5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
4RNSA 1VE4A 4WXJA 4H5GA 1B1HA 2O7IA 3LSLA 4XKRA 1FQBA 2RCBA 2YPNA 2NVUB 3S9EA 2Y7IA 3TQLA 1H76A 4IO2A 2I6EA 4OWDA 5AE4A 3C36A 1IXIA 1UQWA 2YJPA 4FEDA 2QMWA 4OEVA 4F3GA 4ZEDA 1B1XA 1Y3QA 3RTWB 1I69A 1LB8A 1JVXA 5I59B 5H8HB 3RLFE 3UK4A 1R6ZA 3N94A 3LSXA 4YB7A 5AA2D 3S9MC 1B3GA 3ONMA 3JV9A 1MY4A 3OELA 1MQDA 4NWCA 4PP0A 4O3BA 4E0WA 1B4HA 2Q9TA 3I5OA 2HEUA 1IUDA 4F19A 4YKPA 4KYSA 4LQ5A 5L9SA 4GXAA 4NF6B 3MVYA 4NMYA 4H6DA 2VD3A 1OIBA 1NKXA 3PMXA 2REGA 3OSRA 1N76A 1VR5A 2GH9A 4GL8A 4OERA 3W9WA 4KI0E 2AYSA 4ELOA 1DTGA 3M3KA 1Z7NE 3N5LA 1SW4A 2FNCA 1B0LA 3QIMA 5EHSA 4F1UA 1R9QA 2X7QA 4C1UA 1JEUA 3UA8A 1EZ9A 2V25A 2AIXA 1I6QA 2ZNUA 2HXWA 3MW0A 4U4XA 5I84A 1NMUA 4BDLA 1AIVA 2WKYA 1Y3NA 4NF5B 4R74A 2I58A 5H8SA 5I59A 3C33A 3Q27A 3W15C 2UVHA 1O64A 5JK4A 1US4A 4YB6A 5ISUA 2KLFA 1A40A 1O7TA 3V8XB 4LP2B 5B70A 3HCQA 1SDXA 5I56B 2QS4A 5EYFA 4XKQA 1QKBA 2F7AA 4GOTA 3JYRA 5JEIA 2H5YA 3IO6A 2G93A 2UVGA 3R6UA 1IZ1A 2YLNA 3OMBA 4YZZA 1YCJA 3K0VA 4QRZA 2GHBA 3TYHA 2REJA 3IB1A 4PQJA 3IB0A 4XIGQ 1BTJA 3ECRA 1M5DA 3CG3A 4M4GA 5CI5A 1B3LA 1ANFA 2Q89A 2Z8EA 1FQEA 3PGFA 1L5TA 3H6TA 3VDFA 4BDMA 4EF2A 4ZECA 1T0KA 3C35A 1XVYA 3G7WA 3IX1A 3Q29A 4EUOA 1I6BA 1SI1A 4QFNA 4L17A 2UXAA 3TTMA 1NNFA 3U72A 3U8QA 1Y1ZA 1OMPA 3KOSA 2Z22A 4AB6A 4FAJA 1GTKA 4IO3A 4G2ZA 5CBRA 2DVZA 4IGRA 4IGTA 5TPAA 3AXFA 1XHYA 2NWJA 2FA7A 3FZVA 3DLNA 1IITA 3C9HA 2LAOA 3IOUA 1MPCA 3IOWA 2CZLA 1DOTA 3E13X 3KG2A 3LC8A 4JXIA 3N26A 5DT6A 1II5A 5I2KA 1QVSA 5TP9B 4R2BA 1DMBA 1MY0A 1QKAA 3VFJA 1USYE 4NF8B 4NWDA 1FQAA 4H8IA 3TCFA 3FJGA 2QSXA 4Q8RA 3M3FA 3OSQA 4THIA 2VOZA 4N07A 4DIGA 2R71A 1A8EA 4GF8A 1D3KA 2R6GE 2F5XA 3Q28A 4O3AA 5EHMA 3T93B 2P0SA 2OJTA 3RN8A 2O51A 3BFTA 3H3GA 4OFJA 1B3FA 3QSLA 2OWTA 4DE8A 3OD7A 1B6HA 3PPQA 4EF1A 3VVDA 3S9NC 3LUYA 3CG1A 3ILUB 4DXCA 4WEPA 2RF1A 1URSA 1JETA 2DYXA 3FGSA 3M3LA 3MP6A 2B3BA 3FATA 3R7XA 4F29A 3T22A 5J1DA 2F6GA 3R26A 2XXUA 4QFPA 1OVBA 1I6AA 1YPNA 1B3HA 2Y84A 4P11A 2I3WA 1MQHA 2I48A 3FXRA 3L6GA 1NH8A 2DE2A 5KZTA 2XXRA 5AA4B 2XX9A 1B5JA 1A7LA 3N6UA 4BDQA 2F36A 3KEIA 3VLUA 4JWOA 2PT2A 4QF9A 4ZEIA 3G3GA 2F97A 5A5XB 1HSJA 2F78A 3CI8A 3MVWA 2Q2CA 1B51A 2GFEA 1LFHA 3GZGA 3TTRA 1EU8A 4QFKA 4ZEBA 3IOVA 2X7PA 3EHSA 2O1MA 4K3FA 2QS3A 4TOZA 4ZZEA 2GHAA 3TCHA 3TODA 1QUJA 3KSXA 4FECA 1ELJA 1LFIA 5DVFA 3T9XB 2QMXA 1OQHA 1MG1A 1CE2A 1P99A 2PVUA 4OHNA 1N3XA 2D3IA 2PT1A 1NNKA 1TFAA 4IB2A 5I2KB 3TMGA 3SEVA 4H8JA 3VV5A 3RT6B 1B0HA 3BKIB 2OK2A 5M2VA 1MY3A 1B5IA 1P1QA 4Q5TA 2Q88A 2DS9A 4GIZA 3QUJA 4KFQA 3IJOB 3O2AA 1B52A 4OYVA 1ZIUA 3RTFB 3IAZA 3CFLA 2AL4A 2OCUA 1JEVA 1R1NA 3A3CA 3H6WA 4I62A 4YKIA 3K6WA 1GV8A 5HBCA 3UN6A 4EXLA 2QJEA 5I57A 2A5TB 3PPNA 3SDFA 3U94A 3VXBA 4C0RA 1MXYA 1NNPA 4RA1A 5K2YA 3TCGA 3TKDA 4HW8A 3G3FA 4TLMB 3FXQA 4NEDA 3KN3A 3GBAA 4ONYA 4Z0IA 3O29A 1IEJA 5FHNA 1LSTA 3PU5A 1POTA 4GWOA 4NTLA 4BLAA 4DLDA 1FCKA 4ISUA 4OESA 2BJJX 3T9UA 1SD3A 4AQ4A 5BUUA 1USYH 1S50A 2ONKE 5FHOA 3RGYA 1SBPA 3VLVA 3V83A 1MQIA 3B6TA 2I49A 2IEEA 3PPOA 4JWXA 1QUIA 1BKAA 4X1DA 3U92A 2V84A 2Z23A 3K01A 1MPDA 5CM6A 5I2NA 1FTJA 1IXHA 2ABHA 4H0WA 1MXXA 4PFWA 2HAVA 2X26A 3DM0A 1B32A 2M8CA 4G77A 3MJNA 2ZYNA 5DYHA 1URGA 1O63A 4ZEKA 1JQFA 1KWHA 1QJMA 1CB6A 5H8QA 1FTKA 3ZS6A 1HSEA 4ZDMA 4N13A 2IA4A 3E3KA 1FW0A 4KCDA 4U22A 1IXCA 1Y1MA 1B7HA 2ONSA 1M5EA 1Z7ME 2XD3A 2F7BA 4LZ5A 3LR1A 2RC7A 3KSJA 5CC2A 4F31B 1ZKBA 1B05A 3DP8A 5KDTA 3PUWE 1B2HA 2ZXTA 3M8UA 1LCFA 3KOTA 2THIA 4KQPA 1AMFA 1US5A 3KJTA 4F18A 1LCTA 3TPAA 3I3VA 2A5SA 2I0CA 4GFRA 1SW5A 3PUZE 2O7UA 4EQ7A 1LBBA 3VLWA 1LAFE 1B7UA 3CSGA 1RYOA 3O28A 3G3HA 5FTHA 4UACA 3RUMA 3S2VA 3UIFA 5KDTB 4TQUQ 2O69A 4ZS9A 2QS1A 3MP8A 4IO5A 3HSTA 4EQ9A 2O6AA 1N04A 4ESXA 1MPBA 1ZMGA 4HCWA 4DCYA 4EXKA 2F34A 1LGBC 4Q30B 4MLQA 2PYYA 3SETA 2ZYOA 2DXRA 1D4NA 4ZEFA 2XXPA 3C34A 1IXGA 1Q1KA 5I58B 4GQOA 4IY6A 1POY1 2ZYKA 3ZSFA 1JVYA 5TPAB 5AA2A 4KYDA 2F7CA 1D9YA 4QHQA 1RYXA 1B58A 2D5WA 4QFOA 4X48A 2CMOA 2V3UA 3K1PA 4GD5A 3USDA 2I4BA 2F35A 3MWBA 4LA9A 2Y7RA 2FYIA 4R2FA 5TP9A 3FVKA 2OLBA 4X9TA 2DE4A 4R75A 5ELVA 1AOVA 1BIYA 2OWSA 3IR1A 4FIMA 5DVIA 3WAFA 3MPLA 2XXHA 5CBSA 3OXNA 3IORA 1Y4TA 2UVJA 4POXA 2QRYA 3SEYA 5HM4B 5HPQA 2DWIA 3H03A 3PMWA 3IB2A 4ND9A 1TXFA 4JSDA 5F1QA 1H44A 1FQFA 3BBRA 2HFBA 4G8MA 2V93A 4NF4B 4GLIA 4LVQA 2ZYMA 1NFTA 2DSFA 3FV1A 3K4UA 1XVXA 3RNNA 3ZKLA 5B7DA 5DTBA 2O1LA 3PD8A 4OENA 5ITOA 3DELB 3LSWA 4ELRA 5DEXB 1GVCA 2DWAA 2HQ0A 3FJ7A 2VGQA 3O6IA 4KCCA 3EHTA 2XX8A 3SEUA 2XHDA 2Y7WA 1HSLA 1FTOA 5I57B 4GXSB 3IJXB 4C1TA 1PBQA 2H9BA 4G68C 5H8NB 5KCJA 3PD9A 3C31A 2HCAA 4U2RA 4JSOA 5JTYA 1J1NA 3IOTA 1PEBA 4MF3A 4JDFA 4KD5A 3T9VA 1BLFA 4RJZA 2UYFA 2OBGA 3GXAA 3W9VA 4ELQA 2H99A 4JBZA 3KZGA 4NF6A 4R72A 5ICTA 3FJMA 1XOCA 3HO7A 5I2NB 2I0BA 2XXYA 3FASA 3F11A 3K6XA 3K6VA 4OZ9A 4YAHX 3TZAA 3OENA 5H8NA 4LUBA 2PX1A 4G8NA 1H43A 2AL5A 1JW1A 4LONB 1N84A 4R6KA 4R9FA 3RQTA 1SI0A 1H45A 4IO6A 4PE5B 1A54A 3MPKA 4G4PA 5H8FA 1D9VA 4HTGA 1OVTA 4XKNA 2ALUA 3I6VA 3LSFB 2ANJA 1DPPA 1Y4CA 1YAEA 5L8DA 2ONRA 1MH4A 4KHZE 5ICQA 2A5TA 4QSCA 3S9LC 2D21A 3MVZA 4F1VA 4F2QA 4MBPA 1Y3PA 2RINA 3FVGA 2VD2A 2RCAA 3KBRA 1Q35A 3OO8A 4KR5A 3D4GA 4ECFA 3U93A 4HCYA 4ZE8A 5LOMA 1MQGA 3TFLA 5H8QB 4XKPA 3S4UA 3H06B 3UORA 2Z8FA 3TQWA 4F1YA 2GRVA 4OFOA 1MY2A 3EN3A 3K02A 4PETA 4X1BA 1N7WA 4LZ8A 2XX7A 2Z8DA 3H4ZA 5AA1A 5I56A 3SERA 1A8FA 3JZJA 4DXUA 3B6WA 3MVXA 4DCXA 4YMBA 4H5FA 5IAIA 2PMSA 2DWHA 5TU0A 1PDAA 3EHUA 3PPRA 1YTVA 2DOJA 1DSNA 4U1OA 4BDNA 2OZZA 2NXOA 3MQ9A 5CRYA 2G29A 3KFMA 3O6HA 1BP5A 3Q25A 3QK6A 1DPEA 1JNFA 2VP1A 3E4RA 4PFUA 4N6PA 4YU0A 3RPWA 3D4CA 2NUVA 2XXVA 3FV2A 4U21A 1ATGA 2F8DA 2H98A 3HHGA 4DXBA 4FATA 4JB7A 4MH5A 4OQOA 1NH7A 1UTHA 3K2DA 4RYAA 1SQYA 3TTNA 1P1NA 3N6TA 1URDA 5CMBA 1MM7A 5KCJB 5ITPA 1MXZA 2DXYA 1LB9A 2RKMA 3CRBA 3HV1A 3TELA 3ZKKA 2XD2A 3VVEA 3OEMA 5H8HA 4ZZAA 1P1UA 4RPNA 1MM6A 1Y20A 1SVXB 3PUVE 2NOOA 3LBSA 2O84X 2RC8A 4O3CA 1B5HA 4OXVA 3VVFA 3IK6B 4P0IA 1FTMA 1WODA 4IY5A 1UIUA 3MZ9A 4LQ2A 1MH3A 4EDPA 1SYIA 3K1MA 1VSOA 4XTCQ 1TFDA 1S7YA 1ZU0A 3O9PA 4OETA 3MP1A 4YKKA 3T96B 1UTHB 3CFXA 3A3UA 2ZMBA 3DP4A 4KPTA 1UTBB 4OEUA 3WAEA 3H6UA 1PBPA 1RKMA 4G8HA 1M5CA 4I8CA 3FIRA 4JWYA 5F7VA 3EPEA 2XXXA 4R73A 3U1OA 4FORA 1FTLA 4YB5A 2RC9A 5DVJA 4I1DA 3MZBA 4NF5A 3VXCA 3O6GA 3G3IA 4POWA 3SESA 3TUSA 2E0SA 4I9DA 1XT8A 4FEBA 4U4SA 5L9OA 2H25A 1MS7A 2Y7PA 3QYTA 1S9TA 3TTKA 4E0XA 4F3BA 3CIJA 5IKBA 1MQJA 2QL3A 3C32A 3GBBA 1B9JA 2XXTA 1PB7A 4M1VA 4OTEA 1M5FA 5AA4A 3SEWA 5I58A 2XXWA 1JW5A 4ELPA 1WVJA 1UIVA 3SEXA 3PUXE 2QS2A 3B7DA 1P1WA 4OMBA 3TTLA 4LZ7A 1H3DA 3ILTB 1LFGA 3IL1B 3VE1B 4QSEA 4RXLA 2B65A 1XS5A 5FTIA 3PV0E 4RK9A 1IQ7A 4MLVA 3OO7A 3CR9A 2UVIA 1AL3A 2XXQA 3QXMA 4ZE9A 5CMMA 3KN8A 5K2XA 1F9BA 3G3JA 2XXIA 3B6QA 2Y7KA 3QUFA 1MDP1 5FHMA 4IO4A 4YMAA 3ODBA 4GL0A 4DZ1A 1B46A 2W7YA 4NF4A 1R9LA 4FE8A 3H7MA 3OEKA 1MXWA 4QFLA 1M5BA 2Q2AA 4NE4A 4YICA 5L9MA 4BDOA 1EZPA 5H8FB 3CFZA 4G68B 3PPPA 1ZLQA 3KJ7A 3DP6A 3MBPA 3OO6A 3FVOA 3O66A 1N7XA 4GRKA 4U23A 3HN0A 2ZNTA 4OFLA 1N0TA 1VFDA 1A55A 1IIWA 2F6PA 5CMCA 4RPOA 4F22A 2V3TA 2I3VA 4RY1A 4LATA 4WKMA 3KGCA 4H1XA 1B3EA 3L6HA 3TDJA 1MDQA 4BDRA 4H67A 2R9JA 4R6HA 3EQ1A 1SW1A 3FVNA 1B40A 1GGGA 1PB9A 4GVOA 1FQDA 1LBCA 1MXVA 2UYEA 1Y9UA 2ZNSA 3E9XA 4H65A 5AA3A 1OLCA 1B4ZA 3C4MA 4FJPA 1TWYA 4Z7EA 1XC1A 3OO9A 5JTYB 1QUKA 4F39A 4EQBA 1WDNA 3THIA 3FXUA 3HHFA 1PC3A 3O97A 3TAJA 1LLSA 4PFTA 1NL5A 4YKJA 3KN7A 2V3QA 2B3FA 3OOAA 3PUYE 1ZBMA 3GLBA 5DEXA 2Q8JA 5BWJA 3IO4A 2I4CA 3MAMA 4F3SA 3A09A 2E1SA 1QULA 3Q26A 4R9GA 3EF7A 3FD3A 4F3PA 1P1OA 1OLAA 2O68A 1FQCA 1SYHA 1MXUA 1ZTYA 3H6VA 1LAHE 4P0GA 3RT8A 2PBWA 4XXUA 3PMVA 3UP9A 4OVJA 4Q0CA 3K1NA 4ESWA 4KYEA 2DP8A 3QAXA 1TT1A 4RK2A 4WEDA 3TEPA 4TLLB 3UGWA 3BFUA 1EZOA 1A99A 4IO7A 1AH5A 4PFYA 2HAUA 2DWJA 2HZKA 1GR2A 3T9HB 2P1SA 2DVCA 2HZLA 1MY1A 1ZJLA 1B7ZA 1LAXA 1OQGA 3FUZA 2P2AA 4R6YA 4U1ZA 1DTZA 3RY3A 3V5AA 4F2OA 4NF8A 5AA2B 1QW0A 3CSBA 1JW4A 3HPIA 3SKPA 1EH3A 5CMKA 3P7IA 4DDDA 2DE3A 1LAGE 3MZ1A 4HS7A 1NNTA 3G3KA 2H4IA 3K6UA 1N3WA 4MFIA 2DQVA 4UA8A 3T66A 4AB5A 4QSDA 1UTBA 1SW2A 5A5XA 3MUQA 4G68A 1VFEA 2ESNA 2VHAA 3MC2A 3V89B 1MRPA 3K00A 3CVGA 1PB8A 2QPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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