5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
5DVIA 4F2QA 4EDPA 3CFZA 3IOVA 3G3IA 5LOMA 2VOZA 2A5TA 4NWDA 3PD9A 2YPNA 2D3IA 3BBRA 1NNTA 2ALUA 2X26A 1YCJA 3ZKKA 4NE4A 4XIGQ 3T96B 3TYHA 2DQVA 3MPLA 1B7HA 2R6GE 1ZMGA 1A8EA 2GHBA 3CFLA 1SW5A 1BP5A 5I58B 2XX8A 1POTA 3K4UA 1H76A 1GGGA 3VVEA 4AQ4A 3D4CA 3V89B 2F35A 2I58A 5TPAA 3VE1B 3EHUA 4ZEDA 3O66A 2O51A 3G3FA 5CM6A 4ZEIA 3W9WA 5B70A 1DTZA 3P7IA 1GV8A 1S50A 4RPOA 2Y7PA 2XX9A 1B3GA 2F5XA 4H6DA 2CMOA 4U22A 3H3GA 3PUZE 4O3CA 4ELOA 1B40A 4JXIA 2VD3A 2Q9TA 2HZKA 4MLQA 4LP2B 3VXCA 2OJTA 1Q1KA 4YMBA 4YKKA 1A54A 3AXFA 2I0BA 5H8NA 2OCUA 3HHFA 3I3VA 1QUKA 2UVJA 3IJOB 1B7ZA 3FGSA 4YKIA 3IL1B 3QXMA 3UP9A 4LZ5A 3MVWA 4G77A 1UTHA 5I57B 2XXIA 1O64A 5AE4A 2E0SA 3KZGA 3MP6A 4HCWA 4QSCA 3M3FA 1SW2A 3N94A 4KPTA 1MM7A 1SYIA 1NL5A 4TLMB 2XD3A 1B2HA 2HXWA 3T9VA 3UN6A 4OETA 4ONYA 4ZE8A 1MY3A 2GFEA 4JWOA 3K1NA 2UYFA 3RGYA 1B6HA 1MM6A 4R2FA 4U4SA 4KCDA 3RN8A 2ZYOA 3FATA 4OXVA 1LFHA 4YAHX 2DXYA 3FXQA 4YB5A 1P1WA 2Z8DA 3OSRA 1M5CA 1US5A 1JETA 4NF6A 5CBSA 5AA2A 1M5BA 3U93A 4POXA 3H6UA 1ANFA 4NF8A 5AA3A 3D4GA 3TFLA 3CVGA 1MDP1 1FTOA 3N26A 4F3SA 1RYXA 3MVZA 2QS2A 4R2BA 3W9VA 3PMVA 2V3QA 2H99A 3Q28A 3ILTB 2O7UA 4JDFA 1SQYA 2DWJA 4X48A 3EPEA 3RLFE 1B51A 3ECRA 3QAXA 4DZ1A 4BDRA 3C34A 1UQWA 3SEXA 3SKPA 2F78A 4G68A 3GZGA 4L17A 3GBBA 1M5FA 4WKMA 3U94A 2Q8JA 1PEBA 4GOTA 2Y7RA 4P0IA 1RYOA 5H8HA 1LAHE 4TLLB 4IB2A 3VDFA 4IY6A 3TKDA 1B7UA 4ECFA 1I69A 3B6QA 3FASA 1FQBA 4E0WA 5F7VA 3W15C 4GL0A 1IXGA 3JZJA 2HCAA 3PGFA 3EN3A 1MQHA 2PMSA 5I2KB 4LVQA 1MPDA 3SEVA 4PETA 4LQ2A 4EUOA 2PVUA 1B3EA 3CG3A 4R6KA 5I2NB 3BFUA 4G8HA 4DLDA 4OTEA 2XXHA 3C4MA 5I2KA 1SYHA 2F6PA 1OIBA 2O84X 1MG1A 3HPIA 1SD3A 5H8SA 2QMWA 3FUZA 3MVYA 1N76A 3O28A 3Q25A 3LSLA 3E9XA 5AA1A 1XOCA 3MWBA 4RK9A 2XXUA 5DVJA 4O3BA 4KCCA 3TUSA 4OFJA 4WEDA 4XKPA 4FIMA 1JNFA 3FV2A 4TOZA 2P2AA 4ZEKA 4KYSA 4I1DA 3H7MA 1A8FA 3CI8A 3MW0A 4OERA 3LC8A 3M8UA 3PMWA 4RY1A 3FIRA 3EQ1A 3THIA 3PPQA 2Q89A 4ISUA 2Q2AA 1NKXA 4AB5A 3T66A 2XXXA 3OD7A 4IO7A 1YAEA 2ZXTA 2GRVA 1NH8A 1R6ZA 1QULA 4OEVA 3K1MA 1OVBA 1NFTA 3KSJA 2O69A 2ESNA 4F2OA 3IK6B 3OEKA 3R7XA 5ISUA 1MQIA 2RC7A 3VXBA 4JB7A 3FXRA 1VE4A 3K0VA 1DOTA 1IXIA 1OVTA 1JW4A 3IX1A 3FXUA 1LFGA 2OWSA 4BDNA 3LBSA 4Q8RA 5A5XA 3FVNA 2V3TA 1LBCA 4C0RA 4RXLA 2XX7A 1OQHA 3SEYA 1FW0A 3QYTA 2G29A 1AMFA 4Q30B 5TU0A 3PUVE 1LB9A 3FJMA 2XXYA 3T22A 3TELA 4FAJA 1B5IA 3HN0A 3MBPA 3RPWA 2XXRA 5CC2A 5ELVA 2UVGA 3SETA 1N7WA 4X1BA 4ELRA 5KDTA 5CRYA 3H4ZA 4KD5A 3FJGA 4NWCA 4XKQA 2UVIA 2ZYKA 2DE2A 4F18A 3T93B 5JTYA 1LAFE 4POWA 4H0WA 2R71A 2RCBA 1B1HA 3PU5A 1EZ9A 1QKBA 3ZS6A 2WKYA 3BFTA 4QFPA 1S9TA 3U1OA 2DWAA 4LUBA 5KCJB 1DMBA 3UA8A 1IXCA 3HO7A 2Z22A 2VP1A 1URSA 2NXOA 4YKPA 2Z8FA 3OO7A 5J1DA 4KQPA 2P1SA 3OSQA 4K3FA 3TZAA 5KCJA 3O6GA 2UXAA 4OVJA 1H3DA 2DS9A 5AA4B 4ESXA 1EZPA 1ZIUA 1BKAA 3IOUA 4U21A 3H6TA 1O7TA 2DXRA 3RTWB 4UA8A 1AOVA 5CMMA 2NVUB 4RK2A 2BJJX 3R26A 3VV5A 1B46A 4RJZA 2REGA 3KJ7A 1N04A 3MC2A 1PBPA 2CZLA 1JVYA 4XKNA 3SEUA 3CG1A 4U1ZA 2F8DA 4KI0E 3LR1A 4EQBA 3DP6A 1MRPA 5JEIA 3U92A 1MQGA 4H65A 3CSGA 3FVOA 2V84A 1B3HA 5I58A 1I6AA 4OFLA 4WEPA 1PB7A 1SW4A 2B3BA 1Y3QA 4F3PA 2HFBA 3MJNA 5DVFA 4PQJA 1LFIA 3O29A 5ITOA 3Q26A 1FQDA 3O6HA 4H5FA 1MS7A 3S9MC 3EF7A 3RY3A 4OQOA 1QVSA 4ZE9A 2DOJA 3TCFA 1VFEA 2AL4A 1Y3NA 4N07A 3C32A 1AH5A 1ZLQA 3MQ9A 2DYXA 1NH7A 3IAZA 4EF2A 3C36A 4G8MA 5IAIA 3TQWA 2I48A 3E4RA 4F1YA 3CIJA 1FTMA 1D9VA 4ESWA 1XS5A 1AIVA 1MXXA 3MZ1A 3T9UA 2PT1A 4PFUA 3C31A 1JW5A 4OESA 1USYE 1NNKA 1R1NA 2RF1A 3PV0E 5I57A 2FYIA 3FVKA 1Y1ZA 2QS1A 2QJEA 3O2AA 3OOAA 1TT1A 2KLFA 2XXWA 4X9TA 1MH3A 4OEUA 4LA9A 4FEDA 2Y7WA 4GXSB 5ITPA 4HS7A 1B05A 4UACA 3E3KA 4PFTA 1MXUA 4LONB 2I4CA 2XXPA 4JWYA 3IB1A 2Z8EA 5H8QB 4GQOA 3S4UA 3MZBA 4MF3A 4YB7A 3QUFA 3V8XB 3IB0A 5CMBA 4G68C 4FEBA 1MXWA 4DCXA 1B58A 1USYH 1B5HA 1Z7NE 4ELQA 2DSFA 4GIZA 3DLNA 1F9BA 3MPKA 3G3HA 1B4HA 4EQ7A 3F11A 3OO9A 3GBAA 3TQLA 3SDFA 4ZDMA 1B32A 1DTGA 5KZTA 1TFDA 3H6WA 1JEVA 1LB8A 1Y1MA 2V93A 2OLBA 5AA2D 3U8QA 1XVYA 5HM4B 5L9MA 4NF4B 4KHZE 3FZVA 2G93A 1URDA 3CFXA 3V83A 4QF9A 4I8CA 5B7DA 4YU0A 3I5OA 4F1VA 1A55A 1IUDA 2GHAA 2I4BA 4KR5A 1Y3PA 1NMUA 1GR2A 2OZZA 4MFIA 1II5A 3R6UA 2VGQA 3E13X 3KFMA 2PX1A 4ZS9A 2XXQA 4XKRA 2E1SA 3G3JA 1FTKA 4R9FA 3TODA 5CMCA 1D4NA 2DWHA 4DDDA 1PC3A 4F29A 4F3BA 5ICTA 5I2NA 2UYEA 3U72A 1T0KA 4RA1A 1FCKA 2ONKE 3UORA 3I6VA 3TTRA 4ZECA 1PB9A 3OMBA 1WDNA 4O3AA 3DM0A 2DE4A 2W7YA 2Y7IA 4JSOA 1PDAA 2X7QA 1A7LA 3LSXA 2HAUA 3QK6A 1MXVA 4PFYA 1MQDA 1M5DA 4H5GA 3MZ9A 4DXBA 4YMAA 2I6EA 1QW0A 4QFOA 2QL3A 3VLWA 1LCFA 3N6UA 3IB2A 3PPRA 5H8FB 4N6PA 4I62A 1Q35A 1XT8A 4GLIA 2QRYA 2IEEA 4MLVA 3MUQA 1UTBB 3G3KA 2OWTA 3QSLA 1MY0A 1DPPA 3K6XA 3TCGA 1LAXA 1FQCA 2Y84A 1VFDA 3C35A 1MY1A 3LSFB 3T9HB 1N0TA 1PB8A 3PPNA 1B4ZA 1B9JA 3H06B 4IO5A 3CRBA 2IA4A 4RYAA 4R74A 3DP4A 5JK4A 1ZKBA 1I6QA 3C33A 5EYFA 5I56B 1GVCA 5HPQA 1YPNA 2H25A 3TTNA 3UK4A 4RNSA 2F7AA 4HCYA 4BDQA 4OZ9A 2ZMBA 3OENA 4NEDA 4TQUQ 1ZJLA 4IO6A 4R6HA 3DELB 2M8CA 1SBPA 1M5EA 5DEXB 2NWJA 1LSTA 4EF1A 3K00A 2XHDA 3B6TA 4U23A 4F1UA 4QHQA 2HZLA 1B1XA 1SVXB 3MP8A 3S9NC 3RTFB 4E0XA 4QSEA 2Q2CA 3QIMA 3GLBA 3SEWA 4ELPA 5K2XA 2O1MA 3K02A 3A3UA 4THIA 3TDJA 1L5TA 1MH4A 3PD8A 4QSDA 4YICA 2PYYA 2RC8A 4DIGA 1IEJA 3S2VA 5I59B 1OMPA 4R6YA 2F7CA 4JSDA 1BLFA 4FE8A 5CI5A 2O7IA 3IORA 1H45A 1MXYA 2H4IA 4F3GA 4PP0A 3ZSFA 5TP9B 1POY1 2VHAA 1ZBMA 3K2DA 4M4GA 4NF5B 1IIWA 2PT2A 4XTCQ 3MP1A 1RKMA 1SI0A 2XD2A 2B65A 4EXLA 2A5TB 2OK2A 1URGA 1ZTYA 1OLCA 4G2ZA 3VVDA 3IJXB 4NF5A 5FTIA 2XXVA 4WXJA 1P1QA 1ELJA 3KN8A 1QUIA 4R72A 2OBGA 4GWOA 2FA7A 3DP8A 4BDMA 1CB6A 2ABHA 1LAGE 4KYEA 5AA4A 4H67A 1P1NA 1TWYA 5TPAB 4GVOA 2QSXA 2I3WA 3VFJA 1I6BA 3OO8A 1J1NA 3H03A 4QFNA 4FATA 4IGRA 4QRZA 2AIXA 3K6WA 4IO2A 1LBBA 3ILUB 2AL5A 4RPNA 2QS3A 3KN7A 1FQAA 5I84A 3KEIA 2ZYMA 2VD2A 5CBRA 4GRKA 2ZYNA 3K1PA 1SI1A 5M2VA 5L8DA 1FTJA 2RKMA 3TPAA 4Z7EA 4Z0IA 2I49A 3N5LA 1HSLA 1MPBA 2HQ0A 4JWXA 1EZOA 4EQ9A 3HHGA 4FJPA 5H8NB 1B3FA 5EHSA 3CR9A 2DVCA 5FHMA 4GD5A 1FQEA 3KBRA 3VLUA 3KGCA 4PE5B 1A99A 1UTHB 3UGWA 1MXZA 3LUYA 3KSXA 3TEPA 1QUJA 2XXTA 1WVJA 3RT6B 4F19A 4YKJA 1GTKA 2DVZA 3EHTA 1SDXA 3TMGA 1N7XA 4C1TA 4H8IA 4X1DA 1NNFA 4I9DA 3HV1A 4LQ5A 1MPCA 1B0HA 4LZ8A 4ND9A 1XHYA 1UIUA 1OLAA 2RC9A 3C9HA 1H44A 3M3KA 1N84A 1ZU0A 3N6TA 3IO4A 3PUYE 2F97A 4C1UA 4NMYA 4NF6B 3WAEA 5AA2B 2HEUA 3V5AA 2YJPA 4KFQA 3VLVA 1TFAA 2FNCA 1P1OA 3BKIB 4NF8B 4IO4A 4AB6A 1HSEA 4OMBA 1O63A 1D9YA 3RQTA 4R75A 3H6VA 4LZ7A 3USDA 1JEUA 3TCHA 2NOOA 4GXAA 4ZEBA 1XC1A 1MDQA 4LATA 4G68B 2D5WA 5IKBA 2UVHA 3MAMA 5DT6A 1MY2A 2ZNSA 3PUXE 2I3VA 1R9LA 2H9BA 3ODBA 3TTMA 2ZNUA 5H8QA 5H8HB 2F36A 3FD3A 2H98A 5L9SA 1UIVA 2O68A 4OYVA 1SW1A 1OQGA 3KJTA 4Q0CA 3TAJA 2H5YA 3T9XB 3A3CA 4U2RA 3B6WA 4ZEFA 2P0SA 2ANJA 3O97A 5BUUA 1BIYA 4HTGA 1FQFA 3A09A 1S7YA 2F6GA 1Y9UA 3RUMA 1DSNA 3FV1A 3IR1A 2R9JA 2O1LA 3HCQA 3S9LC 4MH5A 1DPEA 2LAOA 4OENA 2ZNTA 5HBCA 2Q88A 4F39A 3QUJA 1IXHA 4QFLA 3RNNA 4NF4A 4R73A 3KOSA 1VR5A 1IQ7A 3L6GA 3LSWA 3Q27A 1JW1A 4GFRA 3KN3A 2ONSA 4FORA 3G7WA 4GL8A 3TTKA 4H8JA 4BDLA 2GH9A 1EH3A 1A40A 3ONMA 4MBPA 1Y4CA 1YTVA 2I0CA 4QFKA 5L9OA 1LGBC 4P0GA 4YZZA 2DWIA 2QS4A 1WODA 2A5SA 3FVGA 2THIA 2F7BA 2RCAA 1VSOA 4IGTA 2DP8A 3K01A 1B3LA 4KYDA 2ONRA 3PPOA 1XVXA 4JBZA 2YLNA 4FECA 1IZ1A 3TTLA 2HAVA 3O9PA 3IOTA 3UIFA 4P11A 3ZKLA 3K6UA 3SESA 3IOWA 2B3FA 3OO6A 1B0LA 1BTJA 3OEMA 4N13A 3SERA 4F31B 1PBQA 4IY5A 1JQFA 1FTLA 1KWHA 5DTBA 4U4XA 5H8FA 4U1OA 4DE8A 3K6VA 5ICQA 1Y4TA 1UTBA 3GXAA 5BWJA 1MQJA 1B5JA 4EXKA 3CSBA 1Y20A 2F34A 4YB6A 2QMXA 3M3LA 5A5XB 5F1QA 4OFOA 3PMXA 4M1VA 3OXNA 4DCYA 4NTLA 2QPQA 3O6IA 1TXFA 1CE2A 3FJ7A 1HSJA 4F22A 2D21A 4PFWA 5I56A 4ZZEA 4G8NA 1H43A 3Q29A 3RT8A 1LCTA 4BLAA 1P1UA 4DXCA 1US4A 1D3KA 5FHOA 5FHNA 4HW8A 1Z7ME 4OHNA 5KDTB 3L6HA 2Y7KA 5DEXA 2DE3A 1N3XA 2NUVA 1JVXA 3MVXA 4BDOA 1QJMA 1P99A 2REJA 4H1XA 5CMKA 3JV9A 3PUWE 3G3GA 5JTYB 1LLSA 3JYRA 2AYSA 3S9EA 1ATGA 1AL3A 3HSTA 4R9GA 2Z23A 3OELA 3VVFA 5DYHA 2RINA 1MY4A 4ZZAA 1R9QA 4XXUA 1B52A 4Q5TA 3WAFA 4DXUA 4IO3A 1EU8A 1NNPA 4G4PA 2V3UA 3KG2A 4GF8A 5I59A 2O6AA 5K2YA 2V25A 3IO6A 3B7DA 1N3WA 1IITA 3KOTA 3EHSA 2PBWA 2X7PA 3PPPA 5FTHA 5EHMA 5TP9A 4OWDA 1QKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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