3PUWE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 121
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puwE01
1OIBA 3V89B 3W15C 1CB6A 4R2BA 2ANJA 2Q9TA 1MDP1 2V25A 3G7WA 3T9VA 1MH3A 4ELQA 1BIYA 2DE3A 1JVXA 3O9PA 5I57B 4NF8B 2RKMA 2R71A 4ESWA 3RTFB 4GF8A 5ISUA 3DM0A 5I58A 2XXUA 1MY4A 2CMOA 2OLBA 3KOTA 5EHMA 4FAJA 2OZZA 4XKRA 4Z7EA 1B7ZA 3K1NA 3UA8A 5AA2B 3PMVA 4PFTA 1DPPA 5M2VA 3TTNA 2R6GE 2VHAA 1USYE 1MXXA 2I58A 4BDNA 3GBBA 3E4RA 4G68C 3SEUA 5H8SA 3HN0A 1Y4TA 1LB9A 2V3QA 3SKPA 3H7MA 3KN7A 1JETA 2DWAA 3FXUA 2A5TB 3LR1A 1QKAA 3UGWA 2QS2A 1H44A 3FJGA 2XD2A 1Q1KA 4FECA 3SEXA 3PMWA 4NF4B 4H8JA 2UVIA 1VFDA 4K3FA 3T93B 1MY0A 1SI0A 2AL5A 3R6UA 2O7UA 4IO4A 5BWJA 4YKJA 2OWTA 3R26A 4G68B 1ZKBA 5B7DA 4MBPA 2F5XA 3UIFA 3THIA 5LOMA 2UYEA 4JWXA 3FVGA 2ZXTA 5DYHA 2IEEA 5CMCA 3HSTA 4Q5TA 5ITPA 3TODA 3HHGA 1FQCA 1B46A 2A5SA 3KN8A 2FYIA 1H43A 1B4ZA 4LZ5A 1LFHA 4YKPA 4DZ1A 4F3GA 4P0GA 3HPIA 1EZPA 1JQFA 1SW4A 2F7AA 2HXWA 1AIVA 3D4CA 3TCGA 1NL5A 1FQAA 4QFNA 3V8XB 4N07A 3I6VA 4Q0CA 2F8DA 4NWDA 5I58B 3H03A 1DSNA 3M3LA 4EQ7A 3K2DA 5DTBA 3UK4A 3IOTA 1AMFA 4LZ8A 1MS7A 3V5AA 4R74A 1IITA 1XVXA 4WEPA 4RY1A 1FQDA 2QMXA 3QK6A 4OQOA 4EXLA 5H8QA 1B9JA 3G3FA 1FTKA 3FIRA 4JBZA 5I84A 1P1UA 1UIUA 1F9BA 1MXVA 2DE2A 4LQ5A 2P0SA 4U2RA 2OBGA 3B6WA 4ZS9A 4WKMA 2PT1A 4ZEBA 1P99A 5K2XA 5FTHA 1WVJA 2OWSA 2ONKE 4F1UA 4MFIA 3CIJA 1MQJA 4GWOA 2D21A 1Z7ME 4DLDA 3PUXE 3RQTA 4ELOA 3LUYA 5TU0A 1JW4A 2Z8DA 4X1DA 4YKIA 2XX7A 3VVFA 1GVCA 4F3BA 2X7PA 4G8NA 4HTGA 4OFJA 1NFTA 2XXWA 4F1VA 5K2YA 2F34A 3PU5A 1I6QA 5CM6A 2UXAA 3PPPA 1ZMGA 4OEUA 3USDA 1IXHA 2CZLA 4NEDA 3O66A 1SD3A 2DE4A 2REGA 3EN3A 2QJEA 4JSDA 2NUVA 4R72A 3IOVA 4M1VA 3LSLA 3C9HA 3ECRA 1Y4CA 3VVEA 1A55A 3K0VA 4FORA 3KJ7A 1XVYA 5KDTA 1D4NA 2NWJA 1B5IA 4OEVA 4HCYA 2ZYOA 2YPNA 2Z8FA 1XHYA 4MLVA 4DCYA 3DP8A 2F6GA 1PB7A 1PB9A 3RY3A 3IK6B 3VE1B 3E9XA 1JW5A 3U93A 1SVXB 4YKKA 3PPRA 2P2AA 3DELB 1UQWA 1ZLQA 4NF6A 4OFOA 2O51A 2I3WA 4ELPA 1LCFA 4F31B 5H8QB 4ND9A 5L9SA 1MH4A 5EHSA 3RT8A 1BP5A 4NE4A 3S9LC 1ZIUA 1US5A 2Z8EA 3ZKLA 3PUZE 3T9XB 3PD8A 3SEWA 4LZ7A 2ZYMA 4KI0E 2XXXA 1EH3A 3O6HA 3MW0A 4OWDA 4GXSB 3UP9A 5ITOA 4DXCA 4X9TA 3H4ZA 3KFMA 3KG2A 1MQDA 1GGGA 1URDA 1QJMA 3JV9A 3EHTA 3CSGA 4IO5A 1NH8A 5J1DA 3U1OA 4O3CA 4PETA 2UVGA 1B7HA 4OVJA 2VD2A 1IIWA 4I62A 2Q89A 2X26A 3SESA 2G29A 1US4A 4KYDA 1EZ9A 4FEBA 1MPDA 4F29A 2Y7WA 5AE4A 3RT6B 4QFKA 1LFGA 3OO9A 2WKYA 4EQ9A 1A8EA 5H8NA 1B3HA 3OO6A 3G3KA 4ZEFA 1O7TA 1AOVA 4EXKA 4FIMA 2DSFA 2PYYA 5F1QA 2PVUA 3MBPA 1MY3A 1DTZA 2Y7IA 3N5LA 2O68A 2ALUA 4QRZA 1M5CA 4OTEA 3DP6A 1JEUA 4ZZEA 4H67A 5KDTB 1ZTYA 3H6WA 3C36A 2DVZA 5BUUA 4IGRA 4RYAA 1WODA 4I9DA 3SETA 2RINA 4OERA 4JWYA 3C32A 3PUVE 2XXIA 3B6QA 3TCHA 3BBRA 3I5OA 3O28A 4BDOA 1N04A 2ONSA 1B3LA 2F7BA 1LSTA 1JVYA 1N3XA 1NNKA 4N13A 4F22A 1Y1MA 1B5HA 2UYFA 2Q88A 1JNFA 3KOSA 2PMSA 3A3UA 1H45A 3A09A 2ABHA 4GQOA 3Q29A 2UVHA 4IO6A 3JYRA 3MVWA 4XKNA 3JZJA 2DWHA 4IGTA 3VXBA 3IL1B 2Q2CA 4GD5A 3MQ9A 3K1PA 4P0IA 4OESA 1AH5A 3LC8A 3VDFA 4YU0A 3K6WA 5JEIA 3FXRA 4POXA 4YB7A 1EU8A 1MM6A 3WAEA 4PFWA 1GV8A 4I1DA 3CRBA 3RN8A 3OMBA 3QAXA 1VE4A 2O1MA 4ZE8A 1L5TA 1CE2A 4PFYA 4KHZE 2H9BA 1LAHE 5IAIA 1LBBA 1B3FA 3SERA 3SEVA 2I6EA 4OENA 5H8NB 2QMWA 3OEMA 4FATA 3F11A 3FUZA 2OK2A 1FTOA 3PGFA 4P11A 1J1NA 1URSA 2YJPA 4U21A 1B5JA 3LBSA 2HFBA 2XXVA 5B70A 1SW1A 3FVNA 3GZGA 3IORA 4AB5A 4ZEKA 5HPQA 3S2VA 3VLUA 3VLVA 2DVCA 4UA8A 3TKDA 4QHQA 4F2OA 3MZ9A 4HCWA 4HW8A 3IJXB 3E3KA 3HV1A 1A8FA 1B3GA 1R9QA 1LB8A 2HZKA 1NNTA 3CFZA 3RTWB 4E0XA 2QS3A 1PEBA 2FNCA 2E0SA 3K1MA 3M8UA 2XX8A 4YMAA 3IO4A 2H25A 1XS5A 1RYXA 4QFOA 4M4GA 1VSOA 3VXCA 3ZSFA 2XXRA 1M5FA 2HEUA 3IB1A 2F6PA 4QFLA 1YTVA 3MWBA 3TFLA 1VR5A 4MH5A 3FATA 4HS7A 2Q8JA 4EUOA 1QUKA 1SW2A 3N26A 5TP9A 3BKIB 3PUWE 3GLBA 3QUFA 3L6HA 3TQLA 3PMXA 5A5XA 4LQ2A 1ZU0A 1B0HA 4H6DA 2B3BA 3PPQA 1XOCA 3TEPA 3B7DA 1D3KA 1HSLA 2DP8A 5CI5A 4QSCA 4Q30B 1LCTA 4PP0A 4KCDA 1MRPA 2AIXA 2HZLA 2R9JA 1QW0A 5FHNA 2DOJA 5CMMA 3N6UA 2F35A 3TTLA 1Y3PA 1OQGA 3ILUB 1PBQA 2FA7A 5JTYA 3OD7A 2ZMBA 3O29A 2IA4A 4NF5A 1IXCA 4YMBA 1PC3A 3C34A 2AL4A 4NMYA 5DVIA 4YB5A 2F78A 3FV2A 1FQEA 1UTHA 2O7IA 4EF2A 4FEDA 2Y7KA 1OMPA 3EHUA 4XKPA 1FTLA 3R7XA 3K4UA 2DXYA 1NMUA 3KZGA 1SDXA 3IAZA 3MC2A 3B6TA 2NXOA 3H6UA 3S9EA 3OENA 2Y7PA 2QS4A 1RYOA 4PFUA 3TTRA 5TP9B 5ICTA 5H8FA 3TMGA 1HSJA 4O3AA 4GL0A 2QSXA 4XXUA 5L9MA 5A5XB 1B40A 2DQVA 3LSXA 3TDJA 2B3FA 4FJPA 1GTKA 3FD3A 2V84A 4F3PA 4ZEIA 1BLFA 4GOTA 3KN3A 1TWYA 1Y1ZA 3QSLA 3H06B 4QSDA 3H6VA 4F19A 1FTMA 2BJJX 3TELA 1B6HA 3Q25A 4LONB 2ZYNA 1VFEA 3MZ1A 4XKQA 3OXNA 4BDMA 4WXJA 1YPNA 3M3FA 1A99A 1UIVA 2I4BA 3PD9A 4U1OA 3S4UA 4AB6A 3KBRA 2XXHA 1TXFA 4LP2B 3HCQA 5JTYB 3TYHA 2KLFA 1R6ZA 2RCBA 1FW0A 1I69A 1JW1A 3MP1A 4NF5B 2Z23A 4ECFA 4MLQA 4EF1A 2VD3A 3QXMA 3CG3A 3PV0E 4WEDA 4O3BA 5ELVA 3VFJA 3FVKA 2XXTA 1UTHB 4JWOA 1M5BA 1WDNA 5HBCA 4H5GA 3RLFE 3PUYE 2ZNSA 4ELRA 1POTA 1QULA 4ZDMA 5DEXA 2DYXA 3MAMA 2QL3A 3A3CA 3TUSA 1OLCA 3FZVA 1O63A 5KCJA 4E0WA 3KJTA 2QS1A 3IB2A 2QPQA 4ZEDA 4FE8A 1FQFA 1USYH 2RF1A 2Z22A 3FXQA 3CG1A 4G77A 1T0KA 5H8FB 1XC1A 1SYHA 5I2NA 5CBSA 1TT1A 3W9VA 4U22A 5L8DA 3OSRA 3OSQA 4NF4A 1JEVA 4G4PA 4PE5B 4EQBA 4KYEA 1FCKA 2AYSA 4NTLA 4NF6B 1ELJA 1MM7A 3HHFA 1N3WA 1MY2A 3N6TA 1LLSA 2F97A 4R2FA 4TOZA 3IO6A 4I8CA 1QVSA 2X7QA 4TLLB 3TPAA 2RC8A 4DCXA 3PPOA 1LAFE 3VLWA 2DXRA 3GXAA 2PT2A 3EQ1A 3FASA 2RCAA 1B0LA 3KSJA 4C1UA 1DTGA 4YZZA 1UTBA 3L6GA 1B2HA 3KGCA 1P1NA 1N84A 4LUBA 1I6AA 2YLNA 2RC9A 4N6PA 4H8IA 1FTJA 3FJMA 1H3DA 4F1YA 2G93A 4YICA 4R6YA 1D9YA 2F36A 1R9LA 1OVBA 3MPLA 3MP6A 2XHDA 1B58A 3EF7A 1URGA 1LBCA 4RNSA 3T96B 4QFPA 3G3JA 1S50A 4C1TA 1A40A 4X48A 2PX1A 4Q8RA 3O6GA 3S9MC 5I56A 3MJNA 1P1QA 4IB2A 5FTIA 2PBWA 4R9GA 5DEXB 5AA3A 3FJ7A 4PQJA 1M5EA 4H0WA 1B3EA 1XT8A 5KCJB 1YAEA 4R73A 3C31A 4UACA 2XXYA 1OQHA 5CMKA 3RNNA 3MZBA 2O69A 1MPCA 3ZS6A 4KD5A 3TTMA 4DDDA 5I59A 3K00A 5HM4B 1Y9UA 1TFAA 4L17A 3UORA 1BKAA 3IR1A 5CRYA 1BTJA 5AA4A 5L9OA 1QKBA 3FV1A 2H98A 5I2NB 3FGSA 5TPAA 2V3UA 1II5A 2NOOA 2NVUB 2GFEA 3T9HB 1A7LA 2ZNTA 1YCJA 4RXLA 3QUJA 2DS9A 1LFIA 1PBPA 5IKBA 5KZTA 3RGYA 1PDAA 5CMBA 1Q35A 1ATGA 3TZAA 1MQGA 3Q27A 5DVFA 3CR9A 3U72A 2I3VA 1Y3NA 3QYTA 1IZ1A 4IY6A 1UTBB 4G8HA 5DVJA 1R1NA 3CI8A 2HCAA 3PPNA 1NKXA 2Q2AA 5AA2D 3H3GA 1B51A 4OMBA 1MG1A 4JDFA 3TTKA 2LAOA 2GH9A 3IJOB 4BDLA 3HO7A 1MQHA 3MP8A 4F3SA 4G2ZA 2HQ0A 4OZ9A 3SDFA 3G3GA 3H6TA 4G8MA 3RPWA 4KYSA 3S9NC 4THIA 1SBPA 5I2KA 2GHBA 5I56B 1N7XA 3TCFA 3AXFA 2H4IA 5CBRA 1POY1 3ODBA 3Q26A 1IXGA 3U8QA 2REJA 3EHSA 2OJTA 4OXVA 1GR2A 2I49A 1OLAA 1NNFA 1NH7A 4GL8A 4OHNA 3MPKA 4RPNA 2Y84A 5I59B 3QIMA 1H76A 3E13X 3OEKA 2ZNUA 4X1BA 1B1XA 3EPEA 1A54A 1HSEA 1MXWA 4DXUA 4ZZAA 3C35A 5AA4B 5AA1A 2HAVA 3LSWA 1B7UA 4POWA 5TPAB 2O6AA 4RK2A 1OVTA 4QF9A 2QRYA 3KSXA 3K01A 4ZECA 4KFQA 4RK9A 4IO3A 3UN6A 2M8CA 1N76A 4GVOA 1O64A 4ONYA 3VV5A 3DLNA 2DWJA 4NWCA 4OETA 4RA1A 4TLMB 3T66A 1DOTA 4OYVA 3G3IA 4R9FA 3OOAA 4LVQA 1MY1A 4YAHX 2V3TA 3V83A 3CFXA 4H5FA 4GXAA 4KCCA 3SEYA 4BLAA 2P1SA 4F39A 3C33A 1TFDA 2D5WA 1SI1A 3D4GA 3O2AA 4GLIA 3DP4A 4F2QA 3N94A 3O6IA 3FVOA 4GRKA 3GBAA 1MXUA 4BDRA 3T9UA 2F7CA 3VVDA 4RPOA 4AQ4A 2ESNA 2I0BA 2Y7RA 3Q28A 3MVYA 4YB6A 4U4SA 3IOWA 5DT6A 1SW5A 1IQ7A 4MF3A 5FHOA 3LSFB 4OFLA 3WAFA 2VGQA 1MDQA 2GRVA 2I48A 4EDPA 5I2KB 1N0TA 5CC2A 1NNPA 5H8HA 2UVJA 2I0CA 1B05A 1IEJA 1PB8A 2V93A 1QUJA 3BFUA 2B65A 4BDQA 2D3IA 1LAGE 4KPTA 2W7YA 1MXZA 3K6UA 2XX9A 1SQYA 4IO2A 1B4HA 3RUMA 4KR5A 3ONMA 2I4CA 2O84X 2VOZA 3U92A 2ONRA 4GFRA 1D9VA 5I57A 3O97A 4NF8A 1ANFA 4ZE9A 1IXIA 1S7YA 4DE8A 3ZKKA 2OCUA 3CSBA 3MUQA 1LGBC 3ILTB 3IX1A 4ISUA 2RC7A 4LATA 4U23A 4R6KA 4F18A 2XXQA 1I6BA 3U94A 3I3VA 5AA2A 5ICQA 4XTCQ 3CVGA 1FQBA 3OO8A 1EZOA 2THIA 2ZYKA 3G3HA 3MVXA 3CFLA 3BFTA 4RJZA 1B1HA 1KWHA 3W9WA 2H5YA 1DMBA 4TQUQ 3OO7A 2O1LA 3OELA 4LA9A 2H99A 5JK4A 4JSOA 1AL3A 3C4MA 1MQIA 2GHAA 1P1OA 1B32A 3IOUA 3P7IA 1DPEA 4KQPA 1S9TA 3K02A 1QUIA 4H65A 2A5TA 4R75A 4ESXA 1Y3QA 1Z7NE 4XIGQ 4H1XA 4IO7A 4C0RA 1ZBMA 1RKMA 2VP1A 2XD3A 3IB0A 2E1SA 1IUDA 2DWIA 4QSEA 4JXIA 4U4XA 4JB7A 4DXBA 4IY5A 3M3KA 5EYFA 1M5DA 1SYIA 1P1WA 5F7VA 1LAXA 1MPBA 2HAUA 3K6XA 4G68A 4U1ZA 2XXPA 4Z0IA 5FHMA 4R6HA 1B52A 1N7WA 3TAJA 3KEIA 3T22A 1ZJLA 5H8HB 3TQWA 4DIGA 3MVZA 1MXYA 4GIZA 3K6VA 1Y20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EYJA 1OIBA 3V89B 3W15C 1CB6A 4R2BA 2ANJA 2Q9TA 4N6DA 1MDP1 2V25A 3G7WA 3T9VA 3MYUA 1MH3A 4ELQA 1BIYA 1CNQA 2DE3A 1JVXA 3O9PA 2L5VA 5I57B 4NF8B 2RKMA 2Y5LA 2R71A 4ESWA 3RTFB 4GF8A 5ISUA 3DM0A 5I58A 2XXUA 1MY4A 1FBPA 1NV0A 2KQZA 2CMOA 2OLBA 3KOTA 5EHMA 4FAJA 2OZZA 4XKRA 4Z7EA 1B7ZA 3K1NA 3UA8A 5AA2B 3PMVA 1YYZA 1DPPA 4PFTA 5M2VA 1IMBA 3TTNA 2R6GE 2VHAA 1USYE 3KC0A 4OVTA 1YZ0A 1MXXA 2I58A 4BDNA 3GBBA 4PGNA 3E4RA 4G68C 3QMFA 3SEUA 5H8SA 3HN0A 1Y4TA 1LB9A 2V3QA 3SKPA 3H7MA 3KN7A 2CZIA 1JETA 2DWAA 3FXUA 1YXIA 2A5TB 3LR1A 1QKAA 3UGWA 4MNCA 2QS2A 1H44A 3FJGA 2XD2A 1Q1KA 4FECA 3SEXA 3PMWA 4NF4B 4H8JA 2UVIA 1FJ6A 1VFDA 4K3FA 3T93B 1KA0A 1MY0A 4I40A 1SI0A 2AL5A 3R6UA 2O7UA 4IO4A 5BWJA 4YKJA 2OWTA 3R26A 4PFBA 4G68B 1ZKBA 5B7DA 3E78A 4MBPA 2F5XA 4N15A 3UIFA 5I7IA 3THIA 5LOMA 2UYEA 1KA1A 2WYPA 3CHGA 4JWXA 3FVGA 2ZXTA 5DYHA 1KZ8A 2IEEA 5CMCA 3HSTA 4Q5TA 5ITPA 3TODA 3HHGA 1FQCA 1B46A 2A5SA 3KN8A 2FYIA 1H43A 1NV3A 1B4ZA 4LZ5A 1LFHA 4YKPA 4DZ1A 4F3GA 4P0GA 3HPIA 1EZPA 1JQFA 1SW4A 2F7AA 2OWZA 1BK4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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