3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
3BBRA 1Q1KA 1B7HA 3U1OA 1MXWA 3A3UA 3S2VA 2CMOA 5CMMA 4FATA 1MM6A 3MBPA 5AA2B 3ZS6A 4E0XA 1ZLQA 5M2VA 2RCBA 4YB5A 4KPTA 1VFEA 1P1WA 2F7CA 2V3TA 1MXZA 4NF5B 5I56B 2Z22A 1A54A 2Q9TA 1QKBA 4ESWA 1A40A 1M5EA 1MRPA 3IB2A 2QPQA 1QULA 2DSFA 4KI0E 1JW5A 2B3BA 4KFQA 3EQ1A 1Y4CA 2O7IA 1N84A 3K00A 3H7MA 5BUUA 3FJGA 3FJMA 1MM7A 1PB7A 3GBAA 4Q5TA 2Z8DA 1SW1A 4TLMB 3GXAA 3H6VA 3U72A 3RN8A 2ONKE 1Z7NE 3MAMA 1QJMA 2YJPA 4YB6A 3RT8A 3DELB 1XC1A 3G3IA 3MPKA 1NH8A 3HCQA 4XKQA 3PUVE 1US5A 4JWOA 1LSTA 3V89B 4AB6A 2HQ0A 2ZMBA 3Q25A 3K1MA 4MLVA 2F34A 4BLAA 5HBCA 1Y20A 2LAOA 2XXRA 3HHFA 4JDFA 5EHSA 5TP9B 5KDTA 3H6WA 1HSLA 4IGRA 5J1DA 5K2YA 2I3WA 2HXWA 4RPNA 3VDFA 2YLNA 3CG3A 3F11A 3IOVA 3K0VA 1SQYA 2QMWA 4H8IA 4YZZA 1YAEA 1OLCA 2THIA 3UGWA 2UVJA 2GFEA 3LUYA 4R2BA 4EXLA 2G29A 3KEIA 4BDMA 2R6GE 4RYAA 1LAXA 1L5TA 1B2HA 4R6KA 3I6VA 3W9WA 2DXRA 2YPNA 4NTLA 4TOZA 3OO7A 3Q26A 3VE1B 4N13A 4TQUQ 3TQWA 2I3VA 3LC8A 5L9MA 4R9GA 4F18A 1MXUA 4EF1A 3QIMA 4OXVA 4OENA 5CM6A 3EF7A 5JEIA 3T9UA 3U93A 1A8EA 5DEXB 3RGYA 3C34A 3MWBA 4X1BA 1H44A 3VXCA 4GD5A 3GZGA 5AA2D 4I8CA 1OVBA 3MQ9A 3G3GA 1LBBA 2P1SA 3T96B 3PUXE 4JBZA 5AA4A 3H6UA 2VOZA 3OELA 4POXA 4UA8A 3VVDA 1PB8A 1Q35A 2RC8A 2P2AA 1VFDA 1ZJLA 1VSOA 1MQIA 1D9YA 3B6QA 3O29A 4HTGA 4KHZE 4M1VA 4OWDA 3TCHA 4P0GA 3OMBA 1ELJA 3MVWA 3V8XB 3HSTA 3IB1A 2F7BA 1O64A 2QS2A 5DTBA 2ESNA 3Q29A 4IGTA 2XHDA 2Y7KA 1OVTA 1JW1A 1EH3A 1MXXA 4GL8A 1S50A 3FJ7A 3M3KA 3QUFA 1B3LA 4UACA 1USYE 2O1MA 3G3KA 3HV1A 3OO9A 1MPDA 4LONB 4QHQA 4QRZA 4BDOA 5EYFA 2Y7IA 3TAJA 3UORA 1IEJA 1EU8A 5I58B 3JZJA 2HAVA 3TQLA 4DDDA 4KYDA 1LBCA 1H3DA 3FVGA 3MZ9A 3ZSFA 5I58A 2X26A 1ZKBA 2ZNUA 1JEUA 3N6UA 4NWDA 3ILUB 4R72A 4AQ4A 5I84A 3M8UA 3FVNA 1NFTA 2V25A 5JK4A 4NE4A 1IUDA 3QSLA 4FIMA 1NNKA 3PD8A 3KN7A 4DXCA 4RY1A 4GXSB 4GF8A 1B1HA 5CRYA 1HSEA 2I58A 1QUJA 2OZZA 2ZYOA 3LSWA 5AA2A 1WODA 3PMWA 1B3FA 1PB9A 2F6PA 4OESA 4PFUA 4HW8A 2XX9A 5AE4A 2XXUA 3MVXA 3E9XA 2DE4A 4I62A 1DSNA 1B5IA 3K2DA 4ZEBA 3VXBA 3CSGA 3EHSA 3UIFA 1MY0A 3N26A 2NWJA 3BKIB 5BWJA 5ITPA 3O28A 2XXHA 4XXUA 3PMVA 2DWHA 1B51A 1F9BA 2HZKA 3IL1B 4I9DA 1AH5A 5K2XA 5I2KB 5A5XB 1TXFA 1FTOA 2REJA 1MH4A 3O6HA 3L6GA 3TMGA 3TELA 1FQBA 4U4SA 4BDRA 4G68B 1A99A 3U94A 1N76A 5B70A 3C4MA 2OBGA 3MVZA 4F2QA 4ELPA 2GHAA 1H76A 1I6AA 1MY1A 2KLFA 1QUIA 2XXWA 3GBBA 2XXVA 3LSLA 4H0WA 4Z0IA 3SEYA 3TODA 1DMBA 1MQHA 2OJTA 1B4ZA 4C1UA 4F3SA 1MQGA 2DQVA 4QFKA 2F5XA 2RC9A 3PPRA 4X48A 4XKPA 1B58A 2Q89A 1NNPA 4YICA 1UIUA 2UXAA 1Y1MA 3JYRA 3IJXB 1P1NA 1NMUA 1N7XA 2H98A 1NNTA 3FXUA 2QL3A 2I4CA 1B5HA 3H3GA 3K01A 3O66A 5IKBA 2I0BA 1Y4TA 2XX7A 3T9VA 2QJEA 5HPQA 2RC7A 2E1SA 2P0SA 4IY6A 4LZ5A 2ZNTA 4NEDA 1LAFE 2O7UA 4KYEA 1URSA 2ONRA 3OXNA 4OVJA 2X7PA 2H5YA 3KOSA 5L8DA 2O1LA 3FXQA 5AA1A 1UQWA 1HSJA 1SI1A 1SW2A 5KCJB 5FTHA 2ZYKA 2Q2CA 1US4A 4YKIA 4F1UA 3HPIA 3AXFA 1B0LA 3OSQA 3PV0E 2OLBA 2V84A 3K6UA 1WDNA 3N94A 4XIGQ 5ICQA 3TKDA 4MH5A 4HCYA 4LZ8A 4U2RA 1Y3QA 1LGBC 3MJNA 4EF2A 2VP1A 3FZVA 1LFHA 1OQHA 1FQEA 4F3BA 4DZ1A 3IO4A 1LLSA 1XHYA 4IO2A 1TFAA 4NF6A 2Y7WA 2A5SA 2RINA 4U21A 1XT8A 2HFBA 4RXLA 1B4HA 2PT2A 2NUVA 1D9VA 3A3CA 2O68A 2V93A 5TPAA 3VVFA 1LB9A 4N07A 3UA8A 4F39A 1B7UA 3E13X 3SKPA 1GR2A 3A09A 3VFJA 1SVXB 2DE2A 4EXKA 4Z7EA 5CMKA 4F19A 3I5OA 4KR5A 4NF8A 4R74A 4R6HA 4ZZEA 5JTYB 4RK2A 2OCUA 4F2OA 2AL5A 3PUYE 4OFLA 2DXYA 4OQOA 2D5WA 5H8FB 1GVCA 5CBSA 1FTLA 1MH3A 2D3IA 2DE3A 2PMSA 2ZYNA 4FECA 4HS7A 4IO6A 3G3FA 3H6TA 4U23A 5DVIA 4ZEIA 3FV2A 3VLUA 4BDQA 4H67A 3E3KA 4ZS9A 1DTZA 1R1NA 1DPEA 3CFZA 4KD5A 1SYIA 5IAIA 3TCGA 2OK2A 4G8HA 4DE8A 1IIWA 1GGGA 1P1OA 2WKYA 1N3XA 1PBPA 3BFUA 5KCJA 3IR1A 2O6AA 2UYEA 4LP2B 3KN8A 4XKNA 3TTMA 1EZPA 4K3FA 3MP6A 1H45A 3B7DA 1O63A 4ZEKA 1GV8A 2F36A 2QS4A 1D4NA 3IOWA 4H6DA 1S7YA 2ZYMA 3M3FA 2XD3A 2H4IA 2XXIA 1SD3A 3KGCA 3RPWA 4DCXA 2E0SA 4F3GA 3IX1A 3TUSA 5AA3A 4AB5A 4RJZA 1MXVA 3O97A 1LCTA 2HAUA 3PPQA 4IO5A 4R73A 4U1OA 4WEPA 1YPNA 2GHBA 3CFLA 3TTKA 3V5AA 4EDPA 2Q8JA 1DPPA 1NH7A 1IITA 4GLIA 1S9TA 4ONYA 4ZEDA 2VGQA 1Y9UA 3FXRA 5I2NB 4FEDA 4DXBA 3P7IA 3K02A 4OFOA 3FASA 5F7VA 5FHNA 2Y7PA 3OSRA 1GTKA 1YCJA 3DP8A 3T66A 2XXTA 2IEEA 2X7QA 1BKAA 1H43A 4WXJA 3O2AA 1JVYA 2GRVA 3EPEA 1Y3PA 3SEUA 3T9HB 1AOVA 1P1QA 4U4XA 1B46A 2PYYA 3IJOB 2FYIA 3N6TA 1M5CA 1FTMA 4O3AA 3H4ZA 4YMBA 5H8QB 4HCWA 4QF9A 2R71A 3HN0A 3CSBA 1MY2A 1JW4A 1A8FA 2H99A 3C9HA 3D4GA 3FVOA 3KN3A 2OWSA 3FVKA 4QSDA 5F1QA 3SEWA 4R6YA 4F1YA 2RKMA 2DWAA 5JTYA 3IORA 1OQGA 1URGA 4PP0A 4OZ9A 1DTGA 1UTBA 1BIYA 3G3HA 1TFDA 1FQDA 1P99A 2UVIA 1MG1A 4G8MA 4OETA 5CC2A 5L9OA 1JEVA 2QS1A 1TWYA 3VVEA 1N7WA 2I4BA 3ZKLA 4ZE9A 1I69A 4QFPA 1BLFA 1O7TA 3B6TA 3S9MC 1B3GA 4JB7A 4O3CA 1VR5A 4XTCQ 3TYHA 3T93B 1ANFA 5H8FA 3RY3A 4YKPA 2ZXTA 2RF1A 2Q2AA 4PFWA 4DXUA 3OOAA 4KCCA 1B32A 4FJPA 4MBPA 5CI5A 5H8NA 1FCKA 3RTFB 3ONMA 3K1PA 3MZBA 3UK4A 1B6HA 3LSXA 4YKJA 2NVUB 5A5XA 1XVXA 2F35A 2H9BA 3HO7A 4H5FA 4OERA 4X9TA 2QRYA 4NF8B 3SEVA 3MC2A 3KBRA 4GFRA 1A7LA 3OO6A 4YKKA 1OIBA 3ECRA 1KWHA 1IZ1A 1MPCA 3CRBA 3PD9A 4GL0A 5H8SA 3MW0A 1J1NA 1XS5A 2XXYA 2PBWA 4ECFA 1II5A 1MDQA 1PC3A 3VLWA 2XXPA 4IB2A 2VHAA 4GRKA 3HHGA 3DP6A 1CB6A 4NF6B 1AMFA 1I6QA 4QSCA 1B9JA 2O84X 3KG2A 1N3WA 3Q28A 4IO7A 1MY4A 4ZEFA 3SERA 1IXGA 2HCAA 3EHUA 1SDXA 2ANJA 3B6WA 4OEUA 4QFOA 4R75A 4THIA 4JWXA 2I0CA 4JSOA 5ITOA 3WAFA 1XVYA 4C0RA 4DCYA 1I6BA 2DP8A 3KOTA 4YMAA 1RKMA 4OYVA 5I59A 4ZZAA 4YB7A 1B7ZA 1MQDA 3KJTA 4OHNA 2QMXA 4PQJA 3W9VA 1QUKA 1QVSA 4RA1A 1ATGA 4FEBA 1DOTA 3OD7A 1POTA 2BJJX 4XKRA 3TZAA 2AIXA 2XXXA 3S9EA 1Z7ME 2F78A 3UN6A 3IAZA 3ODBA 5H8QA 2ZNSA 3EHTA 4JWYA 3LSFB 3U8QA 1IXCA 1ZTYA 3CFXA 3KSXA 3G3JA 2UVHA 4G4PA 4QSEA 4F3PA 1SW5A 3TEPA 3FGSA 2QSXA 4H5GA 2PT1A 3SETA 3O6IA 5H8NB 3FIRA 4G77A 2H25A 1JQFA 3TPAA 5I2KA 4X1DA 2O69A 1JNFA 5ISUA 3N5LA 1MY3A 4PETA 3ZKKA 5I57A 1RYXA 1SW4A 3KZGA 4G2ZA 3E4RA 1SBPA 3MP1A 4GXAA 5CMBA 3FD3A 3OENA 1POY1 4QFNA 4ELOA 3PUZE 3KSJA 4DLDA 3TTNA 4F31B 4ELRA 1B3HA 1BTJA 2XD2A 5DVFA 3MZ1A 3K1NA 1B40A 1M5DA 3FUZA 4KQPA 1IXHA 2B65A 2V3UA 4OTEA 3SEXA 2Z8FA 3PU5A 5L9SA 1AL3A 5H8HA 2FA7A 2B3FA 3C32A 5EHMA 1URDA 3CIJA 2O51A 1QW0A 4PE5B 1LB8A 4N6PA 3RT6B 1AIVA 1MS7A 1ZMGA 1FQCA 2DVZA 2VD2A 4QFLA 1N04A 5ELVA 1D3KA 4YU0A 2CZLA 1RYOA 3TDJA 4NWCA 1BP5A 2R9JA 3V83A 3IOUA 3RQTA 1B1XA 3C35A 4C1TA 2W7YA 4JXIA 3L6HA 4EUOA 5CBRA 4YAHX 4H65A 3PMXA 3QAXA 1B52A 4NF4A 4DIGA 1T0KA 3R26A 2DYXA 2IA4A 3R6UA 4OMBA 3RLFE 4MF3A 5FHMA 3PGFA 2F7AA 2PX1A 5TP9A 2Y84A 1FQAA 3C36A 3CI8A 3C33A 2HZLA 3LR1A 4POWA 1IQ7A 3S9LC 4H8JA 3Q27A 4GVOA 4JSDA 1LAGE 1SYHA 3IB0A 3GLBA 4ISUA 4U1ZA 1OLAA 1LFGA 3C31A 5DVJA 4FORA 5TU0A 3MPLA 1NNFA 1UIVA 4IY5A 4RNSA 3MVYA 3K4UA 1UTHB 1JETA 1B05A 4M4GA 2AYSA 2ABHA 2I6EA 4H1XA 2DOJA 3JV9A 3LBSA 4ZDMA 2V3QA 3TTRA 3W15C 1ZIUA 3D4CA 5DEXA 1QKAA 4ELQA 5CMCA 3PPPA 3CVGA 1IXIA 3TTLA 2D21A 4R9FA 2F97A 3K6XA 3K6WA 1FW0A 4ND9A 3QUJA 5B7DA 1M5FA 3O9PA 3DM0A 4EQ7A 3I3VA 2NOOA 1VE4A 3T9XB 2XXQA 2Z8EA 3THIA 1UTHA 3RTWB 1LFIA 4KYSA 4WEDA 1MQJA 3SESA 4GQOA 5H8HB 3K6VA 2DS9A 4OFJA 3EN3A 3FATA 3USDA 4L17A 4FAJA 2DWJA 1SI0A 1N0TA 4F22A 3CR9A 3T22A 1Y1ZA 5KDTB 4U22A 3PPOA 1UTBB 3S4UA 1YTVA 1ZU0A 4NMYA 3FV1A 4MLQA 3TCFA 4ZECA 5I57B 3M3LA 3RNNA 4FE8A 2OWTA 4RPOA 1FTJA 4LA9A 4Q30B 1ZBMA 3OEKA 2HEUA 3UP9A 3WAEA 4KCDA 4MFIA 4OEVA 4I1DA 1JVXA 4G68C 1MPBA 4LQ5A 2UVGA 1Y3NA 2I49A 2QS3A 2F6GA 4LQ2A 3G7WA 3BFTA 5I2NA 1FQFA 1R6ZA 1B5JA 4IO3A 3R7XA 4RK9A 1NL5A 4Q8RA 4G68A 4GWOA 3IOTA 4LATA 4WKMA 4P0IA 4E0WA 4BDLA 4F29A 1EZOA 1USYH 3TFLA 2NXOA 3KFMA 4Q0CA 1B0HA 1EZ9A 1PDAA 3DP4A 2AL4A 4NF5A 1WVJA 3SDFA 5I56A 5HM4B 1NKXA 3OO8A 1LCFA 1OMPA 2GH9A 4BDNA 1M5BA 3KJ7A 1PEBA 4F1VA 2Q88A 1FTKA 3RUMA 4IO4A 4PFTA 4EQ9A 1XOCA 4NF4B 5DT6A 2M8CA 1P1UA 3U92A 3QK6A 1PBQA 3VLVA 4LZ7A 2A5TB 3PUWE 2Z23A 4LUBA 3OEMA 5AA4B 5KZTA 3QXMA 2DVCA 2UYFA 1MDP1 3MP8A 2FNCA 2RCAA 3QYTA 2REGA 3O6GA 4GIZA 2ONSA 3PPNA 3H03A 5I59B 4G8NA 5LOMA 4GOTA 4PFYA 3ILTB 4ESXA 3CG1A 4ZE8A 3MUQA 2Y7RA 3IK6B 5FTIA 5ICTA 2I48A 4LVQA 1TT1A 3DLNA 2ALUA 2PVUA 4P11A 1R9QA 3IO6A 2F8DA 2DWIA 2G93A 2XX8A 5DYHA 1A55A 2A5TA 4O3BA 5FHOA 2VD3A 4R2FA 4EQBA 5TPAB 4TLLB 3VV5A 1LAHE 3S9NC 3H06B 1B3EA 1CE2A 1R9LA 1MXYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVQA 2CMOA 1MM6A 1XI6A 2V3TA 2Z22A 1QKBA 3RPLB 2ZZWA 1MRPA 2QPQA 1JW5A 4KFQA 1Y4CA 2O7IA 1NV6A 4Q5TA 2Z8DA 4TLMB 3GXAA 3U72A 1NH8A 1US5A 1LSTA 4AB6A 2HQ0A 4MLVA 2F34A 5ET7A 5TP9B 1HSLA 5ET6A 5K2YA 2MKZA 2YLNA 1SQYA 4H8IA 3KEIA 2R6GE 1LAXA 4R6KA 4NTLA 3OO7A 3Q26A 5IM2A 4EF1A 3FXBA 4H45A 3T96B 1OVBA 3MQ9A 3G3GA 2VOZA 4GBVA 1Q35A 2RC8A 3TFLA 3BIGA 4HTGA 1MQIA 1D9YA 4P0GA 4HE2A 3IB1A 4I3EA 4IGTA 2Y7KA 1OVTA 1JW1A 2WYPA 3FJ7A 1USYE 3OO9A 3TAJA 4DDDA 1H3DA 2PCRA 2X26A 3N6UA 4AQ4A 4O7MA 4OVTA 1NNKA 3PD8A 5CRYA 4O8MA 2ZYOA 1WODA 4PFUA 2XXUA 3MVXA 2DE4A 3K2DA 3EHSA 5IGAA 5BWJA 3O28A 3IL1B 3TELA 4G68B 2ZZVA 1N76A 2OBGA 3MVZA 3GBBA 2XXWA 4P8BA 2OJTA 4C1UA 4GX4A 1MQGA 4X48A 4XKPA 3PPRA 2UXAA 3JYRA 1P1NA 1N7XA 3H3GA 2QL3A 2I4CA 2RC7A 4LZ5A 4NEDA 1LAFE 2X7PA 5DW8A 3KC0A 2Q2CA 1US4A 2JJKA 3N94A 1LGBC 3IO4A 1LLSA 4PTKA 4NF6A 3SEXA 2Y7WA 2A5SA 2RINA 2NUVA 3VVFA 1SVXB 1VDWA 4MNPA 3I5OA 4KR5A 4R74A 4ZZEA 4N6KA 2D5WA 4HS7A 4U23A 4IO6A 3B50A 3G3FA 3H6TA 4DE8A 2HPGA 1P1OA 1N3XA 1PBPA 4K3FA 1K9YA 2WBDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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