3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
3IB0A 3VVDA 4G68A 3PU5A 4PFWA 2O7IA 4ELPA 1TXFA 3DLNA 3V5AA 2XXWA 1MY0A 3O6HA 5I59B 3QSLA 3PPQA 4WKMA 2E0SA 3K4UA 2YPNA 1N76A 3IOTA 4R9FA 2BJJX 1UQWA 3CG1A 3G3KA 2X7QA 1B32A 3I3VA 1IIWA 1NNPA 3OD7A 3OO7A 3R6UA 3AXFA 3KBRA 1DPEA 1VFEA 1DOTA 2F6GA 4KD5A 4E0XA 3IJOB 2E1SA 1VE4A 4ZS9A 4DXUA 1B0HA 2Y7PA 1B40A 4GXAA 3VLVA 3PMXA 2DWHA 2O69A 3CFLA 2V3UA 1B6HA 2REGA 4PQJA 5CMKA 1Y3PA 4F18A 4UA8A 4RXLA 1Y20A 4R6HA 2Y84A 2XXXA 4IO6A 1M5DA 3T9XB 1A8FA 2X7PA 4PE5B 1DPPA 3IOVA 2ONSA 3UORA 2DQVA 4OERA 2REJA 5I58B 1MXYA 3R7XA 2Z8FA 2M8CA 5CRYA 1NNKA 4G77A 1SQYA 3B6QA 1SW5A 3ILTB 3S9MC 4G8HA 4NE4A 4JWXA 4C1UA 4YMAA 3QXMA 2AYSA 2RC9A 2XXIA 4OXVA 1PEBA 1HSEA 4H1XA 3MZ1A 2D21A 3IL1B 2QMXA 1FTJA 3FVNA 4P0IA 1QJMA 2QPQA 3MUQA 1WODA 3K6VA 1LGBC 4POXA 4R2BA 4KYEA 4EXLA 5CI5A 4HS7A 2DP8A 4LQ5A 1M5EA 4YKIA 2UVIA 5CBRA 4OENA 2O7UA 4ELOA 3PPRA 3MVWA 2YJPA 2DXRA 5DVIA 3T96B 2DOJA 4KFQA 3IOWA 3U92A 2RCAA 5FTHA 2PX1A 2HCAA 1MPBA 1LB9A 2R6GE 3L6GA 1JEUA 1N7XA 1MG1A 1VSOA 4NWDA 3QAXA 5FHNA 3U94A 2V25A 2FYIA 3U93A 5LOMA 2ONKE 4QFLA 1MM6A 2GFEA 1CB6A 1DSNA 3VDFA 3MP8A 4ZEDA 2VD3A 1GTKA 4ND9A 1B4ZA 2D3IA 2ZYMA 3P7IA 4F1YA 1B0LA 5ITOA 4H6DA 3T66A 1LCFA 1B46A 3PGFA 3O29A 1MQDA 3MZBA 4LONB 3N5LA 3RGYA 3E4RA 4XXUA 3EHUA 2XXVA 4JBZA 4GF8A 4KCDA 4YZZA 4QFNA 3FVOA 1US4A 5TPAB 1LFGA 5TP9A 3G3HA 5CBSA 3FATA 3TCGA 3TCHA 2FA7A 4K3FA 4O3BA 5J1DA 1LB8A 2HZKA 4G4PA 1GV8A 2UYEA 4DE8A 5AE4A 3ZSFA 1ZBMA 5L9SA 2Y7WA 4ESXA 3SETA 3IOUA 1NH8A 2UXAA 3G3IA 3FD3A 4IY6A 3MAMA 2WKYA 5HPQA 4EQBA 3FIRA 2RINA 5BUUA 3K02A 2F35A 4TOZA 4H8JA 3JYRA 4N13A 3WAFA 1A55A 3H6TA 3H4ZA 5ISUA 2QS3A 3FJ7A 5DT6A 3JZJA 1DTGA 3JV9A 1PBQA 2H25A 2F8DA 1B5IA 3U72A 1RYOA 2NVUB 1PC3A 4XTCQ 3ILUB 1B3EA 2HAVA 3EHSA 1OQHA 3TQWA 1XVYA 2F78A 1T0KA 3VXBA 4XKRA 1SD3A 5JTYA 3N6UA 1USYE 2DWAA 1B5JA 1P1UA 3A09A 4QFKA 3VVEA 3OEKA 1EH3A 3TTNA 1LLSA 4ZZEA 2XXPA 4JWOA 5IKBA 3TODA 2HAUA 3MP1A 3U1OA 1Y1ZA 3CFXA 3PPPA 2DWJA 4QF9A 3DP6A 2Q8JA 1JVXA 3HCQA 1D4NA 4ELQA 5A5XA 3OELA 3OMBA 1MS7A 2ZNSA 3W9VA 1FCKA 1J1NA 1QULA 1PB8A 4NF8A 4HW8A 3PPNA 3TZAA 3TEPA 3M3FA 1RYXA 3HO7A 1M5CA 3GZGA 5AA1A 3IO6A 3ONMA 3EQ1A 1GVCA 1D3KA 3KZGA 2XXUA 3MPLA 1IXHA 2DS9A 1H43A 4LA9A 1AH5A 4KPTA 1DMBA 4GRKA 4H0WA 3I5OA 4R73A 1LFIA 4QRZA 4OHNA 3HPIA 4GFRA 2LAOA 4H65A 2Q89A 1B05A 4U22A 1O7TA 1IZ1A 4YMBA 3TMGA 3H6WA 2OK2A 3UIFA 4M1VA 2OCUA 3HHGA 3H6UA 1P99A 3C35A 5DYHA 3C31A 5KCJA 1QUKA 1P1WA 5H8HB 4OMBA 4ISUA 1DTZA 2F5XA 1AOVA 5CMCA 3PMWA 3MPKA 3W9WA 1FQDA 4JB7A 1XHYA 3FV2A 5H8SA 3KSXA 2F7BA 3QIMA 4KI0E 3MZ9A 3FXQA 4N07A 1FTKA 1ZJLA 3FUZA 3K00A 1D9VA 3OO6A 1NL5A 1EZOA 4F1VA 3KJ7A 3VXCA 4H5FA 2IEEA 4ZEIA 4FORA 1A99A 3TFLA 1Q35A 2I3VA 2O51A 4RNSA 5I56B 4XKNA 5I84A 4GIZA 1SYIA 4QFPA 5BWJA 4KYSA 2XHDA 3IX1A 3CR9A 1B7HA 1IXGA 3VV5A 3MC2A 1H3DA 2V84A 2ONRA 2W7YA 5AA2D 2YLNA 3MJNA 3THIA 1BKAA 2ZYOA 2UVJA 1ZIUA 3ODBA 1LAFE 2DE3A 4L17A 2H5YA 2GHAA 5ELVA 3CIJA 1JW5A 4ELRA 1URSA 4OYVA 4RYAA 4EQ9A 4H67A 2QS4A 4R9GA 3O2AA 3SDFA 4NWCA 5I57A 1POY1 5DEXB 2PT1A 1I6AA 2G93A 3RY3A 3V8XB 4G2ZA 4YB6A 3TTMA 3UK4A 3SERA 4OEVA 3K6UA 3TUSA 3VLUA 2NWJA 1SW1A 3FJMA 1WVJA 1AL3A 1I69A 4X1BA 3N6TA 1R9LA 5L9OA 3OSRA 1SW2A 3PV0E 2XX7A 5HBCA 2F34A 4ZDMA 3BFUA 3BFTA 5I2NA 3LSFB 4GWOA 4UACA 2A5TB 1B5HA 4BDQA 3S9NC 1MXWA 1BLFA 3TQLA 1PB9A 4EUOA 1MY3A 3CSGA 4GL8A 4BLAA 1IEJA 1UTBB 4LZ7A 4H8IA 5H8QB 3OENA 4G8NA 4LQ2A 1NMUA 1B7UA 2ANJA 1TT1A 1FQBA 1BP5A 4DIGA 3GXAA 4GOTA 4OEUA 5ICTA 1OLAA 2XXTA 3OO9A 1IXCA 4NF4B 3TTLA 5AA2A 1M5FA 2VP1A 3B6WA 1UTHB 4OFLA 2OWTA 5H8FB 2F7CA 2VHAA 4PFYA 4KYDA 3E3KA 4FE8A 1SYHA 2P1SA 1MXXA 4R2FA 1QVSA 1IQ7A 3RN8A 1B7ZA 1OQGA 4YKPA 5H8HA 3USDA 1B3GA 4NF5B 4R74A 1BTJA 5EHSA 4ONYA 3B6TA 2H4IA 5AA4A 1MPDA 3KOSA 4FEBA 1ZLQA 1S9TA 5KDTB 2Z23A 1H45A 1B3HA 3ECRA 4EDPA 3BBRA 1XVXA 1OVBA 3LUYA 1XC1A 5L8DA 4F3GA 4THIA 3U8QA 1HSJA 2D5WA 1QW0A 3OO8A 5FHOA 4U23A 4Q5TA 4R75A 2I4BA 3MVXA 2QJEA 3PUZE 3FJGA 1NNTA 3CRBA 1Y4CA 1GR2A 5JK4A 4R6YA 4X1DA 4C0RA 3N26A 2PMSA 1A54A 3MP6A 4WEDA 4XIGQ 2OLBA 2P0SA 4H5GA 4YB7A 2XX9A 5I59A 2NXOA 1IUDA 5H8NB 5L9MA 1B51A 1FQEA 4JSDA 4QHQA 2R71A 3G3FA 4OTEA 1MQGA 1MXVA 4OZ9A 3F11A 4OVJA 1YCJA 2RF1A 1Y1MA 2HXWA 5CC2A 4BDOA 1O64A 3KGCA 4ESWA 4FECA 2QRYA 1SBPA 4F3BA 4TQUQ 1IXIA 1MY1A 1ZKBA 1MDQA 2O84X 2RKMA 5IAIA 2F36A 3C32A 1L5TA 5DEXA 1S7YA 4F39A 4G68B 3RPWA 4RJZA 4NEDA 3FVGA 2PVUA 3T9VA 3BKIB 3PUXE 3S9LC 1D9YA 4DXBA 4PP0A 5DTBA 4MH5A 1MY2A 1B2HA 3PD8A 2I58A 3UN6A 3KOTA 4IGRA 2Q9TA 2O68A 3O9PA 2QL3A 2A5TA 1Y4TA 3CSBA 3K1MA 2ZYKA 5I58A 4QSDA 4DCYA 1CE2A 4U4XA 1JNFA 2HZLA 4ZECA 1B52A 3PUYE 2Q2CA 4ZEKA 2ZMBA 1WDNA 4TLMB 1FW0A 5AA3A 2Y7KA 3IJXB 4Q30B 1H44A 1ANFA 1XS5A 2IA4A 3HHFA 2Z8EA 1Y3NA 4FAJA 2UVHA 3T93B 2O1LA 3Q27A 3M3KA 3RLFE 3K01A 1R1NA 3QYTA 5DVJA 2GH9A 2P2AA 4HCYA 2DE4A 3OXNA 2I0CA 4OQOA 4YB5A 3RUMA 2I3WA 2XXRA 3IK6B 2AL4A 5F7VA 1ATGA 4NF5A 1H76A 2G29A 4IO7A 4MLVA 2XX8A 3FV1A 4ZE9A 2AIXA 3C34A 4HTGA 3ZKLA 4JDFA 1SDXA 4Z0IA 3RTFB 3HSTA 3SESA 3TCFA 3MBPA 4IGTA 1YAEA 2GHBA 1B1HA 4HCWA 3UA8A 1LBCA 3FASA 4U2RA 3UGWA 2PBWA 1N7WA 1R6ZA 4MF3A 4ECFA 1N04A 2H9BA 3G3JA 2Z8DA 4JXIA 4NF6B 4YAHX 4YU0A 3Q26A 5KZTA 3LBSA 3GBAA 3MW0A 3RT8A 2B3BA 2VGQA 4DLDA 1ZMGA 5ITPA 3ZKKA 2XD3A 2QMWA 2O6AA 1NH7A 4QFOA 4WEPA 5TPAA 3H6VA 3Q25A 3MQ9A 2V93A 1F9BA 3C36A 4OWDA 4F3SA 1FQAA 1VR5A 2RCBA 4ZE8A 1LBBA 4IO4A 1P1OA 1VFDA 2RC7A 1EZ9A 3VVFA 1TFDA 2V3TA 2RC8A 2I0BA 3EPEA 4I8CA 3KN3A 5I2KB 3IORA 1ZTYA 1R9QA 3K1PA 3KSJA 1B58A 3LSXA 2Q88A 1B9JA 2I4CA 2GRVA 4FATA 2ZYNA 3FVKA 4LVQA 2ESNA 4RY1A 4N6PA 2THIA 4BDLA 1QUIA 1RKMA 3T9UA 1UIVA 1MXUA 3SEXA 5TP9B 4E0WA 4Z7EA 1MDP1 3PMVA 1BIYA 3TELA 3HN0A 2UVGA 3OSQA 3E13X 3TYHA 5TU0A 4I62A 4P0GA 3C33A 1MRPA 3W15C 1ZU0A 3C9HA 1US5A 1MM7A 3SEYA 3QK6A 3MVZA 1I6BA 1OIBA 2ABHA 4NMYA 4JSOA 3T9HB 2VOZA 4LZ5A 4P11A 4AB5A 5F1QA 4OETA 1POTA 1A40A 2ZNUA 2PYYA 3CFZA 1N84A 1S50A 2OZZA 4YKKA 3IB1A 1LFHA 4MFIA 3Q28A 3V89B 3PPOA 3FXUA 3CG3A 3KN8A 4F29A 4RPOA 1OLCA 3S2VA 2HEUA 4YKJA 1OVTA 4BDNA 4U4SA 2I48A 3VFJA 1MQHA 1A7LA 4POWA 2DWIA 4IY5A 3D4GA 3TDJA 1P1NA 4ZEBA 4AQ4A 4FEDA 2DVZA 1QKAA 2AL5A 1MH3A 4KCCA 5EYFA 3RTWB 4KHZE 3R26A 3TAJA 4DCXA 4U1ZA 3ZS6A 4OESA 1XOCA 5JTYB 4PFUA 2XXHA 4PFTA 2Z22A 3EN3A 3V83A 2DXYA 2HFBA 4Q8RA 4KR5A 1P1QA 4OFJA 4EF2A 1FQCA 3PUVE 1Z7NE 2QSXA 4LZ8A 2B65A 4IO5A 2XXYA 3K0VA 5A5XB 5CMBA 3H03A 2XD2A 5K2YA 2DYXA 1Z7ME 2Y7RA 3VE1B 4NF8B 1N3WA 3IAZA 3O28A 1MY4A 2FNCA 4EQ7A 4GLIA 3SKPA 3KG2A 4RK2A 4TLLB 4AB6A 3HV1A 4RK9A 3O66A 5K2XA 1MPCA 3K1NA 4RA1A 1IITA 1ELJA 2V3QA 4YICA 4WXJA 4NF6A 3RQTA 1LAXA 4C1TA 1LAGE 2QS2A 4QSCA 1MXZA 1TWYA 3O6IA 1URDA 3E9XA 4GD5A 3OOAA 1JEVA 4O3AA 4ZEFA 4NTLA 3MWBA 1MQJA 3CI8A 3RT6B 3O97A 5KCJB 5I56A 3EF7A 4XKQA 5I2KA 4G8MA 1TFAA 1Y3QA 1JW4A 4F31B 1JVYA 4ZZAA 3S4UA 4F1UA 4I1DA 3G3GA 1O63A 2UYFA 4RPNA 4GQOA 5EHMA 3L6HA 4G68C 1FTLA 1B3LA 3GBBA 2ZNTA 4R72A 2R9JA 5CMMA 1AMFA 3KEIA 5FHMA 2H98A 1JW1A 3SEWA 2XXQA 3PUWE 3H7MA 1NNFA 1FQFA 3UP9A 4F19A 3D4CA 4OFOA 1EZPA 4MLQA 1B4HA 2VD2A 1II5A 4BDRA 3KFMA 1B1XA 1GGGA 3LSLA 1XT8A 3KN7A 4QSEA 4FIMA 2OBGA 3FGSA 3TKDA 3LR1A 1EU8A 2ZXTA 1A8EA 2DVCA 4IO3A 2F6PA 1SVXB 2DE2A 3I6VA 3VLWA 1OMPA 4XKPA 3H3GA 1MQIA 3A3UA 4JWYA 3CVGA 2NOOA 3K6WA 5I57B 3FZVA 1B3FA 2A5SA 4I9DA 3SEUA 3K6XA 4X48A 1UTBA 4FJPA 1FTMA 5CM6A 1MH4A 3M8UA 4MBPA 5H8QA 3O6GA 1PB7A 1KWHA 4GL0A 3IR1A 4F3PA 3TPAA 4GVOA 2CMOA 2OWSA 4NF4A 3PD9A 1Y9UA 4EF1A 1URGA 1UTHA 4F22A 1AIVA 3DP8A 3MVYA 3C4MA 3QUJA 1M5BA 5H8FA 3A3CA 2Q2AA 5I2NB 3LSWA 1PBPA 4LATA 5B70A 4O3CA 2Y7IA 5JEIA 4IB2A 1SI0A 5ICQA 4U21A 3EHTA 4Q0CA 4IO2A 3S9EA 1N3XA 2DSFA 2KLFA 3WAEA 2F7AA 1YPNA 1UIUA 1HSLA 5DVFA 5KDTA 4GXSB 1SW4A 5M2VA 2PT2A 4X9TA 3TTKA 1NKXA 3K2DA 1FTOA 4R6KA 4M4GA 1N0TA 5HM4B 5AA2B 3DP4A 3DELB 4BDMA 3KJTA 2B3FA 4DDDA 1NFTA 2ALUA 1YTVA 3IO4A 3B7DA 1PDAA 2NUVA 3Q29A 1QKBA 1JQFA 1LSTA 4F2OA 2CZLA 5B7DA 4LUBA 1LCTA 3G7WA 3IB2A 1I6QA 3QUFA 1Q1KA 3H06B 3RNNA 1JETA 2H99A 2I6EA 4DXCA 2OJTA 4U1OA 5AA4B 4EXKA 2F97A 4F2QA 2HQ0A 3GLBA 3FXRA 5H8NA 4PETA 3DM0A 2X26A 1QUJA 3N94A 3M3LA 2O1MA 3OEMA 3TTRA 4DZ1A 3LC8A 1SI1A 1USYH 3SEVA 3T22A 1LAHE 4LP2B 5FTIA 2QS1A 4KQPA 2I49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A29A 3IB0A 3VVDA 2V4CA 2QVRA 4G68A 4N4UA 3PU5A 4PFWA 2O7IA 4ELPA 1TXFA 3DLNA 3V5AA 2XXWA 1MY0A 3O6HA 5I59B 3QSLA 3PPQA 4WKMA 2E0SA 3K4UA 2WBDA 2YPNA 4O7MA 1N76A 3KC0A 3IOTA 4R9FA 2BJJX 1UQWA 3CG1A 3G3KA 2X7QA 1B32A 3I3VA 4N81A 1IIWA 1NNPA 3OD7A 3OO7A 3R6UA 3AXFA 3KBRA 1DPEA 1VFEA 1DOTA 2F6GA 4KD5A 4E0XA 3IJOB 2E1SA 1VE4A 4ZS9A 5I3SA 4DXUA 1B0HA 2Y7PA 1B40A 4GXAA 2WBBA 3FBPA 3VLVA 3PMXA 2DWHA 2O69A 3CFLA 2V3UA 1B6HA 2REGA 4PQJA 5J16A 5CMKA 1Y3PA 4F18A 4UA8A 4RXLA 1Y20A 4R6HA 2Y84A 2XXXA 4IO6A 1M5DA 3T9XB 2PFZA 1A8FA 2X7PA 4PE5B 1DPPA 3IOVA 2ONSA 3UORA 2DQVA 2VPOA 4OERA 2REJA 5I58B 1MXYA 3R7XA 2Z8FA 2CZHA 2M8CA 5CRYA 2JJKA 1NNKA 4G77A 1SQYA 3B6QA 1SW5A 3ILTB 3S9MC 4G8HA 4NE4A 4MNPA 4JWXA 3ROJA 3RPLB 2XWVA 1Q9DA 4C1UA 4YMAA 3QXMA 2AYSA 2RC9A 4NX1A 2XXIA 4OXVA 1PEBA 1HSEA 4H1XA 3MZ1A 2D21A 3IL1B 2QMXA 1FTJA 3FVNA 5IZ3A 4P0IA 1QJMA 2QPQA 3MUQA 1WODA 3K6VA 1LGBC 4POXA 4R2BA 4KYEA 4EXLA 5CI5A 4X8RA 4HS7A 2DP8A 4LQ5A 2XWIA 1M5EA 2OWZA 4YKIA 2UVIA 5CBRA 4MHFA 4OENA 2O7UA 4ELOA 3PPRA 3MVWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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