3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
3I6VA 3K6XA 4BDNA 3TTLA 3H6WA 3FV2A 3M3LA 1DPPA 3MVYA 1B6HA 1MXYA 3MWBA 2FYIA 1DTGA 2H98A 4FAJA 2DVZA 4EQBA 3FXUA 4GD5A 3QSLA 3TUSA 4KD5A 1SW2A 2QS1A 3DELB 3MW0A 5JTYB 4FATA 3ILUB 4OERA 1ZMGA 2ZYKA 1J1NA 2Q8JA 3PMWA 4M1VA 4FJPA 3TODA 3PPPA 1RKMA 3DP8A 4OEUA 5FHOA 1DTZA 4JWXA 4OMBA 5DVIA 2HQ0A 3H4ZA 2NXOA 3FIRA 1A8FA 3H03A 5I56B 5I58B 5DT6A 3H6TA 4KR5A 4F19A 2XD2A 5ICQA 3SEXA 1VR5A 1ZJLA 4ZEBA 1WDNA 1Y3NA 2V25A 4GFRA 5EHSA 1QVSA 2REGA 1BP5A 1FTLA 5K2YA 3V83A 4GIZA 4LVQA 2VGQA 3VFJA 3IB1A 5DEXB 1LBCA 1SYHA 1B46A 4PP0A 3N26A 4QFPA 4EQ7A 1M5DA 1Y1MA 2F8DA 3QUFA 1FTKA 5H8FA 1FTJA 4IY6A 1Y3PA 1HSEA 3TQLA 2DQVA 4RA1A 4DDDA 1B52A 1H76A 4ELRA 4OYVA 2R9JA 3EHTA 3K2DA 5EYFA 2Q88A 5K2XA 1HSLA 3PPOA 3KGCA 1WODA 3CG1A 4TLMB 1Q1KA 1OIBA 2DXRA 1S7YA 3IJOB 4DXBA 1SW4A 5H8HB 4E0XA 4AB5A 4ZDMA 1XHYA 4H65A 1ZTYA 2PMSA 2W7YA 1IITA 1LB9A 3BFTA 3ODBA 4Z7EA 3KN7A 4OETA 3LSLA 4Q8RA 5I2NA 4IGRA 3GBAA 3TYHA 1M5FA 4P0IA 1F9BA 3KN8A 4R2BA 3K4UA 1B51A 3K1PA 3D4GA 5FTIA 1O64A 1B9JA 3TEPA 4R9GA 4G77A 1MPCA 1B3EA 3K02A 1B0LA 3G3GA 3O9PA 3PUVE 1YTVA 4JSOA 2QS3A 1PB9A 2XX9A 2O7UA 1FQEA 1JW5A 4IB2A 3UP9A 4RJZA 4IO3A 4P11A 4ZEKA 4H8IA 4ESXA 3PD8A 2PX1A 3PPRA 3KSJA 4NF4B 3SEYA 4F3SA 2WKYA 1SDXA 1B3FA 1AOVA 5CI5A 1D3KA 2XXQA 5L8DA 1IQ7A 2HZLA 2ZYNA 4Z0IA 5I84A 3CSBA 4EXLA 3OO6A 3D4CA 5I2KA 1B32A 4R74A 1SI1A 4ND9A 2QL3A 1GVCA 1DSNA 1FQCA 1ZKBA 3N6TA 5I59B 1QUIA 1MDQA 5KDTB 3T93B 3ZKKA 1MH3A 4QSCA 2DE2A 4F2QA 2YLNA 4Q30B 3H6VA 5LOMA 3L6HA 4GF8A 4DLDA 4X1BA 4LA9A 1O7TA 1IXIA 2ZYMA 4GL8A 3EHSA 5EHMA 2H99A 2Y7IA 3MJNA 1B7ZA 1I6AA 2B3FA 3S9LC 3C35A 3MP1A 4WEDA 5CBSA 3C9HA 1CE2A 3FJ7A 1I6QA 4Q5TA 1R9LA 3KBRA 1VFDA 4PQJA 1US4A 4OQOA 5AA2D 1R9QA 4RPOA 4NMYA 4XTCQ 2ZXTA 2D21A 4UACA 4ELPA 2DYXA 2DE4A 1OVTA 3IOUA 2UVIA 5JEIA 3UN6A 4ESWA 1EZOA 2Q89A 4X1DA 2PYYA 3T96B 2GRVA 4XKQA 2I48A 5ITOA 4QHQA 1FQDA 2F7CA 3W9VA 2XXRA 1EU8A 2XXVA 3CIJA 1P1QA 1ZU0A 1QUKA 1MS7A 4F1VA 3SEVA 1MQJA 3U8QA 3MZ9A 4N07A 1R6ZA 5TP9B 1L5TA 1UTHA 3TAJA 2DWJA 4ZZEA 3E4RA 4LQ2A 1B7HA 3K6UA 5L9MA 1MXWA 2THIA 2XXYA 4OZ9A 3ONMA 2OCUA 3MPLA 4WEPA 5HPQA 1B1HA 1XT8A 4JB7A 4HTGA 3CSGA 1TFAA 1N3XA 3IB2A 4M4GA 1UIUA 4YKKA 3CRBA 4G4PA 1SW1A 2HCAA 3THIA 4F3BA 4F1UA 4OFLA 3KG2A 3TTMA 1XVXA 3FXRA 1RYXA 4QSEA 1NNKA 1ZLQA 2XD3A 4NF6B 1CB6A 4YB6A 4TQUQ 2ZNSA 4F2OA 4UA8A 2VHAA 5JTYA 3I5OA 5DYHA 4PFWA 4IO7A 4YZZA 4PFTA 3QYTA 2I3WA 5ITPA 1PBQA 3DLNA 4DZ1A 2OWSA 2QPQA 4IO6A 3PMVA 5AA4B 2DSFA 4FIMA 3FJMA 1MXVA 3KJTA 1P1WA 5CC2A 4IGTA 4KCCA 1B58A 1B3LA 5CMBA 2QS4A 1QUJA 3IL1B 4HCWA 3FD3A 3HHFA 5I58A 3ZS6A 2G29A 4G8HA 1FQAA 2ZNTA 1AH5A 3U94A 3BFUA 2OLBA 1MQGA 3OEKA 4C1TA 4DCXA 2F7AA 3UK4A 3SESA 2OBGA 5DEXA 2F7BA 2I0CA 1Y4TA 3FZVA 1B3GA 4F1YA 4F31B 2I49A 4YB5A 1PC3A 3O97A 2ONSA 1R1NA 3TQWA 5DVJA 1FQBA 2H4IA 2Z8EA 4JSDA 2Y7WA 4BLAA 2HXWA 1B0HA 4ZEIA 4KCDA 4R72A 4O3CA 1MY1A 2PT2A 4K3FA 4U1OA 3AXFA 1MQIA 2P2AA 3MUQA 3C32A 4O3AA 3Q28A 3EF7A 2H25A 3PU5A 1OQGA 5CBRA 2ZNUA 3VXCA 3MVWA 2P0SA 1ANFA 3RLFE 5H8HA 1IEJA 3F11A 3TTRA 3E9XA 4XKRA 4FEDA 3GBBA 3FVNA 1JW4A 1N84A 1Y4CA 2O69A 3N94A 1OQHA 4YB7A 3S9EA 3IORA 2X26A 4EQ9A 3T66A 1YCJA 3O6HA 1B5IA 3RPWA 1A55A 3PPNA 1LFIA 3O6GA 4MLVA 1D4NA 1MY4A 3TCGA 2V3QA 2REJA 4NF8B 2UVGA 5AE4A 2M8CA 5H8QB 4YKJA 4EF1A 4G8MA 1NNTA 3G3FA 5CMCA 1MY0A 1OLCA 3CR9A 3OELA 3FASA 4HS7A 4NTLA 2O7IA 2AL5A 3IJXB 1LGBC 5F7VA 1A99A 3QUJA 4RK2A 4HCYA 4FECA 4NF4A 3L6GA 4POXA 1GTKA 1B05A 3TPAA 1EZ9A 5IKBA 3MVZA 2I4CA 4DCYA 1KWHA 1QJMA 4ZE8A 4X9TA 1YPNA 3PUXE 3IOVA 4MH5A 3K6VA 5FTHA 1JEUA 2ZYOA 1NL5A 3U92A 1SD3A 1TT1A 1MY2A 1AIVA 4GWOA 3A09A 2ONKE 1I69A 2ESNA 3CFXA 2GHAA 1NMUA 2F97A 2YJPA 2UXAA 3LSXA 3UA8A 3CFLA 3T22A 5A5XB 2DS9A 2D3IA 3LUYA 5I59A 3O29A 4R75A 5KDTA 1JETA 3G3HA 2DE3A 2OJTA 3CFZA 1NH7A 4YKPA 3MP6A 3FVGA 4R6YA 3TKDA 1Y9UA 3MAMA 3B6WA 4F29A 1M5BA 1D9YA 3K00A 1B2HA 3U93A 2O1MA 3QXMA 4LATA 3QAXA 3VLWA 2AL4A 1LCFA 3G3KA 3U72A 2NVUB 2KLFA 3RTWB 3DM0A 1LAXA 2V93A 5BWJA 4POWA 4MLQA 1JW1A 3EQ1A 1MG1A 1TXFA 5L9OA 4TLLB 1NNPA 3UGWA 4ELOA 1LSTA 1NFTA 1P1UA 5L9SA 2HZKA 4G8NA 4P0GA 2DWHA 4G68C 2VOZA 4ELQA 1FTOA 3IOTA 3OSRA 4G2ZA 4R73A 1QULA 4XIGQ 4XXUA 3W15C 1SVXB 1MPDA 3SETA 1MXXA 3SKPA 4ZEDA 3OENA 1B3HA 2E0SA 1MXZA 2DVCA 5M2VA 4GL0A 4E0WA 1GV8A 5TP9A 1Z7NE 2O68A 3ZKLA 3A3CA 3UORA 3R26A 1POY1 4KYSA 1IXGA 1MXUA 5TPAB 4H5GA 4PE5B 2B3BA 1SBPA 3FATA 4KPTA 3PGFA 5AA2B 3C4MA 2DWAA 3OD7A 1EZPA 4OEVA 2XXTA 3HO7A 3HSTA 1UTBA 1XOCA 2ANJA 4DXUA 3IAZA 2V84A 3WAEA 3MZ1A 1P1NA 2IEEA 1N3WA 2XXIA 3VDFA 3S4UA 5ELVA 2XXXA 1S9TA 5F1QA 3VVEA 3PUWE 1DMBA 1HSJA 4EXKA 1PB8A 3PV0E 3RN8A 3BKIB 2IA4A 4NF6A 4AB6A 3FXQA 2ABHA 2HFBA 1P99A 5KZTA 4PETA 4R9FA 2AYSA 4WKMA 3IK6B 4F18A 4EUOA 1N7XA 4L17A 4OXVA 2HEUA 2B65A 1B4HA 3MC2A 2DXYA 2PT1A 5AA4A 5FHNA 5AA1A 3B6TA 3RT8A 3N5LA 3K6WA 4KFQA 4GOTA 1BKAA 3EHUA 4XKNA 4BDMA 1S50A 3OSQA 4QFKA 4YKIA 3PMXA 3ECRA 4KYEA 4BDOA 2Z23A 1UTBB 4I1DA 3T9VA 3Q27A 4OHNA 4IO4A 3SERA 2XX8A 3FUZA 1XS5A 3IX1A 2A5TB 3MZBA 1JNFA 4OFJA 2PVUA 4OVJA 1LFHA 4EF2A 3V5AA 4C0RA 1PB7A 4LONB 2VP1A 3R6UA 4H6DA 1US5A 3I3VA 1T0KA 1II5A 1MM6A 1H45A 3CVGA 4GXSB 3O66A 2LAOA 1MM7A 2Y7PA 3MBPA 2FNCA 4QRZA 1FQFA 2GFEA 3KSXA 5H8SA 2QMXA 3V89B 3MVXA 4LP2B 1IZ1A 3MPKA 1QKAA 3M8UA 1GR2A 1FW0A 3Q29A 4YICA 4U2RA 1H43A 1TWYA 1B4ZA 4G68B 5J1DA 4DXCA 1EH3A 2ONRA 3HHGA 4MF3A 2Q2CA 3M3FA 4IO5A 4RPNA 2FA7A 4OENA 3G7WA 4QFLA 3GLBA 3TTKA 2V3UA 1M5CA 3KFMA 3OXNA 3HV1A 3C33A 3PPQA 2VD3A 3E13X 2Y7KA 3LC8A 3VLVA 2X7QA 1URDA 3VLUA 3OMBA 3KZGA 4MFIA 5CMMA 4DE8A 4H5FA 4NF8A 1M5EA 3C31A 4ECFA 2H5YA 5H8QA 3H7MA 4LZ8A 3PUZE 5B70A 5HBCA 2PBWA 4GRKA 1PEBA 5TU0A 3UIFA 3FV1A 1Z7ME 2HAVA 2D5WA 1O63A 4PFUA 3N6UA 2UYEA 4R6KA 4ZE9A 3S9NC 2CMOA 2I58A 3TFLA 1UIVA 2DOJA 2QSXA 3FVOA 2A5SA 1FTMA 1MH4A 2OWTA 2AIXA 1AMFA 1MRPA 4KHZE 3H6UA 3HN0A 4XKPA 2OK2A 3S9MC 4H67A 1H44A 1B5JA 1D9VA 2F78A 5KCJB 4MBPA 3TELA 2QMWA 3JV9A 1URGA 1WVJA 3G3IA 1H3DA 5A5XA 4HW8A 3ZSFA 5BUUA 2ALUA 1IXCA 3WAFA 4THIA 4KI0E 2VD2A 5ICTA 3B6QA 2XHDA 4LZ5A 1BLFA 2O84X 3IOWA 2UVHA 4QF9A 1PDAA 3RQTA 4R6HA 2OZZA 1VE4A 2Z8FA 4GQOA 3V8XB 3O28A 1XC1A 1NNFA 3VE1B 3C34A 2E1SA 5CRYA 4LQ5A 3RNNA 1XVYA 1Q35A 4JWYA 1VFEA 3KOTA 4C1UA 4EDPA 1SW5A 1MY3A 2XX7A 2H9BA 3QIMA 4GVOA 4OFOA 1B1XA 2I3VA 1LLSA 1IXHA 2XXUA 1LBBA 1ZIUA 1DOTA 3KN3A 4ZZAA 2RF1A 3EPEA 2NUVA 5B7DA 1N0TA 1USYH 4KQPA 4YMAA 4YAHX 4ZEFA 5TPAA 2RC8A 1Y3QA 5IAIA 3K01A 2X7PA 3SEUA 4RNSA 5AA2A 2DWIA 4U21A 1ELJA 3O6IA 1N04A 5HM4B 4OWDA 3C36A 3KOSA 2UYFA 4DIGA 3B7DA 2R6GE 3MP8A 4I9DA 2RKMA 1B7UA 4N13A 2GH9A 4BDLA 1GGGA 2RINA 1URSA 3RT6B 3A3UA 3LSWA 2Y7RA 5DTBA 5H8FB 1DPEA 1N7WA 2YPNA 3TDJA 3M3KA 3T9UA 2F36A 4R2FA 3BBRA 3IR1A 4JWOA 1LAFE 2I4BA 3P7IA 4N6PA 2HAUA 4TOZA 2RCAA 3S2VA 2RC7A 5AA3A 2NOOA 1Y1ZA 3HCQA 4O3BA 2Q2AA 4U22A 1NKXA 1PBPA 3FVKA 4GXAA 1LFGA 1RYOA 3OO8A 4JBZA 1P1OA 2P1SA 5ISUA 4RK9A 1JVYA 3ILTB 3Q25A 3K1NA 1MQDA 1ATGA 1USYE 3K0VA 3DP4A 3T9XB 1MDP1 4IY5A 1N76A 4QSDA 5I2NB 4JDFA 4NF5A 1LB8A 4IO2A 4WXJA 4U4SA 5FHMA 3USDA 4Q0CA 2XXWA 3Q26A 4I8CA 3U1OA 1QW0A 1TFDA 1AL3A 2XXHA 2I0BA 2O1LA 3TCHA 2A5TA 2I6EA 3CG3A 1NH8A 4LUBA 2F5XA 3PD9A 2NWJA 2G93A 3TCFA 1Y20A 2GHBA 4U1ZA 3TZAA 3R7XA 3JYRA 1SQYA 3RGYA 3H06B 1A40A 4H8JA 3KEIA 2Z8DA 2O51A 1JVXA 4X48A 1BIYA 4OESA 2Z22A 3DP6A 3E3KA 4F22A 4I62A 4QFNA 1QKBA 3O2AA 1UQWA 3FJGA 1B5HA 4FORA 4F39A 1VSOA 3G3JA 3IO6A 1IUDA 3LSFB 4F3GA 3VV5A 2O6AA 2Y84A 5H8NA 4G68A 4AQ4A 4NWCA 2F34A 3JZJA 4OTEA 4U23A 5I57A 4RYAA 4KYDA 5I2KB 2RCBA 3T9HB 4YU0A 4FEBA 2QS2A 4NF5B 3K1MA 3RTFB 4LZ7A 3SDFA 3LR1A 3FGSA 1BTJA 3IO4A 4H1XA 1SI0A 3TTNA 3IB0A 4BDQA 5CM6A 3OO7A 2CZLA 4JXIA 3GXAA 2XXPA 1JEVA 1I6BA 1OMPA 1B40A 4PFYA 1SYIA 4U4XA 2QRYA 1MPBA 4ONYA 4H0WA 3RUMA 2F6GA 3W9WA 4NWDA 4ZECA 1YAEA 1OVBA 2DP8A 2QJEA 5JK4A 3LBSA 3SEWA 3HPIA 4RY1A 3VXBA 1LAHE 3QK6A 2F6PA 1A54A 3EN3A 1POTA 2F35A 4BDRA 3MQ9A 4NEDA 1OLAA 4ISUA 4FE8A 5H8NB 2ZMBA 5I57B 3CI8A 3PUYE 5DVFA 4RXLA 1A8EA 2V3TA 3GZGA 5KCJA 3VVFA 1UTHB 4YMBA 1LCTA 1IIWA 3OEMA 3OO9A 4QFOA 3OOAA 5I56A 4ZS9A 3RY3A 1A7LA 3KJ7A 1MQHA 2BJJX 2R71A 5CMKA 3TMGA 4NE4A 4F3PA 1ZBMA 1LAGE 3VVDA 1JQFA 1FCKA 2RC9A 4GLIA 3H3GA 2UVJA 2Q9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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