3PUWE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 121
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE01
3PUWE 2O51A 2Y84A 1ELJA 2ALUA 2X7QA 2O84X 2V25A 1MH3A 2XD3A 4OERA 1DTGA 3TMGA 2HAUA 4XKQA 3K02A 1IEJA 3S9EA 1AH5A 4Z7EA 4F2OA 1QUIA 3UK4A 5KZTA 1QW0A 5KCJB 1PBPA 1B1XA 5I2NB 4LVQA 4QFNA 4FIMA 1SDXA 2NXOA 4HW8A 3HN0A 5DVFA 1YAEA 3P7IA 3CG1A 3W9VA 1LFGA 1D3KA 3QSLA 2H98A 1EZOA 3EPEA 5DEXA 5CC2A 4G8MA 5CMBA 4F18A 2Y7IA 5AA2A 1JVXA 2H25A 3UORA 3MPLA 1MPBA 3RUMA 4O3CA 3ONMA 3ZS6A 3G7WA 1I6BA 4QFLA 1VSOA 4KR5A 4ZDMA 1ZJLA 1UTHB 1OMPA 5AA3A 4LQ5A 1JQFA 3K00A 1KWHA 1XHYA 1MPDA 2THIA 3MVYA 3H6UA 2DXRA 4RYAA 1FQBA 3FASA 1IITA 1PB9A 4H0WA 4NE4A 2ZXTA 5CMMA 4ND9A 1SI0A 3KJ7A 1PC3A 3R6UA 2OLBA 5DYHA 4THIA 1Q35A 4KHZE 1B4HA 1VFDA 1B32A 4DIGA 3RQTA 1AIVA 3DELB 4AB6A 4NF4B 1II5A 3KBRA 4NF6A 3CVGA 1UQWA 2I58A 1PB8A 2F6GA 4KQPA 4K3FA 5BWJA 1MS7A 4U4XA 4ZEFA 3KSJA 4GIZA 1I6AA 4QHQA 4UA8A 4U23A 4ZEKA 4BDMA 1TT1A 5I58A 1PDAA 2DE4A 3IORA 1JW4A 2XXPA 2ZYMA 2O7UA 3PU5A 1MQIA 3PMVA 1DSNA 3U94A 3IOWA 4GXSB 1NL5A 1LBCA 1FQAA 5L9SA 5AE4A 2XHDA 3RGYA 1B3EA 5H8HA 1BKAA 4KYEA 1EH3A 1GV8A 5I59B 3UGWA 3FUZA 1B3GA 2A5TB 4XIGQ 5H8NB 4P11A 3N6TA 2XD2A 3HHGA 4LP2B 1M5BA 2OBGA 1SBPA 4F1VA 4MH5A 1M5EA 1ZBMA 3CRBA 4YAHX 4I8CA 3HV1A 2GFEA 3V89B 2D5WA 4IO5A 4E0WA 5CRYA 2XX8A 1FTLA 2A5SA 4QRZA 4OFOA 4NF8B 2PYYA 1USYE 1JNFA 4FE8A 4X9TA 2CZLA 5I84A 3ECRA 4NWCA 3RNNA 1SYHA 4Q0CA 4OENA 4L17A 1WVJA 2I4CA 4QSDA 3I6VA 2DWIA 2Y7KA 4F3BA 3K1PA 5EHMA 1XOCA 4OVJA 4YMBA 1B2HA 2RF1A 3C36A 4IY6A 2QS4A 4DXCA 1T0KA 3HO7A 3IB1A 5AA1A 3L6HA 2RINA 2I3VA 3DLNA 3OO8A 4OFLA 4F1YA 3C33A 2DSFA 2ZNUA 2V93A 2F6PA 1EZPA 5JTYA 2DE2A 4MFIA 1MXXA 4NTLA 2F78A 4PFYA 2W7YA 2F36A 5B70A 3CIJA 3TTMA 4OTEA 3MW0A 2R9JA 4F3SA 3KJTA 4R2FA 3GBAA 4N07A 1VR5A 4GL0A 5L9MA 4EF2A 4R72A 3FXRA 3OSQA 1GTKA 4IGTA 1OIBA 3OD7A 1A55A 1XT8A 3SETA 3QYTA 1ZKBA 2O1LA 1MY3A 4YICA 4GRKA 4GQOA 4OEVA 2KLFA 5DEXB 4I1DA 4KCCA 2BJJX 3JV9A 1MQGA 5AA4A 3S9LC 4U1OA 1Y20A 4KD5A 3BFUA 3TTKA 4ISUA 4C0RA 3EHUA 4G2ZA 4DXBA 3TAJA 1RYOA 1LCFA 1MXUA 1N84A 4DE8A 4F31B 1QULA 5H8FB 3TEPA 3PPNA 3N5LA 1UTBB 3I5OA 2QSXA 3USDA 4H8IA 4GD5A 3C32A 3K1MA 1NNFA 4LONB 4DCXA 5H8QA 3M3KA 4G68C 5AA2D 3OEKA 2H9BA 2UVIA 3KN7A 2OWSA 3OO9A 4G8NA 3IK6B 2G29A 4FJPA 3SERA 2ONSA 1B0LA 1Z7ME 4Z0IA 4AQ4A 1US5A 3TODA 4H1XA 3MZ1A 2ESNA 2D21A 3IOUA 3ODBA 3T22A 3QAXA 1B58A 4OFJA 2ONKE 1B7UA 1LB8A 3FVOA 4EXKA 4EQ9A 1YPNA 2DWHA 1O63A 2ZYKA 4QSEA 1LAXA 1SW2A 2VP1A 4BLAA 3VVFA 2ANJA 2Q8JA 3D4CA 3H7MA 4BDRA 4KYDA 1P99A 1YTVA 3LSWA 3O29A 2QS1A 3S9MC 1XS5A 1MM6A 1SVXB 1RYXA 3M3FA 4JWXA 5TP9A 4LUBA 3MQ9A 3E4RA 1TXFA 4FAJA 2F34A 3G3FA 4QFOA 5CM6A 1O64A 2I6EA 2DE3A 5CI5A 4G68A 5H8HB 3H6WA 4PP0A 4KCDA 3H06B 3M8UA 4RY1A 2ZYOA 5FHMA 3IR1A 4NF5A 1SW5A 1Z7NE 4X48A 4EF1A 1FQFA 2VGQA 2CMOA 1PB7A 1Y3PA 5TPAB 1B5JA 3D4GA 1DPPA 3FD3A 4YB7A 1Y1MA 3TCGA 4RPOA 3VLWA 4OZ9A 4JWYA 1LSTA 3KFMA 3PUXE 4JB7A 3Q29A 2X26A 3V5AA 1CE2A 1DTZA 3W15C 1ZMGA 4G8HA 4ELQA 3FXQA 3HPIA 3O6GA 4JSOA 3L6GA 2Q89A 3C31A 4WEDA 3V8XB 4KI0E 3FVGA 2DP8A 3FVNA 4RPNA 1OLCA 3OOAA 5EYFA 3IX1A 2Y7PA 2HFBA 2P0SA 2XXUA 2UYEA 1BLFA 1NNKA 1B52A 3O9PA 1GGGA 3B7DA 1P1QA 1B51A 1RKMA 4HCWA 1FQCA 2VOZA 1SD3A 4NEDA 4DXUA 5JTYB 2DWAA 2QMXA 4F22A 4WKMA 3T9UA 1JEVA 5A5XA 3BFTA 4TQUQ 1VFEA 4IGRA 1N7WA 4OEUA 3TZAA 4RNSA 3MWBA 4EUOA 5FTIA 2QL3A 3HHFA 3K6WA 1NNTA 4PQJA 3EF7A 3TTRA 3EHTA 3KZGA 2GHBA 3VXCA 5ISUA 1R9QA 1Y4CA 3Q26A 4YMAA 3E3KA 3ZKLA 1H45A 1MXYA 3MC2A 3FATA 2IA4A 1MXWA 2AL5A 1IXIA 3UIFA 1Y9UA 2Q2AA 2AYSA 4GOTA 3U72A 4KPTA 3LC8A 2V3TA 1R9LA 1LAGE 2RCAA 3GLBA 3B6QA 3MJNA 3MP8A 4GL8A 5ITOA 3OEMA 2HZLA 1QKAA 4EQ7A 3KN3A 1B5HA 4PETA 4PFTA 3K6XA 4BDQA 2H4IA 3K6UA 5DVIA 3C9HA 3H03A 3TDJA 3UN6A 2Y7RA 3H6VA 2O6AA 1A54A 1LB9A 1B5IA 3JZJA 3TCFA 3VVEA 1M5FA 3TQLA 2R6GE 1B46A 3IJXB 4IO4A 3TPAA 4QFKA 3FJ7A 4ZEBA 1P1NA 3TFLA 1IXGA 2OZZA 1Q1KA 1B3HA 2UXAA 4MBPA 4YU0A 3UA8A 1OQHA 3QIMA 2ZNTA 4ONYA 3S9NC 2G93A 1WODA 1ZIUA 4HTGA 3EHSA 2GRVA 3KGCA 4GWOA 1P1OA 3LUYA 5I57A 1Y4TA 1FTMA 1URDA 3FXUA 3MBPA 5I56A 3CR9A 3O66A 1ZTYA 3B6TA 3G3IA 2UVGA 2O7IA 4EQBA 4FEBA 5HM4B 1NH8A 1MQHA 5ELVA 1NMUA 2QS2A 3PGFA 3VFJA 1Y3QA 5KCJA 2Z8FA 3A3UA 1H43A 1DPEA 1FTJA 4GVOA 5DVJA 4ZECA 1XVYA 2Q88A 2Q9TA 4OWDA 3PD9A 5I2KB 3Q25A 4N6PA 1LFHA 2Z23A 1B7HA 2I0BA 2WKYA 4U2RA 2XXTA 1SW4A 3OELA 3E9XA 1L5TA 1EU8A 4DDDA 3VDFA 3IAZA 1B7ZA 4ELOA 3RPWA 2GH9A 2UVJA 1MH4A 4JWOA 2DVCA 4OESA 3CFXA 1B3LA 1IXHA 4F3PA 1UTHA 1CB6A 2FNCA 3OO6A 4DCYA 2NOOA 3T96B 4ZE9A 4U4SA 3Q28A 3SEVA 4FORA 2HAVA 4FECA 2XXXA 1FTOA 3E13X 4WXJA 1LGBC 4RXLA 2ONRA 4GXAA 4LATA 5HPQA 2QRYA 2OCUA 3DP4A 1FTKA 3SEXA 1ZU0A 2I4BA 2E1SA 3T9XB 3BBRA 4G77A 1N76A 2HQ0A 4GFRA 4R74A 4ZZEA 3A09A 3I3VA 3PMXA 5AA2B 3QUJA 3TTLA 3G3KA 4NF4A 5A5XB 3U93A 4MLQA 4RK2A 3CSGA 1GVCA 1B4ZA 4H6DA 5IKBA 5KDTA 1TWYA 3LBSA 4LQ2A 2DQVA 4MLVA 3C34A 5B7DA 2FYIA 2XX9A 5ICQA 1B05A 2XXYA 1UIUA 2DVZA 5K2YA 2XX7A 1AOVA 4TLMB 2P1SA 2UYFA 1IQ7A 2XXQA 5I59A 4POXA 3ZKKA 3CFZA 5H8NA 3N94A 4TLLB 4LZ7A 3ILTB 4QF9A 4OMBA 2F7CA 3TQWA 3KSXA 2V3UA 3MP6A 2VHAA 3K6VA 3MAMA 2DOJA 4NF6B 3OMBA 2QJEA 5DT6A 4ZS9A 3MVWA 4R75A 2F8DA 1BP5A 5TU0A 1MXZA 3FV1A 3JYRA 5I58B 5F1QA 4O3AA 1TFDA 3KEIA 2PX1A 4ELRA 5HBCA 1NKXA 4NF8A 4IO7A 4YKJA 2XXHA 1JW5A 3O28A 2VD3A 3LSXA 4E0XA 3LR1A 3KOTA 4U1ZA 3G3HA 4TOZA 1NNPA 3FGSA 1MY2A 4POWA 2X7PA 3RLFE 4Q8RA 1A99A 1MDQA 3PUZE 1TFAA 1OVTA 2DYXA 3PUVE 3TYHA 5JK4A 1AL3A 1BTJA 1YCJA 2QMWA 3CSBA 1O7TA 1OQGA 2OK2A 3V83A 3DP6A 2B3FA 3SEUA 5EHSA 4BDLA 3T93B 4ZEIA 4UACA 3OXNA 1LLSA 1Y1ZA 1S7YA 3IOTA 4QFPA 3C4MA 4JBZA 2PT1A 4ECFA 1XC1A 2Y7WA 3K1NA 4GLIA 1URGA 4O3BA 4RA1A 2OWTA 4YKPA 5FHOA 2F97A 4G4PA 2NUVA 4EDPA 2PVUA 4R9FA 4F1UA 5K2XA 2VD2A 2FA7A 2I48A 1QUJA 1IZ1A 2HXWA 1JEUA 3KG2A 4BDNA 3N6UA 2V84A 3PMWA 1POTA 4X1DA 1A40A 4ESWA 3UP9A 3TTNA 1S50A 3MP1A 2QPQA 3MZ9A 4HCYA 4R6YA 1QJMA 3FV2A 4OETA 4KFQA 4ZZAA 1D9YA 3CFLA 2Z8EA 3IO4A 5L8DA 3FJGA 3IB2A 2YJPA 3RY3A 4IO3A 3R7XA 5H8SA 5M2VA 3SEWA 1I69A 3HCQA 4R9GA 3WAFA 2AIXA 4LZ5A 4RJZA 4XXUA 1LBBA 5ITPA 1USYH 3GXAA 1B0HA 3T66A 1N3WA 2RC8A 2DXYA 5H8FA 2ABHA 3G3GA 1UTBA 1ANFA 2E0SA 1LAHE 2YLNA 5J1DA 1I6QA 1SW1A 3BKIB 1A7LA 4LZ8A 3CG3A 2H5YA 1XVXA 3O2AA 1JETA 1R1NA 3RTFB 5JEIA 3RT6B 1N7XA 2QS3A 3FVKA 3VV5A 3QK6A 2RC7A 3PUYE 4P0IA 4C1UA 4F2QA 2P2AA 2DWJA 3T9HB 3U92A 1PBQA 2RCBA 1PEBA 1N0TA 1ATGA 3MVZA 2I3WA 4R6KA 1MY4A 5AA4B 1NFTA 3N26A 3RN8A 4EXLA 1DOTA 1B1HA 3VXBA 4C1TA 1US4A 1FW0A 4R2BA 1S9TA 1MRPA 4YZZA 1MY0A 2V3QA 3TELA 5KDTB 1ZLQA 3EN3A 1B40A 1BIYA 3CI8A 5ICTA 1FQEA 4H65A 1MQJA 4YB6A 1M5CA 1HSEA 3OENA 2O69A 3B6WA 1LAFE 1WDNA 5H8QB 4WEPA 2F7BA 3PPOA 2RC9A 2XXVA 3FJMA 4OQOA 4PE5B 5IAIA 4MF3A 3PPQA 4H8JA 3VLVA 2REGA 5F7VA 3QXMA 3FIRA 1QVSA 3F11A 4XKNA 2OJTA 1SI1A 4ESXA 5TPAA 4ZEDA 1MDP1 1DMBA 1QUKA 4YKKA 1MXVA 2Z8DA 1SQYA 4YKIA 1H44A 1M5DA 4N13A 4PFWA 3PPRA 4GF8A 4U21A 2AL4A 1POY1 3VLUA 2PT2A 3A3CA 2PBWA 3MUQA 5TP9B 4OXVA 3VE1B 3G3JA 3K4UA 1A8FA 2F5XA 3S2VA 2PMSA 4I9DA 5FHNA 5CMKA 5I2NA 3S4UA 4G68B 2DS9A 3Q27A 3RT8A 2NWJA 2I49A 4OYVA 4P0GA 4FATA 1HSJA 4IB2A 3WAEA 4NF5B 4PFUA 3SESA 3AXFA 3TCHA 3ILUB 1UIVA 2HEUA 1D4NA 3T9VA 4XKRA 4NMYA 2F7AA 4JSDA 2HZKA 1N04A 4Q30B 2O1MA 2H99A 3IO6A 3H4ZA 3M3LA 3HSTA 3IOVA 3MVXA 4M1VA 3FZVA 1GR2A 1MPCA 3U1OA 2REJA 4KYSA 2HCAA 4R6HA 3C35A 4F3GA 3H3GA 4H5GA 3H6TA 3LSFB 2O68A 2B65A 3IJOB 2M8CA 4R73A 1F9BA 3K01A 1IIWA 3O6HA 4F19A 3K2DA 1P1WA 1A8EA 3KOSA 3KN8A 3TKDA 1FQDA 2ZNSA 5CBSA 4RK9A 4Q5TA 3GZGA 2Z22A 1QKBA 2R71A 3SKPA 4JXIA 4XKPA 3U8QA 5CMCA 3MZBA 1MG1A 2Q2CA 3QUFA 4U22A 4FEDA 2ZMBA 1Y3NA 2RKMA 4QSCA 3SEYA 3GBBA 1AMFA 2ZYNA 2B3BA 3DP8A 2IEEA 3OSRA 4I62A 4IO2A 4HS7A 4OHNA 4JDFA 1MQDA 5BUUA 1H76A 4F39A 4YB5A 1H3DA 3PPPA 1B9JA 1EZ9A 3PV0E 1NH7A 2I0CA 3W9WA 4DZ1A 3EQ1A 5FTHA 3O6IA 3SDFA 2A5TA 2LAOA 3IL1B 1FCKA 3THIA 1J1NA 4AB5A 3PD8A 1URSA 3OO7A 3RTWB 2YPNA 4BDOA 2UVHA 4ELPA 1IXCA 4DLDA 2F35A 4XTCQ 2NVUB 1P1UA 5L9OA 3VVDA 1VE4A 4IO6A 1D9VA 1HSLA 1JW1A 1B6HA 1LCTA 2D3IA 4NWDA 1B3FA 1JVYA 1IUDA 3DM0A 4M4GA 1OLAA 5LOMA 2XXRA 2XXIA 4H67A 3LSLA 1OVBA 1MM7A 1LFIA 5CBRA 3IB0A 2XXWA 1MY1A 4F29A 1R6ZA 3K0VA 4X1BA 5I2KA 4IY5A 4LA9A 3R26A 3TUSA 3ZSFA 1N3XA 3MPKA 5DTBA 4ZE8A 5I57B 4H5FA 1SYIA 2GHAA 5I56B 3O97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PUWE 2O51A 2Y84A 1ELJA 2ALUA 2X7QA 4OA4A 2O84X 2V25A 1MH3A 2XD3A 4OERA 1DTGA 3TMGA 4PDDA 2HAUA 4XKQA 4N81A 3K02A 1IEJA 1G0IA 3S9EA 1AH5A 4Z7EA 4F2OA 3PTYA 2WYPA 1QUIA 3UK4A 5KZTA 1QW0A 5KCJB 1PBPA 1B1XA 2DDKA 4N6KA 5I2NB 4LVQA 4QFNA 4FIMA 2ZZVA 1SDXA 2NXOA 4HW8A 3HN0A 4NHBA 4MX6A 5DVFA 1FPLA 1YAEA 3P7IA 3CG1A 3W9VA 1LFGA 1D3KA 3QSLA 2H98A 1EZOA 4P1EA 3EPEA 5DEXA 5CC2A 4G8MA 5I7IA 5CMBA 4F18A 1NV5A 2Y7IA 1CNQA 5AA2A 1JVXA 2H25A 3UORA 3MPLA 1MPBA 3RUMA 4O3CA 3ONMA 3ZS6A 3G7WA 1I6BA 4QFLA 1VSOA 4KR5A 4ZDMA 1ZJLA 1UTHB 1OMPA 5AA3A 4LQ5A 4GWSA 4PF6A 1JQFA 3K00A 1KWHA 1XHYA 1IMFA 1MPDA 2THIA 3MVYA 3H6UA 4GBVA 2DXRA 4RYAA 1LEVA 1FQBA 3FASA 1IITA 1PB9A 4H0WA 4NE4A 2ZXTA 4O7MA 5CMMA 4ND9A 1SI0A 3KJ7A 1PC3A 3R6UA 2OLBA 5DYHA 3NOHA 4THIA 1Q35A 4KHZE 1B4HA 1VFDA 1B32A 4DIGA 3RQTA 3BIGA 1AIVA 3DELB 4AB6A 4NF4B 4OANA 1II5A 3KBRA 4NF6A 3CVGA 1UQWA 2I58A 1PB8A 2F6GA 1FBHA 4K3FA 4KQPA 5BWJA 5IZ1A 1MS7A 4U4XA 4ZEFA 3KSJA 4GIZA 1I6AA 4QHQA 4UA8A 4U23A 4ZEKA 4BDMA 1TT1A 5I58A 1PDAA 4PBHA 2DE4A 2QVRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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