4FIMA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with celecoxib acid at 1.80 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with celecoxib acid at 1.80 A Resolution
rcsb
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA02
1URDA 1XVXA 2H4IA 3TODA 4PFTA 2QS4A 5IAIA 1QUIA 5DEXB 4OWDA 4O3BA 4NWCA 1PBPA 4YKPA 4F22A 1JVXA 1PC3A 4ZE9A 1NNTA 1PBQA 5ICTA 3UP9A 1N7WA 4EDPA 4NF6A 1OVTA 2B3FA 4XKQA 4LZ5A 5FHMA 5CRYA 3PMWA 3CI8A 4GLIA 1RYXA 5I2KB 1M5BA 5AA4B 3N5LA 4GWOA 4IY6A 1NL5A 1FQAA 4IO2A 3GBAA 2NWJA 5KDTB 1MM6A 4C1TA 4QHQA 4GXSB 1I6AA 3KFMA 4DLDA 5L9OA 3S2VA 4YKJA 4F3PA 4ZEBA 3JV9A 4NF5B 1NNFA 3JYRA 1SBPA 5K2XA 3DP8A 2H99A 4POXA 5H8FA 3EHSA 1IEJA 4GIZA 2QSXA 3IORA 2DYXA 3FV1A 5DVJA 3G7WA 2PBWA 1IXHA 1PB8A 3MBPA 2X26A 3HN0A 2YPNA 4I8CA 4YAHX 2XD2A 4XTCQ 1ZIUA 4F2QA 1B40A 4R6HA 4F2OA 4OMBA 3RUMA 3MC2A 1B5HA 1NH8A 1N7XA 5CBSA 1QUJA 1LFIA 1MQGA 3P7IA 3ZSFA 4EXLA 1I6QA 2VP1A 4HCWA 3THIA 2RCBA 3EQ1A 5EYFA 2Y7KA 1B7ZA 4EQ9A 1B1HA 3ZKLA 4QFOA 2NOOA 2ZNTA 3PMVA 4ZEKA 3S9MC 2XXWA 5TP9B 1CB6A 2X7PA 3LR1A 2CMOA 3TTLA 1LB8A 4H1XA 2ESNA 1B46A 4NF8B 5KCJA 2H25A 2O84X 4NEDA 4WEPA 4F1UA 2HEUA 4ELQA 1B5JA 4JWYA 4G8HA 5A5XA 4ZEDA 3K1NA 2XXYA 3U1OA 5EHMA 3TQWA 1XS5A 2Q2AA 2I3VA 3A09A 3KOSA 3FVNA 2XXRA 3FATA 1VFEA 3EF7A 1OQHA 1P1NA 1IUDA 4KYEA 3BFUA 1PB7A 3OO7A 3RT8A 3MP6A 1EZOA 4OYVA 3FV2A 1ZJLA 1B3HA 4M1VA 3KEIA 3RLFE 1UIVA 1NNKA 3Q29A 3PPOA 3O2AA 1UTBA 3SESA 3FJGA 1FTOA 3VLWA 2Q8JA 3U72A 1B52A 1LLSA 3O28A 4GFRA 2YLNA 1US5A 1WODA 4ELOA 5JTYA 1O64A 2I6EA 4EF1A 5FTHA 4EF2A 1JETA 3S9LC 4DXBA 5I2NA 1MXXA 1DPPA 2DWJA 4ZECA 2ZNUA 2KLFA 3OD7A 2XXTA 5IKBA 1LAHE 2F6GA 4R73A 4RA1A 3RNNA 4OEVA 4N6PA 1AOVA 4HS7A 3LUYA 4ESWA 2IEEA 3TELA 4RNSA 1NNPA 1TXFA 5HBCA 3CIJA 5K2YA 5CMKA 1MY0A 1B5IA 1QKAA 1AH5A 4M4GA 3TUSA 3U94A 2THIA 4Q5TA 4F3SA 1QVSA 2YJPA 3G3JA 1ZU0A 4U23A 2UVHA 3VFJA 2DWIA 3OSRA 3K1MA 1B58A 1ANFA 2ZYKA 3O6GA 2Y7RA 2H98A 1LB9A 2A5TA 2OJTA 3EHTA 3QAXA 4ELRA 4R75A 4U4SA 3WAFA 1EZPA 4WKMA 1HSLA 1ZKBA 1Y3QA 3Q25A 4OQOA 2QPQA 4GD5A 3PPRA 2HZKA 4F1VA 2RC8A 4RPNA 3SEXA 4QFPA 1S9TA 4IY5A 3E3KA 3MJNA 1URSA 1JEVA 2Z8FA 3HHFA 1T0KA 2VGQA 3TTNA 1BTJA 2Y7IA 1D9YA 4DCXA 4GL8A 4THIA 4GRKA 1MRPA 3B7DA 3TKDA 3K02A 3OOAA 5CMBA 3C32A 2NUVA 1POY1 2ABHA 1NMUA 2AIXA 3IJOB 4JWOA 2GFEA 4RXLA 5FHOA 2PT1A 1US4A 5TPAA 2B65A 2DE3A 4JDFA 1NH7A 3CVGA 4I62A 1LCTA 1MDP1 5BUUA 1AL3A 1MS7A 4F3BA 4G68B 2E1SA 4MLVA 3TEPA 4I9DA 2I48A 3G3KA 3SEYA 3CG1A 3FVOA 4RY1A 1UTHB 4OFLA 1MXZA 2HZLA 4ZS9A 1GV8A 3T22A 2RCAA 4G8MA 3K2DA 2Q88A 5F1QA 5ICQA 2V93A 1MDQA 5KCJB 3QUJA 1RYOA 1Y3PA 5ISUA 1RKMA 3OELA 3PGFA 3VDFA 2H5YA 3A3UA 1HSJA 5A5XB 2UYEA 4QSEA 2W7YA 4ELPA 4ONYA 1Q35A 1I6BA 4E0XA 3FGSA 3VXCA 4JXIA 3M3KA 1VSOA 1JNFA 1B7UA 1SYHA 2OBGA 5EHSA 2F5XA 3N94A 2IA4A 2NVUB 3PD9A 3KN7A 3FJMA 1A99A 4ECFA 4FECA 2HAVA 3FXUA 4Q8RA 2QMWA 3KSXA 3CFZA 3MPKA 4LA9A 3N26A 2O1MA 4IO6A 3UORA 2G93A 1IXGA 3U92A 1QW0A 1L5TA 2HXWA 4LONB 5FTIA 2QMXA 3VVFA 2GH9A 4GQOA 1POTA 4R72A 4R9GA 3USDA 4N07A 3DLNA 4JBZA 5I58A 3FASA 2M8CA 3LSXA 1XHYA 3H6TA 1GGGA 3H06B 4G77A 1Y4TA 5AA2A 1MH4A 3V8XB 5HM4B 4DXCA 4FATA 1D9VA 2DVZA 5JEIA 3A3CA 5HPQA 2DXRA 4G4PA 3TZAA 5H8NA 4G68C 2I0CA 3S9EA 4PP0A 4F3GA 4R2FA 2DXYA 1XT8A 2I4CA 1N0TA 4OZ9A 1ZLQA 4Z7EA 1SQYA 1R9LA 4OENA 2V3UA 1EZ9A 3W9WA 4F1YA 1H44A 3T9XB 2F7BA 3T9VA 2ZMBA 3PD8A 4MFIA 4RYAA 1P1OA 4UA8A 4N13A 5H8SA 3DELB 1TFAA 3CRBA 3GZGA 2PX1A 1AMFA 3CSBA 1MQHA 2I0BA 2V3QA 4F19A 2OLBA 3UK4A 3K01A 4HW8A 4QSDA 3IR1A 3O97A 3OEKA 1MXVA 1WDNA 3PUVE 4KQPA 3VXBA 1MQJA 1BP5A 4ISUA 1QKBA 2DS9A 4BDLA 4IO5A 5H8HA 2I58A 3KZGA 1FW0A 3OENA 4H67A 2XXHA 2RINA 1EU8A 4WXJA 3DP6A 2A5TB 2Z23A 1ELJA 5CMMA 4BDQA 3RT6B 1J1NA 4IO4A 1OMPA 4H5FA 2OZZA 2F35A 4H0WA 3KBRA 4YB7A 4H8JA 3K6WA 2ANJA 3ZKKA 2Y7WA 1B4HA 2DQVA 4O3CA 3LC8A 4MH5A 1OIBA 2P0SA 3H03A 2FYIA 4KI0E 2UYFA 4F29A 3PUYE 5ITOA 4R6KA 1A55A 3C31A 1Y20A 3FIRA 1XVYA 1USYE 1B4ZA 4GL0A 1XC1A 3K6XA 1JW1A 1FQBA 4ESXA 2OCUA 2VD2A 1Q1KA 3KG2A 4R74A 1R1NA 1SD3A 3T96B 1QUKA 3MZBA 4U1OA 1AIVA 5M2VA 4DCYA 4LP2B 4C0RA 2XXQA 4DZ1A 2G29A 1SYIA 5KZTA 3MVZA 1IQ7A 5H8QB 3UGWA 3R7XA 3EHUA 2XHDA 3IAZA 3HO7A 5F7VA 5AA3A 4FEDA 1MH3A 2PVUA 4RK2A 5I59B 1N84A 3T66A 3MVYA 4KPTA 1O7TA 4IO3A 4NF4B 3WAEA 3C34A 4NMYA 5AA4A 3W9VA 3TCFA 1LBCA 1SW5A 3ODBA 1FTLA 1P99A 3CR9A 2NXOA 1B3EA 2DSFA 1LFHA 1B0HA 1WVJA 1MXWA 1LAGE 4LQ5A 4EUOA 1JQFA 4QFLA 1LAXA 1DPEA 4NF5A 1F9BA 4RJZA 4YMBA 1Y1ZA 3V89B 4YZZA 5L9SA 2Q9TA 3CG3A 1B2HA 1ZMGA 2OWSA 3MW0A 2O69A 3EN3A 4YMAA 1B51A 2QS2A 3K4UA 1Z7ME 2DWHA 1MXYA 1KWHA 4NWDA 1SW2A 1Y3NA 3RTWB 4GOTA 3TTMA 2O7UA 4TQUQ 4IB2A 2O1LA 4TLLB 4IO7A 4QF9A 3KOTA 4NF6B 2F6PA 4R9FA 2OK2A 1SI1A 3SERA 3PU5A 2F36A 2QS3A 4QFKA 4Q0CA 2O51A 2REGA 1P1UA 2OWTA 4KYSA 4QFNA 4UACA 4IGRA 1MY1A 3G3IA 3GLBA 3L6HA 1S50A 1N04A 4MBPA 3RN8A 1DSNA 4O3AA 5TP9A 2GHAA 3TQLA 1MPCA 4NF8A 1D3KA 5H8FB 4L17A 1VR5A 1FQCA 3FXQA 1EH3A 1B7HA 5CBRA 1A7LA 4Q30B 2HCAA 5BWJA 4PFUA 2F34A 3IOWA 1YCJA 5LOMA 3KN8A 3H3GA 3QYTA 4RPOA 5DT6A 2R6GE 4R2BA 3B6WA 3D4CA 3Q27A 4YICA 3ILTB 4PE5B 4XKRA 3SDFA 1YAEA 2ONKE 1SW4A 3IOUA 4OERA 1PDAA 4XXUA 2XXPA 1BKAA 4JSOA 1QJMA 1BIYA 2DE2A 5CM6A 1B0LA 3RY3A 2B3BA 3LBSA 5CI5A 1D4NA 4JSDA 3O66A 3MZ1A 2DWAA 4ZDMA 1TT1A 1IXCA 1B6HA 1ZTYA 4F18A 3H7MA 1M5CA 5B70A 2PMSA 4H65A 5B7DA 2LAOA 3IX1A 3LSFB 1OLAA 2RKMA 3IB2A 3IO6A 3O29A 3HV1A 2O6AA 4LZ7A 1B3GA 3AXFA 2I3WA 1SVXB 3H4ZA 5DVFA 4PFWA 3K0VA 4U1ZA 2BJJX 1FQFA 1R6ZA 3IO4A 3RQTA 3G3FA 1N3XA 4PETA 4AQ4A 3HPIA 3MP1A 4HTGA 2XXVA 2ZYNA 4LATA 3TMGA 4FJPA 2F7AA 3BKIB 2DOJA 4F39A 1MPBA 1FQDA 3CFLA 3IB1A 3U8QA 1UTBB 3PPPA 4YB5A 2QL3A 1TWYA 2A5SA 4K3FA 4YU0A 1MY3A 5JTYB 3ZS6A 1LGBC 3QK6A 4ZZAA 1M5DA 2Z8DA 4FEBA 5I56A 3RGYA 4C1UA 5I2NB 1A8EA 3MPLA 4LZ8A 1MY2A 1PEBA 1M5EA 4LUBA 3IOTA 5AA2D 2O68A 2XXXA 1GTKA 3N6UA 4GF8A 3TAJA 3M3LA 4DDDA 2P1SA 1M5FA 1FTJA 3E4RA 4E0WA 1XOCA 3CFXA 1II5A 3OO8A 3HHGA 4OVJA 4OESA 2Y84A 1UQWA 3D4GA 3PUZE 2ONSA 4XIGQ 2V84A 1USYH 1JW5A 3TDJA 2ZXTA 1P1WA 3QSLA 4H8IA 4FORA 1JVYA 1MM7A 3PUWE 3VLVA 4KD5A 3FUZA 3KN3A 1OQGA 3C36A 2F78A 4KR5A 3ONMA 3FXRA 4IGTA 3G3HA 2Z22A 3T9UA 3QUFA 1H3DA 3W15C 3MVXA 4G8NA 5FHNA 1A54A 4Z0IA 2QS1A 1DTZA 4U21A 5JK4A 2P2AA 1SI0A 4XKNA 4BDNA 2I49A 4MLQA 4OTEA 2ZYOA 5I84A 2RF1A 1A40A 2DE4A 2F97A 2UVGA 1H76A 4G68A 2AL5A 4YKKA 1JW4A 4KCDA 3Q26A 3TCGA 4FIMA 3IL1B 1CE2A 3SETA 4X1BA 4QRZA 1UTHA 3GXAA 1B1XA 4OFJA 5L9MA 1R9QA 3V83A 3C35A 2Y7PA 3PMXA 3HSTA 3QXMA 1LFGA 3HCQA 4X48A 3T9HB 2XD3A 2X7QA 3VV5A 1TFDA 3KGCA 1Y4CA 2REJA 4JWXA 4HCYA 4KHZE 5I57A 4P11A 3MVWA 4X9TA 3L6GA 1S7YA 1LAFE 1IIWA 1IXIA 1N3WA 1VFDA 3ILUB 3SKPA 4TLMB 3I3VA 1LSTA 5TPAB 3ECRA 1P1QA 4P0GA 5L8DA 1B32A 3T93B 4AB6A 1SDXA 5DEXA 5AE4A 3KJTA 3TPAA 3OO9A 1IZ1A 3FJ7A 3H6VA 3OMBA 3K6UA 5CC2A 3C9HA 2ONRA 4NE4A 2HQ0A 2XX9A 2QJEA 2UVJA 2GHBA 1H45A 3H6WA 1PB9A 3MAMA 1OVBA 3FVGA 3RPWA 4I1DA 1HSEA 2UXAA 5I2KA 4U4XA 3VVDA 4X1DA 2HAUA 3OEMA 3GBBA 5KDTA 1NKXA 4GXAA 2XX7A 3MP8A 4XKPA 3VE1B 3MUQA 1Z7NE 3UN6A 2D21A 3IB0A 1MG1A 4LVQA 4QSCA 1B3LA 3M3FA 5DVIA 1MQDA 2H9BA 1MQIA 3EPEA 2AL4A 2PT2A 3IJXB 3BFTA 4PFYA 1BLFA 4ZE8A 3UA8A 4G2ZA 1B05A 4POWA 4FAJA 3JZJA 3TTRA 2XX8A 4TOZA 1UIUA 4BDOA 4YKIA 3I6VA 3SEWA 1Y9UA 3F11A 1N76A 1OLCA 3LSWA 5DYHA 2F7CA 3C4MA 3O9PA 5J1DA 2ALUA 3OSQA 3K1PA 5I58B 2PYYA 3PV0E 3B6QA 3SEVA 4R6YA 3O6HA 4FE8A 5AA2B 3U93A 4ZEFA 2GRVA 1FCKA 3TTKA 3OO6A 5I56B 3FZVA 3FD3A 4LQ2A 2WKYA 5H8NB 1I69A 2Z8EA 4KYDA 1MY4A 1URGA 2RC7A 4PQJA 1MXUA 4U2RA 3MQ9A 4JB7A 2QRYA 4P0IA 1SW1A 1FTMA 4U22A 1O63A 1YTVA 3FVKA 3R6UA 4DIGA 2O7IA 3LSLA 2ZNSA 2VHAA 4H5GA 1GVCA 1DOTA 4BDRA 2VOZA 1ATGA 3E13X 4BLAA 3K00A 3KSJA 3S4UA 1DMBA 4DE8A 1LCFA 5ITPA 4ZZEA 2R71A 3MWBA 3C33A 3VVEA 2HFBA 1GR2A 1FTKA 3IOVA 2R9JA 2XXIA 5ELVA 4AB5A 2V3TA 2RC9A 3UIFA 1H43A 3DM0A 3TFLA 3Q28A 5H8HB 4KCCA 2VD3A 2I4BA 4OXVA 3RTFB 2F8DA 4NTLA 5CMCA 3DP4A 1NFTA 1B3FA 3QIMA 4EXKA 3IK6B 2V25A 2UVIA 3SEUA 3V5AA 2AYSA 4ND9A 3CSGA 2CZLA 4BDMA 3S9NC 3B6TA 4OETA 4OHNA 5H8QA 2E0SA 3TYHA 4GVOA 1QULA 3O6IA 3OXNA 1ZBMA 5I59A 1MPDA 3I5OA 1FQEA 1Y1MA 2Q89A 3PPNA 2ZYMA 2D3IA 4NF4A 2FNCA 4H6DA 4EQ7A 3K6VA 2Q2CA 1JEUA 4MF3A 4ZEIA 4YB6A 3M8UA 3G3GA 3N6TA 2D5WA 4DXUA 3H6UA 4KFQA 4RK9A 3VLUA 2FA7A 3R26A 1DTGA 3KJ7A 3PPQA 2DVCA 5AA1A 4WEDA 5DTBA 5TU0A 3E9XA 5I57B 1LBBA 2XXUA 4F31B 1A8FA 3BBRA 2DP8A 3MZ9A 3PUXE 4OFOA 1YPNA 1VE4A 3TCHA 4EQBA 1IITA 1B9JA 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3S9MC 2DDKA 2XXWA 5TP9B 1CB6A 2HPGA 2X7PA 3LR1A 2CMOA 3TTLA 1FPDA 1LB8A 4H1XA 2ESNA 1B46A 4NF8B 5KCJA 4X04A 4HE2A 2H25A 2O84X 2VPNA 4NEDA 4WEPA 1RDYA 4F1UA 2HEUA 4ELQA 1B5JA 4JWYA 4G8HA 5A5XA 4ZEDA 3K1NA 2XXYA 3U1OA 1DCUA 5EHMA 3TQWA 3IFAA 1XS5A 2FIXA 2Q2AA 2I3VA 2QFLA 3A09A 3KOSA 3FVNA 2XXRA 3FATA 5A5LA 1VFEA 3EF7A 1OQHA 1P1NA 1IUDA 4KYEA 4P9KA 3BFUA 1PB7A 3OO7A 3RT8A 3MP6A 1EZOA 4OYVA 3FV2A 4GX3A 1ZJLA 1B3HA 4M1VA 3KEIA 2CZIA 3RLFE 1UIVA 1NNKA 3Q29A 3PPOA 3O2AA 1XI6A 1UTBA 4P47A 3SESA 3FJGA 1FTOA 3VLWA 2Q8JA 3U72A 1B52A 1LLSA 3O28A 4GFRA 2YLNA 1US5A 1WODA 4ELOA 5JTYA 1O64A 2I6EA 4EF1A 5FTHA 4MX6A 4EF2A 1JETA 3S9LC 4DXBA 5I2NA 1MXXA 1DPPA 1FPBA 2DWJA 4ZECA 2ZNUA 2KLFA 3OD7A 2XXTA 1YYZA 5IKBA 4GWUA 5ET8A 1LAHE 2F6GA 4R73A 4RA1A 3RNNA 2WEFA 4OEVA 4N6PA 1AOVA 4HS7A 3LUYA 4ESWA 2IEEA 4PC9A 3TELA 4RNSA 1NNPA 1TXFA 5HBCA 3CIJA 1FTAA 5K2YA 2XWOA 5CMKA 1LBXA 1MY0A 1B5IA 2HXRA 1QKAA 1AH5A 4M4GA 3TUSA 3U94A 1AWBA 2THIA 4Q5TA 5I7IA 4F3SA 1QVSA 4DI4B 2YJPA 3G3JA 1ZU0A 4U23A 4OVRA 5T3JA 2UVHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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