1LLSA

Crystal structure of unliganded maltose binding protein with xenon
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title DETECTION AND CHARACTERIZATION OF XENON-BINDING SITES IN PROTEINS BY 129XE NMR SPECTROSCOPY
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 130
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1llsA01
3VXCA 2DOJA 3K6XA 4GXAA 4ZS9A 1ZU0A 3C4MA 2LAOA 3KZGA 5FTIA 4IB2A 2YLNA 3MWBA 3TEPA 4F3PA 4YB7A 3HV1A 4BDQA 4NF6B 2UVIA 4JDFA 1MY4A 1SW5A 1B4ZA 3JZJA 4QHQA 4O3BA 4ND9A 1Y4CA 4ISUA 3PMXA 1MPCA 1SD3A 5EHSA 5I84A 2F5XA 3TDJA 3O66A 4PFWA 1M5CA 4R6YA 3VLVA 2XXIA 3IR1A 2RCAA 1USYH 2Y7RA 1MY2A 5HBCA 3IOTA 3PD8A 2XXRA 1MDP1 3FUZA 3ONMA 2O69A 3MP6A 2X7QA 3R6UA 3G7WA 4EF2A 4EXLA 5I56A 1H45A 4EF1A 4ZDMA 1EH3A 1BP5A 2DXRA 3ZSFA 2O84X 4GVOA 3Q29A 3FZVA 3PUXE 1P99A 1FTJA 1GR2A 4NWDA 1BKAA 1QKAA 3WAEA 2DWIA 4ZECA 1MQHA 4DCYA 3V8XB 3F11A 2UVGA 2XXVA 1JVYA 2ZNUA 4YZZA 1LGBC 2PMSA 1P1NA 3VE1B 1WODA 1PB9A 4R6KA 1I6QA 1FQEA 2ZMBA 3T9XB 3M3LA 3OOAA 1H43A 5H8FA 2W7YA 2OBGA 1MXXA 1LCFA 3FXQA 5CMBA 4HW8A 1OMPA 4LVQA 2OWTA 4FEDA 4LATA 1H44A 3TELA 4NEDA 3SESA 2DS9A 2QMWA 2H5YA 2F78A 2ONRA 3OELA 1US4A 5AA4B 2F6PA 3GZGA 4GQOA 4U4XA 4KI0E 5ICTA 3ZS6A 4LP2B 3TCFA 4H8JA 3T9UA 1UTBB 5TU0A 3UK4A 1HSJA 4RJZA 5H8QB 1XHYA 4FJPA 1S9TA 1AH5A 4DXUA 2AYSA 4OETA 1JNFA 1MQIA 2Z8FA 3FIRA 3LR1A 2DE4A 1XOCA 4Z7EA 1FQFA 1A55A 3O6HA 2HCAA 3R26A 4DE8A 4QSEA 3TYHA 3FJGA 1RYOA 3S2VA 4AB5A 1B40A 2RCBA 3S9LC 5DEXA 4E0XA 3MP8A 1B3LA 1RYXA 1BTJA 1Y1ZA 4X1BA 2ABHA 5DVIA 5KDTB 1LCTA 1M5EA 2XX9A 2O7UA 1UIVA 4OFJA 4U4SA 1POTA 3TODA 3PUWE 3MP1A 4QF9A 2UVHA 2H25A 5DTBA 4KCCA 3O28A 4OFLA 4TOZA 5K2YA 4MLQA 4NF6A 4X48A 1LSTA 3FV2A 1DMBA 3W9VA 3T66A 2M8CA 1QULA 2FA7A 1B7ZA 5CBRA 3OO7A 3B6WA 3GBBA 2PX1A 3MVWA 1A8EA 5I2KB 4LUBA 5EHMA 1NMUA 3KSJA 1H76A 4RPOA 1Y3NA 2QRYA 3UIFA 1B5HA 3MZ9A 3K01A 1NL5A 4H8IA 3K1NA 3PMVA 1FQDA 1QVSA 3CFLA 1URGA 4H5FA 3THIA 3UA8A 2HQ0A 3JYRA 3LUYA 4LZ7A 1Y3QA 5A5XB 2F34A 4OZ9A 3FVGA 3HPIA 5BWJA 4GL0A 5ISUA 5DYHA 2ZNTA 4YMBA 1D9YA 4KYEA 4POXA 4ZEFA 1MPBA 2Q88A 4LZ5A 4GFRA 3DP6A 3D4CA 2UYEA 2GHAA 5I56B 3O97A 2V25A 3FGSA 3H6WA 1AMFA 3PPRA 4Q5TA 3K02A 2I48A 3Q27A 1N3WA 3CR9A 1I6AA 2NOOA 3H06B 2X26A 2H99A 4R74A 4IO6A 4PE5B 4PP0A 3O2AA 2VD3A 4Q30B 3K4UA 1SQYA 1UTBA 4P11A 5BUUA 3QIMA 1JEVA 5H8QA 1JVXA 4ELPA 5FHMA 1JETA 2H9BA 3MPKA 1B5JA 1JW4A 2A5SA 4RPNA 4QFKA 3GXAA 2G29A 2ONKE 1Z7ME 3SDFA 4NTLA 4DLDA 3V83A 1OQHA 3T9HB 1IXGA 3T93B 5I57B 1NFTA 1WDNA 1IUDA 1B05A 3T22A 3MAMA 2XD3A 3IORA 1BLFA 2GFEA 3LSLA 3PPPA 1Q1KA 3KN8A 2XXHA 3IJOB 3B6TA 5CMCA 4DZ1A 2UYFA 3TTNA 1DPEA 3SEYA 1JW1A 4JWXA 2VGQA 3ILTB 3SEXA 3N26A 3TQWA 4PETA 1UQWA 2PVUA 5FHOA 2D5WA 5CMKA 2VOZA 3IX1A 1FTKA 4NE4A 3TUSA 2I3WA 3DM0A 4ZEKA 4F3GA 3PUYE 3R7XA 3ILUB 3H6UA 5ELVA 2PBWA 2CMOA 3Q26A 4ELRA 2HEUA 3H7MA 1YPNA 2UVJA 2F36A 2QS1A 4BDMA 3O6GA 3LSFB 4IY5A 2Z22A 5CM6A 3KOSA 3OO6A 3TZAA 5I2KA 1Y4TA 3H6TA 5DT6A 4X1DA 3VXBA 1B1HA 4C0RA 5I58A 1B3FA 2Z8DA 2I49A 4GWOA 4UACA 3OEKA 3KOTA 1B52A 1L5TA 2Y7IA 1QJMA 4QSDA 3GLBA 1TFDA 3DP4A 5L8DA 5B70A 3PU5A 1MXZA 3MC2A 5I59A 1MS7A 1FW0A 1PB7A 3PD9A 5A5XA 1N3XA 2NWJA 4RXLA 5CC2A 1HSLA 4GL8A 3FJ7A 4JWOA 5J1DA 1SYHA 3ODBA 2XXXA 4EXKA 3FVKA 1N76A 2AL4A 4R73A 5I2NA 2OZZA 3IJXB 3TTRA 1D3KA 1M5DA 5M2VA 4YICA 3EHUA 2DQVA 4OVJA 4POWA 3C33A 5AE4A 3MBPA 4PFYA 3GBAA 5EYFA 1OVTA 1EU8A 3C9HA 4FECA 2HXWA 2DE3A 2XXYA 3V89B 1MY1A 3RN8A 3MVZA 3FV1A 4ELQA 5CMMA 2REGA 3C31A 4MH5A 3L6GA 4AQ4A 3PUZE 4WKMA 5ITPA 1NNPA 2V93A 2R9JA 1H3DA 3H3GA 3B7DA 2F8DA 3HO7A 4XKRA 1Y20A 4BLAA 2RINA 4C1UA 2Q8JA 2ZYNA 1EZ9A 1ZBMA 1LAXA 4LA9A 3IOUA 5DVFA 4F3BA 4RA1A 2O7IA 1R9QA 2Y84A 4OESA 3ZKLA 1VFEA 1P1UA 4HCWA 5I57A 2O51A 3C36A 1TWYA 1NH8A 1MH3A 1F9BA 3FVNA 1GVCA 4G68C 2WKYA 3EN3A 1IQ7A 2Z8EA 1HSEA 1R6ZA 3UGWA 3BFUA 1LBCA 1URSA 1MY3A 4XKPA 3VVFA 3M3KA 3KEIA 1B32A 4U23A 1PBPA 1ATGA 1B3GA 2PYYA 1D4NA 3VLWA 4XKQA 3TTKA 2REJA 4XKNA 4G4PA 1R1NA 3VFJA 3WAFA 1USYE 4GLIA 1FQBA 2OJTA 4JSOA 5F1QA 4F39A 3RUMA 3K1MA 2Q2CA 4HTGA 2NXOA 3LSWA 4LQ2A 4KQPA 1B6HA 4DIGA 4M4GA 3OSRA 1LB8A 3H4ZA 1AIVA 1BIYA 1IXIA 3MVXA 1Y9UA 3H03A 4GF8A 5AA2B 2XX7A 3UP9A 1FCKA 3O6IA 2HZLA 4FIMA 3OO8A 3CG3A 1NH7A 1ELJA 4KD5A 4ZE9A 2F97A 3TTLA 1IITA 1B0HA 2B65A 3QUFA 3RT8A 2OK2A 3OXNA 4DXBA 5ICQA 4H65A 2VHAA 1MY0A 3TFLA 2HFBA 3K6WA 1B7UA 1CB6A 3SEWA 4RYAA 5I58B 3FASA 4OQOA 1QUIA 2H98A 4F29A 4MLVA 2NUVA 4KYSA 4O3AA 1A99A 5H8SA 2V3QA 3P7IA 3T96B 4IO7A 1DTZA 4QRZA 4R75A 1UTHA 4H0WA 5I59B 4F31B 2DWJA 1N7XA 3OEMA 4KYDA 1ZTYA 5L9MA 1OLCA 1B5IA 4RY1A 1LFIA 3I5OA 4NF5B 2DVCA 2F6GA 1LB9A 1ZLQA 2DYXA 4UA8A 5I2NB 2ZYKA 3S9EA 2R71A 2HAVA 5B7DA 3PPOA 3G3IA 3LC8A 3DELB 3W15C 4FATA 3K2DA 3KBRA 3RY3A 4U21A 5K2XA 1SW4A 3A09A 4JB7A 3G3KA 3QSLA 4GRKA 1IXHA 1XVYA 2B3BA 3V5AA 3MQ9A 1MM7A 4YKIA 3SEUA 2ONSA 4ELOA 3OD7A 5IKBA 1R9LA 4ZEIA 5TP9B 3KN3A 1FQCA 4OTEA 4IO4A 2I4BA 1LAGE 1I6BA 3FD3A 3HCQA 1O63A 4GXSB 2I0BA 3IB0A 3U94A 1TFAA 1B9JA 5CBSA 1LLSA 1SI0A 4WEDA 3B6QA 1N04A 3CVGA 2HAUA 2E1SA 4ONYA 2F7AA 4THIA 1ZKBA 3RLFE 4U1ZA 4RK9A 1XS5A 4NF8A 1JEUA 3S4UA 2QL3A 1MDQA 3PMWA 2XXUA 2O68A 4M1VA 1LAFE 4H6DA 3E9XA 3K6UA 3VDFA 1A40A 5KCJA 4G8MA 3TCHA 2QMXA 1PC3A 3KFMA 1MXWA 1FTOA 4YB5A 3EHSA 3BFTA 3T9VA 3RT6B 3N6TA 3FVOA 2GH9A 3FJMA 2RC8A 2ZYMA 3VV5A 4K3FA 3IOWA 1MG1A 1M5BA 4I9DA 3RTWB 5AA2A 1P1QA 2XHDA 1ANFA 5JEIA 3VVDA 3K00A 2YJPA 2VD2A 3OSQA 3TTMA 1B4HA 4NWCA 4R9FA 4R72A 3MW0A 3MJNA 4IGRA 1S50A 4AB6A 3E13X 1N0TA 3DP8A 4GOTA 1URDA 2DVZA 3PPQA 3CIJA 2DE2A 2DP8A 2GRVA 1QW0A 1KWHA 1FTLA 5JTYB 1DPPA 3ZKKA 1AOVA 2ESNA 5AA3A 4YKKA 4LZ8A 4F2QA 2V3TA 4HS7A 1Y1MA 3SEVA 4LQ5A 4BDNA 4YKPA 2D3IA 4G68B 3OENA 3S9NC 4EQ7A 1TT1A 3E3KA 3CFZA 3I6VA 3K1PA 1FTMA 1MM6A 1GV8A 1IZ1A 2Q89A 1IIWA 1Y3PA 4Q0CA 3IO6A 3N6UA 3TPAA 3TQLA 2D21A 4NF5A 1XVXA 4OENA 5H8HB 2B3FA 4L17A 5HPQA 1OIBA 1II5A 3AXFA 3K0VA 1O64A 3CG1A 4FE8A 3PUVE 1POY1 3DLNA 3M3FA 2I0CA 2P0SA 4IGTA 2KLFA 1B2HA 2ZNSA 4HCYA 1UTHB 4DDDA 3UN6A 3LBSA 5ITOA 4EUOA 4P0IA 1SI1A 3D4GA 4ZE8A 1B0LA 2DSFA 4U22A 3SKPA 2XXPA 1SYIA 4TQUQ 4WXJA 3CFXA 2A5TA 3TCGA 3Q25A 4ESWA 3OMBA 2I4CA 3TMGA 1FQAA 4JSDA 4KFQA 4PQJA 4RK2A 4FORA 5TP9A 4FAJA 4XIGQ 2RF1A 5LOMA 1DOTA 1LFHA 3CSBA 3EF7A 2PT2A 4TLMB 4ZEDA 2QS2A 3C35A 3Q28A 4IO5A 3G3JA 4N07A 2F7CA 4N6PA 1LAHE 1QUJA 4YAHX 4NMYA 4R2FA 3HHFA 3IL1B 1B3HA 1SW1A 4JXIA 4NF4B 2AIXA 1GTKA 3MUQA 4QFLA 4F22A 4H1XA 4E0WA 4OMBA 3C32A 2O1MA 1J1NA 3HN0A 3I3VA 4JWYA 1MRPA 2Q9TA 4R2BA 3KG2A 3KGCA 2P1SA 3A3UA 4ZZEA 3S9MC 3TAJA 1VSOA 3QXMA 4QFPA 1PDAA 1MQGA 1US5A 5F7VA 5H8NB 3JV9A 1B1XA 1DTGA 2VP1A 4Z0IA 3BBRA 3RPWA 2BJJX 4ZZAA 3U8QA 4NF8B 1NNFA 2QS4A 1OVBA 2Y7KA 1OQGA 4TLLB 4F1VA 2DXYA 2XX8A 3MZBA 1JQFA 1ZIUA 3QK6A 5KCJB 4G8HA 4F1UA 2DWAA 4X9TA 2QPQA 3TKDA 3MZ1A 4KR5A 4GD5A 4ESXA 2IA4A 3SETA 5JTYA 4U1OA 1MQDA 4F1YA 4BDRA 4ZEBA 1NNKA 3O9PA 1NKXA 3PPNA 3VVEA 4OEUA 1Q35A 2FNCA 3H6VA 4IY6A 4YU0A 1MPDA 3U1OA 1YTVA 2F7BA 4G68A 2HZKA 1PB8A 1NNTA 5FTHA 4JBZA 4FEBA 5AA2D 1Z7NE 1MXVA 4MFIA 1EZPA 1XT8A 4IO2A 1D9VA 4XXUA 2RC9A 1YAEA 3FATA 1AL3A 1ZJLA 5H8HA 4YB6A 1ZMGA 4P0GA 2GHBA 3EQ1A 3FXRA 2RKMA 4C1TA 2ZYOA 1N7WA 1N84A 4LONB 1VE4A 4EDPA 5KZTA 2RC7A 4Q8RA 5TPAB 3FXUA 3LSXA 1XC1A 3CSGA 2I6EA 3O29A 4YKJA 1MH4A 1P1WA 3QYTA 1DSNA 2O6AA 1IEJA 4QFNA 3W9WA 2PT1A 2OWSA 3RTFB 3C34A 2ALUA 2ANJA 2H4IA 2OLBA 4WEPA 2IEEA 4F19A 1PEBA 4DXCA 3VLUA 4R9GA 4G8NA 1B58A 1OLAA 4H5GA 4U2RA 4XTCQ 4EQBA 3EPEA 1EZOA 3CI8A 4I1DA 4RNSA 2Q2AA 1A7LA 4N13A 4QSCA 2XXTA 2FYIA 3K6VA 4GIZA 2X7PA 4OFOA 2XD2A 3BKIB 1S7YA 4R6HA 2NVUB 2A5TB 3IB2A 4I8CA 4OHNA 1CE2A 4NF4A 2Y7WA 3KJ7A 4OWDA 3IB1A 3L6HA 1MXYA 3U72A 2P2AA 1LFGA 2G93A 1I69A 4KCDA 5JK4A 3UORA 1SVXB 3G3GA 3E4RA 1RKMA 1T0KA 3U93A 5AA4A 2F35A 4OXVA 3KN7A 4OERA 1MQJA 1QUKA 2V3UA 4KPTA 3IOVA 3IO4A 3QUJA 5FHNA 5H8NA 1VFDA 2V84A 4O3CA 1YCJA 4QFOA 3RNNA 5H8FB 2OCUA 3PV0E 4F3SA 1JW5A 2QS3A 4H67A 2ZXTA 4PFTA 1GGGA 4PFUA 4ECFA 3SERA 5DVJA 2AL5A 2UXAA 4YMAA 2I3VA 4MF3A 3RQTA 3A3CA 1IXCA 4BDLA 3CRBA 1SW2A 4I62A 3OO9A 3HHGA 3USDA 3N94A 4IO3A 4G77A 2THIA 5HM4B 3MPLA 5L9SA 1UIUA 5KDTA 2Y7PA 3IK6B 3KJTA 2XXWA 1A54A 2O1LA 3KSXA 2QJEA 4MBPA 4BDOA 3QAXA 4OEVA 3PGFA 3HSTA 3U92A 1SDXA 3G3HA 1VR5A 2DWHA 1A8FA 5AA1A 3IAZA 5IAIA 3N5LA 4EQ9A 1MXUA 2E0SA 3G3FA 2QSXA 5CI5A 1SBPA 4F18A 5DEXB 4KHZE 1M5FA 1B3EA 5CRYA 1B46A 1O7TA 2I58A 2XXQA 2R6GE 3ECRA 1B7HA 1LBBA 4G2ZA 4F2OA 1B51A 3MVYA 3M8UA 1WVJA 5L9OA 1QKBA 4DCXA 2CZLA 3EHTA 5TPAA 1TXFA 2YPNA 4OYVA 1P1OA 3RGYA 2Z23A 1PBQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWYA 3VXCA 2DOJA 3K6XA 4GXAA 4ZS9A 1ZU0A 3C4MA 2LAOA 3KZGA 5FTIA 4IB2A 4H46A 2YLNA 3MWBA 2HHMA 3TEPA 4O7MA 3PTYA 4F3PA 4YB7A 3HV1A 4BDQA 4NF6B 2UVIA 4JDFA 1MY4A 3RPLB 1SW5A 1B4ZA 3JZJA 3LUZA 4QHQA 4O3BA 4ND9A 1Y4CA 4ISUA 3PMXA 1MPCA 1SD3A 5EHSA 5I84A 2F5XA 3TDJA 3O66A 4PFWA 1M5CA 4R6YA 3VLVA 2XXIA 3IR1A 2RCAA 1USYH 2Y7RA 1MY2A 5HBCA 3IOTA 3PD8A 2XXRA 1MDP1 3FUZA 3ONMA 2O69A 3MP6A 2X7QA 4PFBA 4OVQA 2R8TA 2VPNA 3R6UA 3G7WA 4EF2A 4EXLA 5I56A 1H45A 4EF1A 4ZDMA 1EH3A 4NAPA 1BP5A 2DXRA 3ZSFA 2O84X 4GVOA 3Q29A 3KC1A 4O7IA 4PFRA 3FZVA 3PUXE 1P99A 1FTJA 1GR2A 4NWDA 1BKAA 4NN3A 4JVDA 1QKAA 3WAEA 2DWIA 4ZECA 1MQHA 4DCYA 3V8XB 3F11A 2UVGA 2XXVA 1JVYA 2ZNUA 4YZZA 1LGBC 2PMSA 3FXBA 1P1NA 1NV0A 3VE1B 1WODA 2Y5LA 1PB9A 4R6KA 1I6QA 5FBPA 2CZHA 1FQEA 2ZMBA 3E78A 3T9XB 3M3LA 3OOAA 1H43A 5H8FA 2W7YA 2OBGA 1MXXA 1LCFA 3FXQA 5CMBA 4HW8A 1OMPA 1EYIA 4LVQA 2OWTA 4FEDA 4LATA 5I7IA 1H44A 3TELA 4NEDA 3KC0A 3SESA 2DS9A 2QMWA 2H5YA 2F78A 2ONRA 2CZKA 5I5PA 3OELA 1US4A 5AA4B 2F6PA 3GZGA 4GQOA 4U4XA 4KI0E 5ICTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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