3N6TA

Effector binding domain of tsar
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
publication title Structural studies on the effector binding domain of TsaR
rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 54
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA02
1B1HA 4YKKA 3AXFA 4TLMB 4THIA 3EHSA 2CMOA 3FV2A 4AB5A 3V89B 3CI8A 2PVUA 1TWYA 3PPQA 4RA1A 2RCBA 3VXCA 4DZ1A 1TFAA 3KJTA 3DP8A 2ZYMA 5I57A 3RNNA 5DVJA 4PFYA 4NF6A 3PUZE 5HM4B 3D4CA 3HCQA 4R75A 1UTBB 4Z0IA 1MM6A 2ZNTA 2Q2AA 3K6VA 3KFMA 1SW4A 4QSDA 4H5GA 5J1DA 1BKAA 3KOTA 1FW0A 2X7PA 2UYFA 4DDDA 4LVQA 3S9EA 2XXQA 4ZEDA 1BIYA 1OLAA 3CG3A 3F11A 4R9GA 3U94A 3ILUB 3FVOA 1MRPA 1AIVA 1O63A 3C34A 4BDOA 1RYOA 3T93B 5TU0A 3O29A 3USDA 2DSFA 5TPAB 2VD2A 1P99A 3O6IA 3OSRA 2PYYA 2HAVA 4KD5A 3H6VA 2V3QA 4G4PA 2P2AA 4F39A 3PMVA 4OMBA 3TODA 2DVZA 1D4NA 3H06B 3TCFA 3PUXE 3UP9A 1PC3A 2VOZA 5H8QA 1FQEA 4GL0A 4ZEFA 1ATGA 2QSXA 4U1ZA 3M8UA 5KZTA 2IEEA 1IIWA 4RJZA 2AYSA 4QHQA 1QW0A 3ECRA 4OZ9A 4QFPA 3C9HA 3OOAA 1SQYA 3DP4A 3TMGA 3MP8A 3TTLA 3KN3A 2F7AA 4BDQA 2HXWA 3IOTA 3TAJA 3CVGA 4U4XA 5EHMA 1OLCA 3K6WA 4WKMA 2Y7PA 1MS7A 3MZ9A 4O3CA 4R73A 2M8CA 2QS2A 3O2AA 1ZIUA 4H67A 4HCYA 3I6VA 2ZYOA 3PPPA 4JWXA 5ICTA 1F9BA 4N6PA 3MC2A 1YPNA 1Y3NA 5I56A 3IJOB 3UK4A 3DM0A 4GOTA 2I0CA 2D5WA 4KYEA 2I3WA 2H5YA 4ZECA 3L6HA 1MY2A 2ZYKA 3FVGA 4O3AA 1DTZA 2Y7KA 4ESXA 4TLLB 1RYXA 1SI0A 2PMSA 1I6AA 1IXIA 1QUJA 4ECFA 5L9SA 1TFDA 3UA8A 1GR2A 2GH9A 4P11A 2XX7A 1QULA 5CI5A 1GV8A 5HPQA 3FV1A 1SYHA 5KCJB 3TZAA 3T66A 2G29A 1EU8A 4NTLA 4K3FA 1B1XA 4GIZA 4QFKA 4QSCA 3C31A 2DQVA 2Y7WA 1MXUA 3PU5A 3K4UA 3KSJA 2P0SA 3HSTA 4ELPA 1MH4A 4GXAA 5BUUA 4Q0CA 4I62A 4G68C 1N76A 3K6XA 5CMKA 3ZSFA 1Z7ME 5I57B 3RPWA 4OESA 3KN8A 3MQ9A 1FQAA 3TFLA 2Z23A 1JEVA 3PD9A 1FTLA 3T9VA 3TELA 2A5TA 4U23A 3S9MC 1LB8A 3M3LA 3FJGA 1N3WA 3C32A 2ZMBA 3MJNA 4YMBA 1EZPA 3WAEA 3VLWA 1B4ZA 2ANJA 2BJJX 1UTBA 3MP1A 3DLNA 2F6PA 5DYHA 1A54A 1B2HA 5H8NA 2XXPA 3K02A 2ZNUA 3CR9A 4KFQA 1HSEA 3V8XB 1B4HA 2V3TA 1MY4A 3LC8A 4WEDA 1BP5A 2XXUA 2Z8FA 4PP0A 4H6DA 2Y7IA 3IO6A 1NNTA 5H8FB 1PBPA 3JZJA 2O1MA 4F31B 2XXVA 1ZTYA 1US4A 4RXLA 2D3IA 3JYRA 3GXAA 3TTNA 2XXRA 1IXCA 3IX1A 1B5HA 4EF1A 2THIA 3PGFA 2XX8A 3MPKA 1NNPA 1USYE 4QRZA 4KQPA 1SD3A 4FEBA 1QKAA 3SETA 2PT1A 4ZZAA 3I5OA 3FJMA 3B6TA 5I2KA 1B5IA 2I58A 4QSEA 3FIRA 1MXZA 5CBRA 2V25A 2Y84A 3VE1B 4KI0E 1US5A 1HSJA 3C35A 1MY3A 3LSLA 3D4GA 4MBPA 5F7VA 5L9MA 3T9UA 1XVXA 4F18A 2PX1A 4X1BA 3B6QA 3R6UA 1B7ZA 4R2FA 4YU0A 4NEDA 2GHAA 1P1WA 4BDRA 2ABHA 2OZZA 1H43A 5FTHA 1BLFA 4EDPA 3K2DA 5ISUA 1AMFA 2XXTA 3OD7A 4FORA 4U22A 3OSQA 3U1OA 4ZE8A 1I69A 4I8CA 1LGBC 4G8HA 4YB7A 1Q35A 3QK6A 4GXSB 3VFJA 4R6YA 1NNKA 3O6GA 2P1SA 4GF8A 2F5XA 4H8JA 3SERA 1M5CA 3KG2A 4UACA 5FTIA 4AB6A 3TDJA 1JVXA 4RY1A 5CMCA 1XT8A 2QL3A 3PUYE 1H3DA 1GTKA 1OVBA 4F29A 3TPAA 4KYDA 3R26A 4GQOA 3TTMA 2XXYA 1QJMA 3FASA 1B05A 3EQ1A 3LBSA 4R6KA 4IO7A 4H65A 4KHZE 3MVZA 4R72A 3L6GA 4Q8RA 3MP6A 2A5TB 3TCHA 3QXMA 2DWIA 3GBBA 1DOTA 3MAMA 3BBRA 1B9JA 1S7YA 4LZ5A 5I58A 3UORA 1PB8A 1SW1A 2DWJA 2OCUA 3CFZA 1CE2A 1MXYA 3ODBA 3K1NA 5AA2B 5A5XA 3N94A 3A09A 4POXA 5H8NB 1A40A 4IO3A 2Z8DA 3FATA 4LONB 1Z7NE 2XD2A 1JNFA 3SESA 1I6QA 1MDP1 1BTJA 1B32A 3TTKA 4XIGQ 2YPNA 3KJ7A 3S9LC 4RNSA 4ELQA 1LFIA 3T22A 3DP6A 1M5BA 2Q9TA 4GRKA 4H5FA 1B3LA 2XXWA 2VP1A 3KGCA 4PQJA 1H44A 5I2NA 3WAFA 5I84A 1LAGE 4FEDA 5DT6A 4JWYA 2G93A 4LUBA 4M1VA 1GVCA 5ELVA 5H8FA 4XKPA 5I59A 3FZVA 2XXIA 3N6TA 1NFTA 3E3KA 3MZBA 4R2BA 3IB0A 1PDAA 4FE8A 4PETA 3IAZA 1WODA 3IO4A 5I2KB 3M3KA 1NKXA 4XKRA 3PPRA 4LZ8A 4F3PA 4RPNA 3EF7A 2O1LA 2OWSA 2GFEA 1B0HA 1LAHE 3MVWA 2RC7A 4AQ4A 3LR1A 4YB5A 2PBWA 4C0RA 3HHFA 1ZJLA 1JW5A 3E9XA 3V5AA 1FCKA 4OERA 2F34A 2X26A 4R6HA 1Y20A 1A99A 1B3GA 3LSWA 3PMXA 1ZLQA 2NVUB 1USYH 2F36A 2YLNA 1XHYA 3O97A 5LOMA 3ZKLA 3K00A 2GHBA 3RUMA 3N6UA 1A55A 1FTMA 2DE4A 2Q89A 3KOSA 5K2XA 3VVFA 3OMBA 4F3BA 5FHNA 4P0GA 2NWJA 4WXJA 3G3KA 4N07A 4F1YA 3SEWA 1P1UA 3KEIA 1OMPA 5AA3A 1DTGA 1N84A 1IZ1A 3T96B 2PT2A 1B0LA 4PFWA 4HCWA 1VFDA 3PUWE 5HBCA 4F2OA 2QS4A 1SI1A 1LFGA 2XXHA 4ND9A 3P7IA 1OIBA 5DTBA 2OLBA 3CIJA 3MW0A 2H99A 3Q28A 4NF5A 2XD3A 5ITPA 3DELB 4JXIA 4WEPA 4NF8A 1IEJA 1MPDA 3C36A 1B3EA 4HTGA 2E0SA 4EQBA 1DMBA 1IQ7A 1Y9UA 3TYHA 5I58B 4DCYA 1N3XA 3B7DA 2O7UA 4FJPA 3T9XB 4LQ5A 1M5DA 3K1PA 1Y3QA 2FYIA 1IXGA 1MY1A 4I9DA 4IO6A 1UQWA 3IL1B 5EYFA 1J1NA 5A5XB 4OHNA 3SEVA 1PBQA 3HHGA 3VV5A 4RPOA 2HFBA 3FVNA 4OENA 4N13A 3OO7A 2I3VA 2VGQA 2V84A 1MQDA 1NNFA 3SEXA 5AA2A 3H03A 1URSA 1M5EA 1UIUA 4IGRA 4H8IA 5I2NB 4U1OA 4DXBA 1Y4TA 2H98A 3ILTB 4DLDA 1LB9A 2VD3A 2QS3A 5DVIA 3OELA 2DXYA 4U2RA 5I59B 1H76A 4EQ7A 4C1TA 3LUYA 2YJPA 1JW4A 3UGWA 2DVCA 3FXRA 3OO6A 2WKYA 1OVTA 1DPEA 1MXXA 3HN0A 1SYIA 3TQLA 3VDFA 1VR5A 5TP9B 5H8HB 2DOJA 1TT1A 3OEMA 2QRYA 4ELRA 3HV1A 5DEXA 4ESWA 1QKBA 5K2YA 1WVJA 2F78A 1B58A 2ZYNA 3G3FA 1N7XA 4HS7A 1XOCA 3CSGA 4BDLA 4IB2A 3VVDA 3H6TA 1EH3A 4OFLA 5B70A 1ZU0A 3H3GA 4ONYA 3MVYA 3H4ZA 4XTCQ 2O69A 2XX9A 3IOUA 3FVKA 3RTFB 4KCCA 5DVFA 1D9YA 3N26A 1IXHA 3PPNA 2Z8EA 3G3HA 4OEVA 1RKMA 5JK4A 3IOWA 4NWDA 3O66A 4DE8A 3U72A 1WDNA 3IB2A 2QJEA 1JW1A 3RT6B 4OWDA 1B7UA 2H9BA 4YMAA 2OJTA 3FGSA 2UVHA 3V83A 1VE4A 4KCDA 4ZE9A 4JSOA 1ZBMA 4I1DA 3T9HB 1OQGA 3BFUA 3IJXB 3IOVA 1GGGA 5KDTB 4RYAA 2ZNSA 1O7TA 2I4BA 2RC9A 4IO5A 4NF5B 4MLVA 3IB1A 3PUVE 2R71A 4G68A 1POTA 4JWOA 5BWJA 2R6GE 4NF8B 4LATA 2NUVA 2B65A 4P0IA 2F8DA 4TOZA 4OTEA 1ZMGA 3O9PA 5AE4A 1I6BA 4U4SA 3TKDA 4LP2B 2REJA 4MH5A 2RINA 1PEBA 3CG1A 4C1UA 4F22A 3RT8A 4UA8A 5CBSA 4XKNA 3H7MA 3E4RA 2RF1A 4IO4A 2QPQA 3A3CA 4ZEBA 5L9OA 3N5LA 1QUIA 1YAEA 4OQOA 5AA4B 3MUQA 4FATA 1XVYA 2X7QA 1B3FA 4F3SA 4EF2A 3BFTA 5JEIA 3H6UA 3UN6A 1POY1 4O3BA 4OYVA 1SW2A 5JTYB 3K0VA 3FD3A 1P1NA 1CB6A 1PB7A 3CRBA 2F97A 3VXBA 5CMMA 1B51A 4IGTA 2F6GA 4MFIA 2Q88A 4F19A 1MH3A 2H25A 2D21A 3G3JA 3A3UA 1MQGA 5ITOA 3UIFA 1LFHA 4GFRA 4IO2A 3FJ7A 1MPBA 1P1OA 3RQTA 4EUOA 4F2QA 3QUJA 3RY3A 1R9QA 4OXVA 4U21A 3U92A 1ANFA 4PFUA 4H1XA 3R7XA 2HCAA 1Y1MA 2R9JA 1IUDA 5DEXB 3OXNA 1MPCA 4PE5B 4GVOA 1SW5A 1NH7A 3FUZA 2F7CA 2O51A 3KN7A 2QMWA 3B6WA 2E1SA 4NWCA 4RK2A 4QFLA 1FQFA 1URGA 3G3GA 3SEYA 2UVJA 1N7WA 2DYXA 3THIA 1MDQA 5TP9A 5H8HA 3IORA 3K01A 4ZS9A 3W15C 4YICA 2I4CA 3O6HA 1MXWA 1MQJA 1XS5A 1LCFA 2B3FA 4BDMA 3E13X 4NF4B 4IY6A 3KBRA 4JSDA 3I3VA 3RTWB 3H6WA 2DP8A 3SKPA 1R6ZA 1L5TA 2Q2CA 3QYTA 1Y3PA 1A8FA 4X9TA 3Q29A 4QF9A 1LAFE 4LA9A 1B52A 4Z7EA 3K1MA 4ELOA 3FXUA 2IA4A 3OEKA 3OO8A 2ONKE 2O84X 3EHUA 2DWAA 2DE2A 1JEUA 3RGYA 3VLVA 4DXUA 2ZXTA 1FTOA 1LLSA 5ICQA 3MPLA 3CSBA 4OETA 2OBGA 2FA7A 1B40A 3S9NC 4JBZA 1NMUA 3LSFB 3LSXA 4DXCA 1MY0A 5F1QA 4G68B 5L8DA 1M5FA 3PPOA 1UTHA 3QAXA 4R9FA 5CM6A 2HQ0A 2HAUA 1NH8A 4E0XA 4EXKA 2FNCA 4ISUA 1OQHA 5KDTA 3MBPA 3BKIB 5AA1A 2I49A 4TQUQ 1R9LA 1Y1ZA 3U93A 3SDFA 3Q26A 1TXFA 2OK2A 5CMBA 4EQ9A 3O28A 1KWHA 1Q1KA 3G3IA 4YAHX 1SVXB 4E0WA 2ALUA 2RCAA 1YCJA 2UVIA 2F35A 4L17A 3C4MA 1NL5A 4OFJA 5IKBA 1MXVA 1SBPA 3CFXA 3KZGA 4Q30B 1B7HA 4MLQA 2W7YA 1LCTA 2O6AA 3PD8A 4F3GA 4PFTA 3Q27A 3M3FA 1AH5A 3U8QA 1FTJA 2V93A 2HZLA 5AA4A 3VVEA 1N04A 1S50A 2O68A 3Q25A 4NF6B 4OFOA 2VHAA 1ELJA 3EHTA 2DE3A 1AOVA 5AA2D 3HO7A 2QS1A 1JQFA 1Y4CA 1QUKA 4NMYA 2DWHA 3KSXA 3PV0E 3C33A 1R1NA 4XKQA 5JTYA 4GWOA 3IR1A 1DSNA 4YKPA 1MG1A 3HPIA 2ONRA 4G8MA 4XXUA 4Q5TA 4MF3A 1XC1A 1QVSA 3S2VA 3IK6B 3OENA 4QFNA 4GLIA 4F1UA 3SEUA 2Y7RA 3QUFA 1UIVA 3CFLA 5IAIA 1DPPA 4G77A 4KPTA 3G7WA 4GL8A 4JDFA 1VSOA 3GBAA 3VLUA 5H8QB 2Q8JA 1FQBA 4OEUA 1FQDA 2XHDA 5B7DA 2UVGA 5FHMA 2I0BA 2QMXA 3K6UA 3RN8A 4JB7A 4ZDMA 5TPAA 1N0TA 1B3HA 2AL4A 2GRVA 3ZS6A 2RKMA 2AIXA 1P1QA 1FTKA 1LAXA 2I48A 1B5JA 1S9TA 5CRYA 1AL3A 3MZ1A 3MVXA 2UXAA 2I6EA 4H0WA 4IY5A 3TCGA 3TQWA 4FIMA 1D9VA 1JVYA 2ESNA 2V3UA 4LQ2A 2RC8A 1LBBA 2HZKA 2OWTA 4FECA 3S4UA 2Z22A 3GLBA 3QSLA 4GD5A 1O64A 1MM7A 1ZKBA 4YKJA 3TTRA 4YB6A 2ONSA 4NF4A 3W9VA 3QIMA 2DS9A 1MQHA 4X48A 1PB9A 3JV9A 1IITA 2CZLA 1VFEA 1YTVA 4F1VA 4KYSA 5I56B 2KLFA 4BLAA 2REGA 4LZ7A 3EN3A 5EHSA 5H8SA 4RK9A 2DXRA 1T0KA 1HSLA 1EZOA 4DIGA 1UTHB 3OO9A 4POWA 2A5SA 3W9WA 4G2ZA 1MQIA 3TUSA 2O7IA 3MWBA 2UYEA 1SDXA 1II5A 4NE4A 3EPEA 1D3KA 3PMWA 3ONMA 4HW8A 4EXLA 2B3BA 4ZEIA 1LBCA 4M4GA 4X1DA 5FHOA 1B6HA 2HEUA 2AL5A 5CC2A 4DCXA 2NOOA 4ZEKA 1A7LA 1LSTA 3TEPA 3ZKKA 4QFOA 3RLFE 5M2VA 4FAJA 4OVJA 2LAOA 4BDNA 2NXOA 4KR5A 4R74A 2XXXA 1EZ9A 1FQCA 2F7BA 1B46A 1JETA 1H45A 1URDA 2H4IA 5KCJA 1A8EA 3GZGA 4YKIA 3FXQA 4G8NA 4YZZA 4ZZEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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