3N6TA

Effector binding domain of tsar
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
publication title Structural studies on the effector binding domain of TsaR
rcsb
source organism Comamonas testosteroni
molecule tags Transcription regulator
total genus 54
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA02
1FQBA 4R2FA 3OSRA 4OHNA 3TEPA 2ESNA 2HZLA 3Q26A 3MPLA 4LA9A 2HAVA 2R6GE 5FHNA 1OVBA 2QSXA 4DCYA 4PQJA 1VE4A 4GFRA 3V8XB 2DXYA 3FV2A 5I2KB 3TCFA 1M5FA 3O28A 3H6TA 3I5OA 2F7AA 2PX1A 4OWDA 1A8FA 3HHGA 1LBCA 2ZYMA 1GV8A 5I59A 1AL3A 1N7WA 4QFNA 4G2ZA 4NF4B 2RC7A 2LAOA 4QFLA 3U8QA 3IOUA 3VXBA 4H8JA 1B9JA 3E13X 1IXHA 1LBBA 3TELA 2F97A 2FYIA 3G3KA 4OMBA 5K2YA 4LVQA 4ESXA 2AL5A 2WKYA 2D21A 4QRZA 3Q29A 4JWYA 2OZZA 2BJJX 3FGSA 3IB1A 2F7BA 2PT1A 3T9UA 1JETA 1SW2A 4GL0A 1D4NA 3CVGA 5I2NA 4ZEFA 4LZ5A 4FAJA 3ILUB 1UQWA 3QYTA 4Q8RA 4LP2B 4YMAA 1B4HA 1A7LA 1MXXA 3IB2A 2XXUA 1URDA 1US5A 5TPAB 3T93B 3B7DA 2Z23A 5FHMA 4F39A 1B7ZA 2AYSA 1URGA 3KN7A 3VVDA 3GZGA 4EQ7A 4QF9A 5HPQA 4RK9A 3PMVA 4FE8A 5F1QA 3C36A 3RTWB 1F9BA 4KFQA 3DP6A 1URSA 4IO4A 3EHTA 4F1VA 4FEBA 1JW1A 2XXHA 4MH5A 2D3IA 4I9DA 4IO7A 1PEBA 1NH7A 1B3HA 1SW1A 4EQ9A 1A54A 3M3FA 1ZBMA 2Q89A 1MXWA 1FQFA 3JV9A 4ELPA 1HSLA 4ELQA 4RYAA 2H98A 4FIMA 2G93A 1QUIA 5AA4B 5HM4B 5DVJA 1SYHA 4ESWA 1R6ZA 2W7YA 3ZS6A 2F78A 1LFHA 3MJNA 2ZMBA 1B5IA 1YAEA 4DDDA 4ECFA 2H99A 5I84A 4ZE8A 3UP9A 5ITPA 2XXXA 3H7MA 4PFYA 4ZEBA 1MPBA 4OZ9A 3ZKKA 3QK6A 4TQUQ 1ATGA 3BFTA 3PV0E 5TPAA 4DXBA 4LQ2A 3MUQA 4H67A 1B5JA 4OERA 2Y84A 2O68A 1B3LA 3DELB 1N3WA 3LSLA 1WVJA 4KR5A 5CMCA 2R71A 3T22A 4F29A 4IO5A 3MZ9A 3N6TA 2VD2A 4NWDA 4IGTA 5BUUA 4JWXA 4GD5A 3TTRA 4KYEA 3CIJA 4JB7A 3CSBA 5EHSA 3VVEA 5L9OA 4F1YA 3O97A 2YJPA 1B46A 2HXWA 3K01A 1FTMA 1ZTYA 2DWIA 1JEUA 3RPWA 3K1NA 2CZLA 2ZYOA 3THIA 5ITOA 5DT6A 4LUBA 4RY1A 4KYDA 4WEPA 1P1UA 5AA4A 3P7IA 4KQPA 1QKBA 4F22A 1N76A 2XX9A 5KCJB 1SQYA 3QUJA 1FW0A 1ELJA 4EQBA 4N13A 3L6HA 4OYVA 4JXIA 1D3KA 1IQ7A 2REJA 4HCWA 5TU0A 1Y4TA 3PUVE 4AB6A 3UORA 2V3TA 1A40A 3QUFA 4RXLA 3T9XB 1B05A 2OK2A 4OEVA 2PT2A 1QJMA 1O7TA 2B3FA 4ELOA 4F1UA 4C0RA 1S7YA 4H1XA 4ZZAA 1LAXA 3H6VA 1A55A 1JNFA 3FXRA 2F8DA 4U4SA 4IY6A 1BIYA 4NTLA 1ZMGA 3K2DA 1A99A 3IJOB 1MY0A 4R73A 5H8FB 1DTGA 3KZGA 1TT1A 3TODA 5AE4A 3Q27A 1MPCA 1GR2A 5I57B 2Q2AA 3VLWA 4DCXA 2ZYKA 4POXA 2VHAA 2F7CA 1JVXA 3UGWA 5KCJA 4NWCA 4IO6A 4H0WA 2VP1A 4F31B 1POY1 3FV1A 2PYYA 4YKKA 2DS9A 3S9EA 3S9LC 4U4XA 1SW4A 2OCUA 1GTKA 4U21A 1MH3A 3C31A 4LONB 5CMBA 1NNFA 5HBCA 3A3CA 1UIUA 3K6WA 3H03A 1I69A 2PBWA 4G8MA 4TOZA 1YTVA 3A09A 2Q9TA 4YB7A 4M4GA 4UA8A 4N07A 5I58B 4MF3A 1B6HA 4U1OA 4H6DA 1KWHA 4BDNA 2XX7A 3S4UA 3HPIA 3CI8A 4XKRA 4GLIA 5CI5A 3OO7A 1B32A 2NWJA 5H8FA 2ABHA 3OD7A 3S9NC 1XOCA 3N5LA 1B1HA 5BWJA 3K6VA 1B4ZA 3JZJA 5I56B 2P2AA 1NMUA 4OEUA 2DE2A 4XIGQ 5L9MA 4WEDA 1M5EA 4BDQA 4F3SA 1LB8A 3KOSA 3FZVA 5H8NA 3LUYA 5DVIA 4LZ7A 2PVUA 1H45A 3GLBA 4PE5B 3N26A 2Y7WA 3OENA 4MLVA 4P0GA 3ZSFA 1MY3A 3VE1B 2VOZA 4RA1A 4OXVA 4ELRA 3WAEA 1FTLA 2DYXA 1DOTA 1TXFA 4GF8A 2O1LA 3S2VA 3QIMA 3IOTA 4R6KA 4GVOA 2XXYA 1TWYA 5TP9B 4G8NA 1EZPA 1VSOA 2HZKA 4MBPA 4GXSB 1LSTA 5H8HB 3C4MA 3G3IA 5I58A 4KYSA 1XS5A 3H4ZA 3K00A 3O6GA 2Y7PA 1FQEA 2CMOA 4IGRA 4LZ8A 3SEWA 4ZE9A 1XC1A 5AA2D 1PBQA 3KBRA 3MVYA 4THIA 4Q5TA 1FTOA 4I1DA 2I4BA 2A5SA 3CSGA 4MFIA 4OFOA 2XXIA 1Y1MA 5I56A 1TFDA 2XXPA 4YB5A 3IAZA 1MXZA 4GQOA 3TQLA 1MY4A 3GBAA 3KGCA 1Y20A 4QHQA 2V84A 2H5YA 1JVYA 3C33A 4BDLA 4ZEKA 3C9HA 2DE3A 4ZECA 3WAFA 2B65A 2FNCA 2XXTA 1UTBB 2DOJA 4G68B 1BKAA 5L8DA 4F18A 5KDTA 2QS1A 4RPOA 4BLAA 1N3XA 5F7VA 5DEXB 1J1NA 1NH8A 3CFLA 2Y7IA 1USYE 3UIFA 3MVXA 3KN8A 5IAIA 1LFIA 4FEDA 1OLAA 4P11A 3ZKLA 1TFAA 5CRYA 3MVZA 2H9BA 5H8SA 4ZS9A 5K2XA 1L5TA 5I2KA 5H8HA 3K6UA 5FHOA 3G3FA 1H3DA 3RQTA 3VXCA 1B7HA 3SDFA 1M5CA 3K4UA 3KEIA 3FUZA 4NE4A 2XHDA 3TUSA 4ONYA 2DWJA 2AL4A 1B51A 3OOAA 2F5XA 3FJ7A 3EHUA 3VV5A 4ZEDA 4NF4A 4OQOA 1HSEA 2X7PA 2Z8EA 1VFDA 4GXAA 4X1BA 1NNPA 3OELA 4H8IA 2O69A 1N0TA 1LAFE 2XXWA 1UTBA 1FTKA 3LC8A 4G68A 3FIRA 1SI0A 3TZAA 4YKIA 2Q8JA 3V83A 3D4GA 1M5DA 2RCAA 1ZKBA 4M1VA 2QPQA 3FJGA 4BDOA 2I48A 2RCBA 1Y3NA 3M3KA 4OFLA 4FECA 5JEIA 1DTZA 2QJEA 3MP8A 1H76A 2NUVA 5JTYB 4NF5B 4UACA 1LAGE 3O29A 1PBPA 4QFKA 4YICA 3OO8A 1BP5A 1Y3QA 3PUYE 5JK4A 3MW0A 4F2OA 1AMFA 5KZTA 1PB7A 3CG3A 5CMMA 4R2BA 4Z7EA 1T0KA 4EDPA 2Z8FA 3M8UA 3TTNA 3VFJA 3KOTA 1US4A 3QSLA 2G29A 4C1TA 1AOVA 3PU5A 2XXVA 3AXFA 4GL8A 2I3WA 4OENA 1NNKA 3SEUA 4NF6B 3KSXA 1EZOA 2QS2A 2OWSA 3TMGA 1Z7NE 3OSQA 1ANFA 3M3LA 1S9TA 1IUDA 2ONSA 4HCYA 2QL3A 1UTHB 3R26A 1MQGA 4YKJA 3H06B 2D5WA 4OVJA 5JTYA 2HCAA 4NF8B 5FTHA 1P1OA 2VD3A 3FASA 1BTJA 1EZ9A 1POTA 3N6UA 3H6WA 3T9HB 3O6IA 1H43A 1CE2A 2DWAA 3OEKA 5CBSA 1FQAA 4XKNA 3FVKA 4X1DA 4I62A 4F19A 3SKPA 4DXCA 2RC9A 3RNNA 3CG1A 3MP1A 1SD3A 3DM0A 4E0XA 4ZEIA 3HO7A 3TQWA 3FXQA 3C34A 1MM7A 2OWTA 4U1ZA 1LCTA 3IJXB 4NF6A 1RYXA 3O9PA 4OFJA 5H8QB 1OLCA 3RUMA 1N7XA 1LGBC 3OMBA 1HSJA 2I49A 3FXUA 5AA2B 3F11A 3MP6A 3BFUA 1IZ1A 1MXUA 2V3UA 3MWBA 1UTHA 4HS7A 4EXLA 1NKXA 1LCFA 4QSDA 2ZNUA 5DVFA 3K0VA 2XX8A 1DPEA 4OETA 1DSNA 2GFEA 4WXJA 3I6VA 3RTFB 2F6GA 1MQJA 1QVSA 3IO4A 3TDJA 4GOTA 2DVZA 5CM6A 3MZ1A 5L9SA 4R6YA 2DVCA 5J1DA 1Q1KA 1XT8A 4G4PA 3CFXA 1B58A 3VDFA 1MQHA 3KG2A 3EHSA 1Y9UA 4DIGA 5DYHA 3IB0A 1N84A 3ILTB 1JEVA 3E3KA 3OO6A 3DP8A 3Q28A 4ND9A 3EPEA 3IR1A 3N94A 1A8EA 5EYFA 5H8QA 1XHYA 1PC3A 4XKPA 1QW0A 3IK6B 4AB5A 4JSOA 4RNSA 4O3AA 4U23A 5AA2A 3SEVA 2H25A 3TKDA 3TYHA 4DE8A 3LR1A 3HCQA 3ECRA 3KFMA 5I57A 2QMXA 3S9MC 4K3FA 3O2AA 3V5AA 3DLNA 1YCJA 4RK2A 1P1QA 3PUXE 1B5HA 1RKMA 3T96B 2XXRA 1I6QA 3LSFB 4BDRA 4O3CA 2DP8A 4XKQA 3TCGA 4WKMA 1Z7ME 1H44A 4DXUA 3W9VA 3PPQA 2XD3A 1IIWA 2I3VA 1OVTA 3QAXA 4BDMA 3ONMA 3KSJA 3VLUA 3MVWA 3W15C 1M5BA 2XXQA 3PPRA 5B70A 3EN3A 2OJTA 2UVHA 4GRKA 1GGGA 2NXOA 4YZZA 3R6UA 4YAHX 5LOMA 4AQ4A 4QSCA 1LB9A 2A5TB 1ZJLA 1MPDA 1Y1ZA 4O3BA 5I2NB 5EHMA 1MQDA 3G7WA 2HQ0A 4YB6A 1DPPA 4JWOA 3KN3A 2O7IA 1EU8A 5IKBA 3PD8A 1Y4CA 1FCKA 5CC2A 1Q35A 3FVOA 1LAHE 4ZZEA 1OIBA 2HEUA 2FA7A 3LSXA 2NVUB 2ZXTA 3H6UA 5CBRA 2V93A 2QS3A 4F2QA 3FATA 4OTEA 5ELVA 2IA4A 5TP9A 2I58A 3CR9A 3CFZA 1MRPA 3C32A 4FATA 4NEDA 1FTJA 4MLQA 2QS4A 1II5A 1MY1A 2YLNA 3U92A 4JBZA 3HN0A 2REGA 3U93A 3E9XA 2ZNSA 2RINA 4X48A 2OBGA 5CMKA 4PP0A 1PDAA 2UXAA 1MDQA 2GH9A 3EQ1A 1MY2A 3MPKA 1ZU0A 2A5TA 2M8CA 2UVIA 3MAMA 3KJ7A 3E4RA 1B0HA 3MZBA 2I0BA 1JQFA 3H3GA 3SEXA 4H5FA 3PPNA 2V3QA 1CB6A 3UN6A 2HFBA 2RC8A 3A3UA 3KJTA 3VLVA 1P99A 3FJMA 1MM6A 3T66A 2KLFA 1PB8A 1VR5A 1MXYA 5ICTA 1MQIA 4R74A 3USDA 2O84X 4I8CA 4R9GA 3RT6B 4DLDA 4RJZA 2THIA 1XVXA 4ISUA 5DEXA 5B7DA 2F36A 3B6TA 4KD5A 4P0IA 4QSEA 2DWHA 4GIZA 3MC2A 3G3HA 3G3JA 4QFOA 4F3BA 1XVYA 1R9QA 3PUWE 1SI1A 3IOVA 2UVJA 1SW5A 4LQ5A 1NFTA 3IO6A 5ISUA 1I6AA 1MH4A 1S50A 3LSWA 1B2HA 3RN8A 2IEEA 2ZNTA 3HV1A 4G77A 3TFLA 3OEMA 1DMBA 1NNTA 1AIVA 1MXVA 1QKAA 4IO2A 2GRVA 4IY5A 3RY3A 2Z8DA 5AA3A 1OQHA 1IEJA 3PD9A 2I4CA 3SETA 4KPTA 2PMSA 1SVXB 3D4CA 4EF1A 4RPNA 4F3PA 4QFPA 3RLFE 3PMXA 1D9VA 1RYOA 2NOOA 2X7QA 4H5GA 4U22A 1MG1A 3Q25A 2O1MA 4U2RA 1WODA 4F3GA 3TTKA 2UYEA 5M2VA 3GBBA 1VFEA 2P0SA 4JDFA 3O6HA 4HTGA 4X9TA 1MS7A 3JYRA 2Y7KA 2Q2CA 3SERA 1IXCA 4PETA 3MQ9A 1I6BA 1O64A 1SDXA 3EF7A 4FORA 1QUKA 3TCHA 3B6QA 4YU0A 4H65A 1YPNA 2I0CA 3IX1A 1P1WA 1JW4A 5ICQA 1ZIUA 1QULA 3PUZE 4NF5A 3U1OA 1Y3PA 4DZ1A 4JSDA 4XTCQ 1B3EA 4EUOA 3IORA 2V25A 1IITA 3K1MA 4TLMB 2H4IA 3L6GA 2F34A 1FQDA 1SBPA 3V89B 4R9FA 1WDNA 3PGFA 1B40A 1B7UA 1P1NA 4PFWA 3K02A 1QUJA 3CRBA 3GXAA 4R6HA 2AIXA 5FTIA 3SEYA 3UK4A 2Q88A 1JW5A 3ODBA 4Q0CA 4G8HA 2O6AA 1BLFA 2GHAA 3IOWA 4G68C 2UVGA 1D9YA 2DSFA 4IB2A 2QMWA 2GHBA 5A5XB 3TTMA 2OLBA 2Y7RA 1UIVA 4PFTA 3SESA 1SYIA 2RKMA 2B3BA 1B3FA 4TLLB 3FVGA 1R1NA 2O7UA 3OXNA 1NL5A 3QXMA 2ALUA 1AH5A 4KI0E 3K6XA 2DE4A 4NF8A 2ZYNA 2ONKE 4LATA 2XD2A 3I3VA 4N6PA 4NMYA 4KHZE 1LLSA 3VVFA 2DXRA 4Q30B 3HHFA 2HAUA 4IO3A 3FVNA 2YPNA 2E1SA 3BBRA 4GWOA 5H8NB 1O63A 2O51A 1LFGA 1B3GA 3PPOA 3C35A 1OQGA 4YMBA 3RT8A 4EF2A 4Z0IA 3PMWA 2F6PA 1B52A 3UA8A 3K1PA 2UYFA 3O66A 5A5XA 1GVCA 2F35A 4YKPA 3BKIB 3IL1B 4FJPA 3G3GA 4OESA 4R75A 3FD3A 1R9LA 1B1XA 3W9WA 3OO9A 2DQVA 1PB9A 4PFUA 3U72A 3U94A 3RGYA 1USYH 2ONRA 4ZDMA 2ANJA 1EH3A 1N04A 3B6WA 4HW8A 3MBPA 3TPAA 5AA1A 5I59B 3T9VA 4KCCA 1FQCA 2RF1A 2P1SA 4KCDA 2QRYA 4R72A 4C1UA 4L17A 1ZLQA 1IXIA 4POWA 1MDP1 2VGQA 1IXGA 3R7XA 2X26A 2Z22A 4XXUA 3HSTA 3PPPA 3DP4A 5KDTB 4EXKA 1OMPA 2I6EA 1B0LA 5DTBA 2E0SA 2R9JA 3TTLA 3LBSA 3TAJA 4E0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FQBA 4R2FA 3OSRA 4OHNA 3TEPA 2ESNA 2HZLA 3Q26A 3MPLA 4LA9A 2HAVA 2R6GE 5FHNA 1OVBA 4GBWA 2QSXA 2B4LA 4MNIA 4DCYA 4PQJA 1VE4A 1IMFA 4GFRA 3V8XB 2DXYA 3FV2A 5I2KB 3TCFA 1M5FA 3O28A 3H6TA 3I5OA 2F7AA 2PX1A 1FPLA 4OWDA 1A8FA 3HHGA 1LBCA 1CNQA 4H45A 2ZYMA 1GV8A 5I59A 5ESYA 1AL3A 1N7WA 4QFNA 4G2ZA 4G61A 1IMDA 4NF4B 2Q8MA 1AWBA 2RC7A 2LAOA 4QFLA 1FPDA 3U8QA 3IOUA 3VXBA 5ET5A 4H8JA 2ZZXA 1B9JA 4NGUA 4N4UA 3E13X 1IXHA 1LBBA 3TELA 2F97A 2FYIA 3G3KA 4OMBA 5K2YA 1NV1A 4LVQA 4ESXA 2AL5A 2WKYA 3E79A 2D21A 4QRZA 3Q29A 4JWYA 2OZZA 1FPJA 2BJJX 3FGSA 1XI6A 2VPOA 4FBPA 3IB1A 2F7BA 2PT1A 3T9UA 1JETA 1SW2A 2GQ1A 4GL0A 1D4NA 1NV2A 3CVGA 4MAGA 5I2NA 4ZEFA 4LZ5A 4FAJA 3ILUB 1UQWA 3QYTA 4GWUA 4Q8RA 4LP2B 4YMAA 1B4HA 1A7LA 1MXXA 3IB2A 2XXUA 1URDA 1US5A 5EYGA 5TPAB 5A5LA 3T93B 3B7DA 2Z23A 5FHMA 2XWVA 4F39A 1B7ZA 2AYSA 1URGA 3KN7A 3VVDA 4I3EA 3GZGA 4EQ7A 4QF9A 5HPQA 4RK9A 3PMVA 4FE8A 5F1QA 3C36A 3RTWB 1F9BA 4KFQA 3DP6A 5LDZA 4O94A 1URSA 4IO4A 3EHTA 4F1VA 4PDDA 4FEBA 1JW1A 3D1RA 2QVVA 1FBEA 1FPKA 2XXHA 4MH5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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