1LLSA

Crystal structure of unliganded maltose binding protein with xenon
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title DETECTION AND CHARACTERIZATION OF XENON-BINDING SITES IN PROTEINS BY 129XE NMR SPECTROSCOPY
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 130
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA01
5TP9A 4G4PA 3H6WA 3T9XB 4EDPA 3I3VA 4RK2A 4OEVA 3H03A 2IEEA 2XXPA 1BKAA 2I0CA 4ELRA 3K6UA 3S9LC 3SEWA 2O69A 4QFLA 5I84A 4OFJA 1SW2A 1MS7A 2GHBA 3ILTB 2GHAA 2OJTA 1P1NA 5FTHA 3D4GA 2CZLA 4R6KA 3RLFE 2I49A 1Y4TA 4IO7A 5B70A 4FEDA 2ZMBA 5CRYA 4H1XA 4ESWA 1B5JA 1B9JA 2PMSA 5I56B 2DQVA 3A3CA 1M5EA 4KYSA 5ICQA 4YB6A 3K4UA 4X1DA 5A5XA 5EHMA 3O29A 3PMWA 3GZGA 1GV8A 2D3IA 1CB6A 5AA4B 4JDFA 4DXBA 2AL5A 2NWJA 2X7PA 2Y7WA 5JK4A 1TFDA 1UQWA 3IB0A 1SI0A 1B1XA 3B6WA 3OEKA 3S9MC 1IZ1A 3OSQA 3S4UA 2HZLA 2DOJA 4YICA 5ISUA 1QULA 3IJXB 3CR9A 1MQIA 4ZEKA 1JW4A 3IK6B 3TEPA 1LBCA 5AA3A 4K3FA 4Q8RA 2F7BA 5TP9B 4IO2A 2I4CA 3QAXA 1SYHA 5H8SA 3TELA 5CM6A 5EYFA 4DXCA 3QUJA 1MY2A 4G68C 4YZZA 4AQ4A 3U1OA 1HSEA 2XXRA 2I48A 1ZJLA 4I9DA 4GXSB 3PPQA 3PUZE 2QS2A 5DEXA 4KQPA 2DSFA 1A8FA 1O63A 2ESNA 4ZE9A 4RYAA 1LB9A 2DWAA 2QMWA 3OO6A 1FQEA 1VFEA 4G68A 4R6HA 2F7CA 4THIA 3Q25A 4OTEA 3VVEA 4EXKA 1MQGA 1SQYA 3IORA 2O68A 1B5IA 4XTCQ 4M4GA 5DT6A 4KI0E 3HPIA 4QFOA 4DCYA 4P0GA 1LGBC 4MF3A 3MP1A 3RGYA 2B65A 1B7UA 4C1UA 3R7XA 1T0KA 3RTWB 3PPRA 1BP5A 5L9OA 1R9QA 2AYSA 4I62A 4IO6A 4FJPA 2QSXA 3IO4A 2QS3A 4LZ8A 1Y3NA 1YAEA 1M5CA 3G3KA 1GVCA 4LZ5A 1IEJA 1B7HA 4O3CA 1Y1ZA 2GFEA 4OWDA 3O9PA 2DWHA 3O6IA 3VLWA 5CBSA 1AIVA 1M5BA 4XKNA 4IO3A 4IO5A 1A55A 3V89B 3HHGA 4H6DA 4PFWA 5I57B 1I6QA 2D21A 2Y7IA 4R2BA 1N3WA 1MPBA 2XHDA 1B5HA 1JW5A 3TFLA 4NWDA 3K1PA 4F3GA 4G8MA 1TT1A 3U72A 3CFLA 1D4NA 1SYIA 2HQ0A 2Q89A 5I58A 2OWTA 3L6GA 3ONMA 4F3SA 3S2VA 4ELPA 1B05A 4ECFA 4TOZA 1NFTA 1XHYA 4F1YA 2XXTA 1RYOA 1S7YA 1LBBA 4KR5A 2XXVA 1VR5A 4G8NA 1XS5A 3FVNA 4Z7EA 1FCKA 2UYEA 3OO7A 1AL3A 5H8HA 4PFYA 4G2ZA 1POY1 1B46A 5DVIA 1XVYA 3CFZA 3TUSA 4I1DA 4QSDA 1UIVA 3LSWA 1J1NA 3C36A 4GFRA 2H98A 2RCBA 1US4A 3N6UA 4DZ1A 1P1OA 4RY1A 3U94A 1SBPA 4OMBA 3TTMA 2REJA 3MP8A 2F35A 3M3KA 4OQOA 4NTLA 4C1TA 4Q5TA 3H6TA 3JZJA 4F3PA 4BDRA 5HBCA 3ZS6A 2F6PA 3O6HA 1A99A 3WAFA 4F39A 3LSFB 4TLMB 4MLVA 3VVDA 4NF5A 2ABHA 1MXYA 2ZYOA 3MPLA 4IGRA 2O1MA 3H06B 3DP4A 4F1VA 3PU5A 4U23A 3GBBA 2VOZA 5H8NA 4FEBA 1B3GA 2HAVA 3C31A 1QKBA 4LA9A 4QFPA 3H6VA 3FXRA 4DLDA 4JWYA 4H8JA 1UTHA 1O64A 3MC2A 4I8CA 1PB9A 1LLSA 2Z8DA 1MY0A 1I6BA 3KN7A 2RINA 5TPAA 1XT8A 4N13A 2UVGA 5FHMA 4ISUA 4F1UA 2HFBA 2O7UA 4PE5B 1JEUA 1OMPA 4MFIA 3MJNA 1Q35A 2F5XA 4JWXA 3F11A 3U93A 5H8QA 2DE4A 3TCGA 3EF7A 4RPNA 4H0WA 1ANFA 2V25A 5H8HB 3T66A 2GH9A 1MRPA 3MP6A 2A5TB 5K2YA 2DS9A 2ANJA 3KJTA 3G7WA 1USYH 3G3GA 1OQGA 3W9WA 4RK9A 3EHUA 3CSBA 3RQTA 1SVXB 3HCQA 4JWOA 3CI8A 4XKPA 3SEYA 1FTMA 4IY6A 3H6UA 3P7IA 3K01A 3S9NC 3PUYE 3MZBA 3CG3A 3PPOA 4HCWA 1I6AA 3IO6A 4YKIA 4KYEA 4IB2A 4FECA 3MVWA 3MBPA 4ESXA 2HAUA 4EQ9A 5I2NA 3K2DA 1HSLA 2I4BA 3TTRA 1MQJA 2O84X 1URDA 1I69A 3FXQA 1KWHA 4LZ7A 3FD3A 4QF9A 1JETA 4NF5B 3RUMA 3E9XA 3TPAA 2FA7A 3FV1A 2I6EA 2RF1A 1EZPA 3S9EA 3R26A 1EH3A 5DYHA 4EQ7A 2G29A 2F7AA 3U8QA 3EPEA 3EQ1A 3ODBA 1LCTA 1UTHB 3M8UA 1FTOA 5K2XA 2UVIA 1MDP1 3SEVA 3TODA 1GR2A 1NNKA 3KOTA 5TPAB 3DLNA 2B3BA 3FVGA 1QW0A 2Q2CA 1ZLQA 3D4CA 5H8FA 2VP1A 2OK2A 3BFUA 1R9LA 4QHQA 4L17A 1N76A 3ZKKA 4U22A 3IR1A 4NF4A 4PFTA 4BDOA 2F8DA 5HM4B 4FAJA 2FYIA 3UP9A 1OVTA 2H9BA 1LB8A 1MY1A 3RTFB 1LFGA 1NNPA 2P1SA 4RA1A 2V84A 4Q30B 2ONRA 3T9VA 3N5LA 1HSJA 3LSXA 4JB7A 3EHSA 4E0WA 3FGSA 5IAIA 1LFIA 1F9BA 3UGWA 1MH3A 2ZNSA 2G93A 4POWA 3FASA 5ICTA 1MDQA 3GLBA 4LONB 4OHNA 4ZEIA 4X9TA 4U4SA 3M3LA 4R72A 5I2NB 2QPQA 1ZMGA 1H44A 3UORA 4Q0CA 3C34A 3G3FA 2CMOA 4QFNA 2PX1A 4YB7A 1FQDA 3FXUA 1NMUA 3O66A 1LFHA 1FTJA 5J1DA 3THIA 2H5YA 1P99A 3W9VA 1Y9UA 3IJOB 3LBSA 3E4RA 2I3VA 1B3FA 2OZZA 2VGQA 3OMBA 3B6TA 1P1UA 1B4HA 2WKYA 3LUYA 3BFTA 5A5XB 4R74A 4DXUA 4RPOA 2QJEA 2R71A 3QK6A 1YTVA 3MVXA 4F3BA 3VDFA 3OEMA 2ALUA 3BKIB 2PYYA 3ECRA 1B7ZA 4U1ZA 2OCUA 2P0SA 3TMGA 3PUWE 4ZE8A 2DWJA 3KN3A 2H99A 4YAHX 1US5A 1BTJA 4TLLB 4F29A 2I58A 2Q9TA 2UYFA 1MPCA 2HZKA 1ZKBA 2REGA 3KSJA 1UIUA 1VFDA 2W7YA 2V3UA 5KCJA 3CFXA 3O2AA 4FE8A 3OO9A 2YJPA 5CC2A 3FV2A 4X48A 2Z23A 4GVOA 3C33A 4OEUA 2AIXA 4QFKA 4PP0A 3N94A 4RJZA 4WKMA 2HCAA 4LATA 1IITA 1AOVA 2HEUA 2XXWA 4NF8A 3I6VA 3O97A 2FNCA 3KN8A 3LC8A 3WAEA 5EHSA 2ZYMA 1B4ZA 2Z8EA 5DEXB 4U4XA 3K1MA 1II5A 1QVSA 2F36A 3MW0A 4G68B 4IO4A 1VSOA 5FHOA 4GL0A 3OELA 4ZZEA 1P1WA 3MVYA 4F2QA 1PB7A 3GBAA 4JSOA 4PETA 3VLUA 3SESA 2V3TA 3K0VA 2Y7PA 1TWYA 3ZSFA 3UIFA 4GWOA 3PD8A 2UXAA 4H8IA 2D5WA 2QS1A 1EU8A 4H67A 4NF6A 1B1HA 4OZ9A 4BLAA 1NKXA 2O7IA 3PPPA 4GLIA 1N0TA 1JVXA 4OESA 4OVJA 1A8EA 1POTA 5FHNA 2V3QA 3IX1A 4YB5A 4EUOA 5BUUA 4R73A 3USDA 3FJMA 3VV5A 5LOMA 3V5AA 2ONKE 1SDXA 1MPDA 1SW1A 4F31B 3K00A 3H3GA 5DVFA 3UK4A 3MVZA 3DM0A 4AB6A 3PUVE 4R2FA 3Q29A 2ZNTA 4UACA 4OENA 3U92A 2DYXA 4OFLA 2KLFA 3DP6A 3HO7A 4KYDA 1PBPA 4PFUA 3TTLA 4H5GA 3QYTA 4F18A 4EF1A 5KCJB 3VFJA 4MH5A 4GRKA 4MBPA 4HW8A 3PD9A 1N84A 3W15C 4BDNA 1ATGA 2XXYA 3MPKA 2XXUA 5I56A 1DMBA 4NF8B 5I58B 1PEBA 2RC9A 2H25A 3KSXA 3T9HB 1ZTYA 3EN3A 4F2OA 4OXVA 3TCHA 4GIZA 1EZ9A 2P2AA 4XKQA 1NH7A 4GD5A 5L9SA 3MAMA 1SW4A 3E13X 3AXFA 3RNNA 4GF8A 1H76A 1PC3A 1Y3QA 2Y7RA 5AA4A 3KG2A 2Q8JA 3T22A 3OOAA 5BWJA 5F1QA 4ZECA 2XX8A 2E1SA 3V83A 3R6UA 3N26A 1TFAA 3Q26A 4IGTA 3ILUB 3SKPA 3CRBA 1NNFA 2UVJA 1NNTA 1QUKA 4ELOA 1IXCA 4HS7A 1OVBA 3H4ZA 3KFMA 1MG1A 2NUVA 4JXIA 3MWBA 4FORA 5F7VA 5I2KA 4ND9A 3RT8A 4NWCA 3KOSA 2QS4A 4PQJA 3KEIA 3T96B 3OENA 3Q28A 1URSA 4AB5A 3QIMA 2DVCA 5HPQA 1TXFA 5CBRA 4FIMA 4YKPA 1Y3PA 2NXOA 3T93B 2F34A 1MH4A 4YMAA 4FATA 4N6PA 1YPNA 2NOOA 1WODA 5CMMA 1OQHA 3QXMA 1VE4A 4OERA 4ZEDA 1ZIUA 4C0RA 4U1OA 3TKDA 3VVFA 1O7TA 3K1NA 4RNSA 4H65A 4OYVA 4P0IA 1QJMA 1DSNA 1ELJA 2DE3A 3T9UA 1NL5A 3E3KA 3IL1B 2RCAA 1OLAA 3OSRA 2PVUA 5H8NB 1SI1A 3C32A 1LAHE 4LVQA 3BBRA 2DE2A 4ZZAA 5IKBA 1MQHA 3IOWA 3TTKA 4G77A 4WXJA 1JQFA 2O51A 4ZDMA 1JNFA 4QSCA 4LQ2A 1MY4A 5JTYA 5L9MA 2DVZA 1JEVA 1H3DA 1MQDA 4DE8A 2IA4A 5H8QB 2DXRA 1PDAA 1Y20A 1A7LA 3HV1A 1DOTA 4ZEFA 3PMXA 5FTIA 3A09A 4UA8A 3RPWA 2VD2A 1B0LA 3CVGA 1Y4CA 4YKKA 1FQAA 1BLFA 1JVYA 5I59A 4G8HA 1S50A 2I3WA 5I57A 4R9GA 5I2KB 1B6HA 4U21A 3MZ9A 3SERA 5DTBA 3V8XB 1FQCA 1A40A 4KCCA 3TDJA 4F19A 2RC8A 2AL4A 4BDLA 2YLNA 1ZU0A 4ZS9A 1OIBA 3H7MA 3B7DA 1UTBA 3I5OA 1WDNA 1ZBMA 2V93A 1EZOA 4DCXA 1QUIA 4POXA 4YMBA 1Q1KA 3KBRA 4XXUA 1L5TA 3HN0A 4HCYA 4F22A 3C9HA 3G3HA 2RC7A 4TQUQ 2XD3A 1LSTA 3JV9A 3SEXA 3G3IA 2O1LA 2ZYNA 4EXLA 2PT1A 1D3KA 1PBQA 4LQ5A 3QSLA 4JSDA 2F97A 3RT6B 4JBZA 3IB2A 5KDTA 5AA2A 1DTZA 5AA2D 1LAGE 1B52A 4R9FA 1IUDA 2QL3A 1H43A 3FVKA 1JW1A 3Q27A 4M1VA 4MLQA 2Y84A 4IY5A 1B58A 4GOTA 3GXAA 1IXIA 3K6WA 5ITOA 4GL8A 2XD2A 1IIWA 1B51A 2H4IA 5KZTA 1N7XA 5H8FB 3CIJA 2F6GA 5JTYB 3N6TA 4KPTA 3G3JA 4WEDA 3IB1A 1D9YA 2PT2A 3EHTA 2UVHA 2YPNA 3O6GA 4NF4B 3RN8A 3IOTA 2DP8A 5CI5A 4DIGA 1MY3A 2OWSA 2HXWA 1FW0A 2X7QA 4H5FA 2THIA 1URGA 4OFOA 2XX9A 1B40A 3PGFA 5M2VA 3FIRA 3KJ7A 1Z7NE 5I59B 1D9VA 2BJJX 2XXQA 3UA8A 1M5FA 2DWIA 1A54A 3TTNA 2OLBA 3VE1B 4KCDA 1Z7ME 1M5DA 5ITPA 1UTBB 3VLVA 2Z8FA 1LAFE 4ELQA 2XXHA 3FATA 2QMXA 3OO8A 3PV0E 4BDMA 3O28A 4OETA 2DXYA 4QRZA 3ZKLA 2ONSA 3FJGA 4DDDA 1BIYA 3TYHA 2R6GE 3L6HA 1MXXA 1OLCA 3DELB 1GTKA 1RKMA 3IOVA 3A3UA 1FTKA 2M8CA 2ZXTA 2XX7A 2NVUB 4WEPA 2A5SA 1MXVA 2XXXA 4LP2B 1XOCA 1DPEA 4N07A 4NE4A 3VXBA 5KDTB 5AA2B 2OBGA 4KFQA 3HSTA 4KHZE 3FUZA 3B6QA 1SD3A 3HHFA 1WVJA 3IAZA 1MXUA 3MQ9A 4GQOA 5CMCA 4X1BA 3OD7A 1B0HA 2A5TA 4E0XA 4BDQA 3DP8A 3TQLA 5AE4A 1DPPA 3CG1A 1IQ7A 2LAOA 4O3AA 2VHAA 2Z22A 5JEIA 1MXWA 3LR1A 3MZ1A 1IXHA 2Q88A 3TAJA 3C4MA 4XKRA 1QKAA 5ELVA 3FZVA 3UN6A 1N04A 1AH5A 1B32A 1AMFA 1B3HA 3PPNA 1QUJA 2X26A 4NMYA 1MM6A 4Z0IA 2B3FA 2XXIA 1MXZA 2Q2AA 2VD3A 1N7WA 3PMVA 3RY3A 3KGCA 1Y1MA 3TCFA 3VXCA 1B2HA 2R9JA 5CMKA 4HTGA 5DVJA 3OXNA 2ZNUA 1LCFA 4RXLA 4ZEBA 1LAXA 1N3XA 2PBWA 4GXAA 3SEUA 2ZYKA 1B3EA 5AA1A 1IXGA 2GRVA 1GGGA 2O6AA 3LSLA 4YU0A 1H45A 1NH8A 3KZGA 2F78A 1R6ZA 4NEDA 1SW5A 1FTLA 3C35A 1USYE 5TU0A 2E0SA 3CSGA 3FVOA 1MM7A 3SETA 4XIGQ 3JYRA 1B3LA 1XVXA 1XC1A 1P1QA 5B7DA 2Y7KA 1YCJA 3MUQA 1S9TA 3M3FA 4QSEA 4P11A 1FQFA 3FJ7A 3K6XA 4O3BA 4LUBA 3PUXE 4U2RA 4ONYA 4R75A 3QUFA 4NF6B 2RKMA 4R6YA 1DTGA 1PB8A 1R1NA 4YKJA 4KD5A 1CE2A 3K02A 3SDFA 4EF2A 1FQBA 4EQBA 3TZAA 3IOUA 3K6VA 3TQWA 2I0BA 5L8DA 2QRYA 5CMBA 1RYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TP9A 4G4PA 3H6WA 3CHGA 3T9XB 4EDPA 3I3VA 2Y5KA 5IZ1A 4RK2A 4OEVA 3H03A 4OA4A 2IEEA 2XXPA 1BKAA 2I0CA 4ELRA 3K6UA 3S9LC 3SEWA 2O69A 4QFLA 4G61A 5I84A 4OFJA 1SW2A 1MS7A 1EYKA 2GHBA 3ILTB 2GHAA 2OJTA 1P1NA 5FTHA 1D9QA 3D4GA 2CZLA 4R6KA 3RLFE 2I49A 1NV4A 1Y4TA 4IO7A 2QVRA 5B70A 1EYIA 4FEDA 1KA1A 5DW8A 5FBPA 2ZMBA 5CRYA 4H1XA 4ESWA 4I40A 1B5JA 1B9JA 2PMSA 5I56B 2DQVA 3A3CA 1M5EA 4KYSA 5ICQA 4YB6A 4P1EA 1NV3A 4O7IA 3K4UA 4X1DA 1KA0A 5A5XA 4MNIA 5EHMA 3O29A 3PMWA 3GZGA 4NQ8A 3LV0A 1GV8A 4MEVA 2D3IA 1CB6A 1FJ9A 5AA4B 4JDFA 4DXBA 2AL5A 2NWJA 2X7PA 2Y7WA 5JK4A 1TFDA 1UQWA 4N8YA 1JP4A 2XWVA 3IB0A 1SI0A 1B1XA 3B6WA 4PTKA 3OEKA 3S9MC 4OVSA 4MNPA 4DI4B 1IZ1A 3OSQA 3S4UA 3ISPA 2HZLA 2DOJA 4YICA 5ISUA 1QGXA 1QULA 3IJXB 3CR9A 1MQIA 4ZEKA 1JW4A 3IK6B 3HFUA 3TEPA 1LBCA 5AA3A 4K3FA 4Q8RA 2F7BA 5TP9B 2B4MA 4IO2A 2I4CA 2WYKA 3QAXA 1SYHA 5H8SA 5I3SA 3TELA 5CM6A 5EYFA 4DXCA 3QUJA 1MY2A 4G68C 4YZZA 4AQ4A 3U1OA 1HSEA 2BJIA 2XXRA 2I48A 1ZJLA 4QBAA 4I9DA 4GXSB 3PPQA 3PUZE 2QS2A 5DEXA 4KQPA 2DSFA 1A8FA 1O63A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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