1NFTA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, iron loaded open form
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTVSSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Alternative structural state of transferrin. The crystallographic analysis of iron-loaded but domain-opened ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
molecule keywords PROTEIN (OVOTRANSFERRIN)
total genus 97
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nftA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nftA02
1SVXB 5H8SA 1NNFA 1B2HA 3DLNA 1R6ZA 3IB1A 4GIZA 4JWYA 3PD9A 1JVXA 3T9UA 4QSDA 3RPWA 5CMKA 4QFLA 1UIUA 4F29A 3SEYA 2FYIA 3RQTA 5K2XA 5JK4A 3EF7A 2F35A 1AOVA 3IL1B 4NMYA 3EHSA 4U21A 4K3FA 1FTLA 2DWHA 3LR1A 3VVFA 3TTLA 5ICQA 4U1OA 3O28A 1WDNA 3UP9A 4ZECA 2ZNUA 1P99A 4R9FA 3MVYA 1OLCA 3H6UA 3G3GA 3EHTA 3USDA 3W9WA 3FJ7A 1MS7A 3OXNA 2A5SA 4TLMB 3K2DA 1MDP1 2D3IA 4YB7A 2I4BA 2RC8A 1RYOA 3H7MA 1YAEA 2DWAA 4UA8A 3S9NC 3QAXA 4U2RA 1JW4A 3IK6B 3MP6A 3FV1A 4JXIA 4POWA 3IB0A 1ZJLA 2VGQA 4MLVA 2RC7A 3ZKLA 1A40A 3CI8A 4KQPA 2O6AA 4ISUA 4Q8RA 3QIMA 4R2BA 4ELPA 1GTKA 4ZE8A 3QUFA 3TTMA 1AH5A 2DXRA 1BP5A 4EDPA 4F22A 3RLFE 2OZZA 1IXHA 5HPQA 4IO4A 1OIBA 5EHMA 1I6BA 3ECRA 2HCAA 2F7BA 5DVJA 1ZIUA 4OESA 3TTRA 3K6XA 1D9VA 4F3BA 1HSLA 5KCJA 3BFTA 4I9DA 4PFUA 4RPNA 5ISUA 4ZZEA 1VFDA 2CMOA 3K6UA 3GXAA 5I56B 1VFEA 3HV1A 3PUVE 1O7TA 4H67A 5KDTB 4EXLA 1IITA 1B9JA 2RCAA 4X1DA 4ONYA 1JW1A 3H06B 1MY3A 3U1OA 3DM0A 4XKQA 3M3LA 1JW5A 2XX8A 3MVWA 1AMFA 3G3KA 3UN6A 1FQFA 3ZKKA 4F3SA 3KSXA 1FTMA 1LAFE 4NE4A 3K1MA 1Q35A 1MM7A 1PBQA 4PFYA 3C33A 4OEVA 1SYHA 4N07A 1WVJA 3DP6A 4HTGA 5L8DA 2Y7IA 4BDRA 4YKPA 1USYH 1JETA 3Q29A 2I0CA 1N7XA 2OJTA 3FJMA 2Q8JA 2QS3A 2REGA 4G68C 4NWDA 4NEDA 2HXWA 1NKXA 2Q89A 4RY1A 5I57A 2QL3A 1Y20A 1MXXA 2RF1A 3M3KA 4ZZAA 3N94A 4U22A 3SESA 2DVCA 1BKAA 1UTBA 4PP0A 2YJPA 1ZU0A 4ECFA 1PC3A 1P1WA 1TXFA 2GH9A 1UTHB 3MZBA 5A5XB 2UVGA 3VFJA 1Y3QA 1LCTA 2XXTA 4NF5B 4KYDA 4QFKA 3I3VA 5H8HB 2UVHA 3N5LA 1B3HA 4F19A 3R26A 1S9TA 4R75A 3E3KA 5DEXA 1LFGA 1WODA 3I6VA 4YB6A 1B5JA 2H9BA 3LUYA 2D5WA 2XD2A 4OEUA 1F9BA 1N04A 3RGYA 2XXIA 3KJTA 5I2NA 4XKNA 2I4CA 2X7PA 1H43A 4DCYA 1MQGA 3K4UA 1MRPA 3FVGA 3UGWA 3OSRA 3FGSA 3G3FA 4M4GA 1JEUA 4HCWA 4ZEFA 4OWDA 5CMMA 2P1SA 4ZEKA 4YZZA 4U23A 1P1QA 4IO3A 4ZEDA 3OEKA 3G3IA 2XX7A 3VXCA 1CE2A 1S50A 3MP8A 4NF8B 3MPLA 2NVUB 4EQ9A 5FHNA 5L9OA 2V3QA 4ZE9A 1LSTA 1Y4CA 5AA2D 2H4IA 2H98A 3HHFA 4Q30B 2B3BA 1L5TA 3O29A 4XKRA 1P1UA 3IAZA 2Q9TA 2G29A 3TZAA 3N26A 1J1NA 3M3FA 1BIYA 4KHZE 2AL4A 1MH4A 1GV8A 1Y4TA 1US5A 4OFOA 1LAXA 1YPNA 2I6EA 2UVJA 5H8FB 4P0IA 3RNNA 4NF6B 2V3UA 1ZBMA 4KYEA 1EZPA 2OK2A 3K00A 4O3CA 3PUZE 4NF4A 5I2KA 1M5CA 2X7QA 3VDFA 1NNPA 2F7CA 4XTCQ 2Q2AA 2PYYA 3O6IA 3C4MA 3UORA 1MY0A 3F11A 3LSLA 2XXVA 3U8QA 1M5BA 2PT2A 2RCBA 2B65A 2WKYA 3FUZA 1YCJA 1BTJA 3I5OA 4NWCA 1OQHA 1B3LA 4R9GA 4OZ9A 3TCHA 2IEEA 2XXWA 3PD8A 1Y1MA 1LAHE 1I69A 1IEJA 1S7YA 1VSOA 3FJGA 3RTWB 5JTYB 1MXWA 3IOTA 2A5TB 4I1DA 1TT1A 5AA2B 4FJPA 4ELRA 1OQGA 2GHAA 3HN0A 4OFJA 2VD2A 4MF3A 4EQ7A 1A54A 1FQEA 3K0VA 4G8MA 5TU0A 3JYRA 1EU8A 4TOZA 1IZ1A 1B51A 3VLVA 5DTBA 3HO7A 2ESNA 3LSFB 1FTKA 1SDXA 3K01A 4YICA 1PDAA 3H4ZA 3KFMA 5I58B 3Q28A 5J1DA 4OTEA 2O84X 5I84A 4U4XA 3H6VA 2DWIA 1SW2A 2LAOA 1MDQA 3FVKA 2ALUA 4Z7EA 1B6HA 5ELVA 2ZYOA 3QSLA 2YLNA 3C32A 1LCFA 1LFHA 2HAVA 1Y3NA 1OVTA 4PFWA 3ONMA 3RN8A 3S9LC 3OO7A 1PB7A 2XHDA 4BDMA 4AQ4A 3CFXA 5TPAA 3ODBA 3MJNA 2Z8EA 1FW0A 4XXUA 3OD7A 3TUSA 4G68A 2HQ0A 4GQOA 2P0SA 2DQVA 3EHUA 2I49A 4ELQA 3M8UA 3IOWA 4H5GA 3BBRA 4EF2A 3BFUA 2Y84A 1JQFA 1N0TA 3HPIA 2HZKA 4X9TA 1B7HA 2F97A 4OENA 1Q1KA 5M2VA 3MW0A 2DE3A 1B05A 4AB5A 2V84A 3TCFA 3PPNA 2AIXA 2V25A 3RTFB 3EN3A 4GL0A 4MFIA 1IXIA 4R74A 1AIVA 3OMBA 5CI5A 4ESWA 3RT8A 1A99A 3LBSA 3TELA 2DXYA 1N7WA 3W15C 5AA4B 3E4RA 4RPOA 2HFBA 1A7LA 3FXUA 5CRYA 4JWOA 1POTA 1Y3PA 5H8QA 4LZ5A 2I3VA 4F31B 3QK6A 2F7AA 1UIVA 1GGGA 3PMVA 4U4SA 3ILUB 3K1PA 1XT8A 4YKKA 4R6KA 4WEPA 2DS9A 4OMBA 4R2FA 2PBWA 2ZYKA 3SEXA 1URGA 5K2YA 2QMXA 2IA4A 1LAGE 4OHNA 1FQAA 3MVZA 4IO7A 4N13A 3PMWA 2ZYMA 2RINA 2V93A 1B3GA 4EQBA 1UQWA 2DVZA 3T9XB 1N76A 3OEMA 3O6GA 2DOJA 1I6AA 2NXOA 4IGTA 2GRVA 1XHYA 4YKJA 3B6TA 3CG3A 1IXCA 5CBRA 4C1TA 2VOZA 4QF9A 4HW8A 3SDFA 1O64A 1TWYA 1QKAA 3IORA 4R6HA 3WAEA 3IJXB 5CM6A 3PUYE 2I58A 1MY1A 5EYFA 2QMWA 2F36A 4YU0A 3SEVA 1IUDA 4IGRA 3UIFA 3SEWA 2ONRA 3RT6B 3CVGA 3SERA 4X48A 4PQJA 2AYSA 2FA7A 3IO6A 3N6UA 2Z22A 4QSEA 2ONKE 3VVDA 4JSDA 4ESXA 5KZTA 1O63A 1LLSA 3H03A 1FQDA 5AA1A 4X1BA 4KI0E 1POY1 3PPPA 5DVIA 2AL5A 2R71A 5ITPA 3KBRA 2O7IA 5KCJB 4KFQA 3T9HB 3SEUA 1MG1A 1N3XA 3V89B 3Q27A 1R9LA 5TP9A 3WAFA 1MQHA 1BLFA 5FTHA 5CMBA 2FNCA 4DXCA 2HAUA 3K1NA 5CBSA 2XXQA 3S2VA 5LOMA 2OWTA 3OELA 3R7XA 4BDOA 4GXSB 1SI0A 3O66A 3UA8A 3CG1A 4TQUQ 5IAIA 2DWJA 3N6TA 5H8NA 3TQWA 3KGCA 3B6WA 1NFTA 4OETA 4YMAA 1H3DA 3H6WA 3O9PA 5IKBA 3T93B 2M8CA 4YKIA 2KLFA 5FTIA 4P0GA 1PB8A 4ELOA 5F1QA 1FQCA 1XS5A 3EPEA 3TDJA 1MY4A 1B3FA 2QSXA 5DYHA 3HHGA 4LATA 1SQYA 1II5A 1MPBA 5I57B 1B5HA 3K6VA 3KJ7A 4F2QA 4YB5A 2NUVA 1SYIA 4I8CA 2THIA 1UTBB 3ILTB 1QUIA 1R1NA 4LONB 1T0KA 4FATA 4H1XA 1MXZA 1B4HA 1FTJA 4HS7A 4IB2A 1A8FA 1LBBA 4QSCA 5BWJA 1B40A 4FIMA 4I62A 1OMPA 4BLAA 5I59A 2H99A 5DEXB 4MLQA 1JNFA 3IJOB 1TFAA 1B4ZA 3ZS6A 5CC2A 1LB9A 1MXVA 2E0SA 2XXPA 4JBZA 1B1XA 3U92A 1DSNA 2I48A 5I2NB 4H8IA 3DELB 2DYXA 3FD3A 4WXJA 4OYVA 4LUBA 3QUJA 2UVIA 2NWJA 2O1LA 3GBBA 1SD3A 3TTKA 3PMXA 1H44A 1P1OA 1MXYA 2O1MA 3IX1A 4LP2B 3QXMA 2QS4A 1EZOA 2XXRA 2VD3A 3TTNA 5B7DA 2REJA 3G7WA 1USYE 3HSTA 2Q88A 5ITOA 1D3KA 4O3AA 4DE8A 2F6PA 1PB9A 2O7UA 1FTOA 1B58A 4G4PA 1SW5A 1IQ7A 1N84A 3O6HA 5F7VA 2UYFA 2E1SA 2QJEA 3VE1B 3TKDA 4EUOA 4Q5TA 4G2ZA 1B52A 4MBPA 4EF1A 3KSJA 3FXRA 3PUXE 2I3WA 4KCCA 1P1NA 3TEPA 3FVOA 4BDQA 4C0RA 1NMUA 2OWSA 1VE4A 4JWXA 4RYAA 4R72A 3MWBA 2Z8FA 4WEDA 3FASA 1B5IA 4LA9A 3TFLA 3VLWA 1D4NA 2F8DA 3D4CA 3TMGA 1LB8A 4LQ5A 2ZNTA 3UK4A 4FORA 4M1VA 3A3UA 2Q2CA 4LZ8A 4NF4B 5I2KB 1MY2A 1MQIA 1MM6A 3HCQA 4HCYA 3KN7A 1MPCA 2OLBA 1M5DA 3MZ9A 2Y7PA 1SW1A 2OCUA 2YPNA 3P7IA 1LGBC 2QRYA 3FVNA 1VR5A 3IOUA 2ZMBA 3JZJA 4FE8A 4THIA 4F1VA 1XVYA 4GD5A 3IO4A 3H3GA 1TFDA 4TLLB 1GR2A 5I56A 2F78A 3CSGA 1B3EA 3CFLA 3S9MC 5KDTA 3MQ9A 1DTGA 4QHQA 1MQDA 1M5EA 3MAMA 1NL5A 4H65A 4QRZA 2D21A 3A09A 3PPRA 4DDDA 4RXLA 3MP1A 3U94A 1HSEA 4IY6A 3FXQA 1YTVA 2ZNSA 2ZXTA 4LZ7A 3KN8A 5L9SA 4JB7A 2VHAA 2NOOA 2ANJA 4H6DA 2UXAA 2ONSA 4OFLA 2Y7WA 2F6GA 1ANFA 3JV9A 3LSXA 1OLAA 3SKPA 4R73A 3K6WA 4XKPA 3H6TA 2GHBA 4OERA 3W9VA 4FAJA 3S4UA 4PE5B 3TODA 3B7DA 4GWOA 2GFEA 1NH8A 2O68A 1US4A 4P11A 4YMBA 1XVXA 5FHOA 2I0BA 4XIGQ 3C35A 4EXKA 4UACA 1QKBA 1ZTYA 1ELJA 4GF8A 1M5FA 3OSQA 1JEVA 4QFPA 3Q26A 3Q25A 1RYXA 2G93A 1UTHA 5A5XA 4IO2A 3PUWE 2DP8A 2P2AA 1ATGA 1MPDA 4NF5A 5TPAB 5H8HA 3U93A 3G3HA 1H76A 3GLBA 3FV2A 3T66A 4DXUA 2HZLA 4G68B 3G3JA 1IXGA 3OOAA 4OXVA 5EHSA 3V8XB 3KG2A 4RK2A 1MQJA 3T22A 1QW0A 3BKIB 2Y7RA 3E13X 1AL3A 3DP8A 2QPQA 3EQ1A 1D9YA 3KZGA 4WKMA 5DT6A 3MVXA 3L6GA 4G8NA 1Z7ME 1DMBA 3OO8A 2O51A 3O2AA 4F3PA 5B70A 2O69A 4F1UA 2RKMA 4GRKA 1B7ZA 5L9MA 2XXUA 4O3BA 2PVUA 3CRBA 1A55A 1EZ9A 3TPAA 4FEDA 1ZLQA 5JEIA 1DTZA 1EH3A 2CZLA 1B7UA 5H8QB 3CFZA 1XC1A 4DLDA 2F34A 4DXBA 3S9EA 3VLUA 4NF8A 4E0WA 3E9XA 4ZEBA 5ICTA 4DCXA 3T9VA 4QFNA 1LFIA 2ABHA 4OVJA 2UYEA 2H25A 2W7YA 2DE2A 4GOTA 2F5XA 1OVBA 1CB6A 4F18A 3O97A 1SI1A 2Y7KA 4G77A 4E0XA 3SETA 2R9JA 4KYSA 3IR1A 3C31A 5AA3A 1DPPA 1H45A 1NH7A 1RKMA 4F3GA 3MC2A 1JVYA 3MUQA 4H5FA 3KOSA 4GL8A 5H8FA 1NNKA 2QS1A 4KR5A 1QUKA 4DIGA 3V5AA 4NF6A 3IOVA 1B46A 4IY5A 3RY3A 4F39A 2RC9A 4ZS9A 2HEUA 1Z7NE 2V3TA 3PPQA 3LSWA 1A8EA 1FCKA 2BJJX 4RA1A 1DOTA 2XD3A 3C9HA 4FEBA 4GFRA 1PEBA 1NNTA 3GBAA 3C34A 3D4GA 4YAHX 3KN3A 4Q0CA 3TYHA 2XXXA 4LVQA 3AXFA 5FHMA 4Z0IA 4N6PA 3PV0E 1KWHA 3MPKA 3OENA 1SW4A 2VP1A 5JTYA 2H5YA 2A5TA 1R9QA 5AA2A 1N3WA 3GZGA 2QS2A 5DVFA 4H0WA 5HM4B 4ZDMA 4POXA 4LQ2A 4G8HA 4L17A 4JSOA 4KD5A 1QJMA 3C36A 4KCDA 4PFTA 1PBPA 4U1ZA 1Y1ZA 4ZEIA 4IO6A 4F2OA 2DE4A 2OBGA 1FQBA 3CR9A 3L6HA 3R6UA 5HBCA 1XOCA 5TP9B 1IIWA 1URSA 2PMSA 3TCGA 3CSBA 1I6QA 3PPOA 4RK9A 5I58A 3T96B 3DP4A 2X26A 3K02A 3IB2A 1ZKBA 4MH5A 1ZMGA 3MBPA 1GVCA 3KEIA 4GLIA 2Z8DA 2XX9A 3QYTA 4GXAA 4BDLA 5H8NB 3VV5A 5AE4A 3VXBA 4IO5A 3FIRA 2B3FA 3FZVA 1Y9UA 1B32A 3ZSFA 1MH3A 4DZ1A 4PETA 3B6QA 3CIJA 2XXHA 3TAJA 3U72A 4AB6A 4OQOA 1B1HA 4RJZA 3PGFA 4BDNA 4F1YA 1DPEA 3THIA 1URDA 3RUMA 3OO6A 5CMCA 2R6GE 3KOTA 4NTLA 5BUUA 3TQLA 3PU5A 4GVOA 4RNSA 2DSFA 1LBCA 2ZYNA 3V83A 1B0LA 3FATA 1QULA 4R6YA 2XXYA 4C1UA 4ND9A 4QFOA 1QUJA 4FECA 5I59B 2Z23A 1HSJA 1B0HA 3A3CA 3MZ1A 1SBPA 5AA4A 1MXUA 3LC8A 4H8JA 3VVEA 2PX1A 3OO9A 4JDFA 1QVSA 2PT1A 4KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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