGYA 1DMBA 1SYHA 5A5XB 1HSLA 3LSXA 5CC2A 1YAEA 1IZ1A 4QFKA 4QSDA 3PU5A 2F7BA 2THIA 4YICA 4R72A 4C1TA 4E0XA 2OBGA 4HTGA 3PUWE 3VXBA 5I56A 2F7CA 5ELVA 1D4NA 1TT1A 3MAMA 4H8IA 5KDTB 5TPAB 1GGGA 5A5XA 2X7PA 4KHZE 4NMYA 2ZNUA 2DE3A 2GHBA 2XXPA 3DLNA 1OLCA 2O1LA 3T9VA 4M4GA 4F19A 5DEXB 1B3HA 2UYEA 4ZS9A 1B7UA 2I3VA 3EQ1A 1OQHA 2QMWA 3GZGA 3ONMA 4PP0A 5KDTA 4RA1A 3B7DA 5DT6A 1LSTA 3G3JA 3PPPA 3K01A 4F22A 1AIVA 4G4PA 4OENA 1JNFA 4G2ZA 5B70A 2F34A 2H98A 1NKXA 3P7IA 1M5FA 1B4HA 1LBCA 5DEXA 2ZNTA 4LONB 1M5EA 3A09A 1Y1ZA 2RC7A 4O3CA 3UP9A 1ZJLA 4BDNA 3THIA 4LQ2A 2F97A 1AOVA 3QK6A 4POXA 4OWDA 1VE4A 4N13A 4PFTA 2H4IA 2R71A 5CMCA 3IO4A 4PE5B 5FHOA 3TZAA 1MRPA 1D9VA 3BKIB 1LAFE 3MUQA 3DM0A 3JYRA 4GL0A 1P1UA 4GOTA 5F7VA 5I59A 5HM4B 1VSOA 1N3XA 4H0WA 3TMGA 3VVEA 1MXYA 4TQUQ 4H65A 2CMOA 4OERA 4ESWA 2GFEA 1UTHB 4LVQA 2Q2AA 4FIMA 2ZYOA 3Q25A 4ND9A 1A54A 2Y7IA 3RTWB 2DWIA 4IGRA 1JEVA 5DVIA 3BFTA 4FECA 1MM6A 2M8CA 5FTIA 1NNFA 4EDPA 1B0LA 4KCDA 4GQOA 3ZSFA 2G29A 1UTHA 3S4UA 2DVCA 3H7MA 2W7YA 3N6UA 4F3BA 2F7AA 4JWOA 3C33A 3OENA 3W9WA 4FORA 3KOSA 4LZ7A 4OETA 4DXCA 1LCTA 4R2FA 1OVBA 3KFMA 3DELB 1DTZA 4OXVA 3M3LA 4XKQA 3MPKA 1SI1A 3K0VA 4YU0A 3PUZE 2P1SA 3CFZA 3Q27A 2DE4A 2V93A 2DS9A 5AA3A 4LA9A 3IL1B 1PBPA 3EHUA 3C32A 1B32A 2OCUA 4YB6A 1DOTA 2DXYA 1S9TA 3KSXA 1B3GA 4N6PA 3MJNA 4FEDA 3W15C 3KG2A 3U8QA 1PDAA 3FJMA 1F9BA 4GF8A 4R6YA 2I58A 2Q2CA 3SEUA 4I9DA 2I0BA 2QSXA 3T66A 4RK2A 1L5TA 3KJTA 4R6HA 1M5CA 1P1OA 3U93A 5AA4A 3CIJA 5CMBA 3TELA 3HHGA 1JVYA 2XD2A 1MY0A 3E13X 4POWA 2QRYA 4IGTA 5AA1A 4X1DA 4U1OA 3O29A 4ZEFA 4GD5A 4IY5A 3IOTA 3TPAA 1QKBA 5EYFA 3PD9A 2ONSA 2XXTA 3I3VA 4U4XA 4JWYA 1B58A 3E4RA 2ONKE 3MVZA 1UIVA 2OK2A 1JW4A 2D21A 2PYYA 4H67A 4RXLA 4WXJA 5B7DA 3VVFA 5K2YA 1MXUA 1B6HA 1B4ZA 3FASA 4Z0IA 2ANJA 3H6UA 3ILUB 2VD2A 4JB7A 2UYFA 2QJEA 4QFPA 4JXIA 4G68B 4ZEKA 3PMXA 1MQJA 2UVIA 4PFUA 1WVJA 3LSFB 1ANFA 2PT1A 4LZ8A 3IORA 1A55A 2P2AA 4LZ5A 2DYXA 3FGSA 4Z7EA 4YMAA 1GVCA 2P0SA 5I2KB 3CRBA 1I6BA 3KEIA 3IB0A 1A8EA 1QULA 1R6ZA 3H6WA 2Z8EA 1UQWA 4P0IA 2XX9A 4GFRA 4DXBA 3MWBA 4G8MA 4P11A 4R9FA 4DZ1A 2QS3A 1A40A 2ZMBA 5L9OA 4GL8A 3PPNA 3MBPA 3TUSA 3G7WA 5H8NB 3HV1A 4I62A 3OELA 3E9XA 4ESXA 4XIGQ 1JETA 3PGFA 4BDLA 3MVWA 5FTHA 1DSNA 3U94A 1MQHA 3PMVA 4MH5A 2G93A 3QUJA 3T9XB 5AA2B 1IQ7A 1SW2A 3FATA 1B1HA 3KZGA 1Y9UA 4F31B 3QAXA 1RYXA 1ZU0A 2AL5A 1VR5A 5H8NA 3IOWA 1OIBA 4IO5A 3D4GA 4IO6A 3RT6B 3K02A 4NE4A 3U1OA 1I6AA 5L9MA 5L9SA 3MW0A 1ZKBA 2HAUA 4HCYA 5H8SA 2QS4A 4KR5A 3WAEA 3HCQA 1FCKA 2O7UA 3RPWA 5AA2A 1UIUA 4EQ7A 1AMFA 1N3WA 5BWJA 3IO6A 4FAJA 5I56B 2QL3A 3MC2A 1P1QA 1B1XA 4F3SA 1ELJA 3HSTA 3MP8A 2Q9TA 1UTBB 4P0GA 3EHTA 1J1NA 2WKYA 1Z7ME 1D9YA 1SW5A 3V8XB 2VD3A 4EUOA 1N0TA 5ICQA 4LATA 2PT2A 5H8FA 3JZJA 4KYSA 3L6GA 1GTKA 1JW1A 1Y3NA 3AXFA 3LBSA 1D3KA 3V5AA 1A8FA 3F11A 4THIA 3H4ZA 3LR1A 4H5GA 2NVUB 1MDQA 3FVGA 1UTBA 1BTJA 4H8JA 2B65A 3T93B 3TTMA 1II5A 2V3UA 4YAHX 1XVYA 4PFYA 3CVGA 1R1NA 1QUJA 2O68A 1B52A 3FUZA 2ESNA 1MH4A 2RKMA 4DCXA 1IIWA 3VLUA 4AB5A 5JTYB 3K6WA 5DVFA 4JSOA 4TLMB 5I58B 3VLWA 4EF1A 2A5TA 4ONYA 5ICTA 3CFLA 1SD3A 4BDOA 1SW4A 3UA8A 3K1NA 3RT8A 2XHDA 4UA8A 1B5HA 1SQYA 3USDA 4XXUA 2XD3A 3ZKLA 1DPEA 3EN3A 2B3BA 1P1WA 5DVJA 1S50A 3OO7A 4YKJA 2O6AA 1MPCA 4HS7A 3TDJA 5JTYA 5I59B 3SESA 4F39A 4NF4A 2XXYA 5I58A 2PBWA 1TXFA 3IJXB 3ECRA 3C9HA 1FQEA 3EHSA 1QUKA 4LQ5A 3TTNA 2YJPA 1M5DA 4KI0E 3R26A 5I2NA 2HQ0A 1MY4A 3CG3A 5JK4A 3CSGA 2ZYNA 2XXVA 3S9EA 4OTEA 1POY1 4C0RA 2B3FA 2O69A 3G3IA 5I84A 1JEUA 3KN3A 5CBRA 4ZE8A 3UGWA 1FQAA 3KBRA 1O64A 4XTCQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4MF3A 4LP2B 3O97A 1RYOA 4OYVA 1A99A 2Q8MA 5M2VA 5TU0A 1B2HA 4ZEDA 3GLBA 4RYAA 1ZIUA 3OO6A 1R9LA 1XS5A 4PBHA 3QIMA 2GQ1A 1PB7A 3OD7A 4PETA 2VGQA 1B5IA 1FTOA 2QS1A 5HBCA 1B9JA 4DXUA 1P1NA 2Y5KA 1NI9A 5EQ7A 3T96B 3IB2A 3SEWA 2Q74A 1Y1MA 1S7YA 2I48A 5H8QA 1RKMA 4Q30B 4NHBA 1B7HA 3IX1A 3DP4A 2Y7PA 3EKIA 2F6GA 2H25A 3JV9A 1NMUA 4ZECA 1NV2A 1IXCA 4LN5A 3OSRA 2PVUA 2I0CA 4K3FA 5CMKA 1DCUA 4NF8A 4PFIA 4PAKA 1FPKA 2AYSA 4IR8A 2OWZA 3LUZA 1FPEA 5I3SA 4I3YA 3Q29A 1FTAA 4IO7A 1Y4CA 3FZVA 1ZTYA 4O7IA 1N76A 4M1VA 1M5BA 4JBZA 4MNIA 4PDHA 4U21A 4F1VA 5CRYA 4GX3A 5KCJB 3IK6B 5F1QA 2DSFA 4F29A 3S9MC 3MVXA 4OFLA 3CI8A 4U23A 4PGPA 1YCJA 1DPPA 1LLSA 4IO4A 4XKPA 1B3LA 4WEDA 1IXGA 2BJJX 2JJKA 3VV5A 1N04A 4KCCA 3K1PA 1MXVA 3MZ9A 2XXQA 4ZEIA 2ZYMA 4HE0A 3O28A 2ZZVA 3MPLA 2RF1A 3LC8A 3HPIA 4U2RA 3TTRA 1P99A 3S9NC 4N8YA 4JWXA 1IMEA 5KCJA 1AH5A 2YLNA 4NN3A 3Q28A 3G3FA 4PF6A 3TQLA 4XFEA 4EXLA 1Z7NE 2XXRA 1BLFA 3NOHA 3PPQA 4F1YA 3FVOA 1FQCA 4NF6A 2A5SA 1OQGA 1Y3QA 4YB5A 5K2XA 4FJPA 3S9LC 3D4CA 3IFAA 1FQDA 1LBYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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