1H45A

R210g n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
RRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLDWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIGESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h45A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h45A02
1LFHA 5I84A 4I8CA 3C31A 1UIUA 1L5TA 4QFKA 4F22A 4ZEIA 1VSOA 2VGQA 3FASA 4IO7A 2ZYMA 3IO4A 2VHAA 4U1ZA 3MZ1A 1B05A 2QS3A 2RC7A 3HN0A 3M8UA 3UGWA 1JW5A 4TOZA 3WAEA 2CZLA 1Y9UA 4F2QA 3LSXA 4Q30B 2QRYA 5FHMA 1SD3A 3MVXA 1IIWA 2QMXA 3FV1A 1QW0A 3M3LA 1JQFA 3U72A 1P99A 3MQ9A 3SEXA 1MY1A 3KOTA 2I0CA 1B4ZA 4KHZE 1O64A 4ZEKA 3QK6A 3CIJA 1R1NA 2AL4A 3AXFA 2O7UA 5I59A 1LFGA 4KYDA 1JW1A 4U2RA 1SDXA 2ESNA 1Y4CA 3VLUA 3KSXA 5DVIA 2PT1A 2QJEA 3O29A 1PB8A 4RNSA 1MDQA 1MY3A 3V89B 4KPTA 1S9TA 5ITOA 2DVCA 3KJTA 5A5XB 3VLVA 4KYSA 1TXFA 1B6HA 3C4MA 2F7CA 3H6TA 5HPQA 4H6DA 4KI0E 3N5LA 3TTLA 3T93B 3PV0E 4HS7A 3TFLA 1B1HA 4U1OA 4PFYA 3O66A 3KEIA 4OQOA 3RT8A 4RY1A 2I4CA 3R7XA 3QYTA 2O68A 1YPNA 4PP0A 1Y3QA 2DSFA 2HAUA 4HCWA 1N7XA 3PMVA 4DXCA 2RC8A 3H6VA 2V3UA 3TYHA 3PPNA 3OO8A 3TQLA 1B1XA 1R6ZA 1SYIA 1JVYA 1DMBA 2FNCA 4TLMB 1XC1A 3EQ1A 3CFLA 4FJPA 4LQ2A 4WXJA 3S9NC 1EU8A 2ABHA 4BLAA 2KLFA 1MG1A 3OOAA 1IQ7A 4WEDA 3WAFA 3U92A 1BIYA 3LSLA 4EF2A 4THIA 4MLVA 5KDTB 4GXSB 5M2VA 3V83A 1B0LA 4IY6A 2R9JA 4G8NA 4MF3A 3V5AA 2IA4A 3H03A 4AB5A 5I58A 4NWDA 1SW4A 4KCDA 3SEYA 4OXVA 3VVDA 1B32A 3CRBA 5H8HB 4OTEA 1MXUA 2NXOA 4ZDMA 2I0BA 3R26A 3KN8A 3T66A 4POWA 3N6UA 3KJ7A 4F3GA 2F6PA 4BDQA 4ELPA 3K00A 5CBRA 1I6BA 5I2KA 1MPCA 4NTLA 2Z8FA 2ZYKA 3JV9A 4ZEDA 3HHFA 2ONSA 2BJJX 5DTBA 4YKKA 3BKIB 3O6GA 5FHNA 3T9VA 1O63A 5AA4A 4H5FA 4PQJA 1NFTA 4BDNA 1IXCA 1M5FA 1OQHA 3PMWA 4QF9A 3MWBA 4EXLA 1NL5A 1MY4A 3IX1A 1HSJA 3G3HA 4R2FA 3K1PA 3TQWA 1IXHA 3PGFA 4NF5B 4BDOA 1MXXA 2XXRA 3UA8A 4KR5A 1YTVA 1R9LA 4EF1A 3PMXA 2NUVA 2O7IA 1FQBA 4EQBA 4R6KA 5I56A 4KQPA 2OLBA 5DVJA 1PBQA 1MM7A 3IB1A 3PUXE 1P1QA 4H65A 4FAJA 3C36A 4XXUA 3U1OA 1DSNA 1FW0A 3ZSFA 2H5YA 2NVUB 1D4NA 5AA3A 4G68B 3MAMA 5L8DA 1EZOA 1TT1A 1URSA 4PE5B 3GXAA 3H3GA 5CMCA 4FEDA 4EDPA 4F31B 1VFEA 4FECA 5DVFA 1MM6A 4YMAA 4YAHX 1D9VA 2DVZA 1URGA 2A5TB 1PBPA 4DCYA 3PPQA 1SYHA 2OJTA 1OLCA 2HZKA 3RGYA 2M8CA 4BDMA 1A8FA 4Z0IA 1A7LA 3ZKLA 1UQWA 3LUYA 3MJNA 3TTKA 5FHOA 4R2BA 2DXRA 4E0XA 2PVUA 1IXGA 1RYOA 5CMKA 3OSQA 1B58A 4IB2A 4PFWA 3VLWA 2ZYNA 3IR1A 4U4XA 3C33A 3C35A 3FXUA 3O28A 2ONRA 3ONMA 4R9FA 5DYHA 5TU0A 1D9YA 1SW1A 1N3WA 4RA1A 4G8HA 1TFDA 1IZ1A 1FTKA 5ICQA 2I6EA 2O1LA 4NWCA 2Z8DA 2WKYA 1B46A 1BLFA 2PMSA 2HXWA 4G8MA 4IO6A 3I5OA 1NNKA 3TCHA 4NF6B 3USDA 1LFIA 4F19A 1LLSA 4P11A 2X26A 4JWOA 4GL8A 2QSXA 4R9GA 5EHSA 3UN6A 4ZE9A 1B51A 1EZPA 1FQEA 1LAGE 2OK2A 4H1XA 3LBSA 2R71A 4M4GA 3RN8A 1B3HA 2F5XA 1H3DA 2D21A 1B0HA 3DP8A 1H43A 1LBBA 3MP8A 1DPPA 5CRYA 1PC3A 1SQYA 1ZJLA 2G93A 5A5XA 4DZ1A 2QS1A 2DE4A 5KCJB 3G3FA 5FTHA 4C0RA 1XVYA 5HBCA 3G3IA 4OFJA 3IK6B 4ZEFA 3EHUA 2XHDA 1OVBA 1ZBMA 4BDLA 4F3SA 1I69A 3RNNA 4AB6A 1URDA 4F1YA 3MVWA 3SESA 1SI0A 4HW8A 3QSLA 3CG1A 3L6GA 4FIMA 1Y4TA 3TTMA 1MS7A 1B5HA 4DXUA 3G3JA 3LR1A 1M5CA 3ODBA 2X7QA 2UYFA 3LSFB 4L17A 3E9XA 4O3AA 1FTLA 5AA2D 5L9MA 5K2XA 5J1DA 2RF1A 3DP4A 1JETA 1H76A 3G3KA 5BWJA 1AMFA 4H0WA 5B70A 2Q2CA 1NNTA 3E4RA 2HCAA 2F35A 4C1UA 4WEPA 3R6UA 3DP6A 5F7VA 1GVCA 5DT6A 3U93A 5KDTA 3G7WA 4LUBA 1LB9A 4OMBA 1GTKA 3MPLA 1MPBA 1RKMA 1CB6A 1MXWA 5H8SA 3T22A 1UIVA 1ANFA 3CVGA 1SW5A 4IO3A 4U23A 3T96B 3CG3A 2A5SA 2V3QA 5H8HA 4YMBA 2XX7A 1HSLA 3SEUA 3PD9A 1B9JA 3MBPA 2QPQA 3MPKA 2QL3A 1WDNA 3N6TA 1ZTYA 3RY3A 4QRZA 4RXLA 5I57B 4ISUA 4P0GA 4XKPA 4LATA 2O1MA 3O6HA 3FATA 2DYXA 3PUYE 1ZLQA 2GRVA 3C34A 3QXMA 5K2YA 4F39A 4ZEBA 3EPEA 1A99A 3K6WA 4ESWA 3H4ZA 4FORA 4DIGA 4GIZA 1WODA 1NH8A 4M1VA 3TELA 4G2ZA 1JW4A 3PUWE 1SBPA 1ATGA 3TZAA 4MLQA 1B40A 3UK4A 4LVQA 4QFOA 4IO4A 1NMUA 2V25A 3MUQA 2H25A 2HQ0A 3FV2A 4N13A 2Z22A 3KZGA 2DQVA 4ZS9A 3A09A 3RUMA 2ONKE 3FZVA 4NF5A 1B3EA 2OZZA 4LZ7A 1MPDA 4O3CA 4OEUA 3IB2A 3GBBA 4G68C 3W9VA 4IGTA 3THIA 1P1NA 1UTHB 3S9MC 3VXBA 3FVKA 3ILUB 1A40A 4OYVA 3IORA 1MXVA 4G68A 3O9PA 1QUKA 1M5EA 1Y20A 3T9XB 1MQIA 4Q0CA 3DM0A 4MFIA 1DTZA 1POY1 5KZTA 3OMBA 3OENA 3BFUA 1VR5A 3VE1B 3Q26A 1IXIA 2A5TA 3TTRA 4ND9A 4F2OA 2AYSA 3TPAA 3PUZE 4GL0A 3PPRA 2ZYOA 1MQHA 1Y3PA 2GHAA 3T9UA 4U22A 2THIA 3W9WA 2QS2A 1B3FA 4C1TA 1PEBA 1NH7A 2I58A 2I49A 4DXBA 3KFMA 4DCXA 2F34A 4IGRA 5CI5A 4JSDA 4O3BA 1MH3A 2V84A 1RYXA 4R6HA 4NF8B 3UP9A 2F6GA 1N3XA 2ZNUA 2REJA 2NWJA 4RYAA 3GLBA 1R9QA 3FD3A 3N94A 4I1DA 1FQFA 3UIFA 4XKRA 2REGA 3C32A 1T0KA 5L9OA 4KYEA 4OETA 5AA2B 2V3TA 3O6IA 3O97A 2UVHA 4X48A 1Q1KA 4ELQA 4NF6A 1N0TA 3ILTB 4EQ7A 2ANJA 3RLFE 4PETA 4X9TA 2O84X 1N04A 4R75A 3RPWA 1JNFA 2FA7A 5H8NB 1LCTA 4UACA 2XD2A 3MVYA 4YB5A 4X1BA 4QFPA 1QKAA 4R72A 3UORA 4JSOA 3KGCA 3ZKKA 1H44A 3TCFA 4BDRA 5FTIA 1OIBA 1LAHE 3QIMA 1DTGA 1BTJA 4YZZA 1OLAA 5KCJA 1Q35A 4ZZEA 1MH4A 1PB9A 2Y7KA 1PDAA 4F3BA 2QMWA 1VE4A 3GBAA 3OSRA 4LZ8A 4YKPA 1S7YA 2Q2AA 4ELRA 3IOTA 2H98A 4GRKA 3EN3A 2E0SA 2F78A 1LAXA 4QHQA 2HAVA 5CMBA 2D3IA 3HO7A 1N76A 2B65A 5AA1A 2P0SA 2PBWA 1LSTA 3SDFA 4DDDA 3K6VA 2Q89A 1GV8A 4GQOA 3K02A 3EHSA 2GFEA 2Q9TA 3TODA 1ZU0A 2PT2A 3IAZA 2XXQA 3K6UA 2G29A 5JEIA 4KD5A 4OENA 4I62A 2YLNA 4FEBA 4LQ5A 1ELJA 5AE4A 4OFOA 2Y7IA 3DELB 1O7TA 1P1WA 4ESXA 3IOUA 3CR9A 3LC8A 4FE8A 2ALUA 4OESA 4GWOA 3FJMA 2XXVA 1XT8A 2V93A 1Y1MA 4N07A 2ZXTA 2ZNTA 3A3CA 4IO5A 5F1QA 2Y7RA 4RK2A 2YPNA 5IAIA 3EHTA 3D4CA 2O6AA 4JWYA 1QUIA 1IITA 3T9HB 4ELOA 4NEDA 1CE2A 1B3GA 2XXUA 4G77A 2VOZA 3G3GA 3K0VA 3HHGA 1DPEA 1TFAA 2X7PA 4LONB 3K1NA 3ECRA 4UA8A 3A3UA 3RQTA 4H8JA 5L9SA 3I6VA 4YKJA 3B6TA 5I2NB 5I57A 1M5DA 2FYIA 1FTJA 3QAXA 2DE2A 1I6QA 4Q5TA 1NKXA 5B7DA 4E0WA 4XKNA 1B5IA 3C9HA 3TCGA 1SI1A 3IO6A 3K01A 5JK4A 1A55A 1EH3A 1I6AA 1AOVA 3B7DA 3F11A 3PPOA 4R73A 3SKPA 5IKBA 4OEVA 5TP9B 2DWAA 4F3PA 2NOOA 1XVXA 3IJOB 1P1OA 3E13X 3VFJA 1IEJA 3MZBA 1B7ZA 3H6WA 4U4SA 4DLDA 1JVXA 4RJZA 1OQGA 5TPAB 5JTYB 3HV1A 4OHNA 4KCCA 3PU5A 1XS5A 1NNFA 3M3FA 3SEVA 1LB8A 2RKMA 1UTHA 2DXYA 5DEXB 4H5GA 2LAOA 3S9LC 4OZ9A 5H8FB 3MP6A 3K2DA 3VDFA 1B7HA 1ZMGA 3PD8A 3BBRA 2I3WA 3TEPA 1QUJA 3SERA 4R74A 3IL1B 1LAFE 3MW0A 2B3BA 3QUFA 1MY0A 1POTA 3FXRA 4LA9A 4NF8A 1SVXB 3OEKA 1UTBB 3M3KA 3HPIA 1B5JA 4OVJA 1QVSA 2DE3A 3U8QA 1US4A 4YU0A 4MBPA 4EUOA 1NNPA 2XXTA 3FJGA 1II5A 2HZLA 2QS4A 2ZNSA 4RPNA 2PYYA 5AA2A 3RT6B 1ZKBA 2Z8EA 1P1UA 4POXA 5H8QB 3VXCA 1MQGA 5CM6A 3H7MA 4GXAA 1USYE 1B4HA 4Q8RA 3BFTA 4NF4B 4OERA 2F7AA 3TAJA 3S9EA 4HTGA 2DS9A 3RTFB 3VVFA 2IEEA 2DP8A 1XOCA 3PPPA 3MC2A 3OO6A 3CSBA 3H06B 4GF8A 5H8NA 4IO2A 2AL5A 3HSTA 1GR2A 4RK9A 2PX1A 3DLNA 2XD3A 1B3LA 2OWTA 2UVGA 4OWDA 5HM4B 1JEVA 4LZ5A 2CMOA 2P2AA 2Y7WA 3FVNA 1FQCA 5CC2A 3FJ7A 3O2AA 4DE8A 5EHMA 2Y7PA 1M5BA 2DWIA 3ZS6A 1VFDA 2XXWA 3Q27A 1SW2A 3FVOA 1USYH 2OCUA 3JZJA 3K4UA 5CMMA 1HSEA 4JDFA 1IUDA 3V8XB 3IB0A 2XXXA 1OMPA 3FUZA 4QFLA 4XKQA 1J1NA 3S2VA 3VV5A 4YKIA 2DWJA 1AIVA 1BKAA 4YICA 3N26A 4ECFA 3U94A 4F18A 1AH5A 3OXNA 5I59B 4H67A 5BUUA 1FQDA 1QJMA 3CSGA 3KBRA 1A54A 1GGGA 2D5WA 4F1UA 2XXIA 4P0IA 2HEUA 1B7UA 2GH9A 3Q25A 4PFTA 4K3FA 4GVOA 3KG2A 4RPOA 2F97A 3I3VA 4XTCQ 2OWSA 1XHYA 1WVJA 1YCJA 4HCYA 2DWHA 3H6UA 1Z7NE 4JBZA 1US5A 3TKDA 1D3KA 2Z23A 4ONYA 4YB6A 2XXPA 1QULA 1TWYA 1OVTA 3VVEA 5ITPA 3SETA 1H45A 4LP2B 4QSDA 2B3FA 5EYFA 4H8IA 4JB7A 2F8DA 3E3KA 3TTNA 1FQAA 4GFRA 5ELVA 2H4IA 1MY2A 3K6XA 2OBGA 1LBCA 5I2NA 3HCQA 3Q29A 3W15C 3IJXB 2DOJA 1BP5A 3FIRA 2I3VA 3FGSA 2VD3A 3TDJA 1QKBA 2R6GE 1FTOA 2VP1A 2F7BA 2UVIA 4X1DA 3RTWB 3OO9A 1KWHA 4IY5A 3PUVE 2RCAA 3B6QA 3EF7A 5TP9A 3IOWA 1FCKA 1S50A 2O69A 3QUJA 2VD2A 2Q8JA 3K1MA 4OFLA 1DOTA 4XIGQ 1LGBC 4WKMA 3Q28A 4GLIA 3JYRA 5I58B 2I4BA 3CI8A 1PB7A 1B2HA 5TPAA 5JTYA 1JEUA 4ZZAA 4I9DA 2RCBA 4EQ9A 2XX9A 1F9BA 3OD7A 5ISUA 4F1VA 5DEXA 2E1SA 3S4UA 1MRPA 4GD5A 4AQ4A 2UVJA 2GHBA 3D4GA 5H8FA 3MP1A 1N7WA 4FATA 4U21A 4NMYA 1Z7ME 3GZGA 5I2KB 2Q88A 4QSCA 2XX8A 4PFUA 2O51A 2H99A 4F29A 3OEMA 2UYEA 1A8EA 3B6WA 2RC9A 4EXKA 1B52A 5AA4B 3TUSA 1AL3A 3FVGA 3CFXA 2ZMBA 1UTBA 4TQUQ 4G4PA 2RINA 3KN7A 2YJPA 3L6HA 1MXYA 2W7YA 4N6PA 3KOSA 4YB7A 4Z7EA 4QFNA 2P1SA 3P7IA 1MQDA 3SEWA 4JWXA 4JXIA 2XXHA 3FXQA 4KFQA 4R6YA 5LOMA 1Y1ZA 1N84A 2I48A 5I56B 4NE4A 4MH5A 1MXZA 1Y3NA 4TLLB 3LSWA 4QSEA 1YAEA 3MVZA 3OELA 3IOVA 5ICTA 1EZ9A 3CFZA 3KSJA 5H8QA 1FTMA 2F36A 4GOTA 3TMGA 2Y84A 1MDP1 4NF4A 3KN3A 4ZE8A 3OO7A 2UXAA 3MZ9A 1LCFA 2H9BA 2HFBA 2AIXA 4ZECA 1MQJA 1ZIUA 5CBSA 2XXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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