3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
2GRVA 2XXUA 4NF6B 3U92A 4OERA 2LAOA 3R7XA 5AA2A 2B3FA 1NNPA 1JEVA 3SEVA 1MXXA 4N6PA 3MP8A 1MY2A 1OLAA 3KEIA 4TOZA 1M5FA 3T22A 3W9VA 4JWXA 1NFTA 2QS4A 1MQDA 4RXLA 3WAEA 3RQTA 2YPNA 4YMBA 4GOTA 4C1TA 1P1OA 1XC1A 3LSFB 2F6GA 3ODBA 4KR5A 1H76A 3I5OA 2HAUA 2V3TA 5J1DA 1PB9A 2DXYA 3Q25A 1GGGA 1FQBA 3FGSA 1VSOA 2XXVA 3TELA 1ZTYA 3MAMA 4GL0A 1AIVA 1OIBA 4RK9A 5HPQA 2O1LA 1LAHE 2W7YA 3W9WA 4Z7EA 1OVBA 1Y3QA 3R6UA 4ESWA 2E0SA 4QHQA 2B3BA 1DTGA 1LCTA 2ONRA 3K0VA 1MXZA 4IB2A 1D4NA 3LSWA 1TFDA 3MZ1A 3PMVA 5DVJA 3HPIA 4DCXA 4HCWA 3JZJA 3KBRA 4R75A 4OMBA 1LFHA 3LBSA 3QYTA 4OENA 4TQUQ 2V3QA 4BDLA 1B4ZA 2QMWA 2PMSA 1CE2A 3HN0A 3IOVA 3K6XA 3KZGA 1B58A 4OEVA 4OTEA 1XVYA 2P1SA 3MUQA 3N6UA 4QFOA 4PFYA 3SEYA 2A5SA 1HSJA 4H0WA 5FHMA 4OESA 1N0TA 3KN7A 1FQEA 1JNFA 3VVFA 1JEUA 4RK2A 5H8FA 2XXYA 1UQWA 3CRBA 3LC8A 3CG1A 2REGA 3O6HA 4LQ5A 3TFLA 3JV9A 3UORA 4BDRA 1B2HA 4H8JA 4KI0E 3FJMA 1MY3A 3MPKA 4GWOA 4IO3A 5F7VA 2ZNSA 1MY4A 1SI1A 1JW1A 2UXAA 1ZLQA 2F34A 3TPAA 4E0WA 2GFEA 4QFKA 2OCUA 2RINA 3VE1B 4DXCA 2R6GE 4U4XA 1A8EA 3OSRA 2H99A 1FW0A 2HXWA 2YLNA 1B7HA 2R9JA 3OSQA 4GQOA 1ZBMA 4YZZA 4C0RA 5JK4A 3OO8A 4U21A 4PP0A 4IGTA 4DIGA 4P11A 2V84A 1WODA 3LSLA 1SDXA 3C33A 5TP9B 4F1VA 2HFBA 1T0KA 1TWYA 1UTHB 4KCDA 4NEDA 3ILUB 4FJPA 4EUOA 1FQFA 3C31A 3OMBA 4NE4A 5ITPA 1H43A 3IR1A 4U23A 3PUXE 3D4GA 2RC9A 3DP4A 4LONB 3IJOB 4QSEA 5I56A 3HCQA 2PT1A 4MBPA 3Q27A 2HZKA 4RYAA 4YB7A 5L9SA 3JYRA 2VOZA 2QS3A 3TCHA 5L9OA 4MH5A 4OYVA 5I57B 1MQIA 3WAFA 5KCJA 3IB0A 3TDJA 3V83A 4F18A 2D21A 2RF1A 2VD3A 1UTBB 2HAVA 3K6VA 3KJ7A 4JXIA 2GHAA 4QFNA 4WEPA 3CSBA 3TCFA 1SD3A 1S9TA 4F29A 1PDAA 3FXUA 2NVUB 1S50A 1DPEA 2DVZA 2V25A 1SQYA 3I6VA 5B7DA 4GIZA 1UIUA 1AL3A 2ONKE 3IOUA 4XKNA 4XKRA 4XTCQ 4H8IA 3T66A 3FASA 4NTLA 4IO2A 3K01A 1US5A 3OEKA 4OEUA 4X1DA 5I2NA 3CG3A 3HHFA 4FATA 1EZ9A 4U1OA 1P1WA 1UIVA 3G3GA 4U2RA 1N84A 2HEUA 1MPBA 4UACA 3TKDA 3E13X 1ZKBA 2CZLA 1LLSA 3KOTA 3EN3A 5AA4B 2HCAA 3K4UA 1SW1A 1P1QA 4ZEDA 2D5WA 1SW5A 2F7BA 4F19A 4F1YA 4JSOA 1B3LA 2UVHA 5H8FB 4AB6A 4O3CA 5DVFA 2F35A 1OVTA 2PVUA 3K2DA 4N07A 5TP9A 3UA8A 2DE3A 1JVXA 1QVSA 5CI5A 2ZXTA 1FTJA 2V3UA 1B05A 2ZYOA 1M5CA 5KCJB 3LSXA 3SESA 1EU8A 1I6QA 2XXQA 4DCYA 1B51A 1QW0A 1R9LA 4BDOA 4C1UA 5F1QA 2I3VA 2ZNTA 5JTYA 3K1NA 4GXSB 1R9QA 1PEBA 3FV1A 3K00A 1Q35A 3VXBA 3PD8A 4TLMB 3OOAA 1FQCA 3OO7A 5CC2A 3TYHA 1QKBA 3H3GA 2Q8JA 3H6VA 1OQGA 1NL5A 1II5A 1M5BA 3D4CA 1UTHA 3MVYA 4LUBA 2F7AA 4R9FA 2I49A 2Q9TA 1BP5A 2Z8DA 3U72A 2QS1A 3ZSFA 3CFXA 2XXXA 5DEXB 2VD2A 4QF9A 4NMYA 1L5TA 3HSTA 1P99A 3G3IA 4X9TA 1IXGA 2XXWA 2RC7A 3PUWE 2X26A 5I59B 4OZ9A 1YAEA 1URSA 1KWHA 3EPEA 4YMAA 2DE4A 3B7DA 4NF6A 3PUYE 3SEWA 5AA4A 4PFUA 3G3JA 3DP8A 1USYH 3PPRA 5DTBA 1ELJA 3OXNA 5K2XA 4GRKA 4MLQA 4ZZEA 2NXOA 1JW4A 3GBAA 3MPLA 1LSTA 1SYHA 4KYDA 4DLDA 5HM4B 3KSXA 4M4GA 1I6BA 4YKPA 1SVXB 5TPAB 1I69A 4FECA 2OJTA 1QUKA 1M5DA 4O3BA 3E3KA 2P2AA 3RLFE 2XHDA 3RY3A 4NF8A 4G68C 2X7QA 3BFTA 3Q26A 4I8CA 2ONSA 3FVNA 1Y3PA 4RY1A 2Z8FA 3H6WA 5ITOA 4EF1A 4WXJA 3HV1A 2DE2A 3GZGA 3O6IA 1RYOA 1MH4A 2DOJA 4LQ2A 1QUIA 4ELQA 3C36A 4EQBA 5AA2D 4DE8A 1MRPA 1SI0A 3FJ7A 4PFTA 1A55A 1B1XA 4KD5A 5KZTA 3OELA 5M2VA 5H8HB 5JTYB 1P1UA 3ZKLA 4EQ9A 1MQGA 2O1MA 3S9NC 3T9VA 1ZIUA 2AIXA 4QSDA 3BFUA 1B7UA 1R1NA 1QKAA 2QSXA 2XXRA 3FIRA 4NF8B 2RC8A 2I3WA 3SETA 2DXRA 1B3EA 3A3UA 2OWSA 4H1XA 4HW8A 1H45A 1XHYA 4ISUA 1F9BA 3B6QA 4U22A 1NH8A 4FEBA 1BIYA 4G77A 1FQAA 3G3FA 4JBZA 4ZZAA 4BLAA 4DXUA 5I57A 4YKJA 3E4RA 1DOTA 4QFLA 3PPQA 4GLIA 2QRYA 1POTA 2F5XA 1NNFA 1US4A 2I0BA 3GBBA 2UYFA 4YAHX 3TTMA 2H25A 3R26A 4JB7A 1MDP1 4ZS9A 2QL3A 3CR9A 3ILTB 3V8XB 3FV2A 4Z0IA 3VLWA 1MS7A 2F8DA 2FNCA 5CM6A 1D9YA 2FYIA 1MPCA 5KDTA 1B3HA 1ZMGA 4IY6A 5DEXA 3N94A 5A5XA 4ESXA 1MG1A 1A99A 4JWOA 4NF5A 2A5TB 1B0LA 2F6PA 2QJEA 3FXQA 4G68A 1Y4TA 4IGRA 4U4SA 2D3IA 4ELPA 4RPNA 2DWHA 1SBPA 1B4HA 1ZU0A 3L6GA 5H8HA 1BTJA 1LFIA 1MH3A 2O6AA 4XIGQ 4JSDA 3O2AA 3UN6A 2DWAA 1XVXA 3DM0A 1FTLA 1M5EA 4R2BA 5BWJA 3MP6A 2OZZA 1ATGA 3USDA 4RA1A 4Q5TA 5H8QA 1CB6A 3F11A 4H65A 3FUZA 3OO6A 4NWDA 4OHNA 4OWDA 3TTRA 1N76A 1QJMA 3IB2A 3C34A 3SERA 1DMBA 4LATA 2QMXA 2HQ0A 1Y1ZA 4GF8A 4YB5A 1DPPA 2Q2CA 3U1OA 4IO5A 3UP9A 3VVEA 5KDTB 2ESNA 3PPOA 3C35A 4PE5B 4R6YA 4KYEA 1Y9UA 4GD5A 3CI8A 5AA1A 2F97A 1WVJA 2Y7RA 1B3FA 4IO4A 5B70A 5H8NB 1B5IA 5CBRA 1H44A 1D9VA 3A3CA 2XD2A 3C32A 4MLVA 1PC3A 4KQPA 3RPWA 4L17A 5FTHA 3N5LA 3FVKA 5I2KA 1JETA 3IO6A 1EZPA 1VR5A 4MF3A 4BDMA 3SKPA 1YPNA 1RKMA 3PPPA 1PB7A 2E1SA 2PBWA 1ANFA 1LCFA 1NNTA 2RKMA 2ZYNA 3M3KA 5CMBA 2GHBA 4YKIA 1B6HA 1PB8A 2XX7A 2XXTA 3MW0A 4F3GA 2AL4A 2B65A 3V89B 3IL1B 3FZVA 1B5JA 1OMPA 4KPTA 3TMGA 5I59A 4G68B 2O7IA 3TEPA 2DWIA 3K1MA 3W15C 1Y20A 3IORA 3TUSA 1O7TA 1MQHA 3MBPA 5EYFA 3QSLA 4O3AA 3TTNA 1J1NA 3TTLA 2OWTA 1GV8A 3S9EA 5FHNA 4NF4B 4FEDA 1WDNA 1YTVA 4F3BA 3G3KA 4R72A 3MZ9A 1Y4CA 1FTOA 4HS7A 1POY1 4OFOA 1USYE 3CIJA 2Y84A 3H6UA 3KN3A 2H9BA 3IK6B 3O29A 1N3WA 4DZ1A 3U94A 1MY0A 3ZKKA 2ALUA 1NNKA 4POXA 2Q2AA 2Q89A 5DYHA 3PPNA 1NH7A 2A5TA 3QUFA 3MVXA 5I58B 5HBCA 3M3FA 1MM6A 5A5XB 2ZYMA 1S7YA 2I58A 3PUZE 4G8MA 3S4UA 4E0XA 3DELB 4H67A 1IXCA 2M8CA 4KFQA 4OXVA 2IA4A 3UK4A 5ICQA 3DLNA 3K1PA 4BDQA 4F1UA 1R6ZA 4XXUA 2CMOA 5H8QB 1VFDA 4ZDMA 3K6UA 4XKQA 4AQ4A 3RTFB 5BUUA 1JVYA 4OVJA 3TAJA 4ELRA 1AOVA 4FAJA 5DVIA 5CMMA 2H98A 3KG2A 5AA3A 1B46A 3FATA 1TFAA 3G7WA 4X48A 2G93A 3K6WA 2Z23A 3EHTA 4GFRA 1LBCA 4PQJA 3S9LC 1MQJA 2UVIA 4YU0A 3K02A 3TTKA 1FTMA 2O84X 3B6WA 2IEEA 3HO7A 3VDFA 3A09A 5EHMA 2Z22A 2UVJA 4N13A 5H8NA 4RNSA 2G29A 3CVGA 3T93B 4ZEIA 3U93A 4EXLA 3MJNA 5CBSA 2XXPA 1LB8A 1GR2A 3H7MA 3N6TA 1N7WA 2OBGA 2PT2A 2QS2A 2YJPA 1EH3A 3MVWA 4FIMA 2R71A 4G2ZA 2P0SA 3FVOA 5DT6A 5FHOA 3PGFA 1FCKA 3QXMA 4KHZE 1MPDA 2H4IA 3MC2A 5I56B 5ICTA 2BJJX 4NF5B 1IUDA 3RUMA 4WEDA 3PD9A 4YB6A 2H5YA 4Q8RA 1XOCA 4LP2B 1A54A 1GVCA 1D3KA 3SEXA 4LA9A 3THIA 1MXYA 5FTIA 2ZMBA 1B0HA 2KLFA 3OD7A 1RYXA 4IO6A 3P7IA 4R2FA 1IZ1A 1SW4A 1UTBA 3FXRA 3PV0E 4EQ7A 4OFJA 3DP6A 3CSGA 3GXAA 2VHAA 1A8FA 1IXIA 3KN8A 3MQ9A 1IIWA 1HSLA 2XD3A 5JEIA 5K2YA 4ZEKA 3IAZA 3MVZA 4ZECA 1B5HA 3UGWA 3IO4A 4HCYA 4F2QA 3H06B 5TU0A 3TQWA 4GXAA 1Y1MA 3TODA 4TLLB 3VLVA 4F2OA 4UA8A 3VVDA 1P1NA 4LVQA 4YICA 2I6EA 4DDDA 4LZ7A 2O51A 3G3HA 3VFJA 4R6KA 1A7LA 3UIFA 3HHGA 3O9PA 1DTZA 2THIA 3B6TA 3T9HB 1DSNA 1AH5A 3EHSA 4ECFA 4F3PA 1B3GA 2HZLA 2VGQA 5L8DA 1B1HA 1AMFA 3FD3A 2VP1A 4F3SA 3ECRA 4LZ5A 2FA7A 5CMCA 4Q0CA 5L9MA 4XKPA 2NOOA 1LFGA 3OENA 3QAXA 3FJGA 1VE4A 3BKIB 4JDFA 4PETA 3PMWA 3QUJA 4OQOA 2Y7KA 3I3VA 1ZJLA 2Q88A 1N7XA 4NF4A 2AL5A 1Z7NE 4G8NA 3RT6B 5LOMA 1Q1KA 3T9XB 1OLCA 2RCBA 3C4MA 3Q28A 5TPAA 3AXFA 3RTWB 4DXBA 4ZEFA 2NWJA 5CRYA 2DP8A 2OK2A 1GTKA 4ND9A 4PFWA 2DVCA 1B7ZA 4R6HA 2QPQA 3O97A 4U1ZA 1URDA 1XS5A 5ELVA 5ISUA 3LUYA 1YCJA 4I1DA 4RPOA 3KOSA 1B9JA 3KFMA 3ZS6A 3IJXB 2F36A 3KGCA 2AYSA 2ZNUA 4R73A 5H8SA 3QIMA 4ZE9A 1A40A 1BKAA 3M8UA 1TXFA 4HTGA 2X7PA 3M3LA 2ABHA 2Z8EA 3PU5A 1EZOA 1NKXA 5I2KB 1B40A 3SEUA 4H6DA 4M1VA 4X1BA 5CMKA 1MXVA 3EQ1A 1OQHA 1BLFA 1XT8A 2DQVA 2I48A 4H5GA 3V5AA 4KCCA 4EDPA 3ONMA 1MXUA 4H5FA 4EXKA 5AA2B 1LAGE 4GL8A 2PYYA 5EHSA 4WKMA 4Q30B 4RJZA 3RNNA 3O28A 3FVGA 2I4BA 3H4ZA 5I84A 2DSFA 1B32A 1H3DA 3H6TA 1FQDA 1O63A 4JWYA 4MFIA 3RT8A 3QK6A 1LGBC 2ANJA 2REJA 1O64A 1NMUA 1IITA 1N3XA 2UYEA 4FORA 1IQ7A 3OO9A 4P0GA 1JQFA 1HSEA 1LBBA 4P0IA 2ZYKA 2Y7PA 2DS9A 3CFLA 4G4PA 1B52A 1IEJA 1VFEA 2XXIA 4OFLA 4R74A 2O7UA 3O6GA 3PUVE 3S2VA 1MY1A 2UVGA 2XX8A 3EHUA 1IXHA 4POWA 4F22A 5AE4A 4IO7A 4NWCA 5I58A 3BBRA 1LAXA 3OEMA 2Y7IA 2WKYA 4BDNA 3O66A 4YKKA 1SYIA 2O68A 3IOTA 4K3FA 3RN8A 1JW5A 1PBQA 1LAFE 2RCAA 3VV5A 1LB9A 2OLBA 1MM7A 4ONYA 3TQLA 4KYSA 3C9HA 4GVOA 3VXCA 2I0CA 4R9GA 5IAIA 2DWJA 4FE8A 3IOWA 4QRZA 4ZE8A 4OETA 3RGYA 4THIA 1I6AA 1QUJA 2GH9A 3TZAA 4ELOA 5I2NB 1QULA 3EF7A 1N04A 1URGA 4ZEBA 3S9MC 1TT1A 3TCGA 3SDFA 3T9UA 4AB5A 3KSJA 4EF2A 3U8QA 3LR1A 3T96B 1Y3NA 2XX9A 2O69A 3E9XA 3N26A 4G8HA 2XXHA 1MDQA 3MP1A 4IY5A 1MXWA 2DYXA 5IKBA 4LZ8A 2V93A 2F78A 1FTKA 2F7CA 3IB1A 4F31B 1SW2A 3KJTA 4I62A 2PX1A 4I9DA 2Y7WA 3VLUA 3H03A 3PMXA 4QFPA 3IX1A 2I4CA 1Z7ME 3GLBA 2NUVA 3MZBA 4QSCA 3MWBA 1PBPA 3CFZA 3L6HA 4F39A 3Q29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OERA 2XA5A 5AA2A 1FPDA 2ZZXA 1MY2A 3KEIA 3RPLB 2WYKA 2QS4A 1P1OA 4KR5A 2DXYA 3Q25A 1AWBA 4MHFA 4GL0A 5HPQA 1LAHE 1Y3QA 5F24A 2E0SA 1LBWA 1MXZA 4IB2A 5EYHA 3LSWA 1TFDA 4AS4A 5DVJA 4DCXA 3JZJA 4R75A 4OMBA 3LBSA 4TQUQ 4BDLA 1NV0A 2QMWA 1CE2A 2XXKA 4HE1A 3K6XA 1B58A 2P1SA 3MUQA 1N0TA 1Q9DA 3VVFA 5H8FA 2XXYA 3O6HA 4KI0E 5F7VA 5ET5A 2ZNSA 1ZLQA 3TPAA 2GFEA 4P1EA 4DXCA 4U4XA 2YLNA 1FTAA 2HXWA 3OSQA 1G0IA 4PP0A 4DIGA 3LSLA 1TWYA 4KCDA 4NEDA 5ITPA 3C31A 2B4LA 3IJOB 4YB7A 4RYAA 1LEVA 4MH5A 4PCDA 2VD3A 4QFNA 2GHAA 1D9QA 1S9TA 1NV7A 1K9YA 2V25A 4GIZA 4ZE9A 2ONKE 4XTCQ 4H8IA 3FASA 4IO2A 4XF5A 5I2NA 4FATA 1EZ9A 4U1OA 3E13X 1LLSA 1SW5A 4JSOA 1B3LA 3IFCA 1T0KA 3T0JA 1M5CA 3SESA 4MAGA 1B51A 4BDOA 4C1UA 5F1QA 3K1NA 4TLMB 3D4CA 2QS1A 3ZSFA 4QF9A 4NMYA 3HSTA 5I59B 1YAEA 4NF6A 4GRKA 1FBHA 1I6BA 4YKPA 3BIGA 3E3KA 3RY3A 4GWYA 1DK4A 3Q26A 2ONSA 4RY1A 2FVZA 3C36A 4PDHA 1A55A 1B1XA 5M2VA 5JTYB 5I5PA 3BFUA 1R1NA 2XXRA 4HW8A 1B3EA 1H45A 4ISUA 4FEBA 1BIYA 4JBZA 4PFBA 5I57A 3E4RA 5DW8A 3NOHA 1POTA 2F5XA 4YAHX 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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