2I48A

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with carbonic acid
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Bicarbonate transporter
publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
total genus 144
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A01
4NF4B 4KI0E 2Z23A 4PETA 2O51A 5AA4A 4U2RA 3H6UA 3PPPA 1EZ9A 3Q27A 4LZ5A 2DVZA 1MDP1 3K0VA 3VXBA 5I84A 4WKMA 2GHAA 3SEXA 3Q29A 2V3QA 3SEWA 2O6AA 4G8NA 2F6GA 3MUQA 2I6EA 3UA8A 1PC3A 4DCYA 5AA1A 3RPWA 3E9XA 2PX1A 2F8DA 4FECA 1M5DA 3TFLA 4OERA 4F19A 4EF2A 3D4CA 2Q8JA 3H6VA 3I5OA 3G3FA 4F1YA 4THIA 3R6UA 4GL0A 2AL5A 3USDA 1D9VA 1MH4A 4YKPA 3ZSFA 3CR9A 1I6QA 1MQHA 3W9VA 1N3WA 5I2KA 3U92A 4KD5A 3FJMA 3UN6A 3FV1A 4IGTA 1IQ7A 2GH9A 3QSLA 1A7LA 3F11A 3P7IA 2QRYA 1FQFA 3VLVA 2XD3A 4UACA 4OTEA 3IR1A 3O28A 4LP2B 3IOUA 3TTRA 1M5CA 2PVUA 2H25A 3IAZA 4OQOA 4DXCA 1B0LA 5TPAA 4N6PA 4R9FA 5CBRA 2F34A 4OMBA 1Q1KA 4IO2A 3WAEA 1LBCA 4AQ4A 1Y3NA 1MPCA 4LUBA 1MM7A 3S9LC 3BFTA 1B0HA 4X48A 3I6VA 1J1NA 1TFDA 2HAUA 2RINA 4ZE8A 3TQLA 4OFLA 3S9MC 4PFYA 1LAXA 4ZE9A 1IXHA 2VGQA 4F31B 2YJPA 5BUUA 4GFRA 3FXQA 1MXYA 2I3VA 2Z22A 1UTBA 3S4UA 2OWSA 2NWJA 4PP0A 2I4BA 3QYTA 4QFPA 2HCAA 3RY3A 3KG2A 1L5TA 1B4HA 3N6UA 3FJGA 4RPNA 1IUDA 2DE2A 3IL1B 4LA9A 3IK6B 3FVGA 4DZ1A 5IKBA 1DTZA 3MVWA 3GBAA 2UVJA 2RC7A 3MJNA 3G3KA 5CM6A 3IOTA 3H7MA 4FJPA 3C9HA 3L6GA 2ZYNA 2QMWA 5AE4A 1SI0A 4ELRA 1B5JA 3PMVA 3DLNA 1N76A 3TCHA 4FEDA 5L9MA 3PD8A 4ND9A 3HSTA 4GXAA 1B1HA 3S9NC 3EHSA 4QSEA 2VHAA 3LR1A 2B65A 1MXWA 3T9XB 2ZYKA 1JW4A 2D5WA 4OYVA 1Y20A 3HO7A 4OXVA 4EQ7A 1FTJA 1B52A 4UA8A 3C35A 2H98A 2ZMBA 1PDAA 1OLCA 3O97A 1LCTA 3MQ9A 3H6TA 1POTA 5ELVA 3U93A 3OO8A 3TDJA 2FNCA 1O7TA 4KQPA 2RCBA 2OWTA 4P0IA 5ICTA 3H03A 3KGCA 1SW1A 4DXUA 1JVYA 2Y7IA 3O66A 1JW1A 4G8HA 5CMKA 5AA2B 3OEKA 3IOVA 4NF6A 2ZXTA 3B6TA 4LZ8A 1NNPA 3G3HA 1NKXA 1HSJA 3ONMA 1WODA 3IO6A 3H3GA 1F9BA 4BDQA 2BJJX 5BWJA 3VV5A 4G4PA 1EH3A 1VE4A 3TELA 3N94A 3PPNA 4BDLA 3JV9A 2FA7A 1UQWA 3B7DA 1MY0A 1QUJA 1B4ZA 5I2KB 4QFOA 3TZAA 1B7HA 3K6UA 2P1SA 4EUOA 2GFEA 3CG3A 4YKIA 1M5BA 3HHFA 4MLVA 4IY5A 1LGBC 5JTYA 1UIVA 4RY1A 5TP9A 4IO3A 3DELB 2B3FA 2P2AA 1P99A 1R9QA 1B3EA 3C32A 3O9PA 3CVGA 1IZ1A 3SESA 4EF1A 5FHMA 1CB6A 1JEUA 1P1QA 3QK6A 4NF8A 4OWDA 1VR5A 2F5XA 3S9EA 3T93B 3LSWA 1B3LA 3ZKKA 2O7UA 5I59A 2QS4A 4KCCA 4R2FA 2VD3A 4Z0IA 4C1UA 2H4IA 1N0TA 5A5XA 1VSOA 2Q89A 3JZJA 1POY1 3GZGA 3E4RA 4KYSA 3DP6A 4KHZE 4F29A 1D9YA 3IOWA 4FATA 1UTBB 1DSNA 1FW0A 2O1MA 1LAHE 4QHQA 4K3FA 1UTHB 4U21A 4GXSB 3MZ9A 4OVJA 5CRYA 1NL5A 3S2VA 3ODBA 3SETA 3H06B 4HW8A 2OJTA 2F97A 4EXLA 2OLBA 3E3KA 3FD3A 3KN7A 5CMMA 3FXRA 3BKIB 3M3FA 1PB7A 2THIA 2CMOA 2RCAA 4TQUQ 3L6HA 1QULA 4NF5A 4O3BA 1XT8A 2Q9TA 4ISUA 3T9UA 3QAXA 4QRZA 5TU0A 4OEUA 1LFIA 1FTLA 2DE4A 3TCFA 4G68A 4MFIA 3QXMA 4LZ7A 2XXIA 3HN0A 1IXGA 2XXVA 2XHDA 4AB6A 1A8FA 4NWDA 4H8IA 4ELQA 5ITPA 1DPEA 2OK2A 3U72A 3V8XB 3VLWA 3H6WA 1LBBA 5CBSA 5KDTA 4O3AA 5CI5A 3LC8A 2G93A 3RTWB 1NNFA 4PFWA 4WEPA 2HEUA 4RNSA 2DSFA 1NH7A 5F7VA 4RA1A 4N07A 3UK4A 4L17A 3K4UA 3KZGA 3FVOA 1S9TA 1HSEA 1JVXA 4F22A 1ZIUA 2DWHA 3OOAA 2PT1A 1SI1A 3I3VA 5I57A 4KYEA 4U22A 1TT1A 1DMBA 2UXAA 1TWYA 4RK9A 3EQ1A 3U8QA 2UVHA 3O2AA 3T66A 2QS2A 5FHNA 3EHUA 3RTFB 3G7WA 1MY1A 2F7AA 1LSTA 2DE3A 2HZKA 1BKAA 1NH8A 1JEVA 2LAOA 3RT8A 3PUYE 3O6GA 4NWCA 2O69A 2ZYMA 4R6YA 3Q25A 3TUSA 5KZTA 3E13X 4ZEKA 1QKBA 1N7WA 3TEPA 1MXXA 1BP5A 2VOZA 4F3SA 3ILTB 1FCKA 1Y4TA 2NXOA 4LATA 2DWAA 3B6WA 3WAFA 5JTYB 1MQGA 4JWYA 5K2XA 5TP9B 2Y7PA 2F6PA 2I48A 3N5LA 1H76A 5L8DA 1H44A 2ZNSA 4NF8B 1USYE 2Z8DA 3TPAA 1QKAA 4TLMB 4F3GA 4DXBA 2G29A 2I0CA 3W15C 1OIBA 3IJXB 1IITA 2HXWA 5KCJA 4OETA 3PUWE 4Z7EA 3ZKLA 4ESWA 1S7YA 1N04A 4ZZAA 4IO5A 1OVBA 1ZLQA 3K01A 1AIVA 1B1XA 3PMXA 1B3FA 3MP1A 3MVYA 3FZVA 4FEBA 3TTMA 4YMAA 3LUYA 3D4GA 1N84A 1I69A 4R6HA 1S50A 2A5TA 4KPTA 1DOTA 3FXUA 1SD3A 1FQDA 1BIYA 4DE8A 2XX8A 2O7IA 1PEBA 3OSRA 3C31A 4OZ9A 5FTIA 4E0XA 3IB0A 3VLUA 4MH5A 3M3KA 1T0KA 3KJTA 1RKMA 3PD9A 1MY4A 1N3XA 3PUXE 2ONSA 4G68B 1PB8A 2KLFA 3CFLA 1MQDA 1MDQA 2FYIA 1YCJA 4F3BA 4WEDA 4JXIA 5DEXB 4U23A 5DVJA 4EQBA 3IO4A 1YPNA 3G3GA 3PPRA 1PBPA 3FGSA 4RJZA 3K1MA 1RYXA 1SVXB 4QFNA 3VFJA 4Q5TA 1ZJLA 3VDFA 2GHBA 2PYYA 4OEVA 4JWOA 1NNTA 3SEUA 2XXPA 3Q26A 4OFOA 4ESXA 1SYIA 3G3IA 4IGRA 5CC2A 1SDXA 1LFHA 3DP4A 3IB1A 2V25A 4MBPA 2I4CA 3GBBA 2REGA 2V3TA 2DS9A 3ECRA 3FIRA 4I9DA 5H8NA 1URDA 5AA4B 2H99A 5F1QA 2ALUA 1A8EA 2ABHA 2X26A 5I57B 5DVIA 1USYH 4ELPA 3IJOB 1NNKA 4R2BA 4JDFA 3PV0E 3HHGA 3RNNA 3CG1A 3VVDA 4RK2A 2V84A 4HCYA 1PB9A 4GVOA 2HFBA 4H8JA 4PFUA 4FAJA 4N13A 3THIA 3BBRA 3PUZE 5DVFA 3OEMA 3QUJA 3RLFE 2RKMA 3KOSA 1FTKA 3MAMA 4ZEIA 3O6IA 1Y3QA 4BDOA 4NF4A 4GLIA 4H65A 1Y1ZA 4OHNA 3MZBA 4GWOA 3U1OA 3KBRA 3MPLA 5H8HA 1A99A 2I0BA 3MVZA 1MPBA 1H3DA 1Y3PA 4JSOA 4YB5A 4NE4A 4R73A 2YLNA 3SERA 3TKDA 3LSLA 1YAEA 2DYXA 3FUZA 4POWA 3OSQA 4JWXA 4RXLA 4DCXA 4EDPA 1Z7NE 3PPOA 1VFEA 1B32A 2P0SA 1Z7ME 3OELA 1OQGA 5KCJB 1LFGA 2DVCA 1GGGA 5TPAB 2DXYA 3MWBA 4IO7A 4H1XA 2QPQA 2OCUA 4EQ9A 3U94A 5L9OA 4GD5A 2UVIA 4TLLB 2HQ0A 1DTGA 3V5AA 2A5TB 3OO6A 4DIGA 1MRPA 3FASA 3UGWA 1SYHA 1SQYA 3T9HB 4WXJA 4OESA 3BFUA 2XXTA 3K1NA 1BLFA 3O29A 1D3KA 4NMYA 4C1TA 1B3GA 2UYFA 5HM4B 4F3PA 1MY2A 2DOJA 1B51A 2AL4A 2NOOA 2W7YA 3K6XA 5IAIA 2O1LA 4C0RA 3O6HA 1MH3A 3SEVA 1XHYA 5I56A 1H43A 5ISUA 4H5GA 4I62A 1P1NA 1R6ZA 1B05A 1MQIA 3M8UA 4JSDA 1B6HA 4XKQA 2XXWA 2E1SA 1LCFA 1ZBMA 2XD2A 3MZ1A 3N26A 1Q35A 3GLBA 5AA3A 3OMBA 2AIXA 1B7ZA 4F18A 1FQCA 1OLAA 3CRBA 4QFKA 4F2QA 2F35A 1FTOA 5B70A 2XX9A 4XKPA 5JEIA 3N6TA 1B7UA 5K2YA 3A3UA 2R71A 3TYHA 2QMXA 1IXCA 4ECFA 1WVJA 4U4SA 4F2OA 4DDDA 3PUVE 5FTHA 1US4A 3OO9A 1B5IA 5M2VA 3FVKA 1GTKA 2PBWA 4H5FA 4IB2A 4IO6A 4R9GA 3ILUB 4Q8RA 3MP8A 3OO7A 2XXUA 2D3IA 1Y9UA 2QS3A 1FQBA 4F1UA 4KYDA 1JQFA 1M5EA 3TCGA 3FJ7A 4GF8A 1WDNA 4BDRA 4O3CA 2YPNA 2ESNA 3TTNA 4NF6B 2XXRA 1OMPA 3DP8A 5HBCA 3C4MA 1XVYA 4X1BA 1IEJA 3TAJA 3MPKA 1GVCA 1B46A 5B7DA 2OZZA 3HCQA 5I58A 3QIMA 1XVXA 4XTCQ 3RGYA 5HPQA 4M4GA 4YB6A 1ATGA 1ZKBA 4HCWA 4I1DA 5H8HB 5H8FA 3IORA 4GL8A 5EHSA 1B2HA 3FATA 2DQVA 4U1OA 2PMSA 5H8QA 1BTJA 3EF7A 4GIZA 4X1DA 1SBPA 4I8CA 1TXFA 1MPDA 2ZNTA 5AA2A 3CI8A 3KSJA 1HSLA 3HPIA 1AL3A 1OQHA 4BDNA 3K6VA 2F78A 2ONRA 1FQAA 5AA2D 4Q0CA 1SW4A 3FV2A 3PGFA 2XXHA 3RT6B 2AYSA 4ZS9A 5JK4A 1P1WA 5CMCA 3EN3A 1Y1MA 3MW0A 4YKKA 4QF9A 1ZU0A 3UIFA 1FTMA 4NTLA 4HTGA 2M8CA 5I59B 4G77A 1AH5A 4KFQA 4ONYA 1AMFA 3FVNA 5A5XB 1URSA 3VXCA 4R72A 4XXUA 2Q2CA 2DWIA 2Q2AA 2F7BA 3IB2A 1TFAA 2F36A 2CZLA 4G8MA 4RYAA 4U1ZA 1IIWA 1MG1A 2DXRA 3OXNA 3PPQA 3SDFA 3R7XA 2V93A 1GR2A 4PFTA 4YU0A 1EU8A 1JETA 5I56B 3R26A 2O84X 3QUFA 4NF5B 2VD2A 1CE2A 3SKPA 1B9JA 3VVFA 4F39A 3MP6A 3V83A 2I58A 4ZDMA 1Y4CA 3CSGA 4P0GA 5H8SA 5I2NA 1NMUA 1UTHA 2ONKE 3TTLA 1A40A 3VE1B 4R75A 1MQJA 3TQWA 3K02A 5L9SA 4G68C 4KR5A 4G2ZA 1EZPA 4XKRA 3G3JA 1YTVA 3TMGA 4YZZA 3V89B 2B3BA 3Q28A 4YMBA 3DM0A 4FE8A 5KDTB 4ELOA 1IXIA 3K6WA 4GOTA 2I3WA 2XXYA 4ZEFA 1QUIA 2PT2A 3LSXA 1B40A 4LQ2A 1QJMA 3MBPA 3C34A 1ANFA 4AB5A 4NEDA 3K00A 5CMBA 2E0SA 3A3CA 4U4XA 3KN3A 4YKJA 3T96B 1ELJA 1SW2A 1MXUA 1ZTYA 3TTKA 3CSBA 3VVEA 1N7XA 2R6GE 1US5A 5I58B 2ZNUA 5ITOA 4QSCA 4FIMA 2H9BA 5DTBA 4KCDA 5H8FB 4PQJA 2ZYOA 1LAFE 3LBSA 3RUMA 1MXVA 4P11A 4YAHX 1JNFA 1URGA 4R74A 3KEIA 5H8QB 4DLDA 3ZS6A 2Y7RA 3K2DA 5EHMA 1QW0A 2XXQA 1ZMGA 1A54A 1MY3A 1XOCA 1I6BA 1MS7A 1DPPA 3JYRA 3KOTA 4ZEBA 1MM6A 3T9VA 3TODA 1QVSA 2IA4A 2QSXA 4R6KA 4FORA 3RQTA 4BLAA 2RC8A 1O64A 5FHOA 1LAGE 1R9LA 4ZECA 3MVXA 4LONB 2R9JA 2HAVA 4X9TA 2F7CA 4H6DA 3RN8A 4ZEDA 4LVQA 1P1UA 3LSFB 2RF1A 2WKYA 4M1VA 2DWJA 4PE5B 2QS1A 5DYHA 1NFTA 3CFXA 2I49A 1QUKA 5DT6A 4JBZA 4IO4A 2HZLA 4XIGQ 3CIJA 1B58A 4Q30B 3W9WA 4GQOA 2Z8EA 2NVUB 2Y84A 1I6AA 4ZZEA 2D21A 4RPOA 4YICA 1O63A 3EHTA 3OD7A 4LQ5A 3AXFA 1MXZA 2OBGA 3EPEA 1LB9A 3M3LA 4GRKA 2X7PA 4OENA 2IEEA 3B6QA 4E0WA 5I2NB 2ANJA 1H45A 3C33A 4EXKA 3KJ7A 1P1OA 1PBQA 2UVGA 5LOMA 1OVTA 2GRVA 3MC2A 4YB7A 2REJA 3KFMA 1LB8A 2O68A 4QSDA 3HV1A 3IX1A 4POXA 1JW5A 3KN8A 2H5YA 4OFJA 4H0WA 3UP9A 1EZOA 3GXAA 2Y7WA 3A09A 2NUVA 3CFZA 1D4NA 4TOZA 4XKNA 4IY6A 2VP1A 3UORA 2X7QA 1B3HA 5ICQA 5J1DA 1FQEA 5DEXA 1R1NA 2Z8FA 5EYFA 2XXXA 4F1VA 1RYOA 5H8NB 1XC1A 2UYEA 3H4ZA 3OENA 4JB7A 1KWHA 2Y7KA 4MLQA 2QJEA 2XX7A 3T22A 2A5SA 3PMWA 2RC9A 1M5FA 1LLSA 1GV8A 1VFDA 3K1PA 1UIUA 4QFLA 3C36A 2Q88A 1AOVA 2V3UA 3PU5A 1B5HA 2QL3A 1II5A 1A55A 4BDMA 3SEYA 2DP8A 1SW5A 3KSXA 4HS7A 1XS5A 4H67A 4MF3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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