4FIMA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with celecoxib acid at 1.80 a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with celecoxib acid at 1.80 A Resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 117
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fimA02
4O3CA 2UXAA 3H6UA 2CMOA 3EN3A 4KQPA 3R26A 4IO6A 3VVFA 1I69A 1SYHA 3O66A 5AA2B 5A5XB 3QAXA 5CM6A 1B9JA 1URDA 5L9SA 4YKPA 2QS2A 1P1QA 1FTKA 1MXWA 1N0TA 1D9VA 3K6XA 2OWTA 4JSOA 3VDFA 4ZEKA 4I8CA 2XD2A 4YB7A 2Y7RA 2UYEA 1ZLQA 4KCCA 3BBRA 1USYE 4ZEIA 3MZBA 3O2AA 4QHQA 1FTOA 2X26A 5KDTA 1N84A 3KFMA 3SESA 3CIJA 1MQGA 3UORA 4YAHX 1NFTA 2F5XA 1B6HA 2I3VA 4P0IA 1BTJA 2G93A 1B5HA 4JWYA 4XIGQ 2KLFA 3IO4A 4NTLA 3I3VA 3U94A 4R72A 3S4UA 4AB5A 3LSLA 3L6GA 4X1DA 1TFDA 4OTEA 1FQEA 3JZJA 4F2QA 1FQCA 1GVCA 4PFTA 3T66A 4DZ1A 3G7WA 3V8XB 3KBRA 3MZ9A 1LAGE 3SEYA 1XHYA 1UIUA 3O28A 4IO2A 4IO5A 1ZTYA 3MVYA 4XXUA 3TODA 1S7YA 2GHAA 3ZS6A 5ELVA 4OESA 1MG1A 1NMUA 3U72A 3FJ7A 4ZEBA 3TDJA 4QSEA 3VFJA 3K02A 1D4NA 1OVBA 2QS3A 3W15C 1NNTA 3FZVA 4DDDA 2RF1A 2O84X 1A40A 2HEUA 5L8DA 2OJTA 5ITPA 5CC2A 5CRYA 4R9FA 2HAUA 5FHNA 3M8UA 2AIXA 4G8MA 2Q89A 3UP9A 2V25A 3LC8A 3FV2A 2ZNSA 4G68C 1XC1A 2V3QA 1PB7A 1LAHE 2RC7A 5EYFA 4JB7A 5DEXB 1A8EA 5F7VA 5H8HB 3OO9A 4Z7EA 1F9BA 3OO7A 1D3KA 1LBCA 5CBRA 3G3HA 4H8JA 1YAEA 4GXSB 4MFIA 2H5YA 1Y9UA 1PDAA 1B46A 3ONMA 2XXQA 3IR1A 4U4XA 3PU5A 3TAJA 4BDMA 3MP6A 3E13X 3H3GA 1HSJA 1J1NA 3S9EA 2W7YA 3BFTA 4RNSA 1URSA 3F11A 2Z8FA 2DE3A 2AL5A 1RYOA 3K6VA 3PPNA 1IUDA 4U2RA 3K4UA 1EU8A 1SW5A 3OOAA 3IORA 4ELQA 2ONSA 2GH9A 3GBBA 5TP9A 2B3FA 4LUBA 4IGRA 3O29A 3KGCA 3MP1A 1DPPA 2V3UA 1TWYA 3QK6A 5ICTA 1ZBMA 2REGA 3KN3A 3VLUA 2LAOA 1P99A 1IXGA 1MH3A 2RCAA 3KJTA 2QSXA 1DOTA 4POXA 1B4ZA 4AQ4A 3M3KA 2GFEA 2PYYA 3DP4A 2DWJA 1AH5A 4HCYA 1VR5A 3Q25A 1LLSA 2RKMA 5I56B 1GTKA 5H8NA 3CG1A 3HHGA 4MBPA 4ECFA 3HHFA 1ANFA 1IXIA 2WKYA 4I62A 2Q8JA 1S50A 4ND9A 1ELJA 4GRKA 4BDOA 5FTHA 2I48A 1SYIA 5CMBA 3SEUA 3ILTB 1LCFA 1PEBA 1B32A 4OFOA 4EUOA 5FTIA 1UQWA 4U21A 1A55A 1ZJLA 2BJJX 1MXVA 4F19A 3H7MA 3RLFE 3CG3A 1UTHB 2ESNA 3PUZE 1MQIA 4O3AA 4JWOA 1PBPA 3TTLA 2PX1A 3VXBA 5BWJA 5DVJA 4QFPA 3MVZA 3MAMA 2Y7KA 4DCXA 2E0SA 1FW0A 4U4SA 5CMCA 3MP8A 5H8QB 3LBSA 4OYVA 3H4ZA 1EZPA 1XOCA 4OEUA 2Z8DA 2PT1A 3OD7A 4RA1A 2XXXA 5FHOA 3RNNA 5I57A 3HCQA 3A09A 4KCDA 4YMBA 2H9BA 4QSCA 5ISUA 5J1DA 1US5A 4OVJA 1EZ9A 4JSDA 1OIBA 3IOUA 4QFLA 2P2AA 1O7TA 4EF2A 2FNCA 1AOVA 4NF6B 3PMXA 3OEMA 4U1OA 1SW1A 2H99A 2Y84A 1B3LA 3KOSA 1BKAA 1UIVA 2ABHA 2X7QA 2XXWA 3A3UA 3S9MC 2QS4A 4ELOA 3CFLA 4FORA 1M5FA 1CE2A 4LATA 2FA7A 4NF5A 4QFNA 3K1NA 2XXUA 1H44A 1LGBC 4GFRA 1MPDA 1Z7NE 4H65A 3S9LC 5EHMA 3KEIA 1UTBB 4WEPA 1SDXA 4OMBA 3TCGA 1DSNA 1B40A 3N6TA 1MY1A 4I9DA 4TQUQ 4KR5A 5DTBA 2F7CA 2ZYOA 3O6HA 3FJMA 1HSEA 5F1QA 5AA1A 4PFWA 4MF3A 1MXUA 1DMBA 5ITOA 2ONRA 1A8FA 1NL5A 4O3BA 3FVKA 3TPAA 3TEPA 2F97A 4K3FA 1R6ZA 2O69A 1H3DA 4RYAA 1B05A 3THIA 2Y7PA 3TQLA 3OELA 4OHNA 2O1LA 1N7XA 2HXWA 5JK4A 4YKKA 2F36A 1LFIA 3I6VA 1NNFA 2ONKE 4F39A 4M1VA 4HCWA 2NXOA 1R1NA 3OO6A 5L9MA 3C33A 4PFYA 5CMKA 1R9LA 2A5TA 2H25A 2XXTA 3QXMA 3U93A 4G8NA 1N3WA 1XS5A 5H8FA 4BDNA 5I59A 1B7ZA 3D4GA 5B7DA 4ZE8A 1VE4A 3JV9A 3QUFA 4QSDA 1P1WA 3PMVA 2DS9A 4OZ9A 2VGQA 2NOOA 5JTYA 1LCTA 4OEVA 2OZZA 4RJZA 3VV5A 2Z8EA 3FV1A 3CI8A 3IB1A 2ALUA 3I5OA 4R74A 4DLDA 4JXIA 3MZ1A 4R6HA 5AA4A 3EHTA 1QULA 1Z7ME 1MPBA 4YMAA 5JEIA 2ZXTA 2I0BA 2Z22A 3C35A 3T9VA 1YCJA 4EDPA 4GWOA 2DE2A 3AXFA 2I6EA 3PD9A 1H45A 4LQ2A 1BIYA 1OLCA 4E0XA 2Q2CA 1TFAA 2DXYA 3PD8A 4NF4A 3TTKA 4Q8RA 1NKXA 3SEXA 3KZGA 2F8DA 3JYRA 3MC2A 3FUZA 5KDTB 2P0SA 3C4MA 1I6QA 3UA8A 4OWDA 1MXYA 3V89B 2OLBA 4YU0A 1PB8A 5AA3A 1EH3A 5CMMA 3IOVA 2O6AA 1SBPA 1USYH 2F7AA 3M3LA 1MDP1 2DWHA 2QPQA 1IEJA 4X1BA 2PVUA 3K6WA 1NH7A 4EXLA 2I3WA 4OFLA 2XHDA 1MXXA 3M3FA 2R6GE 4GIZA 3IK6B 4E0WA 1TXFA 4GVOA 2DXRA 1NNKA 3MUQA 2ZYKA 2DSFA 3DM0A 1QUJA 5M2VA 1QJMA 4DE8A 1JNFA 2HZLA 3K6UA 4ZEFA 1B3HA 2XX7A 3EHUA 4LZ5A 5L9OA 3PPQA 4NF8A 3FXQA 3RQTA 3OSRA 4F3BA 4FEBA 4F3PA 4YB6A 5EHSA 3GXAA 2AYSA 1MQHA 1B2HA 3ILUB 4ESWA 2XX8A 3LR1A 4EXKA 3T9XB 1B0LA 3CVGA 4ZDMA 5DYHA 3K0VA 3HO7A 3G3GA 4EQ7A 5I58A 3N5LA 1NH8A 3CFXA 4C0RA 2QS1A 3LUYA 4H67A 2VOZA 1AMFA 3C34A 4IO4A 1QUKA 2XD3A 3PV0E 4HTGA 4HS7A 2B3BA 1EZOA 2DWAA 3O6GA 1JW4A 4F3SA 2XXPA 3V83A 4XTCQ 2G29A 4NF8B 4FIMA 3O9PA 2I0CA 3FVOA 1FTLA 3TCFA 2XXIA 4H1XA 2ZNTA 4NEDA 4IB2A 4BDQA 1TT1A 5TPAA 3VXCA 4P0GA 2YLNA 4KD5A 4DIGA 2DQVA 1JEUA 2UVGA 4QFOA 2XX9A 4ELPA 4HW8A 4U23A 3K1MA 2Q2AA 3UK4A 5KCJA 3U92A 2VD2A 3ZSFA 5AA2D 3SEVA 5TP9B 3KJ7A 1LAFE 3W9VA 3A3CA 1HSLA 1WDNA 4H0WA 3VVEA 3WAFA 1MQDA 2HFBA 1A7LA 2UVHA 4JWXA 3R7XA 1DTGA 1B51A 1MPCA 4OXVA 2V84A 4DXBA 4N13A 3BFUA 3N26A 2D5WA 1AL3A 3FXRA 1IZ1A 4BLAA 3KOTA 3H6VA 3OXNA 2F6PA 5BUUA 4WKMA 1BLFA 1PC3A 3T22A 3C36A 3TQWA 3FATA 1ZKBA 1US4A 1P1UA 3EHSA 3TYHA 2O51A 4OQOA 4PP0A 5H8NB 2QMXA 3DP8A 3EQ1A 3FVGA 5I2NA 4I1DA 3L6HA 1FTJA 4JDFA 2REJA 2R9JA 4OERA 4H5FA 3UIFA 1N04A 3HSTA 2ZYMA 1MM6A 1FQDA 3V5AA 4IGTA 5IAIA 2ZNUA 1Q35A 4TLMB 3PUVE 1VFEA 1WVJA 1MM7A 4PQJA 1B1XA 1B5JA 1LB8A 1D9YA 2D21A 4ZE9A 3IX1A 4ZZAA 4YB5A 1CB6A 2NVUB 4NMYA 1XT8A 2RCBA 3RUMA 1OQHA 4F1VA 1Q1KA 1SVXB 3N94A 1IITA 2FYIA 2VP1A 3OMBA 1II5A 4OETA 2M8CA 1Y4TA 2QRYA 3G3KA 1O64A 4U1ZA 1A99A 2P1SA 5I2KA 5I57B 4KYDA 4G68A 4RPNA 4WXJA 1B0HA 2PMSA 4TOZA 4PETA 4BDRA 4JBZA 1IIWA 3PUYE 3FIRA 2PBWA 1OLAA 3K1PA 2RC8A 1H76A 3ECRA 1MXZA 1Y1MA 1MY2A 4GXAA 1M5BA 5CI5A 3E4RA 5HBCA 4GOTA 4R73A 3C31A 5AA2A 4KI0E 5A5XA 4C1UA 3RGYA 1LFGA 5IKBA 2RC9A 3N6UA 4G2ZA 1ZU0A 2OK2A 2IEEA 2YPNA 3RY3A 1AIVA 2RINA 4NF5B 4QFKA 4R2BA 4G68B 1M5CA 1Y3NA 1QKAA 1B58A 1SQYA 4G8HA 2QMWA 4DXCA 3GLBA 3PPOA 5HPQA 2HCAA 3LSFB 3RTWB 2V93A 1JVYA 2DYXA 3ZKLA 4NE4A 2YJPA 1QUIA 4R75A 1ATGA 3HV1A 5DVFA 3C9HA 2QL3A 3EF7A 1P1NA 3PUXE 3MVWA 1B3EA 3MQ9A 3WAEA 1B52A 4POWA 1OQGA 1M5DA 2Y7WA 2DE4A 1M5EA 1MY4A 3VLVA 3QSLA 4H5GA 3PUWE 4F1UA 4FAJA 1I6BA 1BP5A 1XVYA 3USDA 4RK9A 4FATA 4N07A 1B5IA 2DVCA 4G4PA 2H4IA 3VLWA 3OEKA 3CSBA 1S9TA 1QVSA 3O97A 4R6KA 3RN8A 2A5TB 1T0KA 2XXVA 4ZS9A 3IB2A 1LSTA 5H8FB 3PPPA 3KN7A 5I59B 1JW1A 4N6PA 5LOMA 4OENA 4UACA 2QJEA 1N7WA 3FASA 4YZZA 3OO8A 4DCYA 5B70A 3ZKKA 1RYXA 2GHBA 4LONB 5JTYB 3S2VA 2Q88A 4NWDA 1DTZA 1KWHA 1B1HA 4LQ5A 3TMGA 4ONYA 2XXYA 4LVQA 3ODBA 3RTFB 5AA4B 4Q30B 3PPRA 5DT6A 1URGA 2O7IA 1P1OA 4WEDA 3LSXA 4EQBA 1I6AA 1ZIUA 2B65A 4KPTA 1MDQA 1MY3A 5K2YA 3W9WA 5DEXA 3MPLA 3KSJA 3KN8A 2NUVA 4Q5TA 5H8HA 3TTNA 3KSXA 3C32A 1JW5A 1PB9A 1POY1 4NF4B 3SERA 3HPIA 1DPEA 3QYTA 3IOWA 3H03A 3IB0A 3IL1B 1RKMA 4EF1A 2A5SA 2I4BA 2GRVA 1B7HA 4X9TA 2OWSA 2VHAA 3IJOB 3LSWA 5AE4A 3O6IA 4U22A 3TKDA 3G3IA 4UA8A 1SW2A 2ZYNA 1JETA 4ZEDA 4GF8A 3TELA 3S9NC 4LA9A 3HN0A 1LBBA 2ZMBA 1QW0A 5DVIA 3G3FA 2R71A 3H6WA 1JQFA 1POTA 3H6TA 1B3FA 3CFZA 4OFJA 3PGFA 3FD3A 4QF9A 4BDLA 4R2FA 4DXUA 2DVZA 2I58A 3T9HB 3UN6A 1WODA 2O1MA 3E9XA 3IAZA 3PMWA 1VSOA 1H43A 3DP6A 4FE8A 1N76A 4RK2A 4ESXA 2V3TA 1QKBA 2Q9TA 3Q29A 3MPKA 4R9GA 2O68A 1Y3PA 4IO7A 4EQ9A 5FHMA 1MQJA 3U8QA 1MH4A 4GD5A 3TFLA 1IXCA 4ZECA 4MH5A 3VE1B 5I56A 3G3JA 2F78A 4F29A 1GV8A 1LAXA 2AL4A 1SI1A 1N3XA 2OBGA 2OCUA 2I49A 5TU0A 2CZLA 3RT6B 5ICQA 2XXRA 5I58B 2F35A 4P11A 3B6WA 4RXLA 3FGSA 4YKIA 2HQ0A 3IJXB 2DWIA 4XKQA 3R6UA 2F34A 1UTHA 3FVNA 4C1TA 2E1SA 3QUJA 3VVDA 1FCKA 5H8SA 2Y7IA 1NNPA 3D4CA 3MW0A 4TLLB 4X48A 4LZ7A 5TPAB 4F2OA 5CBSA 1XVXA 4FECA 5I84A 4Z0IA 4H8IA 3CRBA 5H8QA 1GR2A 1Y20A 2F6GA 1FQBA 3SETA 1R9QA 3QIMA 3EPEA 2DOJA 2UYFA 3IOTA 3FXUA 1IXHA 2DP8A 4XKPA 1PBQA 5HM4B 1YPNA 5KCJB 3TTRA 3B6QA 4KYEA 2ANJA 3K01A 3K00A 4KHZE 2IA4A 4F3GA 1A54A 3MVXA 4FEDA 4IY6A 2THIA 2X7PA 1OMPA 4ZZEA 1VFDA 2H98A 4NF6A 3MBPA 4GLIA 3MJNA 3KG2A 1L5TA 3CSGA 3RPWA 1SI0A 5KZTA 1B7UA 3B7DA 1GGGA 1B4HA 2Z23A 3U1OA 4PFUA 3Q27A 4RY1A 2UVJA 1Y4CA 3RT8A 3Q28A 1YTVA 1ZMGA 4H6DA 3MWBA 2D3IA 4YICA 4RPOA 3SDFA 3GBAA 4YKJA 4XKRA 3TTMA 1MRPA 3B6TA 2HAVA 3TCHA 4GL0A 4L17A 1LFHA 1IQ7A 1SD3A 4G77A 3OSQA 1UTBA 1Y3QA 4ELRA 4Q0CA 2I4CA 4KYSA 1Y1ZA 5I2NB 4LZ8A 1JEVA 3H06B 1JVXA 4IO3A 4F31B 4XKNA 2HZKA 3FJGA 3CR9A 3Q26A 2XXHA 5K2XA 2F7BA 1LB9A 3TUSA 3GZGA 3BKIB 2VD3A 3DLNA 1FTMA 1FQAA 2NWJA 1B3GA 1MY0A 2PT2A 2UVIA 3T9UA 3T93B 4GL8A 4QRZA 4PE5B 3K2DA 4F18A 4MLVA 4ISUA 4IY5A 1MS7A 4F22A 3TZAA 3DELB 4NWCA 1OVTA 3IO6A 3SEWA 3UGWA 4KFQA 4MLQA 5I2KB 4THIA 2O7UA 3P7IA 4AB6A 1SW4A 3SKPA 4LP2B 1FQFA 4GQOA 3OENA 1O63A 4FJPA 4F1YA 3T96B 4M4GA 3E3KA 4R6YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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