3KJ7A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with dextrin at 1.9 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Specific interactions of C-terminal half (C-lobe) of lactoferrin protein with edible sugars: binding and structural studies with implications on diabetes.
pubmed doi rcsb
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kj7A02
3UP9A 3S9LC 4QFOA 5IAIA 3TPAA 2UYFA 4NWDA 2XXHA 2HXWA 4F22A 4M1VA 2GHBA 3H6UA 2A5SA 3U72A 3TMGA 1P1WA 4QFPA 1NNKA 1WODA 3Q29A 4GL0A 4FATA 2A5TA 1LAHE 4YKKA 3FATA 4O3AA 2Y7RA 1N3WA 2X7PA 4I1DA 3EHUA 2I3VA 2O69A 1VFDA 1PB9A 4XKQA 3AXFA 4H8JA 4LZ8A 4H1XA 4R72A 1B3FA 5L9MA 3G7WA 1S7YA 1CB6A 2DQVA 1JVYA 1OLCA 1PBQA 2QRYA 3G3KA 3S9NC 2DSFA 4PFUA 4YMBA 3TODA 3QXMA 1FQEA 4ZS9A 3V83A 1QUIA 4G8MA 4OFJA 3CSBA 4JSOA 2UVJA 5TP9B 4RYAA 4F1YA 4YZZA 2YLNA 4BDQA 3MQ9A 3H6VA 4DCXA 1B0LA 3K1NA 5DTBA 4POXA 4GVOA 4NF5A 2OCUA 3TTKA 3G3FA 1B7ZA 5EHSA 1Y9UA 3KFMA 3IAZA 2O1LA 3C31A 3GLBA 4MF3A 4NF8A 3TYHA 1OVTA 1UTBB 2QS1A 1D9VA 4P0IA 4ECFA 2HAUA 3UIFA 4E0WA 3BKIB 4F2QA 3KN8A 1USYH 1LAFE 4OMBA 2KLFA 3K1PA 2V3TA 1ATGA 2H25A 1EZ9A 4OEVA 1F9BA 1JVXA 1UQWA 3TTMA 4PFWA 3RNNA 1AIVA 5H8FB 4YICA 2F6GA 5I58A 4LATA 3MWBA 4ESXA 1O63A 1MXVA 3EF7A 3W15C 1MXYA 4ONYA 2VGQA 3I6VA 3KOSA 1S50A 1JEVA 3FXQA 4P11A 3U1OA 3FIRA 1Y4TA 1ZLQA 3F11A 1NFTA 3LR1A 3FXRA 4ELOA 2GH9A 1MH4A 4H0WA 1LB9A 1NMUA 4GRKA 2R71A 3KG2A 3L6HA 1US4A 2F7BA 1ZMGA 4RY1A 4JWXA 3VE1B 4JBZA 5AA4A 3E3KA 4NEDA 3FVKA 2DWIA 4N07A 3G3IA 3U8QA 3CI8A 3OEMA 2ZNUA 4ELPA 4ZZEA 2R9JA 2XXPA 5ICQA 4AQ4A 5I2NB 3W9WA 3P7IA 1ZIUA 3PUVE 3SKPA 1LAGE 2PT2A 3T93B 3USDA 5A5XB 3CRBA 3O28A 2ZNSA 4FEDA 1SQYA 1TFAA 4NF4A 5FTHA 1JW5A 4KD5A 4N6PA 1SYHA 3LC8A 5H8HA 2QL3A 3PPNA 1ZKBA 4OZ9A 1LBCA 1A8EA 3SDFA 4K3FA 1EZOA 4LVQA 2DWJA 3ECRA 1H76A 3A3UA 3R26A 3ILUB 4R2FA 4EUOA 1SW2A 4R73A 3PMVA 3KGCA 2O51A 4PP0A 4FORA 4I8CA 4YKIA 2D3IA 4RA1A 4R9GA 3C35A 1A8FA 1YTVA 4NMYA 2NWJA 5K2XA 3TQLA 2E1SA 2AL4A 3FUZA 3HHGA 1YCJA 4KI0E 5H8QA 4OERA 1JW4A 4KYDA 5CMMA 1EU8A 2DE3A 3A09A 3ODBA 4PE5B 1GVCA 5ICTA 5L9SA 4QSDA 3PMXA 4YB5A 2ONSA 2OJTA 4UACA 3DLNA 4XKRA 1PB8A 2OWTA 1I6QA 1TFDA 1IEJA 2UVIA 4AB6A 3LSXA 3M3KA 4RXLA 3MVYA 1B7UA 5HBCA 4C0RA 1NH8A 2V93A 5B7DA 4OQOA 5DYHA 3RT6B 2I49A 3RT8A 4JWOA 5H8NA 1MM7A 1QVSA 1SW4A 3O6IA 4F3PA 5M2VA 3G3GA 4OXVA 4QRZA 2H98A 1VFEA 3FD3A 3IX1A 3PMWA 4G2ZA 2Z8FA 1XHYA 3OENA 4ZEDA 2HAVA 5I59B 1FQCA 1NNTA 3IJOB 4G68B 4X48A 3T66A 2ZYKA 4Q5TA 1BTJA 3KSJA 3GXAA 1IXCA 3PUYE 5I56A 3SERA 4KPTA 4I62A 3MJNA 3ZKLA 2Q2CA 3QAXA 5TPAA 3JV9A 3KZGA 3VXCA 1P1OA 3MP6A 3TCFA 3PPOA 2VD2A 4TOZA 1R9LA 3O2AA 3KOTA 1XVXA 1B0HA 4R6YA 1BKAA 4GF8A 5AA2B 3WAEA 2DVCA 1H44A 2RKMA 3KN7A 2O1MA 1I6BA 4F18A 3T9XB 4G8NA 2CMOA 4HCYA 2NVUB 5AA1A 4IO6A 1Y3NA 2BJJX 2B3BA 5ITOA 4TLLB 1Y1ZA 4ZZAA 1B3HA 2XXTA 1NH7A 3RTWB 1JQFA 1JNFA 2OK2A 2UXAA 2HZKA 2PX1A 1SD3A 2H5YA 3CFLA 1QKAA 3M3LA 3VLVA 4NF6A 3SEUA 4DXBA 3IO4A 3TZAA 3MW0A 3QYTA 1S9TA 3C34A 3OOAA 3K0VA 5HM4B 1OIBA 1II5A 1B7HA 4Z7EA 4RK9A 3IORA 1MQIA 1Q35A 1D3KA 1USYE 3OELA 4R75A 3H4ZA 4ZECA 3V89B 4BDOA 1MQJA 3DP4A 3PU5A 4U22A 3K2DA 1FQFA 2AL5A 1R1NA 3UGWA 2Y7KA 2V3UA 3RQTA 2IA4A 1B9JA 5B70A 1Y1MA 4FEBA 2ZYOA 5I2KA 3MBPA 1B3GA 3CSGA 3O66A 4Q0CA 1POTA 1D9YA 3N6UA 3HSTA 1US5A 2V25A 4MLQA 3IB1A 3H06B 3TTRA 1BP5A 4POWA 1NKXA 4ZE9A 2HEUA 4NWCA 1XOCA 4NF5B 5I84A 5JEIA 1QUKA 4OEUA 2QMXA 4ELQA 4E0XA 4FIMA 3E9XA 4LQ5A 3FV1A 4GLIA 2F34A 3LSWA 1MDP1 2NOOA 4NF8B 2Z8EA 4PFYA 2M8CA 1D4NA 3THIA 3N6TA 2ABHA 4QSEA 4DCYA 4BDLA 1Z7ME 1MXWA 1SDXA 4GXSB 5CMBA 3TEPA 1MY0A 3MZBA 1B2HA 5CMKA 4ZEBA 4R6KA 4ZEKA 3FGSA 1MH3A 4ESWA 5I58B 3FVOA 1GGGA 2H4IA 1B52A 4OFLA 3TDJA 2DXRA 2RCAA 4H8IA 2ONKE 2RINA 1T0KA 5TP9A 4IO3A 3CIJA 2G29A 4MH5A 4F19A 2VHAA 4RNSA 3ONMA 1L5TA 2HZLA 2QS4A 3IOUA 3M8UA 4QHQA 2E0SA 1MQDA 3IK6B 4IGTA 3ILTB 4EXKA 4H65A 5AA4B 3M3FA 4LZ7A 4R74A 1MRPA 1UTBA 3IOWA 2DXYA 3TKDA 3TQWA 4YMAA 4LUBA 4GXAA 3W9VA 5ISUA 1H45A 3FXUA 5CMCA 2XD2A 2I3WA 1N04A 4EQBA 5DVJA 2XXYA 3FV2A 4FJPA 1N7WA 4OTEA 1OVBA 4NF4B 3SEVA 1TT1A 4GD5A 5H8HB 5F1QA 1Y3QA 3V5AA 1B32A 4FAJA 1MY1A 1ZU0A 4R6HA 1B05A 5AE4A 4LONB 2VOZA 3O6HA 1QKBA 2XXXA 4THIA 3QUFA 1XVYA 2ANJA 4WKMA 2REJA 5KDTB 2QSXA 3K01A 5J1DA 5CC2A 1MY4A 3H7MA 1B1HA 1LLSA 1DSNA 5CBSA 3OSQA 2Z8DA 2HQ0A 3DP6A 1SW5A 3KBRA 4Z0IA 4ND9A 1HSEA 1B51A 3PUZE 1MS7A 5HPQA 2O7UA 1AMFA 1PB7A 3LSFB 1MPBA 3S4UA 3UN6A 1OQGA 3MUQA 1Y4CA 1YPNA 3MZ1A 2I4CA 3C32A 4JB7A 5H8SA 2OLBA 3C4MA 2OZZA 4TQUQ 4MFIA 1B4HA 3K1MA 5DEXA 1FCKA 3KSXA 4R2BA 1B3LA 4OHNA 2DP8A 3RY3A 5JK4A 4EQ7A 2XX7A 2VD3A 2D5WA 4M4GA 4OENA 2PMSA 4QFKA 3RPWA 3TAJA 1CE2A 3OXNA 3UK4A 5H8NB 1PC3A 1GV8A 3UA8A 1TWYA 3IJXB 1MQHA 4GIZA 1IXHA 4MLVA 1P1UA 1R6ZA 1IQ7A 2I6EA 3EN3A 2I48A 5CI5A 3EPEA 1RYOA 1P1QA 2H99A 3I3VA 4OWDA 3B6WA 1P1NA 3PD8A 3L6GA 2V3QA 1UTHB 4YAHX 3K6UA 3E4RA 1M5FA 2D21A 2Y84A 4U4XA 3RLFE 3Q25A 2W7YA 1B5IA 4QF9A 2B65A 1A55A 3N5LA 3OEKA 2NXOA 4O3BA 2F8DA 1DMBA 3K02A 3VDFA 4NE4A 5EHMA 4LQ2A 3TFLA 2Q2AA 2CZLA 1AL3A 2Q89A 4DLDA 3MP1A 2DWAA 2Y7PA 1MXUA 4IO5A 5CRYA 3CR9A 3VFJA 4DZ1A 2ZXTA 2B3FA 5FHMA 1HSJA 3K00A 2UYEA 3Q27A 3SETA 4KCDA 4JWYA 2I0BA 1DPPA 4H5GA 2LAOA 4LP2B 3CFXA 3V8XB 1Q1KA 4GQOA 4IB2A 2NUVA 1TXFA 1DTZA 2I58A 5I57B 3DP8A 4EF2A 5LOMA 2YPNA 1OMPA 4NF6B 4G68A 2R6GE 3FZVA 4H67A 4ZE8A 2Z22A 3PD9A 1M5DA 3GBAA 3CG1A 1QW0A 5ITPA 4RPOA 2AIXA 4XXUA 3MVWA 4WEPA 3CFZA 1JETA 3T9HB 3O29A 1B40A 3O97A 5FTIA 3TCGA 4H5FA 3Q26A 2UVGA 5JTYA 2ZYNA 1MPCA 4ELRA 1MXZA 1LCTA 1O7TA 1FTLA 1Z7NE 4U2RA 1ZTYA 3G3HA 4IO4A 4RK2A 4I9DA 2RC7A 3R6UA 4P0GA 2V84A 1MY3A 4U1ZA 5I2KB 5FHOA 4BDRA 2F97A 2F35A 4ZDMA 2A5TB 3HO7A 1I6AA 4IO2A 4XKPA 1B3EA 4KHZE 4L17A 5KCJA 3FJMA 4U23A 1IUDA 1KWHA 4U1OA 3TUSA 3PUXE 2O84X 4Q8RA 2F36A 4H6DA 4XIGQ 4LZ5A 5BWJA 3N26A 1MXXA 4EF1A 4ZEIA 1B5HA 3H3GA 1OLAA 4X1BA 3H6TA 3I5OA 1SBPA 4F2OA 3TELA 1LFHA 2F7AA 3C33A 3MPLA 4XKNA 1ELJA 1MG1A 3JYRA 3QSLA 5DVFA 4DXCA 5AA3A 3FVGA 4FE8A 3VV5A 1N3XA 4F31B 4GOTA 2X7QA 3R7XA 2REGA 1GTKA 3S9MC 4QSCA 2O7IA 1B58A 1ANFA 3T22A 2XXQA 2VP1A 2ALUA 1A54A 3OSRA 1M5BA 3BFTA 2OWSA 3DELB 4KYEA 3VLUA 2PBWA 4DIGA 1FTJA 3VXBA 1ZJLA 2I0CA 1PBPA 4F39A 3BFUA 2XD3A 3FJGA 3E13X 2UVHA 4PFTA 2QMWA 3SEWA 1WVJA 4RPNA 4U4SA 4DXUA 5EYFA 2QJEA 4OETA 4F3GA 4YU0A 2GHAA 2FNCA 1IITA 4GL8A 2O68A 5CBRA 3QUJA 2QS3A 1OQHA 1IZ1A 2H9BA 1LAXA 4KR5A 1SI1A 2YJPA 4F3SA 1PDAA 4XTCQ 1XC1A 3PPQA 4GFRA 4JXIA 4PETA 1H43A 3HHFA 1UIUA 1BLFA 3N94A 5F7VA 1B5JA 3DM0A 3HV1A 2F7CA 3B6QA 4LA9A 3KJ7A 3IB2A 1DTGA 1VR5A 3OO7A 4F3BA 5BUUA 1YAEA 4IY5A 4EQ9A 1A99A 4HCWA 3VLWA 1B4ZA 1FTOA 3UORA 3OO8A 3O6GA 3PV0E 4FECA 4R9FA 3TTLA 3EQ1A 3U94A 1URDA 5FHNA 3Q28A 4YB7A 2FA7A 3H03A 3MP8A 2DOJA 3U93A 2OBGA 4RJZA 3ZKKA 2Y7IA 2DVZA 2I4BA 2QS2A 2PVUA 3D4CA 3PGFA 2Y7WA 3T96B 4N13A 5H8FA 3T9UA 2DE4A 3KN3A 4UA8A 3IL1B 4ISUA 2ZMBA 3FASA 1B46A 1MDQA 4G68C 1FQAA 1MPDA 3VVFA 1H3DA 2WKYA 1Y20A 1EH3A 2F5XA 3SEYA 1LFIA 1B1XA 3K4UA 3B7DA 3PUWE 4KFQA 4YKPA 2QPQA 2F78A 2RC8A 2F6PA 1HSLA 3FVNA 3QK6A 1N84A 5IKBA 1DOTA 3GBBA 2FYIA 3FJ7A 1FTKA 3OD7A 2DE2A 4QFLA 5DEXB 3MZ9A 2G93A 1LCFA 3BBRA 4EDPA 1RYXA 2ONRA 1P99A 3G3JA 1N76A 5H8QB 4F1UA 3LBSA 3EHTA 2DWHA 1BIYA 3HN0A 4WXJA 3ZS6A 1JEUA 3IO6A 4EXLA 4KQPA 3KJTA 4X9TA 4IO7A 5I2NA 3OO6A 3TTNA 2Q8JA 1O64A 4OFOA 3CVGA 5A5XA 3B6TA 5KDTA 2ESNA 2THIA 3GZGA 3RUMA 4F1VA 1A7LA 1NNPA 3A3CA 3WAFA 4WEDA 4JSDA 1M5EA 3RN8A 3K6VA 1SYIA 1VE4A 2RC9A 4HTGA 4DDDA 3RGYA 4C1TA 2GFEA 4YB6A 4KCCA 1DPEA 4IY6A 1LB8A 4Q30B 3MC2A 4X1DA 3VVEA 3K6XA 2HCAA 1B6HA 4U21A 1SW1A 2RF1A 4TLMB 1EZPA 1URSA 2HFBA 2XX9A 1LBBA 3VVDA 2PYYA 3IOVA 1R9QA 1RKMA 2O6AA 3OMBA 3LSLA 5I56B 4F29A 1QUJA 3ZSFA 1NNFA 5TPAB 1MQGA 1IXGA 1NL5A 1XS5A 5K2YA 4BLAA 1I69A 1FQBA 1J1NA 3SESA 2Q9TA 2XXRA 4G8HA 3LUYA 5L8DA 3HCQA 1AOVA 2GRVA 2P1SA 4JDFA 1UTHA 1MM6A 2DYXA 4O3CA 2ZYMA 2XXVA 1IXIA 4ZEFA 3EHSA 4PQJA 1URGA 3KEIA 4BDNA 5L9OA 3U92A 3D4GA 4DE8A 1WDNA 3PPPA 4BDMA 3RTFB 2AYSA 3IOTA 3S9EA 3MVZA 5I59A 5JTYB 3MPKA 4IGRA 3C9HA 4HW8A 1LGBC 4OVJA 1FQDA 3HPIA 4GWOA 1QJMA 4KYSA 1SVXB 3JZJA 4AB5A 3T9VA 1SI0A 1Y3PA 2IEEA 5DVIA 2P0SA 4G77A 2PT1A 1FTMA 2XXIA 1PEBA 5DT6A 4OESA 1VSOA 4C1UA 4YKJA 2RCBA 4OYVA 5ELVA 3OO9A 2Z23A 3C36A 1JW1A 1ZBMA 3PPRA 4QFNA 5KCJB 3TCHA 5I57A 2Q88A 2P2AA 1FW0A 1M5CA 3SEXA 1A40A 5AA2A 3MVXA 5CM6A 1N7XA 2ZNTA 3MAMA 1QULA 2XX8A 2XXUA 1MY2A 1LFGA 1LSTA 3IB0A 2XXWA 3QIMA 1POY1 1GR2A 3H6WA 4MBPA 5AA2D 3IR1A 4NTLA 2DS9A 5TU0A 1IIWA 3S2VA 3K6WA 3O9PA 1N0TA 2X26A 1XT8A 4G4PA 3CG3A 2XHDA 1UIVA 5KZTA 1AH5A 4HS7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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