3FJMA

Crystal structure of phosphate bound peb3
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Campylobacter jejuni
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 83
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fjmA02
1ZU0A 2PYYA 4DCXA 4F19A 2XXTA 1A8FA 2XXUA 1NL5A 3W9VA 3CG1A 1EZPA 3O28A 3T22A 4G8NA 2XXXA 3U1OA 2V3TA 4QFLA 2DVCA 1A55A 3DP4A 3K1PA 1B3GA 1Z7ME 4DIGA 3Q25A 1MPDA 4BDQA 1N7WA 2Y7IA 4GF8A 2QSXA 4PE5B 5I2KB 2V93A 5I2NA 3GXAA 5HM4B 1MM7A 5H8FB 1LCTA 2QPQA 1LB8A 4LP2B 3VLUA 1RYOA 4P0IA 4G68B 1N3XA 3TEPA 1UTHB 2ZYKA 3PUWE 4Z7EA 3G3HA 4OFJA 1UIUA 2ZYNA 2OK2A 4POWA 1LAFE 1SW1A 1I6AA 3UGWA 1TWYA 4GFRA 1FQDA 1I69A 4QRZA 4F3BA 4WXJA 5ITPA 3QAXA 3L6HA 4OHNA 4EF1A 5CMCA 4RY1A 2DWIA 3PU5A 2H9BA 1MY4A 4QF9A 5AE4A 3R6UA 1FW0A 3IJXB 3O6GA 3T9UA 1N84A 1M5CA 2Y7RA 3DLNA 4ESWA 1ANFA 4G8HA 3S4UA 3PMXA 1WODA 2XX7A 2OWTA 4NF5A 2R9JA 2ONSA 1FQFA 3W15C 3M8UA 5AA4A 3T96B 3DP6A 4EQ7A 4H1XA 2Z8FA 4G68C 4I1DA 4YB7A 4H67A 3LSFB 1MY3A 4Q8RA 4JWYA 1VR5A 1LAXA 2DOJA 1YTVA 5H8QA 3OSQA 1UTBA 3HV1A 4KI0E 5DYHA 3SDFA 3LC8A 1USYH 2QJEA 3RY3A 4R72A 2Q88A 4XXUA 4IGTA 4HTGA 2H99A 3BBRA 2I4BA 3FD3A 3S9MC 4QFPA 4RPOA 2RC7A 4FJPA 3H6UA 3RPWA 4LVQA 3FVOA 1POY1 5JTYA 3TCGA 2WKYA 4U4SA 4RNSA 1ZJLA 2F34A 4GL0A 5CMMA 1XT8A 3EN3A 2XD2A 2DWHA 3TKDA 4P11A 3U94A 5AA3A 1CE2A 3PUZE 5I58B 5DVJA 4ZEDA 2O51A 1A40A 4ELRA 1LCFA 3K00A 2Y7WA 3FGSA 3PUXE 5I56A 3A3CA 3FJGA 5M2VA 4TLLB 4F31B 2VD2A 3PPQA 2ONRA 4FEBA 2O7IA 4TLMB 3E13X 3H7MA 3H06B 3H6WA 4OZ9A 1QVSA 2ZNUA 1IIWA 1URDA 5K2YA 3MBPA 4YICA 4IO3A 4ELPA 4OFLA 2NOOA 5TP9A 1LAGE 4HW8A 4IB2A 2A5SA 4YZZA 2ZYMA 2GRVA 2ALUA 2Z22A 3QK6A 3MVYA 3EF7A 1LFIA 2QL3A 1P1NA 4HS7A 1B6HA 3OEMA 4ZE8A 3UK4A 5I57B 4I9DA 2X26A 4G2ZA 5ISUA 4F29A 1OQHA 4DXUA 1PBPA 3U92A 3CG3A 2KLFA 4DXCA 2VOZA 3KN3A 3V89B 3QSLA 1MDP1 5DT6A 5H8HA 1DOTA 2RCBA 3IR1A 3K1NA 3C32A 4OETA 2NWJA 2PT1A 1POTA 1MY0A 2DQVA 2XD3A 1UQWA 1EZOA 4X1BA 1B05A 5F1QA 3VVDA 2ONKE 1JETA 3SEVA 3EHTA 4R73A 1D9VA 5CMKA 2DYXA 2ESNA 1LBBA 3H4ZA 1B32A 3K0VA 1MXYA 1PB9A 4R2BA 3UN6A 3B6WA 1YAEA 3H6TA 2PBWA 3MZBA 4ZEFA 1H76A 4NF8B 5I2KA 5DVFA 2I4CA 1B1XA 4OERA 3R26A 5H8FA 4FEDA 4G68A 4GXSB 3FVNA 4FORA 1UTHA 3MP8A 4U2RA 4M1VA 5EYFA 1J1NA 1D3KA 5HPQA 1MDQA 3HO7A 3MPKA 3MZ1A 3MPLA 2UVGA 1R9LA 3KOSA 1BIYA 1MY1A 2UYFA 3FJ7A 1NNTA 1D4NA 4QFKA 4BDNA 3RUMA 3QIMA 3E3KA 3B6TA 1NH8A 2H25A 2QS2A 1FTOA 1TFAA 1PDAA 4F2QA 4GQOA 3PV0E 1RKMA 1LFHA 2GHBA 2P1SA 3P7IA 4KCCA 5L9OA 4EDPA 3MP1A 4OTEA 4DZ1A 1LFGA 1QUJA 4KPTA 5I59B 3R7XA 1JW5A 2HAVA 1US5A 1II5A 1VFDA 2G29A 1ELJA 3HPIA 3OENA 4O3BA 1NH7A 2Q8JA 1IXCA 2NXOA 5F7VA 2V25A 1Y4CA 1SD3A 4JXIA 3TZAA 1IZ1A 1QULA 3T93B 2HXWA 1DTGA 1M5BA 2XHDA 4UA8A 3OSRA 2PVUA 3PPOA 2RKMA 3FASA 3VE1B 1ZKBA 3UORA 3LUYA 2R71A 1B5HA 3KG2A 3BFUA 1B5IA 4XKNA 5AA1A 4ONYA 2PMSA 2PX1A 3G3JA 3FXQA 4QFOA 4ZS9A 4X1DA 4YKIA 1B7ZA 1PEBA 2I3WA 2REJA 3T9VA 3O6HA 1P1WA 3FV1A 3B7DA 2VHAA 1JEUA 1TT1A 3O66A 4ZEIA 3UA8A 5CRYA 3MAMA 2QS4A 1SW5A 1MQDA 2I49A 3TTNA 2XXHA 1WVJA 5FHMA 4ZEBA 4MBPA 1MY2A 5I58A 2DWAA 1PBQA 2ZYOA 4EF2A 1F9BA 4FAJA 1URSA 2DS9A 2O1LA 5HBCA 3K1MA 4O3CA 1ZLQA 4JSOA 4GRKA 2ZMBA 1M5FA 4NMYA 1ATGA 3B6QA 4O3AA 1DMBA 4E0WA 1LLSA 4QFNA 2Q2AA 2ANJA 3CFZA 1FQAA 4C1TA 1N3WA 4ESXA 4JBZA 2VGQA 3Q27A 1PC3A 2OBGA 4H6DA 1BKAA 3EHSA 3PD8A 5B70A 1FTLA 3MWBA 3LBSA 3K6WA 1AIVA 2F78A 1JEVA 3KSJA 4THIA 4X48A 2ABHA 3PPNA 4MFIA 2F36A 3F11A 2X7QA 5KCJB 3RTWB 5TPAB 5I57A 3KJTA 3OEKA 3TELA 1IUDA 1MS7A 4N13A 2XXWA 3IB2A 5CBRA 3S9EA 2NUVA 3C9HA 1B3FA 3IB0A 4JSDA 3S2VA 4KHZE 1B3HA 3ECRA 3TCHA 1P99A 4R6HA 3O6IA 4JWOA 2D3IA 4R6KA 3SESA 3CR9A 3SEXA 3RN8A 2Q9TA 3PPRA 1PB7A 4U21A 3N5LA 1SI0A 3OMBA 3OO7A 4RYAA 3TTLA 3U93A 4WKMA 1B3LA 1WDNA 4POXA 3T9HB 3TFLA 1B5JA 4G8MA 4ECFA 4NF8A 1JW1A 4K3FA 3TTKA 1O7TA 5L9MA 2XXRA 3VFJA 3KFMA 5CBSA 1URGA 1FQBA 3PUVE 1MQIA 3CIJA 4PQJA 3G3IA 1OVTA 2QS1A 4PFUA 2YLNA 5KZTA 1EZ9A 3SEYA 3IAZA 1XHYA 3OOAA 4KYEA 1MPCA 4YB6A 2IEEA 2REGA 1N04A 1SYHA 4MLQA 2I6EA 5H8NB 2V3QA 2FNCA 3ZS6A 1R1NA 4IO5A 5A5XB 3K01A 2O68A 2CMOA 5DEXB 1AL3A 1MXUA 1B1HA 4H65A 2V84A 3D4GA 3L6GA 2XXVA 1ZTYA 3DP8A 4OYVA 3FXUA 5I59A 2Z23A 3A09A 3VXCA 3E9XA 5CC2A 1IXIA 3C34A 3M3KA 4TOZA 3IL1B 4NWCA 2GFEA 3E4RA 4EXLA 3MUQA 4U23A 2YPNA 4NWDA 2QS3A 4BDLA 4HCWA 3BFTA 5K2XA 3U72A 3IOVA 3WAFA 1XVYA 2B65A 1I6BA 2Q2CA 3FIRA 1SW4A 1H43A 3KZGA 1YPNA 1MXZA 3QUFA 2O7UA 2IA4A 3S9LC 1B3EA 1O64A 2DE3A 1OLCA 1XOCA 4GL8A 2B3BA 5J1DA 4IO6A 3OO9A 3MJNA 1Y9UA 1OLAA 4UACA 3RQTA 3TQLA 3RTFB 1VSOA 4FIMA 1GR2A 3CVGA 2FA7A 4U1ZA 4L17A 4G4PA 3MVWA 2Y7KA 3A3UA 4F3PA 4P0GA 4F3GA 5L8DA 3K2DA 1P1OA 3N6UA 4LQ5A 1B7UA 4YMAA 5KDTB 4OFOA 5JK4A 5FHOA 3LR1A 4IGRA 1SDXA 4F39A 4KCDA 2OLBA 3TPAA 1XC1A 4HCYA 3JZJA 2LAOA 3OO6A 2QRYA 4OEVA 3KN7A 4N07A 1FTMA 4PP0A 4H8IA 3MVZA 1S50A 3RGYA 1MQJA 4ELOA 5ICQA 1NNPA 1MH3A 4R2FA 1QKAA 5EHSA 3I3VA 3USDA 4DDDA 4QHQA 1B46A 1Y1MA 1LAHE 5CM6A 4OXVA 2O1MA 1RYXA 2I3VA 3LSWA 5EHMA 1JW4A 4Q0CA 4ND9A 2HAUA 2QMXA 4OWDA 3O97A 1B0LA 4OVJA 3IOTA 4E0XA 1MQGA 4LONB 3PMVA 4F2OA 1AH5A 2A5TB 5KCJA 5TPAA 1US4A 3FZVA 5ITOA 2UYEA 1Y3NA 3FATA 1A54A 4YKPA 3IX1A 1VE4A 3PGFA 1NNFA 3Q28A 1S9TA 3TODA 1ZIUA 3HN0A 4C1UA 5TU0A 2NVUB 4FECA 1EU8A 4ZZEA 3ONMA 1D9YA 3ZKLA 1H3DA 4G77A 4C0RA 3OO8A 1QJMA 3U8QA 4R9GA 2VD3A 3HSTA 3ZSFA 3K02A 3OELA 3CRBA 1B0HA 4BLAA 4TQUQ 4ELQA 4F22A 1A7LA 1CB6A 2G93A 4DLDA 5I84A 2HZKA 4GLIA 2XXYA 2DSFA 3TUSA 4AB6A 3RT8A 1B52A 2VP1A 2E0SA 1BP5A 5AA2B 3IJOB 2I0CA 3M3FA 4KYSA 1GTKA 3DM0A 4I8CA 2XXPA 1JVXA 5DVIA 3IK6B 3WAEA 3SEUA 1Z7NE 2P2AA 4H5FA 2RC9A 1UIVA 2UVIA 4YAHX 4FE8A 3QXMA 4KD5A 2DWJA 1SBPA 4XTCQ 1HSEA 1S7YA 2GHAA 4LZ7A 3AXFA 3GBBA 5H8NA 2UVHA 3FVGA 4YKJA 1FQCA 3DELB 1EH3A 4LZ5A 2AL4A 4AQ4A 5A5XA 5DEXA 1GV8A 3HHFA 5DTBA 2Z8DA 5IKBA 4NF6B 2AL5A 1N76A 4LA9A 4QSCA 1Y1ZA 2GH9A 4Q5TA 3S9NC 1LB9A 3N6TA 3PUYE 3KBRA 2OCUA 3TYHA 3PD9A 4YKKA 1R6ZA 1SQYA 4NTLA 4JWXA 1NMUA 3MP6A 2UXAA 3K6VA 4F18A 1MXXA 1MXWA 2RINA 2P0SA 1SW2A 2W7YA 2BJJX 4RJZA 4H5GA 3ILTB 3G3KA 1SI1A 3KSXA 1NKXA 4EQ9A 2DXRA 3MC2A 3O2AA 3V83A 3IB1A 1GVCA 4ZECA 5H8SA 4WEPA 3SETA 4BDOA 1OMPA 3VDFA 3FUZA 4FATA 2Y7PA 4MH5A 3MZ9A 1QUIA 2RC8A 2Y84A 4GIZA 3GBAA 3KN8A 2F8DA 4QSDA 4BDRA 5CMBA 4U22A 3O29A 4OESA 4RA1A 3RLFE 2DVZA 1AOVA 4OMBA 1H45A 2F6GA 3GLBA 2QMWA 2H5YA 1ZBMA 5KDTA 3KJ7A 2D21A 4ZEKA 2XXQA 1L5TA 3IORA 1MH4A 3QYTA 3TCFA 3H3GA 2HFBA 2Z8EA 3CI8A 5ICTA 4DXBA 3CFLA 1GGGA 1NFTA 1ZMGA 4LZ8A 3VVFA 2I58A 1KWHA 3ZKKA 2DE4A 4QSEA 2H98A 1FTKA 3HHGA 3RT6B 2HEUA 3GZGA 3Q29A 2AYSA 2R6GE 1YCJA 1JQFA 3CSGA 3RNNA 1Y3QA 3T9XB 2F35A 1P1UA 4ISUA 4XKQA 2OJTA 3UIFA 1MG1A 4KR5A 3G3FA 4WEDA 4PFTA 2O69A 1B58A 2B3FA 4F1VA 3QUJA 1I6QA 4H0WA 2D5WA 2A5TA 3K6XA 2DP8A 1IITA 5LOMA 4M4GA 1USYE 4IO7A 3FVKA 3PPPA 2OWSA 4NF4B 3ILUB 4MF3A 2CZLA 4OEUA 3TQWA 3JYRA 3VLVA 4GOTA 2H4IA 4LATA 4H8JA 3TDJA 3C33A 4I62A 2RF1A 4YU0A 1Q1KA 1FQEA 2THIA 4DCYA 2XX9A 5BWJA 2F6PA 1LBCA 3N26A 3EPEA 4AB5A 1MM6A 2ZNTA 1FTJA 5I2NB 3TTRA 4R74A 4IY6A 1B40A 5L9SA 3VVEA 4RK9A 3EHUA 5AA2A 1N7XA 4Q30B 1B2HA 4GVOA 4IY5A 3H03A 3FV2A 1LSTA 4KYDA 3BKIB 1DSNA 4GWOA 3MQ9A 4LQ2A 4EQBA 1PB8A 1O63A 3VLWA 3TMGA 4OENA 3W9WA 2AIXA 4IO2A 2PT2A 4BDMA 1VFEA 4OQOA 3FXRA 3C36A 1NNKA 1XS5A 3O9PA 2DXYA 2F97A 2HQ0A 1LGBC 3VV5A 3OD7A 1QW0A 5ELVA 4GXAA 1DPPA 4LUBA 3KOTA 1JNFA 1M5DA 2I48A 4NF6A 3TAJA 4RXLA 3C31A 1FCKA 3SEWA 1B4HA 3MW0A 3I5OA 2OZZA 3VXBA 2F7AA 3IOWA 4NF5B 1M5EA 4JDFA 4XIGQ 4F3SA 5JEIA 1QKBA 5CI5A 5AA4B 2ZNSA 2HCAA 3Q26A 5FTHA 1P1QA 1SVXB 3V8XB 2M8CA 3SKPA 3FJMA 4PFYA 4F1YA 3THIA 1HSJA 2V3UA 1A8EA 2F7CA 3SERA 5H8QB 1AMFA 5B7DA 4RPNA 1UTBB 1MXVA 4NE4A 1MRPA 1BLFA 1B9JA 3ODBA 2I0BA 4R9FA 4KFQA 2XXIA 2DE2A 5AA2D 2HZLA 4X9TA 1MQHA 3IO6A 3C4MA 3K4UA 4IO4A 2X7PA 4KQPA 3M3LA 4U4XA 2ZXTA 4NEDA 5JTYB 3PMWA 4R6YA 2XX8A 3K6UA 1TXFA 1IXHA 1Y4TA 3KGCA 4Z0IA 2F5XA 4XKRA 4U1OA 4ZDMA 2RCAA 3HCQA 3T66A 1N0TA 3KEIA 1Y3PA 1Y20A 5IAIA 3IOUA 4PETA 2O6AA 2O84X 1H44A 2Q89A 3OXNA 5I56B 4ZZAA 1OIBA 1MPBA 4F1UA 3JV9A 1TFDA 4XKPA 1BTJA 2F7BA 1IEJA 3D4CA 3TTMA 1DPEA 2YJPA 1A99A 4YMBA 2FYIA 1SYIA 3EQ1A 1XVXA 4PFWA 5TP9B 1B4ZA 3V5AA 4ZE9A 2UVJA 4RK2A 3CSBA 3N94A 5FTIA 1HSLA 3LSLA 3CFXA 1QUKA 4YB5A 3LSXA 4MLVA 3C35A 1B51A 4DE8A 3I6VA 4EUOA 1IQ7A 3IO4A 3G7WA 1OQGA 4GD5A 1OVBA 5FHNA 4R75A 1IXGA 1T0KA 3MVXA 1Q35A 3G3GA 4NF4A 4JB7A 5H8HB 4EXKA 4N6PA 2E1SA 3H6VA 1DTZA 5BUUA 1R9QA 1B7HA 1JVYA 3UP9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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