5FTHA

Crystal structure of the glua2 k738m-t744k lbd in complex with glutamate (zinc form)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
248
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPMGSSLGKPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Distinct Structural Pathways Coordinate the Activation of Ampa Receptor-Auxiliary Subunit Complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 79
structure length 248
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fthA02
3K1PA 2XX8A 2HQ0A 2B3FA 4X1DA 3EHTA 4UA8A 3S9MC 4R73A 2PMSA 1DTGA 2F6GA 1MM6A 1MY2A 3K01A 5JK4A 3IL1B 3KN3A 2WKYA 1PEBA 4F3GA 2XXUA 4IGTA 4TOZA 3RPWA 3H7MA 2DP8A 4R75A 3VLVA 3MPKA 2R9JA 1B6HA 4UACA 2OLBA 3V89B 3KOSA 3MJNA 3OMBA 3KN7A 4I62A 3UN6A 2Y7KA 3T9VA 3RY3A 5I56B 4GRKA 4ZEDA 2RKMA 1GR2A 1NFTA 1UTHA 1N84A 4ELQA 3S2VA 4KYEA 4H1XA 5A5XB 3TKDA 3CR9A 3QSLA 2E0SA 3IOWA 4KQPA 4FECA 3EQ1A 1XVXA 2A5TB 4HTGA 5I59A 2OBGA 1DSNA 1XHYA 5DYHA 4ZEBA 1D3KA 1A7LA 4F2QA 3E9XA 3LUYA 4YKJA 1IXIA 3C32A 4N13A 2QMXA 4G2ZA 2HFBA 4H6DA 1N3WA 3KOTA 4YMAA 3T22A 3CFZA 3T93B 2DWJA 1GV8A 1MPCA 4XKPA 3EHUA 4XKRA 2O1LA 4F22A 2ONKE 4R2BA 3U94A 3RQTA 3OOAA 2F7AA 3TAJA 3S4UA 1JQFA 2XX9A 3U93A 1QKBA 1NKXA 3N6UA 4GQOA 4U2RA 3H3GA 3OO9A 1FQAA 4XTCQ 1M5DA 1YPNA 4YKIA 4AB5A 4QFLA 5H8HA 3JYRA 4YMBA 3K2DA 3ZS6A 1LAFE 1M5CA 3USDA 3MBPA 2BJJX 3TMGA 3R7XA 3IX1A 4H0WA 2I58A 4FORA 4BLAA 4ZE9A 3TZAA 3QXMA 3SEXA 2E1SA 3K0VA 1B3FA 3W15C 2ZXTA 4LA9A 4I9DA 3EN3A 1R9QA 1HSLA 1B4HA 3HV1A 5ELVA 3QAXA 4JSOA 4AB6A 2R71A 3FVOA 5H8NB 2ZYMA 4NF8A 3OEKA 3G3JA 3C31A 1PBQA 2HAUA 4GXAA 4JDFA 2H5YA 1VFDA 3RT8A 1US4A 1SVXB 1H44A 4ISUA 3K02A 4BDMA 3MZ9A 4EUOA 3T9UA 1MY3A 3RUMA 3RLFE 4OFOA 1S50A 4GOTA 4O3AA 2PVUA 3KZGA 2PX1A 4M1VA 4ZECA 3VE1B 4QHQA 4PE5B 1QJMA 5DVFA 3N94A 1MXZA 1O63A 1IEJA 2DWAA 4PFUA 3OELA 4IY6A 1BP5A 3BBRA 3IJOB 3HSTA 2CZLA 2QL3A 3V8XB 4MLVA 5TP9A 3IB1A 3RT6B 2KLFA 5DTBA 1NNPA 1OIBA 4QRZA 3VXCA 3A09A 2F34A 5DVIA 4OZ9A 3FVGA 2Z8DA 3VLUA 1SI0A 2ESNA 2Q9TA 4Q30B 2HZKA 3TODA 3TFLA 3FZVA 4OFJA 4G68A 1SD3A 3LR1A 1B52A 3TDJA 1B1XA 3PUWE 1EZPA 3UA8A 4OETA 1OLCA 3C33A 1OVTA 3FIRA 1MXVA 3D4CA 1B5HA 3GXAA 2RC8A 4IO5A 1NH7A 4X48A 1ZIUA 5CBRA 5CMKA 2QJEA 2OWTA 1II5A 5AA4A 5AE4A 5L9OA 1MG1A 1FCKA 3CI8A 4QFNA 4FEBA 5I56A 5F1QA 3OXNA 4HW8A 4E0WA 1DPPA 4OEVA 1A8FA 5A5XA 4EF1A 2H98A 3VFJA 4U4SA 3H4ZA 2H25A 4FATA 4Q8RA 3VV5A 2G93A 1VR5A 1WVJA 4KHZE 4BDRA 2B65A 1B9JA 3O6HA 4P0GA 1B0HA 5DT6A 5HBCA 2ONRA 1TT1A 4R74A 1JVYA 4RK9A 5H8HB 4KYDA 3CFLA 3ODBA 4ZZEA 3HHFA 3KSJA 5CRYA 1MXUA 1DMBA 3PUZE 5B7DA 3KJ7A 4OHNA 2D21A 4QFPA 1M5EA 2ZNTA 4H5GA 3ILUB 1A8EA 3EHSA 4R6YA 4QF9A 5H8QB 2VOZA 5K2YA 1PB7A 3VXBA 4H8IA 3FXQA 4HS7A 4YAHX 5IAIA 3OEMA 5FTIA 1JEUA 3OSQA 4NF8B 4ELPA 4ONYA 4U1OA 2W7YA 4GVOA 3VVDA 1JW5A 3WAEA 1EZOA 2PYYA 2RCAA 4I1DA 3LSXA 4N07A 4Q5TA 2OZZA 1ZJLA 3MWBA 1QUIA 3T9XB 1FQDA 2Z8EA 3HCQA 4EF2A 1CB6A 3N26A 3H03A 1XVYA 4RPNA 1Y3PA 2DOJA 5H8NA 5CI5A 4KCDA 2F7CA 4GFRA 3FV2A 3CSBA 2F5XA 3IJXB 4DXBA 3I3VA 4QSEA 3FV1A 5TP9B 1P1OA 4KCCA 4PQJA 4PFYA 3JV9A 3M8UA 3Q26A 2RC7A 2XHDA 1A40A 2XX7A 3BKIB 4OWDA 2DWIA 3C35A 4JWOA 5FHNA 2H9BA 1M5BA 2REJA 1RKMA 3U8QA 3VVFA 2GH9A 3AXFA 3MP8A 5AA3A 4ZS9A 3B7DA 1I6QA 1MH4A 2Y7PA 1P1UA 2UVGA 3E3KA 3EF7A 2ZYKA 4G68B 4EXKA 4DDDA 1LAHE 1SYIA 4PFWA 3Q25A 1WDNA 3RTWB 3FGSA 1D9YA 4KI0E 5I2KB 4HCYA 1F9BA 3B6QA 2ABHA 3ZSFA 3DELB 4ND9A 3TYHA 3Q28A 2DXYA 3SESA 2NVUB 2LAOA 1VFEA 4GF8A 1IXHA 5TU0A 3H6TA 3KSXA 4G8MA 3S9NC 2H4IA 3D4GA 4DLDA 5AA4B 3M3LA 2D3IA 2NWJA 4EQ7A 1N7WA 1ANFA 1EZ9A 5M2VA 1ZMGA 4YB5A 1B1HA 4NEDA 3TQWA 1SQYA 3OSRA 4PP0A 1BLFA 1SW1A 1N04A 3QIMA 5L8DA 1MY4A 4ZEIA 3G3IA 3TCHA 5EYFA 2Q2CA 4WEDA 5AA2A 1PB9A 4LZ8A 1MM7A 4QFKA 2VGQA 3MQ9A 3PD8A 5BWJA 1Q35A 4U4XA 1DPEA 1TXFA 1JVXA 2X26A 2XXHA 4F29A 3Q29A 4DZ1A 4H5FA 3QYTA 3RGYA 4NF4B 1I69A 3ECRA 3KN8A 1UQWA 1TFDA 2F7BA 1IUDA 2O69A 4OYVA 3CFXA 3F11A 4RA1A 1R9LA 1J1NA 1FQFA 3MP6A 1EH3A 1MQIA 2M8CA 2RC9A 1JETA 2RCBA 2Y7RA 1Y1ZA 4F1UA 2O7UA 1MXWA 1UTBB 2DVZA 1IXCA 2ZYNA 1H45A 4RYAA 3OO8A 3G7WA 4LATA 4YB7A 1ZKBA 3GZGA 4M4GA 4G68C 4EXLA 1N7XA 1PB8A 4ZEKA 1B3GA 1NNTA 4NF5A 5H8QA 4ZZAA 1B51A 2F97A 1MXXA 2UYFA 4F3BA 2CMOA 3FXRA 1SW5A 2Z23A 1WODA 3PPPA 2V84A 2ZNSA 4BDQA 1B7ZA 2XXQA 3BFTA 3W9WA 3N5LA 2GHAA 1GVCA 1URSA 1B3EA 2F36A 2HCAA 1FQEA 2XD3A 1USYE 3C36A 1Y3QA 4F1YA 3DM0A 4MF3A 4NTLA 3B6WA 3R26A 3MP1A 3IAZA 2D5WA 3M3KA 1LGBC 3MUQA 3K6VA 1B7HA 4BDLA 3I6VA 1AH5A 4MLQA 2QMWA 4WXJA 3K1MA 5TPAB 4GXSB 3TELA 3MZBA 2XXXA 3FUZA 1SW4A 1FQBA 1LB9A 4IO4A 3IOUA 1ZBMA 5LOMA 4IY5A 4LVQA 3QK6A 4R6HA 1OLAA 2YJPA 3EPEA 3KGCA 2P1SA 2Y84A 1BIYA 3V83A 1SDXA 3O6IA 1PC3A 1LBBA 2UVJA 4TQUQ 5EHMA 2R6GE 2Z22A 5CM6A 4ZDMA 5KCJA 5FHOA 1XS5A 3SERA 4OESA 4U1ZA 5HPQA 1GGGA 3ILTB 3FJ7A 4OVJA 2YPNA 5AA2D 5DEXB 1B5IA 3K6UA 3DP6A 5I2KA 1O64A 2OWSA 2AYSA 4F3SA 1A55A 3K6WA 1IZ1A 3CG3A 5ITPA 1B7UA 3JZJA 3H6UA 2Q8JA 2F35A 1SBPA 1LFHA 5AA2B 1LCFA 3K4UA 4KPTA 2GFEA 3IORA 4NWCA 2HEUA 1VSOA 1MXYA 4U21A 1BTJA 1Y9UA 1Q1KA 3SEVA 2O51A 3PUXE 3CSGA 5I58B 3LBSA 4RNSA 1EU8A 4E0XA 1NMUA 5I84A 1OQGA 2OCUA 1MY1A 2XXVA 3GBBA 2F78A 3OD7A 1B4ZA 4Q0CA 2YLNA 3IK6B 1S9TA 4YKKA 4NF4A 1RYXA 2ZNUA 3UGWA 5ISUA 3IO6A 3B6TA 1XT8A 4PETA 5CMBA 1QVSA 3RTFB 3FJGA 4JXIA 2I4CA 1LB8A 1LAGE 3L6HA 5FHMA 4QFOA 5JEIA 3S9LC 2XXYA 1I6AA 2PT2A 1LFGA 4KD5A 3FVKA 2I0CA 2F8DA 3PU5A 4THIA 4P11A 1POY1 4ZEFA 1SI1A 4FE8A 2AL4A 3IOVA 4LP2B 5CMCA 4NF5B 1UTBA 2I4BA 3TTLA 3DP8A 4WEPA 4C1TA 2NXOA 1QULA 3U1OA 4XXUA 3SEYA 5B70A 4YKPA 4NMYA 3N6TA 3TTNA 2H99A 2I0BA 4F19A 1LCTA 2DVCA 2QPQA 4IO3A 2X7QA 1M5FA 1FTKA 3G3GA 1MPDA 1B2HA 5KDTB 3LC8A 3KFMA 1L5TA 1VE4A 2OJTA 5FTHA 4G8HA 3ZKLA 3MVYA 2QS2A 3VVEA 4GD5A 3QUJA 5CBSA 4EQBA 4IO2A 2V3UA 2DE3A 3K1NA 4FIMA 4N6PA 1ZU0A 4POWA 4HCWA 3S9EA 3GBAA 3T96B 1Y20A 3CRBA 3SETA 4NF6B 4YB6A 3G3KA 1CE2A 1QW0A 3K6XA 4K3FA 2DXRA 1ZLQA 1NH8A 4F2OA 4H65A 3MAMA 5TPAA 2DYXA 4LZ7A 5H8FA 5KCJB 3P7IA 5I57A 2QSXA 2OK2A 3MVWA 1N3XA 1OQHA 3KEIA 2Y7IA 1Y3NA 1Y4CA 2UXAA 2O84X 1UIUA 2FNCA 2I49A 2AIXA 1LFIA 2ANJA 3FD3A 4DE8A 2DWHA 2XD2A 1H76A 4FAJA 3H06B 2XXRA 3T9HB 1LSTA 3TTRA 3PMVA 4DCYA 4Z7EA 4NWDA 3IOTA 1Z7NE 3VDFA 1MY0A 5EHSA 1YTVA 1ZTYA 3PD9A 1D4NA 4F39A 5I2NB 2NOOA 4X9TA 2DE2A 4EQ9A 5KZTA 4F3PA 1P1QA 2XXTA 5DEXA 2QS4A 4GWOA 2DE4A 3DLNA 3QUFA 4KR5A 3LSWA 3PPQA 4OERA 1JEVA 3FJMA 4OTEA 2VD3A 3LSFB 4H8JA 1FW0A 1PBPA 5L9MA 4IB2A 3FVNA 5CMMA 5I58A 4ZE8A 2XXPA 1QKAA 1YCJA 2AL5A 4OQOA 4OMBA 1KWHA 2V3TA 1URGA 2I6EA 2Y7WA 2VHAA 4QSCA 3GLBA 2Q88A 4PFTA 3THIA 3O29A 2DSFA 5BUUA 4F1VA 1T0KA 3MW0A 1LBCA 3TUSA 1DOTA 3TPAA 1B40A 3M3FA 1O7TA 1AMFA 4RY1A 2I48A 4XIGQ 1RYOA 2IA4A 5L9SA 3SDFA 1FTOA 1LAXA 4JSDA 1JW4A 4GIZA 4BDOA 3G3FA 2GRVA 3C4MA 1A54A 5F7VA 2PT1A 3T66A 3KG2A 3I5OA 3IO4A 1IQ7A 2VP1A 2ONSA 1IXGA 2RINA 3IB0A 1US5A 2O68A 1GTKA 1Z7ME 1N0TA 2DQVA 5JTYA 2Q89A 3W9VA 3PUYE 1JW1A 4AQ4A 5CC2A 3TEPA 3R6UA 1MDQA 2PBWA 4RPOA 4RXLA 5IKBA 1QUJA 3FATA 1OMPA 3PUVE 3OO7A 3FXUA 3IR1A 1NNFA 2ZMBA 4NE4A 2HAVA 3CG1A 4LQ5A 4RJZA 4OENA 1ELJA 3ONMA 2VD2A 3MVZA 1AL3A 1YAEA 3TQLA 4FJPA 1MQHA 2UYEA 3L6GA 4POXA 3TCFA 3UK4A 5KDTA 1URDA 2I3VA 2X7PA 3C34A 4U22A 3RN8A 1IIWA 1P1WA 4GL0A 4ELRA 1TFAA 1JNFA 3MC2A 3UP9A 4BDNA 2O7IA 2Q2AA 3MPLA 4OFLA 5H8FB 4KFQA 5I57B 1QUKA 1NNKA 2I3WA 4NF6A 4IO7A 3O97A 3PPOA 4IGRA 3VLWA 3G3HA 3HPIA 3CVGA 1USYH 2NUVA 2DS9A 2F6PA 4RK2A 3TCGA 1Y4TA 4R2FA 4IO6A 3H6VA 2GHBA 3A3CA 3RNNA 1MQDA 4X1BA 4GLIA 4H67A 2HXWA 4C1UA 3PGFA 3TTKA 1N76A 3HO7A 2THIA 1I6BA 1R6ZA 4G8NA 2IEEA 1B5JA 1MDP1 2FYIA 3ZKKA 1LLSA 4MH5A 1P99A 1PDAA 1IITA 5DVJA 3SKPA 4DCXA 4XKQA 3E13X 3LSLA 3H6WA 3E4RA 1A99A 1HSEA 1MQGA 1B05A 1B32A 2O1MA 4I8CA 3A3UA 4LZ5A 4ESWA 1H3DA 4WKMA 5ICQA 1UTHB 3V5AA 5I2NA 3FASA 1FTLA 3DP4A 2XXIA 4YZZA 2FA7A 3PMXA 2A5SA 5I59B 3PV0E 3IB2A 4KYSA 3OO6A 1B3HA 1POTA 4JBZA 3WAFA 2XXWA 1FTMA 4JB7A 4R9GA 4P0IA 3PPRA 5K2XA 4F31B 4ELOA 4Z0IA 4O3BA 4O3CA 2RF1A 4YICA 2A5TA 2QS3A 3UORA 2UVIA 1MQJA 1D9VA 3CIJA 4MBPA 1B0LA 5ICTA 3U92A 1SW2A 1Y1MA 3HHGA 2QRYA 2HZLA 3HN0A 3K00A 1UIVA 5J1DA 1AIVA 1XC1A 3BFUA 5H8SA 1ATGA 1OVBA 4FEDA 2QS1A 2O6AA 2UVHA 3O6GA 3O9PA 5AA1A 4QSDA 2V25A 5JTYB 4ECFA 1BKAA 3SEWA 1TWYA 2ALUA 4DIGA 1B58A 4DXUA 4LONB 1FQCA 4GL8A 4L17A 1NL5A 4DXCA 3C9HA 3KBRA 3UIFA 1R1NA 2B3BA 4U23A 3U72A 1XOCA 1B3LA 4R9FA 1B46A 2G29A 4OEUA 4C0RA 3PMWA 4LQ2A 3TTMA 4EDPA 1S7YA 1AOVA 4R6KA 2Z8FA 4YU0A 4ESXA 3Q27A 1SYHA 2V3QA 4JWYA 3PPNA 1MRPA 4LUBA 3O66A 2P2AA 1MPBA 4TLLB 3O2AA 4R72A 1MH3A 4XKNA 2P0SA 4F18A 1P1NA 1DTZA 2ZYOA 4OXVA 2V93A 4G77A 5HM4B 4G4PA 3MZ1A 3OENA 3KJTA 3MVXA 2REGA 4MFIA 4TLMB 4JWXA 1HSJA 3O28A 5ITOA 1MS7A 1FTJA 3SEUA 1H43A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K1PA 2XX8A 2HQ0A 2B3FA 4X1DA 3EHTA 4UA8A 3S9MC 1NUZA 4R73A 2PMSA 1DTGA 2F6GA 1MM6A 1MY2A 1YYZA 3K01A 5JK4A 3IL1B 3KN3A 2WKYA 1PEBA 3BIGA 4F3GA 2XXUA 4IGTA 2CZHA 4TOZA 3RPWA 3H7MA 2DP8A 4R75A 3VLVA 2WYPA 3MPKA 2R9JA 2ZZVA 1B6HA 3RPLB 4UACA 2OLBA 5IZZA 2P3NA 3V89B 2WX9A 2GQ1A 4NQ8A 3KOSA 3MJNA 2VT5A 3KN7A 3OMBA 1FJ6A 4I40A 4I62A 3ROJA 3UN6A 2Y7KA 3T9VA 3RY3A 4P56A 5I56B 4GRKA 4ZEDA 2RKMA 4NN3A 2XWIA 1IMCA 1GR2A 1NFTA 1UTHA 1N84A 4ELQA 4OVTA 3S2VA 4KYEA 4H1XA 5A5XB 3TKDA 1LBWA 2ZZWA 3CR9A 3QSLA 5IZ3A 2E0SA 3IOWA 4G61A 4KQPA 4FECA 3EQ1A 1XVXA 2A5TB 4HTGA 5I59A 2OBGA 1DSNA 1XHYA 5DYHA 1NUWA 4ZEBA 1D3KA 1NV7A 1A7LA 4F2QA 3E9XA 3T1BA 3LUYA 4YKJA 4NF0A 1IXIA 3C32A 4N13A 2QMXA 4G2ZA 2HFBA 4H6DA 1N3WA 3KOTA 4YMAA 3T22A 4OVRA 3CFZA 3T93B 1NUYA 2DWJA 1GV8A 4AS4A 1MPCA 4XKPA 3EHUA 4XKRA 5I5PA 2O1LA 4F22A 2ONKE 4R2BA 3U94A 3RQTA 3OOAA 2F7AA 3TAJA 3S4UA 4MNIA 1JQFA 2XX9A 3U93A 1IMAA 2OWZA 1QKBA 1NKXA 3N6UA 4GQOA 4U2RA 3H3GA 3OO9A 1FQAA 4GX4A 4I3EA 1M5DA 4XTCQ 1LEVA 1YPNA 4YKIA 4AB5A 4QFLA 2XWKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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