1N7WA

Crystal structure of human serum transferrin, n-lobe l66w mutant
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGWVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin. A Structural Study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 105
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1n7wA01
3D4GA 1AH5A 2I58A 4KQPA 2AL5A 2HZKA 1Y4CA 1SQYA 5KCJA 2X26A 3JZJA 1MQGA 2V93A 5K2YA 1WODA 5I2NA 3UGWA 3T22A 3CR9A 4MLQA 4JXIA 1JVYA 1MXVA 4QSEA 2O1LA 4NEDA 2QS3A 3PUWE 5CMCA 4XKNA 1Y3NA 3Q29A 1PBPA 1OQHA 3KOTA 3TAJA 3T9UA 3TKDA 3KOSA 1NNFA 2I0BA 2Y7WA 4Z0IA 1URGA 2P0SA 2DP8A 2CZLA 1QVSA 2DQVA 5FHNA 4RJZA 3MAMA 3R26A 5L8DA 1AL3A 1A99A 2BJJX 5EYFA 3QAXA 2H25A 3VVDA 4R9FA 3UP9A 4LATA 3IJOB 4C1UA 3GBBA 3UA8A 5FHMA 3UIFA 1LCFA 4EQ9A 3K6VA 3O66A 3HHGA 2P2AA 1O7TA 3H4ZA 3TELA 2DE3A 1QW0A 2KLFA 4JSDA 3RY3A 4PFUA 1B9JA 2I0CA 2DE2A 4YICA 2GHBA 1ELJA 3KJ7A 1I6BA 3TTRA 2GRVA 3V8XB 3OSRA 1LGBC 1AOVA 2ZYMA 3A3CA 1JNFA 4R9GA 3FXUA 4DZ1A 1DPPA 3TTMA 2QS2A 1USYE 3IO6A 5TPAA 3IOVA 3OELA 3IORA 2R71A 3OOAA 3VFJA 1MXWA 1IXHA 3HCQA 3PV0E 2GH9A 4OXVA 4YKJA 3MWBA 4DXBA 1P99A 4OMBA 5HPQA 4O3CA 3N94A 3PMVA 5DYHA 1JW1A 5TU0A 5B7DA 2VGQA 3C35A 4R6HA 5CBRA 3RNNA 5I84A 4O3BA 3KSXA 3V5AA 1HSEA 5I58B 2XD3A 4F39A 5I59B 4R6KA 2PBWA 5JK4A 1QKBA 4RK2A 1H44A 4IB2A 1R9LA 2D3IA 1N84A 1I6AA 1B5JA 3SEYA 1UTHB 1RYXA 4U4SA 4ELRA 4P0GA 2D5WA 1DMBA 5H8SA 4DDDA 4ZS9A 2VHAA 3C33A 2PX1A 2HAUA 3HPIA 5TP9B 3MBPA 1LAGE 5ICQA 4OEUA 1B52A 2DWJA 1ZBMA 4XKPA 1S50A 4F3BA 2XXRA 4P11A 1Y9UA 4I9DA 1NH8A 2H99A 2ZNUA 1GGGA 3FATA 3CSGA 3FIRA 1UIUA 1M5CA 1B58A 1QUJA 1LLSA 4UACA 3RTWB 3K6WA 5I56A 1IXGA 4EQBA 3K00A 3FVOA 4JSOA 5CC2A 4LZ7A 5H8FB 1A55A 2XHDA 1II5A 1MY3A 2O69A 5A5XB 1FQFA 4H8JA 3K1PA 3VVEA 1QKAA 4C1TA 4BDOA 2QMXA 3CFLA 4H65A 1VR5A 4WKMA 4G2ZA 4XIGQ 3M8UA 4GVOA 4YU0A 2XXPA 1A40A 1MDP1 1B5HA 2NUVA 4H5GA 4M4GA 1TFDA 1IITA 3TMGA 3OO7A 3BKIB 2QMWA 3HN0A 3CFZA 1DPEA 1QUKA 3TTNA 2RC9A 1B4HA 3V83A 2WKYA 3U8QA 5DEXB 1M5EA 3U94A 1D9VA 3TYHA 1RYOA 4MBPA 2I6EA 5EHSA 5ISUA 3N6UA 2YLNA 3MQ9A 2QL3A 1GV8A 3TTLA 4GIZA 1B7ZA 2V3UA 3EHUA 2DE4A 5AA2B 4R75A 1B32A 2Q89A 3VXBA 4ZE8A 2OCUA 2Q2CA 3GLBA 1N0TA 1F9BA 3CSBA 3KZGA 3MZBA 1EH3A 4NF6A 1R6ZA 1FW0A 2GHAA 3H7MA 3RUMA 4NF8B 4KFQA 5H8HA 1OVBA 3QUFA 1H76A 4RPOA 1GTKA 3PPNA 4R73A 4F1VA 2Y7RA 2F35A 1FTKA 4NF4B 3O97A 3T66A 3U92A 5CMKA 2UYFA 2GFEA 4YKKA 3TFLA 4DCXA 3UK4A 4FAJA 3H6WA 3LSFB 2D21A 3VVFA 4GD5A 3LC8A 1VE4A 4FEBA 1LFGA 2NWJA 4FECA 3T9XB 4RPNA 4ZE9A 3IOWA 3CG1A 1Q1KA 2O84X 2NOOA 3LSLA 1B7UA 1B51A 1MQDA 4KI0E 4WXJA 1R9QA 4PETA 2H4IA 3ODBA 4KPTA 2UYEA 4NMYA 1MQHA 4LQ5A 3MZ1A 2HXWA 1POY1 3TPAA 3FUZA 4BDLA 4RY1A 2QS1A 3E9XA 2Z8EA 1MQJA 1L5TA 2HZLA 4G77A 2AIXA 4DIGA 4OESA 2Y84A 3SEXA 3FVNA 2THIA 4X1BA 1VSOA 3C31A 2F36A 5H8HB 1B1HA 2ABHA 4U2RA 1JQFA 1SBPA 3E4RA 5H8NB 3FXQA 4EXLA 1UTBA 5KZTA 4WEPA 4TQUQ 5CBSA 1O64A 4DXCA 2ZNTA 4BDQA 4UA8A 1MH3A 3N6TA 3CI8A 1MQIA 4LONB 4IO4A 3HHFA 4BDMA 4LVQA 3MP6A 1FTLA 4PFYA 1SDXA 3TQWA 4ZEDA 3B7DA 3RGYA 3K0VA 1R1NA 2ONRA 1DSNA 2DWIA 4G8NA 3D4CA 2PVUA 4NF5A 2UVHA 2RCAA 2E0SA 4M1VA 2I4BA 3ZKKA 1UIVA 1YAEA 2Z8DA 1PB7A 3SEVA 4X9TA 1NNPA 4U1OA 3PUXE 4HS7A 4LUBA 5I57A 2V3TA 3H6UA 2Z8FA 4L17A 2Y7IA 3K4UA 2F7CA 1SI1A 3QYTA 5L9SA 5H8QA 4G68A 3C32A 5HM4B 4XKQA 1XC1A 1ZU0A 1MY4A 4F3GA 4GFRA 1B3LA 3BBRA 3LSWA 3G7WA 2DWHA 2Q88A 3I5OA 3A09A 2REGA 1LBCA 2YPNA 4KD5A 5JTYB 4GLIA 3TEPA 1M5BA 1ATGA 5AA4B 3JYRA 1JEUA 1AMFA 1LB9A 3FGSA 4G68C 4GRKA 4F1YA 1ZJLA 1NMUA 1BTJA 4BLAA 1PDAA 2I48A 2QRYA 1SW1A 3CIJA 2F7BA 1SD3A 2F6GA 1DTZA 3K1MA 5KCJB 3FJ7A 2ZYKA 1B0LA 3IOUA 3R6UA 5I2NB 2X7QA 3H6TA 4AB6A 4I8CA 2Q2AA 4F3PA 3SEUA 2QS4A 2F7AA 2XXTA 4GXSB 2A5TA 1B3GA 1HSJA 1POTA 3S9EA 4JB7A 1MXYA 4TLMB 3T93B 2I49A 1MDQA 3VLWA 3LBSA 5LOMA 3H6VA 1N3WA 4I62A 1LAFE 3UORA 4MH5A 2O68A 3MVXA 3TTKA 4YB5A 5AA2D 3RT8A 1SW4A 3IAZA 1N3XA 4BDNA 1M5FA 4LA9A 3C4MA 2V84A 4ONYA 4HW8A 4R74A 4PFWA 1B5IA 3B6WA 5CI5A 3IB2A 1A7LA 4RYAA 3PPRA 3LSXA 2X7PA 4IO3A 1PC3A 1ZKBA 4BDRA 3MUQA 1PBQA 2H98A 4Q8RA 2OJTA 3IB0A 1ZLQA 2PT1A 3LUYA 3SERA 3VE1B 4OEVA 2XXUA 1MRPA 3SEWA 3M3KA 3MC2A 2A5SA 3EHTA 4ZDMA 1VFDA 4X48A 1TFAA 4JWOA 3OEKA 4NWDA 3OSQA 3TCGA 3Q28A 4R2BA 1NL5A 5IAIA 4FIMA 4Q5TA 3QXMA 1P1QA 3K2DA 1USYH 1P1WA 3F11A 5TPAB 4AQ4A 3S4UA 3K6UA 4H6DA 3KG2A 1B05A 4LZ8A 3OO8A 4QFLA 1OQGA 2F6PA 1GVCA 1IIWA 3SESA 4G8MA 1MXXA 4FJPA 4ELPA 5EHMA 3L6GA 4ZZEA 2VD3A 3DP6A 1B7HA 3OXNA 3TZAA 1OMPA 2O7UA 3O6IA 3VLUA 3ECRA 3TCFA 4JDFA 2UXAA 2VOZA 1NNKA 1HSLA 2I3WA 3O2AA 4IY6A 3CG3A 4ISUA 4PQJA 1SW5A 3S9LC 3WAFA 4DCYA 2HQ0A 5K2XA 4QFOA 1B4ZA 3U1OA 1Y1ZA 4QSCA 3KJTA 1YCJA 4IO6A 1JW4A 1DTGA 1CB6A 3H3GA 2RKMA 4WEDA 1MPDA 3R7XA 1TXFA 3ZKLA 1MY0A 3S2VA 1XVYA 1B40A 1IZ1A 3A3UA 4GOTA 1LBBA 2OLBA 3K01A 2P1SA 4THIA 4E0WA 1YTVA 3THIA 5AE4A 4POWA 4QF9A 3C36A 1Y3QA 1FQCA 1B6HA 1SYHA 4F22A 3MVYA 3MP1A 4EQ7A 4TOZA 2R6GE 3VXCA 1A8EA 3T9VA 4NWCA 1JETA 4U1ZA 5I2KA 5AA3A 3OO6A 4KYSA 5FTIA 4FATA 4O3AA 3O9PA 1EZOA 3FASA 1PB9A 3MVZA 2DXYA 5KDTA 4OVJA 4RA1A 4QRZA 1BP5A 3M3FA 4U23A 3FXRA 4GQOA 1MY2A 2DVZA 5I56B 1PB8A 1US5A 1BLFA 3Q25A 2OK2A 1LAHE 1OLAA 1QULA 5ELVA 3MW0A 3K02A 3W15C 3IX1A 4YKPA 2ZMBA 5BUUA 1QUIA 1IQ7A 2XXQA 3G3GA 3OMBA 2XXHA 2HEUA 1FTJA 2ZYOA 4YB6A 1T0KA 5FTHA 3RLFE 4YZZA 1B3HA 1OVTA 2ONSA 4YAHX 2O51A 4GL0A 4P0IA 1H3DA 2ALUA 2UVIA 1XVXA 3UN6A 4H8IA 1IXIA 4AB5A 1RKMA 2I4CA 4H1XA 4HTGA 4ELQA 1LAXA 1XS5A 1KWHA 4MLVA 1ZTYA 2VD2A 1D3KA 4NF6B 2OWTA 3JV9A 1M5DA 1S7YA 1NKXA 3KN7A 4HCYA 1Y1MA 2VP1A 1D9YA 2V3QA 4LP2B 5DT6A 2XXXA 1B46A 1P1NA 3G3FA 4QSDA 2F97A 2XX9A 3PUYE 3IO4A 2DYXA 2Q9TA 2PMSA 3TDJA 1D4NA 4GXAA 3PMWA 3M3LA 4F3SA 3T96B 3FZVA 4IO5A 4KCCA 1FTMA 4XXUA 5BWJA 3K1NA 2XD2A 1O63A 2AL4A 2R9JA 1SVXB 3G3HA 3EN3A 3FV1A 2XXYA 3KSJA 1URSA 2O7IA 3KEIA 3MPLA 1FTOA 1N76A 4ZECA 4QHQA 4OQOA 2RINA 1IXCA 1FQBA 4R2FA 1J1NA 1B1XA 2DXRA 2H9BA 2LAOA 1WVJA 1I6QA 4HCWA 2O1MA 4U22A 4QFNA 1FQDA 4JWYA 1UQWA 4ESWA 3HSTA 2DS9A 2OWSA 3GBAA 3RT6B 4G4PA 4ESXA 1BIYA 4EUOA 3P7IA 3ZS6A 5I58A 2QSXA 1VFEA 3I3VA 4Q0CA 5I59A 1P1UA 2W7YA 2AYSA 4ZEKA 4C0RA 4H5FA 2IA4A 3CRBA 3VV5A 2B3FA 4MFIA 5B70A 3W9WA 4I1DA 1UTHA 3QIMA 5DVJA 1XHYA 3FJGA 3EQ1A 1UTBB 2RC7A 4F2QA 5ITOA 3DLNA 1JVXA 3EF7A 3IB1A 5DVIA 5F1QA 3SDFA 1SI0A 2XX8A 4ZEBA 1LFHA 3ILTB 4OETA 1PEBA 1MY1A 5TP9A 2NVUB 2DVCA 1WDNA 2RCBA 2HCAA 2YJPA 1NNTA 3C9HA 3N5LA 4XTCQ 3V89B 1XOCA 1ANFA 2UVGA 3MVWA 2FYIA 1SW2A 1H45A 2OBGA 3SKPA 4IGTA 3MP8A 3PPQA 4NF5B 3H06B 2XXIA 3GZGA 1N7XA 4FORA 4N13A 2HAVA 3QUJA 3K6XA 3EHSA 4OWDA 1NFTA 3PD8A 4KHZE 4DXUA 1SYIA 3PU5A 4KCDA 5I57B 3KN3A 3HO7A 3S9MC 3OENA 2DOJA 4LZ5A 3IR1A 5H8FA 4OZ9A 3SETA 5H8QB 4G68B 3S9NC 5A5XA 1TT1A 3T9HB 2Z23A 3KN8A 4KYDA 3Q26A 3ONMA 3U93A 4JBZA 2G93A 4U4XA 4YMAA 1US4A 5F7VA 5CMBA 3IL1B 4OTEA 1MM7A 2PT2A 1B3EA 4OFLA 3U72A 1NH7A 4IO7A 4IO2A 3OO9A 1Q35A 3PPPA 4G8HA 3G3JA 2RC8A 3O6GA 3Q27A 2NXOA 2XXVA 1BKAA 1TWYA 5DEXA 2Q8JA 5ITPA 5M2VA 4JWXA 1FCKA 4YB7A 1OIBA 5AA2A 4GWOA 2DWAA 1A8FA 3OD7A 2F34A 1FQEA 4QFKA 3PUVE 2QPQA 1MXUA 1Y20A 2XX7A 4NF8A 2CMOA 2A5TB 3MPKA 3W9VA 3ZSFA 2F8DA 4N6PA 3FD3A 4RXLA 3I6VA 4ELOA 4IGRA 2V25A 3CVGA 2Z22A 3RN8A 3VDFA 2ONKE 2RF1A 2FNCA 1LB8A 4NF4A 4YMBA 5J1DA 1A54A 3USDA 4EXKA 4IY5A 3LR1A 5IKBA 4OHNA 3FVKA 2Y7KA 3KGCA 3PMXA 5ICTA 2H5YA 2IEEA 4ND9A 3GXAA 3H03A 3N26A 3G3IA 4F31B 1ZIUA 2OZZA 2FA7A 3AXFA 3IOTA 1GR2A 3QSLA 2ZYNA 4PP0A 1EU8A 3PUZE 1MH4A 3MZ9A 3CFXA 3TODA 1Y4TA 2O6AA 4ZEIA 1MM6A 1MS7A 1EZPA 3E3KA 3OEMA 3WAEA 4DE8A 4LQ2A 4F29A 3DELB 1EZ9A 3PD9A 5L9MA 4H0WA 3PPOA 3IK6B 4FE8A 3MJNA 4OENA 2M8CA 5DTBA 2Y7PA 4RK9A 1MPBA 3G3KA 1LFIA 4OFJA 1Y3PA 3O28A 3FVGA 3KBRA 4PE5B 5JEIA 4R72A 1DOTA 1H43A 4RNSA 4KR5A 2XXWA 2HFBA 1P1OA 4XKRA 3PGFA 1N7WA 4NTLA 1Z7ME 5H8NA 3RTFB 4OERA 4Q30B 3DP4A 2PYYA 4K3FA 4FEDA 2F5XA 4POXA 2E1SA 1LSTA 3O6HA 4MF3A 1JW5A 1LCTA 3BFUA 2UVJA 4F18A 3KFMA 1CE2A 5DVFA 4GF8A 3B6QA 3FV2A 1AIVA 4OFOA 4EDPA 1QJMA 2G29A 2REJA 3E13X 4OYVA 5CM6A 3L6HA 4QFPA 4PFTA 1N04A 5FHOA 5AA1A 2ESNA 3DP8A 2B65A 3RQTA 2QJEA 4EF1A 3TQLA 3ILUB 4N07A 1MXZA 4ZEFA 2I3VA 4F1UA 4ZZAA 3IJXB 1IEJA 5HBCA 4F2OA 1B0HA 4KYEA 1I69A 2F78A 3FJMA 1URDA 4YKIA 4EF2A 1YPNA 5I2KB 2DSFA 4R6YA 4E0XA 3VLVA 1IUDA 3HV1A 1FQAA 1S9TA 2ZNSA 1MG1A 3BFTA 2ZXTA 4GL8A 4F19A 4DLDA 5KDTB 3DM0A 3RPWA 5JTYA 1B2HA 5CMMA 5L9OA 4H67A 5AA4A 1B3FA 1OLCA 1Z7NE 3B6TA 4Z7EA 1JEVA 2ANJA 4NE4A 3EPEA 3TUSA 3TCHA 4U21A 3QK6A 4TLLB 1XT8A 1ZMGA 3C34A 4ECFA 1MPCA 3O29A 5CRYA 2B3BA 4X1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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