2I48A

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with carbonic acid
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
b'MMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A01
4PFWA 3MP8A 2DP8A 4NF5A 4TOZA 3W9VA 4IO3A 1IIWA 1NH7A 2QPQA 3VV5A 4R73A 3AXFA 4QSDA 3C32A 4I62A 4O3CA 2VHAA 4R9FA 1FTLA 2NXOA 4EF2A 3FUZA 2REJA 3CFXA 4U22A 1LB9A 1Z7NE 4R72A 2I0CA 4H0WA 2NUVA 3T22A 3CSGA 3TUSA 2OWTA 3O66A 1B3LA 1B1XA 1B46A 4DE8A 4ELQA 2F97A 4EF1A 4RXLA 5CM6A 4R2BA 1PBPA 3TKDA 1BKAA 3FATA 2DVZA 3K0VA 3TTLA 2DWAA 1IUDA 5KDTB 1NNKA 4G77A 3OSRA 4NF8B 2UYFA 5KDTA 2OLBA 3RT6B 1LAGE 4U1ZA 1L5TA 1USYH 1WDNA 5AE4A 4QFPA 3IOTA 3ECRA 3S9EA 1B3GA 4N13A 5HPQA 4OFOA 4GWOA 3CFZA 2H9BA 3SESA 2V84A 2F7BA 1HSJA 2DOJA 3RTFB 4YMAA 1EU8A 4LZ5A 3TTKA 1Y4TA 2DXYA 4X1BA 3H6WA 3M3LA 1URGA 4X48A 1EZOA 3MPLA 4U4SA 1HSEA 4QFKA 1SW4A 3VXCA 3PGFA 2OZZA 1NNPA 3IOVA 3MZ9A 1LBBA 1SW5A 3CG1A 4QHQA 3ZKKA 1BTJA 1MQGA 2V3TA 1I6QA 3MZ1A 2FYIA 1IITA 4N6PA 1CE2A 2UVIA 2DWIA 2H25A 4FEDA 3T66A 1B32A 2DWJA 4KQPA 4OQOA 4GD5A 3CG3A 1LB8A 2DVCA 3T9XB 2GHAA 2PVUA 3FD3A 3B7DA 4MLQA 3SEXA 1FQEA 4R74A 4BDNA 2DE4A 1B5HA 1M5CA 3Q28A 1B0LA 3MP1A 2DE2A 1R1NA 3EQ1A 2ZNSA 3E13X 2KLFA 3A3UA 1Q1KA 4F3BA 5CBRA 1LFGA 4YKIA 3B6TA 3TELA 4OFLA 1N76A 2PT1A 2FNCA 4EQ7A 4N07A 4Z0IA 1P1QA 2PT2A 3EHSA 3IOWA 3QXMA 3T9HB 4F1VA 3RT8A 2Q8JA 3HO7A 3MW0A 1ZJLA 1MQHA 4DLDA 4QFNA 3BFUA 1SDXA 4OFJA 4GQOA 3IORA 1YTVA 4PP0A 5DYHA 3FVKA 4OEUA 4ISUA 1MPDA 4BDMA 2LAOA 4EXLA 2F5XA 3IO6A 4ZEDA 2NOOA 4TQUQ 5EYFA 3K6VA 3OENA 1VSOA 3TFLA 5I57B 2Z22A 3WAEA 2D3IA 4P0GA 1I69A 3PUYE 3FZVA 2AIXA 1POY1 3FXUA 2Z8DA 2O1MA 4Q8RA 4XKNA 4JB7A 4F2QA 1JQFA 3CIJA 5FHOA 2V25A 3O29A 1PDAA 1LLSA 1JW5A 4HTGA 2A5TB 4PFYA 2OWSA 3G3FA 1D4NA 4UA8A 1Z7ME 4DZ1A 1JVYA 1P1OA 2YJPA 2F7CA 4F19A 2XXRA 3FASA 4RK9A 3OD7A 3VLVA 3GBBA 4R75A 4OHNA 4G8MA 3UGWA 4OTEA 4EUOA 3SERA 1VFEA 4HW8A 2Y7WA 4ZEIA 2F6GA 2P1SA 4MFIA 4LP2B 1MXWA 1WODA 2CMOA 3JYRA 4POWA 2GRVA 4U23A 5A5XB 1P99A 5H8FB 4LVQA 4PFTA 3C34A 3SEWA 1JVXA 2ZYNA 2I49A 1SW1A 5A5XA 3K6UA 3U93A 3HCQA 5AA1A 4YKKA 2DXRA 3LSLA 1MXXA 4P11A 5B70A 3S9LC 3L6HA 1IEJA 1MQJA 1EH3A 3SEYA 1NKXA 5H8HB 2Z8FA 1D3KA 3M8UA 4R6HA 3FXRA 4F29A 4IGTA 4WEDA 3VE1B 1SD3A 2I4CA 3W9WA 2DYXA 1J1NA 3RTWB 4NMYA 4NWDA 3OEKA 3FJGA 5I2KA 2ZXTA 3PMWA 2XXHA 5J1DA 3LUYA 5ITPA 1P1NA 2ZNUA 1GTKA 5I59B 1YCJA 4ONYA 1MM7A 1MXVA 3FV1A 2O6AA 1DPPA 2R6GE 1N3WA 5I84A 3TEPA 2Z8EA 4FEBA 5I59A 3A3CA 4JWYA 1DPEA 3EHUA 4TLLB 3T9VA 3PUVE 4NF6B 3THIA 3KZGA 2QS1A 3R6UA 4NE4A 3VXBA 1QW0A 3IJOB 1JNFA 1OQHA 3QUJA 4PETA 1R6ZA 3HHGA 4KCDA 2AYSA 2CZLA 3SKPA 4DCYA 2E0SA 2X26A 4FE8A 3C33A 4GLIA 2RC8A 2F34A 4PE5B 4BDQA 1QUJA 3U92A 3KJ7A 2O68A 3OO7A 3BKIB 3CI8A 3S9MC 3HN0A 4R6KA 4Q0CA 1FQAA 3V83A 2UYEA 1QKAA 3IX1A 2XD3A 4H6DA 4DCXA 3MVZA 5I56A 3K02A 3KOSA 4R6YA 5CMBA 1BP5A 4YB6A 2Q89A 4ZEKA 5ELVA 4MLVA 1VE4A 3KJTA 2OBGA 3VLUA 1XS5A 2HFBA 4PQJA 1SQYA 4BDLA 1MDP1 3IAZA 4G8NA 1Y3PA 4OETA 1Y3NA 3KN7A 4H5GA 3O6GA 4C0RA 1LAHE 3MVXA 4QFLA 3VVFA 1SI0A 4QF9A 3FIRA 3VLWA 2PX1A 2O7IA 1QULA 3G3KA 3UIFA 1DMBA 3MC2A 3K2DA 2O1LA 1B3EA 5K2YA 3Q25A 3IJXB 4H8IA 3FJ7A 3G3JA 3SDFA 1VR5A 2QJEA 4FIMA 5DVJA 1F9BA 4EQ9A 1Y20A 1GGGA 4BLAA 3H3GA 2D21A 1MPCA 3QYTA 1FTMA 2HAVA 2H5YA 5JTYB 3TTMA 1A7LA 1OLAA 4GL0A 3TTRA 4KPTA 4ESXA 1MY1A 2YLNA 3HPIA 2O7UA 1GVCA 4YB5A 4K3FA 3K00A 1BLFA 1A99A 4EQBA 1QJMA 4GRKA 3TPAA 1IQ7A 5AA4B 1N04A 4NF8A 2DQVA 3A09A 3RN8A 4XXUA 3UP9A 3O9PA 1XOCA 2HZKA 5TPAB 1YAEA 3PPQA 3FGSA 3HV1A 1OVBA 3IOUA 4LUBA 5TPAA 3U8QA 5LOMA 1LBCA 4UACA 2QS3A 1O63A 2F36A 1AIVA 1URDA 3C9HA 3I3VA 1XVXA 3ONMA 1B3HA 4H67A 4F1UA 3O6HA 3TODA 1ZBMA 3DM0A 1MXYA 3EN3A 1QUKA 3GLBA 3QUFA 2F6PA 1XHYA 2I4BA 3O6IA 1KWHA 1NFTA 1GV8A 3CRBA 4O3BA 4ZE9A 1UQWA 3S4UA 1LSTA 1PB7A 2PMSA 4WKMA 4IB2A 2DE3A 3TQWA 2XX8A 5CC2A 5F7VA 4XIGQ 1IXCA 3IB2A 1IZ1A 3JV9A 1PEBA 2FA7A 3ILUB 4HCWA 3B6WA 4THIA 2NVUB 1LFHA 3LBSA 4RYAA 4IO5A 2A5SA 2ALUA 3G3HA 3PUWE 4H8JA 1CB6A 1B4HA 3OELA 3KSJA 5DT6A 4EDPA 3O2AA 2YPNA 3CFLA 5AA2D 1ATGA 4Q5TA 4FAJA 1R9LA 3Q26A 3H06B 3T93B 3N94A 3RGYA 1ZU0A 4G68B 3C36A 5ICQA 2QMWA 1XVYA 4AB6A 3P7IA 1OVTA 1ANFA 1A8FA 3QK6A 4OERA 4G68A 5DTBA 4OYVA 2RC7A 3C4MA 1N84A 3QIMA 5I57A 3MBPA 2Z23A 1DSNA 3KBRA 3RY3A 5JEIA 3OO8A 3SEVA 4TLMB 1LAXA 4U4XA 1FQDA 1B5JA 1AOVA 1NH8A 3PPOA 1O7TA 2ONSA 3D4CA 3S2VA 4FORA 4NTLA 3M3FA 4JXIA 4YZZA 3K6WA 3L6GA 2ZMBA 2A5TA 3Q27A 4MH5A 4NF4B 4Q30B 3TCFA 1MY3A 3RUMA 2AL5A 4IY6A 1JW1A 2RF1A 1OIBA 1LFIA 4IO2A 4NF4A 4I9DA 1JW4A 2ONRA 1PB9A 1BIYA 3H4ZA 4ZZAA 2P0SA 4DDDA 3M3KA 3IR1A 5H8SA 1Q35A 1IXIA 3VVDA 3IB1A 3FVOA 3H7MA 5FHNA 3TMGA 4LATA 5BUUA 5ISUA 4IO4A 3VDFA 2VP1A 1M5EA 3PU5A 4H1XA 5L8DA 4IY5A 5H8FA 1MH3A 3FVGA 3H03A 4JWXA 3MQ9A 4LQ5A 4MBPA 1S7YA 2XXWA 4LZ8A 3V8XB 2I0BA 1Y1MA 4OENA 2IEEA 2ZYMA 1ZKBA 3UK4A 1P1UA 2XXUA 3EF7A 1R9QA 2M8CA 3OEMA 1RYXA 4ESWA 1QVSA 5H8HA 4GVOA 1SYIA 5M2VA 3S9NC 2H99A 3GBAA 3RNNA 2I48A 4BDRA 4RPNA 5L9MA 1US4A 4KR5A 2XXYA 4WEPA 4DXCA 3FJMA 3PMXA 3C31A 4RPOA 1NNFA 3UA8A 3T96B 3SEUA 3KGCA 1MG1A 3FVNA 1EZPA 2BJJX 3KFMA 1OQGA 2ZNTA 1SI1A 3Q29A 4QFOA 4RA1A 4GF8A 3RPWA 3V89B 1MS7A 2PBWA 1SW2A 4F3SA 1B2HA 1WVJA 4OWDA 2Y7PA 2I3VA 2OCUA 4LONB 4NF6A 4OXVA 4JBZA 5F1QA 1URSA 1MPBA 3O97A 1FW0A 2DS9A 1N7XA 5KCJB 1LCTA 4P0IA 4RJZA 3DP4A 4BDOA 3USDA 4FATA 5KCJA 2B3BA 4OMBA 2HQ0A 5L9SA 3EPEA 3KSXA 3TZAA 5CI5A 1B6HA 1RKMA 1H3DA 3MP6A 1VFDA 3V5AA 2W7YA 5HBCA 5IAIA 4R9GA 4POXA 2ZYKA 1B3FA 1PB8A 1MM6A 2XXVA 3GXAA 3TQLA 3IB0A 4KYEA 4JSOA 4F3PA 1OLCA 4RK2A 5H8QB 3VFJA 3N6UA 1Y4CA 3UORA 2OK2A 1N3XA 3H6TA 5K2XA 2I58A 3G3GA 2ANJA 1B40A 1MY0A 2Y7KA 4NEDA 5H8QA 4GIZA 3MVYA 5CMMA 1D9YA 4G2ZA 1AH5A 1B7HA 2Q88A 2V3UA 3E4RA 3OSQA 5AA3A 2Y84A 3G7WA 4GXSB 2E1SA 4YKJA 1FTKA 5HM4B 1M5FA 2PYYA 4XKQA 4F3GA 1MQIA 1FQCA 2IA4A 5I58B 1I6AA 3LSXA 2UVHA 2GHBA 1A40A 2Q9TA 3W15C 3U94A 3C35A 2XX9A 5TP9B 1N7WA 4KD5A 2ZYOA 1B7ZA 2GH9A 5I58A 3ILTB 2NWJA 4AQ4A 5JTYA 3E3KA 5TP9A 1B7UA 1H45A 1B4ZA 2F35A 2WKYA 3K1NA 3ZKLA 1H43A 2RCAA 3O28A 3KN3A 1ELJA 5TU0A 1II5A 1S50A 2RKMA 1FTOA 1USYE 1DOTA 3HHFA 4QSCA 5CMCA 3MUQA 1Y9UA 1A8EA 3IL1B 1Y1ZA 5AA4A 4GOTA 1B0HA 1TWYA 3H6UA 1JETA 1P1WA 3FXQA 4YMBA 1FQBA 4O3AA 3U72A 4KI0E 4ELPA 1DTGA 2RC9A 1SYHA 4IO7A 3ZSFA 4DXBA 2HZLA 2G93A 3K1MA 4JDFA 3B6QA 3PUZE 1PC3A 4X9TA 5EHMA 4OEVA 4YU0A 3MZBA 5FHMA 3PMVA 1FTJA 4QSEA 2G29A 2XXIA 1MY2A 3FV2A 3MPKA 2QS2A 1M5DA 4U1OA 3R26A 2UVJA 2UXAA 3I5OA 1A54A 3R7XA 2V93A 1TFDA 3MAMA 1B51A 2I3WA 3LSWA 3GZGA 4ELOA 1NMUA 1B1HA 3N6TA 1TT1A 3IK6B 3U1OA 3KN8A 4U21A 3DELB 2X7PA 3EHTA 4YKPA 1TXFA 3OO6A 4ND9A 4Z7EA 1SBPA 1NNTA 1HSLA 4GXAA 4OVJA 5H8NB 1YPNA 4F22A 4IO6A 3LSFB 4HCYA 2B3FA 1A55A 1MH4A 5H8NA 2F8DA 4ZEFA 3DP8A 5B7DA 3K01A 4G8HA 2OJTA 1US5A 4U2RA 1IXHA 1PBQA 1POTA 5CRYA 2Y7IA 4NWCA 2DSFA 1GR2A 4JSDA 1O64A 5FTIA 4KYSA 3PUXE 1B52A 4KCCA 1IXGA 2QMXA 4DIGA 3WAFA 3D4GA 2HEUA 4G68C 1UTBB 3OO9A 1JEUA 1FQFA 3F11A 4ZECA 1MXZA 2QSXA 1ZIUA 4LZ7A 4F39A 1UTBA 3TTNA 1M5BA 4JWOA 4KFQA 2RINA 3MJNA 3K1PA 3IO4A 4RNSA 2O51A 3N26A 2HXWA 4LQ2A 1N0TA 3CR9A 2I6EA 2H98A 4QRZA 3T9UA 4PFUA 1MRPA 4FJPA 1DTZA 1TFAA 3PPNA 2P2AA 5DVFA 4F2OA 1XT8A 4YB7A 3KG2A 2QL3A 1XC1A 1ZMGA 3PPRA 4ZZEA 5CMKA 3KEIA 3PV0E 4F31B 3MWBA 1UIUA 1MDQA 2THIA 3HSTA 4ZDMA 4MF3A 4LA9A 3H6VA 2D5WA 4GFRA 1FCKA 2XXQA 3CVGA 4ELRA 2Q2AA 3TCGA 3TCHA 2XHDA 4ECFA 1S9TA 4YAHX 3BBRA 2HCAA 3G3IA 4F1YA 2VGQA 3TAJA 2XD2A 3K4UA 4OZ9A 4E0WA 3RLFE 3DP6A 5AA2B 5CBSA 3VVEA 1T0KA 2XX7A 4KYDA 3DLNA 2Y7RA 3PD9A 2VD3A 3ZS6A 5AA2A 2RCBA 2V3QA 1B5IA 4M1VA 3LC8A 3OOAA 4XKRA 4YICA 1ZTYA 4HS7A 2REGA 4X1DA 3E9XA 3OMBA 5L9OA 4WXJA 3I6VA 4E0XA 2ONKE 1H44A 2F78A 1LAFE 2QS4A 4H5FA 4ZEBA 2H4IA 2QRYA 1D9VA 4C1TA 3TYHA 3ODBA 5I2KB 4H65A 3PD8A 4ZE8A 4IGRA 4XKPA 1B05A 5IKBA 2F7AA 2B65A 1B9JA 2O69A 2HAUA 4AB5A 3K6XA 4C1UA 1SVXB 4FECA 1EZ9A 2ABHA 3KOTA 3TDJA 3MVWA 1B58A 2VD2A 1ZLQA 2VOZA 4GL8A 5BWJA 4DXUA 1QKBA 1OMPA 1LCFA 2ESNA 2GFEA 5ITOA 5EHSA 1RYOA 4R2FA 3CSBA 3JZJA 4RY1A 2R71A 4F18A 4XTCQ 2XXXA 1LGBC 4I1DA 1H76A 1MQDA 2O84X 2XXPA 1AMFA 1NL5A 3OXNA 4M4GA 5DEXB 5ICTA 4G4PA 2R9JA 5FTHA 2X7QA 1JEVA 1UTHB 3BFTA 2AL4A 5DEXA 3UN6A 1UIVA 2UVGA 3LR1A 3QSLA 4EXKA 1UTHA 1QUIA 1I6BA 5I2NB 5I56B 4KHZE 4I8CA 1MY4A 3N5LA 2DWHA 2Q2CA 2XXTA 1MXUA 4NF5B 5KZTA 5JK4A 4OESA 5I2NA 1AL3A 5DVIA 3RQTA 4ZS9A 3SETA 4L17A 3PPPA 3QAXA 1Y3QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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