4FIMA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with celecoxib acid at 1.80 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with celecoxib acid at 1.80 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA02
1UTBB 3S9EA 1BKAA 2O69A 3G3JA 4G68C 3H03A 4X9TA 5TPAB 4KI0E 2OBGA 1A55A 4X48A 2ZNTA 4FAJA 1IXHA 3O66A 4EDPA 2Q2AA 3OOAA 4AQ4A 4F29A 4YMAA 3EN3A 3VLVA 3RNNA 4ZDMA 3AXFA 3H06B 1SDXA 1MXWA 3O97A 3GXAA 3O6IA 1QULA 1I69A 1UQWA 2E1SA 3R26A 3R6UA 4O3CA 5AA2B 1VFDA 3FXRA 3PMWA 4ZEKA 2OLBA 3RN8A 3M8UA 3O28A 1EZ9A 1JEVA 2AIXA 2ONSA 3B7DA 4QSCA 5CC2A 4R2BA 3Q28A 3TTKA 2XXWA 2ZYMA 1O64A 4NF5A 3KFMA 4POWA 4R6HA 3TODA 5DEXA 4DDDA 3Q27A 1A54A 5AA4B 2H5YA 4X1BA 1B0LA 4F1VA 5K2XA 4HS7A 4QFNA 2V3UA 1MRPA 3FXUA 4GIZA 3ZKLA 4ELOA 1JETA 4NF8B 1ZU0A 3QUFA 4OTEA 1POTA 3U8QA 5ELVA 4IO3A 4IO6A 3M3LA 3IO6A 3OO8A 1URSA 5I56B 5BWJA 3V5AA 3PPRA 1I6AA 2LAOA 4WEDA 1P1UA 2A5TA 3N6TA 3ZS6A 1A40A 2OK2A 4YB7A 3T96B 2QS4A 1GGGA 2HZKA 4QSDA 1US4A 1LAFE 1MPCA 3T9UA 4KCDA 5H8SA 2B65A 4EF1A 5EHMA 4BDMA 3MP1A 3H6VA 2Q88A 4NF4B 1SD3A 1B3HA 1ATGA 1SW5A 3OMBA 5HPQA 5KCJA 3IORA 3PUVE 1VR5A 4NE4A 2XXQA 4OQOA 1ZLQA 3IB0A 4OWDA 2DE2A 2QMWA 3TELA 3KZGA 2DSFA 3Q26A 4EQBA 5H8FA 1OIBA 4HCYA 3SERA 1DMBA 4P0GA 2I0CA 4DCXA 1QJMA 4NWCA 5JTYB 4ELQA 1NMUA 1AL3A 3THIA 1B0HA 3TUSA 1MQIA 3UGWA 3O6HA 1SW1A 5I59B 4ESXA 1WODA 3CSBA 4MF3A 5KDTA 5CI5A 1MS7A 3MP6A 2RF1A 3PPPA 4N07A 4F2OA 2HXWA 4F18A 2UVJA 3K1NA 1R9QA 1Z7NE 3I5OA 4OERA 3WAFA 1CB6A 2PT1A 5I2NB 1AOVA 1EH3A 3H6WA 3O2AA 4BDLA 2KLFA 1Y3NA 3GBAA 4ZS9A 4ZZAA 4G4PA 3QXMA 3FVGA 3EHSA 1JNFA 3JZJA 1N76A 1P1WA 3N5LA 3PPNA 1TFDA 4U4XA 4EXKA 1F9BA 2D3IA 3B6TA 4LZ8A 1FQCA 2VP1A 4H8IA 4PFYA 4WEPA 2O7UA 2Z8EA 3KSJA 1I6QA 3LUYA 5ICTA 1ZMGA 1XOCA 2Q89A 3G3FA 1B3LA 2GRVA 1UTHA 2ZNSA 3A3CA 3LC8A 4NMYA 1LBBA 1LGBC 4FJPA 3USDA 3CFZA 3ONMA 4I62A 4F22A 3FZVA 4LA9A 4QHQA 4YZZA 1SI0A 3PUYE 4ZZEA 3HCQA 4OHNA 1MH4A 5TP9B 2FA7A 1B3FA 2HFBA 1HSJA 4RPNA 4GRKA 2PX1A 2XXUA 2UYFA 1NNKA 1D3KA 2OWSA 1DPEA 4RJZA 2OWTA 1D9VA 4LUBA 5FHNA 2Y84A 3EQ1A 3TAJA 4ELPA 1HSEA 4IY6A 5L9SA 2UVIA 3T22A 3EHUA 2YJPA 4KR5A 1A99A 1OVBA 3V89B 1MY2A 4LZ7A 3KG2A 3PMXA 5DYHA 4G8NA 2ESNA 2ONRA 3L6HA 1KWHA 1B9JA 1NNTA 3DELB 3DP6A 5KZTA 1MY3A 1XHYA 3TCGA 1XVXA 5AA4A 3TKDA 1B1HA 1URGA 3I3VA 4G68A 2B3FA 3MC2A 4OETA 4PETA 4IGTA 4LQ5A 4F2QA 4KYDA 4POXA 3CFLA 2RC9A 2O51A 1D9YA 1UIVA 5F1QA 4NF4A 3H3GA 2DE3A 1FCKA 1RYOA 2I4CA 1IUDA 4R74A 5M2VA 2PBWA 4TOZA 1QUIA 3RGYA 3GBBA 3K00A 2GFEA 3RQTA 4F3SA 5IAIA 2A5TB 3RLFE 1B7UA 2WKYA 1QW0A 2ZMBA 1H44A 2D21A 1FQEA 2RC8A 1CE2A 2QSXA 3C31A 3CI8A 3FV2A 3K1MA 4K3FA 1J1NA 3MBPA 5DEXB 4Z7EA 1QUKA 5AA2D 1QVSA 1BIYA 1UTBA 1YTVA 2F97A 3IB1A 3BKIB 4DXCA 5J1DA 3O9PA 3T93B 3PGFA 2Q8JA 1A7LA 5CMBA 5CMKA 4U21A 4AB5A 1M5CA 3IX1A 1RYXA 3G3GA 4N6PA 2ABHA 2V93A 3K6WA 1N84A 5A5XB 4XXUA 3K6UA 4JWYA 1SYIA 4YKJA 1I6BA 2NWJA 2OJTA 1LB9A 4R2FA 3CG3A 3TQLA 2DS9A 1M5BA 2H25A 1N04A 2QMXA 3BFUA 1FQFA 3TPAA 5B70A 5H8NB 2PVUA 4FEDA 3VXBA 1WDNA 1ZBMA 2V3TA 1MY0A 1SW2A 3E3KA 4FECA 4RY1A 2F36A 1MPBA 1ANFA 1B32A 2D5WA 3KN7A 1JW5A 2IA4A 4KYEA 1MQGA 4JBZA 1A8EA 1BLFA 4G8HA 1P1OA 1PB9A 2DYXA 3IOUA 1LAXA 5CBRA 3FD3A 3KN8A 1SYHA 4PP0A 2O1LA 3MW0A 2F7AA 3DLNA 4RPOA 3ZKKA 4QF9A 1S7YA 3M3KA 1Y1ZA 1LCTA 3TZAA 4IO5A 1OQGA 4H5FA 4M1VA 1FW0A 5TU0A 2H98A 1LCFA 3KJTA 3KOSA 4IO4A 4QFLA 3MJNA 1FTMA 3KEIA 5H8NA 2A5SA 4IO7A 1OMPA 3CR9A 1USYE 4X1DA 1GVCA 4U22A 2Z23A 2YPNA 1PB8A 1IITA 4N13A 4ELRA 3HSTA 4ZE8A 3SEVA 3JYRA 3QAXA 4F3PA 4IGRA 3FVNA 1M5EA 2ZYKA 2F78A 2UVGA 4RA1A 1TXFA 4GVOA 3RPWA 3PV0E 2H4IA 1BP5A 3IO4A 4PFUA 4YAHX 1NKXA 4YB5A 3MUQA 2O1MA 4DIGA 2F6PA 2NUVA 1IZ1A 3IOWA 3KSXA 3LSFB 1B40A 3CSGA 4FORA 4H1XA 3U1OA 2Y7PA 4I9DA 2THIA 4FATA 3DP8A 3FIRA 3MZBA 4KQPA 1AMFA 3HN0A 3U92A 3TMGA 3OXNA 3U94A 4DLDA 2IEEA 1BTJA 2Y7WA 1PBQA 2ZYOA 1Y4CA 1ZIUA 4MH5A 1S50A 4ESWA 1SQYA 4LZ5A 4HTGA 2XXTA 4LONB 1JVYA 1B58A 2PYYA 1GTKA 3RTFB 5KCJB 2XXVA 2E0SA 4YICA 5TP9A 4C1UA 2AYSA 2RINA 3S2VA 4F19A 4U1OA 2CZLA 4JDFA 1OVTA 3SESA 2DQVA 2P1SA 5I2NA 4M4GA 3RT6B 1S9TA 4YKKA 4GXAA 4TLMB 3ODBA 1EZPA 2I3VA 1JW4A 1FTKA 3EPEA 4GXSB 5H8FB 3T9XB 5KDTB 1MQDA 1ZTYA 2XXPA 4G2ZA 5FHMA 1UTHB 1P1NA 1GV8A 1M5FA 2PT2A 3TEPA 3ILTB 5DVIA 1R6ZA 4KD5A 2FYIA 4Z0IA 2F7CA 3EHTA 3HHFA 3KGCA 2REJA 4JSDA 1Y4TA 4TLLB 3TTMA 4EQ7A 2QJEA 3CVGA 5H8HA 1MY1A 3QIMA 4C0RA 1XVYA 2X7QA 3BBRA 5I57A 2O6AA 4Q30B 5DVJA 2F7BA 4E0XA 1L5TA 3S9NC 1B2HA 1N3XA 3K6XA 4OEUA 2P2AA 4OEVA 1DTGA 2O84X 4UA8A 4F3BA 4R6KA 1MXXA 1VFEA 4F1YA 1O63A 3OSRA 3SEWA 1LFIA 4DCYA 4OFLA 1RKMA 3K2DA 3S4UA 1B3EA 3G3IA 1PEBA 4KCCA 4H6DA 3U93A 4EUOA 5I58A 4FE8A 4PFTA 1SVXB 2Q9TA 3BFTA 1JW1A 1UIUA 3K4UA 1DSNA 4LQ2A 4YMBA 1ZJLA 3FV1A 1D4NA 1LAHE 1Y3QA 3KOTA 4QFPA 3IL1B 3MAMA 2QS3A 4BDQA 4EF2A 2DWJA 2PMSA 4UACA 1HSLA 1MH3A 4Q5TA 1M5DA 4FIMA 5L9MA 5TPAA 5CM6A 4G68B 2VOZA 2XX7A 3ILUB 3SEYA 2XXIA 3SDFA 1FQDA 1ZKBA 2XD3A 3P7IA 4U23A 5H8QB 2XD2A 1DPPA 3DP4A 1LAGE 1LLSA 3VFJA 3RUMA 3C33A 4WKMA 4JXIA 3QYTA 3O6GA 2F5XA 3MPLA 4OYVA 1TFAA 4LVQA 3GZGA 4OFJA 1MDQA 4I8CA 2DWAA 3CFXA 3ZSFA 2DWHA 1QKBA 2DVCA 1NNPA 2HAVA 4XKQA 5H8HB 2Z22A 3FJ7A 3OEMA 4Q8RA 4IB2A 1B1XA 3K0VA 4NF6B 4BDRA 4DXBA 3U72A 2AL4A 2DE4A 1VSOA 2ZXTA 3LSWA 2QL3A 4GL8A 5F7VA 2V84A 3FASA 4L17A 1GR2A 2XHDA 3SKPA 2ANJA 3VLWA 3W9WA 4DE8A 3Q25A 1A8FA 1MXZA 1N3WA 1N7WA 3OO7A 3M3FA 2AL5A 3GLBA 1POY1 3PU5A 2CMOA 3KBRA 4R75A 4R6YA 3R7XA 2Y7IA 3HO7A 1MQHA 4KPTA 3IOVA 4H8JA 2QS1A 1FQAA 2Z8DA 1FTJA 5K2YA 1PDAA 3PUWE 4JWOA 4MLVA 4R9GA 5ISUA 1NFTA 2HQ0A 4BLAA 2F8DA 4YKIA 1P99A 3LBSA 4KHZE 2GHAA 4HW8A 1FTLA 2OZZA 4GQOA 4H67A 4NF6A 4FEBA 3UP9A 3UORA 3W15C 4QRZA 5CRYA 2NXOA 1MY4A 3JV9A 2GHBA 3C34A 1SBPA 4NF8A 3KN3A 1SI1A 1N0TA 1MQJA 1US5A 2O68A 2DOJA 4ZEBA 3C9HA 3RT8A 4ECFA 2P0SA 3UA8A 2Q2CA 3H6UA 4MFIA 4XTCQ 4GLIA 2XXYA 2BJJX 1LB8A 1SW4A 5DT6A 4ZEFA 3IJOB 3OO9A 2H99A 3MP8A 1ELJA 4JWXA 5JTYA 3B6WA 3H6TA 2O7IA 4OMBA 3VVEA 2R6GE 2F34A 1TT1A 4OESA 4BDOA 4DZ1A 1QUJA 3SEUA 3PD8A 1NH7A 3DM0A 5CMMA 1MXVA 3CG1A 3LSXA 3SEXA 5JEIA 3OENA 4EXLA 3Q29A 3C4MA 2HAUA 4TQUQ 3FVOA 2G29A 1OLCA 3QUJA 4Q0CA 3VLUA 1MDP1 2RCAA 3TCFA 4HCWA 1R9LA 1NNFA 2ONKE 2RC7A 3IR1A 5FTIA 3V8XB 3VV5A 1FTOA 3OELA 4XKNA 1P1QA 2QPQA 1MM7A 5FHOA 1JVXA 4ZECA 3K1PA 3ECRA 2FNCA 4MLQA 4BDNA 4QFOA 1OLAA 4KYSA 1PB7A 3VE1B 4ZEDA 2F6GA 4U1ZA 1IXIA 1IEJA 4H0WA 2I48A 1PBPA 2Y7RA 3MWBA 1USYH 2UYEA 4GL0A 4OENA 4NEDA 3MVWA 3VVDA 3VVFA 2I0BA 2I4BA 2QRYA 4ND9A 4JSOA 1MG1A 2VD2A 3PPOA 1XT8A 3MPKA 4P11A 1B4ZA 3A09A 1H76A 3E13X 4PE5B 5LOMA 4RYAA 3G3KA 4YU0A 2R71A 3A3UA 2DVZA 1Y9UA 3MVXA 3TCHA 1YAEA 2DWIA 2REGA 4LATA 5A5XA 2XXHA 5HM4B 5I58B 1LFHA 4RK9A 1VE4A 4G8MA 4GWOA 4NTLA 4YB6A 1B5HA 4GFRA 4OXVA 4P0IA 3RTWB 3S9MC 1QKAA 2H9BA 3S9LC 3IOTA 3LR1A 5I56A 3PMVA 5FTHA 5L9OA 1URDA 3TDJA 3TQWA 4F3GA 2GH9A 2M8CA 4GD5A 1T0KA 5AE4A 3IJXB 4KFQA 3OO6A 5I84A 4OVJA 1Z7ME 2UVHA 3UN6A 3H4ZA 3K02A 3MVZA 4RK2A 2XXXA 3MZ1A 2F35A 4R72A 5AA3A 3V83A 3FJGA 3EF7A 3N26A 4F39A 4GOTA 1EZOA 3FGSA 5L8DA 4YKPA 5CMCA 3T66A 1MM6A 1B52A 2I3WA 3T9VA 1IQ7A 4R9FA 4AB6A 4F1UA 3F11A 4OZ9A 4PFWA 3UK4A 1R1NA 2OCUA 3TTLA 3D4CA 3N6UA 4GF8A 1NL5A 3W9VA 3UIFA 2DXRA 5JK4A 3C36A 1B7HA 3E9XA 4RXLA 5ITOA 5I57B 3TFLA 4LP2B 5IKBA 4U4SA 2VHAA 3MZ9A 3VXCA 2UXAA 2I49A 2HCAA 3FATA 3KJ7A 3MQ9A 1O7TA 3VDFA 2RCBA 5I2KB 2XX9A 1B3GA 4XIGQ 4ZE9A 3OD7A 4O3AA 5CBSA 2RKMA 4E0WA 2HEUA 3SETA 1B4HA 1MXYA 5H8QA 3IB2A 3TTNA 2HZLA 2NOOA 3G7WA 1OQHA 5AA2A 2VD3A 4O3BA 1YPNA 4OFOA 2NVUB 1WVJA 5ITPA 2R9JA 1B05A 1B5IA 2DXYA 2Y7KA 2QS2A 2G93A 3TTRA 3HV1A 3FXQA 4RNSA 1Y20A 3HHGA 3TYHA 4EQ9A 3OSQA 1MXUA 1DOTA 1H43A 4H5GA 1EU8A 1LFGA 1MPDA 2XX8A 1N7XA 3QK6A 2B3BA 1B5JA 3O29A 3RY3A 1DTZA 1LBCA 2W7YA 4U2RA 2ZNUA 4THIA 3G3HA 4I1DA 4WXJA 3FUZA 3CIJA 1Y1MA 1IIWA 1B46A 2ALUA 1B7ZA 2DP8A 4R73A 4MBPA 1Q1KA 1B6HA 4QSEA 1IXGA 3K6VA 4XKPA 3C35A 3B6QA 4ZEIA 4IY5A 3LSLA 2V25A 4G77A 3H7MA 1JEUA 4NWDA 4PQJA 2ZYNA 3E4RA 3K01A 5I2KA 4NF5B 2Z8FA 1TWYA 1IXCA 3QSLA 3HPIA 1Y3PA 4QFKA 1H3DA 2I58A 3CRBA 2I6EA 3OEKA 2VGQA 3PPQA 1AIVA 5ICQA 1B51A 3MVYA 5BUUA 1II5A 4H65A 3IK6B 5DTBA 3WAEA 4DXUA 3PD9A 3D4GA 4ISUA 5DVFA 3T9HB 1YCJA 3L6GA 1NH8A 5HBCA 5I59A 1Q35A 2V3QA 3PUZE 1AH5A 2X26A 4IO2A 4F31B 2XXRA 3IAZA 4ONYA 4XKRA 3I6VA 5EHSA 3N94A 1PC3A 3PUXE 5AA1A 5B7DA 1LSTA 1FQBA 1XC1A 2X7PA 1H45A 1JQFA 3C32A 3FJMA 1XS5A 3FVKA 4JB7A 2YLNA 5EYFA 4C1TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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