5FTHA

Crystal structure of the glua2 k738m-t744k lbd in complex with glutamate (zinc form)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
258
structure length
248
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPMGSSLGKPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Distinct Structural Pathways Coordinate the Activation of Ampa Receptor-Auxiliary Subunit Complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 79
structure length 248
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fthA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5fthA02
2Y7PA 3KN8A 1O7TA 4GWOA 2F34A 2F7BA 2WKYA 4FEDA 3UIFA 1BP5A 3IX1A 4ZZEA 2DE4A 2OCUA 5IKBA 3KBRA 2E0SA 3FJ7A 3VVEA 4H6DA 3TODA 2XD2A 3QUJA 1D3KA 4F2QA 3IB0A 3PGFA 4RNSA 1BTJA 4H5GA 3IK6B 4DZ1A 3RLFE 3Q25A 3BBRA 1QKAA 3O6GA 4F3GA 3HHFA 3HSTA 2O68A 5A5XA 2P2AA 1QJMA 2Z8EA 2D5WA 1SYIA 1IITA 3PU5A 3U92A 1OVTA 1UTBB 3OO6A 4OHNA 1DPPA 4ND9A 5CI5A 2B3BA 2DVZA 3LR1A 4BDOA 1NL5A 3UN6A 1ANFA 2FYIA 1MXYA 4GL0A 5H8FB 4PFYA 3LSWA 2NXOA 3ZS6A 1D4NA 4G68C 4QSCA 1LCTA 1PB9A 2V25A 2QS2A 3FVOA 3R7XA 4F39A 5H8QA 5JEIA 4GD5A 4JBZA 1SW4A 1MDP1 5JTYB 5I2KA 4RA1A 3T9HB 3K01A 2H9BA 1MQHA 2VOZA 1ZKBA 3U72A 1B2HA 2QMXA 4NEDA 3VVFA 4DXUA 4EQ9A 2O84X 3K1MA 3JZJA 3UA8A 1SYHA 2QSXA 2ZNTA 3VVDA 4ELRA 1Y1MA 2DWAA 3BKIB 2GFEA 2O1LA 5CC2A 1IXIA 2NUVA 1JW5A 3H06B 3KFMA 3PUZE 4UA8A 5ELVA 1IUDA 3VXCA 4F2OA 3CI8A 1DTGA 1MG1A 4F31B 3CSBA 1NFTA 3QIMA 3KSXA 1R9QA 2THIA 2I0CA 4IGTA 1AL3A 4YKJA 3SETA 1UTBA 2HAVA 3H4ZA 1B7ZA 1XHYA 1URSA 3IORA 1JNFA 4IO7A 1MPCA 5CMMA 4MH5A 1MXVA 1F9BA 4R6YA 1I6AA 2Y7IA 4YB6A 1ZU0A 3VV5A 3M3KA 1B7UA 3PMXA 4RK9A 3DM0A 3OEMA 5FHNA 1Y4CA 2VD3A 3C4MA 4R9FA 4RJZA 3U8QA 4EF1A 4GXAA 4KCDA 2ESNA 4NF4B 3RNNA 3FASA 3TTMA 3RTFB 5HM4B 4WEDA 4LQ2A 4NWDA 5I59A 4GVOA 4BDQA 2ABHA 3P7IA 4ECFA 5KCJB 2A5TA 1VE4A 1IXHA 2REJA 2Z23A 5DEXB 1M5FA 1N3XA 3H7MA 3S2VA 3PMVA 1A99A 2QPQA 3C32A 5TP9A 2Q89A 3O29A 4OMBA 4QSEA 2H25A 4LONB 5H8HB 1QW0A 3FXQA 4QFNA 4DLDA 1QULA 2PMSA 4JSOA 4IO4A 1US4A 3M3FA 3PUWE 4FORA 4MBPA 5DEXA 4L17A 3RPWA 1N04A 3Q26A 1FTOA 3H6VA 1IIWA 4YU0A 2DSFA 3T22A 2X26A 4OEUA 5CBRA 4MLQA 1OLCA 4IO6A 3SEYA 4EF2A 5I2NB 1KWHA 2H4IA 2VHAA 4TQUQ 2O69A 1SD3A 2R6GE 1BKAA 2F6GA 3C33A 1ZMGA 3CVGA 2ZYMA 1MXZA 3MPLA 4FEBA 4XIGQ 3FD3A 1Y3NA 3SKPA 4M1VA 3ILUB 2OZZA 4U1OA 1QUIA 2DQVA 4RPOA 1GR2A 1MM7A 3HPIA 5CMCA 3TYHA 3RT6B 1SBPA 3ZKKA 4XKRA 3KSJA 5J1DA 3TCHA 4M4GA 4F1UA 1M5BA 1MRPA 5FHOA 5L9MA 4NE4A 3N6TA 3KG2A 3UORA 1POY1 4BDNA 2H99A 4ELQA 3FZVA 3EF7A 3SEWA 1TFAA 2HEUA 4LZ7A 3OO9A 1P1NA 1EZ9A 2ONSA 3IR1A 3OENA 4PETA 3RQTA 4F29A 3KN3A 1MY3A 4YB5A 5AA1A 4G68B 3V83A 1FQDA 3SERA 3B6TA 5CM6A 5I2NA 4C1TA 3EN3A 2QS1A 4G8NA 3W9VA 4E0WA 1CE2A 4G8MA 4I8CA 3TEPA 1N0TA 3JYRA 1MY1A 2Q88A 3QAXA 2RINA 5KZTA 4OETA 3HO7A 3TUSA 2VGQA 2ZYNA 2LAOA 4OZ9A 5H8FA 4EQBA 4H65A 3IOWA 2PX1A 4MF3A 4QFLA 2B65A 4H1XA 1LAFE 2UVHA 2CZLA 4RK2A 5EHMA 4ELPA 1PBPA 2VD2A 4RXLA 1IQ7A 1B3LA 4WKMA 5JTYA 1B0HA 3MZ1A 1RYOA 1H76A 2HQ0A 2IA4A 2XXTA 4MLVA 1B7HA 2DOJA 2ZMBA 4X1DA 3TFLA 4LATA 3N26A 5I59B 1NNTA 1B05A 2OWSA 1LAHE 2GRVA 3GLBA 4EDPA 5TU0A 2HXWA 3ECRA 2NWJA 3T9VA 2PVUA 3H6TA 1JVXA 2Q8JA 4IO2A 3PPNA 4BDLA 1B6HA 3L6HA 2OWTA 4P0IA 1B40A 1A7LA 4LA9A 1FQFA 1UTHA 3IB2A 1B3GA 3IOVA 4PFTA 3FIRA 4YKKA 1B5JA 4PE5B 1B32A 3G3FA 3G7WA 2AL5A 4DXCA 2ONRA 4N13A 5DT6A 1H3DA 3OMBA 3SDFA 4DCYA 5CMBA 1AH5A 4BLAA 1US5A 4NF6B 4XKNA 1QUKA 2G29A 2Y84A 4GXSB 1SW5A 4QFPA 5L9SA 1HSJA 3PMWA 4R2BA 3R6UA 3KOTA 4FIMA 4O3CA 2HCAA 4F1YA 1H44A 1NNKA 4JWOA 1A8FA 3KEIA 1UIVA 2F97A 1N84A 2R71A 1POTA 2Z8DA 3KJTA 4I62A 1B51A 2Z22A 3WAEA 5CMKA 3RGYA 4ZDMA 1XOCA 4ZEIA 3V5AA 2I58A 3C9HA 3N5LA 3HHGA 4KYSA 4Q30B 3TPAA 4QRZA 3PD9A 1ZLQA 4YB7A 2GHBA 4JSDA 4GOTA 2QMWA 4KFQA 3BFUA 4N07A 1LFHA 3MP6A 3I5OA 1OLAA 2H5YA 2A5SA 1HSLA 2CMOA 4PFWA 3O6HA 3G3HA 2XD3A 3MAMA 3CR9A 4H8JA 3WAFA 4U4SA 2XX8A 5DYHA 4LVQA 3K4UA 1MY2A 1H43A 3E9XA 3N94A 3RUMA 3FV2A 3CG3A 1FTKA 1MQJA 4U23A 1Y9UA 1JW1A 1H45A 4YICA 3IJOB 2XXYA 4LUBA 2QL3A 1LB8A 1DMBA 1USYE 4MFIA 1UQWA 1O63A 4OXVA 5F1QA 1FCKA 5H8QB 3MBPA 3W9WA 5A5XB 4FECA 1EZPA 3CG1A 3E13X 5AA2D 1TWYA 2I4CA 2FA7A 5L9OA 1M5DA 4JXIA 1B46A 4IY5A 3TELA 2Y7KA 3DP4A 3MZBA 4DXBA 5I56A 3IOTA 3FV1A 2XX7A 3IAZA 1D9YA 3KJ7A 3AXFA 5ITPA 3IOUA 3KZGA 4ZEDA 1Y3QA 1FW0A 3H6WA 4KR5A 3S4UA 4HCYA 3CFXA 4YZZA 4ZEBA 4OFJA 1MQIA 2BJJX 4C0RA 1PDAA 1WODA 2F6PA 1EH3A 4OFLA 4LP2B 2X7QA 2REGA 3E4RA 4GF8A 4F3BA 1MH3A 2PYYA 3T9XB 5AA2A 3GBAA 4P11A 1MQGA 4G8HA 4DE8A 2YPNA 3RN8A 2G93A 2I0BA 4OFOA 5CBSA 3N6UA 3PPPA 4NTLA 4RPNA 1B52A 3DP6A 1NNPA 5EHSA 1J1NA 4RYAA 3Q28A 3VXBA 1LB9A 1B3EA 2PT1A 3MZ9A 3VE1B 3EPEA 2XXXA 3MVWA 2AIXA 1DTZA 2I3WA 1NKXA 3B7DA 3LBSA 1LGBC 4KD5A 5KDTB 4KHZE 3LUYA 4ZS9A 3VDFA 4JWXA 3SEXA 2UYEA 1RKMA 2XX9A 3FGSA 3K2DA 4NF8B 4HW8A 3S9LC 3MVXA 2B3FA 2P1SA 1A54A 2D21A 4Z7EA 1SDXA 3TDJA 3U93A 1T0KA 1EU8A 5H8NB 3IL1B 1BIYA 4U2RA 2HAUA 1Z7NE 3PV0E 4AB6A 4C1UA 1MH4A 2XXRA 1PB8A 3CFZA 3A09A 4LZ8A 1AIVA 2F36A 2ZYKA 2PBWA 2QJEA 4KI0E 1IXCA 1ZJLA 2UVJA 3G3KA 4G77A 5TPAB 5JK4A 1B4HA 4X48A 3MVYA 3PPQA 1NMUA 1PEBA 3HN0A 2FNCA 2V84A 3MVZA 3O9PA 3TKDA 2UVGA 4R75A 4U22A 1M5EA 3HV1A 4I9DA 1ZIUA 4G4PA 4U21A 4DIGA 1SI1A 2P0SA 4E0XA 1R1NA 4XKQA 2AYSA 1P1QA 4R9GA 3LSXA 2KLFA 4P0GA 3V8XB 2ZNUA 4NMYA 3S9NC 4O3BA 3B6WA 4GRKA 1JEVA 5H8SA 5M2VA 1YCJA 1NH7A 1Z7ME 1M5CA 2ZXTA 2DYXA 3K6WA 3THIA 4OENA 1FQAA 5I57A 2NVUB 3FVGA 3L6GA 1DSNA 1R6ZA 2RC7A 3OSRA 4TLMB 2PT2A 4U4XA 1LSTA 1YPNA 3R26A 2YJPA 1FTMA 4Z0IA 3T96B 2I6EA 4F22A 5TP9B 1B4ZA 3FATA 1B3HA 5FTHA 2RCBA 3QUFA 3ZKLA 5H8NA 1R9LA 1AMFA 1FQEA 5DTBA 1YTVA 4KPTA 1LBBA 2GH9A 3LSFB 3DP8A 1OIBA 4BDMA 3M3LA 4NF8A 3LC8A 3MWBA 3OEKA 4TOZA 4GLIA 4LZ5A 3TTKA 1VFEA 3EHUA 3SEUA 3U1OA 5AA4A 3SEVA 1LBCA 2RF1A 2V3QA 4ZECA 2O1MA 3UK4A 2O7IA 1URGA 1VSOA 3OSQA 4K3FA 3KOSA 5FHMA 1N76A 3K0VA 4Q8RA 1UTHB 4HCWA 2Q2AA 4OTEA 2RCAA 1XS5A 2F78A 3USDA 2QRYA 3QK6A 3Q27A 2DE2A 1II5A 3BFTA 3K1PA 3U94A 2AL4A 3UP9A 3K6XA 2HZKA 4Q5TA 1JVYA 2DWIA 4X9TA 2UVIA 3V89B 1QVSA 1Y3PA 3E3KA 3FXRA 3K1NA 1LCFA 3MP1A 4R6HA 5HBCA 1A8EA 1QUJA 3DELB 2F7CA 5KDTA 1L5TA 1S50A 4ESXA 3TCGA 4H67A 4ISUA 3MJNA 1Q1KA 1MPDA 5BUUA 3IO6A 1XVXA 3B6QA 4H0WA 1GV8A 1TT1A 4GL8A 1GTKA 3W15C 4DDDA 2F7AA 3EHTA 3I6VA 3MP8A 4HTGA 2I49A 2V3TA 4JB7A 1VFDA 5AA3A 5H8HA 1SVXB 5DVIA 3ILTB 3H3GA 4F19A 5ITOA 3SESA 2O51A 3RT8A 3TCFA 4F18A 1PB7A 1AOVA 1MPBA 1PBQA 2D3IA 1URDA 2I3VA 1UIUA 2QS3A 2XXPA 2XXUA 1VR5A 4POXA 5KCJA 1MY0A 4KQPA 3FVKA 1MQDA 5TPAA 1I6BA 3UGWA 3VLUA 5LOMA 4NF5B 1I6QA 3VFJA 3S9MC 2QS4A 1N7XA 1NH8A 1Q35A 2F5XA 2XXHA 4G68A 1S9TA 2OK2A 4NF4A 1IEJA 1MXXA 3F11A 1PC3A 5AA4B 4OQOA 4QFOA 4THIA 5K2XA 2ANJA 3FJGA 3FXUA 4YKIA 3G3JA 1JQFA 2X7PA 2OLBA 4ELOA 2ALUA 1RYXA 1SW2A 3HCQA 2YLNA 5K2YA 5B7DA 5ISUA 3G3IA 5I57B 1SW1A 3QXMA 3TZAA 1XT8A 2XHDA 4G2ZA 1TFDA 4U1ZA 1JW4A 2RKMA 4IGRA 4FATA 2H98A 1MXWA 3PPOA 3C34A 4IY6A 4F1VA 3OELA 1MY4A 1OVBA 1Y1ZA 1O64A 3FJMA 3T93B 4FAJA 3QYTA 4AB5A 1ZBMA 3GBBA 4GIZA 1IZ1A 1JETA 5IAIA 5L8DA 1B3FA 2DVCA 1P1UA 3T9UA 3K02A 1SI0A 2F35A 4POWA 2VP1A 3O66A 1B0LA 1OQHA 3S9EA 2V3UA 1IXGA 1Y4TA 3A3UA 4DCXA 3TMGA 1N7WA 1P99A 4ONYA 5AE4A 5DVJA 2DXYA 4R6KA 4ZEKA 3TQWA 1TXFA 3O97A 4EUOA 2DS9A 3I3VA 4O3AA 2GHAA 3Q29A 3EQ1A 4KYDA 1DOTA 3IB1A 1A55A 1JEUA 2Y7RA 4NF6A 1LFIA 1CB6A 5I58B 1SQYA 3KN7A 3KGCA 3M8UA 2Q9TA 4NF5A 3JV9A 5CRYA 1EZOA 1N3WA 4OERA 4R2FA 4LQ5A 4OYVA 3GZGA 3D4GA 3TAJA 2ZYOA 3G3GA 1OQGA 2RC8A 5EYFA 4JDFA 3K6UA 3PD8A 2XXWA 5AA2B 3O28A 3TTRA 1WDNA 1XC1A 5FTIA 4EXLA 1P1WA 4YMBA 3QSLA 1LFGA 3D4CA 2IEEA 4WEPA 4H8IA 3O2AA 3ODBA 2W7YA 3RY3A 1OMPA 5ICTA 3DLNA 1P1OA 1FQCA 2DP8A 2UXAA 3CFLA 5DVFA 3K00A 4JWYA 1MXUA 4GQOA 3OO8A 1USYH 4IB2A 4X1BA 3TQLA 1BLFA 3PUVE 3PPRA 3OD7A 2RC9A 4QHQA 4RY1A 1WVJA 4OWDA 1ELJA 4TLLB 4WXJA 5BWJA 1B9JA 3C35A 3PUYE 1FTLA 4ZEFA 2ZNSA 1I69A 3PUXE 3TTLA 4ESWA 5I84A 4YKPA 4UACA 3H03A 3GXAA 3ONMA 2HZLA 3CRBA 4QFKA 2DWJA 4I1DA 4BDRA 3MW0A 4YAHX 3T66A 3TTNA 2OBGA 1XVYA 1S7YA 3MPKA 4PP0A 3OOAA 5B70A 4Q0CA 2R9JA 4KCCA 5I56B 4YMAA 4QF9A 5ICQA 2XXQA 1LLSA 3FVNA 4GFRA 3CSGA 1B1HA 2DXRA 4XTCQ 5I2KB 2NOOA 2XXIA 3OXNA 4PQJA 1YAEA 2Y7WA 2F8DA 2I48A 1B5IA 2Q2CA 4OEVA 5I58A 3VLWA 3MUQA 3ZSFA 4R74A 4H5FA 5F7VA 2ONKE 3RTWB 3O6IA 3IJXB 4PFUA 4AQ4A 1QKBA 2E1SA 4N6PA 4XXUA 4F3SA 1B58A 1GGGA 2Z8FA 4HS7A 2DWHA 4F3PA 1LAGE 2HFBA 4KYEA 3H6UA 1GVCA 3OO7A 3A3CA 1DPEA 3VLVA 4ZE8A 3C36A 3MC2A 4OESA 2UYFA 2XXVA 3MQ9A 4FJPA 1FTJA 4R72A 1MM6A 1MDQA 1D9VA 3EHSA 3K6VA 3IO4A 4OVJA 4ZE9A 4ZZAA 1HSEA 1B5HA 3CIJA 5HPQA 4QSDA 4FE8A 4R73A 1A40A 1FQBA 1LAXA 4IO3A 1ZTYA 1B1XA 1NNFA 1ATGA 2A5TB 2M8CA 2OJTA 3FUZA 2O6AA 2DE3A 2I4BA 2V93A 3LSLA 4IO5A 1Y20A 3C31A 4NWCA 4XKPA 4EQ7A 4EXKA 1MS7A 2O7UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7PA 2WKYA 3UIFA 1BP5A 4ZZEA 2OCUA 5IKBA 3TODA 2HXRA 1D3KA 3PGFA 4RNSA 1QKAA 2Z8EA 3U92A 1DK4A 1LBZA 3OO6A 4BDOA 3UN6A 1ANFA 4GL0A 5H8FB 2NXOA 4QSCA 1LCTA 1PB9A 2QS2A 5H8QA 1FBGA 3U72A 4EQ9A 1FBHA 1SYHA 1FPDA 2GFEA 1IXIA 3PUZE 4O94A 1IUDA 1DTGA 3QIMA 1R9QA 4OA4A 3SETA 5IZ3A 1B7ZA 1XHYA 1URSA 5CMMA 3DM0A 3TTMA 5I59A 5EYHA 1IMAA 4ECFA 5KCJB 4O7IA 1LBWA 1IXHA 4NHBA 5EQ7A 5TP9A 4QSEA 2H25A 4LONB 5IZZA 2PMSA 3PUWE 3RPWA 4XFEA 4PGNA 5CBRA 4MLQA 3SEYA 5I2NB 2O69A 1BKAA 2F6GA 2WYPA 1ZMGA 3MPLA 4XIGQ 3FD3A 5LDZA 1EYJA 1NUXA 5FBPA 4GX3A 5ET6A 3TYHA 1XI6A 4P8BA 4M4GA 5L9MA 3N6TA 2H99A 3FZVA 3OENA 1MY3A 5AA1A 3V83A 4G68B 3ROJA 3TEPA 1N0TA 1MY1A 3QAXA 3HO7A 2VGQA 1INPA 4OZ9A 2KQZA 2PX1A 4ELPA 1PBPA 5JTYA 4WKMA 3MZ1A 4MLVA 4MCOA 1B7HA 2ZMBA 1FRPA 1G0HA 1B05A 2OWSA 1LAHE 3T9VA 2Q8JA 1B6HA 3L6HA 2OWTA 3BIGA 3IOVA 4YKKA 3G3FA 2AL5A 4N13A 3OMBA 1AH5A 2Y84A 2HCAA 1FBEA 4PF6A 1NNKA 1A8FA 3KEIA 4I62A 5CMKA 2VPNA 3E78A 1XOCA 3C9HA 3TPAA 4GOTA 2A5SA 4PFWA 3K4UA 1MQJA 3IJOB 1LB8A 1DMBA 1UQWA 3W9WA 5A5XB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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