3U8QA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with phenyl-propanolamine at 1.97 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Phenyl-Propanolamine at 1.97 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA02
3OXNA 3K6XA 1Q35A 1B3EA 4P11A 2H9BA 1DSNA 3QAXA 3KEIA 4OFLA 4FEBA 4IO7A 3ILTB 4Q0CA 1O63A 3EQ1A 3Q29A 4I62A 3KZGA 2DSFA 3THIA 1YTVA 3P7IA 4OERA 4OZ9A 2F6GA 1F9BA 4EF2A 1MY3A 1OVBA 4FECA 3PU5A 2ABHA 3UIFA 1H44A 4QSCA 3HSTA 4NF6B 2YPNA 1JVXA 3TFLA 1NNKA 2F34A 3A3CA 3LSLA 4HCWA 4LATA 1Y4TA 2I0BA 4Z0IA 2XX9A 1FQBA 4H6DA 1B3LA 1FTJA 2ZYOA 1LCFA 2O84X 2DE2A 1RYOA 1UIVA 2RCBA 1OLAA 4GD5A 4ND9A 4OMBA 3HHGA 5TU0A 2OBGA 1PB7A 1MY2A 4MFIA 4G68C 4Q8RA 4PFWA 1AL3A 5I57A 5A5XB 3LBSA 3KJ7A 3C31A 4GWOA 1ELJA 4GIZA 2D5WA 3K1MA 1D9VA 4KD5A 1S7YA 3T9HB 1RKMA 2QRYA 5DVJA 3V8XB 2OCUA 5CMKA 4FJPA 1JQFA 3ONMA 2BJJX 4LUBA 2XXTA 1PEBA 3K6WA 5I59A 3MAMA 4ELPA 5ISUA 5H8QA 3MZ1A 3OENA 4GLIA 3PD9A 5L8DA 3S9LC 5AA4B 2I3WA 4JXIA 4BDOA 1N7WA 3L6GA 1ZKBA 4JSDA 3C35A 2ZNUA 3C33A 2VHAA 1XOCA 4IO5A 3LSWA 4I8CA 4EDPA 2Q9TA 1MDP1 1A99A 5KCJA 4U22A 2G93A 2F7BA 1DPEA 1LLSA 5CMMA 1M5DA 2QS1A 3TODA 3TQWA 1I6BA 1N3WA 4TLMB 2UXAA 1B40A 3ZKKA 3G3KA 5H8FB 4QFOA 1NNFA 2Z8DA 3Q28A 4ISUA 3MBPA 2ONRA 1BKAA 3RTFB 3DP8A 3VE1B 1EZ9A 4BDMA 1IXHA 1D3KA 2REJA 5HBCA 1D4NA 4IGTA 1USYH 2X7QA 4N6PA 5H8SA 4F29A 2REGA 3HHFA 4QFNA 2OZZA 3KN8A 5AA3A 3JYRA 3MP8A 4Z7EA 1SI0A 4POWA 4KCDA 4M1VA 3LSFB 1JETA 2ZNTA 4ECFA 3QXMA 4RYAA 3H6TA 3N5LA 5H8HA 1Y3NA 1N84A 2DE4A 3FJ7A 3Q27A 3TCHA 3MJNA 3E4RA 3S4UA 3PMXA 3U8QA 4RJZA 3V83A 1XC1A 1BIYA 5M2VA 1MQJA 1MH4A 3RGYA 2O1MA 3D4GA 1FQDA 3PPOA 3U93A 5FHNA 1POY1 5ITOA 4ESXA 4RNSA 3O29A 4IO4A 1ZMGA 1MM7A 4EXKA 3IB2A 4NF6A 4THIA 1MY4A 3FXUA 3TZAA 3W9VA 4KCCA 2GH9A 1R9QA 2VOZA 4E0WA 1N0TA 4HS7A 4DDDA 2R9JA 3H6WA 4POXA 4NF8A 2H25A 1H43A 3MVXA 4FAJA 4NE4A 1WDNA 1PDAA 1EH3A 4QFKA 2OLBA 4YMBA 3G3HA 3PUZE 3FXQA 5FHOA 1JEVA 2HQ0A 4H8IA 1B0HA 4JSOA 2H98A 3S9NC 4HCYA 1DPPA 1DMBA 2XX7A 2CZLA 2QPQA 4C1TA 4IB2A 3FUZA 2HXWA 4O3AA 4QSDA 2XXRA 2DXRA 4N07A 2F8DA 3OD7A 2RC7A 1M5BA 2WKYA 4XKPA 3RN8A 1DOTA 4H0WA 4G77A 4LQ5A 2OWSA 3IB0A 4X1BA 5ICTA 1B46A 1USYE 1AOVA 3ZKLA 3K00A 4PFTA 4ZE8A 2RC9A 5I2KB 4R6HA 3UORA 4YICA 1JNFA 3FGSA 2PMSA 2XXXA 3UGWA 2PT2A 5CMCA 2W7YA 1SQYA 2FNCA 2X7PA 1Q1KA 1M5FA 4PE5B 1RYXA 1UIUA 1IXCA 3USDA 1TFDA 4G8HA 4G8NA 4R9GA 5H8QB 1UTHB 4R2FA 2I4CA 3EHTA 5F7VA 1PB8A 5CBRA 3H6VA 3O6GA 2GRVA 3KG2A 2B3BA 1SVXB 1TWYA 3VXBA 4GL8A 3OMBA 4H65A 1MQGA 5H8FA 4H1XA 1N76A 3K01A 2YLNA 3E9XA 3RQTA 1O64A 1JW5A 3OEMA 4JWOA 4AB6A 1B1XA 2THIA 2O7UA 2E0SA 1US5A 5DEXA 3OO8A 4G4PA 3FVKA 3FV2A 1NH7A 3R26A 3U72A 1Y1ZA 1MQDA 4PP0A 4R72A 1QW0A 3KSXA 4DXCA 3SEWA 3IJOB 3CFXA 1LB9A 5LOMA 4KFQA 1FQAA 1POTA 4O3BA 4BDQA 3BKIB 3TCGA 2Q2CA 4OEVA 1HSJA 3MP6A 1P1NA 4G8MA 3SEUA 4E0XA 4ONYA 3MVWA 1P1OA 4FATA 2UVHA 1P1WA 5H8HB 4NWDA 3S9MC 2PT1A 2XXUA 1Y9UA 1MXWA 2VP1A 1XHYA 3VVDA 4EQ9A 3T96B 3KBRA 3B6TA 4YKPA 4YKKA 1Z7ME 2ZYNA 1L5TA 2RC8A 3SEYA 2IA4A 4P0IA 3G3IA 4N13A 3QUJA 3TAJA 1OVTA 3DLNA 5I56A 2NXOA 3KSJA 4KR5A 2ONKE 4YKIA 1B51A 2NUVA 4R75A 3C9HA 3KJTA 3U92A 2ANJA 5AA2D 4NF8B 1FTOA 5AA1A 3PUVE 3CR9A 4FORA 1SW4A 2PX1A 3EN3A 3FXRA 2XD2A 3K6UA 3OO9A 5L9SA 1P1QA 5EHMA 4ZE9A 5B70A 3OEKA 5B7DA 1GR2A 4YKJA 3TTKA 4F31B 1GVCA 3H7MA 1MPCA 3K02A 3TTMA 1VR5A 5I2KA 1P99A 2Q8JA 3CG3A 3CVGA 3MP1A 3IB1A 1FTKA 2GHAA 3CFLA 4NF5A 3RPWA 3ODBA 4DCXA 2QS2A 4QSEA 1R1NA 1OQGA 4UACA 3FJMA 2V93A 2D21A 1JEUA 1A8FA 1M5EA 4WXJA 2Q2AA 3TUSA 4IO2A 2P0SA 3PPRA 3MVZA 3QSLA 2NOOA 3B6WA 2UYFA 3H03A 3O97A 1XT8A 4R74A 1SW5A 5JTYB 2I4BA 3RLFE 3TEPA 1UTHA 4FIMA 3DP6A 1PBPA 2XXVA 4X48A 3K0VA 1TT1A 2VGQA 2HFBA 1H3DA 3PPPA 3BBRA 2UYEA 2DYXA 4QFLA 4ELRA 2HZLA 3Q25A 4PFYA 3O9PA 5DTBA 4R73A 3T66A 1URDA 4U1ZA 3R6UA 1MDQA 5EYFA 2AL4A 3IO6A 1S9TA 3IL1B 1EZOA 2B3FA 5JK4A 1A40A 5KDTA 1FW0A 3C36A 2FYIA 4ELOA 3ZS6A 2O51A 1A54A 5DT6A 3PPQA 5CBSA 1B58A 4HTGA 3FZVA 5AA2B 3TKDA 5CRYA 3T9XB 3TYHA 1EU8A 1B7ZA 4G2ZA 1GGGA 4JDFA 3FASA 2O7IA 4GOTA 2DS9A 5TPAB 1JW4A 3PUYE 1I6QA 4TQUQ 3MC2A 1VFEA 1OQHA 1T0KA 2AYSA 5CI5A 1FQCA 1ATGA 2F78A 1DTGA 1Y4CA 4DE8A 3MZBA 4YB7A 2O68A 5DEXB 3EHSA 3MWBA 4DCYA 3FIRA 3M8UA 4H8JA 1UQWA 3QUFA 1B4ZA 3DM0A 5CMBA 3SDFA 1B7HA 4YB6A 3PMWA 4RPNA 1BLFA 2XXIA 2F35A 3TTLA 4XTCQ 4EF1A 4AQ4A 4QF9A 3A3UA 3TDJA 2F7CA 4U21A 4ZEDA 4OETA 2XD3A 1VFDA 3IOWA 3L6HA 5HPQA 2GHBA 1URGA 3OO6A 4XIGQ 4XKQA 1QUKA 3UN6A 1NNPA 2RCAA 4RY1A 2M8CA 3SERA 3CG1A 4C1UA 1B3FA 1HSLA 4MF3A 1FTLA 2ONSA 3FD3A 1ZJLA 3K1NA 1B5HA 1A55A 3T9VA 2V3UA 2DWHA 4XKNA 3EHUA 3LC8A 1B3GA 1MXUA 5FTIA 1N04A 2R71A 2O6AA 4UA8A 2ZXTA 2P2AA 3R7XA 3G3FA 5I56B 2PBWA 3TPAA 1AIVA 1BP5A 1FCKA 2NVUB 3IO4A 1Y3PA 3JV9A 1KWHA 5IKBA 4LZ5A 5I2NA 2Q88A 3IOUA 5K2YA 2QSXA 4IY5A 4DZ1A 1IEJA 3OOAA 1M5CA 4NF4B 1CE2A 1MS7A 1B5JA 3BFTA 2FA7A 4R6YA 3PV0E 1H45A 2RKMA 4KQPA 4I1DA 2V84A 3JZJA 4NF5B 4GRKA 5EHSA 5JTYA 5IAIA 1MQHA 1MXXA 1SBPA 1P1UA 1IQ7A 1MM6A 5L9MA 4NMYA 1JVYA 2ALUA 3N26A 2H4IA 3H6UA 4GXAA 1XVYA 1UTBA 5CM6A 1ANFA 3FVOA 4LQ2A 1MH3A 2Z8FA 4JWYA 4U2RA 2DVZA 2AL5A 1FTMA 3O6HA 4LA9A 5ICQA 1IXGA 3FVGA 4BLAA 2QS3A 3FV1A 3HCQA 5AA2A 4YAHX 3SETA 3MW0A 3VVFA 1CB6A 4PQJA 5K2XA 4ELQA 5TPAA 3GBAA 4O3CA 1ZIUA 2H99A 5KDTB 3IX1A 3RT8A 2Y84A 3CFZA 1B9JA 3QIMA 4F39A 1QVSA 2NWJA 3DELB 1YAEA 2HCAA 3LUYA 3SEXA 1US4A 2Y7WA 1LSTA 1QKBA 1MQIA 3LR1A 3VFJA 3IOTA 4I9DA 1AH5A 5BWJA 4JWXA 2O69A 5TP9B 3IAZA 3OO7A 2KLFA 2Y7RA 3C34A 1S50A 3UA8A 1NFTA 4K3FA 4YB5A 1II5A 3IOVA 2DVCA 4H5GA 2DOJA 2RF1A 3ZSFA 2QMXA 2UVGA 1TFAA 3GLBA 4U1OA 2QJEA 2UVIA 4X9TA 3SKPA 1B32A 1QKAA 3G3JA 4EXLA 5J1DA 3M3FA 3TCFA 4F19A 5HM4B 4MH5A 1LB8A 3MUQA 1MXVA 1ZU0A 3FVNA 1N7XA 5ITPA 5AE4A 3H3GA 1PB9A 2OWTA 4ZZAA 4M4GA 4U4SA 3HO7A 4JBZA 4YU0A 1BTJA 5BUUA 1MY0A 1SDXA 1H76A 3OELA 2X26A 4ZZEA 1IXIA 2DXYA 5CC2A 3OSQA 2ESNA 1YCJA 3Q26A 2A5TB 5FTHA 4AB5A 4KYEA 1LBBA 4F22A 1XVXA 3MPLA 1LCTA 4OFOA 4JB7A 3MQ9A 1NH8A 5DYHA 2Z23A 3VVEA 3QK6A 3UK4A 1NKXA 2Y7KA 2Z22A 4LVQA 3E3KA 3N6TA 2IEEA 1VE4A 4RK2A 2XXYA 4GFRA 4ZS9A 1B3HA 3PPNA 4LZ8A 5H8NB 4NF4A 4R9FA 3S2VA 1SD3A 4OXVA 4IGRA 3MVYA 3PUXE 1B05A 3VV5A 5FHMA 3S9EA 4ZEKA 1B52A 1Y1MA 3K6VA 4U23A 4ZEIA 1MPBA 1VSOA 2D3IA 1OIBA 3KN7A 2B65A 2ZNSA 3B6QA 5I2NB 4L17A 3B7DA 3FATA 4WKMA 4KYSA 2E1SA 2XHDA 4FE8A 4DXUA 2DWJA 1MXZA 4H67A 4TOZA 3WAFA 3A09A 3IJXB 2DP8A 4MLQA 1TXFA 1LFHA 1SW2A 1FQFA 4NTLA 5KZTA 4P0GA 4TLLB 2I6EA 4R2BA 4H5FA 4QFPA 3VLWA 3T9UA 2HAUA 5JEIA 2H5YA 3SESA 1WVJA 2PVUA 1UTBB 2F7AA 3EF7A 1JW1A 3TQLA 4C0RA 4DLDA 1LAFE 2PYYA 1IIWA 2QL3A 3TTRA 2UVJA 3CIJA 3TMGA 3C32A 3WAEA 2I49A 3T93B 4OVJA 1PC3A 2QS4A 3W15C 1A8EA 3U1OA 1LGBC 4PETA 4ZDMA 1QULA 1Z7NE 1AMFA 3K4UA 4ZECA 3HV1A 1NL5A 4FEDA 1LFIA 4XXUA 2F97A 4OWDA 2F6PA 4F3BA 1MPDA 1A7LA 4RA1A 2Y7IA 1D9YA 3KOTA 5TP9A 4OFJA 1I6AA 1QUIA 4F1UA 5I58A 1OLCA 2DWIA 3N94A 1WODA 4G68A 2HAVA 3FJGA 4F3SA 3RUMA 3SEVA 1IITA 3M3KA 1URSA 3T22A 4EQBA 3VLUA 2V25A 2F5XA 1GTKA 3PMVA 2I58A 1QJMA 1FQEA 1NNTA 4GL0A 3F11A 3C4MA 3IK6B 4XKRA 3PGFA 3HPIA 5L9OA 4RXLA 1IZ1A 3OSRA 3G7WA 3O2AA 3VLVA 4LZ7A 3MZ9A 4DXBA 3I3VA 4F2OA 2V3QA 4OESA 3M3LA 2A5TA 1ZBMA 1B2HA 1HSEA 1OMPA 3O6IA 3KN3A 2YJPA 3ECRA 3CRBA 4KHZE 2A5SA 4F2QA 1LAHE 4U4XA 3UP9A 2GFEA 4Q5TA 2VD3A 1LBCA 2OJTA 1SYIA 3GXAA 2F36A 2ZYKA 4BDRA 3I5OA 2I0CA 3IR1A 4QHQA 2I3VA 5H8NA 3VDFA 3BFUA 2RINA 2G29A 1MY1A 2Z8EA 4MLVA 5ELVA 4RK9A 4F1VA 2XX8A 4NWCA 3CSGA 4EQ7A 2O1LA 3W9WA 4WEDA 1MG1A 2QMWA 4IO3A 4GVOA 2XXPA 3KFMA 5A5XA 1XS5A 1B0LA 1SYHA 4YMAA 4ZEFA 4BDLA 1QUJA 3PUWE 3DP4A 3GBBA 3U94A 2HZKA 4HW8A 3KGCA 3E13X 1R9LA 4F3PA 4YZZA 2P1SA 4KYDA 1LFGA 3PD8A 5I57B 4EUOA 1R6ZA 1EZPA 3H06B 2I48A 4QRZA 1GV8A 3TTNA 4LONB 4ESWA 1ZLQA 4OQOA 4DIGA 2Y7PA 4KPTA 4RPOA 5DVFA 4X1DA 1NMUA 2DE3A 4F3GA 5AA4A 3N6UA 3QYTA 1LAGE 3GZGA 5F1QA 5DVIA 3RT6B 3CSBA 1SW1A 1Y3QA 4Q30B 3KOSA 3ILUB 4IY6A 1B7UA 3RY3A 5I59B 3CI8A 3H4ZA 2DWAA 2DQVA 3O28A 4ZEBA 4NEDA 4OYVA 4BDNA 3TELA 3AXFA 2XXQA 3RNNA 4OHNA 4GQOA 2XXHA 3MPKA 2VD2A 3D4CA 1B6HA 1I69A 4GF8A 2CMOA 4WEPA 1B5IA 5KCJB 4OEUA 3K1PA 5I84A 3I6VA 4IO6A 1LAXA 4F18A 1DTZA 3V89B 2ZMBA 1ZTYA 4OTEA 1B4HA 1PBQA 1SI1A 2OK2A 4MBPA 1N3XA 2XXWA 1J1NA 3LSXA 4KI0E 2R6GE 3EPEA 2V3TA 5I58B 3K2DA 1MXYA 2HEUA 4LP2B 4R6KA 4G68B 3G3GA 3IORA 3VXCA 4F1YA 2ZYMA 3O66A 2Q89A 2LAOA 1IUDA 4PFUA 3HN0A 1YPNA 1O7TA 2AIXA 1Y20A 1B1HA 4GXSB 3V5AA 1MRPA 3RTWB 4OENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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