3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
2B3FA 4NF4B 4AB5A 4X9TA 4F3GA 2RCBA 3D4GA 2GRVA 2VOZA 3PMVA 2XXHA 3FUZA 1UTBA 5EYFA 1IXGA 2F8DA 1EZ9A 3TCHA 3V89B 3TTNA 1GVCA 3KSXA 3RLFE 2NOOA 5K2XA 3PGFA 1HSEA 1NFTA 2V3TA 4NF8A 5H8HA 2VHAA 4UACA 1D9VA 1NNKA 5DVJA 1MH3A 4IGTA 1QW0A 1B3FA 4R72A 1I6BA 1TFAA 2GFEA 3IAZA 2F78A 2PMSA 4ZEIA 3EPEA 4NE4A 2Y7IA 5I57A 3TEPA 5DT6A 1N3XA 2O1MA 1ZU0A 5JEIA 2DE2A 3PUWE 5ELVA 1NMUA 2NWJA 3S4UA 5HBCA 4OFLA 3MAMA 3QYTA 5I59B 5L9OA 5I2NB 2BJJX 4RY1A 4Z7EA 2PT1A 4YZZA 1A8EA 4P0IA 4NF6A 3N26A 1MY3A 3FVGA 3KN3A 1M5DA 5CMBA 4KCDA 3QSLA 1SVXB 4ZEFA 2HFBA 5AA1A 3VVFA 4BDRA 2XXYA 4ZS9A 2XX8A 3ONMA 4BDLA 1NH8A 2OK2A 2PYYA 4OVJA 3BFUA 3O6GA 5HPQA 2VP1A 1LB8A 2ZYOA 3QXMA 4RPNA 2H99A 2OZZA 1DSNA 2ONKE 4UA8A 3PD8A 3C36A 1D4NA 2QS4A 2KLFA 2DXRA 4ELOA 2AL5A 1QKAA 1B5IA 3H3GA 2P2AA 4QFPA 3PV0E 3K1NA 1WVJA 4NWDA 1BTJA 4KPTA 1Q35A 3H6TA 3ODBA 3IR1A 3MWBA 4YB5A 4DZ1A 4GRKA 3H7MA 5CM6A 1P1NA 1AOVA 2I4BA 3LR1A 4BLAA 4HCYA 4NF4A 5DEXB 3B6WA 5CMKA 5K2YA 1S50A 3M8UA 5JTYB 1JW1A 4FEDA 5I2KB 4IO6A 4G8MA 3DLNA 3E13X 3TTRA 5ITOA 3E3KA 5L8DA 1VFDA 2YJPA 2OWSA 3MP1A 4JBZA 3UORA 2DVZA 1PB9A 1O63A 1Y1ZA 3RY3A 4GVOA 3A3CA 2H25A 5TP9A 1PC3A 4JSOA 2X7PA 2VD3A 5A5XB 3BKIB 1JQFA 4F1UA 3FV2A 1ELJA 1USYH 1MM7A 4Z0IA 3ZSFA 4EF1A 4FJPA 3Q29A 4LZ5A 1MXZA 5FTHA 3PPOA 4YAHX 3KJTA 4G77A 1MQIA 3N94A 3OXNA 2OJTA 5I59A 5I2NA 4LUBA 5FHMA 3FVOA 4OEVA 4DDDA 4EXLA 1O64A 2XD2A 3FD3A 3BFTA 4THIA 4I8CA 5FTIA 4YB6A 2QMWA 5AE4A 1H43A 2X7QA 2Z8EA 2DP8A 2OLBA 4M1VA 4G68B 5BUUA 4OEUA 3EHSA 4NF5B 3PU5A 3R7XA 4FE8A 3SEYA 3FJGA 3ZS6A 4XKRA 3CSBA 1MQHA 3KGCA 4GL8A 3M3KA 4X48A 4YB7A 3SETA 4OFJA 3RUMA 1MDP1 3O6HA 4ZECA 4JSDA 2ZNUA 1I6AA 2XD3A 1MPDA 1Y20A 3SDFA 1QUJA 4MLVA 4R6KA 2ONSA 1IXHA 1SI0A 1GR2A 1FTMA 3CRBA 2Q2CA 4ZEBA 1A55A 2AYSA 2E0SA 2PVUA 1LBBA 4H65A 3TYHA 4U22A 1P99A 1MH4A 2VD2A 4OFOA 3AXFA 5DEXA 4F1YA 3TQLA 4C1UA 1B6HA 2NXOA 3VV5A 4YKKA 1IEJA 2XHDA 5KDTA 4HTGA 3MVZA 3SERA 3D4CA 4OQOA 5I2KA 4F31B 2IEEA 3TMGA 3CG1A 3T96B 2QMXA 3U92A 4R2BA 4X1BA 4F3SA 2B3BA 4F1VA 5DYHA 3MBPA 5FHOA 2QSXA 2F35A 1DMBA 1M5FA 5H8NB 1A8FA 5L9MA 1JW4A 3K6WA 4BDQA 5L9SA 5A5XA 3H06B 3MJNA 3OOAA 4FIMA 4GXAA 1FQFA 2OCUA 3O66A 1EZPA 2PT2A 4WXJA 5KZTA 3LUYA 5H8QB 1N76A 2RC8A 4MFIA 1MQGA 2DSFA 1MY2A 4N6PA 1M5CA 3WAEA 5ICQA 3HO7A 1Y4TA 1JEVA 1JW5A 3MP8A 1EU8A 4YKPA 1CE2A 2D5WA 1POY1 2HXWA 3FJ7A 3TKDA 2AIXA 3MW0A 3T66A 3N6UA 1OQGA 4GOTA 1YAEA 4RJZA 4LVQA 4NF5A 3MUQA 3TZAA 2RF1A 1II5A 5I56B 3CIJA 1DOTA 4WEPA 2ZNTA 4MLQA 2X26A 3R26A 3FV1A 1MQDA 5CMMA 4R75A 1P1UA 1LAFE 2V3UA 2F97A 2Y7KA 4PFWA 5CBRA 1Q1KA 3K1PA 4OWDA 3HPIA 3FGSA 1JVYA 4F22A 4NTLA 1PB7A 3VLVA 4ELRA 3ZKKA 3K02A 2V93A 5EHMA 2I58A 3W9WA 3S9EA 1PBQA 3OENA 2XXRA 3T22A 1FTLA 1P1QA 1Z7ME 4ESXA 4OENA 1MXWA 3KN8A 4R6YA 1B0LA 4Q8RA 3IB2A 3SEXA 2DWAA 1R9QA 1A7LA 4U1ZA 2Y7WA 4EDPA 2ZMBA 2I3VA 1B7HA 2XXUA 4AB6A 4FECA 1L5TA 3K6UA 4OMBA 2Y7RA 4KQPA 4ELQA 4LQ2A 2HZKA 1JEUA 2QRYA 1I69A 3C33A 1FQEA 5H8NA 5TP9B 1UQWA 5B70A 3K1MA 4PETA 4F18A 3TDJA 1R9LA 3PPQA 3RN8A 2RKMA 4OYVA 4M4GA 3RNNA 5I84A 1LB9A 1NNFA 4DXUA 4XKNA 3EHUA 5AA2D 3PMWA 2Q2AA 5H8QA 3P7IA 3FJMA 1B9JA 3OEKA 3VLWA 2F6PA 4ZE9A 1N84A 4TOZA 4G68C 4R73A 3ILUB 4ZE8A 1LFIA 5TPAB 4U4SA 2ZYNA 3L6GA 1KWHA 4IO2A 4Q0CA 3OEMA 1IITA 4DE8A 3U8QA 2UYFA 1SBPA 2Q9TA 4H67A 2ANJA 5I56A 1Y3PA 1PB8A 1FQAA 4OHNA 4QF9A 2O7UA 3U94A 1BIYA 3CFXA 2ESNA 3QAXA 3Q28A 4ZEKA 3GZGA 1BLFA 1B3LA 3CFZA 3A09A 2DWIA 1B46A 4ZZAA 2HCAA 3SEUA 2XXVA 4RNSA 3HSTA 1B05A 1XVXA 4OZ9A 5TU0A 4G8HA 1DTGA 1N7WA 3O28A 1OVTA 4XTCQ 1AH5A 3F11A 3USDA 3CVGA 3FXUA 4JWOA 1FTKA 3KZGA 2NUVA 5KDTB 1MM6A 3QUFA 2DE3A 2A5TB 5CRYA 5KCJB 2DS9A 4JWYA 1Y1MA 4GXSB 3O9PA 3FIRA 1J1NA 3OO9A 3TTLA 3C9HA 2F7AA 2XXTA 4GF8A 3IK6B 4FAJA 2UVHA 4QSCA 1UTHB 1D9YA 1HSLA 1AIVA 1R6ZA 3M3FA 4MH5A 3PPRA 1H3DA 3IB1A 3N5LA 4EQBA 3C32A 3DM0A 1LFHA 1QUIA 2WKYA 1LAHE 1NL5A 1FW0A 1T0KA 1OIBA 1SW2A 3B7DA 1B4HA 3EN3A 1FQCA 3VXCA 3MC2A 5TPAA 1XOCA 3MPKA 3DP8A 4HW8A 4I1DA 4U4XA 3K01A 1SYIA 3O6IA 2YLNA 4GLIA 4ESWA 4F3BA 3O29A 4F19A 1FTOA 4BDNA 3K0VA 1P1OA 3JV9A 1N0TA 1B0HA 2H9BA 2XX9A 1BP5A 1Y9UA 2XXPA 2LAOA 5J1DA 1QUKA 5H8FB 2D3IA 4N13A 2F36A 3QUJA 4PFUA 2I48A 3C34A 1D3KA 4KHZE 1MQJA 2F6GA 3EQ1A 5H8SA 1CB6A 4DIGA 2UVJA 1P1WA 3EHTA 1VFEA 1MPCA 1TT1A 3A3UA 3W9VA 5DVIA 3TUSA 1MXYA 3GLBA 3MP6A 3S9NC 3WAFA 4TLMB 4IB2A 5BWJA 1MS7A 1OQHA 2REGA 3TODA 3GBBA 3MVXA 4EQ7A 2DE4A 4LQ5A 4ZDMA 1VE4A 4PP0A 3EF7A 4U1OA 3KOTA 3CSGA 4K3FA 3I6VA 4LATA 5DVFA 3TCFA 3ZKLA 1GV8A 2V84A 3IO4A 2A5TA 3RT8A 1HSJA 5AA4B 3TCGA 2ZYKA 3IOTA 4C1TA 3LBSA 3S9MC 4ECFA 1LSTA 5KCJA 5IAIA 1LBCA 2O1LA 1YTVA 3RT6B 1B3EA 2DWHA 3DELB 2QS3A 2RC7A 4EQ9A 1NNPA 4PFTA 2REJA 4KR5A 3GBAA 4ZZEA 3PUYE 3OSRA 1F9BA 1UTHA 3TPAA 2GHAA 5DTBA 2THIA 2I49A 3OMBA 3L6HA 1ZKBA 5LOMA 3H4ZA 4BDMA 1A99A 3HHFA 3CR9A 1EZOA 4FATA 5AA2B 1ANFA 2UVGA 1US4A 4P11A 1XHYA 2PBWA 4GWOA 3O2AA 4R6HA 2DYXA 4E0XA 3B6TA 1MPBA 4OTEA 4O3BA 2HZLA 3TTKA 3LSWA 4GFRA 1B3HA 1POTA 1XC1A 4DLDA 2UVIA 5FHNA 5I58B 3V83A 1SQYA 1RYXA 1QULA 4L17A 4OESA 4ND9A 2I3WA 3G3FA 3ECRA 4OETA 3H6UA 4I9DA 1B4ZA 3U72A 4DXBA 1N7XA 4YKJA 2O7IA 2QL3A 1QJMA 4C0RA 5H8FA 4QSDA 1B5JA 4Q5TA 3UN6A 3IORA 2P1SA 4HS7A 1URDA 1ZMGA 4NWCA 2HAUA 4GL0A 2DOJA 3DP4A 4KI0E 4XKQA 5F1QA 1OVBA 4PQJA 2IA4A 1ZTYA 1YPNA 1SI1A 4KCCA 3FZVA 3KSJA 1BKAA 2O84X 3TELA 1M5BA 3H6VA 3IJXB 3CI8A 3OO8A 4U2RA 4YKIA 1B2HA 1YCJA 3IJOB 1RKMA 2HEUA 4MF3A 2W7YA 1GTKA 3FVNA 2I4CA 1PDAA 1NKXA 3PPPA 2Z23A 3G3GA 1OMPA 1Y4CA 2VGQA 4E0WA 2XXQA 4IGRA 3LSFB 4EXKA 1QVSA 4QFOA 3Q25A 1MRPA 3U93A 2NVUB 4GQOA 3HV1A 4X1DA 3N6TA 2OBGA 3FXRA 3T93B 1N04A 5AA4A 2E1SA 4I62A 1XT8A 1VSOA 4IO7A 2QS1A 2F7CA 4U21A 4DCYA 5AA3A 1B40A 4DXCA 1RYOA 2O69A 2H5YA 4ISUA 2FA7A 4O3AA 1IQ7A 3PD9A 3MZBA 3IX1A 4F3PA 2I6EA 5ITPA 1N3WA 4NMYA 3G3KA 1MY0A 4R9GA 4R74A 3GXAA 3Q27A 4FORA 5CC2A 1ZJLA 3PMXA 4QFNA 1NNTA 4YMBA 2F7BA 3FATA 1R1NA 2D21A 5AA2A 3QK6A 4LA9A 5HM4B 1OLAA 1PBPA 4JB7A 5EHSA 4LZ8A 4QSEA 1SYHA 2Z22A 4KD5A 1MDQA 1LFGA 4IO3A 3SESA 4KYEA 3S9LC 4H5GA 1B1XA 5I58A 4IY5A 4H8IA 3SEVA 3Q26A 2HQ0A 1IIWA 3B6QA 4F2QA 1B52A 4Q30B 1I6QA 2YPNA 1US5A 4YICA 2RINA 2UXAA 3O97A 3BBRA 3KN7A 3MZ1A 1SW4A 4QFKA 1ZLQA 1B1HA 1LCFA 1B32A 1MY4A 3R6UA 1EH3A 5JK4A 4LONB 2H98A 3T9UA 3V8XB 4BDOA 1SW5A 4IO4A 1LLSA 3PUZE 1SDXA 3KG2A 4XXUA 4H0WA 3MQ9A 3OD7A 3RQTA 2ZXTA 1H45A 1A54A 2F34A 3KFMA 1FTJA 4KYDA 1MXUA 5F7VA 1GGGA 3G3HA 3IOVA 2QS2A 2OWTA 4IY6A 4JWXA 3RTWB 1PEBA 3TFLA 1DPPA 4F29A 1IZ1A 3FXQA 3UA8A 4YU0A 4EUOA 2P0SA 4PFYA 1SD3A 1DPEA 3C31A 1S9TA 4QRZA 4ONYA 4R9FA 2FYIA 2HAVA 2G93A 3UP9A 3KJ7A 4RYAA 2Q8JA 4WEDA 4NEDA 2AL4A 1WDNA 2GHBA 4AQ4A 1UIUA 1B5HA 1H44A 3T9XB 3MPLA 1AMFA 3MZ9A 1ATGA 2Y84A 3THIA 1ZIUA 3QIMA 5ICTA 3VLUA 3K2DA 2ABHA 3PUVE 1LAGE 3K00A 4MBPA 3CFLA 2QJEA 2I0CA 2UYEA 2GH9A 1M5EA 4GIZA 3E9XA 3KOSA 1A40A 4KYSA 4JDFA 4JXIA 2CMOA 1MXXA 2XXIA 1MY1A 2FNCA 3IOWA 3PUXE 4RPOA 1XVYA 1FQBA 2R71A 3OSQA 4LZ7A 4ELPA 4P0GA 1AL3A 3RTFB 2DWJA 4G2ZA 3FVKA 4HCWA 1IXCA 3OELA 1Y3QA 3T9VA 1TFDA 2QPQA 1B3GA 3G3JA 5CBSA 5M2VA 3TAJA 4R2FA 2V25A 1LCTA 3HHGA 4RXLA 4O3CA 1URGA 3JYRA 3SEWA 3H03A 1QKBA 3RPWA 1LGBC 1TXFA 1FCKA 1LAXA 3FASA 3OO7A 3I3VA 2XX7A 1USYE 3KEIA 4G4PA 3T9HB 2G29A 2ONRA 3SKPA 2V3QA 3JZJA 2F5XA 1B58A 1O7TA 1Z7NE 1B7ZA 2RCAA 3IL1B 4POWA 2CZLA 3VVDA 3IB0A 2Z8FA 1UIVA 3HCQA 2RC9A 5JTYA 3K4UA 4PE5B 3I5OA 1UTBB 3UK4A 2ALUA 3OO6A 2I0BA 5CI5A 3C35A 4RK2A 5ISUA 1JNFA 2B65A 4TLLB 1VR5A 3K6XA 4KFQA 5H8HB 4NF8B 1IUDA 2O51A 2A5SA 3TQWA 2R9JA 3LC8A 1OLCA 3KBRA 4H6DA 3TTMA 1MG1A 1B7UA 1B51A 1XS5A 3LSLA 3LSXA 3MVYA 1URSA 2H4IA 4DCXA 3VXBA 1DTZA 3VDFA 2XXWA 4H8JA 4G8NA 5I57B 2DVCA 3DP6A 2DXYA 4QHQA 3HN0A 2R6GE 1MXVA 1Y3NA 4TQUQ 4RK9A 1JVXA 1NH7A 1TWYA 4QFLA 3E4RA 3H6WA 2ZNSA 3VE1B 4H5FA 3S2VA 3VFJA 4F39A 2PX1A 2ZYMA 4NF6B 1JETA 4N07A 4XKPA 4FEBA 1FQDA 3W15C 1IXIA 4F2OA 4XIGQ 1ZBMA 4RA1A 3G7WA 4G68A 3UIFA 1H76A 4ZEDA 4YMAA 4POXA 4LP2B 3V5AA 3C4MA 2DQVA 3IO6A 1SW1A 5CMCA 2XXXA 4U23A 4EF2A 3M3LA 3RGYA 2M8CA 2Z8DA 3IOUA 2O68A 3U1OA 3K6VA 3MVWA 2Y7PA 4IO5A 4WKMA 3UGWA 3ILTB 1WODA 5B7DA 2Q89A 4OXVA 4GD5A 3VVEA 2Q88A 1S7YA 4H1XA 3G3IA 3PPNA 3CG3A 5IKBA 2O6AA 4OERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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