5CC2A

Structure of the ligand-binding domain of the ionotropic glutamate receptor-like glud2 in complex with 7-cka
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
VVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPQEDGTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRGTSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPFERDSMYSQMWRMINRSNGSENNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVGNTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, delta-2
publication title Pharmacology and Structural Analysis of Ligand Binding to the Orthosteric Site of Glutamate-Like GluD2 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cc2A02
5TU0A 1POY1 4MF3A 3TCFA 3TELA 1HSEA 2Z22A 5FHNA 3FXRA 4C0RA 3UIFA 3OD7A 2I3VA 4AB5A 3SETA 4QRZA 4DLDA 1PB8A 1M5DA 3QUFA 5AA2A 3KBRA 4JBZA 2V25A 2HAVA 4LVQA 1DPEA 3MP1A 1JW4A 1LBBA 2Q89A 1M5FA 4LZ7A 4NTLA 4LA9A 4FE8A 2A5TB 2Q2AA 4H65A 3MZ9A 3O28A 5K2YA 3ILUB 4WEDA 3TFLA 4GQOA 2IA4A 1Y9UA 4IY5A 3ZS6A 3O29A 1MQHA 4HCYA 4YAHX 4P11A 1SI0A 3TKDA 3FXQA 1B4ZA 3S4UA 3IX1A 4POXA 4EQ7A 3U72A 1LFHA 2H5YA 3ECRA 1EH3A 4BDOA 1B0HA 3KN7A 5FHMA 4PFTA 1SD3A 3EPEA 4DDDA 4THIA 3DP8A 1NNPA 3RY3A 4R6YA 1B58A 2O7UA 2ALUA 2OWSA 1HSLA 4Q5TA 5I2NB 4RPOA 3B6WA 1RYXA 4YKIA 4EF2A 3EQ1A 1LAHE 2Z23A 2HCAA 3S9LC 4G77A 2DOJA 1Y4TA 1A8EA 4JB7A 5JK4A 2NOOA 1P1WA 4ZECA 1SBPA 4FAJA 1B32A 4IO7A 5K2XA 3V89B 3IO4A 4YB6A 3UORA 1JNFA 2G93A 2DE4A 3HO7A 3DP4A 3G3GA 3FASA 4U22A 4NF4A 3OEMA 4ZEFA 3MUQA 3OO6A 4DCYA 2HQ0A 3M8UA 1P1QA 3TMGA 1GGGA 1B5IA 1MG1A 3CIJA 1B4HA 4F31B 5CMKA 3KFMA 4H1XA 2O7IA 2GHBA 2H99A 3KOTA 3OO8A 4RXLA 4TQUQ 3HHGA 2I0CA 4YMBA 2V84A 2DQVA 3H7MA 4JWYA 1FCKA 1YCJA 3K6WA 2D5WA 1UIVA 4FJPA 3WAFA 5KDTA 1MPCA 1DOTA 5I58A 3B6QA 3THIA 3FATA 1QVSA 1N7XA 3SDFA 5I59B 2QRYA 3VXCA 2I6EA 5TPAB 2F35A 3MQ9A 4XTCQ 3LR1A 3WAEA 3IR1A 3VLUA 3UK4A 4YB7A 1SYIA 4XIGQ 1LAXA 1Z7ME 5BWJA 1IQ7A 2XXRA 4HCWA 3DLNA 2B3FA 4DXUA 1BLFA 1YAEA 2DXRA 3H06B 2F7AA 4GF8A 5DVJA 3MBPA 4OFOA 2O1MA 2YLNA 3ZKKA 5ICTA 2NXOA 1SDXA 3KOSA 4IGRA 1ZU0A 4ZS9A 3BBRA 5H8NB 1B3EA 5JEIA 4F29A 3SEWA 2VOZA 4PFWA 1B5HA 3K00A 1US4A 1GVCA 2X26A 3G7WA 2PX1A 3QIMA 2D3IA 1S7YA 4OFJA 3U92A 1M5BA 3V8XB 3N6TA 4ZE8A 1VE4A 1EZPA 5CM6A 4KQPA 5I57B 1H45A 1RYOA 3TZAA 4M1VA 3T66A 3VE1B 3MJNA 3TDJA 3M3LA 4KCCA 1A99A 3D4GA 1MQJA 4IO3A 4JWXA 1PDAA 4NF5A 2H9BA 4OERA 3RTFB 3A3UA 4OYVA 2HFBA 5FTIA 5H8QA 1EZ9A 1XVXA 4XKNA 1B52A 3OO9A 3SEUA 1MM7A 1VR5A 1O63A 3KZGA 4U23A 3EHUA 3ONMA 5ICQA 2Z8FA 1NNFA 3QSLA 2CZLA 5JTYA 4QHQA 3FJMA 1JW1A 1N3XA 4ZZEA 4F22A 1A8FA 3MAMA 3QXMA 2XX8A 1MXZA 1H3DA 3CRBA 3SEVA 2XXTA 3BKIB 4M4GA 4R9FA 4YB5A 4R73A 1Q35A 3SKPA 3PV0E 4MFIA 2ZNSA 1T0KA 3FD3A 1OQHA 2Q2CA 5H8FB 3A09A 4RYAA 1QUIA 4P0GA 3KG2A 4U1OA 3GLBA 3OMBA 3VV5A 3LC8A 3DELB 3JZJA 4ELRA 2I3WA 1OQGA 1QUKA 2B3BA 1AL3A 3FV1A 4LUBA 5H8SA 3VLWA 3O9PA 4GXAA 2RC8A 1D9VA 3TTLA 3HSTA 2ANJA 5B70A 3MW0A 2H25A 2PYYA 2A5SA 4GXSB 5IKBA 5AA3A 4H5FA 3CFZA 3TTNA 3QK6A 3KJ7A 2VP1A 1B2HA 3S9MC 1OLAA 2UVJA 4Q0CA 2X7QA 3VLVA 1QKAA 4MBPA 5I56B 1N0TA 4OMBA 4NF6B 2OWTA 3KSJA 3LSFB 4EUOA 4Q30B 3IB2A 4RPNA 3N26A 4NMYA 3FGSA 1XS5A 2Y7IA 2X7PA 4FATA 1UTHA 2ZYMA 1MRPA 2V3UA 1LLSA 2XXXA 2O1LA 1MY0A 2XXWA 3E4RA 1O64A 3IB1A 1MY3A 1VSOA 3TUSA 4TLLB 3RTWB 2DYXA 1ZMGA 3PPOA 2RKMA 2PMSA 1B1HA 2KLFA 3C4MA 3FV2A 5DVFA 4G68B 2DS9A 4G4PA 3R26A 1B3GA 4X48A 4KPTA 4IB2A 2O69A 1MM6A 1UTBA 4EXKA 4RY1A 2VGQA 3OO7A 1CE2A 1DMBA 2W7YA 3TTRA 4ESWA 3H6VA 1R6ZA 5ELVA 3K6UA 3FZVA 4ECFA 3FXUA 1XC1A 3IOUA 3TQWA 3I6VA 4NE4A 1NL5A 3JYRA 3CI8A 2ZYOA 4U2RA 1GV8A 3Q28A 1MXUA 1A54A 4ZEBA 5I2KB 1MPBA 1OVTA 2HXWA 1FQEA 2VD2A 3R6UA 4I1DA 5H8NA 1P1NA 3TCHA 1PB9A 3RUMA 4YZZA 2Q8JA 1MDQA 3TAJA 3ZKLA 3RQTA 3H4ZA 2I4BA 4WEPA 2XD3A 4BDRA 3Q26A 3T22A 3F11A 1JW5A 4R2BA 5DEXA 4TLMB 5ISUA 4IY6A 4WKMA 5TP9A 2HZKA 3CG1A 3KSXA 5EHSA 4BDLA 1MH4A 3ODBA 1B46A 2QS2A 2RC9A 2XX7A 4P0IA 1US5A 5A5XB 5CRYA 3OEKA 4OESA 4LQ2A 3IJXB 1TXFA 4GFRA 2M8CA 1B05A 4ELPA 3TTKA 1YTVA 2F34A 3N94A 1BKAA 4OFLA 1MPDA 3K1NA 4F39A 1GTKA 1N04A 2RCAA 3TEPA 1NH7A 1NNTA 1ZLQA 3C35A 2REJA 2RF1A 2I58A 4C1UA 1AH5A 4F1YA 1O7TA 1Y1ZA 2HZLA 1B3HA 5DTBA 1IXHA 3DM0A 4YICA 4YKKA 1SI1A 3O97A 2GH9A 2GRVA 3FJ7A 2QMXA 3KEIA 3BFTA 4NEDA 5H8HB 4IGTA 2XD2A 2HEUA 1MQIA 4XKRA 3U1OA 3PUXE 4HW8A 4BDNA 3KGCA 2UVGA 3OOAA 4ZZAA 2XXYA 2QJEA 2FYIA 4DIGA 5CI5A 2I48A 5L8DA 1L5TA 2DWAA 4QFNA 4LP2B 3RT8A 3RGYA 3T9HB 3C33A 3W9WA 4POWA 4MLQA 2PT1A 3IOTA 1IEJA 5HBCA 5FHOA 5AA4A 1D3KA 4UA8A 1S50A 5CMCA 4K3FA 4AQ4A 1DSNA 1SQYA 2Y7KA 2AL4A 1IZ1A 3UN6A 3O2AA 4Z7EA 3MP6A 2OJTA 1R9QA 3A3CA 1FW0A 1MH3A 4IO2A 4ZEIA 3T96B 3MVZA 3UGWA 3FJGA 1URGA 3W15C 1ZIUA 3UP9A 4RNSA 4OQOA 1A40A 4F2QA 4AB6A 4F2OA 3RLFE 3C36A 1B0LA 1R1NA 1PB7A 3Q29A 1Y4CA 3FVGA 4G68C 4ZE9A 1MY2A 1JVYA 3G3FA 3PPQA 2DWHA 3FVNA 4OETA 2V3QA 4OZ9A 2P2AA 1M5EA 4EDPA 1NH8A 2B65A 1B40A 3PMVA 1LFIA 3OXNA 1OLCA 1DTZA 1CB6A 2Z8EA 1XVYA 2V93A 4BDQA 5KCJB 3V83A 1POTA 2R71A 2ZNTA 3B6TA 3LSLA 4ESXA 3CFXA 2FA7A 4L17A 1JEVA 1Z7NE 3LUYA 4NWCA 4HTGA 3PUVE 3FUZA 2XXQA 3O6HA 3Q25A 4G2ZA 4GL0A 2VHAA 3TODA 3G3KA 1R9LA 3HN0A 3KN3A 5AE4A 3V5AA 3N5LA 3FIRA 3O6IA 2ONKE 5I84A 1YPNA 2H98A 4O3AA 3ZSFA 5CMMA 1P1UA 2A5TA 3HV1A 2Z8DA 1MQDA 1I6QA 1LAGE 4FEDA 4RJZA 1Y3PA 3T9XB 2DE3A 4YMAA 4OWDA 4QSCA 2OLBA 2Q88A 4RK9A 1USYH 1OIBA 2R9JA 1WODA 4NF8B 4I9DA 1LSTA 3K6XA 1P99A 4RA1A 3RT6B 3QYTA 3M3KA 3IOVA 4QFOA 1B7UA 4R75A 1VFDA 1EU8A 5L9MA 2QPQA 4H8JA 3IOWA 4QSDA 4X1BA 2F78A 5KDTB 3H6UA 5I58B 4H6DA 2QMWA 2YJPA 3MVYA 4KYEA 1MXVA 3T9VA 3I3VA 1D4NA 3W9VA 3C34A 4KYDA 3H6TA 5LOMA 1ZKBA 5M2VA 2ONRA 3K02A 2UVHA 4NWDA 1JVXA 3VVDA 3RN8A 4YU0A 3TQLA 3VFJA 4ZDMA 1NMUA 3E13X 4DCXA 5CMBA 5I2NA 4H67A 1B1XA 4TOZA 4PFUA 4EF1A 5AA2D 4KYSA 4G8MA 1ZJLA 4BLAA 3K0VA 4U4SA 1S9TA 1B9JA 1UIUA 2AYSA 3KN8A 3TTMA 1F9BA 1N76A 5DT6A 2THIA 3DP6A 2F8DA 3EN3A 5ITPA 1TFDA 3G3JA 1IIWA 3P7IA 1PBPA 5EYFA 1QW0A 1ELJA 1DTGA 2F97A 3O6GA 2H4IA 3CSGA 3TPAA 4G8NA 1I6AA 4H5GA 1AIVA 4KR5A 1FQFA 1BIYA 3K6VA 4NF5B 4FIMA 5FTHA 5KZTA 1Y20A 5H8QB 2VD3A 4E0WA 1P1OA 5CBSA 1TT1A 4KFQA 1HSJA 1QJMA 3LSXA 1FQBA 1J1NA 4EXLA 4PFYA 2E1SA 5I59A 3PUYE 1ZTYA 1OVBA 3GXAA 5TPAA 2Q9TA 5JTYB 3PU5A 1MY4A 1FTJA 4GIZA 1LB9A 4KI0E 5HM4B 4DXBA 1MY1A 1JEUA 1MXWA 1IXIA 4XKQA 2DVCA 2XHDA 1II5A 1B3FA 1QUJA 2XXIA 4OTEA 1TFAA 4IO5A 1Y3QA 4IO6A 3OELA 3B7DA 2ZNUA 3CVGA 1TWYA 3VXBA 2F6GA 3BFUA 5DVIA 1WDNA 1FTOA 4RK2A 5CC2A 4MH5A 2AIXA 3ILTB 2YPNA 3T9UA 4ELQA 1FTLA 4H0WA 1SW2A 1MDP1 3IO6A 3IB0A 4R6HA 3IJOB 3K1PA 3USDA 4XXUA 2GFEA 1I69A 1SW5A 4H8IA 2DWIA 2DP8A 5I57A 2DVZA 1BP5A 2WKYA 4UACA 4I8CA 1KWHA 2Y7RA 1MQGA 2ZXTA 3GBAA 1IUDA 3D4CA 2HAUA 3MVXA 5KCJA 3SEXA 5BUUA 2XX9A 3U94A 4FEBA 1Q1KA 1H44A 1AMFA 1NKXA 4Q8RA 3RNNA 4QFLA 4F18A 2I49A 1GR2A 3OENA 1XOCA 1SVXB 3FVKA 3PPPA 3HPIA 3SEYA 3E3KA 4R2FA 3C32A 1ZBMA 2XXUA 1M5CA 1UTHB 4U1ZA 5J1DA 1JQFA 4F3GA 1EZOA 2FNCA 1USYE 1LGBC 1B3LA 4WXJA 4QFKA 4OVJA 3PUWE 4E0XA 2OK2A 3OSRA 1FQAA 4ELOA 3HHFA 3EHTA 5H8FA 1PEBA 1WVJA 2RCBA 3R7XA 4NF8A 4MLVA 3S9EA 4KCDA 4GVOA 1FTMA 4JWOA 4PETA 4GOTA 4LATA 2UXAA 4KHZE 3PMWA 2O68A 1IITA 2OCUA 4OEUA 1UTBB 4F19A 3K4UA 1FQDA 4OXVA 3EF7A 2UVIA 5AA2B 4DXCA 2I4CA 4U21A 5L9SA 4LQ5A 1I6BA 2CMOA 4JDFA 3IAZA 4KD5A 1B5JA 2XXPA 3MVWA 4N13A 5EHMA 3CG3A 3PMXA 1RKMA 2DXYA 4EQBA 4FECA 1URSA 1B7ZA 3IORA 1PC3A 3OSQA 1N84A 2F7BA 4C1TA 2ESNA 1N3WA 2RC7A 4YKJA 1VFEA 1Y1MA 1QKBA 1MS7A 3LBSA 4JXIA 1NNKA 2O51A 3MP8A 4PP0A 3AXFA 1H43A 2F7CA 4R6KA 4F1VA 5CBRA 5I56A 3MPKA 4NF6A 4G8HA 2P0SA 1N7WA 2E0SA 1MXYA 4F1UA 3U93A 1XT8A 3N6UA 4R72A 1B7HA 5DEXB 3TCGA 4X9TA 1D9YA 3VVEA 5TP9B 4LZ5A 2QS4A 1LBCA 3C9HA 5HPQA 3MZ1A 3VVFA 1XHYA 4LONB 1IXGA 2QL3A 5F1QA 3PD8A 1IXCA 4GRKA 3K2DA 1BTJA 3EHSA 2RINA 3PD9A 4G68A 2XXVA 3UA8A 2DE2A 3GBBA 3MC2A 2PBWA 1ATGA 3GZGA 4R74A 3L6HA 2NWJA 3U8QA 4YKPA 2QS3A 3FVOA 4R9GA 4ZEKA 3CFLA 3G3HA 5IAIA 2UYFA 2Y7WA 4NF4B 3K1MA 4HS7A 5DYHA 4ISUA 3CR9A 4XKPA 2D21A 3C31A 5AA1A 1LB8A 4N07A 1H76A 3G3IA 4PQJA 2P1SA 2REGA 1A55A 1LCTA 5I2KA 1Y3NA 3PPNA 3HCQA 3QUJA 2OZZA 1NFTA 3JV9A 3Q27A 4PE5B 1LFGA 1URDA 2QSXA 4DE8A 2DWJA 2BJJX 1UQWA 2GHAA 3RPWA 2ZYNA 3H3GA 3TYHA 4LZ8A 1DPPA 4Z0IA 2PT2A 1LCFA 3E9XA 4QFPA 3PGFA 2NUVA 5AA4B 3SERA 3M3FA 4JSOA 2NVUB 1SW1A 3K01A 3MPLA 5ITOA 2Y84A 4BDMA 4I62A 1SYHA 2ZYKA 1MXXA 1B51A 2UYEA 1FQCA 3IK6B 2IEEA 3IL1B 2ZMBA 3SESA 5F7VA 3H6WA 4ONYA 3O66A 1SW4A 5A5XA 4GLIA 2ABHA 3MZBA 2F6PA 4OHNA 2R6GE 3T93B 2XXHA 4GD5A 4F3SA 4DZ1A 1A7LA 4EQ9A 2G29A 2LAOA 4IO4A 2ONSA 2Y7PA 2F36A 4JSDA 4GWOA 3MWBA 1ANFA 4U4XA 3PPRA 3PUZE 2V3TA 4QSEA 4O3BA 1OMPA 2I0BA 3VDFA 4FORA 4ZEDA 1LAFE 1JETA 2PVUA 1QULA 3L6GA 4GL8A 4N6PA 3S2VA 2F5XA 2OBGA 1B6HA 2QS1A 4F3BA 3I5OA 3QAXA 3CSBA 4O3CA 2AL5A 5H8HA 5B7DA 2DSFA 1PBQA 3KJTA 4ND9A 4OENA 4F3PA 2O6AA 5L9OA 3LSWA 1AOVA 4OEVA 1FTKA 4X1DA 2O84X 3S9NC 4QF9A 3H03A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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