1QVSA

Crystal structure of haemophilus influenzae h9a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQAKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 111
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qvsA01
5I2NA 5AA2A 1D9VA 2WKYA 2E0SA 1Y9UA 1VFDA 3BFUA 2Y7WA 2DVCA 3K2DA 4LATA 1JW1A 1QUIA 3IB2A 1S7YA 4IO6A 4P0IA 1O64A 5ELVA 3PMVA 4YAHX 2UVHA 1TFAA 2Q88A 4ZEDA 4H0WA 1MS7A 1TFDA 3RT8A 4GRKA 2E1SA 4H1XA 3CFXA 5HBCA 4QSEA 4DXCA 3U72A 3IOWA 3RLFE 3RPWA 2AIXA 4U21A 5H8FA 3PD8A 3GBBA 3MZBA 3T93B 3MP8A 3DELB 2PX1A 5CC2A 3PMWA 4TOZA 3FGSA 4O3BA 1SYIA 2R9JA 3OOAA 4AB5A 1MPDA 1AL3A 3MBPA 3VFJA 4JSOA 5J1DA 3BFTA 1YCJA 2Z22A 3TZAA 1B58A 4ZE9A 3MQ9A 1N7XA 2G29A 2O51A 3TTRA 2V93A 3B6QA 4EUOA 2DXRA 4F2OA 3ZSFA 3KJ7A 1AMFA 1ZKBA 1FQBA 4H5FA 3O97A 4THIA 3B6TA 4OWDA 3FVNA 4IO2A 4IGTA 4O3AA 2YLNA 4OERA 3RTFB 4ZEBA 4PFYA 2VD2A 2ABHA 4FAJA 3S9LC 3A09A 3EN3A 5FHMA 4JWOA 5AA3A 4ELPA 4LZ5A 3O29A 3C32A 4HCYA 1FW0A 3T9VA 4JWXA 3LC8A 3N26A 4Q5TA 3T96B 2F7AA 3S9EA 4H8JA 1PBPA 4IO7A 4ZEIA 2G93A 1SI0A 4XKRA 5A5XB 5ITOA 4TLLB 1N7WA 3K0VA 3GZGA 3C9HA 2UVJA 3K00A 4QFNA 1I69A 3IAZA 4R75A 3MZ1A 3C36A 2O1MA 2Y7RA 3VV5A 3LR1A 5I58B 4DDDA 3FXUA 4ONYA 1Y20A 4QRZA 4MLVA 2OK2A 1MXZA 3M8UA 4NE4A 4JB7A 3TTKA 3VVEA 4QHQA 1JNFA 1A99A 5LOMA 2OJTA 5HM4B 3T9UA 1FQCA 2GRVA 1P1NA 3ZKLA 3N6TA 2XX7A 1B51A 4FE8A 2O68A 2QJEA 3O6GA 3TTLA 3TQLA 1TT1A 3FV1A 4MBPA 4WXJA 3VXCA 1I6QA 2VHAA 3R6UA 5K2XA 3ODBA 1XS5A 1Z7NE 2ZXTA 5H8SA 2O6AA 1MXXA 1M5EA 4ISUA 1M5BA 2QMXA 3UIFA 2ZNTA 1IXGA 4KQPA 1OVTA 2H5YA 4BDLA 2I0CA 2I48A 1XHYA 2B3BA 3IOTA 1MQDA 4DCXA 1MXWA 1GV8A 2RC7A 1MY4A 3O28A 3WAFA 2H9BA 3CFLA 4H67A 2F34A 4KHZE 1XT8A 3O66A 1MH3A 5IAIA 3RGYA 2ZYMA 1B2HA 4XKPA 1NH7A 2AL4A 1MY0A 5JTYB 5EHMA 1GTKA 5K2YA 2QS3A 1DMBA 4DLDA 5CMKA 2AYSA 1R6ZA 3T66A 4KCCA 3R26A 5FHNA 4PFWA 1H45A 1OMPA 5CMMA 2HXWA 1Y1MA 5H8QA 3W15C 3GLBA 2M8CA 3CG1A 4GXAA 2H98A 1H43A 2Q8JA 4GQOA 1LCTA 4ZZEA 5DEXB 2RINA 2HEUA 3E4RA 2XXPA 1QKAA 3KEIA 2F36A 4RY1A 2DP8A 4R72A 4WEPA 4YB6A 3HCQA 1JEUA 1IEJA 1SW2A 2BJJX 3V83A 1A54A 4P11A 4RK2A 3JZJA 4KYSA 4ZEFA 1N3XA 4F1UA 1J1NA 1UIVA 3PD9A 1POTA 3RN8A 3HHGA 4EQ7A 5I59B 4U1OA 3CFZA 5H8HA 3L6HA 5AA1A 5I2KB 4DE8A 1IXHA 4ZE8A 2RC9A 4GXSB 3OD7A 2DWIA 3H6TA 4H65A 3TKDA 3MW0A 1BP5A 1ZTYA 3EQ1A 5EHSA 5KZTA 1DTGA 3PPQA 3FVOA 5DTBA 3JV9A 2V25A 3RQTA 2I4CA 4QSCA 1OQGA 5DVIA 2XXUA 2XXQA 1B3LA 1YAEA 3K1PA 4AQ4A 3VDFA 2V3TA 4MH5A 3CVGA 4GF8A 1M5DA 4WEDA 2O7UA 4QF9A 2DWJA 2XXHA 3O6IA 3TCHA 1PEBA 1RKMA 1QJMA 1NKXA 2XX8A 3H03A 3PPPA 1L5TA 3D4CA 1NMUA 3CRBA 3MUQA 3ZS6A 4QFPA 4NF5B 1LCFA 1VFEA 2RKMA 1BTJA 4XKQA 4G68B 2F8DA 3UK4A 2ANJA 4OEVA 1AIVA 4R6KA 3TTMA 4I1DA 3ECRA 3G3FA 1UTBA 3IB0A 4NEDA 2FNCA 1O63A 2HAUA 1SVXB 3L6GA 2R6GE 4OXVA 1S9TA 3FJ7A 3PUXE 4JXIA 4KFQA 5L8DA 2OCUA 2H4IA 4LZ7A 2X7QA 4G8NA 1Y3NA 3K6VA 2REGA 1B3GA 1USYE 4M4GA 4OMBA 3MP6A 2O69A 5TPAB 3GXAA 4G2ZA 4KYEA 4BLAA 3T9XB 3FXQA 3OO9A 1WVJA 2GH9A 2DXYA 3TEPA 3I6VA 3BBRA 3MVYA 1P99A 2REJA 4DXUA 1FTKA 1IUDA 4G4PA 3VLVA 1SBPA 4N13A 4EXLA 3K6UA 3K02A 3G3IA 1Y4TA 4XIGQ 4LONB 3VLWA 3TTNA 3K6XA 1I6AA 1LFGA 1NNPA 2OWTA 3H6WA 3HO7A 4U4SA 1Y3PA 4R74A 2I4BA 3C34A 4R9GA 1MDP1 3KGCA 3P7IA 2UVIA 4ESXA 4ELRA 5EYFA 1LLSA 1H44A 2HAVA 3ILUB 1HSEA 3CSGA 2NVUB 1YTVA 1ZBMA 4YICA 3D4GA 1VE4A 1JW5A 3K1NA 2ALUA 2F97A 1JVYA 1QW0A 1DPPA 3G3GA 3CG3A 4JBZA 4F29A 5L9OA 4LVQA 3N94A 1USYH 3N5LA 4R9FA 3VE1B 5ITPA 5CM6A 1TWYA 1B1XA 5CMCA 3W9VA 3ZKKA 4F18A 1S50A 2DQVA 2I0BA 3BKIB 2FA7A 4F3BA 3FATA 3OSQA 1B4ZA 1ZU0A 3IO4A 3MVZA 4IO5A 3ONMA 4G77A 3OMBA 3FJMA 2V3QA 1VR5A 4KI0E 3MC2A 4UACA 3TODA 1PB9A 3K6WA 1MY2A 1B4HA 4N07A 1QUJA 4GFRA 1B7ZA 2Y7KA 4M1VA 1II5A 4Q0CA 5H8NB 1AOVA 1A55A 1MRPA 1JVXA 2RC8A 2DWHA 3G7WA 2R71A 4FJPA 2I49A 1LBCA 1FCKA 4EQBA 2F6PA 4NF8B 3SEYA 3C33A 1Z7ME 3USDA 1B32A 2YJPA 3Q25A 4NF6B 4RK9A 3MAMA 3TELA 1ZMGA 3C31A 3FV2A 4BDOA 5BUUA 3JYRA 4ZS9A 1BLFA 1P1UA 1Y4CA 3E3KA 4RPNA 3T22A 4ELQA 4IB2A 5AA4B 2P2AA 3IOVA 4IO3A 3M3KA 2H99A 3VLUA 1H3DA 1JEVA 1IITA 2PMSA 5A5XA 2PYYA 1MPCA 1B46A 2IA4A 2P0SA 1MQHA 1B5HA 4C0RA 4POXA 2F5XA 5I58A 1F9BA 5KCJB 2QMWA 1MY1A 4MF3A 3V89B 1EZOA 4BDQA 3W9WA 4Q30B 2F7BA 3I3VA 4R6YA 2VP1A 4OZ9A 1B0HA 2VD3A 3K1MA 4WKMA 2OBGA 4GD5A 5I57B 3KJTA 4NWCA 1MPBA 1SYHA 5KDTB 2DOJA 4F3PA 1B05A 4FATA 3FXRA 4FECA 3OEMA 4H6DA 1MH4A 1URGA 4EQ9A 4JSDA 5AA2D 1MM7A 1R1NA 2O84X 5CBRA 3OSRA 1WDNA 2Q2AA 5I57A 2QPQA 1NNTA 1DSNA 5I56B 4IO4A 2F6GA 3S9NC 3SETA 3VVDA 2Q89A 3H3GA 1EH3A 4GIZA 3A3CA 1B3FA 1UTHB 2I6EA 3TQWA 3U93A 5TP9B 1PBQA 4GOTA 2HQ0A 4R2BA 4YKIA 2O7IA 2XXYA 4OETA 3TYHA 4JWYA 4X9TA 5JTYA 3Q26A 2A5TB 2UXAA 1FQFA 2THIA 4G8MA 1EZPA 3TDJA 1B6HA 3IO6A 3MWBA 1GGGA 2ZYKA 1BKAA 4DZ1A 1MM6A 1XVXA 1IXIA 2ZYNA 3O6HA 1LAGE 3PGFA 3RTWB 4PP0A 3PUVE 1IIWA 1HSLA 1LB8A 2DE3A 3S2VA 1URSA 1N84A 4IY5A 3SKPA 4F31B 1VSOA 4NF4B 3FD3A 3DP6A 4ZECA 3QXMA 1NH8A 2GHAA 3H7MA 3CIJA 1QVSA 3H6VA 5DEXA 3IORA 1D9YA 3TMGA 3LSFB 4GWOA 3KOSA 4KD5A 1A7LA 4G8HA 1LGBC 2O1LA 4OVJA 2PT1A 4NF4A 4XXUA 3HPIA 4IY6A 4OEUA 1IZ1A 2F78A 3PUWE 1LSTA 3MJNA 5I59A 4MFIA 4TLMB 2XXWA 5I2KA 2DS9A 2HCAA 4Z7EA 2NWJA 5AE4A 1LBBA 4X1BA 3IJXB 5ICTA 3KOTA 1R9LA 3MPKA 3PMXA 2Q2CA 2ZNUA 3HN0A 4QFLA 4OQOA 4RPOA 1SI1A 4U4XA 3F11A 4Z0IA 1ZLQA 1Y1ZA 4KCDA 1NFTA 4ZDMA 3QSLA 3EF7A 3LBSA 2F7CA 4QFOA 3G3JA 1P1OA 1QUKA 1LB9A 1MXYA 4BDRA 1A8EA 2ZMBA 2DYXA 1PC3A 3OEKA 3PUYE 1FTLA 1EU8A 1XC1A 1SW4A 2ONKE 3MPLA 1DPEA 4X1DA 3RY3A 4ND9A 1ZIUA 1JQFA 2ONSA 3SEWA 4OFLA 4EDPA 3QAXA 1DTZA 1B3EA 2DE2A 3MVXA 4YB7A 5FTIA 2H25A 3DLNA 4NF5A 2ESNA 4G68A 2XXVA 4PE5B 3TCFA 5M2VA 4YU0A 3QIMA 3HSTA 1ZJLA 1LFHA 4TQUQ 5I2NB 1Y3QA 2CZLA 3FUZA 3V8XB 1M5FA 3WAEA 3FZVA 3QUJA 1FTMA 2DWAA 4I62A 4FIMA 5IKBA 4KYDA 3C4MA 3TFLA 5TPAA 1D4NA 4YMAA 3OO8A 4NWDA 5DVFA 1T0KA 1YPNA 4LUBA 3QUFA 4I9DA 4F1VA 2HZKA 1B5IA 1QKBA 1P1QA 1N04A 3SEUA 4F1YA 1RYXA 1OLAA 4JDFA 5CMBA 5CBSA 5F1QA 4H8IA 3EHTA 3HV1A 3GBAA 2W7YA 5B7DA 3SERA 4BDNA 3I5OA 3A3UA 2XXRA 5B70A 5H8FB 1DOTA 1WODA 3T9HB 1EZ9A 4BDMA 5DYHA 2D3IA 1ELJA 4U1ZA 2Y84A 2Y7IA 3UN6A 4HTGA 4GVOA 1SW5A 4POWA 4E0XA 4YKPA 3EHUA 4L17A 4MLQA 5I84A 4ECFA 1MXVA 4EF1A 4X48A 4LQ5A 1NNKA 1MG1A 3QK6A 3M3LA 3MP1A 3OO6A 4YKKA 1M5CA 2XHDA 2XXXA 2XXTA 4YMBA 4OFOA 1FTJA 3EHSA 4GL8A 3KG2A 2V84A 1I6BA 3OENA 3K4UA 1R9QA 3LSXA 1RYOA 4NTLA 4QSDA 5JEIA 4RJZA 5L9MA 4ZZAA 5JK4A 4OYVA 1Q1KA 3SDFA 3B6WA 4LA9A 4F3SA 3IL1B 1PB7A 4DIGA 1SD3A 1SQYA 3EPEA 1JETA 4FEDA 3N6UA 5DVJA 4RNSA 4OTEA 2OLBA 3PUZE 1ATGA 2Y7PA 2HFBA 4DXBA 4LQ2A 3UGWA 2XD3A 5H8NA 1CE2A 2Q9TA 1GVCA 1B5JA 1MQJA 2PT2A 4RXLA 2VOZA 5ICQA 2X7PA 3IK6B 2I3VA 4NF8A 3U8QA 4U23A 2XXIA 4C1TA 1HSJA 2PBWA 1OQHA 4NF6A 2XD2A 3OELA 3UP9A 1A8FA 4AB6A 4YB5A 1US5A 3IR1A 3UA8A 3LUYA 5AA4A 4R2FA 3KN7A 3CSBA 4H5GA 4UA8A 1B0LA 2I58A 1POY1 2Z8EA 5ISUA 4HCWA 3IOUA 4LZ8A 2XX9A 2QRYA 4YKJA 3HHFA 4HW8A 1TXFA 2X26A 3SESA 4P0GA 2OZZA 4RA1A 3TPAA 3H6UA 5KCJA 2PVUA 1B3HA 1US4A 1OIBA 3Q28A 4EXKA 1GR2A 3RNNA 2RF1A 4OFJA 2QS2A 1NL5A 3VVFA 3OXNA 3KN8A 1NNFA 1P1WA 3U94A 3KN3A 5L9SA 5KDTA 2D21A 2NUVA 4XKNA 3S4UA 3E9XA 3E13X 3R7XA 5HPQA 2LAOA 2F35A 4KPTA 5F7VA 2DVZA 4FEBA 1QULA 1LFIA 4ELOA 3KBRA 3RUMA 4FORA 2ZNSA 5I56A 2RCBA 5H8QB 4QFKA 3V5AA 2P1SA 2IEEA 2DE4A 2NOOA 1OLCA 1MDQA 4R73A 1XOCA 4F19A 2Z23A 2KLFA 2V3UA 1SW1A 3TUSA 1SDXA 4I8CA 1UTHA 3LSLA 3PPOA 3QYTA 1MY3A 3FVGA 3THIA 2Z8DA 4PQJA 1LAFE 2ZYOA 5DT6A 5TP9A 1KWHA 2VGQA 1Q35A 3CI8A 3G3HA 1MXUA 1B9JA 4ESWA 3UORA 2A5TA 3H06B 3PV0E 1N3WA 2QS4A 1URDA 2B3FA 3Q29A 4ZEKA 1MQGA 5H8HB 4K3FA 4N6PA 3KZGA 2GFEA 2A5SA 3IB1A 3DM0A 4F22A 4F3GA 5CRYA 1B40A 3ILTB 4OENA 2NXOA 4PFUA 3PU5A 1AH5A 4GL0A 1A40A 4F2QA 2B65A 1PDAA 4KR5A 4Q8RA 2DSFA 3S9MC 2QS1A 5FTHA 2HZLA 3C35A 3DP4A 3DP8A 1PB8A 1IXCA 3OO7A 3H4ZA 3PPRA 1IQ7A 2UVGA 3RT6B 2Z8FA 4O3CA 2D5WA 3K01A 3FIRA 2UYFA 3IX1A 1XVYA 4R6HA 1D3KA 1FTOA 3TCGA 1B7UA 3SEXA 4E0WA 4LP2B 2QSXA 2I3WA 1MQIA 1N76A 3SEVA 1LAHE 1FQAA 1LAXA 2AL5A 3O2AA 3M3FA 3CR9A 1UTBB 4IGRA 1FQDA 4NMYA 3FJGA 5BWJA 3U92A 3B7DA 1B52A 4EF2A 1BIYA 2YPNA 1O7TA 5CI5A 4XTCQ 3MZ9A 5TU0A 4G68C 1OVBA 3TAJA 3PPNA 2FYIA 4U22A 2UYEA 4RYAA 3KSXA 3G3KA 3KSJA 3O9PA 1FQEA 4YZZA 1UIUA 4OHNA 4OESA 2OWSA 4PETA 1UQWA 3Q27A 4GLIA 4DCYA 3AXFA 4U2RA 3FVKA 5AA2B 4PFTA 3U1OA 4F39A 3KFMA 1B7HA 2GHBA 2RCAA 2CMOA 1H76A 5FHOA 1B1HA 4C1UA 1N0TA 3LSWA 3IJOB 3VXBA 2QL3A 1CB6A 1JW4A 4HS7A 1ANFA 3MVWA 3FASA 2ONRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I2NA 2FBPA 5AA2A 1D9VA 2WKYA 5FBPA 2E0SA 1Y9UA 1VFDA 3BFUA 2Y7WA 2DVCA 2QVVA 2FIEA 3K2DA 4LATA 1JW1A 1QUIA 3IB2A 1S7YA 2F3BA 4IO6A 4P0IA 1O64A 5ELVA 3PMVA 4YAHX 2UVHA 1TFAA 2Q88A 4ZEDA 4H0WA 2R8TA 1MS7A 1TFDA 3RT8A 4GRKA 2E1SA 4H1XA 3CFXA 5HBCA 4QSEA 4DXCA 3B50A 3U72A 3IOWA 3RLFE 2XWOA 3RPWA 2AIXA 4U21A 5H8FA 3PD8A 3GBBA 2WBDA 3KC0A 3MZBA 3T93B 3MP8A 4XFEA 3DELB 2PX1A 5CC2A 3PMWA 3ISPA 4TOZA 3FGSA 4O3BA 1INPA 4N91A 1SYIA 1KA1A 2R9JA 3OOAA 4AS4A 4AB5A 1MPDA 1AL3A 4PBHA 3MBPA 3VFJA 4JSOA 5J1DA 3BFTA 1YCJA 2Z22A 3TZAA 1B58A 4AS5A 4MIJA 4ZE9A 3MQ9A 1N7XA 5A5LA 2G29A 2O51A 3TTRA 2V93A 3B6QA 4EUOA 2DXRA 4F2OA 3ZSFA 3KJ7A 1AMFA 1ZKBA 1FQBA 4H5FA 3O97A 4GX3A 4THIA 2DDKA 3B6TA 4DI3D 4OWDA 3FVNA 4IO2A 4IGTA 4O3AA 1IMEA 2YLNA 4OERA 3RTFB 4ZEBA 4PFYA 3E79A 2VD2A 4OANA 4MEVA 2ABHA 4FAJA 3S9LC 3A09A 3EN3A 5FHMA 4JWOA 5AA3A 4ELPA 4LZ5A 3O29A 4N8GA 2MKZA 4GBWA 1EYIA 3C32A 4HCYA 1FW0A 3T9VA 4GBVA 4JWXA 3LC8A 3GYYA 3N26A 4Q5TA 3T96B 2F7AA 3S9EA 4H8JA 1PBPA 4IO7A 1XI6A 4ZEIA 2G93A 1SI0A 4XKRA 5A5XB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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