2I48A

Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. pcc 6803 in complex with carbonic acid
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
MMPETANIKLGYIPIVEAAPLIIAQEKGFFAKYGMTGVEVSKQANWASARDNVTIGSQGGGIDGGQWQMPMPHLITEGIITNGNKVPMYVLAQLITQGNGIAVAPMHEGKGVNLDITKAADYIKGFNKTNGRKFKAAHTFPNVNQDFWIRYWFAAGGVDPDTDIDLLAVPPAETVQGMRNGTMDAFSTGDPWPYRIVTENIGYMAGLTAQIWPYHPEEYLAIRADWVDKNPKATKALLKGIMEAQQWIDDPKNRPEVVQIVSGRNYFNVPTTILESPFKGQYTMGDGQPAIDDFQKGPLYWKDGIGNVSYPYKSHDLWFLTESIRWGFHKNAIPDLDTAQKIIDKVNREDLWREAATEAGFTADIPSSTSRGVETFFDGITFDPANPSAYLQSLAIKKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of a Cyanobacterial Bicarbonate Transport Protein, CmpA.
pubmed doi rcsb
source organism Synechocystis sp.
molecule tags Transport protein
molecule keywords Bicarbonate transporter
total genus 144
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2i48A01
4F3BA 2F78A 2UVIA 3FGSA 1LB8A 3OEKA 4FE8A 1Z7ME 3BKIB 4PFWA 1S50A 3FVOA 5J1DA 1EZPA 4IO6A 1N84A 3TTKA 2V84A 2NOOA 4F19A 4FJPA 4HW8A 3V83A 4EQ7A 4L17A 4PP0A 2DQVA 1Q35A 3O28A 3U94A 2Y7IA 3S9NC 4RJZA 2I0CA 4BDRA 4GWOA 4F29A 5H8HA 2AYSA 4RPNA 3G3KA 5CBSA 1ELJA 1RKMA 4LONB 5IKBA 4YKIA 4GIZA 3DM0A 5LOMA 2Q89A 3PU5A 3KFMA 1B9JA 3OO6A 3T96B 1SD3A 2DP8A 3JYRA 1MXYA 3OELA 1L5TA 3TFLA 3TZAA 3T9UA 1SW2A 4RXLA 4GL0A 3H6TA 3M3KA 4XKNA 4F2OA 2FYIA 4U4SA 1I69A 2F8DA 1PDAA 5CI5A 3E3KA 1US4A 3W15C 1IXGA 5I2KA 2RC9A 3FD3A 4OERA 3MZBA 4F1YA 1MQGA 1MXWA 2F5XA 2HEUA 3HO7A 3LUYA 4QSCA 3RUMA 1TWYA 5KDTB 5M2VA 4KHZE 4KCDA 1ZIUA 2F7BA 1P1WA 2QS3A 2YJPA 3CRBA 3H03A 1DPPA 3LC8A 3PMXA 2ONKE 4H6DA 1NNFA 3M8UA 4X1DA 4YB6A 3JV9A 3U92A 2IA4A 2XX7A 3F11A 4I9DA 4ZDMA 1N3WA 1B3HA 1OIBA 3MQ9A 5AE4A 2D5WA 2D3IA 1TFDA 2Z22A 1TT1A 4FEBA 1HSEA 4OEUA 4OXVA 3G3GA 5HBCA 2QS4A 2RKMA 4DDDA 3C34A 3K6VA 3O6HA 4JSDA 4R9GA 4ZZAA 3MJNA 3RT6B 5ICQA 2V3QA 3MP6A 1UQWA 2B65A 2GH9A 2PT2A 3K6UA 1D9VA 5EHMA 1OMPA 4MF3A 1QUIA 4RYAA 3T22A 3UA8A 1B0LA 5I56A 4U21A 2PBWA 1CE2A 5L9SA 3PPPA 2YLNA 3LBSA 1QJMA 3DLNA 2UVGA 3RNNA 5B70A 5TPAB 4G68B 3RN8A 1IZ1A 2Y7KA 4RA1A 4H5GA 4R9FA 1VFDA 1MY1A 3MWBA 4GRKA 1NFTA 2O84X 1AMFA 2OZZA 4I62A 1SDXA 1OQGA 3O6GA 2XHDA 1R1NA 3KN8A 3ZKLA 5I58B 1LSTA 2H4IA 2QMWA 1JVXA 4QSEA 1URGA 3C32A 1JQFA 2XXHA 5I2NB 1EZOA 1FQEA 3C33A 3M3LA 3SKPA 3E9XA 5CMCA 2Y7PA 5H8FB 3OEMA 4BDNA 2RINA 3SEWA 1MDQA 3N5LA 1P1OA 1BP5A 1USYE 3U8QA 3LSXA 1B5IA 3N6TA 1ZU0A 4UACA 3VE1B 4KQPA 1AIVA 1H43A 4OFLA 1D4NA 2GRVA 2HZKA 4ESXA 1Z7NE 3O9PA 2GFEA 1A54A 1R9QA 1JNFA 1YCJA 3K02A 3L6GA 3OXNA 1US5A 2VD3A 2I4CA 1XHYA 3UGWA 3KG2A 2DWJA 1M5FA 4YB5A 1A8EA 4ELRA 4G8HA 3A3CA 1PC3A 4NF4B 1B6HA 4PETA 5CMMA 3IX1A 3TTNA 5A5XA 1YTVA 2DOJA 3IORA 1GTKA 2XXUA 4JXIA 4MH5A 2F97A 3GLBA 1CB6A 3GBAA 3FVKA 2Z8DA 2B3FA 5BWJA 2QRYA 3CSBA 1PBPA 2NUVA 1FQBA 4C0RA 5HM4B 1SW4A 3T9XB 3TKDA 3RPWA 3VVDA 3VVFA 5KDTA 2F6GA 1Y1ZA 4E0XA 2B3BA 3LSFB 4XKQA 2P1SA 3PPRA 3S9MC 1QULA 2PT1A 4KPTA 2ONSA 5AA1A 4YMAA 4NEDA 4F2QA 1IUDA 1P1UA 4PFYA 4ZE8A 2O1MA 4F39A 3B6WA 4LZ8A 2F34A 5KZTA 2I0BA 4DXUA 1LCTA 1SW1A 1MY2A 1Y1MA 3OMBA 5AA4B 1FCKA 2P0SA 3KSXA 3ONMA 4YKJA 2X26A 2AIXA 1OLAA 2XXTA 4OZ9A 3D4CA 1SW5A 3Q29A 4G2ZA 4Z7EA 3KGCA 1LAXA 3A3UA 5FTIA 1MQIA 3PPNA 3SETA 2DWAA 3FJ7A 1P99A 1B3EA 1VE4A 2DVCA 4BDQA 4ECFA 1NH7A 3G3FA 3TODA 2QS2A 4NF6A 2RC7A 3SERA 3K1PA 3KN3A 3VXBA 4N6PA 5L9MA 3FJMA 4ONYA 3TTRA 3V8XB 4WXJA 4H8JA 4NF8B 4FAJA 1B4HA 1BLFA 1Y3PA 3UK4A 3FUZA 3PUVE 4IY5A 5H8SA 1AOVA 5H8NB 1WVJA 1SI0A 4KCCA 1LAHE 2F7AA 4NE4A 1UTBA 3OO9A 2ZYMA 4IO2A 3IB0A 4ZEKA 4EXLA 1B1XA 2Y7WA 1XS5A 2O7IA 4NTLA 3K2DA 4DCYA 3B6QA 1B0HA 1DOTA 1PB9A 2HQ0A 3FVGA 3H7MA 3IO6A 3VLVA 3GZGA 4JDFA 3CFLA 5AA3A 3T9VA 3MPKA 4XKPA 1JEUA 3ZSFA 3MVXA 3MBPA 4OHNA 3CFXA 4KI0E 4XXUA 4QHQA 1QW0A 3EHUA 5ITPA 1D9YA 1NNPA 3R26A 2NVUB 1MY3A 1QKBA 2H9BA 3N26A 2QSXA 2ZNSA 4LQ2A 3KN7A 5CBRA 5CC2A 4JWXA 5AA4A 4H1XA 5B7DA 3PPQA 3MVWA 4XTCQ 4EUOA 4PFUA 2QS1A 4IGTA 2I4BA 3TTMA 1O64A 2HXWA 3MAMA 3FV2A 4N13A 5K2XA 1LFGA 1MQHA 3I5OA 4OEVA 3FZVA 4MLVA 3C31A 2M8CA 3IOUA 3K4UA 3O6IA 2VOZA 1SQYA 1Y3NA 2PYYA 4U22A 4F18A 1AL3A 4Q30B 5DTBA 1P1QA 2ZNTA 3QAXA 3T93B 2I3VA 1II5A 4XIGQ 2BJJX 1BKAA 2REGA 4NF8A 3H6WA 3SEVA 3PPOA 1B4ZA 3DP4A 3UN6A 1N3XA 3SEUA 3TTLA 4G4PA 3TYHA 5H8FA 1ATGA 3H4ZA 1N04A 3FXRA 1FTLA 3W9VA 1F9BA 1UTBB 2I49A 3R7XA 4DLDA 3IJXB 3QXMA 4NF5A 1OQHA 2ESNA 5JEIA 3TCHA 4NWCA 2V25A 1P1NA 1UTHB 1JW1A 2XD3A 1OLCA 3EF7A 3K0VA 3IOTA 5EYFA 4OVJA 4EF2A 1N7WA 3PMWA 1Y20A 1Y4TA 2WKYA 4QFOA 4YZZA 2GHBA 1XVYA 1UIUA 1Y9UA 3PUWE 2THIA 5L8DA 2ZYOA 3ILUB 1FTJA 4FECA 4JB7A 4U1ZA 4NF4A 1JW5A 2DYXA 2ONRA 2DWIA 1LBCA 3IK6B 3OOAA 2O7UA 1SI1A 2VP1A 4G8NA 4GLIA 4C1TA 3QYTA 4AB5A 1Q1KA 4GXAA 2XXQA 1GR2A 1UIVA 1HSLA 4R74A 4Q0CA 2HZLA 3ECRA 4K3FA 1MXXA 3HCQA 3PV0E 5HPQA 1B5HA 2UVHA 4G68A 5CMBA 5FHNA 4OETA 4F22A 5ISUA 3MC2A 3CG1A 2PX1A 4POWA 3TELA 2V3TA 3UP9A 2DE3A 3CVGA 3ZS6A 5IAIA 3TUSA 2V3UA 3PD9A 4NWDA 3GXAA 4WEDA 3IOWA 2G29A 2E0SA 2PVUA 4O3AA 1NL5A 4R75A 1FQCA 3IJOB 1QVSA 4H65A 4LZ7A 1VFEA 4G68C 3WAEA 3KSJA 1SBPA 2ZNUA 3C36A 3OO7A 1MRPA 4NMYA 2CMOA 3K6XA 3N6UA 1A7LA 5DVIA 4HTGA 2DWHA 1MY4A 1IXCA 4ND9A 5FTHA 3WAFA 1XOCA 2H5YA 3LSWA 4PFTA 5FHMA 1XC1A 4YMBA 1JEVA 1N0TA 1RYXA 1ZKBA 4QFPA 5I57A 2DE2A 4IO5A 3EHSA 3QSLA 5DVJA 1T0KA 3TCFA 4U23A 5I84A 2UYFA 3KZGA 4G8MA 4GXSB 2ZYNA 4EQ9A 5I59B 1GV8A 1I6BA 2VD2A 5I2KB 2KLFA 3Q26A 5DVFA 4ZEIA 3TQLA 3VFJA 3MW0A 1B7ZA 1EH3A 2Z8EA 2Q8JA 3B7DA 3EQ1A 1SYHA 2ZYKA 3FIRA 2XXRA 3MP8A 3OSRA 2XX9A 2PMSA 4EDPA 2V93A 3L6HA 1POTA 1B7HA 4DIGA 4F3PA 4FORA 1Y4CA 4ELPA 1A8FA 3HHFA 4F31B 2HCAA 1USYH 1ZJLA 2OBGA 3TEPA 2OJTA 3FATA 4AQ4A 1AH5A 1MXUA 1VR5A 2H25A 3PD8A 4PQJA 2I58A 3TCGA 3DELB 3FV1A 1MM6A 1S9TA 4TLMB 4ZS9A 1DMBA 1FW0A 4E0WA 2XX8A 4U1OA 2DXRA 5K2YA 1B46A 1HSJA 4JWOA 2YPNA 1IITA 2RC8A 3PUYE 1JW4A 3U93A 4FEDA 1M5EA 4BDOA 1RYOA 2NXOA 1LGBC 3S9LC 2FNCA 3Q27A 2UXAA 5TPAA 2XXPA 4F3SA 1IIWA 3FXQA 4OFOA 3H3GA 3VXCA 4Q8RA 1PEBA 4YB7A 2X7QA 3FJGA 3GBBA 4WKMA 4YU0A 3S2VA 2REJA 3KJ7A 4Q5TA 5H8NA 4IO4A 1N7XA 1O7TA 3CR9A 4DCXA 4LVQA 1A55A 2DS9A 2AL4A 3VVEA 4KYEA 2O69A 4IGRA 4MFIA 4POXA 2R71A 1B52A 5DEXB 1MQJA 3D4GA 4H5FA 4F1UA 1B3LA 3G3JA 1LFIA 2XXIA 3UORA 2QJEA 2VHAA 3B6TA 3EPEA 3QK6A 4KFQA 3ODBA 4ZEFA 1ZTYA 3O97A 3VLWA 4I1DA 4O3BA 1QKAA 1YAEA 1H3DA 2O6AA 2Z23A 3RTWB 5I56B 2Y7RA 3IAZA 1B3GA 4R2FA 1MY0A 4RK9A 3G7WA 1EZ9A 2OWSA 3VV5A 3QUFA 3FXUA 3KOSA 3O2AA 2R9JA 4YICA 2OWTA 5ICTA 3IB1A 1NH8A 1MG1A 1LB9A 3PGFA 3CIJA 4M4GA 3O66A 4QF9A 1VSOA 1MH3A 3KJTA 5ELVA 2VGQA 1O63A 2E1SA 2H99A 2O51A 3HPIA 2A5SA 2Z8FA 3IOVA 3FASA 4LATA 3QUJA 3R6UA 1GVCA 4QFLA 3SESA 1ANFA 5AA2A 2XD2A 1B3FA 2QPQA 4R6KA 3CSGA 4HCWA 1MS7A 1LFHA 1R9LA 1DSNA 1D3KA 2HAVA 4P11A 5F7VA 3OENA 1NNKA 3IO4A 3JZJA 1FTMA 1FTOA 1IXIA 3BBRA 4LZ5A 3N94A 4QSDA 3U72A 2F7CA 1LCFA 2I3WA 1DPEA 1H76A 1YPNA 3KOTA 1URSA 2ALUA 3PUXE 4KR5A 4N07A 4RPOA 5DEXA 4ZZEA 3V5AA 1URDA 4GVOA 2QMXA 4U2RA 3H6UA 2AL5A 4R6HA 5TU0A 4ELQA 3K1MA 1S7YA 5DT6A 2RCBA 5JTYA 1IEJA 4LP2B 4OYVA 2HFBA 2RF1A 4GOTA 4PE5B 5I59A 1ZMGA 3KEIA 3SEXA 3SDFA 4BDMA 3MUQA 3C9HA 4YKKA 1OVBA 2OLBA 3VLUA 3E13X 2ZXTA 4H0WA 3QIMA 2D21A 1OVTA 3RY3A 4NF6B 4EXKA 3BFTA 1XT8A 2X7PA 4HS7A 5AA2D 4GD5A 2RCAA 4JBZA 4TOZA 4JWYA 4LA9A 4G77A 4OMBA 3H06B 1JVYA 1R6ZA 5JK4A 1SVXB 1SYIA 4IO7A 3EHTA 1QUJA 4OWDA 1B7UA 4WEPA 4Z0IA 3S4UA 4TLLB 3TMGA 4BLAA 4C1UA 3PMVA 1KWHA 5DYHA 4LQ5A 2I48A 4HCYA 5CMKA 3K01A 4ESWA 3HV1A 3MVYA 2IEEA 1M5BA 4KD5A 1A40A 1BIYA 2Q88A 4ZE9A 4JSOA 1FQAA 1MPBA 1PB7A 4ZEBA 3HHGA 5CRYA 1B2HA 2ANJA 3HN0A 5EHSA 3RT8A 1B5JA 2O68A 3ZKKA 1H45A 4R72A 4EF1A 5CM6A 1B1HA 1MQDA 2DXYA 2H98A 2I6EA 3CFZA 4FIMA 2A5TB 4XKRA 4BDLA 1NMUA 4ZECA 4GFRA 3RLFE 1MPDA 1PB8A 1MM7A 2G93A 4P0GA 4RNSA 2Y84A 2OK2A 2P2AA 2A5TA 3DP6A 4U4XA 2CZLA 3U1OA 3IB2A 4ELOA 4O3CA 4DXCA 3MP1A 1N76A 1M5CA 2XXWA 3T66A 3EN3A 4YKPA 1PBQA 3Q25A 4OENA 3AXFA 1TXFA 4YAHX 2XXXA 3RGYA 3M3FA 1MXZA 4FATA 3K00A 1LAFE 2DE4A 3ILTB 4GQOA 1FQDA 1M5DA 1DTZA 4THIA 5KCJB 5KCJA 1XVXA 3CG3A 4GF8A 3THIA 1I6QA 1DTGA 2Q2CA 4NF5B 4QFNA 5FHOA 4MBPA 2DVZA 3P7IA 4OQOA 3TQWA 3H6VA 5BUUA 1UTHA 3OSQA 2UYEA 2W7YA 3MVZA 5TP9A 5H8QB 3A09A 4ZEDA 5F1QA 4UA8A 4TQUQ 1B05A 4I8CA 1MXVA 4F3GA 4RK2A 3RQTA 3K1NA 3Q28A 1GGGA 1FQFA 3O29A 4IB2A 4ISUA 4P0IA 2FA7A 3CI8A 3IL1B 4DZ1A 1IXHA 1POY1 1ZLQA 5AA2B 4EQBA 3T9HB 3MZ9A 1LLSA 2UVJA 3C35A 3C4MA 2QL3A 1I6AA 3I6VA 2XXVA 3RTFB 3MPLA 4DE8A 2ABHA 4QRZA 3MZ1A 4KYDA 3G3IA 2GHAA 3V89B 1B51A 1Y3QA 4OFJA 4OTEA 3K6WA 4QFKA 4X9TA 3USDA 1LAGE 4DXBA 1B58A 1ZBMA 3E4RA 4IO3A 5I58A 2Q2AA 5TP9B 3LR1A 2NWJA 1QUKA 4R73A 4H8IA 1JETA 2DSFA 2O1LA 3FVNA 1MDP1 1NKXA 4IY6A 3OO8A 4R2BA 1B32A 3G3HA 5JTYB 5I2NA 3S9EA 1J1NA 4MLQA 1IQ7A 5ITOA 1FTKA 2Q9TA 3LSLA 1BTJA 4X48A 3UIFA 5L9OA 4RY1A 2ZMBA 4X1BA 5H8HB 3PUZE 4R6YA 3VDFA 3TAJA 2F35A 3I3VA 2F36A 4GL8A 4LUBA 1MPCA 1EU8A 1WODA 5H8QA 3TDJA 2R6GE 3BFUA 2F6PA 1WDNA 3DP8A 4OESA 3W9WA 4F1VA 2HAUA 3KBRA 2OCUA 4H67A 4M1VA 3OD7A 5A5XB 1NNTA 5I57B 3SEYA 1TFAA 2XXYA 1H44A 4KYSA 3HSTA 2LAOA 1MH4A 1A99A 1LBBA 3IR1A 4AB6A 1B40A 3TPAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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