5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
4ZE8A 3RTFB 3MP1A 2ZNTA 4EDPA 4FJPA 2OBGA 1MPDA 1OVTA 5FTIA 2IA4A 1FTLA 4RYAA 2V3TA 3QAXA 3TODA 2NWJA 2DXYA 3CSGA 3GLBA 2I0CA 3ODBA 5EHSA 4NEDA 1CB6A 3PUWE 2FYIA 5K2YA 2DS9A 3K6VA 5AA4A 4OXVA 3JV9A 3JZJA 3OD7A 3Q29A 2DP8A 4R72A 1URDA 5L9SA 3FVNA 4OQOA 5FHOA 4QSCA 1B7ZA 1B2HA 2HAVA 3K1MA 1MDP1 1LBCA 4ZZAA 1B3GA 5ICTA 2DQVA 3KBRA 5IAIA 3FJ7A 3TCGA 2HFBA 2OJTA 3DP6A 2A5TA 3KGCA 4KHZE 2Y7IA 5ELVA 3C31A 1IITA 3EF7A 3OSRA 1M5FA 1DPEA 4KR5A 3UN6A 4POWA 4KI0E 2QS2A 2OCUA 2HEUA 3FXUA 3ZS6A 3IK6B 4PE5B 1N84A 1B46A 4O3CA 2W7YA 4H0WA 2B65A 1PB8A 2F97A 4GRKA 4RPNA 4Q0CA 3O28A 1R9QA 1CE2A 3EHSA 3W9VA 1JETA 4GOTA 4E0WA 1B1HA 4Q30B 1UTBA 4AB6A 3C36A 4G68A 4F22A 1R9LA 2DOJA 5FHNA 1UIUA 4GL8A 2Q2CA 4NF5A 5I2NB 3TTLA 1NKXA 3A3UA 3E4RA 4DXCA 1LB9A 1WVJA 1QJMA 1PC3A 2I3WA 2VGQA 4HCWA 2O1MA 4P11A 4ISUA 3FJGA 1A8FA 3OEMA 4JSDA 1JVYA 4NMYA 1PDAA 1ANFA 3UORA 3VXCA 2GFEA 4JSOA 3HSTA 4MFIA 3OO6A 3H3GA 3K01A 4F1VA 1MY2A 1FQFA 3K00A 4G4PA 5HBCA 4ELQA 5KCJA 2UYEA 4F2OA 3O6HA 3FZVA 3PV0E 4H5FA 2H99A 4NF4A 1PEBA 2UYFA 3ECRA 2Y7WA 2H9BA 3K6XA 5I57B 3VE1B 2DWJA 3U92A 1H43A 4OWDA 1R1NA 3OO7A 4U4SA 3U1OA 3S9MC 3HV1A 5TU0A 3ONMA 4O3AA 5CMCA 3L6GA 2REGA 3VDFA 1B1XA 3CG1A 3PD9A 1DPPA 5TPAB 1B52A 2DWHA 3PD8A 5I59A 4WXJA 4ELOA 2Y7KA 3T9VA 3FV1A 1M5BA 2DXRA 1MXYA 2XXXA 2QL3A 2QS1A 4C1UA 1SW5A 4HTGA 4ZZEA 5BWJA 3TZAA 3SEYA 4YMBA 3MVWA 4R6KA 3QYTA 1QUKA 1S50A 1FTMA 3IB1A 4GD5A 1B32A 1JQFA 3MW0A 2DSFA 1ELJA 4GLIA 1N7XA 4FEDA 4IB2A 4KYSA 3IR1A 1NNKA 2THIA 3FIRA 4YKKA 2LAOA 1QUIA 1QKBA 1MXUA 1GTKA 1MQJA 4ZE9A 1XC1A 5H8FB 3W15C 1B6HA 2F34A 4OFLA 3CVGA 3IO6A 1USYH 4YKJA 1OLAA 5J1DA 2E1SA 4N6PA 1B0LA 4PETA 3PUZE 4M1VA 4YB5A 4C0RA 3TDJA 1BTJA 4ELPA 1R6ZA 5H8NB 1YAEA 4YICA 4R6YA 1ZBMA 1LB8A 2XX8A 3C34A 4WEDA 3TMGA 2F5XA 2O51A 1BLFA 3FASA 4BDLA 3TFLA 3O2AA 2ALUA 4WKMA 4G68C 4LA9A 3FJMA 3TELA 3WAFA 1WDNA 2QJEA 2G93A 5B70A 3UIFA 1NNPA 4RXLA 4ELRA 3TCHA 4H8JA 1MXZA 3MC2A 2AL5A 5CI5A 4OYVA 2Q2AA 1FCKA 3SKPA 3GBBA 3TUSA 4XIGQ 5L9OA 3S9EA 1L5TA 1DSNA 4N13A 1MS7A 1URGA 4MH5A 1IEJA 2HZKA 4ZEIA 4XTCQ 2Z22A 4EQBA 2ONKE 2DYXA 4LUBA 3OENA 2XD3A 3A09A 5I56A 3CRBA 4EQ9A 4RA1A 1SW1A 3OELA 5DEXA 4DZ1A 4OMBA 3HN0A 3SEUA 1QUJA 2Q88A 3SEXA 2X26A 1T0KA 1ZTYA 2ESNA 3F11A 1H76A 2I4CA 4EXLA 3TEPA 1SQYA 4QFOA 3GXAA 4PQJA 4IO4A 3IL1B 2RF1A 1I6BA 3PPOA 4P0IA 3MQ9A 1FTOA 3N26A 1MXWA 1D9VA 1B51A 2OWTA 3KJ7A 3I5OA 4F3SA 5H8SA 3CI8A 4X9TA 1LFGA 2DVCA 4ONYA 3MVYA 3I3VA 1SYHA 4XKPA 2OZZA 3B6QA 3WAEA 2RC9A 4XKNA 4GWOA 2I3VA 4PFUA 4N07A 3M8UA 1NH8A 1XVXA 3MZ1A 1XT8A 2H98A 4QFNA 1ZLQA 4BDNA 3KJTA 4JXIA 5F1QA 3H6UA 2XXYA 1GR2A 2F7BA 3VXBA 2O6AA 4NF6B 2D21A 4EUOA 1FQBA 2HCAA 1MQDA 5H8QA 1S7YA 5LOMA 4RNSA 4YKIA 4DIGA 1S9TA 1MPBA 2OK2A 3OOAA 3P7IA 3QK6A 2I58A 1IXGA 3PPQA 3FGSA 1RKMA 2V3QA 4FE8A 5L8DA 4QSDA 5AA2B 3G3IA 1B0HA 3KEIA 3MP6A 3TTNA 4BDMA 5KDTA 3IJXB 3PMVA 3VFJA 2GHBA 2QSXA 1UTHA 5AA3A 5H8HA 1PBQA 2QRYA 3QXMA 1NH7A 3IOVA 1AMFA 1VR5A 4PFWA 1VFEA 4LZ5A 4QFLA 5AA1A 1Y9UA 1B7HA 2ZYKA 4NF8B 1JEVA 4TOZA 2V3UA 4FECA 1EH3A 3PPRA 3PU5A 1IUDA 3ZKKA 1YTVA 1GV8A 3IORA 4F3GA 5KZTA 3RUMA 4YU0A 2NXOA 1LSTA 2HQ0A 4PFTA 1ZKBA 4YAHX 3VLVA 4YB7A 2REJA 1NFTA 1ZIUA 1B4ZA 3H4ZA 3BFTA 3DELB 1AIVA 2B3BA 1GGGA 1A40A 2H5YA 3VVDA 1H3DA 3D4CA 4XKQA 4RJZA 5I58B 2AIXA 2F7CA 4GF8A 2Q9TA 3ZKLA 2F7AA 4BDQA 2ONRA 4IO6A 4JWYA 4GXSB 4FEBA 1Y3PA 1LFIA 3SDFA 3O6IA 5HM4B 5TP9A 3JYRA 3CR9A 2CMOA 2PMSA 3LSLA 5I2KB 4OFOA 1MXVA 2QMXA 4LP2B 2WKYA 4OEUA 3OO8A 2A5SA 1Y1MA 2VHAA 1VFDA 3RY3A 1TWYA 2DWIA 4IGTA 3U8QA 2F36A 1B3LA 2ZMBA 1JVXA 5CM6A 3GZGA 4K3FA 5F7VA 4R6HA 2XHDA 2XX9A 3FVGA 1FW0A 4EQ7A 4DLDA 3K2DA 3LBSA 1MQHA 2RINA 4DXBA 2XXQA 4OESA 1EZPA 4F18A 4TQUQ 2O1LA 3MZ9A 5A5XA 4EXKA 4ESXA 1MH3A 2UVHA 3MVXA 3IB2A 4H5GA 4U21A 3IB0A 4KQPA 1LGBC 5DVFA 1B5HA 1XHYA 3RN8A 3MBPA 1NNFA 2UVJA 2YLNA 1IXIA 1SYIA 4LONB 5K2XA 4U2RA 4QSEA 3KG2A 1D3KA 4IO3A 1O7TA 3IAZA 5CRYA 2NOOA 2GH9A 2PT1A 4GVOA 2PBWA 4HCYA 2G29A 5ISUA 3BKIB 1FQDA 4TLMB 5DVIA 4NE4A 2Z8FA 1OLCA 3O29A 4HS7A 4UACA 3MWBA 1MH4A 4QF9A 4U1OA 5H8QB 5JTYA 3MJNA 2R6GE 3ILTB 1P1QA 3QUFA 3AXFA 1XS5A 1ZJLA 3S9NC 1IIWA 3S9LC 3G3GA 4X48A 1OQHA 3EQ1A 1EU8A 5CMMA 3O9PA 5AA4B 4MLQA 3V8XB 3SEWA 1FQEA 1AOVA 2ZYNA 4YZZA 1MM6A 4IO5A 1N7WA 4X1DA 1LAXA 5JEIA 2KLFA 4BDRA 2XXWA 4OHNA 5H8HB 3GBAA 3DP8A 1LLSA 1RYXA 1D9YA 1IXHA 2A5TB 2XXRA 5L9MA 3KSXA 3RQTA 5EYFA 4MBPA 1M5EA 4LQ5A 4XKRA 1TT1A 1HSJA 4F1UA 3PMXA 3OXNA 2XXUA 2UXAA 2PVUA 2XX7A 1A54A 3E9XA 4OENA 3T22A 1O63A 1QVSA 1POY1 1JEUA 2QMWA 2VD3A 3PUYE 3TYHA 4Q8RA 1AL3A 1H44A 4KYEA 2HAUA 1UTBB 3QUJA 4BDOA 4G68B 2V84A 3H7MA 3EHUA 1I6QA 1B40A 2GRVA 3OMBA 5DYHA 4Q5TA 4NF5B 4AQ4A 2BJJX 3R26A 4OFJA 4Z0IA 3H03A 4F3BA 2XXHA 1B3HA 2UVGA 3T66A 2O84X 3VVEA 4KPTA 3DM0A 2F6PA 4KFQA 1FTJA 1B7UA 4M4GA 4QHQA 5IKBA 5I2NA 3FD3A 3SEVA 3TTMA 2PT2A 3TCFA 2Z8DA 4WEPA 4ZEDA 5FHMA 5KCJB 3LC8A 4QRZA 3KN8A 1FQCA 4ZEBA 4NF4B 3OSQA 4PFYA 3T96B 4JWXA 1D4NA 2ZYMA 4F19A 2ZNSA 3H6TA 3EPEA 3MAMA 4KCDA 3BBRA 3PUVE 4H67A 4LQ2A 5CBSA 4O3BA 3FV2A 3OEKA 5I57A 2B3FA 4F31B 2D5WA 4EF2A 2F8DA 2ONSA 2V93A 3PPNA 1QKAA 2H4IA 1P1NA 2Z23A 3H06B 1JW4A 2ZNUA 2HXWA 4IY5A 3T9UA 1NL5A 5I59B 1MG1A 3CG3A 3BFUA 4THIA 3U93A 1IZ1A 3R7XA 4KD5A 2Y84A 2QS4A 3O6GA 2FNCA 4DCXA 1NMUA 2DWAA 3SETA 3UGWA 2F6GA 1Y1ZA 5TPAA 5AA2D 2FA7A 4I9DA 2O7UA 3C4MA 4NWDA 3C32A 4OETA 1Y4CA 1I69A 3R6UA 1FTKA 4PP0A 4F39A 3H6VA 1P1OA 4R9FA 3UA8A 4ZEKA 5DTBA 4RY1A 2PX1A 3K1PA 4FAJA 3PPPA 4OEVA 2GHAA 1J1NA 1LCTA 3RLFE 2AL4A 3FXQA 3K1NA 2ABHA 4IY6A 2X7PA 1MY1A 4EF1A 3SERA 3UK4A 3CFLA 3G3KA 4ESWA 2OWSA 3MUQA 1POTA 4G77A 1M5CA 2Z8EA 3B7DA 1MQGA 1US5A 1VSOA 2P2AA 1YPNA 4ECFA 4I62A 5H8FA 3RGYA 3TPAA 2ZXTA 3LUYA 5ITPA 3FUZA 2M8CA 3B6TA 1IXCA 4YMAA 1JW1A 4G2ZA 4GFRA 3PMWA 1Q1KA 1OMPA 3ZSFA 2H25A 1P1WA 3E13X 1HSEA 5H8NA 3W9WA 3KOSA 3E3KA 2NVUB 3PGFA 3U72A 1Y3QA 1B4HA 3VLUA 2RC7A 3KFMA 1TFAA 3HHFA 1MY0A 1Z7ME 5M2VA 2VD2A 4ZECA 2XXTA 4H8IA 3K6WA 5B7DA 4F1YA 3U94A 1XVYA 5I84A 3TQLA 1MXXA 3KZGA 5FTHA 2PYYA 1JNFA 1A7LA 5HPQA 4R2BA 4F29A 1F9BA 1NNTA 3LSWA 1P99A 5I56B 3MVZA 4NWCA 3TTRA 4HW8A 1MM7A 5DEXB 3IJOB 3K6UA 3OO9A 1Y3NA 1Y20A 4R73A 3K4UA 4X1BA 4H1XA 1YCJA 2R71A 3L6HA 4U1ZA 3RT6B 2RCAA 1SVXB 5EHMA 1PB7A 3G3FA 4JDFA 4ND9A 1II5A 4DCYA 4F3PA 3RPWA 4LZ7A 1OQGA 3N94A 1LBBA 1MDQA 3Q26A 2YPNA 3N5LA 2F78A 3O66A 3V83A 3T9XB 1SD3A 3K0VA 1B9JA 3VLWA 1XOCA 3MPKA 1SI1A 1AH5A 1LAHE 1BP5A 2XXIA 1LAFE 1RYOA 1VE4A 4IO2A 2O69A 1GVCA 4DDDA 3G3HA 3IOWA 1DMBA 2XXVA 4RK9A 4G8MA 4MF3A 3K02A 1IQ7A 3C9HA 1PBPA 4U4XA 3RT8A 1MPCA 4DE8A 2DE3A 3CSBA 3H6WA 1TXFA 5CMKA 3N6TA 2P0SA 1M5DA 3KOTA 4AB5A 1URSA 2NUVA 4I8CA 5ITOA 5AE4A 1MY4A 1DTGA 3M3KA 1OVBA 3USDA 4FATA 4DXUA 3B6WA 3CIJA 3EHTA 4KCCA 2RCBA 1US4A 3N6UA 3Q28A 3C33A 5BUUA 4G8NA 2IEEA 3KSJA 3Q25A 4NF6A 3KN3A 3IX1A 1DOTA 4JB7A 1LFHA 1JW5A 3MPLA 1DTZA 1UQWA 3TTKA 1B5IA 4JBZA 3TAJA 1ZU0A 3V5AA 2X7QA 3LSFB 1N3WA 2I49A 5KDTB 4GL0A 2YJPA 5DVJA 2P1SA 3FVOA 3V89B 2UVIA 1UTHB 4TLLB 4R2FA 4LZ8A 5AA2A 4IO7A 1QW0A 4NTLA 2O68A 4I1DA 3MP8A 1ATGA 3PUXE 1QULA 1SDXA 2HZLA 1LCFA 3FXRA 1UIVA 1SBPA 1MRPA 3DLNA 2QS3A 1KWHA 5CMBA 2VP1A 2RKMA 1N76A 3HO7A 3RNNA 2V25A 3A3CA 3LSXA 2F35A 2Y7PA 3CFXA 4F2QA 1BIYA 4H6DA 5ICQA 2DVZA 4XXUA 3C35A 3RTWB 3S2VA 2CZLA 1LAGE 4NF8A 2D3IA 3IOUA 2E0SA 4ZEFA 3UP9A 4POXA 1N0TA 3O97A 4Z7EA 1FQAA 4YB6A 1B3FA 4FIMA 1USYE 4U22A 4LATA 2O7IA 4IGRA 1HSLA 3VV5A 3TKDA 3DP4A 4BLAA 4P0GA 1MQIA 4ZDMA 4QFKA 2DE4A 4MLVA 5TP9B 1SI0A 1PB9A 1N04A 4H65A 3KN7A 1ZMGA 2XXPA 3S4UA 5I58A 2Q89A 3FVKA 3THIA 1OIBA 1A8EA 4ZS9A 2R9JA 4GIZA 2I48A 5DT6A 1N3XA 4G8HA 4R75A 4UA8A 3QIMA 3FATA 3G3JA 2I0BA 4RK2A 3HHGA 4OERA 1O64A 5JK4A 1Y4TA 2RC8A 3SESA 3CFZA 1B5JA 5I2KA 2OLBA 1I6AA 1P1UA 3QSLA 3M3FA 2I6EA 3HCQA 3IO4A 4GXAA 3G7WA 1Q35A 1B3EA 2ANJA 2Q8JA 1SW2A 3IOTA 4OZ9A 5A5XB 2XD2A 1BKAA 4KYDA 5CC2A 4QFPA 3M3LA 3I6VA 1H45A 1WODA 3HPIA 2VOZA 4OVJA 3T9HB 1B05A 4E0XA 2QPQA 3T93B 1MY3A 2Y7RA 3TQWA 1B58A 2AYSA 3MZBA 4U23A 4OTEA 1A99A 2ZYOA 3ILUB 2I4BA 4YKPA 4C1TA 4RPOA 4GQOA 2DE2A 1TFDA 3VVFA 4R9GA 4FORA 4JWOA 4L17A 3D4GA 3LR1A 5JTYB 3Q27A 1EZ9A 5CBRA 1EZOA 1SW4A 1A55A 4LVQA 4R74A 1Z7NE 3EN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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