3U8QA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with phenyl-propanolamine at 1.97 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Phenyl-Propanolamine at 1.97 A Resolution
rcsb
total genus 116
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u8qA02
5A5XA 1M5FA 2O7UA 5AA2A 3Q28A 4PQJA 5I58A 3SEXA 5DYHA 2R6GE 2A5SA 2ALUA 4O3AA 3OD7A 5JTYA 5EHSA 2B3BA 1POTA 3AXFA 3BBRA 1RYOA 3V89B 2HEUA 2QRYA 3QUFA 4LATA 4P0GA 3FUZA 5CRYA 2X7QA 2UVGA 3K6WA 3SEUA 3P7IA 4EXKA 3K2DA 3OEMA 4YZZA 2OCUA 1SYHA 3N6UA 3MPKA 1D3KA 4GOTA 3ZKKA 3IR1A 2F7AA 3IAZA 4ISUA 1IXHA 4R74A 3GZGA 2DE2A 5AA4A 3TCHA 3C4MA 5FTIA 4WXJA 3DELB 2NXOA 4MBPA 2Q2CA 1N3XA 2ONKE 2I48A 1Z7ME 2DOJA 4P0IA 2RKMA 5I56A 3A3UA 3O2AA 3K6XA 1UTBA 5CM6A 3FXQA 2XD3A 2XXVA 2O84X 1H76A 4IO3A 1I69A 2I3WA 3I3VA 1ATGA 1MQDA 3N5LA 1DPEA 3W9VA 1EZPA 1BP5A 2F5XA 3DP8A 3PU5A 1F9BA 4RXLA 2E0SA 2A5TA 3IOWA 2Y7KA 1MPBA 4F1VA 3PMXA 1US5A 1B58A 5ICQA 3PUWE 2DVZA 4R6HA 3RNNA 4RY1A 5HM4B 3LR1A 3CIJA 2Q89A 3K1MA 3MW0A 3G3GA 1UTHB 1OMPA 5H8QB 3JZJA 3VVDA 2XXUA 3KN7A 5FHOA 4AQ4A 3T96B 3H6TA 1R1NA 2V93A 4G77A 3GBAA 1JVXA 1H45A 1OVBA 3KGCA 3ODBA 1D9VA 3VLUA 2M8CA 1Q1KA 1B05A 1MXXA 4Q8RA 1H3DA 3V5AA 3UIFA 1FQCA 1MXYA 3MVWA 5TPAB 4BDLA 4DXCA 4DXUA 3FVNA 3ONMA 5CI5A 4X48A 1B3LA 3G3IA 1B5IA 2VOZA 1R6ZA 5DVJA 4KCCA 2Q2AA 1VFDA 3V8XB 4E0XA 4ELQA 4YMBA 3HPIA 2HZKA 4GIZA 1FTOA 1NH7A 4XTCQ 2H4IA 3M8UA 3K4UA 3FD3A 3UGWA 2V25A 5HPQA 2ONSA 3VFJA 1N76A 4PFUA 3IJXB 4GD5A 3B6TA 1IUDA 4QFOA 3OO7A 3BFUA 1MH4A 5CC2A 2B65A 1OQHA 2OJTA 4G8MA 3O6HA 1T0KA 1P1WA 3QSLA 3R7XA 4QSEA 4IGTA 5FHMA 1MY4A 4O3CA 4XKRA 3MJNA 2F6PA 1AIVA 2ANJA 4FJPA 3WAEA 1P1OA 4HS7A 1NNFA 1FTJA 4YKKA 4R2BA 5FHNA 3CG1A 3OSQA 3MZBA 4OFLA 3SETA 4ESXA 3UP9A 4LA9A 3KJTA 4E0WA 1DTGA 3E4RA 1NNKA 2YLNA 4ZEKA 1B7ZA 2ZXTA 1BIYA 1TT1A 2HZLA 3TELA 4AB6A 3USDA 3S4UA 4BDQA 4U1OA 1II5A 4X1DA 1QVSA 3MWBA 3L6HA 4ONYA 1Q35A 1JW5A 4Q5TA 4RK9A 1P1NA 4FECA 2PX1A 4UA8A 3VXCA 4FE8A 3SEWA 2QS3A 4IO5A 1O7TA 4F1YA 5JK4A 1B9JA 5HBCA 5ITOA 4IY6A 2PVUA 4YU0A 4POXA 3JV9A 3FJMA 1XVXA 3PGFA 3G3HA 2CZLA 3CG3A 1MXZA 2HCAA 2H98A 3T9HB 1LSTA 1SI1A 1B1XA 4G4PA 4OMBA 2RC8A 2VGQA 3IORA 2O1LA 4GL8A 3CVGA 1ZLQA 5M2VA 4NF5B 4JBZA 1I6QA 3ILUB 1LCFA 2O69A 5TP9A 5I59A 2OBGA 1XT8A 1QUKA 2Z23A 1O64A 5ELVA 3K00A 1CE2A 2VD2A 5B7DA 5H8HB 2F97A 4EUOA 3LSWA 5CMKA 2XXIA 1PEBA 3I6VA 4YB6A 4ZEFA 4UACA 3MQ9A 5KCJA 2ZYNA 3VVEA 3VE1B 3TAJA 4H65A 1MM6A 3C32A 1HSEA 4OTEA 5I2KB 3O97A 3RGYA 2IEEA 4MF3A 4LUBA 4GWOA 1MXWA 4GXAA 1KWHA 1SW1A 3KOSA 1WVJA 2I0CA 3MZ1A 1MY3A 5AA1A 1H44A 4F3GA 3HHGA 4KI0E 4ZEIA 1MQHA 1DTZA 3FJ7A 4TOZA 1B3HA 4AB5A 4RJZA 4ZE8A 3HO7A 4U1ZA 2ABHA 3KEIA 1SBPA 3UORA 2NOOA 5I58B 2I4BA 3TMGA 3OO9A 2OLBA 3PPRA 1Y3NA 3H3GA 4HCYA 4EDPA 2F34A 3K01A 3EN3A 5JTYB 3FXUA 2F78A 1A99A 4X1BA 2AL5A 3PUZE 3OOAA 2OZZA 3U72A 1B52A 1B2HA 1AL3A 3G3FA 4EQBA 2DE4A 2I4CA 1LB9A 2DP8A 2RC7A 5K2YA 1PBQA 2H9BA 1MXUA 4JB7A 4F19A 1R9QA 1BTJA 3QK6A 4IB2A 3RQTA 1D4NA 5ICTA 2E1SA 2GHBA 3HN0A 2AIXA 3PMVA 2V84A 3EQ1A 2QMWA 4QRZA 2W7YA 3OEKA 2DWIA 5DT6A 1B0HA 1WDNA 5AA4B 1YPNA 3S9EA 3ZS6A 2NVUB 1M5EA 1FTKA 5CBSA 3K0VA 2I0BA 1N3WA 4NF4A 3EHUA 4PETA 3K1NA 5I56B 2NWJA 2REGA 3TFLA 2DSFA 1EU8A 3RT6B 1NMUA 3H6WA 5KDTB 1MQIA 3HSTA 1MPCA 2Y7RA 3C33A 4F31B 1ZMGA 3QIMA 1YAEA 5H8NA 2A5TB 1EH3A 4ELRA 1LAHE 2UYEA 3MVXA 3H4ZA 5DVFA 2HAVA 4XKQA 2I3VA 2Y7WA 4GFRA 3TQWA 4FEBA 3TODA 2P1SA 1GTKA 3MVZA 4X9TA 1FQEA 4KYDA 3PD9A 4POWA 3DP6A 3N26A 1SW4A 3Q29A 2QPQA 3K6VA 3PUXE 2RCBA 3RT8A 2X7PA 4OYVA 2V3UA 1XC1A 1GGGA 3ECRA 5DTBA 5EHMA 3TPAA 3PMWA 1Y9UA 4KCDA 5EYFA 3OO6A 4IY5A 2DWHA 1B5JA 4FIMA 1FQDA 3OO8A 1MG1A 1P1QA 4F1UA 1A7LA 4F3PA 3KSXA 4NWCA 3FJGA 2DXYA 2VHAA 1DSNA 4N13A 4H5GA 3H6VA 4EQ7A 1IITA 3N6TA 1SVXB 3H06B 4TLLB 3TDJA 4H1XA 4YB5A 2XX8A 5LOMA 3FATA 4F18A 3PUYE 3S2VA 2QSXA 3F11A 3ZKLA 3G3KA 3B6WA 4MLVA 2RF1A 3M3KA 5JEIA 4JSOA 3SEYA 4OFJA 4H6DA 4GRKA 2YPNA 1ZBMA 3H6UA 4C1TA 4ND9A 1EZOA 4K3FA 1GR2A 3FGSA 4XKPA 3K6UA 3O29A 2I58A 3GXAA 4F3SA 4MLQA 1JW4A 4R75A 5I57A 1HSJA 4EQ9A 3LSXA 4GF8A 3S9LC 3N94A 3RTWB 1I6BA 1YCJA 3TTRA 1I6AA 3O6IA 3B6QA 1B6HA 3VDFA 1CB6A 3FASA 2R71A 1URDA 2Q88A 3KBRA 5L9SA 3LSLA 4H67A 5H8QA 1B7HA 2F7CA 1B0LA 4R6KA 1B3FA 2UYFA 4ZZEA 4EF1A 3IOTA 4EXLA 3FIRA 3FV1A 4G8HA 2O7IA 3D4CA 1ZTYA 3VVFA 1Y3PA 4NF6A 2FNCA 5TPAA 1UIUA 3PUVE 3RUMA 3I5OA 4ELPA 2P0SA 1LAGE 1LFGA 3S9MC 4BLAA 4Z0IA 3IOVA 4WEDA 2Y7IA 3CFXA 2YJPA 1Z7NE 4RPNA 4F2OA 3IJOB 3IB1A 2AL4A 5TP9B 3QYTA 4R72A 2UVHA 4GLIA 4FAJA 3KFMA 3TTMA 4YMAA 3KSJA 1SW5A 3IK6B 2XXHA 3PV0E 4NF8A 2QS4A 4OETA 3UA8A 5IKBA 5TU0A 2V3QA 1VR5A 1DOTA 3HV1A 5DEXA 4P11A 3TYHA 1FW0A 1PDAA 2WKYA 3CFLA 3O28A 3KZGA 1SD3A 3LUYA 4QFLA 4IGRA 2Y7PA 2Z8DA 3PPOA 3G7WA 1QKBA 1US4A 3TEPA 1RYXA 1PC3A 1IEJA 1EZ9A 3RLFE 2DS9A 2REJA 4YKIA 4G68B 4F29A 3C31A 3QAXA 1XOCA 3PPQA 3SESA 1N04A 2Y84A 5I84A 2DXRA 3VXBA 3E9XA 3TCFA 2F7BA 2I49A 2O51A 2O6AA 4F22A 4ZS9A 4LZ5A 1JNFA 1DMBA 1ZKBA 2RCAA 3R6UA 4NMYA 1N7XA 3T93B 1B3EA 2OWTA 2F35A 3B7DA 3UN6A 1A55A 3Q27A 1LFHA 3GBBA 2XXPA 3A09A 4LZ7A 3TZAA 4RYAA 4C0RA 3KN8A 1H43A 5I2NA 1GVCA 2Z8EA 3C34A 3KOTA 4OQOA 3G3JA 2D21A 4QFKA 4PE5B 4JSDA 2XXWA 2VP1A 1N7WA 4GVOA 4M4GA 1TXFA 5A5XB 4NF5A 4NE4A 3PPNA 2PT2A 1MXVA 5IAIA 5AA2B 3LC8A 4U22A 5H8HA 5AE4A 4JWXA 1URGA 1B3GA 1M5BA 2V3TA 1LB8A 2F6GA 4KR5A 1P1UA 3MP6A 2ZYMA 4HCWA 1XVYA 2AYSA 4KPTA 2FYIA 1B32A 1LGBC 4C1UA 2HFBA 1IIWA 1B46A 5I2KA 4EF2A 4KYEA 1XHYA 1B7UA 3FV2A 4DCYA 2GFEA 4YKJA 5AA3A 2NUVA 2Q8JA 4WEPA 4GQOA 2GH9A 1JETA 4H5FA 4QFNA 3W9WA 3MVYA 4ZEDA 1Y1ZA 4RNSA 3OXNA 1MQJA 1WODA 1LLSA 1S50A 2ZNTA 4OESA 3IO6A 4XKNA 4QFPA 5K2XA 3TTKA 4FEDA 1YTVA 3ZSFA 5L9MA 1BLFA 5H8NB 1MPDA 4HTGA 2DWAA 1FQBA 3HCQA 1PB8A 1MDP1 4YB7A 4ZE9A 4GXSB 2H25A 1OVTA 4BDNA 2BJJX 4I9DA 3OSRA 3IB0A 4KFQA 4FORA 1MQGA 3E13X 1SQYA 4DE8A 1J1NA 5H8FA 5BWJA 2DE3A 2DWJA 3FXRA 3TTNA 2RINA 3O9PA 4FATA 1UTBB 2QL3A 2O1MA 4PFTA 4IO6A 4OXVA 4JWOA 1Y20A 1OLCA 1TWYA 2PBWA 4DCXA 1A8EA 3TQLA 2THIA 4ZECA 3EHSA 2ZNUA 4R6YA 1B4HA 2D3IA 1OQGA 3H03A 4ZDMA 1NL5A 4XXUA 3LSFB 3KN3A 4G8NA 1SYIA 3CSBA 1B1HA 4F3BA 1LBBA 1MM7A 1QW0A 2RC9A 3KJ7A 3DM0A 3THIA 1S9TA 4LZ8A 4I62A 1B5HA 1PB7A 2QMXA 3QUJA 5FTHA 3RN8A 1AMFA 4H8IA 2OK2A 1NKXA 1ZU0A 4DLDA 4R9FA 4H8JA 4IO2A 4OVJA 3O6GA 4NEDA 4MH5A 3U93A 4QHQA 1IQ7A 5KDTA 4U4XA 4OEVA 1QUIA 4U4SA 3MP1A 3U8QA 3RY3A 5ISUA 5F1QA 2F8DA 5CMBA 2QJEA 3FVGA 5I57B 3PPPA 1LAXA 3OMBA 1NFTA 4LQ2A 2ZYOA 3TCGA 5L9OA 1LBCA 3HHFA 3BKIB 2I6EA 1MDQA 4ELOA 3PD8A 4H0WA 1DPPA 2ESNA 3CRBA 1MS7A 1QKAA 5CBRA 3FVKA 1AOVA 1R9LA 5L8DA 3CI8A 4LQ5A 3U1OA 1A40A 3GLBA 3JYRA 5CMMA 1A54A 3U92A 1SDXA 1HSLA 4LP2B 2Q9TA 2XHDA 3A3CA 3CSGA 1GV8A 4DXBA 2G93A 4G2ZA 4MFIA 3H7MA 1QJMA 4KYSA 1TFAA 1A8FA 4Z7EA 4OZ9A 4RA1A 3K02A 1LCTA 4YICA 2QS1A 4NF6B 2Z22A 1UIVA 3T66A 3MBPA 1ELJA 4R2FA 1MH3A 2GHAA 4IO4A 1VFEA 2XD2A 4L17A 4NTLA 1IXIA 3MP8A 2H5YA 5DVIA 3MUQA 2XX7A 4PFWA 4OHNA 5CMCA 4ZEBA 1UTHA 1VE4A 1Y4CA 1JEVA 2IA4A 1FTLA 1XS5A 1BKAA 3RTFB 3C36A 4I8CA 3TUSA 1LFIA 2XXYA 2H99A 3IB2A 2R9JA 3T22A 1JEUA 1OIBA 4N6PA 4YKPA 4TQUQ 2UVIA 4WKMA 4NF8B 1NNTA 4M1VA 4F2QA 1ANFA 3FZVA 4O3BA 5KZTA 1NNPA 4N07A 4RPOA 5DEXB 1TFDA 2O68A 3UK4A 4IO7A 1USYH 3MC2A 2DVCA 2XXTA 1L5TA 3VLVA 4QF9A 4QSCA 1IXCA 4U2RA 3EF7A 1POY1 3DP4A 3L6GA 3T9VA 5I59B 2HQ0A 2ZYKA 4R73A 5H8SA 3CR9A 2DYXA 3SERA 1S7YA 4GL0A 3Q25A 3M3LA 3OELA 3MAMA 5KCJB 5BUUA 1O63A 3IX1A 2XXRA 4TLMB 1QUJA 2XXQA 4KHZE 3TTLA 4KQPA 4BDRA 1B4ZA 4DIGA 1UQWA 2KLFA 4Q30B 4OWDA 3WAFA 1MY1A 4ESWA 1PBPA 4OENA 5ITPA 2X26A 1JW1A 4JDFA 5F7VA 3E3KA 1B40A 1AH5A 3O66A 2HXWA 3Q26A 4ECFA 5I2NB 3M3FA 3C9HA 1IXGA 1FQAA 3VV5A 1M5CA 3R26A 2G29A 2XX9A 5AA2D 4ZZAA 3RPWA 1RKMA 2QS2A 3IO4A 1N84A 3OENA 3ILTB 4THIA 3SDFA 1JQFA 3QXMA 2HAUA 1ZIUA 2F36A 4YAHX 3W15C 4DDDA 1MY2A 1B51A 4U21A 4LONB 1NH8A 2ONRA 3K1PA 1MRPA 2ZMBA 3FVOA 1QULA 3T9XB 4BDOA 4OFOA 2VD3A 2OWSA 3BFTA 4OEUA 1URSA 4JWYA 2DQVA 3EPEA 4PFYA 2B3FA 1FQFA 3KG2A 4OERA 4I1DA 3S9NC 4U23A 3CFZA 1Y4TA 1FCKA 3T9UA 3DLNA 1VSOA 4F39A 1M5DA 4R9GA 3EHTA 4PP0A 1JVYA 2PT1A 2UXAA 1LAFE 4XIGQ 2UVJA 2Z8FA 2XXXA 4QSDA 2FA7A 2PMSA 4G68A 2PYYA 4RK2A 3V83A 1FTMA 1PB9A 1SI0A 3SEVA 1OLAA 2D5WA 1USYE 1Y1MA 3TKDA 3SKPA 2P2AA 1IZ1A 3IOUA 1Y3QA 3D4GA 3U94A 3C35A 3LBSA 4NF4B 5H8FB 2CMOA 3IL1B 4G68C 2GRVA 4JXIA 4KD5A 4HW8A 4Q0CA 4DZ1A 3MPLA 2LAOA 4LVQA 5B70A 1D9YA 3VLWA 1ZJLA 3MZ9A 5J1DA 1N0TA 1SW2A 2ZNSA 1MY0A 4BDMA 4NWDA 1P99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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