2I48A

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with carbonic acid
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A01
3QUJA 2VOZA 3FJMA 4H5FA 3ILTB 3HHFA 4QSEA 3F11A 3T9UA 4GD5A 5FTHA 3PPRA 5H8FB 3ECRA 4P0IA 5IKBA 2ZYOA 3D4CA 4F1VA 4OMBA 4NF4A 2XXQA 3M3FA 2Q9TA 1AOVA 1LFGA 4ZECA 1TT1A 1P1UA 2ABHA 2O69A 1B6HA 4OEUA 3VLUA 4RPNA 5KDTA 2QJEA 3KOTA 3HV1A 5CI5A 3FIRA 3T93B 2B3BA 4ESWA 4ZDMA 4FECA 1PC3A 2GH9A 4KI0E 4MBPA 4F2QA 2Z8FA 3ONMA 1URGA 1Y4TA 2XXIA 3Q29A 2UYFA 3IB2A 1N7XA 2F5XA 3T9XB 1LAFE 5L9OA 3L6HA 1EZPA 5JTYB 3K4UA 1IXGA 4H1XA 4DZ1A 3TCHA 3AXFA 2XXYA 3KZGA 2AL5A 2Y7KA 4ZEDA 3H7MA 2UYEA 3MPLA 4YMBA 1Y4CA 2O1MA 3IO4A 4JWOA 2Z8DA 1MXUA 4H65A 3Q28A 3KG2A 1NH7A 1VR5A 1N76A 4X9TA 1P1OA 3KSJA 5H8HA 4U22A 3VFJA 3SKPA 2RKMA 4TLLB 3FJ7A 4GXSB 1VSOA 2UVHA 1SQYA 3T9VA 4JB7A 1MRPA 2F97A 3T9HB 4OVJA 1MY3A 3SEUA 5AA4B 4KCDA 1CE2A 3TZAA 3U1OA 2W7YA 2DXRA 3H03A 4WXJA 1WDNA 1F9BA 4ELQA 3N26A 3VE1B 4R74A 3IL1B 4U2RA 4G8NA 1Y1ZA 3K00A 1DPEA 3SEWA 2E0SA 3PUYE 1USYH 4OHNA 2O6AA 4OFJA 1FTMA 3K6WA 4WEDA 4NF4B 1JVYA 2QS4A 1QKAA 3U8QA 3SETA 3H06B 3QXMA 5JEIA 2ONKE 2AL4A 3B6QA 5KDTB 1OLAA 4KHZE 1N84A 4LUBA 5I59B 1ZIUA 1R1NA 5AA2D 1WODA 3H6UA 2ZXTA 3P7IA 3TTMA 3FVKA 1SW4A 1OVBA 1EZ9A 4OEVA 1ATGA 3PGFA 3IJOB 3R6UA 4MLVA 1P1QA 1M5FA 5DVJA 5K2YA 4ELOA 4LQ2A 1FQDA 3CSBA 2XXUA 3SEVA 2XX9A 2D3IA 1D3KA 3OEKA 5H8NA 3ZKLA 5ICQA 4G8HA 1AL3A 1NNFA 3OD7A 1LBBA 1B1XA 1RYOA 2X7PA 3O2AA 4KPTA 4BDRA 5I56B 1HSJA 1US4A 4BDMA 4EQ9A 1UTHA 1GR2A 5EHMA 1LSTA 4YICA 4Q30B 1MY4A 5DVIA 3TODA 1LB9A 2I0CA 3K02A 4EDPA 5I58B 3K6VA 1B2HA 3VVFA 1PBQA 1USYE 2FNCA 4ZEBA 3S9MC 1M5DA 4Z7EA 4BDOA 3DELB 1MQHA 5TP9B 1B32A 4ELRA 3RTWB 2F36A 1YTVA 4R2FA 2H5YA 1MY0A 2OLBA 2UVIA 4RK2A 3B6WA 3PMWA 3VXCA 1B52A 4DDDA 3O9PA 4GRKA 3OEMA 2HAVA 4XKRA 1MQGA 1OIBA 2PT1A 3U92A 2QS3A 1O63A 2Y7RA 5B70A 1FCKA 1DTZA 1EZOA 3TFLA 3QUFA 3S9EA 4RYAA 4YMAA 3N6UA 1UIUA 1B40A 2P1SA 5I57B 5LOMA 1XOCA 2F35A 3CR9A 3ILUB 2I4BA 3RGYA 4RXLA 5CBRA 1DSNA 5FHMA 2REJA 1QVSA 3MZBA 1YPNA 2V3UA 4GLIA 2HXWA 2R6GE 3H3GA 3OENA 1PDAA 2Q8JA 5K2XA 2Q89A 4OFOA 4QRZA 3C33A 2HQ0A 3IB0A 1N0TA 4OQOA 3PPNA 5HPQA 4F3SA 1XC1A 2R9JA 1BTJA 5CBSA 1SBPA 2VGQA 1ZBMA 4ISUA 3OO9A 4RPOA 3R7XA 3WAEA 1O64A 1PBPA 3QSLA 1D9YA 1N3WA 3U93A 4UA8A 3VV5A 4F19A 3RNNA 1UTHB 4YKIA 3T22A 2QS1A 1N7WA 1Q1KA 4BDNA 1PB7A 3CIJA 3G3HA 5CRYA 2RCAA 4I9DA 3K01A 1QUIA 4EXKA 4KYEA 1BP5A 1IITA 2HFBA 3KSXA 3WAFA 1B0HA 2FYIA 1N04A 1IZ1A 4QF9A 3KJTA 2QPQA 5CM6A 3KOSA 4TLMB 1PB9A 4G8MA 5AA1A 4ZZEA 5J1DA 4HCWA 2GRVA 3T96B 4R73A 3TCGA 4F1YA 2THIA 2F78A 3E3KA 3KN3A 4FORA 2XXWA 4AB5A 3KBRA 4F22A 5I2KB 2D21A 1XS5A 3M3KA 2RF1A 2E1SA 2CMOA 2ZYNA 2FA7A 2X26A 5FHNA 5AA4A 1NKXA 1H43A 4F3BA 3LBSA 3MP8A 4HW8A 4TOZA 1B5JA 3PD9A 5ISUA 4H0WA 1FQBA 2F8DA 3N6TA 5I84A 3OMBA 1A7LA 5JK4A 3VVEA 4L17A 3IOVA 1XVXA 4ZEKA 3FXRA 3FGSA 3DM0A 4U4SA 2O84X 4OZ9A 3MWBA 4G68C 1JW4A 5EYFA 5CMKA 3IR1A 3S9NC 2DP8A 4PP0A 5I2NA 5F1QA 3O28A 3UK4A 3O29A 3KN7A 3LR1A 2XX7A 3BFTA 1TFAA 1H3DA 5I59A 1JEVA 4N13A 4R6HA 3S9LC 4R9FA 2I0BA 1MXZA 1MXYA 3V8XB 2XHDA 3TELA 3KJ7A 4H8IA 2UXAA 5IAIA 4GWOA 3UP9A 2F7CA 2DQVA 1M5EA 3C32A 1LAGE 4LA9A 1TXFA 2H4IA 4F1UA 3FVGA 3S2VA 1B05A 2QSXA 1IIWA 4WEPA 3K1MA 3CG3A 3D4GA 4F2OA 4F29A 1LAXA 5CMCA 5I56A 3DP6A 4IO6A 2ONRA 3V5AA 1B7HA 2V3TA 4HTGA 5ELVA 3OSRA 4ESXA 3MW0A 1B5HA 2DWJA 5AA3A 1DTGA 1Z7ME 3TMGA 1A40A 3FATA 3PU5A 1FQCA 2DE2A 4NWDA 5I58A 1J1NA 3C34A 2VD3A 3FJGA 4NWCA 4IB2A 2ZNTA 1ZU0A 4PQJA 3PPPA 1B7ZA 3CFZA 1M5CA 3MVZA 3O6GA 3IO6A 5TP9A 2OK2A 3TYHA 4KCCA 4U1OA 1P1NA 3G3KA 2RC8A 3ZKKA 3CRBA 2V84A 4DXBA 3MVXA 2PBWA 3RLFE 3G3IA 2V93A 1XHYA 1GV8A 4F3GA 3PUZE 3CFLA 4OESA 4MH5A 5AE4A 1MDP1 1DMBA 1MXXA 1MPDA 1WVJA 1SI0A 3QYTA 5A5XA 3CSGA 3MQ9A 1MH4A 4YB5A 4E0XA 5I2NB 3BBRA 2R71A 2F6GA 1SW2A 4DXUA 3FVOA 3MPKA 1UQWA 5I57A 4R6YA 3L6GA 1H45A 4QFNA 1QW0A 4QSCA 4ZE8A 3KFMA 4XTCQ 4NF8A 5BWJA 2AYSA 4O3BA 3VLWA 4ECFA 2XD2A 1POY1 4QFKA 2OZZA 3OXNA 4YKKA 3IAZA 2YLNA 3UORA 4R75A 1OLCA 3CFXA 5AA2B 4KD5A 1P99A 2OWTA 2G93A 3GZGA 1ZLQA 2ZNUA 3CG1A 3C4MA 4KYSA 3RT6B 1LFIA 3C36A 1EU8A 3A3CA 1URDA 1SVXB 4O3AA 2DS9A 2UVGA 2ESNA 1R9QA 3IOWA 1B3GA 4JSDA 3RPWA 4U4XA 4EF2A 4RY1A 4NE4A 4PFTA 4F39A 3IK6B 5M2VA 4N6PA 2F34A 3KN8A 4PFYA 3C31A 3PMXA 2A5TB 1ZKBA 5KCJA 2XXPA 1KWHA 1Y3NA 1B3LA 2DYXA 4JXIA 3FUZA 1MPBA 4FIMA 2Q88A 5TU0A 2QMXA 4KQPA 3TTNA 1XVYA 2GFEA 2H99A 4EQBA 5H8QA 1LB8A 3FASA 2P2AA 1IUDA 1B4ZA 2XD3A 3PUWE 3UN6A 4N07A 4P11A 4MFIA 3JYRA 3RTFB 3VVDA 3W9VA 4KR5A 2G29A 3MVWA 3FVNA 5I2KA 2OWSA 2P0SA 3THIA 2V25A 3UGWA 1B9JA 3PUXE 2DXYA 1MM6A 4H8JA 2V3QA 1NNKA 4NF6A 5HBCA 1YAEA 1GGGA 5A5XB 1JNFA 3TTRA 4OFLA 4POWA 4FAJA 3TTLA 5L8DA 3ZS6A 2QL3A 2H9BA 3KGCA 3VXBA 1VFDA 1LFHA 1PEBA 4IY5A 2Q2CA 2ZNSA 4H6DA 3IOTA 1P1WA 2I58A 3SEYA 3E9XA 3EF7A 3IB1A 2I6EA 4IGRA 1T0KA 2QS2A 4NF8B 3PMVA 3H4ZA 4OYVA 4G77A 1ZJLA 1B1HA 4LP2B 2DVZA 1OQHA 1B3HA 3MAMA 4GF8A 1DOTA 1TWYA 3OO8A 4F31B 3C35A 2XXHA 4P0GA 1JQFA 4Q8RA 3O6IA 3TUSA 4PE5B 4ZE9A 3G3GA 3MUQA 2DE4A 5ICTA 2OJTA 3I5OA 2LAOA 4H67A 2DOJA 3E4RA 4ND9A 5TPAB 4AQ4A 1HSEA 3K1NA 1A54A 3Q25A 3LUYA 2HAUA 4EUOA 1MY2A 3O6HA 2X7QA 3TAJA 4GL0A 4FJPA 2VP1A 1AMFA 5KCJB 4JWXA 3FD3A 5L9MA 2O7UA 1O7TA 1QULA 3FV1A 4R72A 1N3XA 4RA1A 4RK9A 4FE8A 4HS7A 3HHGA 3VDFA 4YB6A 1QJMA 5H8QB 1QUKA 2I3VA 3GLBA 4GXAA 2CZLA 4R6KA 1PB8A 1L5TA 2KLFA 2O68A 3IX1A 1A8EA 1POTA 3OOAA 2OCUA 2ZYKA 3ZSFA 2ALUA 2DVCA 1I6QA 4LVQA 3MVYA 2ZMBA 4XKQA 1FTLA 1JEUA 5DVFA 5H8SA 1BIYA 3PPOA 4C1UA 4ZEIA 3EPEA 5EHSA 1SYIA 3RUMA 5ITOA 5L9SA 4U23A 4NF6B 2QRYA 4QFOA 3O97A 4YU0A 4G2ZA 3Q26A 4GOTA 5ITPA 2I48A 2DSFA 2BJJX 4GL8A 3A3UA 1Y9UA 4IO2A 2B65A 4H5GA 1HSLA 3HO7A 1RYXA 1QUJA 4BDLA 1FQEA 3K0VA 1URSA 1CB6A 1LGBC 2I49A 3TQLA 4RJZA 3OO7A 1S50A 2PMSA 1LLSA 4F3PA 3H6TA 3LC8A 3FZVA 2HZKA 2H25A 4IY6A 3I6VA 3G3JA 3LSWA 4LATA 5AA2A 1YCJA 4RNSA 1IXIA 4X1DA 2Z22A 2NWJA 4DCXA 1Y1MA 1OQGA 5KZTA 4IGTA 4ZS9A 2Y7PA 4NF5B 1JETA 2ANJA 1SDXA 4GIZA 4GQOA 3TCFA 5HM4B 5CMMA 1JVXA 3B7DA 1SYHA 2REGA 1BLFA 1NNPA 3T66A 3N5LA 1Z7NE 1AIVA 4NTLA 2XXTA 2IEEA 4YAHX 5DTBA 2D5WA 3B6TA 4E0WA 3TQWA 3JV9A 3OO6A 2O1LA 2A5TA 2Y7IA 2A5SA 3EHUA 1MXVA 4MF3A 4DIGA 2H98A 4OETA 2XXRA 4EQ7A 4YB7A 3G3FA 4C1TA 2GHBA 3W15C 1MQJA 3UIFA 3VLVA 2PYYA 4TQUQ 4DE8A 4BDQA 2B3FA 4G68B 4GVOA 4IO7A 4XKPA 1VFEA 2O51A 1US5A 3QAXA 1XT8A 2OBGA 5CMBA 1MPCA 1LAHE 1UIVA 4UACA 1MDQA 1GTKA 5DT6A 4K3FA 2Q2AA 1IQ7A 3SDFA 1H44A 2DWAA 1S7YA 2M8CA 1ELJA 4IO4A 3V83A 3EHTA 1FQAA 1Y3PA 2YPNA 3H6WA 5DYHA 3CVGA 4I62A 1JW1A 4NMYA 1B5IA 1LCTA 1MY1A 1NFTA 4Z0IA 3TDJA 3C9HA 4DXCA 4IO5A 1MH3A 2AIXA 3M8UA 4JWYA 4QFPA 2Z23A 4POXA 3EQ1A 4LZ7A 4FEBA 1I6AA 2YJPA 1A99A 2GHAA 2NUVA 2XXXA 1D4NA 2PX1A 4C0RA 3MZ9A 1Q35A 3USDA 3PD8A 4JDFA 4OERA 4DCYA 3BKIB 3H6VA 3E13X 3TEPA 3MJNA 4OTEA 4U1ZA 4G4PA 1Y3QA 3S4UA 2HEUA 4LZ8A 2WKYA 4THIA 5B7DA 3K1PA 1SW5A 3RQTA 5TPAA 3TTKA 3HSTA 1BKAA 2RC9A 3HPIA 1M5BA 1UTBA 3U94A 1ZTYA 2RINA 1B4HA 1Y20A 3I3VA 3V89B 3FXUA 3Q27A 4X48A 5FHOA 4O3CA 2DWIA 1FTJA 3LSFB 2Y7WA 1A55A 5DEXA 1B3EA 1FTKA 2QMWA 5H8HB 4JBZA 4JSOA 3RT8A 4PFUA 2F6PA 1B46A 1ANFA 1II5A 3A09A 5BUUA 3LSXA 2O7IA 3O66A 4ONYA 1A8FA 1MS7A 4GFRA 1LCFA 3G7WA 1MM7A 3MZ1A 1NL5A 4EF1A 2F7AA 2VHAA 3EN3A 4OWDA 1I69A 4LZ5A 3K2DA 4I1DA 1EH3A 1FW0A 4WKMA 3MP6A 4X1BA 5CC2A 3SEXA 2I4CA 1D9VA 2PVUA 1SI1A 4QHQA 2Y84A 4ELPA 1B7UA 2XXVA 1TFDA 3R26A 4FATA 5F7VA 3OSQA 1B3FA 2RC7A 2ONSA 4YKJA 5FTIA 1DPPA 2UVJA 4EXLA 4YKPA 1H76A 3PPQA 3SESA 3OELA 4Q0CA 4HCYA 1IEJA 3PUVE 4AB6A 3IJXB 1R6ZA 3BFUA 5H8FA 3DLNA 4YZZA 3U72A 4OXVA 1SD3A 4M4GA 3RN8A 4I8CA 4PFWA 3GXAA 4KFQA 1FTOA 1GVCA 3MBPA 3CI8A 1RKMA 1B58A 2VD2A 1FQFA 3HCQA 4NEDA 2PT2A 1AH5A 3UA8A 4QSDA 2Z8EA 3TKDA 1IXHA 1ZMGA 4FEDA 3MC2A 1UTBB 3QK6A 3W9WA 5H8NB 3JZJA 1MQIA 4Q5TA 3DP4A 3IOUA 4PETA 1LBCA 1MG1A 4LQ5A 3PV0E 3DP8A 4NF5A 2DE3A 3M3LA 2NVUB 5JTYA 4BLAA 1NNTA 5DEXB 4ZZAA 1I6BA 3GBBA 1NH8A 1B51A 3IORA 4IO3A 2DWHA 3K6UA 3LSLA 4M1VA 1OVTA 3TPAA 3GBAA 4DLDA 3EHSA 1SW1A 2IA4A 4XXUA 2ZYMA 4XIGQ 2XX8A 4U21A 4KYDA 1IXCA 3FV2A 1OMPA 2NXOA 2I3WA 4XKNA 4LONB 2RCBA 4OENA 1QKBA 1MXWA 2NOOA 4F18A 4G68A 4R9GA 3QIMA 3RY3A 3SERA 4QFLA 3HN0A 1B0LA 1MQDA 3ODBA 1S9TA 1NMUA 2HZLA 3K6XA 4MLQA 1VE4A 3MP1A 1R9LA 4ZEFA 3FXQA 4R2BA 3N94A 2F7BA 2HCAA 1JW5A 3KEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PBHA 2ZZXA 3QUJA 4NGUA 2VOZA 3FJMA 4H5FA 4PAIA 3ILTB 3HHFA 4QSEA 3F11A 3T9UA 4GD5A 5FTHA 3PPRA 5H8FB 3ECRA 4P0IA 5IKBA 2ZYOA 3D4CA 1EYKA 4F1VA 4OMBA 4NF4A 2XXQA 4GX4A 3A29A 2KQZA 2Q9TA 3M3FA 1AOVA 1LFGA 4ZECA 1TT1A 1IMBA 1P1UA 2ABHA 1YXIA 2O69A 1B6HA 4OEUA 3VLUA 4RPNA 5KDTA 3T0JA 2QJEA 3KOTA 3HV1A 5CI5A 3FIRA 3T93B 2B3BA 4ESWA 4ZDMA 4FECA 1PC3A 2GH9A 4KI0E 4MBPA 4IR8A 4F2QA 2Z8FA 3ONMA 1URGA 1Y4TA 2XXIA 3Q29A 2UYFA 3IB2A 1N7XA 2F5XA 3T9XB 1LAFE 5L9OA 3L6HA 1EZPA 2VPOA 5JTYB 3K4UA 1IXGA 4NF0A 4H1XA 4DZ1A 1FPDA 3TCHA 3AXFA 2XXYA 5I7IA 3KZGA 2AL5A 2Y7KA 3NOHA 4ZEDA 3H7MA 2UYEA 3HFUA 3MPLA 4YMBA 4PBQA 1Y4CA 2O1MA 3IO4A 4JWOA 2Z8DA 1MXUA 4H65A 3Q28A 3KG2A 1NH7A 1VR5A 1N76A 4X9TA 1P1OA 4PE3A 3KSJA 5H8HA 4U22A 3VFJA 3SKPA 2RKMA 4TLLB 3FJ7A 4GXSB 1VSOA 2UVHA 1SQYA 3T9VA 4JB7A 1MRPA 4OVQA 2F97A 3T9HB 4OVJA 1MY3A 3SEUA 5AA4B 4KCDA 1CE2A 3TZAA 4HE1A 3U1OA 2W7YA 2DXRA 3H03A 4WXJA 1WDNA 1F9BA 4ELQA 3N26A 3VE1B 4R74A 3IL1B 4U2RA 4P3LA 4G8NA 1G0IA 4N8YA 1Y1ZA 3K00A 1DPEA 3SEWA 2E0SA 3PUYE 1USYH 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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