1UTBA

Dntr from burkholderia sp. strain dnt
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFSELEHVGVVALNTGHGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSEAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Development of a Bacterial Biosensor for Nitrotoluenes: The Crystal Structure of the Transcriptional Regulator Dntr
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
molecule tags Transcription regulation
total genus 60
structure length 214
sequence length 214
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1utbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1utbA02
1ZIUA 1MXVA 1XVXA 1PB9A 4MLVA 3Q26A 4GLIA 2X26A 3MP1A 2Y7WA 1R9LA 2DXRA 1MH3A 3SESA 3C31A 4JWXA 1Q35A 3DM0A 3PMVA 3IOVA 1IQ7A 3QUFA 3EF7A 2F6GA 2I3VA 1O7TA 3RN8A 3OELA 1S9TA 2DOJA 3F11A 1FTKA 4HCYA 1A7LA 3V83A 1JW1A 1MPBA 4QFLA 1EZ9A 2O1MA 2XXIA 3GBAA 4R74A 1N84A 3TELA 3OMBA 1B46A 5CBRA 4F39A 1B3GA 3TCHA 1BKAA 4NF5B 1N7WA 4LATA 4E0XA 4MBPA 1FQAA 4OQOA 2DYXA 2UXAA 3O2AA 5CI5A 4H5GA 1FQBA 3TTLA 4BLAA 2Z8EA 3WAFA 2W7YA 2XXRA 2P0SA 4H6DA 5I58B 2I4CA 3FV2A 3B6WA 1B5HA 4YICA 3RLFE 1GVCA 3D4GA 4O3BA 1HSLA 5CMBA 4DZ1A 4ND9A 3DP8A 2V3QA 3ZKLA 5BUUA 1B4ZA 3PPQA 2V84A 3VDFA 1NFTA 3IORA 1TFAA 3TPAA 2DSFA 4U4SA 3UORA 4Q0CA 3W15C 2DE2A 2AL4A 4U1ZA 4YMBA 5I59A 4GVOA 4PFWA 1Z7NE 3SDFA 2HAVA 3FV1A 2HCAA 5AA2B 1LBBA 1FQEA 1LAFE 4QSEA 3ZSFA 1LFIA 1UIVA 4HCWA 2V3UA 5H8FA 3LBSA 1ZMGA 4F29A 3MPLA 2PYYA 1I6AA 1JVXA 3FASA 3IB2A 3KG2A 2THIA 4NF8B 4NWCA 4TQUQ 1ZJLA 2UYFA 2XX7A 3SERA 4Z7EA 1H45A 3OO8A 2UVGA 1SVXB 3UN6A 2O6AA 2PBWA 4NWDA 3ONMA 3TCFA 1IXCA 1DPEA 2QMWA 3CI8A 4X9TA 3LSFB 3FIRA 4GL8A 4F3PA 3A3CA 5CMCA 4BDNA 5J1DA 3E13X 5JEIA 1D4NA 2Q89A 4ZEBA 1MM7A 1M5CA 1SW5A 2QS4A 3PV0E 3HSTA 2XHDA 4ZEKA 1JQFA 5JTYA 4ZZAA 3CIJA 3HPIA 4R6YA 1MDP1 4F19A 1M5EA 3MPKA 4NF4A 4G8NA 4JBZA 2GRVA 2HAUA 1RKMA 3SKPA 1II5A 1HSEA 3I6VA 4MF3A 4OFJA 5L9OA 2RC9A 1XC1A 3H6WA 3I3VA 4YB7A 2F35A 1HSJA 2V93A 4E0WA 1M5DA 3D4CA 4F22A 3ECRA 3FXQA 3IO4A 1NNFA 2I4BA 4ESXA 1MXZA 4POXA 4QF9A 2RKMA 1DSNA 1QULA 3IJXB 3RUMA 2FYIA 2HZLA 3IO6A 1SI1A 2FNCA 4DXCA 1B7ZA 4DE8A 3MAMA 2F36A 5ITOA 3GLBA 3DP6A 3MQ9A 2Z8FA 4JSOA 1N04A 4BDQA 3TTRA 1MQGA 1IIWA 2B3BA 3CSGA 1SYHA 5CMMA 1LLSA 3KSJA 1RYOA 2R9JA 3G3IA 3R7XA 1B7UA 5I59B 3JYRA 2Q8JA 3MZBA 2ANJA 3IAZA 3R6UA 4IY5A 4OEVA 3U8QA 3U72A 1PBQA 1JETA 3CFLA 1DPPA 2LAOA 2AL5A 1NNTA 4N07A 4FAJA 1B52A 3M3LA 5H8FB 3PUVE 2PMSA 1URDA 3PPOA 3LC8A 4PFUA 3MP8A 4KD5A 4NEDA 3O66A 3K6UA 2ZXTA 1NKXA 4YZZA 1ATGA 4GXAA 3DELB 3OSRA 2KLFA 3PUYE 1B05A 5CBSA 3CSBA 1B7HA 3B7DA 4ELOA 4F3SA 1FTMA 2F6PA 1LBCA 5EHMA 2NOOA 3MVWA 4L17A 4PE5B 3E9XA 2VD3A 1PBPA 1USYE 1UTHA 1IEJA 3TTMA 1ELJA 4OERA 3LSWA 1AIVA 4QFKA 3SETA 1YAEA 4OWDA 4U2RA 5JTYB 2X7PA 3EHTA 4FECA 4HTGA 4KI0E 2VP1A 5HM4B 1XOCA 4PFYA 3VXBA 4BDOA 1UIUA 3TFLA 1PEBA 4MH5A 2DWJA 4KPTA 2DWAA 3OO9A 4XKRA 1ZU0A 5DVIA 5H8NB 2NXOA 3UGWA 3IL1B 5L9SA 1US5A 3K4UA 4PQJA 1ZKBA 3MUQA 2QRYA 3O6GA 3B6TA 3RT8A 1FW0A 1I6BA 1UTBA 4DIGA 1P1UA 2DE3A 2REJA 2XXYA 1VR5A 4QFOA 4YU0A 5FHOA 4I62A 3N94A 4UACA 4EF2A 1BTJA 2Y7RA 4IO3A 1FTLA 4O3CA 4GL0A 2O68A 2F7CA 2R71A 2REGA 1FQDA 3MBPA 5TP9A 2OK2A 4GD5A 3VLVA 1J1NA 5CM6A 1EU8A 4GXSB 1URSA 4MLQA 2UVJA 4DXBA 4XIGQ 1AH5A 1Y20A 3ILUB 1FTJA 1H76A 4EDPA 3O29A 4DXUA 1QUJA 3TEPA 4H5FA 3Q25A 5DT6A 4YAHX 1L5TA 1OVTA 4YB5A 3MWBA 3G3FA 4K3FA 2DE4A 2I58A 3L6GA 4EUOA 2F34A 1QJMA 4U22A 4RA1A 1O63A 4LA9A 1F9BA 4OYVA 2FA7A 3TAJA 1N3XA 3CR9A 3TQWA 4JDFA 2XD2A 1T0KA 1POY1 2ZYNA 4FIMA 3K00A 1EZOA 1P1OA 3G3KA 4FORA 1P1NA 4C1TA 1H3DA 2I0CA 4GWOA 1EH3A 1EZPA 4WEDA 4Q5TA 1MXYA 2XXXA 3S9EA 3G3JA 2V3TA 1IITA 1R9QA 3BBRA 1S50A 3Q29A 1MPDA 1WVJA 4NF6B 2F5XA 3FGSA 3QK6A 1Y3NA 2Y7KA 1XT8A 3E3KA 1SDXA 4IY6A 4P0GA 1AMFA 1B1HA 3QXMA 5DVJA 2UVHA 4ECFA 3EHSA 3AXFA 4LONB 2X7QA 4MFIA 4EQ7A 3V5AA 1B5IA 2DWIA 1Y4CA 1MRPA 4IO7A 3MVZA 2Y84A 2I3WA 1BIYA 1A8EA 3U92A 3PUZE 4OVJA 5M2VA 5KCJA 1B32A 4U21A 4AB5A 5CMKA 2XXHA 1LCTA 4XXUA 4N6PA 4POWA 1MQIA 4XKQA 4G68A 4R9FA 4OMBA 3KFMA 3TODA 2F97A 3IOTA 2ZYKA 3N5LA 3IK6B 1SD3A 4GOTA 3B6QA 3OEMA 3R26A 2A5TA 3MC2A 3T22A 4C0RA 3DP4A 3MVXA 1TFDA 5ITPA 5TU0A 5TP9B 4PFTA 2G93A 5DEXA 3FVGA 4F2QA 2DP8A 3O9PA 1WDNA 4ZEFA 3QUJA 3H6VA 5FHNA 3H3GA 4G4PA 2PX1A 1NNKA 2ZNUA 4OESA 5H8HA 4IGTA 3VFJA 1OQHA 4OFLA 3KN8A 4YKJA 1VSOA 2I48A 3EN3A 3S9NC 2B3FA 3HO7A 3RT6B 4ELRA 2ZYMA 4G2ZA 2O1LA 3HV1A 1AOVA 1R6ZA 3SEYA 2NVUB 1B1XA 4FEDA 1P99A 4P11A 5KDTA 2Z8DA 3WAEA 4RYAA 1FQCA 1RYXA 4OEUA 1VFEA 3FD3A 3OXNA 3CVGA 3G7WA 4FJPA 4F1VA 1LSTA 5AA3A 1SW4A 4RXLA 1ZBMA 2QMXA 1MH4A 4KHZE 5KZTA 3OOAA 3IJOB 4PETA 5JK4A 3PUWE 4KFQA 2E0SA 2YPNA 3IOWA 1MG1A 5HBCA 4Z0IA 2GH9A 4R73A 4R9GA 2GHBA 3C9HA 2Q2CA 4RPOA 3T9XB 4NTLA 1POTA 3G3HA 1MY3A 4OENA 1Y9UA 4C1UA 3IOUA 3MP6A 1JNFA 1LB9A 3TKDA 4BDLA 4QHQA 2Q88A 3VV5A 1QW0A 3PPRA 1D9YA 2VHAA 5IAIA 3EHUA 1SW1A 1JW4A 4OETA 4M4GA 2F7AA 2HEUA 2OWTA 4ZZEA 4IO4A 2OBGA 5CRYA 4Q30B 4I1DA 1B5JA 2F8DA 4G68B 4TOZA 1B9JA 2UYEA 4R72A 3RTWB 4QFPA 3FVKA 1QUKA 3U1OA 2Y7IA 2ZYOA 3KGCA 2DS9A 2XXQA 3GXAA 5L9MA 1QVSA 2OZZA 2A5TB 4PP0A 4YMAA 2RINA 4Q8RA 1USYH 4IO6A 1US4A 3K6VA 4G8MA 3SEXA 4R2FA 3JV9A 1OLAA 5H8QA 4AQ4A 4LUBA 4U1OA 1MQHA 1Y1ZA 3KBRA 4OFOA 2IEEA 4EXLA 3SEWA 3I5OA 2O84X 1JEVA 4DCXA 1DTZA 1A55A 1I69A 1IXIA 4YKIA 4U4XA 3K1NA 3K1PA 4BDMA 2CZLA 4NF4B 5ICQA 1IUDA 1R1NA 4G68C 2P2AA 1VFDA 4THIA 3SEVA 3TMGA 4QFNA 3TCGA 5KDTB 3A3UA 4EQBA 3KN3A 4I9DA 2ONRA 2XXWA 4DDDA 1XS5A 5B7DA 1FTOA 4WEPA 2R6GE 4X1DA 3VLWA 4RPNA 2I0BA 1ZLQA 3CG3A 3CRBA 5I58A 1B4HA 4F18A 5I57A 1LB8A 3G3GA 3O97A 1OIBA 1IZ1A 1Q1KA 3MW0A 3PU5A 5ELVA 1H44A 3K1MA 3PGFA 1GGGA 2RC8A 1BLFA 2HXWA 3MZ1A 1XVYA 3THIA 2OWSA 1DTGA 4F1YA 1B6HA 1NH8A 1SQYA 2F7BA 3T9UA 3KOTA 1O64A 4LP2B 5F1QA 2QS1A 2QS2A 2XD3A 3V89B 3TYHA 5AA2A 1LGBC 4JB7A 3UP9A 1B51A 1P1WA 2XXVA 5IKBA 3OENA 5BWJA 1PC3A 4P0IA 4ZE8A 4ZE9A 2QL3A 1GTKA 4F1UA 2ABHA 3T66A 2ZNSA 2GFEA 2ZNTA 1MQDA 3H7MA 4DCYA 3PPPA 4LZ5A 1MDQA 5DYHA 4KYSA 3CFXA 4HW8A 2M8CA 1Z7ME 3N26A 3N6UA 4YB6A 2VD2A 2XX8A 2QS3A 4ZECA 3H06B 3T93B 3FUZA 1MY4A 1SYIA 2E1SA 2I6EA 3H03A 5H8QB 1NNPA 2GHAA 1B0LA 3EPEA 3ILTB 2ALUA 5A5XA 4G77A 4RNSA 3TQLA 1IXGA 2QPQA 4XKPA 1UTHB 4ZEDA 3BFUA 2ONKE 4EF1A 4I8CA 3M3KA 4GIZA 2H25A 3UA8A 2O7IA 1B2HA 4BDRA 2Z22A 3RQTA 2HFBA 3QSLA 3U93A 5AA1A 2H99A 3VE1B 4OTEA 4KQPA 1SBPA 3O6IA 4GQOA 4H0WA 5F7VA 3IB0A 3VVDA 4IO2A 2ZMBA 2D21A 4ZS9A 4EXKA 3OO7A 3T96B 5K2YA 3GZGA 4F31B 2VGQA 4KYDA 1MXWA 4H67A 1MS7A 3K6XA 1Y3QA 1URGA 3IB1A 1LFHA 2OLBA 5I57B 2DVZA 3FVOA 3OEKA 1UTBB 5FTHA 5I56A 5B70A 4QRZA 1CE2A 1B3FA 1ANFA 5FHMA 1UQWA 4KR5A 2O7UA 1M5FA 4ONYA 3MVYA 4R2BA 3PD9A 2O51A 2QSXA 2XX9A 4DLDA 1YPNA 2OJTA 3TDJA 4ESWA 2DVCA 3Q28A 2DWHA 1YTVA 2QJEA 3EQ1A 3FATA 4RY1A 3JZJA 1NL5A 3PMWA 3K6WA 4LQ5A 3M3FA 3OO6A 5FTIA 4JXIA 1TWYA 1B0HA 1DOTA 2P1SA 2Y7PA 4YKPA 4X48A 4WKMA 4JSDA 3L6HA 5EYFA 1MY2A 5DVFA 3LR1A 5I84A 2XXUA 3CG1A 1QUIA 4R75A 4KCCA 2Q2AA 3OD7A 2OCUA 2YJPA 4IGRA 2PT1A 3GBBA 3TTKA 4OXVA 3C4MA 3VLUA 2YLNA 3H6TA 3IX1A 3QYTA 2F78A 1A40A 2DQVA 3TZAA 3ODBA 1MXXA 3KEIA 3HN0A 4RJZA 3C35A 5A5XB 4XTCQ 4LVQA 2NWJA 1I6QA 5HPQA 3LSLA 4XKNA 1B3LA 4TLMB 5AA4A 2Z23A 1PB8A 4O3AA 4FE8A 2D3IA 1VE4A 3TUSA 1IXHA 3HCQA 1PDAA 4QSDA 1GV8A 1WODA 3C32A 3KJ7A 1QKBA 2ESNA 3KZGA 1OQGA 1Y1MA 5H8NA 1DMBA 4NMYA 5ICTA 3W9WA 1AL3A 3FXRA 1MPCA 2HQ0A 3BKIB 4FATA 1S7YA 5I2KA 4F3GA 3KSXA 1Y4TA 3QAXA 3O28A 3CFZA 1D9VA 3FVNA 1PB7A 1SW2A 5KCJB 4F2OA 4RK2A 5I56B 4EQ9A 3ZKKA 1LAXA 4ISUA 2D5WA 2ONSA 4ELPA 4ELQA 1OVBA 2RF1A 4X1BA 2RC7A 3W9VA 5AE4A 2A5SA 2CMOA 3VXCA 4GFRA 5LOMA 2AYSA 2H9BA 3FJGA 4WXJA 3N6TA 3OSQA 1LAHE 4KCDA 1JEUA 4LQ2A 3FXUA 3HHFA 5TPAA 5DTBA 2V25A 3MZ9A 2RCBA 1M5BA 3A09A 1YCJA 3KOSA 1D3KA 1A99A 5I2NA 3MJNA 3ZS6A 4QSCA 3RPWA 3VVEA 2UVIA 5DEXB 1N76A 3S2VA 2H98A 3RGYA 3RY3A 3KN7A 1B40A 1NMUA 1N7XA 1MM6A 3K2DA 1GR2A 2NUVA 1MY1A 1KWHA 3K0VA 1B58A 2AIXA 3FJ7A 3PPNA 5H8HB 4OHNA 3LUYA 1B3EA 3T9VA 3C34A 4YKKA 3UK4A 4G8HA 4JWYA 4R6HA 3VVFA 3C33A 4OZ9A 2BJJX 3UIFA 1MXUA 3T9HB 3O6HA 1TT1A 1MQJA 3TTNA 2Q9TA 3M8UA 3C36A 1NH7A 4AB6A 4FEBA 4KYEA 4TLLB 4NF5A 1FCKA 3HHGA 3QIMA 1JVYA 3KJTA 1Y3PA 4JWOA 3BFTA 4LZ8A 4R6KA 1OMPA 3RNNA 2H5YA 2IA4A 3USDA 4IO5A 1N0TA 5AA4B 5H8SA 3E4RA 5K2XA 4H8JA 4NF6A 1A54A 4IB2A 2PVUA 3PD8A 3LSXA 3PMXA 3K02A 4N13A 1LFGA 4U23A 3FZVA 2G29A 4F3BA 1XHYA 3S4UA 4HS7A 1SI0A 3PUXE 4ZDMA 2XXPA 3P7IA 1OLCA 1BP5A 3K01A 2H4IA 4GF8A 2O69A 1MY0A 4H1XA 4M1VA 2PT2A 2VOZA 1A8FA 1H43A 1N3WA 3RTFB 3FJMA 2RCAA 3H4ZA 2XXTA 5I2KB 2HZKA 5CC2A 1FQFA 4RK9A 2DXYA 3V8XB 1TXFA 5L8DA 2WKYA 3S9MC 3Q27A 1CB6A 1LCFA 3H6UA 4H65A 1P1QA 3DLNA 5ISUA 2I49A 4NF8A 4H8IA 1LAGE 3IR1A 4GRKA 1B3HA 4ZEIA 5TPAB 3S9LC 4LZ7A 4UA8A 3U94A 5EHSA 4NE4A 2B65A 1JW5A 5AA2D 3SEUA 1QKAA 1ZTYA 5I2NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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