1QVSA

Crystal structure of haemophilus influenzae h9a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQAKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 111
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA01
1VR5A 2Y7IA 4K3FA 1EZ9A 2AYSA 5JK4A 3UA8A 3IOTA 1B2HA 3Q28A 1MPDA 4BLAA 1SBPA 1ZJLA 4O3AA 3WAFA 1OLCA 1S9TA 3HHGA 4OYVA 4OTEA 2R71A 3PMWA 4KCDA 5TPAA 3N5LA 2Z8FA 1FQBA 2ESNA 4ZEBA 5TU0A 5ELVA 3W9WA 2ZYKA 4F19A 1SVXB 1TWYA 5TP9A 1D9YA 3VLUA 1LAXA 3Q26A 3ODBA 4ZEIA 2F6PA 1AL3A 4YAHX 1H45A 1Y3NA 2F34A 3H3GA 3DP6A 4IB2A 2NWJA 2DXRA 3E3KA 4ND9A 1N0TA 4OESA 3KSXA 4LA9A 4NTLA 4EXLA 3H6TA 3FJ7A 3AXFA 1AIVA 1VFEA 2OLBA 2Y84A 3R26A 4R72A 4DDDA 4E0XA 3I5OA 3OXNA 4NF6B 1B4ZA 1FTJA 4GRKA 3QUFA 5H8QA 4PFTA 2RKMA 1A55A 2A5TB 3HV1A 1IIWA 2I0CA 4QSEA 4F2OA 3RY3A 1FTLA 3V5AA 1FW0A 1PC3A 2F7BA 2PVUA 4G8NA 1B3EA 4I9DA 4QFPA 4DXCA 4FJPA 2HCAA 4DXBA 4G77A 1T0KA 4BDMA 2I58A 2UYEA 3K6VA 3OSQA 1IXHA 3MJNA 1SW2A 1IEJA 1NMUA 1QKAA 2DWHA 3OOAA 3OO7A 4OEVA 2HZKA 4GL0A 3FXUA 2NXOA 2V84A 3EF7A 3G3KA 3PMXA 3SEXA 3SESA 1A99A 4FEBA 4YU0A 3FATA 3ILUB 3VVDA 1II5A 1GGGA 2DXYA 5HPQA 2DS9A 5DEXA 3VXBA 3W15C 2VHAA 1JETA 4G68C 1MXUA 3TELA 3CSGA 5EHMA 2QS3A 1OLAA 2A5TA 3OENA 3PD9A 2V3TA 4OFLA 2PT1A 4YB7A 4ESWA 4NF4A 4C1UA 2XXPA 2V3UA 5ICTA 4JDFA 4BDRA 1OVTA 1DOTA 1JW4A 1XS5A 4BDNA 1PB9A 1LLSA 4UACA 1MM6A 4QFKA 3THIA 1UTHB 1B32A 3OEKA 2CMOA 4R9GA 4KR5A 4E0WA 1D9VA 4ZE8A 3FXRA 4Q5TA 3ZKKA 2DWJA 1B05A 3A3CA 3IORA 3T9XB 1B3HA 4ELQA 2DWIA 2H9BA 4KI0E 3RTFB 5AA3A 4Z0IA 3V89B 2QL3A 3LSLA 4NWCA 5ITPA 1MQHA 3Q27A 1A7LA 1ZMGA 3IOWA 1LCFA 1A40A 5I2KB 1SYHA 4M1VA 1HSJA 1N3WA 2XXWA 4ELPA 1NH7A 1NNKA 5J1DA 1XC1A 1B3GA 4NF8B 2ZNUA 1PB8A 4OQOA 2NVUB 1R9LA 1UTBA 3K6XA 1QUJA 1DSNA 3MVXA 1TT1A 3MP1A 4LZ5A 4NWDA 4THIA 3K00A 4YMBA 5ICQA 1LAGE 3D4GA 1BIYA 3PUZE 4F2QA 4GD5A 4PFYA 5K2YA 4X1DA 5AA4B 1SQYA 3K1PA 1N04A 1ZU0A 3PUVE 1IQ7A 3DELB 3E9XA 4RK2A 5F1QA 4F3PA 4OEUA 3E4RA 1P99A 2Z22A 3FXQA 4AB6A 5H8SA 4ONYA 5AE4A 3K0VA 3C9HA 1MG1A 2H99A 2I3WA 1JW5A 4X1BA 1MQIA 3B6TA 5KDTB 2RC8A 1AOVA 2HFBA 1MQJA 3TFLA 5CMMA 1OIBA 3IAZA 5JEIA 1UTBB 4MLVA 1TFDA 4F3SA 1DPEA 1SW1A 1JVYA 3A09A 3EHSA 3KJTA 2I3VA 4H67A 4KYDA 4DE8A 4IO7A 2OZZA 4ZDMA 4JB7A 1N7XA 1B1HA 4H1XA 3O2AA 1LBCA 3H6UA 1IUDA 1P1UA 2VOZA 4Q0CA 3K6WA 1JEUA 4MFIA 5A5XB 4R2FA 5DVIA 3KEIA 1B3FA 4C1TA 1P1WA 3FV2A 3ZSFA 4F39A 3T9HB 3TAJA 3OMBA 4I8CA 3FVOA 5B7DA 3IB2A 2O84X 4HS7A 4OFJA 3MBPA 3T9VA 5H8NB 3KSJA 2F36A 3IB1A 1BKAA 4LQ5A 1LFGA 3TEPA 1SW4A 4ZECA 5H8FA 1H44A 1GVCA 2XXYA 4LATA 4RNSA 2DQVA 4YZZA 2DVCA 5H8HB 4ISUA 1HSLA 3H6WA 2HEUA 1LCTA 2X7QA 3K4UA 2Q8JA 3TTRA 3LC8A 3O6IA 2XD2A 1BTJA 3QIMA 4KPTA 2X7PA 4KQPA 3C31A 2XXTA 3CG3A 3LSXA 3BKIB 3PPPA 3RLFE 4GVOA 4RA1A 3MZ9A 3PV0E 1O7TA 3C35A 3TQLA 4R6HA 4F1YA 5I2KA 1SI1A 3C4MA 3MW0A 3TPAA 3CFXA 4WKMA 3U72A 3KOTA 5IKBA 1B1XA 1M5CA 4BDLA 1L5TA 1MQGA 1H43A 3MP8A 5BWJA 3R6UA 4IO3A 2O69A 4Q30B 3GBBA 3PPQA 3V83A 1M5FA 1LAFE 3CSBA 3HO7A 3VLWA 1TFAA 4UA8A 1WDNA 3QXMA 4OXVA 3DLNA 2H98A 3MAMA 4FE8A 1JQFA 2THIA 5CI5A 1EZPA 3PGFA 4LQ2A 2RINA 3CG1A 1AH5A 4U21A 1ZKBA 1MXZA 5HM4B 2XXVA 1CB6A 5L9MA 4BDQA 3EN3A 3KN8A 3DP8A 5L9SA 4R74A 2GHBA 5I59A 2GFEA 1EZOA 4G4PA 4DLDA 5H8QB 3FASA 3GLBA 3V8XB 1IZ1A 4R6YA 3IX1A 1A8EA 2XX9A 3VFJA 2B65A 2OK2A 1H76A 3L6GA 1MY0A 4HCYA 1QKBA 1Y4CA 1MY1A 2HZLA 1XOCA 4LVQA 4OVJA 3SKPA 2F7CA 1NKXA 3UORA 3WAEA 1WVJA 4OETA 3MPLA 4OENA 1POY1 3P7IA 4FORA 4PETA 1ZBMA 3C32A 2V25A 4PFWA 3W9VA 1SYIA 4OHNA 4G68A 5KCJB 4EF2A 3K1NA 1MXXA 3OO6A 4Z7EA 4FAJA 3T9UA 3OO9A 2Q88A 2Y7RA 3DM0A 3KZGA 3LUYA 4DCYA 4PQJA 2I48A 2ZYNA 1N84A 1USYH 3GXAA 2HQ0A 4JSOA 4LZ8A 3RPWA 1USYE 4POWA 3MZ1A 1NNPA 4YB5A 3G3IA 4X48A 2P0SA 3PUXE 3RT8A 2H5YA 4GXSB 4MF3A 2R6GE 3PUWE 2B3BA 3R7XA 3RTWB 4P0GA 2AIXA 2F97A 3H03A 4WEPA 3RQTA 3TTMA 3CI8A 5H8HA 3G3GA 3G3JA 4RK9A 1HSEA 3S4UA 2QRYA 4YMAA 3S2VA 5I57A 1MPBA 4O3CA 2UVJA 2ZYMA 3DP4A 3FJMA 1PB7A 3VVFA 1A8FA 5H8NA 4QFNA 1NFTA 1MY3A 1US4A 4XKRA 3SEUA 2O6AA 3S9NC 1MS7A 3VVEA 2OJTA 3CFLA 5HBCA 1Y1ZA 1ZLQA 2Y7KA 4ZZAA 4F3GA 4FECA 1PDAA 4OMBA 4LUBA 5CMKA 3RN8A 5I56B 4DXUA 3ECRA 2XXIA 2D21A 4X9TA 4JBZA 3FGSA 4C0RA 4EXKA 1FQCA 3BBRA 5L8DA 4JSDA 3B7DA 3PD8A 1B5JA 1YCJA 4XKQA 3EQ1A 5FHMA 3RGYA 3TTKA 4FATA 3QSLA 3LSWA 2XXRA 5I2NB 2O7IA 3MVYA 3QAXA 3TMGA 4EQ7A 3S9EA 4LONB 1B6HA 4OFOA 4RPNA 2UVGA 3U92A 1IITA 4ZEKA 3K1MA 3IL1B 4RJZA 2CZLA 4IO4A 4MBPA 4YB6A 2WKYA 1FTOA 2G93A 2NOOA 4GF8A 1M5EA 3FIRA 4MLQA 4NF4B 5KDTA 2BJJX 1LB8A 4QHQA 3SEVA 1QVSA 2I6EA 2REGA 2F78A 1DTGA 3EPEA 4ZZEA 5M2VA 4AQ4A 5LOMA 2M8CA 2XXUA 3FVKA 3I6VA 3PPRA 1FQEA 3QK6A 3C33A 1FQDA 3MVZA 5DVFA 3S9MC 4U22A 1B5HA 1NH8A 3H4ZA 4U23A 4XTCQ 3GBAA 1R6ZA 3FZVA 3JZJA 3T96B 4ECFA 2D5WA 2O1LA 1OMPA 2R9JA 5K2XA 2O51A 2O68A 3Q25A 3A3UA 1AMFA 4NE4A 3KGCA 4NMYA 4QRZA 3VLVA 3ZKLA 5F7VA 4RY1A 3M3LA 4H8IA 3IJOB 4EUOA 3HHFA 1Y4TA 1BLFA 4IO6A 1B4HA 1SD3A 4XKPA 1NNFA 1FQAA 2DP8A 2OWSA 3TYHA 1B5IA 3KN3A 1FTKA 5I59B 4LZ7A 3B6QA 4BDOA 3UP9A 5L9OA 2ABHA 4GWOA 1F9BA 1LFHA 3SERA 5B70A 3KBRA 1M5BA 3Q29A 4DZ1A 3IB0A 2PBWA 4YKIA 2HAUA 3OELA 1SDXA 1JEVA 3KJ7A 1JW1A 2YPNA 3EHUA 4RYAA 3O9PA 5AA2B 4F1VA 4G2ZA 4YKJA 1MRPA 3UIFA 3K01A 4QFLA 1UIVA 2RCAA 2V3QA 3HPIA 4NF5A 5I58B 2GH9A 4R73A 3JYRA 3IOVA 4PE5B 5KZTA 2A5SA 1ELJA 1URGA 4JWXA 3T66A 1QUIA 3MP6A 1J1NA 3VV5A 4JXIA 1LGBC 1H3DA 4AB5A 1RYXA 2RC9A 4GIZA 4NF6A 3SDFA 1MM7A 3CRBA 4QSCA 4KFQA 2I49A 2O1MA 4FIMA 4O3BA 2DOJA 5FHNA 3U93A 3RNNA 3TDJA 2FYIA 4QF9A 3MPKA 4R6KA 5AA2A 1MDQA 5JTYA 1WODA 2V93A 3FV1A 1P1OA 2F6GA 2H25A 2QS1A 1GTKA 3IJXB 3IO6A 1B0HA 1I69A 3OEMA 1PEBA 5TPAB 5H8FB 2UVHA 4U4SA 4P0IA 3GZGA 4KD5A 4KYSA 3MC2A 4I1DA 1VSOA 5EYFA 3H06B 4EQ9A 2O7UA 2XX7A 3IO4A 1MXWA 2RCBA 1SI0A 2DE2A 1IXIA 2Y7WA 4WXJA 1YPNA 2IA4A 3TODA 4GLIA 3FVGA 4XXUA 2HAVA 5ISUA 3HCQA 3TTLA 3T93B 1B46A 4ZEFA 5CM6A 1DPPA 4LP2B 4ZEDA 2DSFA 4IO5A 3H7MA 4QFOA 4EDPA 4H0WA 2PYYA 3ZS6A 2AL4A 5CMCA 3C34A 1XHYA 4F18A 2D3IA 1A54A 1US5A 1NNTA 3IOUA 4F29A 3PPOA 4I62A 4NF8A 4NEDA 3OD7A 5CBSA 1MXYA 1UQWA 2VD3A 3PU5A 4YKKA 2ZNSA 2I4BA 2VD2A 2F35A 3O97A 3I3VA 2YLNA 1URSA 1Y3QA 1B52A 2ZMBA 1POTA 3TTNA 3U1OA 4ESXA 4P11A 3N6TA 1XVXA 4F1UA 5BUUA 5I57B 2I4CA 2XD3A 2OCUA 2W7YA 2DVZA 3M3FA 3PPNA 2DE4A 2QJEA 4GQOA 5AA4A 4G8MA 5JTYB 1BP5A 4WEDA 4H5GA 1B7UA 1S7YA 2G29A 4TLMB 1B40A 3G3FA 2Q2CA 2XXXA 1MH4A 3E13X 2HXWA 2IEEA 5FTIA 4YICA 2ONSA 1JVXA 1CE2A 1B58A 2I0BA 1B7HA 2ONKE 3ONMA 4U2RA 3UGWA 1SW5A 5IAIA 4U1OA 2Z8EA 2RC7A 5DTBA 4ELOA 3EHTA 3N6UA 4DCXA 2DE3A 3ILTB 3MWBA 3SEWA 3T22A 4TQUQ 2P2AA 1I6BA 3PUYE 4ZE9A 1TXFA 1XVYA 2YJPA 2QS4A 3B6WA 1FCKA 1Y1MA 3OSRA 2QS2A 4NF5B 1QUKA 4TLLB 3U8QA 5I58A 3O28A 1MXVA 1P1QA 2FA7A 4G68B 5KCJA 1B7ZA 1RYOA 1ZTYA 1VE4A 3LSFB 4RXLA 3CR9A 1LAHE 3FVNA 1PBPA 3IR1A 1OQHA 2Q89A 2Z8DA 3F11A 4XKNA 2Y7PA 1LFIA 3SEYA 4EQBA 4KHZE 5CBRA 4R2BA 5DT6A 2X26A 3CFZA 4IO2A 2FNCA 3K6UA 2RF1A 3D4CA 3PMVA 5I84A 1I6AA 1MY4A 2GHAA 1FTMA 4XIGQ 4HTGA 1LBBA 1O63A 1P1NA 2XXQA 4OERA 4KCCA 3O29A 2KLFA 4TOZA 3MZBA 4DIGA 3FD3A 4OZ9A 1ZIUA 3KN7A 4JWOA 3HSTA 1ATGA 3TUSA 2ZNTA 3G3HA 3U94A 2E0SA 4IGTA 4F31B 4IY5A 1VFDA 4HW8A 5DEXB 4POXA 2ANJA 3MUQA 1S50A 1B3LA 1EH3A 2ZXTA 4FEDA 2XX8A 4G8HA 2OBGA 3FUZA 1Z7NE 4Q8RA 2AL5A 4KYEA 1UTHA 3G7WA 1QJMA 4IGRA 3VXCA 1Y20A 2OWTA 3L6HA 1KWHA 2XXHA 3HN0A 1GV8A 4H65A 3TKDA 4GXAA 1M5DA 5CC2A 1RKMA 2QMWA 1OQGA 4YKPA 3LR1A 4JWYA 5A5XA 4U1ZA 4MH5A 3CVGA 3O66A 3KFMA 3O6GA 4F22A 1QULA 2Q2AA 4ZS9A 3JV9A 1IXCA 3VE1B 2REJA 4IY6A 4N13A 3RT6B 1MY2A 1O64A 4GOTA 1YAEA 3N26A 1NL5A 3TCGA 1UIUA 1Y3PA 2F7AA 2ZYOA 2UVIA 3H6VA 3VDFA 1DMBA 1GR2A 3S9LC 1D3KA 2B3FA 2DYXA 1D4NA 5DYHA 2UYFA 4GFRA 3KG2A 2PX1A 3SETA 2ALUA 2F8DA 1QW0A 1Q1KA 1R1NA 3KOSA 4L17A 5FHOA 4OWDA 3TCHA 4H8JA 3TZAA 4H6DA 1EU8A 1LSTA 1OVBA 2LAOA 2E1SA 5AA1A 1IXGA 1ANFA 1LB9A 4HCWA 5I2NA 3UN6A 1JNFA 4M4GA 4R9FA 5AA2D 3M3KA 1URDA 3BFUA 4ELRA 4EF1A 2F5XA 2H4IA 3LBSA 4H5FA 1DTZA 1MH3A 3K2DA 5TP9B 1FQFA 4F3BA 3QUJA 2ONRA 4U4XA 1B51A 1Z7ME 3RUMA 3O6HA 3UK4A 1PBQA 2DWAA 4PP0A 2GRVA 1MQDA 3IK6B 5I56A 3FJGA 3MVWA 3CIJA 2QSXA 1Q35A 2NUVA 2QPQA 3OO8A 2Q9TA 2XHDA 1N7WA 1N76A 2QMXA 3MQ9A 1I6QA 3BFTA 3QYTA 4PFUA 4R75A 5EHSA 3C36A 1Y9UA 3USDA 2UXAA 5ITOA 3K02A 3M8UA 5DVJA 5FTHA 1R9QA 1N3XA 5CMBA 4GL8A 4N6PA 2PT2A 3TQWA 3N94A 2P1SA 4N07A 1MDP1 1B0LA 2VP1A 1B9JA 2VGQA 5CRYA 2PMSA 4QSDA 4RPOA 2Z23A 1YTVA 1XT8A 3TCFA 1MPCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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