3PUWE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 121
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE01
1H3DA 3U92A 5KZTA 1TFAA 3MC2A 5ICTA 4NF6A 4JSDA 1BP5A 3TDJA 1B4HA 4EDPA 3RN8A 1Z7ME 3WAFA 4P0GA 3RPWA 3FASA 4U1ZA 4YKKA 2XX7A 3D4GA 5A5XB 2I4BA 3VXCA 1NMUA 2V3UA 2FYIA 1FCKA 4G4PA 2H9BA 2RC7A 2HFBA 3KFMA 2V3TA 3ZS6A 4POXA 3FXQA 3TTLA 5CMBA 1ATGA 4OYVA 2THIA 3A09A 3C35A 3LUYA 1NFTA 2AIXA 2QS2A 4GQOA 3T93B 2E0SA 1B0HA 1AH5A 5I57B 3FV2A 3CG3A 5ELVA 1P1UA 5I2NB 2D3IA 1MQGA 1NNFA 3TTMA 3IORA 1M5BA 1NNPA 5FHMA 1A8FA 2OLBA 1B5JA 3SESA 3PMVA 4ZEDA 3VDFA 1YAEA 5K2XA 4RPOA 2DS9A 3W9VA 5B7DA 2GFEA 3V83A 2I49A 3G7WA 4HS7A 3O9PA 3U1OA 2OJTA 3TODA 1URSA 4I8CA 4PE5B 4RYAA 3A3CA 3CSGA 2Y84A 1MQIA 3KSJA 1OVTA 2Y7KA 1O64A 4ELPA 1MM6A 1BIYA 3KOTA 2F6PA 4XKQA 2CZLA 1NNTA 2NOOA 4QSCA 3LSWA 5ICQA 4ESWA 4GLIA 5I58B 1MS7A 5AA3A 3PD9A 4XKNA 1MPDA 1DSNA 4XXUA 3KZGA 4R9GA 2D21A 5CMCA 1EU8A 4MLQA 4OTEA 1PC3A 1YTVA 4R6HA 1UIUA 4I1DA 3K6WA 2F7AA 3H3GA 4JWXA 4IO3A 2HZLA 1WVJA 4F3BA 5I57A 4OFOA 4NEDA 5I59B 5I2NA 2XXHA 1NKXA 4DXUA 4X1DA 4C1TA 1J1NA 3PUWE 5ISUA 1MDP1 4BDNA 2OBGA 2Q89A 1IUDA 3MZ1A 1QVSA 1D9YA 4E0WA 3DELB 2DQVA 4UACA 4EXLA 1T0KA 2DP8A 3N26A 1MQJA 3IO4A 3HV1A 5DVIA 2ANJA 4BDRA 1NNKA 1Y20A 1AL3A 3FV1A 1LB8A 4DCXA 4OXVA 1JETA 1JVYA 3MP8A 4ZEFA 4LZ8A 2NVUB 4IO7A 2V84A 5IKBA 4NF4B 1SYIA 1XC1A 4EXKA 4ESXA 1Y3NA 4C0RA 4H6DA 2QMXA 4KFQA 3SKPA 1SI0A 3KOSA 4YKIA 4G77A 4OESA 2ALUA 4N07A 3OENA 4IO2A 4RXLA 3TELA 1TFDA 2RC8A 4LVQA 3KG2A 3EHUA 1P1WA 1QW0A 4IY6A 1PBQA 5CMMA 4I62A 3K6UA 4ZEKA 2I6EA 2YLNA 4TOZA 2O69A 1A99A 1Y3PA 4FAJA 4DXBA 5L9MA 2RINA 3VLVA 1TWYA 1WDNA 4F31B 3MP6A 4F39A 1HSEA 3QUFA 1B9JA 3G3IA 1DPPA 3TQLA 4MH5A 4O3BA 2HQ0A 2D5WA 1QJMA 3PUZE 1GTKA 4BDMA 2XXWA 1LFIA 3CFLA 4TLMB 3KSXA 3N6UA 1SQYA 3PPOA 4EQ9A 1A8EA 1SI1A 1FTKA 3G3FA 2DVCA 4QFPA 3TFLA 3USDA 4F3SA 3OSQA 4LQ2A 3TAJA 3G3KA 3JZJA 2Z8EA 3IOVA 4R74A 3SEVA 3O29A 1S50A 4O3CA 2VD2A 1OMPA 3GZGA 4H67A 4OEUA 1POTA 3MZ9A 5EYFA 2DVZA 2UYFA 2I0CA 2OK2A 4QRZA 4TQUQ 1B1XA 4PFWA 5EHMA 2I58A 5JK4A 4WEPA 2ZMBA 3P7IA 3K6XA 4OENA 1MXXA 2Z22A 1LAHE 1ZKBA 3KBRA 1US5A 2P1SA 3C33A 4NF4A 4KI0E 2UVGA 2V3QA 4LP2B 2P0SA 1QUIA 1Z7NE 5L9SA 3MQ9A 5H8NA 1IXCA 1CB6A 5ITOA 1B3EA 1JEVA 3O6IA 4F1UA 2H25A 2RCBA 3PU5A 3OMBA 2XHDA 4XKPA 1I6BA 3R26A 2ZXTA 2H5YA 1VFEA 3K0VA 1EZPA 1GGGA 3KN7A 4IO6A 4EQ7A 1R6ZA 3MVZA 3PUVE 1HSLA 1A55A 4M1VA 2Q8JA 1PB7A 4HCWA 4TLLB 1NH7A 1GR2A 3UA8A 5CC2A 1B7UA 3MW0A 2F5XA 3CVGA 4HW8A 3CG1A 2AYSA 1UTBB 1AOVA 1D3KA 3SETA 1B58A 2CMOA 1Y3QA 2P2AA 3TKDA 2PX1A 4QFKA 3TEPA 3O6GA 2BJJX 2WKYA 1MRPA 1URDA 1ZU0A 3FJMA 1MM7A 5HM4B 1S7YA 4NF5B 2R6GE 3H6WA 3W9WA 4LQ5A 3FVGA 3QUJA 3K1MA 5K2YA 1BTJA 2ZNTA 3ZKLA 1OIBA 3T9XB 3RNNA 2O1MA 4PFTA 5I2KB 4KPTA 4ZEIA 2PT1A 2ZNUA 3FZVA 4P0IA 5TU0A 1M5CA 1SW2A 3VLUA 2F78A 4ND9A 3KGCA 3IB0A 5M2VA 4DIGA 3HN0A 4PETA 1ZMGA 2XXVA 2QPQA 1PBPA 5AA1A 4KHZE 2HCAA 1UTHB 2GHBA 1IITA 3SEUA 1CE2A 1TXFA 2DXYA 4JXIA 3CR9A 3GXAA 4ZECA 4LZ7A 2ONSA 3OOAA 4NWCA 4U1OA 4GWOA 3RY3A 3T66A 1MDQA 1Q35A 3VE1B 1B5HA 3U8QA 1R9QA 1MY3A 1VR5A 3MAMA 3DP8A 3IOTA 5AA4B 1XS5A 2XXRA 2Y7WA 1GVCA 3OD7A 3CFXA 4ZS9A 2NUVA 2ZYNA 2E1SA 2KLFA 4G8HA 5I84A 3PMWA 1A7LA 1UTBA 2DWIA 4F3GA 4H5GA 2XXXA 5HBCA 4Z7EA 4NF8B 1B7ZA 3M3FA 2DSFA 2PVUA 2UYEA 5KDTB 2W7YA 3FXUA 5DT6A 1LSTA 2XXPA 4LONB 1SBPA 2QRYA 1B51A 3K1NA 1SVXB 1B3GA 3VXBA 4NF5A 1NL5A 2XXIA 4X1BA 4YB7A 3FUZA 3QSLA 2XXYA 3GLBA 4FIMA 5BUUA 3H06B 3H7MA 2UXAA 4IGTA 4ISUA 1B32A 2GH9A 5AA2D 4G68C 3I3VA 4FECA 4Q30B 3S4UA 3Q27A 1R9LA 5AA2B 2QSXA 5A5XA 4GVOA 4GL8A 4FEBA 3IL1B 3IO6A 3IOUA 3FD3A 1AIVA 1MPBA 1MXYA 1OQHA 1UTHA 3CRBA 2O1LA 5FTIA 2UVJA 3U93A 4KYEA 3IJXB 3QIMA 3TTKA 4Q0CA 3KN3A 4X48A 3TQWA 1US4A 1I6QA 3T96B 2X7QA 1PB9A 2DE3A 1JQFA 3OEMA 4ELQA 2I0BA 2QJEA 4NTLA 2HZKA 1DTZA 1A40A 1N7XA 2Q9TA 4BLAA 5AA4A 3FXRA 3K4UA 3ODBA 2M8CA 3SDFA 2PYYA 3ZSFA 3DM0A 5HPQA 2AL4A 3ZKKA 3IB2A 3LSXA 2O84X 4L17A 4ZE8A 3O97A 4BDQA 4LATA 3OO7A 1P1QA 3H03A 4NF8A 5FHNA 2V93A 1SDXA 1FQCA 3KJTA 4ZDMA 3CI8A 3KEIA 2Y7RA 2X26A 1L5TA 3FGSA 1QKAA 1R1NA 3C32A 4UA8A 1MG1A 2ONKE 4RK2A 1MXVA 2Z8FA 4G8NA 1SD3A 4FATA 5I58A 2DWJA 2HXWA 1M5FA 3OSRA 1YPNA 4THIA 2XXQA 5AA2A 1LCTA 1SW4A 3KJ7A 3EN3A 3IOWA 3CFZA 1BLFA 3SEWA 5CI5A 4OQOA 3EHSA 3MBPA 3OO9A 2FA7A 1MPCA 4IO4A 4EF1A 2R71A 2ZYOA 4PFYA 1ZTYA 3QK6A 1M5EA 1I6AA 1LFHA 3UK4A 2OZZA 5F1QA 4GFRA 4DZ1A 4H5FA 5ITPA 2RCAA 3UP9A 2I4CA 2F7BA 1Q1KA 3B6WA 5I59A 5L9OA 5I56B 3G3JA 4XTCQ 3TTRA 1JNFA 1JW5A 3EPEA 3U72A 4GOTA 5TP9B 4JWYA 1FTMA 1H76A 3T9HB 5H8HB 4GIZA 1B5IA 2XX8A 4MFIA 4QFOA 2F97A 4ELOA 1EZOA 3O66A 3VVEA 1B7HA 5J1DA 4U21A 1B3FA 4E0XA 1N04A 2QL3A 3ECRA 2H4IA 4H0WA 4NE4A 3QAXA 4I9DA 4F19A 5JTYB 5EHSA 3SERA 1NH8A 2Q2CA 3LC8A 4KQPA 3HO7A 3LBSA 1QULA 2XD2A 1D9VA 1OQGA 1FQBA 3C34A 1XT8A 1IIWA 4F3PA 1LAFE 4HTGA 3V5AA 1H43A 5TPAB 1Y4CA 4LZ5A 4AB6A 2DWAA 2XXUA 1FW0A 4N13A 3PPRA 3Q26A 5DVFA 1MY4A 1ANFA 3TCGA 1IXGA 1ZJLA 3BFUA 2F6GA 1BKAA 3TUSA 3WAEA 4EF2A 1B05A 2ZYMA 2Y7PA 1B2HA 1Y1MA 3S2VA 2REJA 1H44A 1MH3A 3H6TA 4FE8A 5FTHA 3QYTA 3S9MC 3OEKA 2OCUA 1MY1A 4BDOA 3R6UA 4YU0A 3OO6A 4RK9A 4WXJA 4YICA 1ZBMA 2UVIA 2LAOA 3FJGA 3K01A 1MH4A 3FJ7A 3VV5A 5I56A 4PP0A 3MP1A 3RT8A 3IB1A 5CM6A 3VFJA 4JBZA 4OZ9A 3MJNA 1RYXA 3CIJA 3QXMA 3DP4A 5TP9A 4KR5A 2DXRA 1LFGA 3IR1A 2YPNA 2O7IA 3PPPA 3GBBA 4ZEBA 1I69A 4OFJA 4F2OA 5CBSA 4YMAA 1P99A 4HCYA 3T22A 3K00A 3D4CA 2IA4A 4FEDA 3JV9A 2F8DA 2B3BA 5JTYA 3Q29A 4IY5A 1HSJA 5H8SA 3S9NC 1MXUA 2O68A 2QMWA 1MXZA 4ELRA 3LR1A 4NWDA 3O28A 3FVOA 5IAIA 3MUQA 4FORA 1RYOA 4OVJA 3UGWA 5TPAA 4RPNA 1Y1ZA 4U22A 2O7UA 2Z23A 4KYSA 4MBPA 3IJOB 4U23A 4DE8A 2ZNSA 1SW5A 4QFNA 4R9FA 1FQAA 2PT2A 2O6AA 3I6VA 4FJPA 4F1YA 2H99A 1IXHA 3FVKA 3T9UA 2B3FA 1MY0A 3TMGA 1B40A 2V25A 2F34A 4ZE9A 1Y4TA 1IQ7A 4EQBA 1PDAA 3EQ1A 2DWHA 2ZYKA 4G68B 2GHAA 4F2QA 3S9LC 3ILUB 1MQDA 4U4XA 1PEBA 1JEUA 3MWBA 4QFLA 1N76A 4OFLA 2Q88A 2RC9A 3Q28A 3K6VA 1GV8A 3I5OA 4KCCA 1LBCA 5DTBA 3H4ZA 2G29A 3PMXA 1MQHA 2Q2AA 3AXFA 4OWDA 4K3FA 3G3GA 2VP1A 2OWSA 1WODA 2PMSA 2VD3A 1N7WA 3H6VA 4Z0IA 2XX9A 5KCJB 4GXSB 2RKMA 4GD5A 1FQDA 2I48A 3RLFE 3RUMA 2IEEA 3K02A 5AE4A 1LAXA 1JW4A 3DP6A 5L8DA 4GRKA 2NXOA 3G3HA 3B6TA 1N84A 3H6UA 4LA9A 1B1HA 3Q25A 3FATA 2F36A 4GF8A 4R2BA 1URGA 3THIA 5JEIA 3W15C 2QS4A 3PPNA 4OETA 4QSDA 3N5LA 4JDFA 5I2KA 4R73A 4U2RA 1LAGE 2REGA 4POWA 4OMBA 1IEJA 1DMBA 2F7CA 4KYDA 1YCJA 4G2ZA 2DYXA 1RKMA 1DPEA 3N94A 4QF9A 3UIFA 1A54A 4ZZEA 1F9BA 2X7PA 1TT1A 3VLWA 1USYE 2HAVA 2VHAA 1KWHA 4O3AA 1PB8A 2A5SA 1LB9A 2FNCA 4G8MA 2R9JA 3ILTB 3HSTA 1SYHA 3PGFA 4G68A 3MPLA 4R6YA 1XHYA 1QUJA 3HHGA 1N0TA 4R75A 3R7XA 4YKJA 3B6QA 1ZIUA 3RT6B 1FTLA 1OLAA 2PBWA 3ONMA 5LOMA 1MXWA 2AL5A 4RJZA 4JWOA 2Z8DA 2QS1A 4H65A 3IAZA 3UORA 4PQJA 4Q5TA 4R6KA 4DLDA 5KCJA 4F22A 5H8QB 5KDTA 4JSOA 1OVBA 1QKBA 3T9VA 4M4GA 4BDLA 2UVHA 1FTOA 3SEXA 4AQ4A 4QSEA 1XOCA 3MPKA 5DEXB 1IZ1A 3C36A 3O6HA 2F35A 3A3UA 4GXAA 3IX1A 3O2AA 1FQEA 3OO8A 5CMKA 4RNSA 4H8IA 3HPIA 4YB5A 5H8NB 2A5TB 4YKPA 3FVNA 3E4RA 3TPAA 4H1XA 3L6HA 3B7DA 1UQWA 2YJPA 4XKRA 3CSBA 5H8FB 3SEYA 3U94A 1VFDA 1SW1A 2VGQA 5B70A 3F11A 3C4MA 3TCHA 1LCFA 3RTWB 4YB6A 2HAUA 3VVFA 1N3XA 3C31A 3L6GA 3KN8A 4KD5A 2DE2A 4NMYA 1O63A 4X9TA 1B3HA 1QUKA 1FTJA 1JVXA 2Y7IA 3S9EA 3GBAA 3IK6B 3RQTA 3MVWA 3N6TA 3E13X 4C1UA 1H45A 4DDDA 2ONRA 2VOZA 3M3LA 4IGRA 3BFTA 2B65A 1P1NA 3M8UA 3FIRA 4ZZAA 3UN6A 2XXTA 1EH3A 3V8XB 4KCDA 4WKMA 1P1OA 3BBRA 3TTNA 3M3KA 3DLNA 1LLSA 1II5A 1B0LA 2G93A 3K1PA 1DOTA 5CRYA 5H8QA 1DTGA 3MVXA 3VVDA 1IXIA 2OWTA 4OEVA 3PUXE 4ONYA 4DXCA 5CBRA 1Y9UA 5DEXA 4YZZA 4PFUA 4IB2A 5F7VA 4MLVA 3E9XA 2XD3A 1M5DA 4NF6B 2H98A 4WEDA 4ECFA 4EUOA 3PPQA 5DYHA 3K2DA 3TYHA 4DCYA 2A5TA 4R2FA 3OELA 2GRVA 3EF7A 1B6HA 3E3KA 2ESNA 1B3LA 5H8FA 1B46A 1S9TA 4RY1A 1O7TA 1OLCA 4N6PA 4AB5A 4H8JA 4OHNA 2QS3A 1LBBA 1N3WA 1LGBC 2I3WA 4RA1A 3MZBA 3PUYE 4GL0A 3EHTA 2NWJA 4F18A 1VSOA 3TZAA 1B4ZA 3RGYA 2HEUA 2DE4A 4YAHX 3JYRA 1USYH 1XVXA 3MVYA 3PV0E 3LSLA 4F1VA 4P11A 1XVYA 2I3VA 4JB7A 1MY2A 4Q8RA 4OERA 1FQFA 2O51A 5H8HA 3RTFB 1UIVA 3V89B 4MF3A 1EZ9A 3LSFB 5BWJA 1POY1 4R72A 1ELJA 3BKIB 1ZLQA 4XIGQ 2DOJA 4LUBA 3C9HA 3TCFA 5FHOA 1D4NA 4YMBA 4F29A 3HCQA 3PD8A 4IO5A 3OXNA 1AMFA 1JW1A 2RF1A 1B52A 1VE4A 5DVJA 4QHQA 2ABHA 3HHFA 4U4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PFRA 2VPNA 1H3DA 3U92A 5KZTA 1TFAA 3MC2A 5ICTA 4NF6A 4JSDA 1BP5A 3TDJA 1B4HA 4EDPA 3RN8A 1Z7ME 3WAFA 4P0GA 3RPWA 2CEXA 2XWKA 3FASA 4U1ZA 4YKKA 2XX7A 3D4GA 5A5XB 4JVIA 2I4BA 3VXCA 1NMUA 2V3UA 2FYIA 1FCKA 4G4PA 2H9BA 2RC7A 2HFBA 3KFMA 2V3TA 3ZS6A 4POXA 3FXQA 3TTLA 5CMBA 1ATGA 4OYVA 4GWSA 2THIA 3A09A 3C35A 1FBEA 3LUYA 1K9YA 1NFTA 2AIXA 2QS2A 4GQOA 3ROJA 3T93B 2E0SA 1B0HA 1AH5A 5I57B 3FV2A 3CG3A 5ELVA 1P1UA 1NV2A 5I2NB 2D3IA 1MQGA 1NNFA 3TTMA 4GWXA 3U65A 3IORA 1M5BA 1NNPA 5FHMA 1A8FA 2OLBA 1B5JA 3SESA 1LBZA 3PMVA 4ZEDA 3VDFA 1YAEA 5K2XA 4RPOA 4N81A 4O8MA 2DS9A 3W9VA 5B7DA 2GFEA 5EYHA 3V83A 2I49A 3G7WA 4HS7A 3O9PA 2B4LA 3U1OA 2OJTA 3TODA 1URSA 2F3DA 4I8CA 4PE5B 4P9KA 4RYAA 3A3CA 4MIJA 3CSGA 2Y84A 1MQIA 3KSJA 1OVTA 2Y7KA 1O64A 4ELPA 1MM6A 1BIYA 3KOTA 2F6PA 4XKQA 2CZLA 1NNTA 2NOOA 4QSCA 3LSWA 5ICQA 2WBDA 4ESWA 4UABA 1FPLA 1K9ZA 4GLIA 5I58B 1MS7A 5AA3A 3PD9A 4XKNA 1MPDA 1DSNA 4XXUA 4PGNA 3KZGA 4R9GA 2D21A 5CMCA 1EU8A 1NUXA 4MLQA 4OTEA 5F24A 1PC3A 1YTVA 4R6HA 1UIUA 2XXKA 4I1DA 3K6WA 2F7AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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