1LLSA

Crystal structure of unliganded maltose binding protein with xenon
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title DETECTION AND CHARACTERIZATION OF XENON-BINDING SITES IN PROTEINS BY 129XE NMR SPECTROSCOPY
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 130
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA01
1B0HA 1TFAA 4U1OA 4PETA 2XXIA 1M5BA 2GH9A 3SETA 2XXXA 5I84A 3QUJA 1PBQA 1B32A 1A40A 4F2QA 4YKKA 5J1DA 4GWOA 1B1HA 1ELJA 1JW4A 3MP8A 3FJMA 3FATA 4MBPA 3TTKA 2RF1A 3B7DA 2DQVA 2DYXA 3GBAA 4ESWA 4IO3A 1TFDA 1OQGA 4XKNA 3FIRA 3T93B 1MY3A 3A09A 4DCYA 1POTA 3CVGA 1Y3NA 1P1UA 1WODA 4EXKA 2O84X 1RYXA 3PD9A 4IGTA 3W9WA 1Y4CA 1QJMA 3K6WA 3GXAA 3TQWA 1DTGA 4JDFA 4NF6B 4O3AA 2O1LA 2O69A 1SQYA 3I5OA 2ZMBA 5ISUA 1XHYA 3N26A 4GXSB 3V8XB 3TCHA 4HCWA 3FV1A 2UYFA 4U4SA 2DWHA 2O7UA 3B6QA 1MRPA 4G77A 3V83A 1LCFA 4ZEFA 1GV8A 1JNFA 3VE1B 1B7ZA 3LBSA 4GXAA 3QK6A 4YKIA 4ZE8A 1DTZA 4NWDA 1LFHA 3LC8A 1UIVA 4OHNA 3QYTA 1MDP1 4IO5A 2W7YA 5CMBA 2HFBA 3SDFA 4QFPA 3ILUB 4Q30B 2DE4A 4YB7A 3DM0A 3PUVE 3S9NC 2ZNUA 2GHBA 5TP9B 1A7LA 2I3VA 3N94A 4F3SA 1UQWA 4TLMB 2QS3A 2O68A 1UTBB 1HSLA 3FXUA 5L9MA 3K6VA 5TU0A 5IAIA 2I3WA 1JETA 4KYEA 2ABHA 2NOOA 4H0WA 4FATA 4F39A 3MVYA 3W15C 1M5CA 4KI0E 3MBPA 4NWCA 1GR2A 2O7IA 4KD5A 5K2YA 2F7AA 5I58B 2F35A 4F1UA 2Z8EA 3H7MA 1NNKA 1YTVA 4H5GA 1FW0A 3FJGA 4FEDA 1A55A 4POXA 4RPOA 4OESA 1R9LA 4QRZA 1N0TA 1M5DA 3MP6A 1MPDA 3WAEA 3GLBA 3S9EA 1QUJA 3S9LC 5FTIA 2WKYA 5I58A 3U93A 1JEUA 1Q35A 1XVYA 2Y7KA 3TZAA 3ECRA 1QKAA 3M3KA 5FHMA 1FQFA 3TCFA 4AQ4A 3KFMA 1M5EA 3PUWE 3MAMA 1URSA 3HHGA 5DVFA 3Q26A 3TTMA 2UVIA 4G8NA 1QKBA 4QF9A 1USYE 1LLSA 1A99A 1PEBA 1MXWA 1VR5A 3PUXE 4FECA 3FJ7A 4F1YA 2OWTA 1AIVA 3JV9A 3UP9A 2Q89A 3RLFE 4EDPA 2H25A 3PMVA 4BDLA 3IOVA 1US5A 4F29A 4EQ7A 1T0KA 2XX8A 2B3FA 3U1OA 1Y1ZA 2VD3A 3F11A 5FHNA 1LFGA 1AL3A 1NKXA 4G8MA 3K02A 3MVXA 4DLDA 2Q88A 3CG1A 1LSTA 5HM4B 5HBCA 2XXQA 3CFXA 3MJNA 2FNCA 1SW2A 4OETA 2G29A 4G68B 3N6TA 3CR9A 2AIXA 1D3KA 3MQ9A 3SEVA 3L6GA 3EHUA 3OOAA 1MH3A 3IJXB 1SDXA 1ATGA 2CZLA 2QS2A 3K6UA 4QSEA 2RC7A 3T66A 3KEIA 4OMBA 2KLFA 3LSLA 5JEIA 3E3KA 1L5TA 3OSRA 2GRVA 4I1DA 1VFEA 3OO7A 2P0SA 1SW1A 4I8CA 2ONSA 3UIFA 5AA2D 3MPKA 2UVGA 1GTKA 3FVOA 2VD2A 4GRKA 4N6PA 3SKPA 3TYHA 3C32A 3KSXA 4NE4A 2UYEA 1B1XA 3N6UA 1JVYA 2I49A 5EYFA 4GD5A 2LAOA 1B51A 1LAGE 1LAHE 5CM6A 3ZKLA 3C33A 4DXCA 4AB6A 1DOTA 5AA3A 2RC8A 5CBSA 4P0IA 1O64A 1NNTA 3LSWA 3TEPA 1Y9UA 3Q28A 4TLLB 4KFQA 2ZYNA 1XOCA 1P1QA 4Q5TA 5CC2A 4E0XA 3OSQA 1R9QA 2A5TB 4JWXA 3T22A 5DEXB 4N07A 2Q2AA 1QVSA 4JXIA 1NH7A 2XXUA 3IO4A 1POY1 3IORA 3T9UA 4XIGQ 3TTRA 3VXCA 1SBPA 2XXHA 2F78A 3IAZA 2B65A 1I6BA 4RYAA 2A5TA 3C31A 2PT2A 3PV0E 5DEXA 1ZLQA 4ZEIA 3U8QA 1SVXB 3HN0A 4LUBA 1YPNA 1QUIA 5DTBA 2F5XA 4DZ1A 4EF2A 1SI1A 3FD3A 4R74A 1M5FA 2DXRA 4F31B 1B5HA 3H6TA 5DT6A 2QRYA 3O97A 5ELVA 5ICQA 1NFTA 3UA8A 1BLFA 1D9YA 1B3FA 3VVFA 3D4CA 4F3GA 3M3LA 3VLVA 4EQBA 2OBGA 4PFTA 4YB5A 4KYDA 4ELPA 3IX1A 3UN6A 2OK2A 4ZE9A 3N5LA 5M2VA 4RPNA 2ZYMA 2HXWA 3O28A 1MY1A 1P1NA 2Z8DA 2RINA 1EZPA 2RC9A 3DELB 1UIUA 1EZOA 1HSEA 4RA1A 1AH5A 3FVKA 1GGGA 4THIA 3R26A 3DP4A 5F1QA 1P1WA 1Q1KA 3FGSA 3O6IA 1DMBA 3IK6B 4LQ5A 3OELA 3P7IA 3C36A 3EPEA 3CFZA 3O9PA 3MVZA 1P99A 1FQCA 3TTNA 3VLWA 2HZLA 1D9VA 3BBRA 3SEYA 4F1VA 4R6KA 2R6GE 4NF5A 4XKQA 2FA7A 4MFIA 4DXBA 3QIMA 2THIA 3G3IA 4QFNA 5TPAA 1QW0A 1AOVA 4R9GA 4RY1A 4MH5A 4LVQA 3ODBA 5FHOA 2X26A 5JK4A 2QJEA 4ESXA 3SEXA 3PPNA 3LSFB 1TXFA 1B5IA 4OWDA 4F19A 3R7XA 3VXBA 1JEVA 3PPOA 5L9SA 4OXVA 4YAHX 5CMMA 2OWSA 2GFEA 3Q27A 1BIYA 2AL4A 1URDA 4ONYA 4EUOA 4IGRA 4GF8A 4QSCA 1CB6A 5H8QB 1B9JA 3PGFA 3T9XB 4PFWA 3MW0A 3S9MC 3USDA 3EN3A 4UACA 4Q0CA 1Z7NE 2H4IA 3CIJA 1ZKBA 4FORA 1IUDA 1PB9A 1LFIA 4F3BA 2XXPA 5JTYB 3K0VA 3MC2A 3PD8A 4KPTA 3CG3A 3KOSA 2NUVA 2H99A 2QMWA 2ANJA 2ALUA 3IO6A 4OTEA 4BDOA 5H8QA 3SEWA 1B52A 4C0RA 3S2VA 1OQHA 2F6PA 3RT6B 1WVJA 2RCBA 1MQHA 2H5YA 5I57A 4YB6A 5JTYA 5CMCA 4JSDA 1XT8A 4I62A 4ELQA 4HS7A 2F6GA 4LATA 1IZ1A 5CRYA 1PB7A 4H8IA 4NMYA 1MY4A 3DP6A 3K01A 3IB0A 2O1MA 2DP8A 5KDTB 1ZIUA 4U23A 1JW5A 2V25A 2Y84A 3QUFA 2DE3A 2VHAA 1LCTA 1BP5A 4YKJA 3LUYA 3OD7A 4L17A 3EQ1A 2B3BA 3KBRA 1FQBA 3IL1B 1ANFA 3O6HA 3M3FA 2V3UA 3CI8A 2XD2A 4GL0A 4QHQA 2XHDA 1H45A 5KDTA 3JZJA 1UTHB 2PT1A 1URGA 2DS9A 4JBZA 2I4CA 4N13A 5EHSA 4GIZA 2DE2A 4U2RA 3G3JA 3KSJA 2D21A 4XKPA 3RN8A 4ELRA 5ITPA 2I6EA 2I0CA 2G93A 1JQFA 4MLQA 3PMXA 2HEUA 1UTHA 3CRBA 3MZ1A 3K6XA 3OO8A 4IO6A 2VGQA 1MQDA 5EHMA 1N3XA 3OEMA 3KN7A 4F18A 1FTMA 2ONKE 4WKMA 4UA8A 3KJTA 1OVTA 4LQ2A 3FVNA 4I9DA 2RCAA 1LAXA 3IOWA 5KZTA 2X7PA 5AE4A 4PE5B 3L6HA 4LZ7A 4X1DA 3FXQA 2PX1A 3K1PA 2OLBA 2YPNA 3FVGA 1IXHA 3PU5A 2V84A 3TDJA 4WXJA 4AB5A 3KJ7A 4OFOA 4PP0A 2YJPA 1FQDA 1OVBA 2AL5A 5BWJA 1IXIA 5I2NB 3RUMA 3LR1A 2IEEA 3G7WA 4OEVA 2DVCA 4C1TA 1MXUA 4YMBA 3H6WA 3E9XA 1MH4A 1RKMA 1B5JA 3BFTA 1LGBC 2HQ0A 4RNSA 4LA9A 3RPWA 3G3GA 2NXOA 3TCGA 1FTLA 2ZYOA 2QS4A 3KZGA 5I2NA 1N7WA 1SYIA 1IXGA 3Q29A 2M8CA 1IXCA 4Z0IA 3VVDA 3H03A 4OYVA 4ZZAA 1MS7A 3E13X 3HPIA 3PPRA 3W9VA 3UK4A 4BDMA 1N84A 1GVCA 2X7QA 3EHTA 2FYIA 3RTWB 4OZ9A 4WEPA 3C9HA 3TTLA 4JWOA 4U22A 3H6VA 5AA1A 1LBCA 2YLNA 1ZU0A 4O3BA 4R72A 1LB9A 1MPBA 3HCQA 4XTCQ 1TWYA 1PC3A 4KQPA 2IA4A 4XXUA 3OENA 3ZS6A 4ZS9A 5A5XB 3K1NA 3IJOB 2F97A 1B3EA 2Z8FA 3MZBA 4R9FA 3VDFA 3QSLA 3SESA 1H44A 3RTFB 5L9OA 2V93A 3U94A 1J1NA 1XVXA 3MPLA 2XX9A 4LZ5A 3T9VA 3HV1A 1Y20A 1B58A 2BJJX 1KWHA 4BLAA 1B46A 1II5A 1OMPA 1B3LA 2F7CA 3RY3A 2P1SA 4HTGA 4ISUA 2DWAA 3OXNA 1XS5A 3H3GA 5A5XA 1A8EA 2QL3A 4BDNA 5ICTA 3TAJA 3IR1A 3O6GA 3SEUA 1SW5A 4G4PA 1FTJA 3UGWA 3M8UA 1IIWA 1NNPA 3A3CA 2HZKA 3TFLA 3R6UA 1MDQA 2PMSA 3C4MA 3VV5A 5AA2B 3MP1A 3ONMA 3C34A 2Y7PA 5AA4A 1FQEA 1A54A 2DWJA 1JW1A 1MQIA 1FTOA 2DWIA 3HO7A 4R2BA 4NF5B 4LP2B 4IY6A 3B6WA 5I59A 5TPAB 4KCCA 3I6VA 4G8HA 1US4A 1Y4TA 4E0WA 4JWYA 4X48A 2R9JA 5AA2A 4H65A 2P2AA 1MXYA 3RGYA 1RYOA 3H4ZA 3O29A 4NF8B 2F8DA 3I3VA 3UORA 4DE8A 1MG1A 3E4RA 2UVHA 2XXVA 2V3TA 1DSNA 2QMXA 3K4UA 3HSTA 4OEUA 1DPPA 1SW4A 1FCKA 5H8FB 2DXYA 1PBPA 1BTJA 4GLIA 3FASA 3KOTA 3EF7A 3S4UA 2DOJA 1N76A 2Y7IA 4P0GA 1ZBMA 4OFJA 4QFKA 2A5SA 4QFOA 4H1XA 4QSDA 1LBBA 4NF8A 2VP1A 4H8JA 2RKMA 4DCXA 3DLNA 1Y3PA 1EU8A 2XXTA 1XC1A 4U21A 5H8FA 1YAEA 5KCJB 3MZ9A 4F2OA 1FQAA 4U1ZA 4ZEBA 1FTKA 4ZDMA 1B0LA 2XXRA 1MQJA 4NF6A 2R71A 3V89B 5I57B 1SI0A 2AYSA 3TELA 1ZMGA 5HPQA 5KCJA 3FZVA 4M1VA 4U4XA 4BDQA 2QS1A 2I0BA 2ZNSA 4FAJA 5K2XA 1MXVA 1B05A 4IO7A 2D5WA 5BUUA 3K2DA 2HAUA 1B6HA 3MUQA 4X9TA 2I4BA 2Q8JA 1S9TA 4OFLA 4NEDA 1JVXA 3IB1A 4G2ZA 1OLAA 2PVUA 4ECFA 1EZ9A 2Y7WA 4RK9A 4POWA 4DIGA 2XD3A 5L8DA 4EF1A 3SERA 1H43A 2REJA 4BDRA 3H06B 1NL5A 3KGCA 3OO9A 5H8NB 4GL8A 3D4GA 5F7VA 3FUZA 1B3GA 5TP9A 3PPQA 1I69A 1B7UA 2Q2CA 5H8HB 3ILTB 1UTBA 4GFRA 1Z7ME 2Z22A 2QSXA 3T9HB 2OCUA 1MPCA 2PYYA 1N7XA 5DVIA 5DVJA 3KN8A 4NTLA 3U92A 1IEJA 4TOZA 2V3QA 5H8NA 3GBBA 1QULA 4DDDA 2HAVA 3QXMA 3EHSA 3OEKA 4Z7EA 1I6QA 5FTHA 3VVEA 2I48A 5H8HA 1AMFA 1USYH 2F36A 5I56B 4R75A 1R6ZA 2ONRA 1H3DA 1SD3A 1B4HA 3ZKKA 3QAXA 4PQJA 4KCDA 3PMWA 3TMGA 4LONB 3KG2A 2XXWA 2ESNA 4MF3A 4ND9A 4ELOA 4ZZEA 2DSFA 4M4GA 1ZJLA 4YICA 3BFUA 4ZEDA 2GHAA 1MM7A 5I56A 2HCAA 4F22A 2CMOA 3U72A 4NF4B 2VOZA 3PPPA 1OIBA 3JYRA 4YKPA 3THIA 1D4NA 4FIMA 4GOTA 1H76A 1MY0A 4R73A 3B6TA 3VFJA 2Z23A 4RXLA 5IKBA 3G3HA 1ZTYA 1B4ZA 3TUSA 1PDAA 4H6DA 4XKRA 1N04A 1O7TA 4KHZE 2F7BA 5CMKA 4OERA 1B40A 3HHFA 4EXLA 4JB7A 3V5AA 3C35A 4NF4A 4R2FA 1B3HA 2Y7RA 4QFLA 4Q8RA 4R6HA 2XXYA 4YMAA 5B7DA 3RQTA 1Y1MA 3TKDA 4F3PA 1NMUA 3O2AA 4OENA 3IB2A 4EQ9A 1HSJA 4FEBA 5ITOA 3MWBA 2ZYKA 4ZECA 2E1SA 4G68A 4WEDA 4GVOA 3DP8A 3G3KA 3ZSFA 4ZEKA 1TT1A 4IY5A 3AXFA 1YCJA 3T96B 2ZNTA 3K1MA 3FXRA 1NNFA 2XX7A 3KN3A 4YU0A 2H9BA 4PFUA 4DXUA 1CE2A 2UXAA 2DVZA 1LAFE 4HW8A 3PUYE 3K00A 1O63A 1B7HA 3A3UA 4RJZA 5I2KB 1WDNA 2OZZA 4X1BA 4IO2A 1S7YA 2O6AA 5CBRA 2I58A 3TODA 4C1UA 3WAFA 1MXXA 5CI5A 4LZ8A 1S50A 4OVJA 1VSOA 1F9BA 2F34A 3Q25A 2ZXTA 4TQUQ 3OMBA 4O3CA 4R6YA 1VFDA 1I6AA 1MY2A 1PB8A 3GZGA 2NWJA 3OO6A 4RK2A 1A8FA 3IOUA 4KYSA 3PUZE 5I2KA 3VLUA 4IB2A 4FE8A 2O51A 2PBWA 1IQ7A 4GQOA 1B2HA 4G68C 4P11A 3RT8A 4PFYA 2REGA 1OLCA 3CSBA 4OQOA 2D3IA 5H8SA 1QUKA 3TQLA 3RNNA 1MQGA 4IO4A 3CFLA 1MXZA 5AA4B 5LOMA 2OJTA 4KR5A 4FJPA 1Y3QA 1NH8A 1P1OA 5B70A 2E0SA 3CSGA 3FV2A 4H5FA 4H67A 4JSOA 1DPEA 3H6UA 4MLVA 1IITA 3MVWA 3TPAA 1EH3A 4HCYA 5I59B 4K3FA 2NVUB 1R1NA 1VE4A 3LSXA 2Q9TA 1N3WA 3G3FA 1BKAA 3BKIB 2QPQA 3O66A 5DYHA 4YZZA 1LB8A 1MM6A 3IOTA 1SYHA 2H98A 2UVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B0HA 1TFAA 4U1OA 4PETA 2XXIA 1DBZA 1M5BA 2GH9A 3SETA 2XXXA 5I84A 3QUJA 1PBQA 4PFBA 1B32A 4GX6A 1A40A 4F2QA 4YKKA 5J1DA 2Q74A 4GWOA 1B1HA 1ELJA 1BK4A 1JW4A 2HXRA 3MP8A 3FJMA 3FATA 4MBPA 4NAPA 3TTKA 2RF1A 3B7DA 2DQVA 2DYXA 3GBAA 4ESWA 4IO3A 1TFDA 1OQGA 4XKNA 3FIRA 4P47A 1JP4A 3T93B 1MY3A 3A09A 4DCYA 1POTA 3CVGA 1Y3NA 1P1UA 1WODA 4EXKA 5LTCA 2O84X 1RYXA 3PD9A 4IGTA 3KC1A 3W9WA 1Y4CA 1QJMA 4JVIA 3K6WA 3GXAA 3TQWA 1DTGA 4JDFA 4NF6B 4O3AA 2O1LA 3MSTA 1NV2A 2O69A 4G61A 4PCDA 1SQYA 3I5OA 2B4MA 2ZMBA 5ISUA 2CZHA 1XHYA 3N26A 4GX4A 4GXSB 3V8XB 3TCHA 4HCWA 3FV1A 2UYFA 4U4SA 2DWHA 2O7UA 3B6QA 1MRPA 4G77A 3V83A 5EQ8A 1LCFA 2Y5LA 4ZEFA 1GV8A 1JNFA 3VE1B 1B7ZA 3LBSA 4GXAA 3QK6A 4YKIA 4ZE8A 1DTZA 4NWDA 1LFHA 3LC8A 1UIVA 4OHNA 2WX9A 3QYTA 1MDP1 5A5LA 4IO5A 2W7YA 4NX1A 5CMBA 2HFBA 3SDFA 4QFPA 3ILUB 4Q30B 2DE4A 4YB7A 3DM0A 3PUVE 3S9NC 2ZNUA 2GHBA 5TP9B 1A7LA 2I3VA 3N94A 4F3SA 1UQWA 4TLMB 2QS3A 1FJ6A 2O68A 1UTBB 1HSLA 3FXUA 5L9MA 3K6VA 1LBYA 5TU0A 4OVTA 5EYHA 2Q8MA 5IAIA 2I3WA 1JETA 4KYEA 4OVQA 2ABHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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