1QVSA

Crystal structure of haemophilus influenzae h9a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
b'DITVYNGQAKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
total genus 111
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA01
3B6WA 2VD2A 2HZLA 5TP9B 2QRYA 1B1HA 3UK4A 1A8EA 2DXYA 1US5A 4QFNA 3CR9A 3H6VA 5HBCA 3IORA 3MQ9A 4AQ4A 3C9HA 2Y7KA 1MPCA 3TQLA 1MXVA 4C1TA 1ANFA 1RKMA 4G68B 1POTA 2E1SA 4IO6A 1NL5A 5JK4A 5H8FB 4MLQA 4E0XA 5J1DA 3USDA 3UORA 3PPOA 1GTKA 1MXWA 5CRYA 2F5XA 3Q26A 3TTRA 1Y3QA 3IR1A 5EYFA 3TEPA 3TELA 3M3FA 3VLVA 1N04A 3TCHA 1FTLA 2QL3A 4WXJA 5A5XA 5I56A 1Y4TA 3EHTA 4YMBA 1P1UA 4OFJA 4JWYA 1IQ7A 1RYOA 4KYDA 1LFIA 4ELRA 3UGWA 2VHAA 3I6VA 4ISUA 5F7VA 1SI1A 2Q8JA 1MY1A 1MXZA 4TQUQ 4YKKA 4OENA 1LB9A 4G77A 4LP2B 5KCJA 1LAXA 3G3IA 4ZZEA 1S7YA 4QFLA 4I1DA 3A3UA 1UTBB 2DE3A 4EF1A 1I6AA 2DYXA 2UXAA 4UACA 1XC1A 4BDNA 3HSTA 4QFOA 4H6DA 3HHGA 2QJEA 4IO4A 1ZTYA 3UIFA 3S4UA 1A8FA 1EH3A 5L9SA 1EU8A 1SW4A 3PU5A 2DOJA 2NWJA 2XD3A 1B4ZA 4R9FA 4YKPA 3T9VA 1A7LA 2D3IA 3VDFA 2XX8A 2Z8DA 4YB5A 4HCWA 5AA2D 2ZNUA 3K1PA 3FJMA 4KI0E 3HV1A 1QUJA 3R26A 1MPDA 2Y7PA 3LC8A 2Z22A 2Q9TA 1JNFA 4F1UA 1Y1MA 4U4XA 4AB6A 3PPRA 3RUMA 2QMXA 3KN3A 1JEUA 4N07A 2ESNA 1AL3A 1LCTA 1P1NA 3QAXA 5EHSA 4OEVA 4NF8B 1MM7A 1SVXB 3IOVA 1Y20A 4LATA 2DE2A 3ODBA 3CFZA 2XD2A 4LZ8A 4GRKA 4NF5A 1J1NA 3L6HA 2DWAA 1PB7A 1WODA 3KJ7A 4PFTA 4QSDA 3WAFA 1H76A 1AIVA 2ZYNA 5AA4A 2Q2CA 4EXKA 4LZ5A 4IO2A 1LCFA 4GVOA 3N5LA 4F2QA 1IXGA 2GHAA 3U8QA 4R9GA 2DXRA 4XKQA 1JW5A 3D4GA 3VVDA 3TZAA 1R6ZA 4DCXA 3IO6A 3R7XA 3HCQA 2Y7RA 5ISUA 4G2ZA 3O6HA 4DXUA 5L9MA 2V3UA 3DLNA 4OYVA 3S2VA 3TODA 3I5OA 5EHMA 1HSJA 1B40A 1FTMA 1JW4A 4F3BA 1D9VA 4ZEIA 1QKBA 3GBAA 4NEDA 4ELOA 2XHDA 4PP0A 5FHOA 1XT8A 1M5FA 1SBPA 2QPQA 3KJTA 4IY6A 5ICTA 3LSLA 4F3GA 5KDTB 1M5CA 2GRVA 5FHMA 2F8DA 2O7IA 1MQDA 1UTHB 2O1LA 1QUIA 5ELVA 3KN7A 3TQWA 2I4BA 2AL5A 1B05A 1TFAA 3OSQA 4F39A 3K01A 3MP6A 4G68A 1P1WA 2DE4A 1FTJA 3H7MA 2GHBA 3CIJA 4KHZE 1B2HA 1LAGE 5AA2A 1FTOA 4EDPA 5H8FA 1QUKA 3L6GA 1LBCA 3JV9A 3K1MA 3PD9A 4NWCA 2BJJX 4GQOA 4FEDA 1GGGA 3ZKLA 1FQAA 4MF3A 3TYHA 2R6GE 3KSJA 4JBZA 4FAJA 2VP1A 4IB2A 3OXNA 3QIMA 3Q25A 4QRZA 1XOCA 3K00A 4O3BA 2ZMBA 4OHNA 2DS9A 3G7WA 4HTGA 4H8JA 4THIA 1OIBA 3B6TA 5CMMA 1Z7ME 4R6HA 5AE4A 1FQDA 4R73A 2UVHA 2UVGA 3BFUA 3K02A 4X1DA 2V93A 2XXVA 4FE8A 5CMBA 3MVWA 3B6QA 3EHUA 1LGBC 1OLAA 3MUQA 4L17A 4H67A 3MPLA 3CI8A 1OVTA 2DWIA 2Y7IA 1B4HA 2D21A 3RGYA 3SERA 1LAHE 2CZLA 2WKYA 4RK9A 3FVGA 4Q8RA 1H45A 3DM0A 2ABHA 3DP6A 1XS5A 2G93A 1B7HA 3PGFA 2ZYMA 1LBBA 5DVFA 1QJMA 5AA4B 3SETA 1VFDA 1NH8A 1URGA 2QS1A 4FIMA 2HXWA 3N6TA 2OLBA 4X1BA 2DVZA 4YKJA 1NNPA 3SESA 3C4MA 2RCBA 1A54A 3LR1A 1D3KA 3VVEA 4DLDA 4Q5TA 3RQTA 2OCUA 3RY3A 1MY4A 1N7XA 2DVCA 5B7DA 3R6UA 3MAMA 3I3VA 3S9LC 4MBPA 3G3JA 1VE4A 1S9TA 1GVCA 1NNFA 1BIYA 1AH5A 1B9JA 5M2VA 3SDFA 3MVZA 1M5DA 1JQFA 1D4NA 4DE8A 4I9DA 2I3VA 3PUZE 4F3SA 4DDDA 4Z0IA 3IK6B 1NNKA 3TKDA 4QHQA 1MXYA 4JSOA 3JZJA 2X7QA 2IEEA 3C35A 2CMOA 4R72A 1BTJA 2QS4A 1IEJA 4RPNA 3RTWB 3HN0A 2RC8A 4IO7A 2XXIA 1ZMGA 3EF7A 2XX9A 4HS7A 4ESXA 1FQEA 4OMBA 2ANJA 4GD5A 1EZOA 3OEKA 3U93A 3C32A 3EQ1A 4U2RA 1ATGA 3OO8A 1FCKA 3O6GA 3PUWE 2XX7A 4ZECA 4ND9A 4OQOA 4EQ9A 3RT6B 4M1VA 4F1YA 2P2AA 4LA9A 1T0KA 3QXMA 4LUBA 1GV8A 4OVJA 4GFRA 5AA2B 3PMXA 1JETA 3CFXA 3KG2A 3OMBA 1A40A 2F7AA 3N94A 3MVXA 3M8UA 3W9VA 3FVNA 3C36A 4ECFA 3VXBA 1NNTA 3FJ7A 3C34A 2I48A 1DPPA 3DELB 3T66A 3GLBA 2A5TA 3HHFA 4PQJA 3KOTA 4LQ5A 2XXYA 4ZEDA 5DYHA 1P1QA 3MP8A 1PC3A 1IXCA 2XXQA 5K2XA 1MS7A 1B6HA 2X7PA 1MXUA 1MXXA 2XXUA 3QUFA 1O64A 3KZGA 3PMVA 4BDLA 3CG1A 5KDTA 1NMUA 4G68C 4N6PA 4LVQA 2KLFA 1UTHA 3M3LA 4JXIA 3S9MC 4P0IA 2Y7WA 3OOAA 2VD3A 2F78A 3W15C 1YTVA 1PDAA 4UA8A 3MJNA 3K6XA 3PMWA 4F18A 3MBPA 1UIVA 5ICQA 4M4GA 4EUOA 3ONMA 4QSCA 3H06B 4KYEA 4U21A 2NUVA 4FECA 3T93B 3CRBA 2RKMA 3PUVE 1Y1ZA 4QFKA 4AB5A 4IO5A 3K2DA 1FQCA 1R9QA 4FORA 1KWHA 3U72A 3IAZA 3SKPA 2V3TA 1H43A 2YLNA 4QFPA 2HCAA 1SD3A 3ZS6A 3MZ1A 2H25A 1DMBA 3A09A 5I59A 1USYH 1SYHA 3HPIA 3SEUA 1B3HA 1B32A 3E13X 3FIRA 4EQBA 4O3AA 1PEBA 2I49A 3O66A 5H8HA 2ZXTA 3OO7A 4F22A 1MH4A 2FNCA 4ELPA 4JDFA 1MG1A 4DIGA 3IB1A 3EN3A 4GXAA 5I2KB 2OK2A 4R2BA 3Q27A 4G8NA 1TFDA 4YB7A 3O29A 4XIGQ 3FASA 2XXPA 3PV0E 1NH7A 2F36A 4X48A 1TWYA 3OO6A 4KFQA 2F7CA 2HFBA 2D5WA 4U22A 4RYAA 2O68A 3KEIA 1JVXA 4FEBA 3VLWA 1CB6A 2HAVA 4ZDMA 3MZBA 1O63A 3N6UA 4KQPA 3K4UA 1B3LA 3E4RA 4PFUA 3A3CA 4R74A 3W9WA 1USYE 3RT8A 4LZ7A 1WDNA 2HEUA 2O69A 4XKPA 3K0VA 1M5BA 2RINA 4ZE9A 5I58A 3QYTA 5KZTA 4NF4A 3TUSA 1D9YA 2Q88A 3E3KA 3KFMA 3BBRA 1JVYA 4C0RA 2YJPA 3OENA 3TTNA 4KPTA 5LOMA 3IB2A 2A5TB 1LSTA 4GLIA 1N7WA 1BKAA 4YZZA 3K6WA 1F9BA 4OZ9A 4EF2A 3KSXA 1B0LA 4ZEKA 4GOTA 1SI0A 3FD3A 3VV5A 4OWDA 3VLUA 3ILUB 5TU0A 2ONRA 3BKIB 1MY0A 4OXVA 1OLCA 4LONB 3TDJA 3V8XB 2THIA 1GR2A 5HPQA 2R9JA 3UN6A 3V89B 4NWDA 4H5FA 4DZ1A 3KBRA 1EZ9A 1ELJA 4POXA 3O28A 4GWOA 1OMPA 4RPOA 4ZE8A 4OETA 2RC7A 5DT6A 2V84A 3IJXB 2O7UA 1Q1KA 1S50A 5I59B 1ZU0A 3TCGA 2HZKA 2H99A 2VOZA 2O84X 3P7IA 2RF1A 1B46A 2QSXA 2OWSA 2R71A 5H8HB 2I4CA 3T9HB 2PVUA 3EHSA 3MPKA 1MQGA 3FUZA 3FXRA 2UVJA 3FVOA 4JB7A 2XXXA 2I0CA 5IAIA 3THIA 1B58A 4JWXA 1LFHA 4H65A 1IUDA 2F6GA 1CE2A 3G3HA 1VFEA 4RXLA 5HM4B 5FTIA 3T9UA 3IJOB 2RC9A 5H8NA 4ELQA 2AIXA 2ONKE 4NTLA 2QS2A 4PETA 1R9LA 2F6PA 1SW5A 5L9OA 3TPAA 3D4CA 1M5EA 2O1MA 4RA1A 1FW0A 2QS3A 4NE4A 4DCYA 1MM6A 3TCFA 4WEDA 3T96B 1P1OA 1DOTA 2UYFA 1B5HA 4ZEBA 5F1QA 5I57A 4HCYA 2UVIA 2OBGA 2QMWA 4H1XA 3O97A 2Z8EA 4Q30B 1ZKBA 3LSWA 5AA3A 4XXUA 4GXSB 3FVKA 1MQIA 1A99A 5I58B 3G3GA 3V83A 4XKNA 2XXHA 1ZLQA 4NF4B 2REJA 5CI5A 4ZS9A 1IITA 1HSLA 1B0HA 4OESA 3CVGA 2RCAA 1Y4CA 1IIWA 3BFTA 3KN8A 1FTKA 4GL8A 4N13A 3CSBA 2HQ0A 3LBSA 4EQ7A 3VXCA 1SYIA 3S9EA 2B3BA 3SEYA 5I2KA 1UQWA 3T9XB 5I2NB 1N3WA 2DWHA 3CFLA 4R2FA 4KCCA 4U4SA 1QKAA 3HO7A 2PMSA 4XTCQ 4F19A 1LAFE 4TOZA 2PT1A 2B65A 3TTKA 4FJPA 4BDQA 4YU0A 2E0SA 2A5SA 2OWTA 3G3KA 2GH9A 2Z8FA 4I62A 3ECRA 3OSRA 3PPQA 4ZEFA 3H3GA 4Q0CA 1H3DA 3U94A 3AXFA 4OEUA 2ZNTA 2REGA 2PBWA 2V3QA 4TLLB 1OQGA 1I6BA 3S9NC 3QUJA 1B51A 3T22A 1XHYA 2O6AA 3ZSFA 4K3FA 4IGRA 1VSOA 3Q28A 4BLAA 3O2AA 4MFIA 1Y3NA 5CBRA 4RY1A 2W7YA 4G8HA 5JTYB 3H4ZA 1BLFA 5FHNA 3PPNA 4QF9A 1I6QA 1OQHA 2I58A 3FV1A 2F7BA 2ZYKA 1L5TA 1PB9A 2V25A 2LAOA 3GXAA 2ZYOA 2X26A 2F97A 5I84A 2ONSA 2VGQA 3CSGA 3O9PA 2M8CA 4F2OA 3IOUA 3SEVA 3F11A 3EPEA 2XXWA 5BWJA 4P11A 3O6IA 5H8NB 4PFWA 3SEWA 1B1XA 4H0WA 1JEVA 3U1OA 4RJZA 3RNNA 3LUYA 4F29A 4F31B 1H44A 3H03A 4MLVA 2PT2A 5TPAA 3U92A 4MH5A 1MQJA 2DP8A 3VE1B 5IKBA 4E0WA 1DTZA 3JYRA 1IXIA 3OD7A 3RPWA 5DVIA 5JEIA 5I57B 2DQVA 1RYXA 3TTMA 4U23A 3C33A 1Y3PA 4NF6B 4GF8A 3UA8A 4XKRA 5FTHA 1P99A 5DEXB 4PFYA 3KGCA 4KD5A 2NVUB 1ZBMA 3VVFA 4PE5B 1FQFA 4OERA 2NXOA 2Z23A 1N0TA 2PYYA 3FXUA 2ZNSA 2DSFA 3SEXA 4HW8A 3WAEA 5H8QB 4I8CA 1PBPA 1AOVA 1LB8A 4BDRA 4R6KA 1R1NA 2F35A 3GZGA 4WKMA 4GL0A 1POY1 1HSEA 1Z7NE 1B3GA 4R6YA 1IZ1A 1Q35A 3RTFB 4G4PA 3PD8A 3MVYA 1UIUA 5CBSA 1A55A 4WEPA 3TAJA 2H9BA 1NFTA 4DXCA 4IY5A 1MQHA 1B3FA 1QW0A 5H8SA 1AMFA 2B3FA 4DXBA 4IGTA 3V5AA 1XVYA 3RLFE 1DTGA 1MY2A 1OVBA 1B52A 4FATA 1B5IA 4F3PA 4ESWA 4YKIA 3OEMA 2OZZA 5BUUA 2Q89A 3UP9A 1VR5A 3G3FA 5DVJA 3IO4A 2FA7A 2IA4A 2Y84A 4EXLA 1ZIUA 4TLMB 3DP4A 3E9XA 1TXFA 4YAHX 3FGSA 4H8IA 2G29A 4OTEA 2XXRA 5AA1A 2PX1A 3IOTA 5I2NA 2ALUA 1II5A 1YAEA 1MDQA 2P0SA 1B7ZA 3QSLA 1MPBA 1MRPA 2H98A 5A5XB 3VFJA 5I56B 1MY3A 1TT1A 1QVSA 1NKXA 3LSXA 2XXTA 3IOWA 2H5YA 2GFEA 4BDOA 3MW0A 3PUYE 4O3CA 2UYEA 5B70A 3IL1B 5K2YA 5TP9A 1Y9UA 4OFOA 3TTLA 1URDA 2HAUA 3FXQA 1YPNA 4RNSA 2AL4A 3K1NA 2F34A 5KCJB 1URSA 5ITOA 5TPAB 4KR5A 3ILTB 3MP1A 5CMKA 1EZPA 1ZJLA 3MC2A 2YPNA 3IB0A 1US4A 2AYSA 3Q29A 1B5JA 4RK2A 4POWA 2NOOA 3FV2A 1PBQA 1XVXA 3CG3A 3H6WA 4ONYA 2I0BA 2H4IA 3FJGA 4NMYA 5CC2A 3GBBA 5CMCA 5JTYA 4R75A 4KCDA 1BP5A 3MZ9A 1N76A 4OFLA 1SW1A 4QSEA 5CM6A 1MDP1 4YMAA 3KOSA 4JWOA 2OJTA 3K6UA 4YB6A 4GIZA 4X9TA 5ITPA 1JW1A 2FYIA 3TFLA 4LQ2A 3B7DA 1FQBA 3TMGA 3OELA 3FATA 3RN8A 3MWBA 1QULA 4Z7EA 1LLSA 1IXHA 5L8DA 3PUXE 1PB8A 4YICA 1YCJA 4NF5B 1UTBA 1DPEA 5DTBA 1MH3A 3ZKKA 2P1SA 1O7TA 4NF6A 1WVJA 1N84A 4H5GA 3IX1A 3LSFB 5DEXA 3N26A 2Q2AA 4JSDA 3FZVA 4U1OA 1SDXA 3OO9A 4ZZAA 4IO3A 4G8MA 1SW2A 2DWJA 5H8QA 1LFGA 4P0GA 3QK6A 1B7UA 4F1VA 1I69A 4C1UA 1DSNA 2O51A 2I6EA 3H6TA 4U1ZA 4BDMA 3DP8A 1SQYA 1B3EA 2I3WA 3C31A 4KYSA 3K6VA 3M3KA 1N3XA 3PPPA 4NF8A 3H6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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